2RC9A

Crystal structure of the nr3a ligand binding core complex with acpc at 1.96 angstrom resolution
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
287
structure length
287
Chain Sequence
KLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAGQLCLDPMTNDSSMLDRLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEQLAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLSGTANMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRGTELSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVQYLKNDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTSNISELISQYKSHGFMDVLHDKWYKVV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit 3A
publication title Molecular mechanism of ligand recognition by NR3 subtype glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 98
structure length 287
sequence length 287
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rc9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rc9A02
4YKPA 5ITOA 1XT8A 3PUVE 1Y1ZA 2RCBA 4XKPA 3RTFB 3C4MA 1DMBA 3HSTA 2PT2A 3IB0A 1VE4A 4Q8RA 3IB2A 1S50A 5A5XA 1UIVA 1CB6A 5JK4A 2D3IA 4NF5B 4OEUA 3MZ1A 1LFGA 4F39A 4OHNA 1IIWA 4OFLA 4FATA 1A8FA 2I3VA 2ONSA 4GFRA 3RNNA 1NNKA 4RYAA 2E0SA 3MP1A 3O66A 3FD3A 3RUMA 2W7YA 2F7AA 1TFAA 4GQOA 3B6WA 1SI1A 4O3CA 5DVJA 4ELPA 1MXYA 3H6UA 4FJPA 3T9XB 5L9MA 2GHBA 3OSQA 4PQJA 5I58B 2XD3A 3U92A 1PB7A 3M3LA 4H5GA 5CMBA 1B52A 1PB9A 2HAUA 1B9JA 3V83A 4MFIA 4PFYA 3MAMA 4JSOA 1ZU0A 1II5A 4OERA 5JEIA 1PEBA 2VD3A 3KZGA 1R9QA 5DEXA 1YTVA 4QRZA 1H76A 5LOMA 3SEYA 4E0WA 1N84A 3FVNA 4NF6B 4C1UA 2V93A 1H45A 2DOJA 1QUKA 3MC2A 5EHSA 3MBPA 2H99A 1MY2A 2QRYA 1LAHE 3MVXA 2XXHA 3OEMA 1B0HA 3TUSA 3AXFA 3EHUA 4DCXA 4QSCA 1LGBC 2DXYA 3K6VA 1TXFA 3LSWA 1A99A 4G68B 1BLFA 3RQTA 4QSEA 4KCDA 3IK6B 4DXCA 1NL5A 1URSA 1LAXA 2Q2AA 2R6GE 1ATGA 4WKMA 5H8FA 4ZDMA 1MY3A 3VFJA 2I3WA 3HHFA 2YJPA 5TU0A 4IGTA 3K1NA 1FTKA 4ZEDA 3O2AA 1N7WA 4GL8A 2HEUA 1JW5A 4OXVA 1IEJA 4PFTA 3HV1A 4QFPA 4I9DA 2VP1A 3ZSFA 4RNSA 3FXQA 1P1QA 2GHAA 3JZJA 4IO7A 1Y20A 3S9MC 4RK9A 4KI0E 