1EZPA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin using peptide orientations from dipolar couplings
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
b'KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTODEXTRIN BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
total genus 45
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezpA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezpA01
2F5XA 5ISUA 1P99A 4I9DA 1S9TA 3T96B 2V93A 4F1YA 4PETA 4GWOA 2ZNTA 1HSLA 1BLFA 3GBBA 3OEMA 1FQAA 2B3BA 3QK6A 3FJ7A 2HZKA 3DP8A 3KOTA 1IXCA 4TQUQ 2VHAA 4I1DA 3UORA 3MW0A 2H9BA 1FTOA 3HHGA 2THIA 4POXA 1PB7A 3TYHA 3CG3A 3H3GA 1Y4TA 3IOUA 3MZ9A 2XXYA 1H43A 1FQDA 2M8CA 4P11A 2XX7A 4OHNA 1LAXA 4EQ7A 1VSOA 2LAOA 4TLLB 3TTRA 2Q2CA 3G3HA 1OIBA 4QSDA 3OO7A 3OD7A 4G8MA 2O7IA 4H0WA 3FJMA 1OQHA 4DE8A 1EZ9A 3TEPA 3BBRA 3EN3A 2NVUB 4GL0A 3OO6A 5ITOA 1FTJA 3T9UA 3HPIA 2I4BA 4EXLA 1ZIUA 1B4HA 3Q29A 2RCBA 2PT2A 1LSTA 4H5GA 3CR9A 2F7AA 2F36A 4KD5A 4ZEIA 3B7DA 5CMCA 2QRYA 4YB5A 4ZE9A 2QS1A 5I58A 1M5CA 5F1QA 2V3TA 1MQDA 1R9LA 2VGQA 1LFGA 2X26A 3ECRA 4KHZE 4EQ9A 4HW8A 5FHMA 3KSJA 4PFUA 4FE8A 4YMAA 2UVIA 1SD3A 4NWCA 4YKKA 1LAFE 5L9OA 3VE1B 3K1MA 3MWBA 1NKXA 1J1NA 1IZ1A 2FA7A 5CI5A 5DT6A 1MQJA 5AA1A 3PUYE 2G93A 4FAJA 1SYIA 2DXYA 2W7YA 3TTLA 3QYTA 5I57B 3FZVA 5L8DA 1A8EA 4RYAA 4LATA 1POY1 1B7UA 2IA4A 1NFTA 2CZLA 3FXQA 1VE4A 3U1OA 5IAIA 4IB2A 1LGBC 2DWAA 4ZDMA 1B3EA 3F11A 5I2NB 2ANJA 4AQ4A 1KWHA 3R26A 4U22A 1N7WA 3TCGA 1S7YA 4GXAA 1AIVA 2HAVA 3M3LA 4OERA 1NMUA 4MFIA 4UA8A 3M8UA 4XKPA 1M5DA 1ZBMA 5HBCA 1LB9A 1UTHA 3UP9A 1FW0A 3L6HA 2GHAA 1O63A 4LZ8A 3VVDA 3ODBA 3CI8A 3UK4A 2H25A 1Y9UA 5B70A 5H8SA 3UGWA 2O6AA 4NMYA 1AOVA 1MPCA 4YZZA 1LFHA 5HM4B 3PD8A 3TELA 2UYEA 2A5TA 3KOSA 1OVTA 1MG1A 1B5HA 2BJJX 4F3PA 4U23A 3UA8A 4KCCA 5CM6A 1IIWA 5I56B 4R9GA 2OK2A 4G77A 2O84X 4NE4A 2Q88A 2V25A 4IO7A 1M5BA 4NF6B 3G3FA 2XXRA 2VD3A 1HSEA 4XXUA 2GHBA 1IUDA 