3E9XA

Crystal structure of the complex of c-lobe of lactoferrin with nimesulide at 2.7 a resolution
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin'
publication title Crystal Structure of the Complex of C-lobe of Lactoferrin with Nimesulide at 2.7 A Resolution
rcsb
total genus 110
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2008-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3e9xA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3e9xA02
5JTYB 3Q25A 3PPNA 3TCGA 4DCYA 1AMFA 1ZLQA 3O97A 2R6GE 1A54A 5BUUA 4G2ZA 3FD3A 3GBBA 2PT1A 2M8CA 4EQ7A 5I58B 3IOWA 3IJXB 5CMKA 4QSDA 1PEBA 4I1DA 4OEUA 3RT6B 5AA4B 5TPAB 5AA3A 1TFDA 4NF8B 1FQCA 1QVSA 4NE4A 3V8XB 4F39A 2B65A 3TZAA 3ZSFA 1B4HA 1LFGA 1QKBA 3FGSA 3TMGA 1TT1A 1JW5A 3PPPA 1NKXA 2R71A 3WAEA 2XXXA 2A5TB 4N13A 3FV2A 1XT8A 3G7WA 1B05A 1SQYA 1XVYA 2XXVA 3SETA 4EQBA 1FCKA 3CRBA 3MVZA 5CI5A 2XXIA 3PUZE 3H4ZA 1P1NA 3TPAA 4GXSB 2XXTA 1UTHA 3VE1B 1MG1A 1MQIA 4JB7A 4F1YA 1LB8A 4JXIA 2HZKA 1D3KA 3N94A 3VXBA 3MAMA 4IGTA 2RC9A 4GRKA 3TKDA 3PPRA 5CBRA 4F2QA 2ZYMA 3PUWE 1LCTA 4H65A 2I6EA 1LAHE 4LQ5A 4TLMB 3T22A 1FQDA 3QUJA 5KCJB 3KOTA 3USDA 2H99A 1N04A 1CB6A 3S9MC 3VFJA 1IEJA 1MDQA 4GF8A 2H98A 3RTFB 1B52A 4BDMA 1IXIA 4KD5A 3DP4A 1USYE 5ITOA 1J1NA 4QFLA 1B32A 4EF2A 4MBPA 5F1QA 5DVIA 4OFLA 5AA2A 4IO5A 1P99A 2QS3A 4L17A 1HSLA 4F3GA 1SW2A 3H6VA 4YKKA 1AL3A 4TOZA 4ZEFA 2F35A 3SEYA 5KDTA 2F7BA 4AB5A 4MFIA 2KLFA 4JWYA 4R2BA 1SYIA 5I2KA 4JWOA 4MH5A 1A55A 1H45A 4KCDA 1HSJA 3BBRA 3O6HA 1Q35A 2I0BA 3RY3A 2GFEA 1PBPA 3R26A 4HW8A 5I57A 1JVXA 3S2VA 1B2HA 4XXUA 2XXWA 1DMBA 3TUSA 3Q26A 1B0LA 3K4UA 3K1NA 3N5LA 3PPQA 2Z8FA 1EZPA 3MVWA 4R73A 5DTBA 3MPLA 4BLAA 3OMBA 3KG2A 4BDRA 3K6WA 4NF4B 