1EZPA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin using peptide orientations from dipolar couplings
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords MALTODEXTRIN BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
total genus 45
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezpA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezpA01
1B5JA 3LSLA 3C31A 3HO7A 4GXSB 4DCYA 3VVDA 1II5A 3A3UA 3K6VA 3O66A 1SVXB 4H1XA 2NVUB 3PPNA 4HCYA 4FORA 3THIA 2XXXA 2FA7A 4ZEIA 1QKAA 1VSOA 4NF5B 2WKYA 3QUJA 2FNCA 3SETA 3IJOB 4E0XA 2F36A 3CIJA 4GD5A 5DVJA 4KI0E 4BDQA 1POY1 3F11A 3H6VA 3PD9A 4F1UA 3T96B 2I3WA 1XHYA 1P99A 2Q2AA 3SESA 4P0GA 2DVCA 2Z8EA 1P1NA 3SEYA 1S7YA 1I6AA 1EZ9A 3IL1B 5AA2A 3H7MA 2RC8A 1B3FA 4F39A 2I4BA 1O63A 1TWYA 2QMXA 3PMXA 4YKPA 2GHAA 4QFLA 1Q1KA 3PUZE 3SEWA 2F5XA 4N6PA 4OFOA 5JK4A 1QVSA 4RXLA 4EQBA 2W7YA 3IOVA 3RUMA 1Y1MA 1SW2A 1ZJLA 3FJ7A 4Z0IA 3KSJA 2V93A 1B4ZA 2M8CA 4HW8A 4DIGA 3KJ7A 2A5SA 3D4CA 4KCDA 1SQYA 3V8XB 1AOVA 3BFUA 2H99A 4RNSA 3EN3A 5AE4A 1JNFA 2F34A 5DTBA 1A99A 4AB5A 2F78A 2R9JA 2ZXTA 1WVJA 5I2NB 3FJGA 2DWHA 3FATA 3MJNA 2I48A 4YZZA 3TDJA 2O1LA 3JYRA 1OVTA 3C32A 3PUWE 2YJPA 1UIUA 5DVIA 4NF5A 1H43A 2VGQA 4NF4B 4NWCA 3OENA 4F18A 1M5FA 1MPBA 5I57B 4KQPA 4R6YA 4WEPA 4ECFA 2X26A 3OO9A 2I6EA 5HBCA 1Y1ZA 3UK4A 2O68A 1M5DA 2YLNA 1B5IA 1DPPA 4U4XA 1R9QA 1MDP1 2QS4A 4KR5A 1N7XA 2XXRA 2THIA 1XS5A 1XVYA 3QYTA 4GF8A 4F2OA 4IO7A 5DEXB 2UVGA 4U22A 4X48A 4PQJA 4MBPA 1IITA 3M8UA 1UTBB 1MH4A 4AQ4A 1LB9A 4TQUQ 1NNFA 1SYIA 4GL8A 3TPAA 3ODBA 1JW4A 1VFEA 5CMMA 4EF1A 3T9UA 3OMBA 3C9HA 4X9TA 4G68B 3TTLA 2XHDA 5ICTA 1Z7ME 3RN8A 3OSRA 4TLLB 3GBAA 5KDTB 1ZMGA 4N07A 1IEJA 1I69A 2F6PA 1DPEA 1FW0A 3IOTA 4ZEBA 4RPOA 3LSXA 1PDAA 2VHAA 2F8DA 1MY1A 3VVFA 2DWIA 2F97A 3B6TA 2F7AA 1SW5A 1B0HA 3MC2A 3G3FA 4ESWA 4NTLA 4OERA 1D3KA 4RPNA 3M3FA 3K6WA 4O3CA 1FTMA 4POXA 1FTKA 3MZ9A 4H8JA 4DZ1A 3QXMA 5FHMA 3MUQA 