3FGSA 2PBWA 4R9FA 1T0KA 2B65A 1RYOA 2XD2A 4EDPA 4IY5A 1IEJA 4QFKA 3M3KA 4OXVA 3SKPA 5I2KB 4ECFA 4YAHX 4LUBA 3PU5A 4MH5A 3JYRA 4K3FA 3SEVA 1N76A 3IORA 1QUKA 4QFNA 2HAUA 3MVZA 2ABHA 4R2FA 2I0CA 1NL5A 4C0RA 3DP6A 2DYXA 4YB7A 5IKBA 5H8FB 3JZJA 2DWJA 3GBAA 4AB6A 3PMVA 1QUJA 4ELQA 3QSLA 3QUJA 4EF2A 4C1UA 4ZEKA 4ESXA 2VP1A 2RF1A 1URGA 1B3FA 2VD2A 4BDLA 1D3KA 2DXRA 4LQ5A 4JXIA 4LA9A 4X9TA 2F97A 3RPWA 1FQBA 3VLVA 3E4RA 2UXAA 5K2XA 2NXOA 2OWSA 1TFDA 3MC2A 4F39A 4H8IA 1O64A 4HCWA 1MDQA 4G68A 4EF1A 1OQGA 4ZZAA 4QSEA 2I58A 1QKAA 4GOTA 1II5A 1N84A 3RLFE 1JW1A 2QL3A 2XX8A 3IB1A 4P0GA 4ONYA 1FQFA 4ZS9A 4HS7A 1D4NA 1LAGE 1N7XA 4F29A 3Q25A 4F3GA 3A3CA 1SI0A 3T93B 1D9YA 3PPNA 5TPAA 4IO6A 1SBPA 1Q1KA 3K02A 1B2HA 1LLSA 1GR2A 5EYFA 3OXNA 1Z7NE 1SW2A 1PBPA 4OWDA 3IL1B 4H1XA 2O69A 4QRZA 2Y7RA 5EHSA 3G3JA 4GXSB 2OBGA 2UVGA 4BDNA 1XVYA 5DEXB 3PPQA 3JV9A 4FEDA 3G3KA 3MP1A 1BTJA 3V83A 3RN8A 1FQCA 4YU0A 3I6VA 3E9XA 4ELPA 3R6UA 3W15C 3O9PA 1JQFA 3Q27A 3RUMA 1MXWA 1RYXA 2QMXA 2HXWA 2H99A 3KGCA 4PFWA 1Z7ME 2Q89A 4HTGA 4Z7EA 3B6WA 2XXVA 2OWTA 1LB8A 5DEXA 5ICTA 1N3XA 4IO3A 4QF9A 3FV2A 2ZYKA 4WEPA 5TP9B 1MQHA 3T66A 3CRBA 2RC9A 4ZEDA 4NWDA 4U4SA 5B7DA 2UVHA 3O6HA 1YPNA 1MM7A 1MH3A 3MPKA 3H6VA 3S9MC 2I3VA 2F8DA 2DE2A 3MVWA 1MH4A 2I49A 5DVJA 4F1UA 4X48A 4OYVA 3OSRA 2G29A 2Y7KA 1R9QA 4NF8B 1QVSA 4L17A 2XXXA 5BWJA 5TP9A 2RINA 5TU0A 1IITA 1A55A 1MXYA 4JBZA 2ZNUA 2XX9A 3SEWA 4GIZA 3S9LC 3MVXA 4MLVA 5JTYA 1DPPA 1ZKBA 2REJA 4OZ9A 4FEBA 2H5YA 4ESWA 1UQWA 4F2OA 4KYDA 4NF8A 3TUSA 5DVIA 1H44A 4R75A 4BLAA 4OQOA 3AXFA 5I58B 4E0XA 3A09A 1A54A 3TPAA 4G8HA 2Q8JA 4ZZEA 5CBSA 4G68C 2DOJA 3TKDA 2FYIA 3C4MA 1UTBB 4E0WA 1SW4A 1B1XA 2P0SA 5H8HA 4JWYA 5ITPA 3U8QA 3ILTB 1JVXA 3VV5A 4U4XA 3C36A 4OMBA 3IR1A 4OEVA 3FVNA 3U94A 1MQGA 3OMBA 1SQYA 3IB0A 2DQVA 2UYFA 1LBCA 1B9JA 1MY1A 1MXZA 3TTKA 2KLFA 4GRKA 1UTBA 1R1NA 1PC3A 3QXMA 3T22A 1TFAA 5A5XA 3IO6A 3IOVA 4OVJA 3G3IA 2HQ0A 1B05A 1MY4A 