1EZPA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin using peptide orientations from dipolar couplings
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
b'KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords MALTODEXTRIN BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
total genus 45
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezpA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezpA01
2ZYOA 4F39A 1MXZA 2XXIA 3TZAA 1TFAA 2FNCA 1FTJA 2DE2A 4R2BA 4X1BA 3PGFA 4R9GA 5H8QA 3G3JA 5H8HB 3Q29A 4U22A 4YZZA 4HCWA 1IZ1A 4OFLA 1YPNA 1WDNA 1Y4CA 4L17A 3FGSA 4OETA 2I58A 3GZGA 4ECFA 3RTFB 1MM7A 2QMWA 4N07A 3KSJA 2BJJX 5I2NA 3H6VA 3OO9A 2XXTA 4MLQA 2ZXTA 3EHSA 4OQOA 3FUZA 5I58A 1ATGA 1B0LA 2I4CA 3PPRA 2RC9A 4YKJA 4PP0A 1ZMGA 5FHMA 3QYTA 4BLAA 2DVZA 2Q9TA 1VSOA 1NMUA 3VVEA 3C34A 3SEVA 4H8JA 4ZS9A 3KJ7A 3HV1A 1SD3A 4RK2A 4OXVA 3CFXA 3PPQA 1S50A 3B6TA 1B1XA 2DXRA 4OHNA 5H8HA 4FATA 2XXVA 4AQ4A 2X26A 3R6UA 1FQEA 5HBCA 4LQ2A 4H67A 4NF6B 3VFJA 3LR1A 4EUOA 3LUYA 1KWHA 3CG1A 1B3FA 4PETA 3FASA 3OENA 1OQGA 1SYHA 3I6VA 1H45A 1RKMA 4I1DA 3S9NC 1FTMA 3FZVA 5F7VA 2DS9A 4EF2A 3MC2A 1R9QA 1DPPA 3T9XB 3KOTA 3SERA 3PD8A 2AL5A 4PFWA 3G3KA 1HSLA 1SW2A 1ZTYA 3W9WA 2IA4A 2QS1A 5I56A 2Z22A 4RY1A 2M8CA 2QS4A 3T93B 1FCKA 3LBSA 1EH3A 1LGBC 1HSEA 1WVJA 4R6KA 2X7PA 1CB6A 5M2VA 2DWIA 3CSBA 4NF6A 4GOTA 3OEMA 2V3QA 1A99A 4DXCA 2O68A 3EF7A 3U72A 3RLFE 4JWOA 4JBZA 3B6WA 3KN3A 3CI8A 2F35A 2ZNSA 1PB9A 3OELA 5J1DA 2ZNTA 3RPWA 1YCJA 3EHUA 1OLCA 2H9BA 1OVTA 3KN8A 1BKAA 3KZGA 3RGYA 5ITOA 1VE4A 4H5FA 4MFIA 4U23A 1IQ7A 3TFLA 4F2OA 4QFPA 3QAXA 4DDDA 4LA9A 1B52A 3ZSFA 1POTA 4OENA 5H8FB 3TEPA 1N04A 3SDFA 2Q89A 1HSJA 5DEXB 4H1XA 3VLUA 2ONSA 