2RC9A

Crystal structure of the nr3a ligand binding core complex with acpc at 1.96 angstrom resolution
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
287
structure length
287
Chain Sequence
KLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAGQLCLDPMTNDSSMLDRLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEQLAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLSGTANMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRGTELSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVQYLKNDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTSNISELISQYKSHGFMDVLHDKWYKVV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit 3A
publication title Molecular mechanism of ligand recognition by NR3 subtype glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 98
structure length 287
sequence length 287
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rc9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rc9A02
3O6GA 1ZJLA 1HSJA 2XXUA 2G29A 3PUZE 2O1LA 3KFMA 4QFLA 3SETA 2R9JA 4LONB 5AA2D 2GHBA 2D21A 3RLFE 1EZOA 2GHAA 2F7CA 1USYE 2CZLA 4U23A 4C0RA 1VR5A 3USDA 5CC2A 1SW1A 3VFJA 1N3WA 4XKNA 4XKQA 3OENA 5H8HA 1QKAA 1IZ1A 4NF8B 2X7PA 3TELA 2FYIA 3RTFB 1IQ7A 5DVJA 5I2KB 2VP1A 3A09A 4LP2B 1I6BA 1B7ZA 1OMPA 2OCUA 2RC7A 3HHFA 3TAJA 3PUWE 3T9XB 2Q8JA 3KSJA 3G3FA 2B65A 3FJMA 3CVGA 3G3KA 2UVGA 2P0SA 2V3UA 2E1SA 2PX1A 1I6QA 1P1OA 4H5FA 2ZYOA 4F3BA 1FTLA 1B2HA 4G8NA 4F39A 3C35A 4NWDA 3OSRA 4E0WA 2LAOA 3T9HB 4TLMB 5M2VA 1DTZA 5TPAA 4N13A 4OZ9A 4Z0IA 2RF1A 2QS2A 3DELB 1MQGA 2RKMA 3DP6A 3K6XA 3AXFA 3FVKA 4U2RA 4ZEFA 1MG1A 4F1VA 3TPAA 1URGA 4LQ2A 4TLLB 3H4ZA 3BFTA 4U4SA 1MM7A 4EQBA 4MLQA 1A8EA 1IXHA 3GZGA 1LBBA 3MPKA 5HM4B 2DWIA 3O6HA 3KN3A 3H03A 2XXHA 1QKBA 1SYHA 4EUOA 4XKRA 3UA8A 1MY0A 4RK2A 4KYEA 3V5AA 4OENA 3EN3A 3LR1A 2I4BA 3Q26A 4GF8A 5CMCA 4QFKA 2NXOA 2AYSA 1ZIUA 1H43A 3EHTA 2X7QA 1LB8A 4IGRA 2GRVA 2G93A 1I6AA 3G3HA 3U94A 2YPNA 3OD7A 1B7UA 3H6TA 4ZEBA 4JWOA 3W9VA 3IAZA 3VDFA 4XKPA 5KZTA 2B3BA 4AB6A 1LFIA 3G3GA 1MRPA 1YCJA 