1EH3A 3K1PA 4OESA 2NWJA 1N3WA 3HSTA 4OTEA 4GL8A 3THIA 3WAFA 4NTLA 2B3FA 1B51A 2HFBA 3O97A 1Y20A 5EHMA 4O3CA 1B32A 1TWYA 3G7WA 4YICA 1US5A 1UTHB 2F7CA 2CMOA 4YKIA 2RCAA 2Z8DA 5M2VA 5H8NA 3R7XA 1B5JA 1O7TA 2OJTA 1NH8A 1OLAA 2F34A 4TOZA 1OLCA 4DLDA 2I0BA 2A5TB 1B1HA 1LAHE 3SDFA 1PBQA 3QUFA 3TQWA 1MY0A 4DDDA 1AL3A 1B0HA 3CFZA 3P7IA 4FJPA 3O6IA 4DIGA 1FTLA 5KZTA 4R74A 2QS2A 3LSLA 4FATA 4R73A 4BDMA 1QUIA 3H4ZA 3VVEA 3GXAA 3EHSA 2Q2AA 1SDXA 2R6GE 2PYYA 1JW4A 3OELA 4ELRA 4R6HA 1PB9A 4OFOA 2Q9TA 4WEDA 3K6VA 3TZAA 3WAEA 1MPDA 4ND9A 1WVJA 2VOZA 1GTKA 2P1SA 4JSOA 5HPQA 3MAMA 1FTKA 3K1NA 4POWA 2Y7IA 3FJGA 2R71A 4QSCA 3KFMA 1LFIA 4ZEBA 3OO9A 3LBSA 1NNFA 2XXWA 3ZKLA 3MQ9A 4GQOA 4KQPA 1IXHA 3N5LA 2O1MA 3LSWA 4KR5A 1B7HA 4U2RA 3FUZA 3K6WA 1POTA 3TQLA 4OFJA 3C35A 1PEBA 2ONRA 5I84A 4UACA 1YAEA 2AL4A 1ZMGA 2DE3A 1USYH 3TTNA 3SEYA 3PPOA 1GVCA 3PPPA 1XVXA 2A5SA 2F6PA 4GFRA 4C1TA 4FIMA 2RKMA 3U72A 3SESA 1Q35A 3DELB 1ZLQA 1MXXA 1DPEA 2DWIA 4JSDA 3H6TA 1US4A 1SW1A 1XC1A 1GGGA 3N6UA 2H4IA 2RC7A 1EU8A 4KPTA 2NOOA 1OMPA 2R9JA 4KFQA 4G68B 1MRPA 3FIRA 3FV1A 2GFEA 4H65A 3VVFA 4XIGQ 3KBRA 4GLIA 4RY1A 3O66A 3UIFA 4MLQA 3HO7A 2D3IA 4OEUA 2Z22A 3I3VA 3VDFA 3MZ1A 1EZOA 4IY6A 4YKPA 2ONSA 4FECA 3C31A 5ICQA 1B3GA 1XT8A 4JDFA 4QFOA 5CC2A 4F22A 2D21A 4RA1A 4Q30B 1Y1MA 3D4CA 1MY3A 5TPAB 3FVGA 1USYE 5KCJA 3M3FA 3RTWB 3CG1A 4WKMA 3K01A 3PUZE 2AL5A 3EHTA 3USDA 5DYHA 4IO2A 3KEIA 1XS5A 1I6QA 3FATA 3FASA 3KG2A 1OVBA 5J1DA 5CMMA 4KCDA 1YTVA 2Z23A 5I59B 4RJZA 1ZTYA 4I62A 5LOMA 4F3SA 3BFUA 3O28A 1A99A 1N04A 4G8NA 1NNTA 4YKJA 3T9VA 2XXQA 5CBRA 1YCJA 1JEUA 2V3QA 1MDP1 4HCYA 3ZS6A 4OENA 4XKRA 4DCXA 2Z8EA 1EZPA 3CVGA 2IEEA 5I59A 3S9NC 1BP5A 3CFXA 3SEUA 3VXCA 2XD3A 2XHDA 4QFLA 2YPNA 3TMGA 3MVYA 3GLBA 3IOWA 4OETA 2F7BA 3CFLA 3FD3A 2ZMBA 3MP6A 3TTMA 3IB2A 3O2AA 4IGRA 4DZ1A 1B5IA 2V84A 3Q28A 5BUUA 3MPLA 3ILUB 5CRYA 2DE4A 5AA4A 3KN7A 2H98A 1P1NA 3KZGA 3IX1A 4NF4B 1B4ZA 3K6XA 