4QRZA 1FQBA 3TCFA 3FUZA 4QF9A 4X1DA 5H8QB 4IO4A 4DE8A 4YMAA 4BDLA 1MQGA 5FTIA 1LBBA 4YICA 3USDA 3EQ1A 4Z7EA 1IXHA 2RKMA 2ANJA 2F7CA 1MPDA 4GL0A 3OELA 3VV5A 4LZ7A 3OD7A 3VFJA 3E9XA 3V83A 1SW4A 2ZYNA 1N7WA 2O1MA 1UTBA 4F29A 1XVXA 1BP5A 4LONB 3IJXB 2V3QA 1UQWA 3FIRA 2GH9A 1SD3A 4G68A 3PU5A 1Q35A 4WKMA 2XD3A 3MAMA 3BFTA 5ISUA 2XXUA 3VVEA 5TPAB 2QS1A 5KDTA 1B7ZA 3C4MA 4I8CA 3ONMA 1Z7NE 3RNNA 2P2AA 2H4IA 4PFTA 4U1ZA 4QSEA 2O51A 2I0BA 3CRBA 5TP9B 1GVCA 1OQGA 4M4GA 1B3GA 4LVQA 4NF8B 2XXYA 1R1NA 5ITPA 1CB6A 2Y7PA 2D3IA 2IEEA 4U4SA 1B2HA 1H45A 4EUOA 3MZBA 1B0LA 1FTLA 3S2VA 1MXZA 2QPQA 4THIA 5AA1A 3HSTA 2ONSA 4GIZA 2ZYOA 4UACA 5DT6A 3QUFA 1QJMA 5B7DA 3G3HA 1A7LA 1DTZA 4YKKA 3VLWA 1QULA 4OEUA 1O7TA 2X7QA 4LATA 2XXTA 4R74A 1DSNA 4NEDA 3G3KA 3S9EA 1DTGA 3PUYE 1EZPA 2DWJA 3UA8A 4G68C 4XKPA 3IB2A 3PMWA 5AA2B 4U21A 3MBPA 4MF3A 2VD2A 2DXYA 4F22A 3H6TA 1B52A 5I59B 3RY3A 1MG1A 3FJMA 3VXCA 2DSFA 1ATGA 3HHGA 3KFMA 3AXFA 2ONRA 4LZ8A 2OK2A 3PPQA 4R2FA 1ZBMA 2OJTA 1MXVA 3B6WA 1JETA 1N0TA 1B4HA 4ELQA 3N26A 2Y7RA 1ZIUA 3S9MC 1NH8A 4LQ2A 4FJPA 1YAEA 4P11A 3N6TA 3U1OA 3V5AA 4KFQA 2G29A 1IUDA 1JW5A 2XX7A 2HAUA 4NF8A 3MPKA 4H65A 3ZKKA 3H6WA 4JBZA 3LR1A 1WDNA 5ELVA 5HPQA 3U8QA 2KLFA 3LBSA 5H8FA 4H5GA 1D9YA 4QFKA 3OO8A 5CBRA 1AIVA 3MWBA 1JW1A 4R6HA 2Y7WA 5CMBA 3CFXA 1SI1A 1BLFA 4RYAA 4BDRA 1MXXA 3K01A 4JSDA 1MRPA 1QUKA 3MW0A 2ZYMA 2OWSA 3VDFA 5I84A 4EDPA 2REJA 4F3GA 3S4UA 2OWTA 3LSWA 3FXQA 2PVUA 4ZEKA 1OLCA 3FVNA 4ISUA 4DXUA 3G3GA 4FATA 1OIBA 1B7HA 1GR2A 4OFJA 3K1PA 2E0SA 5I59A 2HXWA 1B40A 4ZEFA 1MXWA 3KOSA 3L6HA 4I9DA 1N04A 1MXYA 3ZKLA 4ZEDA 3U94A 3G3IA 1ZKBA 1ZLQA 2ALUA 1Y4CA 2XXHA 4OYVA 1H44A 4L17A 2D5WA 4BDMA 4M1VA 3FV1A 3PPOA 2Q88A 2UVIA 4K3FA 3KEIA 1N76A 3PMVA 1B51A 5EYFA 5K2YA 3HPIA 3RTFB 4WEDA 1FTOA 1YCJA 4YB6A 3GBBA 3I5OA 4QFNA 4OXVA 2XXVA 4RK2A 5F1QA 3FD3A 3FVKA 3K0VA 1NFTA 1MQDA 3S9LC 2YPNA 1Y9UA 2R6GE 1EU8A 3CSBA 3O6IA 1IZ1A 2V84A 