2RC9A

Crystal structure of the nr3a ligand binding core complex with acpc at 1.96 angstrom resolution
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
287
structure length
287
Chain Sequence
KLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAGQLCLDPMTNDSSMLDRLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEQLAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLSGTANMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRGTELSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVQYLKNDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTSNISELISQYKSHGFMDVLHDKWYKVV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Molecular mechanism of ligand recognition by NR3 subtype glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit 3A
total genus 98
structure length 287
sequence length 287
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rc9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rc9A02
3TTMA 4OERA 1ELJA 2A5SA 4X1DA 4U1OA 4YAHX 1UIVA 3G3FA 1A7LA 4JWOA 1B40A 5JTYA 3KN7A 5I59A 2REJA 3EF7A 3KJ7A 5ISUA 2XXRA 2LAOA 1B7HA 3S2VA 1AL3A 3S9LC 3IK6B 4OFOA 1POTA 4PE5B 3CFZA 2H5YA 1QKAA 5L8DA 1PDAA 4YU0A 2HXWA 3IJOB 4EQ9A 3KFMA 2XX9A 4BDOA 5JTYB 1II5A 3FUZA 4ZEKA 3PGFA 1MDQA 3K1PA 5I59B 3KBRA 1MS7A 4HTGA 4Z7EA 2O69A 2W7YA 3K00A 4I62A 4OYVA 4E0WA 2DE2A 3H6WA 4ZECA 4H0WA 3FJMA 4G8HA 2HAVA 1QVSA 5F7VA 3C33A 1FCKA 1MH3A 2PT1A 4YMBA 5ITPA 1ZIUA 3B7DA 2PT2A 2Q89A 1XT8A 1D4NA 4GXSB 1JETA 1P1OA 3FV1A 1CE2A 4ZZAA 1B51A 1R9QA 1USYH 2QS2A 4GFRA 4KHZE 1LLSA 2P0SA 1B4HA 5CRYA 1B4ZA 4QSDA 2XXIA 3I5OA 3RT8A 3P7IA 2OK2A 4H67A 3CSBA 3KGCA 5K2XA 3SEUA 3CG3A 3FJGA 1N3WA 3R7XA 4F3GA 3HCQA 1SYHA 3SKPA 1UQWA 1SD3A 3JV9A 1H44A 3PPPA 3MZ1A 1FTLA 4I9DA 2DQVA 2A5TA 5B70A 1EU8A 3MPKA 3PV0E 1O63A 1JNFA 3VXBA 4U4SA 4PFYA 2XXUA 