1NNPA 3LSFB 4DXCA 3H03A 3K2DA 1MPBA 1BKAA 3L6GA 5JTYB 4F3BA 4RK9A 1AH5A 2E1SA 4OFLA 1PB8A 3E3KA 4QHQA 4X1BA 2O51A 4PQJA 3KJ7A 4PE5B 4R6KA 3EF7A 3TDJA 3RTFB 3OENA 4NF5A 2DVCA 3H6UA 5JEIA 2PX1A 5KDTB 1JVYA 1MXVA 4NF4A 1M5FA 2ZNSA 1TXFA 3MZBA 3S9EA 5AA3A 3S2VA 2Y7WA 1GV8A 1I69A 4MBPA 2QS4A 4XKQA 1TT1A 1NH7A 1QJMA 5AA2B 3G3GA 1ANFA 4DCYA 4RPNA 5CMKA 2QSXA 2RC8A 3OEKA 5KDTA 2UVJA 4IGTA 5H8HB 1B52A 3ONMA 3FVOA 2ZYMA 3DLNA 3OO8A 3MBPA 4N07A 2GRVA 1VFDA 2WKYA 5AA2A 2XXIA 2GH9A 3U92A 3ZKKA 4U1OA 4DXUA 3TCHA 3PMXA 4H8JA 4M1VA 1B58A 3EPEA 2QMWA 3MJNA 3FVKA 2AYSA 4R2BA 1URSA 3O6GA 3VLWA 5A5XB 4RXLA 1N0TA 3KJTA 3HCQA 3DM0A 1SI1A 3D4GA 5AA2D 1Y3QA 4F1VA 5FHNA 1P1OA 1QKBA 2HEUA 4XKNA 3EHUA 3BKIB 2QJEA 5CMBA 2F78A 3SEXA 4KYEA 1IQ7A 3IJOB 4YB6A 4JWOA 1ZJLA 4GVOA 2Y84A 3Q26A 4BDQA 2X7PA 3LUYA 2DP8A 1RKMA 4GD5A 3TAJA 1SYHA 4U1ZA 5H8NB 4RNSA 4JWXA 2OLBA 3CSBA 1Y1ZA 4THIA 1VR5A 2HZLA 1XOCA 1JW5A 3K6UA 4KI0E 3PUWE 4G4PA 3MUQA 2PVUA 4R6YA 3LC8A 1D9VA 5L9SA 1UIVA 1B40A 2FNCA 5F7VA 3V5AA 3RY3A 4U21A 3K0VA 4ISUA 3K4UA 2ZYOA 3C33A 1DOTA 3IJXB 2XXHA 1FCKA 3N6TA 3H7MA 2Y7PA 4LONB 4LQ2A 4F18A 3RQTA 4M4GA 1B3LA 4F2QA 5K2YA 2P2AA 2O68A 3VXBA 2ONKE 2ESNA 1B7ZA 2XXTA 1QW0A 1AMFA 5I57A 3A3UA 5H8QB 2PT1A 4N6PA 1BIYA 1XHYA 3TFLA 3UN6A 1JETA 3ZSFA 1Y4CA 4WXJA 2QS3A 3IK6B 2I3WA 1URDA 5DVFA 5DTBA 3E13X 5I2NA 5FTIA 3KSXA 5ELVA 3IO4A 4BDOA 2ZXTA 1DSNA 3N26A 2YJPA 1MQIA 1CB6A 4Z0IA 2DWHA 5H8QA 2OZZA 3T9HB 3TCFA 4GF8A 2QPQA 2X7QA 4X1DA 2I6EA 4FORA 3PUXE 4O3AA 3HN0A 1WODA 1B0LA 1DMBA 3N94A 4I8CA 2DSFA 1MY2A 1S50A 1B46A 3PUVE 1R6ZA 1P1QA 1FTMA 1A8FA 4IO5A 2PMSA 5AE4A 1DTGA 3PD9A 3C9HA 1H3DA 3EQ1A 4O3BA 1P1WA 2XXPA 1F9BA 4LP2B 4H5FA 4DXBA 1JNFA 1SW5A 1H45A 2HCAA 5I56A 4AB5A 1PDAA 3U93A 1Y3NA 3VLUA 1IXGA 3B6TA 1DTZA 4RK2A 3CSGA 2DVZA 1B3HA 4PFYA 4NF6A 1FQEA 2OCUA 3OSQA 4IO4A 4LVQA 3H06B 4LZ5A 1JEVA 2F35A 2REGA 1MS7A 2ALUA 3QIMA 1H76A 3RT8A 5KCJB 4ELOA 1CE2A 5I2KA 3RNNA 