4ZEKA 3T66A 5DYHA 4ND9A 3IORA 3JZJA 5H8NB 3K1NA 1L5TA 5I57A 1B2HA 4KYDA 4TLMB 5I84A 1US5A 1R6ZA 5AA2B 4BDQA 1N76A 5KCJB 1ZKBA 1MDQA 1DMBA 1LB8A 4DCYA 4U1OA 3H4ZA 2DXYA 3HHGA 2ZYMA 3MJNA 1JEVA 1LCFA 3IAZA 4R74A 1II5A 1H3DA 2F7CA 3OOAA 1B32A 3O6IA 3P7IA 1I6QA 1A55A 4P11A 4RNSA 4IO7A 1S7YA 1MPCA 5TU0A 2XXUA 3L6HA 4BDLA 1LAFE 1MY4A 2Y7WA 2Z8EA 5DEXA 3JYRA 2ONKE 4WKMA 2HZKA 4BDNA 1A54A 4Q5TA 3ECRA 3H6TA 3SESA 3MPLA 4ZDMA 4XIGQ 4NE4A 1N3XA 3IOTA 4YAHX 4U1ZA 4G2ZA 3HN0A 4RJZA 1MS7A 3RY3A 4YU0A 2QPQA 3TODA 3IOWA 3RNNA 1B3GA 2PBWA 3E3KA 3JV9A 1FW0A 2D21A 1MDP1 5CC2A 2DE4A 1M5EA 4ELRA 3Q25A 1FQBA 3K1MA 3MQ9A 2Q8JA 5TPAB 1LAXA 3M3KA 1XT8A 5CMMA 5I59A 4P0IA 1MY2A 3FV1A 1SI1A 1MXXA 1POY1 5CMCA 5CM6A 4ESWA 3U92A 4HW8A 4F3SA 4GXAA 4QSCA 3H7MA 2UVIA 1ANFA 2YPNA 3QXMA 1Y1MA 3DM0A 2F7BA 1F9BA 3FD3A 3CFZA 3PPPA 2VHAA 3SEWA 1B9JA 3CIJA 5ELVA 3KOSA 4M1VA 4R75A 1GTKA 4F2QA 3FXUA 3K01A 4GL8A 3UA8A 2OZZA 5AA1A 5H8QB 3DP6A 3MP1A 1MG1A 4EQ9A 1NNPA 1B46A 3BFUA 3R26A 1US4A 4YICA 4YMBA 4NF8B 4R6HA 4RPOA 1IIWA 3VE1B 5K2XA 5TPAA 1DSNA 2XXPA 2UVGA 1QUIA 2QJEA 3W15C 5DT6A 3S2VA 3SEUA 3TTRA 1LBBA 2RF1A 4LVQA 1MPBA 2RINA 2I0CA 3T22A 4MLVA 3LC8A 2HZLA 4OZ9A 1Y3NA 2A5SA 3SKPA 5FTHA 3T9VA 4U2RA 3IL1B 2VOZA 4POXA 1B0HA 3OD7A 5ITPA 2F8DA 4LZ7A 2NOOA 4RA1A 2XD3A 3OO6A 2PX1A 2O51A 4YB7A 1T0KA 2HEUA 1MH4A 2HAVA 3H6WA 1YAEA 2I3WA 2RCBA 2DVCA 4LATA 4ZEIA 4NF8A 4N13A 4OYVA 3IOVA 3S4UA 3TTNA 3HCQA 1P1WA 3G3HA 4R6YA 4U21A 3A3CA 5TP9B 1QKBA 1SDXA 4RK9A 1VR5A 2ESNA 4OEVA 1MXUA 1TFDA 3Q26A 3O9PA 1A40A 5LOMA 3O97A 4JSDA 2GH9A 2GHBA 2W7YA 3HSTA 3N94A 5I56B 3D4GA 2XD2A 4DXBA 3GBAA 4GD5A 4RYAA 4OERA 1N7WA 4ZE8A 4F19A 2V84A 4IO4A 1XOCA 4QFOA 1QKAA 5FTIA 4N6PA 2G29A 5A5XB 