4NE4A 3K00A 1A40A 4QFOA 3RT8A 2Z23A 3K6UA 3U72A 1PB8A 1NNTA 1NH7A 4KYDA 4G8MA 3PD8A 3Q29A 2XXIA 3K6XA 3FASA 1AMFA 4H5FA 3IOWA 4GWOA 4GQOA 4LA9A 3G7WA 5L9SA 4JXIA 2R71A 5CBSA 3QIMA 5JEIA 4RA1A 1P1QA 3IB0A 4YMBA 1EZOA 3FV2A 1M5EA 3O29A 5I2KB 3MVYA 2X7PA 2Z8FA 1OVBA 1PBQA 1EH3A 1B3EA 5IAIA 3CI8A 3U92A 5EHSA 3DLNA 4UA8A 3KGCA 4YU0A 1JEUA 1YTVA 4ELOA 1SW1A 3KG2A 3MZ1A 3UGWA 2I4CA 2DVZA 3BBRA 3TKDA 3O28A 1UTHB 2D21A 2ZNTA 3Q25A 5BWJA 4OESA 3EHUA 1SYHA 2GFEA 1JQFA 3WAEA 3N5LA 2NWJA 3DP6A 1LGBC 2B3FA 1LAGE 4DXCA 4GOTA 3TTRA 2DWAA 2DOJA 2V3UA 3DP8A 3BKIB 5ICQA 3ZS6A 2UVHA 2OLBA 4OWDA 3IORA 3MP1A 2I58A 4OETA 1PBPA 4XXUA 3IO4A 4OEVA 4R75A 4JB7A 3FGSA 4GRKA 5I58A 4NWDA 4R6KA 3HHFA 4R9FA 4IGRA 4P0IA 4YAHX 3UP9A 5KCJA 1Y3QA 4DCXA 3TTNA 3CVGA 3T22A 2GRVA 3PPRA 4FEBA 1N84A 3T93B 1B46A 3TTMA 5A5XB 1FQDA 1LAFE 3MVWA 1M5CA 5TU0A 4R73A 1A55A 3OO7A 3W9WA 3SEUA 3TEPA 5I2KA 2O7IA 1VE4A 3OOAA 1AH5A 3TELA 4G8HA 1LB8A 2REGA 1O64A 3GZGA 2UXAA 3RPWA 1USYH 1MM6A 3WAFA 1MM7A 1VFDA 3KZGA 4OHNA 5AA3A 2CMOA 2QS3A 1JVYA 1N3XA 1UTHA 1FQFA 1NNKA 1SBPA 4BDOA 4RK9A 1P1WA 1B5HA 1RKMA 1B7UA 1B3HA 3K4UA 3EHTA 1BKAA 2VP1A 2H98A 2AL5A 4Q30B 1TT1A 1YPNA 4JSOA 2O69A 4LZ5A 5CMKA 2RF1A 4KPTA 3TQLA 1M5BA 4XKRA 3O9PA 5H8SA 2QS2A 2RCBA 4R72A 3MVZA 3TODA 5H8FB 3R7XA 3H4ZA 3OEKA 3CG3A 4GVOA 4WXJA 4H67A 4F2QA 1GTKA 2O6AA 3TYHA 5AA2D 3N6UA 5H8HB 4R9GA 3GXAA 1OMPA 2V25A 3K1MA 1B32A 5A5XA 1LFGA 4BLAA 3T66A 2H9BA 4YKJA 3QAXA 4F1VA 3IR1A 4G8NA 1JEVA 5ITOA 4C1UA 2H5YA 5H8NA 4EQ9A 1A8EA 5L9OA 4OVJA 3R26A 2PYYA 3FVGA 1P1UA 3E13X 3PV0E 2DYXA 2DE2A 2UYEA 1R9LA 1OLAA 4PETA 2ZYKA 3KJTA 4XTCQ 1KWHA 2HFBA 1ELJA 3SDFA 2XXPA 2NOOA 5F7VA 5J1DA 1R6ZA 1US5A 4KYSA 4HCWA 2B65A 3B6QA 2Q8JA 2AYSA 3EHSA 2Q9TA 1MQHA 4DLDA 3KOTA 1RYXA 4HTGA 3K2DA 4H0WA 3CSGA 4U2RA 1XC1A 4ELPA 3ILUB 2Y7IA 1LCTA 3PGFA 2P1SA 3HCQA 3ZSFA 3B7DA 3C34A 4PP0A 4MH5A 4I1DA 4YB7A 1NKXA 1QUJA 5H8HA 4EXKA 1L5TA 4IO2A 