3MVXA 4N6PA 4XTCQ 4NWDA 5KZTA 2O1MA 2Z8EA 1ZMGA 4E0WA 3C33A 3T66A 3W9WA 1D4NA 4ONYA 2QMWA 4QFOA 3OOAA 4MLQA 3G3KA 1BLFA 1EU8A 3LSXA 2IA4A 1MRPA 4G8NA 2NWJA 1FQBA 4C1UA 1GR2A 1Y1ZA 1M5EA 3I6VA 2DWJA 5EYFA 4DCXA 1MY3A 1B5IA 4NMYA 4G68B 1QUIA 4IO7A 1MXUA 5I59A 1EZOA 3JZJA 4C0RA 1MPBA 3SEVA 4DXCA 4IB2A 5TP9B 3PV0E 3SEUA 4YB6A 3EHUA 2I48A 2YPNA 2RKMA 3T96B 1ELJA 3H03A 2H4IA 5CRYA 4KR5A 4OFJA 1FW0A 4RYAA 2Z8DA 3JV9A 4EXKA 2Q9TA 3EHTA 5I58A 4XKPA 4FEDA 4DDDA 3UA8A 4AQ4A 4THIA 4HCWA 1P1OA 1LCFA 4TQUQ 1OVTA 2O69A 3CI8A 3RNNA 5AA4A 1YTVA 5TPAA 3A3UA 4NF8A 2I58A 1LBBA 2DWAA 4U4SA 4R72A 1ZJLA 3RLFE 2O7IA 5JK4A 3U8QA 3K6VA 3UGWA 2HFBA 1PBQA 2X7QA 1POTA 3OSQA 3S9EA 1Y9UA 2FNCA 2LAOA 3HSTA 3E4RA 4K3FA 5EHMA 4NEDA 2F8DA 5CMCA 3MQ9A 3MP6A 1LBCA 4Q30B 3IB0A 4F1VA 1SBPA 3FJGA 1FTOA 3MPKA 3M8UA 4TLLB 2DE4A 1PC3A 1XVXA 1RKMA 4OEVA 4O3CA 3H06B 3SDFA 3Q29A 3FIRA 2F34A 4OVJA 3Q28A 5I56B 5FTHA 2G93A 5CBSA 1Y3PA 5FTIA 3KFMA 4N07A 3C31A 3SEXA 3CFLA 3KGCA 4WEDA 4DE8A 2Q2AA 3EF7A 4ZEDA 3IB1A 1D9VA 4I8CA 3ODBA 1A40A 1MY2A 4HS7A 4KYDA 3H6TA 2P0SA 4H0WA 4OYVA 3C32A 2H5YA 4GVOA 5KCJA 4JSDA 4XKQA 1PB8A 3KOSA 2ONSA 1UTBB 3IO6A 4U1ZA 3TAJA 5CC2A 4M4GA 1OVBA 3V89B 2I3WA 4PFUA 3CR9A 3EQ1A 2ZNUA 3FASA 3QSLA 2PYYA 1O7TA 3L6GA 3N6UA 4RY1A 2HCAA 1B3HA 3K00A 3LSLA 4PFTA 3DP8A 4U22A 1FTJA 4KQPA 1FTKA 2Z22A 1AOVA 3O9PA 4F19A 1QUKA 4EF1A 2REJA 5H8FA 2OBGA 3CG3A 4JWXA 4KCCA 5ICQA 1M5CA 2RC7A 3SEWA 1N84A 3A09A 3P7IA 3U93A 1O63A 5K2YA 3EHSA 3ILUB 5EHSA 3OD7A 1LLSA 3U92A 5H8SA 1NFTA 3K6XA 4IO6A 4H5GA 3THIA 3U94A 3MP8A 1MQDA 1JEUA 4ZE8A 1P1UA 5HPQA 4QF9A 1S9TA 1N3WA 1BKAA 5I84A 4PE5B 3FVNA 4HTGA 1YAEA 4XIGQ 3HHGA 3FXRA 1I6QA 4GIZA 1GVCA 1SI1A 3OO8A 2RCBA 3VV5A 3MZ1A 3CSBA 3MUQA 