1JQFA 3U94A 4OETA 4EUOA 2DWAA 2P0SA 2ONRA 1PBQA 1FTOA 4ZEIA 3A3CA 2B3BA 4ZE9A 3BBRA 4N07A 3ZKKA 3MPLA 3ONMA 4IO2A 4XKNA 4ECFA 3VXBA 1D4NA 4WEDA 5KDTA 4ND9A 1LCTA 2UVIA 4GF8A 5F7VA 1SW1A 3O9PA 5KCJB 4Z7EA 2F78A 2F35A 4H0WA 3FV2A 3EQ1A 3H03A 5A5XB 5I2KA 1LSTA 3ZKLA 4IB2A 2DWJA 2GRVA 4G77A 4MBPA 1MH3A 3MWBA 5AA4A 3TTNA 4F31B 3QXMA 2I4BA 3LSLA 1SI0A 4AB6A 4R6HA 3S2VA 1JEUA 2OWTA 4QSDA 1XHYA 3LSXA 3TPAA 4G2ZA 3RY3A 4YKJA 3T22A 1B5JA 3UP9A 3SEXA 3PGFA 3MVZA 1LFIA 2B65A 3A3UA 4GOTA 4TLLB 3H6VA 4OQOA 3DP4A 3KSXA 4OMBA 1B40A 2V3UA 2UXAA 3FJGA 3Q28A 1USYE 3IL1B 4PP0A 3OSRA 2H9BA 5DYHA 3QUJA 3WAEA 1T0KA 3TZAA 4GWOA 5DEXB 4EQBA 1SQYA 1IZ1A 3T93B 3G7WA 3O6HA 4ISUA 1H3DA 4K3FA 1Y3PA 4H8IA 3K1PA 1MXZA 1M5FA 2YPNA 3DM0A 5ICTA 3LSFB 2UYEA 3LBSA 1B7HA 3CIJA 3LUYA 2R9JA 3K0VA 1LFHA 3H3GA 4JXIA 3SKPA 2HZLA 3KJ7A 2Z8EA 1B6HA 5J1DA 2ONKE 3RT6B 5BUUA 2VGQA 1DTGA 3PPNA 5CMMA 3U1OA 3K02A 3C34A 5ITPA 3MVWA 2A5SA 2OZZA 3MPKA 1MM6A 4X1BA 3VLWA 5H8NA 2F6PA 2FA7A 4R72A 1MXVA 4ESXA 4U21A 5I84A 4PFWA 2BJJX 2F7BA 5H8FB 3TCFA 3FV1A 1QJMA 4EQ7A 3M3KA 4POXA 2ZMBA 3T96B 4GIZA 4R2FA 4F1YA 2Y7PA 4YB6A 3TTKA 1HSJA 4U23A 4RA1A 3BFTA 3IO4A 3PD8A 3TQLA 3B6TA 2DP8A 4FE8A 3W9VA 4LP2B 2WKYA 4OFJA 4JWOA 2IEEA 4ZE8A 2Z8FA 3D4GA 3W9WA 5L9OA 3S4UA 3PPQA 3N26A 3K00A 4TQUQ 4F3SA 4ZEFA 4IO5A 1UTBA 1OIBA 5CMCA 4DZ1A 3PMVA 4R2BA 5KDTB 4IY5A 3ECRA 3U8QA 2REGA 5I2NA 4QFNA 5TP9A 1URGA 4EDPA 4KFQA 4RXLA 1Y3QA 4LA9A 5H8HA 1Q35A 3PPRA 5EYFA 1GTKA 4HCYA 1MPDA 3UA8A 3K01A 1BP5A 3CR9A 4MLVA 1QKBA 5I2KB 3UK4A 3K1MA 4RJZA 4F3GA 4TLMB 1CE2A 3OO9A 4IO6A 4P0GA 5AA4B 1PBPA 2XXQA 1LCFA 3FJ7A 2G29A 1MQGA 3G3HA 4NF8A 3LR1A 3UN6A 1FQEA 4H5FA 1ZKBA 1NMUA 4C0RA 1N3WA 3FATA 1MQIA 3KN8A 1FW0A 3FJMA 2O1LA 1A55A 2LAOA 2OJTA 2V3TA 2B3FA 1RKMA 1US5A 3EHSA 1PC3A 5I56A 1HSEA 1ELJA 3OD7A 4UACA 1B4ZA 3H7MA 2OK2A 1QKAA 1DOTA 2QMXA 1ZIUA 1ZMGA 2UVJA 2X7PA 2IA4A 1OVBA 2CMOA 1JETA 4KCCA 1VFEA 2Y7WA 3PUWE 3TCGA 2RF1A 3A09A 1PB8A 2F7CA 3UIFA 2FYIA 1MS7A 2XXPA 3K4UA 1UQWA 4LATA 1UTHA 2R71A 4WXJA 3KOSA 3TYHA 4MH5A 