2E0SA 3CIJA 3I5OA 1MM6A 1I6BA 4EXKA 3TODA 1IXIA 1B6HA 1VFEA 2O7UA 3C34A 4PFTA 4XTCQ 3KN3A 3H6WA 4MF3A 4F19A 5H8FA 4QFPA 3V89B 2D5WA 4Q8RA 3LSXA 4ZECA 2XXUA 1SVXB 4RPOA 2ZYNA 1LBBA 3GZGA 1QULA 1ZU0A 3MP8A 4EQBA 3RGYA 3W9WA 3C32A 4H67A 3W9VA 4Q0CA 3PMWA 4Q5TA 3VFJA 1ATGA 1MXUA 3HV1A 4F31B 1A7LA 3SETA 4G2ZA 4NEDA 2NUVA 3FXRA 3V8XB 2YLNA 2I4CA 4BDRA 1WDNA 1M5EA 4ZEFA 1L5TA 4JB7A 1HSJA 1LCFA 3FXUA 2DS9A 1LCTA 4EUOA 1Y3PA 3K00A 3SERA 5AA4B 1I6AA 4TLMB 2V3UA 3BFTA 5FHOA 3HHFA 5JK4A 3IAZA 5FTHA 5L9MA 2O1LA 1NNKA 2I48A 3LR1A 4LZ7A 3DP4A 3RT6B 3T9XB 3B6QA 3OOAA 2AIXA 2Z8FA 3PV0E 3PPRA 4P0IA 3IOTA 4PP0A 3KN8A 3QAXA 4YMBA 3O29A 4NF5B 1ELJA 4KYSA 2F6GA 3S4UA 1P1UA 1A40A 4ZE8A 3PGFA 4R72A 1UIUA 4H6DA 4N13A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XWOA 2F5XA 2HPGA 5ISUA 1P99A 4I9DA 1S9TA 3T96B 2V93A 4F1YA 4PETA 4GWOA 3KC0A 2HXRA 1FPDA 2ZNTA 1HSLA 1BLFA 3GBBA 3OEMA 1FQAA 4JVCA 2B3BA 3QK6A 3FJ7A 2HZKA 2BJIA 3DP8A 3KOTA 1IXCA 4TQUQ 2VHAA 4I1DA 5IZZA 3UORA 3MW0A 2H9BA 4PFBA 1FTOA 3HHGA 2THIA 1NV1A 4POXA 1PB7A 3TYHA 3CG3A 3H3GA 1Y4TA 3KC1A 3IOUA 3MZ9A 2XXYA 1H43A 1FQDA 2M8CA 4P11A 2XX7A 4OHNA 1LAXA 5EQ8A 4EQ7A 1VSOA 2LAOA 4TLLB 1NUWA 3TTRA 2Q2CA 3G3HA 1OIBA 4QSDA 3OO7A 3OD7A 4G8MA 1LBWA 4P3LA 2O7IA 3SZPA 4UABA 4H0WA 3FJMA 1OQHA 4DE8A 1EZ9A 1LBZA 3TEPA 2CEXA 3PTYA 5ET8A 3BBRA 3EN3A 2NVUB 4GL0A 4NHBA 3OO6A 5ITOA 1FTJA 3T9UA 3HPIA 2I4BA 4EXLA 1ZIUA 1B4HA 3Q29A 1KA1A 1NV0A 2RCBA 2PT2A 1LSTA 4H5GA 4OVTA 3CR9A 2F7AA 2F36A 4KD5A 4ZEIA 3B7DA 5CMCA 2CZHA 2QRYA 4YB5A 5IM2A 4ZE9A 4X04A 2QS1A 5I58A 2ZZVA 2KR0A 1M5CA 3MSTA 4NF0A 5ET6A 5F1QA 2V3TA 5EYGA 1MQDA 1R9LA 2VGQA 1LFGA 2X26A 3ECRA 4KHZE 4EQ9A 4HW8A 5FHMA 3KSJA 2ZZXA 4PFUA 4FE8A 4YMAA 2UVIA 1SD3A 2Y5LA 4NWCA 4YKKA 1LAFE 5L9OA 3VE1B 4PAIA 3K1MA 3MWBA 1NKXA 1NV6A 1J1NA 1IZ1A 2FA7A 5CI5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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