2XXHA 2V93A 2BJJX 2CMOA 1M5CA 4RPNA 4YB7A 4FE8A 3SEXA 2A5TB 1B3LA 2VP1A 3CI8A 3V8XB 2Z8FA 4QFNA 5HM4B 4OVJA 1MXUA 1B9JA 2X26A 1NNFA 1MM7A 1UTBA 3U94A 1URDA 3QK6A 4F1UA 4ND9A 3K6VA 3UN6A 4GOTA 2GHAA 2I4CA 1EZOA 4ELQA 1MRPA 1MQDA 1UTHA 2PYYA 4EF1A 4ELOA 3DM0A 5KDTA 3EPEA 3T93B 2NXOA 3DP4A 4GIZA 2OWSA 4YKIA 4F39A 4F19A 1UTBB 3K6UA 1NNTA 5A5XA 1XC1A 5I2NA 1A8FA 4IO4A 1ZU0A 2ONRA 3RPWA 4C0RA 1B0HA 3CIJA 2V84A 4GVOA 4JXIA 2D3IA 5DEXA 5KDTB 2UYFA 4LP2B 4EUOA 3IJXB 4R9GA 3FVGA 5I57A 3B6TA 5A5XB 4G8MA 5I2NB 4M4GA 3M3FA 5LOMA 1A40A 3VVFA 2Z23A 2F6GA 1IXGA 1TFAA 2H98A 5DEXB 2ANJA 2Q8JA 3OO8A 3DELB 3N5LA 3KEIA 5I57B 1NNPA 2ESNA 1Y20A 4LVQA 3A09A 3OO7A 2X7PA 4MF3A 1WDNA 1MXZA 1Z7ME 3B6WA 4EDPA 1OVTA 4THIA 2Q2CA 3H6UA 3Q28A 3G3HA 4Z0IA 3BFUA 4OFLA 1AIVA 3OXNA 1MM6A 4DXBA 4KYDA 1B0LA 3MVXA 3TQWA 2B3FA 3QIMA 4TLLB 1SQYA 1MXVA 4O3BA 1OMPA 4UACA 4DXCA 1MQGA 3H7MA 3OSRA 4XIGQ 4DE8A 2YPNA 3K0VA 3IOVA 1SDXA 1SW1A 4ZDMA 1B3EA 4R73A 3UORA 3M3LA 1LAFE 5IKBA 3MP6A 4ZE8A 2IA4A 3V89B 1MQHA 4GLIA 1MY1A 3MQ9A 4YB6A 1Y4CA 3VDFA 1ZLQA 3HHFA 4F3PA 3CR9A 2ONKE 1B3FA 3E3KA 2R9JA 2ZNSA 1XHYA 1S9TA 4JWYA 1D9VA 1JEVA 1M5EA 5TU0A 2DWJA 3UA8A 3O2AA 4QSCA 3U72A 2F8DA 4KYSA 3ILTB 4ZE9A 1MDP1 1S7YA 3VFJA 4NMYA 5H8QA 1Y3PA 3JYRA 2F36A 1Y1MA 4GF8A 3H06B 1B5HA 4Q8RA 4OZ9A 4OETA 1SYIA 4L17A 4N6PA 4F1YA 2PBWA 4X9TA 3OD7A 2QS3A 2XHDA 4BDRA 1SW2A 5H8QB 1BKAA 2XD2A 4QFKA 1S50A 3ZS6A 5DT6A 1MY0A 4R75A 2QPQA 4OXVA 3Q29A 1MY4A 3FV2A 1JQFA 3K2DA 1MXXA 3ECRA 2DE3A 2IEEA 2ONSA 4GXAA 5CBSA 2DWIA 2YLNA 1OLAA 2Y7IA 3PMVA 2X7QA 1B7UA 1EH3A 4OEUA 4ZEBA 1B46A 1LAHE 2UVGA 2XXQA 4DDDA 5TPAA 5I2KA 2B65A 3ODBA 5H8NA 3TQLA 2DP8A 4DCXA 4POWA 2I3VA 3GZGA 2G29A 2PMSA 5CC2A 3FD3A 5JK4A 3H6TA 2QRYA 5I58A 1M5FA 4OEVA 3TCFA 2OBGA 2XXVA 3QUJA 5TPAB 4ESXA 5I2KB 1N3XA 1HSJA 5H8NB 3PUYE 4QSEA 