4AB5A 3KN3A 3ZS6A 3OEKA 4H8JA 1D9VA 1LB8A 4F2OA 2OBGA 1B4HA 5I57B 1FCKA 1P1UA 4I62A 4I1DA 4EF1A 1P1WA 1I6BA 3PPOA 3SERA 2D21A 1NNFA 3FIRA 3MJNA 4IGRA 3VDFA 5H8NB 3OOAA 3IJOB 4BDQA 1TT1A 3TAJA 5H8QA 4P11A 1OQGA 5HM4B 4Q0CA 1ZBMA 4QF9A 1XOCA 3U93A 3L6GA 4I8CA 4JWXA 2HCAA 3QYTA 3C32A 1B0LA 5CRYA 4KYEA 1WODA 3R6UA 2D5WA 4XTCQ 1Y4CA 4U4XA 4DCYA 1XVXA 3Q26A 2DS9A 4Q30B 4EXLA 1JEVA 2RC7A 4M4GA 2DYXA 5AE4A 2H4IA 3BKIB 4NWDA 5DVIA 1TWYA 2XX8A 3EF7A 4EF2A 3EPEA 1I6QA 4ELOA 3OO8A 3KFMA 5FHNA 1UTBB 4N6PA 4ONYA 1BIYA 3FASA 4U22A 4JB7A 4F1VA 2ZYNA 4O3AA 3E13X 1FQFA 2XXRA 5I2NB 1YPNA 2F5XA 3RTWB 4G8NA 3MQ9A 5H8HB 3C9HA 2P2AA 4F1UA 4HCWA 4NEDA 4LQ5A 5DT6A 1MXXA 1JVXA 4OENA 4LVQA 3TTLA 3GZGA 3GLBA 2V3QA 2VOZA 4X9TA 1VSOA 4H65A 3CI8A 3T9HB 3MP6A 1EH3A 5EHMA 4GRKA 3O6GA 1LLSA 1IXGA 1NH8A 4QHQA 1B5HA 2Q88A 1A8EA 4OZ9A 5AA2D 4NF8B 2DXRA 3CSBA 3IJXB 3S9NC 1O63A 4R9GA 3VVDA 4DDDA 4POWA 3B6QA 4F19A 1M5DA 2RC8A 2VHAA 5CBSA 1GR2A 3RGYA 4DXBA 5DTBA 4OWDA 2XXWA 2I0CA 1BTJA 1POY1 4PFUA 1GV8A 3OO7A 4XKRA 2QS3A 2Z22A 3IB1A 1YCJA 5I56B 5B70A 4GLIA 3K6UA 1OLAA 2QMWA 4NF5A 4E0XA 4G8HA 2X7QA 5L9SA 1S7YA 4THIA 4RPNA 3S9LC 3IR1A 4KHZE 2PBWA 4N13A 1B1HA 3PMWA 5AA2A 3MUQA 3FVKA 4H1XA 2V25A 3N6UA 2Y7KA 3CFXA 1UTHB 2RKMA 4R6KA 2YLNA 5K2XA 1B05A 1L5TA 5F1QA 3FUZA 5AA1A 2REJA 3W15C 2DVCA 2I0BA 3D4CA 2OCUA 5HBCA 4FECA 2GH9A 5I58A 4G68C 2DWHA 1B7ZA 3TQWA 2ZYOA 1FTLA 4OYVA 1DPEA 1J1NA 1SW5A 3VE1B 4R73A 3N5LA 3RT8A 3MW0A 2I6EA 4ZEKA 1B3GA 4ZEBA 4DIGA 1QVSA 1FQDA 1SBPA 1MPBA 5H8QB 1EZOA 1QUIA 4LZ5A 1P1OA 3T9UA 2X26A 5IKBA 2THIA 2O7IA 3CRBA 3UGWA 2ZXTA 3BFUA 2ABHA 1NKXA 3L6HA 4FEDA 3KG2A 3SEUA 4BDRA 3KOTA 3TTRA 2DE3A 4F18A 3C31A 1S9TA 1EZ9A 4YAHX 1P99A 2XXIA 1USYH 2ZNUA 5I59A 2HQ0A 3E9XA 3DP8A 3K2DA 4KPTA 4YMBA 3KSJA 2RCAA 4KYDA 1MQHA 3IOUA 1B58A 3ILUB 3O97A 1N7XA 3USDA 3OO6A 4NE4A 1I69A 1B32A 2F6GA 1KWHA 1O7TA 2CZLA 2DQVA 3SDFA 5JTYA 3FVGA 3VVEA 2DE2A 5TPAA 2Y84A 1ZLQA 4FAJA 2ALUA 4YMAA 3Q25A 3GBAA 2O51A 4JWYA 3TTMA 1Q1KA 4R75A 1HSLA 4KD5A 2I48A 2QS1A 3Q27A 3CVGA 1B51A 