3FIRA 2X7QA 4F3PA 4F22A 1AMFA 5L9SA 4LZ8A 2XXRA 4G77A 2YJPA 4U4SA 4QFNA 3UP9A 2PVUA 3MZBA 4KCDA 2DWAA 1NNKA 1DOTA 4XXUA 3PUZE 3PV0E 2QSXA 3MVXA 4IO5A 1GVCA 3TKDA 3K6UA 2HCAA 3PMWA 3I3VA 1MRPA 5TP9A 3N5LA 5FHNA 4DE8A 1MXYA 4H0WA 4EDPA 4I62A 5CRYA 2B3FA 1IUDA 2WKYA 2IEEA 2E0SA 5KZTA 2NUVA 3LSXA 4RXLA 4GFRA 3A09A 2FYIA 4MH5A 1MM6A 3ZKKA 1N84A 3H03A 1DTGA 1AOVA 1B51A 4H8IA 3K02A 3B7DA 3T9HB 2PMSA 3R7XA 3C31A 3H06B 3SEXA 3MVWA 2E1SA 4EXKA 1EZ9A 5A5XA 2OLBA 4QSDA 1SW1A 1SI0A 1R9LA 3K1PA 3C35A 1P99A 1MY3A 2PT1A 3CFLA 3KBRA 4TQUQ 2H4IA 2OCUA 3MWBA 4KCCA 4QFKA 5I57B 1A7LA 3KJTA 5K2YA 2ZYNA 1B5IA 3TYHA 1EZOA 3UORA 3IOUA 2F97A 1QVSA 1URDA 5DVJA 4PE5B 1OLAA 4G68B 1PDAA 5AA3A 2XXYA 4OFOA 1QUJA 2R9JA 1B5HA 4ELQA 4DXUA 4YMAA 1BP5A 1MXWA 1M5CA 3G3FA 4Q0CA 1NH8A 3WAEA 3USDA 3TELA 4KYEA 3PU5A 3PPNA 1M5BA 4NF4A 2R6GE 3QUFA 2O7IA 1XVYA 4XKRA 2DSFA 2ONRA 2UYEA 4JSOA 5CI5A 3MZ1A 4F31B 3VVDA 2G93A 1UIVA 5B70A 3HPIA 2LAOA 4NWDA 2QS2A 1ELJA 3ILUB 2DOJA 3MZ9A 1PC3A 4OWDA 1URGA 2Q2CA 1O64A 1QULA 1USYE 3B6QA 1SW5A 2NXOA 3EHTA 2NWJA 2D3IA 2OK2A 1NNTA 2RC8A 1UTBA 4P0GA 2DE3A 3D4CA 3FXRA 3I5OA 4G68A 1WODA 3TTLA 3OMBA 4F29A 4YKPA 4LZ5A 2HQ0A 3MP6A 3FVKA 2D5WA 3OSRA 4ONYA 1LAHE 3U1OA 1FTLA 4FE8A 1N0TA 1H44A 5AE4A 1I6BA 2XX8A 3ILTB 3MVYA 3T96B 1I69A 1LCTA 4ZZAA 3AXFA 2XX7A 1GGGA 1PB7A 4AB5A 5I59B 3PPOA 2OWTA 1USYH 4KD5A 4YB6A 4GVOA 1Y20A 1B7HA 1NKXA 1P1QA 3PUXE 4IGRA 2HAUA 3CSGA 3G3GA 3M3LA 4PFTA 2VP1A 4G8NA 3UGWA 2I0BA 3SETA 4R72A 1LBCA 2XX9A 1JVYA 1TWYA 3IO6A 4PFUA 3VXCA 2ZMBA 1NFTA 1Y9UA 1Y4TA 1UIUA 1PEBA 3G7WA 5H8SA 4KI0E 2F6PA 3BKIB 4DZ1A 1IXIA 3VXBA 2REGA 1D4NA 4JWXA 2PT2A 3EPEA 1NNFA 1ZIUA 1GR2A 3QK6A 4UA8A 4C1UA 3OSQA 3H6UA 4GWOA 3KN7A 5CBSA 