1YAEA 2Q89A 2R71A 3C34A 5HBCA 1B4ZA 2H5YA 1POY1 2O51A 3ZS6A 1JNFA 3U1OA 3Q29A 1XS5A 3D4CA 1POTA 2V3TA 2HAUA 3OXNA 3T22A 4X9TA 3EHSA 3SDFA 3CSGA 3R6UA 5I57B 2OWSA 3IB2A 1SQYA 2H9BA 1NKXA 1B5IA 4PFUA 1IITA 4ESWA 4GWOA 4LATA 2IEEA 3FJ7A 4ELRA 1UQWA 3TCGA 3JYRA 1M5BA 5F7VA 1M5DA 4OERA 1JETA 4R6HA 4G4PA 3MBPA 1B58A 4GRKA 3PUVE 5TU0A 1XVXA 5AA4A 1FTMA 3QXMA 2QMXA 3VV5A 3TTKA 5IAIA 2OBGA 1M5EA 2Q2AA 1QJMA 3PGFA 3H3GA 1OLCA 3M3KA 1AH5A 2ALUA 3VVEA 3K02A 2ONRA 4JSOA 1S9TA 5ICQA 3B7DA 1LAHE 4ESXA 4MLVA 2UYEA 2PYYA 4GXAA 3N26A 4OETA 3U72A 3KN7A 4ZDMA 3K6VA 3UGWA 1O7TA 4PFTA 5BWJA 1UTHB 3CR9A 1N7XA 4NF6B 1R9QA 2Z23A 1JW4A 4WEPA 3C32A 4P0GA 1II5A 1NMUA 3S9LC 3TCFA 3KJTA 4Q8RA 4RXLA 2M8CA 4DXUA 5H8NB 5JTYB 2D5WA 1F9BA 4GFRA 1M5FA 3O6IA 1FQFA 4YKKA 3C36A 4R75A 2QRYA 2Y84A 3VXCA 5AA2A 3E3KA 5B7DA 4NF5B 2RCAA 4PE5B 1FQCA 1A55A 3UP9A 2UXAA 4ZZEA 3MC2A 3RY3A 1PBPA 1B05A 1MQIA 4LVQA 1H76A 2H25A 1BTJA 3K0VA 3K4UA 4YICA 1YPNA 4LA9A 3SEXA 2RCBA 3RN8A 3I5OA 3DM0A 2ONSA 1HSEA 1BLFA 2V93A 3C9HA 3KEIA 3ZKKA 1NL5A 3PMVA 5JK4A 3RNNA 4IB2A 3IORA 1DSNA 4IO7A 3S9NC 1LAFE 3PD9A 3T96B 1B3EA 1DOTA 3V89B 1ZTYA 2XX9A 1AIVA 1ZLQA 3O66A 4GIZA 1US5A 2I4CA 4XIGQ 4G2ZA 2Z22A 1PB8A 2VD3A 4YKPA 3TQLA 4E0XA 2YLNA 4ND9A 5IKBA 1ATGA 3EHUA 1O63A 3KBRA 4RYAA 1B4HA 4NF8A 2ZXTA 4Z7EA 4YB5A 3MUQA 2KLFA 2O6AA 3FUZA 5ICTA 1IUDA 3U93A 4TOZA 5I2KA 5KDTB 2PVUA 4OHNA 1LCTA 1ZBMA 4XXUA 1P1NA 1PB7A 1LGBC 5K2YA 3O28A 3HPIA 3QK6A 1B40A 3WAEA 1DTGA 1DMBA 4HCYA 3TFLA 1SBPA 1SI1A 3RUMA 2RINA 5I2NB 3G7WA 1EZPA 3T66A 2P1SA 3SEUA 3K1MA 3PPRA 3PPNA 5KCJA 3K01A 4DCXA 4AQ4A 2FNCA 4EF2A 4MH5A 4JWYA 1LBCA 1EZ9A 1MY3A 4F3GA 3OELA 4FATA 4L17A 4MBPA 2HQ0A 2Y7RA 2F34A 2OK2A 4YU0A 4UACA 2V84A 4NEDA 1UIUA 3N6TA 4DLDA 2VOZA 3QAXA 1B7HA 1B0LA 1MY4A 1O64A 1B51A 1QULA 1GTKA 3FIRA 1ZKBA 4AB5A 5I56B 1B3HA 3ONMA 1D4NA 1JEUA 4HTGA 1IIWA 3FVGA 4Q30B 3FD3A 3B6QA 3SERA 4FIMA 1FQDA 1MPDA 4RK9A 2Q2CA 3U8QA 3FXUA 3LSFB 4ISUA 1LFHA 4QSEA 2YJPA 4QFPA 1XVYA 1AOVA 1FW0A 5H8QB 1PEBA 3TEPA 3TZAA 2HZLA 4KYSA 4ZS9A 3PUYE 