4AB6A 3PUXE 3ECRA 1FQCA 4QHQA 3MPLA 1T0KA 3LUYA 2HZLA 4C0RA 4ZZEA 1TFAA 4O3AA 2OBGA 2HAVA 2VD3A 2A5TB 4F19A 1Y4TA 3HN0A 4LUBA 2AIXA 4ND9A 4XKQA 2HZKA 4IO5A 1IXCA 2F6GA 2QJEA 3A09A 5CRYA 3VXBA 4OTEA 4ZECA 3UN6A 1S9TA 4H6DA 3O6HA 1MQJA 4KHZE 5L9MA 1D4NA 4GLIA 1HSEA 2P0SA 3CFZA 4KYEA 4U23A 3TUSA 3H6UA 1AL3A 3KN7A 3MQ9A 1J1NA 3H06B 3VE1B 1FQAA 2Q2CA 1JVXA 4FEDA 1US4A 4O3BA 4U1OA 1XOCA 5K2XA 2F7BA 2XX9A 4OMBA 1B58A 2Z22A 1B6HA 3IAZA 1H76A 3VLUA 3CR9A 4QSDA 4JWOA 3IOUA 4XKNA 2RC9A 3M3KA 5DYHA 4JWXA 1ZU0A 1FTJA 2DQVA 3TTKA 1LBCA 3EF7A 3Q28A 1UIVA 5AA4B 1PEBA 3GLBA 2BJJX 5I58B 1LCFA 3IO6A 4NMYA 5CM6A 2A5TA 1Y20A 2ESNA 3FZVA 3I3VA 3G3JA 4QSCA 3T9XB 5KCJB 1MPCA 4LP2B 4E0WA 1TXFA 4LQ5A 1URGA 2HQ0A 1WODA 3PPPA 3RLFE 1DOTA 5HM4B 2QMWA 3QSLA 2QSXA 2QL3A 3R6UA 1H3DA 1USYE 4F3BA 4PE5B 3OXNA 3TQWA 1POTA 4OENA 5CC2A 1IXIA 4FECA 4F3PA 3HV1A 1IXGA 4N13A 2F35A 2PT2A 4PFWA 4X1BA 2DXRA 1GGGA 3FXUA 3QK6A 5M2VA 3A3CA 3CG1A 4ZE8A 1B1HA 3RTWB 3E4RA 4MLVA 4NF6B 2FYIA 1MDQA 1Y3PA 1BIYA 1S50A 4MFIA 4GXAA 1TFDA 2ONKE 1PB9A 3DP4A 1URDA 1N3WA 1MY0A 3UIFA 2I49A 4F1YA 3MP6A 4IGTA 1BTJA 5CMCA 3RT6B 2DE4A 1MY4A 2HCAA 3CFLA 3JV9A 4MLQA 3K1NA 1B05A 2UYFA 4EQ7A 3E3KA 2OCUA 5I2NA 4JDFA 3C33A 2O7UA 1NL5A 3H3GA 3RQTA 4PFYA 3W15C 2QRYA 1P1OA 4I62A 5JTYB 1LSTA 3P7IA 4FIMA 5AA4A 4R2BA 3OO6A 3SEVA 5I56B 2DE3A 4RY1A 4QFPA 2Y7KA 4NF4A 1SI0A 4POWA 3K02A 2B3BA 5FHOA 4H8IA 5I57A 3L6GA 4DXBA 3V89B 3PUVE 4JWYA 1LFHA 5FTHA 4ONYA 1Y3NA 3TCGA 1A54A 1LAXA 2I3VA 4OFLA 3OEMA 4KD5A 1URSA 3M3LA 1A8FA 4ZS9A 2Y84A 1I6QA 1NMUA 2Z8DA 5H8NB 1QUIA 3TFLA 3Q27A 4DDDA 5DEXA 1NNPA 4IO3A 1DMBA 2Q89A 4F3SA 4RJZA 4NF6A 1SDXA 1FCKA 3LC8A 5EHMA 1RYOA 2PX1A 1IIWA 3ILTB 3IB1A 3KSXA 3D4GA 5BUUA 1B1XA 3C36A 3I6VA 4OZ9A 3EPEA 1QKBA 1PC3A 2ABHA 4IB2A 2RCAA 3TMGA 3KN3A 2PT1A 3O97A 2OZZA 1HSLA 1LFIA 3SEXA 1ZTYA 4HS7A 3SERA 2XX8A 4C1TA 2PBWA 3JZJA 3S9NC 1F9BA 2CZLA 4PFUA 3TAJA 2H25A 1MY2A 3MVXA 