1MPCA 1QULA 3TCHA 3I5OA 4Q5TA 2I4CA 3Q29A 1DSNA 2RINA 3RN8A 1OVTA 3PUXE 1MRPA 1IUDA 2AL5A 4XXUA 3PMXA 1OMPA 3FGSA 2Q8JA 2AYSA 4C1TA 1EZPA 1LBCA 4ZS9A 4AQ4A 1QW0A 4YU0A 1DTZA 2XXXA 2Q2CA 3LC8A 1AH5A 1R6ZA 3CSGA 3FXRA 4F3BA 1EU8A 3O6IA 2UYFA 2Z8DA 2XXTA 4QFKA 5KCJA 4LZ7A 1MDP1 3GBBA 5IAIA 2HXWA 3OENA 4LUBA 1MH4A 4GD5A 5ISUA 4ZZAA 4NWCA 4JSDA 1Y4TA 1JW1A 3M3FA 5AA2B 1UIUA 1P1NA 2FNCA 2XX7A 4DE8A 3FZVA 1A40A 2PYYA 1VR5A 2O84X 1JNFA 3H6TA 4EXKA 2H5YA 1H44A 4YZZA 2ZNSA 2NUVA 2UVGA 2F34A 3VLVA 1Z7NE 2NWJA 3VVFA 3HN0A 1AMFA 1MY0A 1B7UA 2A5TA 1AIVA 4YICA 4F3PA 1D9YA 1XC1A 1RYXA 1MDQA 4RPOA 1Y9UA 1SYIA 3OXNA 2KLFA 1GGGA 3G3JA 4R6YA 3IOTA 3V89B 3KJTA 1LBBA 2DSFA 1A7LA 4BDLA 5ELVA 2PMSA 2XXVA 3T66A 1POTA 3I3VA 4BDNA 2XX9A 1B3EA 1R1NA 3E4RA 4P0IA 4ELQA 1ANFA 2O7UA 4YB7A 4UA8A 4LQ2A 3OELA 3B7DA 3KN7A 3GXAA 1B3FA 2QS4A 2PVUA 4FEBA 2PX1A 4YKKA 1N0TA 3VV5A 4DLDA 3KBRA 3O29A 5I59B 1FQBA 3WAFA 1GVCA 1NFTA 2XD2A 3CFZA 1R9LA 4NTLA 4XKQA 2ZNTA 3K6WA 3EHTA 3TFLA 4KR5A 1FQAA 2Z23A 4F29A 5CM6A 3G3FA 3CG1A 2XHDA 1FQCA 3IX1A 5JTYB 4JDFA 4QFOA 5TPAB 3R7XA 3T9VA 3PU5A 4WEPA 3JYRA 1FTJA 3UORA 4RK2A 2V84A 4BDOA 5L8DA 3PPPA 5TP9B 3FXUA 3TEPA 2O69A 4ZECA 4HS7A 1Y3NA 1AOVA 2DWIA 1B1XA 1JW4A 4TOZA 2O68A 3IO6A 5B7DA 4X1DA 4LZ8A 1MQDA 3F11A 4GXSB 3C35A 2VD2A 4PETA 5KZTA 1D3KA 3P7IA 3QIMA 1IQ7A 5CC2A 3HPIA 4EQ9A 4NF4A 3TODA 3H6WA 1YAEA 2QSXA 4GVOA 3R26A 3IORA 2M8CA 1MXWA 3G3GA 1SVXB 1URDA 3SETA 3SESA 4G4PA 3N94A 1IXHA 2E1SA 3MVYA 1NH7A 4ELRA 4LONB 1M5EA 3U72A 2PT1A 2OWSA 3O28A 4O3BA 1VFDA 4OEVA 3PV0E 3ILTB 2ANJA 3C33A 4MF3A 4ZZEA 4MLQA 1SDXA 3G3KA 3HCQA 3EN3A 3FVOA 1B2HA 1TFDA 4XIGQ 1B5IA 4OESA 3IAZA 3H06B 1A54A 2DVZA 3SEVA 3PD9A 3PUYE 3QSLA 3KEIA 4OTEA 2A5TB 2I49A 2F36A 3C36A 1Z7ME 1FTMA 4KQPA 1B46A 4IY6A 4QFLA 3OMBA 2I58A 5K2YA 4OFOA 4F22A 1IXCA 3E3KA 1MXUA 1JVYA 1LB9A 3QAXA 4IO3A 3DP6A 2Y7RA 3TELA 4X48A 5FTIA 1MG1A 2NOOA 4ESWA 2NXOA 4RY1A 2O6AA 1XS5A 1US4A 1QUJA 1M5BA 1NNPA 1OQHA 2QPQA 4M1VA 4F2QA 5CBRA 2AL4A 4H67A 4YB5A 1MY1A 3V5AA 2OLBA 2Q9TA 4U2RA 4NMYA 