4U1OA 3C34A 3HO7A 1O64A 4BDOA 4NF6A 3H3GA 4NWCA 5I2NB 3IX1A 1SI0A 5L9MA 1R9QA 2ALUA 3PU5A 2O51A 3OELA 1B3FA 4H8JA 4JBZA 2ZMBA 2ZNTA 3BKIB 1QW0A 3C4MA 4I9DA 4ZZEA 4E0XA 4JDFA 2HQ0A 4R9FA 3MBPA 5DEXB 4G8HA 1IXHA 2CZLA 2G29A 4G68A 3TQWA 2ZYKA 2NUVA 2Y84A 2QPQA 3HV1A 2DVZA 3IB2A 4JSOA 2D21A 4DLDA 3QK6A 1TXFA 2QS2A 4YKJA 1WODA 2AYSA 4DZ1A 1OLCA 1LAXA 4Q8RA 1D9YA 3U1OA 5H8QB 1B58A 5H8HB 3QIMA 3QUFA 5A5XB 3PMVA 4OTEA 1H3DA 2OWTA 4ND9A 4Z0IA 3C36A 2XXHA 3KN7A 3OO7A 1B51A 3OEKA 4F22A 4PP0A 3UP9A 4X1DA 1TWYA 2Y7KA 2Y7IA 4IGRA 1PB9A 1IXCA 2DVCA 2RF1A 1Y20A 4WEPA 2CMOA 3LUYA 1TFAA 3PMXA 3K1MA 3A3CA 2X26A 1DTZA 1B0HA 2XXPA 4YMAA 1NMUA 3PUVE 4F29A 4G4PA 3TODA 3K1PA 5B70A 2Z23A 3O6GA 1BP5A 2F6PA 3H6WA 4ECFA 4GXAA 4DIGA 5AE4A 2YJPA 5CM6A 1JQFA 1Y4TA 4P11A 3DM0A 5F7VA 1B3EA 1QJMA 3KJ7A 3CFXA 1B46A 4BDNA 4OXVA 3O29A 1ZTYA 2UYEA 3SESA 4OENA 3LSFB 5L8DA 4POXA 4QFKA 4MLVA 4KPTA 1JW4A 3TTNA 4YICA 1P1WA 5DYHA 3IOVA 4OERA 1MQJA 1M5DA 4YB7A 2FYIA 4H67A 4POWA 4OZ9A 3ONMA 2E0SA 2PMSA 3IOTA 1MY4A 4F3SA 1LGBC 1NNKA 3KZGA 4RK9A 2F5XA 2QJEA 3O66A 1UTBA 1LAGE 1MM7A 3IR1A 5ELVA 4GFRA 4IY5A 3PMWA 1NNFA 3VLWA 2Y7WA 4FAJA 2OJTA 2PT2A 2XX8A 3V5AA 5TU0A 1XHYA 2PBWA 2VD2A 4F2OA 1I69A 3S4UA 1USYH 1US4A 4OQOA 3VLVA 4FEBA 5H8NB 3LR1A 3JYRA 1P1QA 4OFOA 3C35A 1FTLA 1Q1KA 4LZ7A 1KWHA 2VHAA 1EH3A 1LAFE 2HEUA 4ELPA 1DTGA 3OEMA 5JTYA 5AA2D 5BWJA 4RPOA 1UTHB 4FATA 4P0IA 5ISUA 4X1BA 2ANJA 3MP1A 1YCJA 3HN0A 4X48A 2ONRA 1B40A 4ESXA 5IKBA 3VXCA 4C1TA 4IO2A 2OCUA 3U72A 2Q2CA 2QRYA 4GLIA 3BFUA 4RA1A 4ISUA 3TYHA 1US5A 1IZ1A 2B3FA 1NNPA 2UVHA 3M3KA 2XX7A 3IAZA 1IQ7A 5JEIA 2OWSA 1N3XA 4KHZE 1WDNA 2UVGA 1PB7A 4RPNA 3HCQA 4U23A 3VVDA 4ZE9A 5CMMA 2A5SA 2ZYOA 1R1NA 4F3BA 1RYXA 3G3JA 