1FTKA 2PVUA 4GQOA 1RYXA 3FXRA 1KWHA 1XVXA 1JVXA 1LAXA 2RF1A 4I1DA 3VLUA 3PMWA 5ICTA 1Q35A 5I58B 5J1DA 4OWDA 3VVEA 1NKXA 5DVFA 3MC2A 5BUUA 3FXQA 2O7IA 4MFIA 2UVIA 4LZ7A 4DCYA 1XS5A 1TWYA 1QKBA 1D9YA 4R2FA 3RUMA 2Y7RA 1VFEA 3C4MA 2QMXA 1D3KA 4R6YA 4KFQA 3IB2A 3W9VA 4IY6A 1GVCA 4LZ5A 1Y1ZA 5CMCA 1LB9A 2FA7A 3ZKLA 1MY3A 3TUSA 4HCWA 3T22A 1RYOA 1BLFA 1JW5A 1PEBA 2H4IA 2F7CA 4X48A 4EXKA 3TDJA 2UXAA 1R6ZA 1OQHA 5FTIA 2RKMA 4XTCQ 3QUFA 4NF4A 4ESWA 3TCHA 2Q2AA 2NWJA 5I84A 3KSXA 3IB1A 1A99A 1A8EA 1XVYA 4YKKA 2HCAA 1IXHA 2OLBA 3MVWA 4FAJA 1PB7A 4RY1A 2P2AA 3D4GA 3SESA 5IAIA 3OSQA 2VHAA 3RNNA 3O6GA 3VXCA 4NF4B 4FEBA 3PUZE 1POY1 4H8JA 3T9VA 4Q30B 2DVZA 3OMBA 4JSDA 1YPNA 2DOJA 4GRKA 3S9MC 5KCJA 4IO2A 3CSGA 3MBPA 3UGWA 4FATA 1LAGE 3C34A 3FVNA 5CMBA 5AA3A 1IUDA 4NF8A 1MQIA 4U1ZA 4RA1A 4BLAA 4JB7A 1IIWA 2Y84A 2VD2A 1QW0A 2Y7WA 4DXUA 4HW8A 4NTLA 5KCJB 2OWTA 5DTBA 3RGYA 2I49A 3FVKA 5CBRA 1B5IA 4NF8B 4NWCA 4G68C 4QFOA 4BDMA 2NUVA 4BDQA 1DPEA 1SVXB 3OO9A 4U2RA 3HV1A 2PX1A 1GGGA 2I0CA 3RT6B 2REGA 1LCFA 3ZKKA 3C9HA 3T9HB 5CMKA 4X1BA 3FGSA 3IL1B 2VD3A 3TTKA 5EHMA 4NWDA 3OENA 1SI1A 1LB8A 2VOZA 4ZEDA 2HQ0A 4C1UA 2ZNTA 1H43A 2F7BA 4F3SA 1UTHB 3E9XA 1LBCA 4E0XA 3A3CA 4KR5A 1JEUA 3UP9A 1LFGA 1MQJA 1J1NA 4XKPA 1N0TA 1RKMA 2I48A 4ZZEA 1B32A 1N04A 1QUIA 3PPQA 4KYEA 3PPOA 1ZJLA 2ZYMA 1T0KA 4GWOA 1ANFA 3MWBA 3PPNA 4H1XA 5L9OA 3RN8A 3TTRA 1NFTA 2V3QA 2QSXA 2XXPA 3GBAA 4RJZA 4P0GA 5DVIA 2F78A 1B58A 3U8QA 1TXFA 4MBPA 4C1TA 3MVYA 1SW4A 1B52A 1B3GA 3TKDA 1N7XA 4PFWA 1MG1A 4U23A 5FTHA 1FTJA 1ZMGA 1TFDA 2D5WA 3MW0A 4PETA 5KZTA 1MXWA 3SEWA 1GR2A 1US5A 4FORA 2ZXTA 2O7UA 1PBPA 5ELVA 3LSWA 2Z22A 3FJ7A 1Z7NE 4NF6A 1YCJA 2I4BA 1JW1A 3OEKA 2XXTA 3UK4A 3I6VA 1HSLA 4NEDA 2B3BA 3U1OA 4F2QA 1I6AA 3AXFA 3DP6A 1NH8A 5HBCA 3S4UA 5F1QA 2KLFA 2ZYKA 4LZ8A 1MPCA 1EZPA 3CVGA 