3I6VA 2DWJA 4OTEA 4JDFA 4I9DA 4GVOA 3FVNA 3OSQA 4R9FA 3UORA 2F35A 2Y7KA 2DVCA 2DXYA 3VLWA 2DYXA 4R6YA 3F11A 3A3UA 1PBQA 1NNTA 1JEVA 1MY1A 5DEXB 4DCYA 4R73A 4H8IA 4TQUQ 1D9VA 5CRYA 5DTBA 3S9MC 4KPTA 1MQDA 3TTRA 4FAJA 2ZNSA 3FXQA 2PT2A 4OEUA 4Q0CA 3RT8A 1H45A 2ZNTA 4IO5A 4X1BA 1SW5A 3H6WA 5I57A 1P99A 3OMBA 3W9WA 2XD3A 2HFBA 1MXUA 4MF3A 1FTOA 3E4RA 3GLBA 3GBBA 1Z7NE 3PUXE 1Q35A 2QSXA 2R6GE 3E9XA 4IY5A 3IJOB 5TP9B 4OESA 3TYHA 3HO7A 3MP1A 1LLSA 1MXWA 3R7XA 5BUUA 2V3QA 2XXRA 5I84A 2O1MA 4ONYA 4F31B 3E13X 2XHDA 3PPOA 1R9LA 2F7BA 1QVSA 1JQFA 3CG3A 2HZKA 2O68A 4DXBA 1MXXA 5CBRA 2O7IA 5DYHA 1TFAA 4LUBA 3FGSA 4OYVA 5FHMA 3TKDA 3MJNA 1Y4CA 4RPOA 1BIYA 3EF7A 1MM6A 2I0BA 4G8HA 4HCWA 4G77A 3IO6A 4EQ7A 1FTJA 2HCAA 3BKIB 2DQVA 4F1UA 4MFIA 1LAGE 3OO9A 1Y1MA 4POWA 3V83A 3CG1A 4KI0E 1N04A 5ELVA 2VD2A 3VVFA 3N94A 1S7YA 4FECA 4FEBA 3VVDA 1D3KA 1UTHA 4YMBA 4H0WA 4F29A 2F8DA 2V25A 1N3XA 4H65A 4LZ7A 4NF6A 3C33A 5H8FA 4BDOA 3KGCA 4O3CA 1N84A 1CE2A 2AL5A 2W7YA 3MVYA 3O29A 2Z8DA 4K3FA 3KOSA 2RC8A 4ELQA 3TTLA 3SEWA 3TODA 3IOWA 2Q88A 1WVJA 1QW0A 5H8NA 5JTYA 4IO6A 1MPCA 2Z8FA 3OOAA 4ZE9A 1SW4A 3FZVA 3H6VA 4F2QA 4NF5A 1GGGA 2AL4A 2OJTA 1Z7ME 4QF9A 3FJGA 3QUJA 4H67A 4OVJA 3MVZA 3HSTA 5DT6A 4I1DA 2OZZA 1US4A 2B3FA 1B5HA 4UA8A 2H98A 2QMWA 4THIA 4FEDA 1SD3A 3O2AA 3RTWB 1ANFA 1R6ZA 3QYTA 5LOMA 2ZYKA 3FATA 3IOVA 3MAMA 3A3CA 5FHNA 5I59B 3M8UA 3QSLA 3R26A 3DLNA 3T93B 4QFOA 1MDP1 2Y7IA 2XXTA 4HW8A 3LUYA 4ELPA 2XX7A 4O3BA 1XHYA 2ESNA 3CSBA 1ZU0A 4G68B 2DWAA 3PMWA 4GL0A 2AIXA 4NMYA 4ZECA 4P0IA 3KN8A 2Q9TA 1B3GA 2ZYNA 4U22A 1B6HA 5KDTA 3MQ9A 4PFWA 5EHMA 1GV8A 3OO6A 3FXRA 5EHSA 5L9OA 1B3LA 2H4IA 4GOTA 5I2NA 2FA7A 4OFOA 4JBZA 1Y4TA 2UYFA 3BFUA 4YB6A 4RY1A 1A8FA 3ILTB 3Q25A 1SDXA 5L9MA 1A99A 1NH8A 4DXCA 3QUFA 3SKPA 1OQHA 3MZ1A 5JEIA 5A5XB 3CFLA 4NF4B 2DOJA 3PV0E 1MDQA 4OEVA 4YZZA 3M3LA 4GQOA 1USYH 5I58B 4YMAA 1HSLA 2VHAA 3HCQA 1Y3QA 2WKYA 1VE4A 4PP0A 3GXAA 4IGTA 4PETA 2DXRA 1OLAA 3IOTA 3K2DA 2UVHA 4U1OA 4ELOA 4R74A 2X26A 1N76A 4ZEIA 2NOOA 3WAFA 4IY6A 4IO4A 5H8SA 1B1XA 