1UTHB 4QHQA 3W9VA 3QUJA 3H3GA 1M5FA 1A8EA 3CG3A 4PQJA 5AA4B 1D9VA 1JETA 3PMVA 5CMBA 3IB1A 3K6WA 1D9YA 2DQVA 4EQBA 1TXFA 1B7UA 5I2KB 4EQ7A 2GFEA 4GXSB 3UIFA 4Z7EA 2I4BA 3OO8A 3FATA 3TCGA 2Y84A 2UYFA 1UQWA 3IB0A 2ABHA 4QRZA 2Q88A 4DCXA 4ISUA 4FJPA 2OBGA 4NEDA 1ZU0A 1SYIA 1PB8A 3C32A 3U8QA 5AA2D 1B3HA 2Y7IA 3PUYE 1AIVA 2P1SA 4G8MA 3KEIA 1ZBMA 2A5TA 3TUSA 3N6UA 3O6GA 2O1MA 2XXQA 1B40A 1LLSA 3VDFA 2O84X 1N3WA 3L6GA 3V83A 1UTHA 3Q28A 1VFDA 5AA4A 3O66A 5BUUA 2O69A 2OWSA 4C1TA 4F1VA 4GQOA 4ELPA 3MPKA 1B7ZA 3CR9A 4EXLA 3FJMA 1B1HA 1DTZA 2DP8A 4YKIA 1N7XA 5I2KA 3UN6A 4QF9A 4IB2A 3PUVE 2B3BA 1Q1KA 2CMOA 2Y7KA 4NTLA 4G4PA 3MP8A 1BLFA 3SEYA 1H76A 2I6EA 2ZNUA 4ZE9A 2PYYA 3BBRA 3T9UA 1JW1A 3O29A 3C33A 4OFJA 3WAFA 5F1QA 4Z0IA 1JVXA 2RKMA 3GLBA 2F78A 4H65A 3OO7A 3EQ1A 4MF3A 1Y3QA 3RUMA 4FECA 4G8HA 1JNFA 2FA7A 2V25A 2RC7A 1LFIA 1QW0A 2XHDA 4R73A 1MQHA 1SW4A 4FEBA 1XC1A 4KFQA 2AIXA 4XKNA 2Y7RA 1MQIA 3MVZA 3DELB 3FVNA 4G68C 2REJA 3BFTA 1XHYA 4IGTA 1I6AA 3MW0A 1B3LA 3ODBA 3E4RA 3TCHA 3VLWA 3RT6B 5L9MA 1B58A 4GLIA 3IK6B 4R9FA 1LB9A 4F1UA 4I8CA 1P1UA 4NWCA 2KLFA 1TT1A 1XS5A 2AL4A 2DYXA 4C0RA 1Y1ZA 3TTKA 1B4HA 5HM4B 2UVHA 4GIZA 1MH3A 2P2AA 2H25A 4XTCQ 1FTOA 2F5XA 3RTWB 2VD3A 3TTMA 4QSEA 4HS7A 3ZKLA 5DVIA 2Q2AA 3IJOB 1A8FA 1EU8A 5JEIA 4XKPA 2I48A 4FORA 4IO6A 4IY6A 4NF4B 4DIGA 1O63A 2B65A 1DPEA 3FJ7A 4MBPA 5BWJA 1Q35A 4KR5A 2F7AA 2ANJA 4KQPA 2V93A 2O1LA 3TPAA 4F3GA 1QUKA 3IX1A 2O6AA 5JTYB 3LSFB 3K0VA 5IAIA 5FHOA 3VLVA 4IO2A 3F11A 4OTEA 2VGQA 4POWA 1IEJA 4BDOA 2Z23A 1B3EA 1Y3PA 4RPNA 4EF1A 1UTBB 1IITA 5EYFA 3U94A 4FIMA 4THIA 3ONMA 4NMYA 3KG2A 3S9EA 5ISUA 3G3IA 2NVUB 4IO3A 4HTGA 2R71A 1OVBA 2QS3A 4FAJA 4Q8RA 1JW5A 4OVJA 3FXQA 3IB2A 2Z8DA 3TAJA 