5JTYA 2E1SA 2I0CA 4BDNA 2DP8A 5I56A 4FE8A 3H03A 3W9VA 1B3LA 4F31B 4Q8RA 2NUVA 1HSJA 5LOMA 1MY3A 2O84X 3T9HB 2G93A 4OQOA 2DS9A 4IY5A 2NXOA 3TZAA 2RC7A 5H8QA 3Q26A 1B9JA 2XD2A 3MP8A 3OSQA 3FVOA 2ZNSA 4TLMB 3FXRA 3SKPA 4YKIA 5L8DA 5FHNA 1MH3A 4G4PA 3UORA 4ELRA 2V3TA 3IK6B 4ZDMA 2HEUA 1LAHE 4YB5A 4EXLA 1MQIA 3IX1A 1OQHA 1LLSA 4IY6A 3LSFB 1IQ7A 4Q5TA 1PB7A 1D9VA 3DELB 2LAOA 2GHBA 5DVFA 4FAJA 3O6GA 2ZNUA 4ESXA 5CI5A 5KZTA 3O2AA 4IO6A 1GV8A 3DM0A 3T9VA 4G77A 4ZE9A 2IA4A 3RGYA 4EF2A 2VOZA 4TOZA 1MXUA 5TPAA 5B70A 1QW0A 2UVJA 3C35A 4GFRA 1CE2A 3TCHA 2XXQA 4Q0CA 2ZMBA 3U93A 1I6BA 1MS7A 4G2ZA 1VR5A 4KCCA 2RINA 1ANFA 5TP9A 5IKBA 3N94A 3KBRA 2AL4A 1XT8A 2PMSA 1FQEA 4ZZAA 3VLVA 3KN8A 4XIGQ 2XXWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B5JA 3KC1A 3LSLA 3C31A 3HO7A 4GXSB 4DCYA 3VVDA 1II5A 3A3UA 3K6VA 4O8MA 3O66A 1SVXB 4H1XA 2NVUB 3PPNA 4HCYA 4FORA 3THIA 2XXXA 1G0IA 2FA7A 4ZEIA 1QKAA 1VSOA 4NF5B 1FPDA 2WKYA 4XF5A 3QUJA 2FNCA 4UABA 2P3VA 3SETA 3IJOB 4E0XA 2F36A 3CIJA 4GD5A 5DVJA 4KI0E 4BDQA 1POY1 3F11A 3H6VA 3PD9A 4I3YA 4F1UA 3T96B 2I3WA 1XHYA 1P99A 2Q2AA 3SESA 4P0GA 2DVCA 2Z8EA 1P1NA 3SEYA 1S7YA 1I6AA 1EZ9A 3IL1B 3T1BA 5AA2A 2KQZA 3H7MA 2RC8A 1B3FA 4PAKA 4F39A 2VPNA 2I4BA 1IMAA 1O63A 1TWYA 2QMXA 1IMDA 3PMXA 4YKPA 4MNPA 2GHAA 4QFLA 1Q1KA 3PUZE 3SEWA 2F5XA 4N6PA 4OFOA 4MNIA 1K9YA 2FBPA 4IR8A 5JK4A 1QVSA 4RXLA 4EQBA 2W7YA 3IOVA 3RUMA 1Y1MA 1SW2A 1ZJLA 3FJ7A 3IFCA 4Z0IA 3KSJA 4FBPA 1NV4A 2V93A 1B4ZA 2M8CA 4PF8A 4HW8A 4DIGA 3KJ7A 2A5SA 3D4CA 4KCDA 1SQYA 3V8XB 1AOVA 4P47A 1QGXA 3BFUA 2H99A 4RNSA 3EN3A 5AE4A 1JNFA 2F34A 5DTBA 1A99A 4AB5A 2F78A 2R9JA 2ZXTA 4PFIA 1WVJA 5I2NB 3FJGA 2DWHA 3FATA 3MJNA 2I48A 3KBZA 3ROJA 4YZZA 3TDJA 2O1LA 3JYRA 1OVTA 1YXIA 3C32A 4PBQA 3PUWE 2YJPA 1UIUA 5DVIA 4NF5A 1H43A 2VGQA 4NF4B 2QFLA 4NWCA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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