5I2NA 3QYTA 2A5TA 2O1LA 1Z7ME 1LSTA 1F9BA 3L6HA 1MH4A 4FE8A 2RINA 1QULA 1EZ9A 1MPDA 3SKPA 1URDA 3MJNA 3G3GA 5KDTB 3E9XA 3TELA 1OMPA 3E13X 1ANFA 1B7ZA 1H44A 3QAXA 4NTLA 2O68A 4X9TA 4QHQA 2QSXA 1IUDA 3UK4A 2VP1A 2DWHA 1S50A 1B6HA 1M5FA 1MS7A 1MXWA 1SW5A 1FTMA 2VOZA 3CIJA 1MXYA 3O6IA 4LONB 3FXUA 3IL1B 2DYXA 5I57B 2PVUA 1GTKA 2RCAA 1B3GA 5H8HA 5A5XA 2UYFA 4NF5B 1MDP1 2F36A 1VE4A 1UQWA 4GL0A 4LATA 1MY1A 3G3IA 4EQ9A 4ZS9A 1JEVA 4H1XA 3KEIA 2Y7PA 1I6BA 1DPEA 1IITA 5J1DA 2Q8JA 3DELB 2AL5A 2XHDA 1JNFA 2F78A 3KN8A 2O7UA 3DLNA 3PGFA 2R9JA 2I0CA 3PUXE 5ICTA 5FHOA 4EDPA 3ZKKA 1LFHA 1I6AA 4F31B 1B9JA 4FIMA 1OQGA 5FHMA 3SERA 3HPIA 3O28A 4ELRA 5K2XA 4U21A 3EN3A 1CE2A 4RK2A 2NOOA 4YB5A 1XC1A 4GD5A 3RUMA 1H76A 4YKPA 4RXLA 5I59B 3I5OA 1XS5A 3AXFA 2DXYA 2RC8A 1T0KA 2YLNA 4LA9A 3C9HA 1Y3QA 4F18A 2D3IA 1B5HA 2XXYA 1VFEA 4QRZA 5L9SA 1Y4CA 1SVXB 4ZZAA 3W9VA 3GLBA 2F7AA 3FVKA 3TTKA 4ZEBA 4G77A 2NXOA 1UIUA 2IEEA 3UORA 2DWIA 3TTRA 4BDQA 4NF4A 3N26A 2THIA 3QXMA 3FZVA 1RYOA 1PDAA 3FV1A 2DQVA 3GBAA 1URGA 4OHNA 2HAUA 5H8NA 2P2AA 1LFIA 3TQLA 2GHBA 4ZDMA 1SW4A 3CVGA 3FVGA 3FUZA 3HHFA 3D4GA 4M1VA 2HAVA 2P1SA 3IORA 3ZS6A 1LB9A 1IXGA 3I3VA 1L5TA 3VDFA 1MXZA 3VLUA 1VSOA 1MXXA 2UXAA 5TP9A 4KI0E 1II5A 1DOTA 3KSJA 3W15C 3PD8A 3RT8A 3OSRA 3RPWA 4YAHX 1B7UA 2D5WA 2DXRA 3TTLA 3LBSA 3MVYA 1A8EA 3UN6A 3B6TA 3IK6B 4Q0CA 3TCFA 1H43A 4Q5TA 2V3UA 4XKNA 4OETA 3UIFA 2PX1A 1B1HA 3T9XB 3ILTB 3OXNA 5HBCA 2Q88A 3KN3A 5IAIA 4ELQA 1A99A 3H6UA 3OENA 4H8IA 1DSNA 4ELOA 5ITPA 3MC2A 2ONKE 3M3LA 1ZBMA 2DSFA 5DVJA 3Q27A 3RTWB 4H5FA 3B6QA 2H9BA 5M2VA 4FORA 2DOJA 4H6DA 4IY6A 5HM4B 2XD2A 1FQEA 2DP8A 2W7YA 3K0VA 1JVYA 3IOUA 4UA8A 3T9HB 1JETA 3MZ9A 1SW1A 2FA7A 2OZZA 1A7LA 3G3FA 4U4XA 5I56A 2ESNA 