1M5CA 3I6VA 3SEWA 1SW4A 1XVYA 4HTGA 4L17A 1MY4A 1LAGE 3S9EA 3THIA 5HPQA 3HO7A 3VXCA 4JBZA 5I57A 3RLFE 1DPPA 1WDNA 1SW2A 4FIMA 4U4SA 4NF6A 1H43A 1SD3A 4GXAA 1MQJA 3K6XA 4KYSA 3DELB 5M2VA 5FHOA 3MP8A 2AIXA 5H8SA 1PDAA 2HAVA 1AL3A 1ZJLA 3TDJA 2G93A 5CI5A 4IO4A 1Y1MA 2ZYMA 2ESNA 3TMGA 2HZKA 4HW8A 2HFBA 4G68A 2Q89A 4R9FA 5BWJA 4YKIA 1IITA 2QJEA 3MZBA 3DLNA 2DE4A 3IOVA 5AA3A 2H25A 1B3LA 1N76A 3PUZE 2XXUA 3RPWA 4R74A 1WVJA 1N3XA 3QUFA 1IXIA 2Y7IA 1RYOA 1BKAA 3V8XB 3JV9A 4U1ZA 2P1SA 2O1MA 5DVFA 4FORA 3KGCA 1SYHA 3HHGA 5FTHA 1MM7A 4OVJA 3CFLA 2F8DA 1NNTA 3TKDA 4G8MA 4U1OA 2RC9A 3H4ZA 3CG3A 1LAFE 3M8UA 5ICQA 2UVHA 1O64A 3QK6A 4NF4B 1F9BA 2QS2A 4Z0IA 4H6DA 4PE5B 2XXYA 3ODBA 2GFEA 3N6TA 1ZTYA 2ZYKA 3MZ9A 5FHMA 3IOWA 4BLAA 3VLUA 1I6AA 2H98A 1N04A 2NVUB 4BDMA 4DXUA 3G3IA 1OLCA 1B3HA 2F97A 4GL0A 5CMKA 2QL3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YKPA 5ITOA 1XT8A 4PFBA 3PUVE 1Y1ZA 2RCBA 4XKPA 3RTFB 3C4MA 4PAIA 1DMBA 3HSTA 2PT2A 3IB0A 1VE4A 4Q8RA 3IB2A 1S50A 5A5XA 1UIVA 1CB6A 5IM2A 5JK4A 2D3IA 4NF5B 1EYIA 4OEUA 1FBEA 3MZ1A 1LFGA 4N91A 4F39A 4H45A 4OHNA 1IMDA 1IIWA 4OFLA 4FATA 1A8FA 2I3VA 1IMFA 2ONSA 4GFRA 3RNNA 1NNKA 4RYAA 4NGUA 2E0SA 3MP1A 5J16A 3O66A 3FD3A 3RUMA 2W7YA 2F7AA 4XF5A 1TFAA 4GQOA 3B6WA 1SI1A 4O3CA 5IZ1A 5DVJA 4ELPA 1MXYA 3H6UA 4FJPA 3T9XB 4N8YA 2QFLA 5L9MA 3IFAA 2GHBA 3OSQA 4PQJA 5I58B 2XD3A 3U92A 1PB7A 1DK4A 4PE3A 3M3LA 4H5GA 5CMBA 1B52A 1PB9A 2HAUA 1B9JA 3V83A 4MFIA 4PFYA 5EQ9A 3MAMA 4JSOA 1ZU0A 1II5A 4OERA 4P56A 5JEIA 1PEBA 2VD3A 4PCDA 1FPBA 1R9QA 3KZGA 5DEXA 1YTVA 4QRZA 1H76A 5LOMA 2FHYA 3SEYA 4E0WA 1N84A 3FVNA 4NF6B 4C1UA 2V93A 1H45A 2DOJA 1FPGA 1QUKA 3MC2A 5EHSA 3MBPA 2H99A 1MY2A 2QRYA 1LAHE 3MVXA 2XXHA 3OEMA 1B0HA 3TUSA 1FPKA 3AXFA 3EHUA 4DCXA 4QSCA 1LGBC 2DXYA 4GX4A 3K6VA 1TXFA 3LSWA 1A99A 4JVCA 4G68B 1BLFA 3RQTA 3E78A 4QSEA 4KCDA 3IK6B 4DXCA 1NL5A 1URSA 1EYKA 1LAXA 2Q2AA 2R6GE 1ATGA 4WKMA 5ET8A 5H8FA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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