2H98A 4X9TA 4XKQA 1ZLQA 1EZPA 1URSA 4YKKA 3PMXA 1FQCA 5IKBA 1IXCA 1LSTA 2THIA 4F3BA 5ICQA 2OJTA 3M3FA 4JXIA 5DTBA 5JTYA 4Q30B 3FVOA 4R2FA 1FTKA 1NH7A 4U4XA 4H6DA 1MQJA 4X48A 1MY0A 5JK4A 4ZEBA 3TQLA 3KGCA 3K6VA 3KSXA 2QMXA 3THIA 4WEDA 1PBPA 3MUQA 5L8DA 3O6HA 1SBPA 1IXGA 4LONB 5ICTA 1P1NA 2YLNA 3K00A 3QSLA 3LSLA 2Z8FA 4JWYA 2I3VA 1OQHA 1FQAA 1JW4A 4TLLB 3FJGA 2GRVA 1R1NA 4LQ5A 2ZYKA 3M8UA 3V5AA 4ZEDA 1OMPA 1IXHA 4ESXA 3A3UA 4ELOA 3N26A 4I9DA 3S9MC 4KHZE 1M5DA 1H43A 2H5YA 1J1NA 3OEKA 3GBBA 1MY1A 3TQWA 1LFHA 3TMGA 3IJXB 4H5GA 3GXAA 2DWJA 4M4GA 2Y7PA 1RYOA 4NF5B 3TDJA 1P1OA 2H99A 2QRYA 2GHAA 4QFLA 3E9XA 2F36A 1Z7NE 4O3AA 5H8FA 5KDTB 1OIBA 1MXVA 2HXWA 4FEDA 1BIYA 2HFBA 1MQDA 3DP4A 3S9LC 1PBQA 2I49A 3CVGA 4LUBA 3VVFA 2V3UA 2XXHA 4BDRA 3DLNA 2P0SA 5H8NA 3KFMA 3OXNA 4OESA 5DVFA 5L9OA 3MBPA 1JQFA 1O7TA 3IR1A 3Q27A 4OEUA 1B05A 5AA2A 3RT8A 5KCJA 4ZZEA 2A5TB 4HCYA 1JEUA 1CE2A 3UK4A 4TOZA 3DP8A 3QIMA 4E0WA 3V8XB 3C36A 4GF8A 1MQGA 2F6GA 1B4ZA 4NF5A 2F34A 4F1YA 3ZS6A 3IO4A 1MPDA 4E0XA 3RN8A 5EHSA 2XXWA 3E13X 4ZECA 2RCAA 4KPTA 1BTJA 2ALUA 3O2AA 1B6HA 1FQDA 5KDTA 3K6XA 4PFYA 1XVXA 5HPQA 1QJMA 4K3FA 2XXXA 3U93A 3HO7A 3PUWE 1AL3A 4DLDA 4LP2B 4JDFA 4WXJA 2O7UA 4WEPA 5CMKA 1RYXA 2UVJA 3VV5A 5CBRA 1LAGE 4F18A 3CRBA 2CZLA 1LFGA 4GRKA 4BDMA 1SQYA 3O28A 4OMBA 3HHFA 3EN3A 3K4UA 3PD9A 4IY5A 1FQFA 1B5JA 1VFEA 3V89B 1NL5A 4AB6A 1Z7ME 4GL0A 5B7DA 3C4MA 3TCFA 3FVGA 4X1DA 3FV2A 2V3TA 4O3CA 5EHMA 1YTVA 5I2NB 1AH5A 4YB5A 2UXAA 2QL3A 3LSWA 1ZJLA 2AYSA 5I58B 1SVXB 1GV8A 3RQTA 4O3BA 4KYSA 4UACA 4ZEFA 4JB7A 2VD2A 1S9TA 3MAMA 3K2DA 2DWHA 3N6TA 1D3KA 3C9HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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