2V25A 1B1XA 3FVOA 4F1UA 4ZEIA 1SYHA 5H8FB 3TDJA 2V84A 1POY1 1QKAA 1OIBA 2XXQA 3LC8A 3GZGA 3FJ7A 2AIXA 1N76A 3D4CA 2QMXA 3CG1A 1VR5A 4LP2B 4P0GA 4NF5A 1Z7NE 2QS4A 3FXQA 3F11A 5L9OA 1Y3NA 1SD3A 4LUBA 1B5JA 4O3BA 2REGA 1MPCA 3VVFA 4R9GA 2I3VA 1ZIUA 4GL8A 1GGGA 4QSEA 4G68C 1SDXA 5DVFA 4NF6B 2GRVA 1OQHA 3EPEA 1S7YA 2QS1A 1MXVA 3VVEA 2HXWA 4XKRA 2I4CA 4RJZA 4FECA 3OO9A 1B4ZA 4QFNA 1NH7A 2GH9A 2VGQA 3T93B 1GV8A 4YMBA 4GOTA 4HCYA 1MH3A 2DS9A 4O3AA 2DE2A 1MM6A 3MZBA 2UVJA 2XXUA 4KYSA 4KFQA 3PD9A 2ABHA 1HSEA 1XOCA 4GQOA 2B3BA 2XX9A 4ZECA 2NVUB 4F3PA 4U2RA 4QFPA 3RQTA 1AIVA 3OO6A 4R75A 4RNSA 1N0TA 3PUYE 3IO4A 2XD3A 3R6UA 3RN8A 1NH8A 1VFDA 3K01A 3TCHA 2E1SA 3S9NC 1N7WA 2Q89A 1IIWA 1BIYA 3FJMA 1JW1A 2UVIA 4PETA 3GXAA 4I62A 4QSCA 1UIVA 4YKIA 4YZZA 3RGYA 1R9LA 3R7XA 3CSGA 1ATGA 3T9VA 4R6HA 3TEPA 4UACA 5FHNA 3B7DA 3MW0A 4LQ2A 4OESA 1ZKBA 5AA2B 1ZU0A 5DT6A 2O6AA 2GHAA 4LZ5A 1MQGA 4IO3A 3ECRA 3WAFA 1MY0A 4R6YA 3K6UA 5DEXA 4PQJA 3K2DA 3B6WA 2AL4A 3KJTA 2F6GA 1BTJA 3MWBA 3V83A 2V93A 4EXLA 3E3KA 3CFZA 2I4BA 1A8FA 1Y1MA 3DP6A 4Z7EA 4G8MA 5I2KB 4OMBA 2QL3A 4DXBA 5B7DA 2ZNSA 1WVJA 3T9UA 4ESWA 2H25A 2F97A 3S9LC 3PPOA 1B3LA 4R6KA 5LOMA 5H8QA 2BJJX 4MF3A 1OLAA 4R74A 3LSWA 4WXJA 4DXUA 4PFWA 4BDLA 3H7MA 3TFLA 3ZKLA 1DPPA 3G3HA 1M5BA 4AB6A 3KSXA 2XXRA 4PFYA 1FQFA 2F7CA 3KBRA 3M3FA 2HZLA 3N6TA 4OWDA 2X7PA 2VD3A 1FQAA 2ZYNA 4LZ8A 2OLBA 1NNTA 1QUJA 4LVQA 2DE3A 2V3TA 1URSA 3FATA 4IO4A 2OK2A 1R6ZA 4GWOA 2O84X 2Y7RA 1NL5A 3TTMA 1N7XA 4R2FA 4FJPA 1B7HA 1YPNA 1AH5A 3IJOB 3BFTA 4YU0A 2V3QA 3K02A 4EUOA 4KYEA 5CMBA 4WKMA 3O2AA 2ZXTA 5AA1A 2WKYA 4ZEKA 1MQHA 2I49A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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