2F6GA 4RNSA 5I56A 2F6PA 2A5TB 5CM6A 5CMMA 4I62A 1J1NA 1FQAA 3KG2A 3KJ7A 1MY2A 1MS7A 3DP8A 1Y3PA 1YTVA 3S2VA 4QHQA 2O69A 4OFLA 3SEVA 2GH9A 5H8QA 1TT1A 3L6GA 1MQJA 1RYXA 4BDNA 3O97A 1OVBA 3Q27A 2PBWA 2XXIA 4KQPA 3SEYA 1SI0A 4LZ5A 4KFQA 1H3DA 2HEUA 5DEXA 4JWXA 3RT6B 2QS1A 3ECRA 1P1UA 1FTKA 2F36A 3LSXA 1NNFA 5J1DA 3CI8A 2ANJA 3C31A 3IB1A 4M1VA 1CB6A 2OLBA 1JVXA 4HS7A 4FJPA 1TFDA 1SVXB 2DE2A 2XD2A 1B0HA 3BBRA 4DDDA 4X48A 3IOUA 2DVZA 3MPLA 2HXWA 4JB7A 1T0KA 4YAHX 4H5GA 2UVIA 2I49A 5TP9A 3VLVA 3DP4A 3K1PA 4R6KA 5KCJB 1UTBB 3CIJA 4GXSB 1LB9A 1BP5A 3MZBA 3GBAA 4EXKA 5AA1A 4NWCA 4G68C 4EDPA 1PDAA 3PPQA 4ECFA 2QL3A 2I58A 3IO4A 3RPWA 1TXFA 3U92A 5FHOA 3D4GA 4OXVA 4EQ9A 4XTCQ 1DPPA 1KWHA 1FQEA 4U21A 4YKJA 4KYDA 4QSCA 4RA1A 4M4GA 2DWHA 5H8HB 1IXCA 4DE8A 1Y1ZA 2QS3A 1OQGA 5F1QA 3PPPA 5CI5A 2GFEA 1N0TA 3LBSA 1LCFA 1JVYA 5L8DA 1VFDA 2DE3A 2DSFA 2UVJA 4F18A 1NFTA 4QRZA 3TDJA 1DPEA 3SESA 1Y9UA 4NE4A 3JZJA 1NNPA 4Q5TA 3RGYA 1ELJA 2XXYA 3TTMA 4P11A 3EQ1A 1QUIA 3EPEA 3MW0A 3M3FA 3IJXB 3S4UA 4DIGA 3CFZA 3CRBA 2F78A 4RPNA 3N6UA 4PQJA 5FTHA 3KOTA 3MVXA 2F7AA 5TPAB 1WDNA 1MQHA 1Q1KA 3MWBA 3ZSFA 5CBSA 1B5JA 1IXGA 1WODA 4F3PA 1P1WA 4U4XA 5B70A 3THIA 2E0SA 3L6HA 2NVUB 3S9EA 3IX1A 1A7LA 5EYFA 2H99A 4GLIA 3K00A 4YKIA 1NH7A 3RQTA 4OQOA 1AMFA 1AL3A 2QS4A 5L9SA 3OO7A 1B32A 1MPBA 1JW5A 4JXIA 4ZE8A 4I8CA 3K1NA 4N07A 3JV9A 1XOCA 2THIA 2CMOA 2QJEA 1VSOA 3K6UA 2XXVA 4BDLA 4R2BA 3P7IA 5I59A 4C1TA 4G8MA 3VE1B 4ZEDA 1NNKA 1D9YA 3HN0A 3VXBA 1B52A 4POXA 5DVFA 2IA4A 1MXVA 4H8JA 3TQWA 2ABHA 2BJJX 2F5XA 3ILUB 1A40A 3W15C 3MZ9A 4QSDA 1XT8A 3ODBA 2ZYMA 3LC8A 3FASA 1BKAA 4G68A 3IB0A 3QIMA 1A54A 2XXWA 3KSXA 4FE8A 3H6UA 3UIFA 1TWYA 3IR1A 1B3FA 3I3VA 3HHGA 4QFNA 3TMGA 2ONKE 1P1QA 1SYIA 3TCHA 1Y20A 4GL8A 5CMBA 1B9JA 4X1DA 2I48A 1Y3NA 3O9PA 3V8XB 4R72A 3MVWA 1MXZA 2O7UA 3LSWA 4R2FA 2XXXA 4OMBA 3H7MA 2I6EA 1PB9A 2O84X 2I0CA 2I3WA 2NUVA 5AA3A 1L5TA 3T9UA 1URSA 4R9GA 2REJA 4F22A 1LSTA 5A5XA 3OO8A 1EH3A 3PMXA 4NF4A 4EF1A 2DE4A 1FCKA 5ISUA 4F2OA 5I58A 2XXPA 1M5CA 3B6WA 1R1NA 4KCCA 