4NF6B 1XOCA 3LSLA 3KN3A 5M2VA 3O66A 3VE1B 2FNCA 1CB6A 3G7WA 2V3TA 2ZNUA 4U4XA 3K4UA 1DPPA 4RXLA 2GRVA 2O51A 3THIA 4WEDA 3H3GA 3TELA 2P1SA 3A3UA 1JW4A 3VVDA 1FQBA 4YICA 2Z8DA 2O68A 3FATA 3V83A 4AB6A 3C32A 4I8CA 5EYFA 3CFLA 1FQFA 4XXUA 1R1NA 3T9UA 4GL8A 2F5XA 4XKNA 3MVZA 3C31A 4N13A 1LFHA 4DLDA 3EHSA 1IXIA 4NE4A 4JDFA 3IOWA 1VE4A 1SBPA 1O64A 5AA4A 3ILUB 4U21A 3IOTA 3BBRA 4R9FA 4KCDA 3K01A 5H8HA 4H5GA 4EF2A 1NH7A 3M8UA 1Y3NA 3PMXA 2QS1A 2O1LA 1DSNA 2Y7PA 1YAEA 5I56A 4PFTA 2THIA 1MXYA 2HZKA 4OENA 5AA4B 4F2OA 4G8NA 2NVUB 4IO7A 3L6GA 5H8HB 3QSLA 1QUKA 3MAMA 3CG1A 5ITOA 4F18A 2XD3A 2Y7KA 5I56B 1LSTA 3SDFA 1SI0A 4G4PA 3VV5A 3MP1A 3S9NC 1L5TA 4F29A 4RK2A 1LCTA 5ICQA 4H8IA 4LATA 3TAJA 3TODA 2XX7A 4G2ZA 2XX8A 4R6KA 2Q9TA 2QL3A 3O29A 1LGBC 3IB0A 4R74A 1H45A 2O84X 3RLFE 1URSA 2RCAA 1FQEA 1B1HA 4F31B 3RQTA 4QFLA 2DVCA 3KSJA 1P1WA 4QRZA 3O6HA 2RC8A 2HZLA 3K6XA 4IB2A 1N7WA 4NF5A 3TYHA 1FTMA 3F11A 2ZYOA 2QMWA 4ZEIA 4F1VA 3MZBA 4ZS9A 1FQAA 1NNKA 2F7AA 1OIBA 4YZZA 1OLCA 1QULA 3VLWA 1SW5A 2VGQA 4N07A 3FXUA 3G3JA 4UA8A 4ECFA 2HEUA 2QJEA 2ABHA 1Y3QA 4NF5B 2RCBA 1JVYA 5BWJA 3IOUA 4Q5TA 2Q88A 4HCYA 4YKJA 4BDNA 3R26A 4P0IA 2CZLA 1B3HA 1I6BA 2F6PA 1FQCA 3BKIB 4IGRA 4JBZA 3UIFA 5TP9A 1FQDA 2XXXA 1DMBA 4KQPA 3MZ9A 4WXJA 3FIRA 3S9EA 3TZAA 3SEVA 2DYXA 2RINA 5AA2D 2YJPA 2DE4A 1IITA 2DWHA 1NL5A 2Z8EA 3KN8A 3G3GA 3WAFA 2I3WA 5L9SA 4IO6A 4ISUA 4YKPA 5TP9B 3T96B 4XKRA 4EQ7A 5AA1A 2DS9A 2HFBA 1PC3A 2I58A 4RK9A 2G93A 2AYSA 4PP0A 1TT1A 2R71A 3PPRA 4KD5A 3EN3A 3B6QA 5CI5A 4DIGA 4TLMB 1ZBMA 2OZZA 4MLVA 3TTLA 3G3KA 3N26A 3RTFB 4O3AA 2E0SA 4RYAA 5L9MA 3RY3A 5JEIA 3GXAA 3T9XB 1MH4A 3K6WA 3USDA 3ONMA 4LONB 1Q1KA 2O6AA 2FYIA 3PUXE 3SEYA 4HS7A 3IR1A 3LSXA 3ZSFA 1B5JA 4EXLA 4YB5A 3W9WA 3N94A 3JZJA 1P99A 4Q0CA 3KJTA 2GFEA 4H65A 2DXYA 3LC8A 1BTJA 1ZKBA 1B1XA 