3FV2A 3IK6B 1OVTA 5H8FB 1RKMA 2Y7WA 2P2AA 1ZMGA 3PD8A 4WKMA 4LQ5A 4ZEKA 1VFEA 1N7WA 3TTNA 4F3SA 5DVIA 3K6WA 2NWJA 3MP8A 4EXLA 3G3IA 2RC9A 4FORA 3G3JA 5AA4B 4F1YA 4KHZE 4LZ8A 1PC3A 1QUJA 3FV1A 2PT1A 2A5TA 1I69A 4YB7A 5ITPA 3FVOA 3CFXA 4OFJA 4WXJA 5CMKA 4H6DA 3H06B 3IL1B 3LSLA 3VLUA 4BLAA 3OEKA 3Q28A 2I3VA 4OWDA 1IEJA 1H44A 4C1UA 3T9VA 1MXYA 4F19A 2PMSA 2Y7PA 4BDRA 3ZKLA 5HPQA 4IO3A 4KD5A 3PU5A 3UK4A 1LAXA 2ZMBA 1JW1A 2Z8EA 3B6TA 4DZ1A 3TUSA 2A5SA 1XC1A 4KCDA 2VGQA 2HAVA 5ITOA 3N5LA 4ZZAA 1GVCA 1FQBA 4NTLA 1GR2A 2ZNUA 1SW2A 2OWTA 2XX8A 3MP6A 3UN6A 4RJZA 1URDA 4O3AA 4BDQA 4KR5A 1QUKA 1IXIA 4JSDA 2DS9A 5K2XA 1S50A 5AA2B 1UIVA 2QPQA 1RYOA 1B1HA 4H1XA 2F97A 4GD5A 4WEDA 4N6PA 1B46A 4BDMA 5AE4A 4IO2A 1LFGA 2XXQA 2D3IA 2DP8A 1OIBA 3KZGA 4PFYA 3OEMA 3HV1A 1MH4A 5FTIA 1UTBA 3C4MA 1EU8A 4U1ZA 1MH3A 2REGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O6GA 1ZJLA 1HSJA 2XXUA 4O7MA 2G29A 3PUZE 2O1LA 3KFMA 4QFLA 3SETA 2R9JA 4LONB 5AA2D 3LV0A 2GHBA 2D21A 3RLFE 4PF6A 1EZOA 2GHAA 2F7CA 1USYE 3EKIA 2CZLA 1LBVA 4U23A 4C0RA 1VR5A 3USDA 2F3BA 4N4UA 5CC2A 1SW1A 3VFJA 1N3WA 4PTKA 4XKNA 4XKQA 4NF0A 3OENA 5H8HA 1QKAA 1IZ1A 4NF8B 2X7PA 3TELA 2FYIA 3RTFB 1IQ7A 5DVJA 5I2KB 2VP1A 3A09A 4LP2B 1I6BA 1B7ZA 1OMPA 2OCUA 2RC7A 3HHFA 3TAJA 3PUWE 4AS5A 3T9XB 2Q8JA 3KSJA 2XWIA 3G3FA 4NHBA 2Q8MA 2B65A 3FJMA 3CVGA 3G3KA 2UVGA 2P0SA 2V3UA 2E1SA 2PX1A 1I6QA 4JVDA 1P1OA 4H5FA 1NI9A 2ZYOA 4F3BA 1FTLA 1B2HA 2L5VA 4GWSA 4G8NA 3C35A 4NWDA 4F39A 3OSRA 4E0WA 2LAOA 4H45A 3T9HB 4TLMB 5M2VA 1NUXA 1DTZA 5TPAA 4N13A 2FVZA 4OZ9A 4Z0IA 2RF1A 2QS2A 3DELB 1MQGA 2RKMA 3DP6A 3K6XA 3AXFA 3FVKA 4U2RA 4ZEFA 1MG1A 4F1VA 3TPAA 1URGA 4LQ2A 4OVPA 4TLLB 3H4ZA 3BFTA 4U4SA 1MM7A 4EQBA 4MLQA 1A8EA 1IXHA 3GZGA 1LBBA 4MJOA 3MPKA 5HM4B 2DWIA 3O6HA 3KN3A 3H03A 2XXHA 1QKBA 1SYHA 4EUOA 4XKRA 3UA8A 1MY0A 4RK2A 1FPGA 4KYEA 3V5AA 3FXBA 4OENA 3EN3A 3LR1A 2I4BA 3Q26A 4GF8A 5CMCA 4P9KA 4QFKA 2NXOA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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