2UYEA 5FHNA 3H6VA 4QHQA 4QFPA 2V25A 1I6QA 1O7TA 1B2HA 1N76A 2GH9A 3TEPA 4GL0A 4WEPA 3WAEA 1ATGA 1P1QA 3HSTA 5FHOA 2F97A 4H5FA 1B05A 4ELPA 1M5DA 1MPBA 3Q26A 1GV8A 3N6TA 4WKMA 4EQBA 1Y9UA 3K1MA 1MPDA 4FECA 4ONYA 4ELRA 2QS4A 4RPOA 1BP5A 3EQ1A 4IY5A 4FJPA 3C35A 3TTNA 4YMAA 3QAXA 3K02A 2OJTA 4QF9A 3W15C 3O28A 3GLBA 3QXMA 4JWXA 4KI0E 2I6EA 3TMGA 5H8FA 2WKYA 4FEDA 3TCGA 1OVBA 3CRBA 2GHBA 1AOVA 3LUYA 4FIMA 2RC7A 1QJMA 3U93A 2D21A 1AMFA 4P11A 1PB9A 1I69A 2H9BA 3HN0A 5H8FB 3OEMA 3PUVE 2RC9A 3M3KA 2O1MA 3RTWB 1A54A 3DLNA 4BDLA 4MH5A 2NOOA 4OQOA 4PFUA 2H99A 4MLQA 3D4CA 2ZYNA 2ALUA 2V3UA 3EHTA 4DZ1A 3OOAA 2OCUA 2M8CA 4ZEFA 1US4A 2ZMBA 5HPQA 5CMMA 3PUWE 1EZ9A 5AA2A 3MP8A 5DYHA 3VLVA 3K1NA 4H6DA 2F34A 4R72A 4R6HA 4KPTA 4OMBA 3TPAA 1LBBA 4PQJA 4OTEA 4KCCA 5AA2B 4LA9A 5H8SA 4AB5A 4TQUQ 4AQ4A 4IO3A 1IZ1A 3MPLA 1H3DA 3H4ZA 3N6UA 3IO6A 3LR1A 2AL4A 1MY2A 1ZTYA 4POXA 3SETA 2XXYA 3C36A 3IORA 3O6IA 1P1NA 1HSEA 4O3CA 1LFIA 5CM6A 3IO4A 1H76A 1M5BA 3LBSA 3QYTA 3Q25A 4G68A 4OHNA 3V5AA 1VFDA 3DP8A 1NMUA 1Y4TA 3CFXA 3E4RA 1DOTA 4F22A 1DTZA 2UVJA 1UIUA 4M1VA 1WVJA 3KOTA 5DVJA 3TFLA 3GBBA 3OELA 1DTGA 1FW0A 5B7DA 4IO5A 3L6HA 3FASA 3KOSA 3IX1A 1VR5A 4RNSA 3MJNA 4G68B 5AE4A 3R6UA 3IAZA 3H03A 3I3VA 2DWAA 4JSOA 3LSFB 4K3FA 2F35A 2H25A 4TOZA 1B7ZA 1PBQA 1R9LA 1F9BA 2E1SA 4F3BA 4LQ2A 3OO6A 3Q27A 1URGA 2I0BA 5K2YA 4XKQA 1N84A 5EHSA 1IEJA 3PU5A 3O97A 2UVHA 3EHUA 3PD8A 1OQGA 3KZGA 5FHMA 3BFTA 4G77A 4LQ5A 3SERA 1B6HA 3HO7A 4R2BA 1BIYA 3G3IA 1PB8A 3HPIA 3PD9A 3MUQA 2AL5A 4OESA 3FVOA 3O9PA 4LUBA 3E13X 4OFJA 3U92A 3FZVA 1IQ7A 1USYE 4GD5A 3KG2A 1P1UA 4U22A 1VSOA 4IGTA 1AH5A 1YTVA 3T66A 2DSFA 1WODA 1FTOA 2XXWA 2HAUA 1A55A 1IXCA 2R6GE 1GTKA 2AIXA 2DXRA 3HHGA 1QUJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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