1EZPA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin using peptide orientations from dipolar couplings
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords MALTODEXTRIN BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 45
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezpA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezpA01
2Y7WA 1NNPA 4U2RA 3LUYA 2RKMA 2QSXA 3U1OA 3KSXA 4IY6A 2A5TB 2XXUA 2ZYOA 1MG1A 1GR2A 3TPAA 2D3IA 1NMUA 2Y7RA 3LR1A 1YAEA 1ZU0A 2F78A 3RTFB 4NF6B 1B1XA 1LBBA 4LATA 4ESXA 2DE4A 3CFZA 4F1YA 4BDLA 2I6EA 2P2AA 4MF3A 4YB6A 1DPPA 2X7QA 4F3SA 5I59B 4MLQA 4IY5A 1MQHA 1Y4CA 3FVGA 3SEUA 1R1NA 2VOZA 3C35A 4OENA 4OFJA 4U21A 3ONMA 3SEXA 1RYOA 5B7DA 1LAHE 2DXRA 2QS1A 3K6WA 1FTMA 2HAVA 3I6VA 3TDJA 4DXBA 2F6GA 1B7UA 3FJMA 3H6TA 5CBSA 3R6UA 1FQAA 1S7YA 4HW8A 3PD8A 3CVGA 5L8DA 2ONRA 4EF1A 3V83A 1SVXB 4OERA 3T9HB 2VP1A 1AIVA 4U22A 1VE4A 1MXZA 1P1NA 2I4BA 2M8CA 5IKBA 3FD3A 1UTBA 5DVJA 2B3FA 3AXFA 2G93A 3EPEA 2FA7A 3GBAA 3G3FA 1H43A 4GL0A 4ZE9A 2AYSA 3ZKKA 4RK2A 5IAIA 3S4UA 2V3QA 3RTWB 3IJXB 1ELJA 5FHNA 1OLCA 4IO5A 4YICA 2RC9A 4TOZA 1MXYA 1ZBMA 1Y3PA 3RLFE 5DYHA 3A3CA 3TTRA 3SEVA 5I58B 5CMCA 3E3KA 2X26A 4WEDA 3LBSA 2DVCA 5A5XB 2PYYA 4LONB 4NE4A 1OQGA 3SETA 3B6QA 4AB6A 1B40A 1M5CA 2O68A 3TTKA 2UYEA 1LSTA 4PFUA 4ZZAA 2HAUA 5I2NB 3OOAA 4JWXA 1DSNA 2CZLA 4JWOA 1POTA 1JVYA 2Q8JA 5AA2A 4F2QA 3T9XB 4G68B 1EZ9A 1MY3A 1I69A 4FECA 1Y4TA 1GTKA 1FQCA 3CI8A 3KN3A 1ANFA 3K02A 1XHYA 2Y7PA 1MM6A 3B6TA 1CB6A 5H8HA 3SERA 2KLFA 2DOJA 1BTJA 4IO7A 3UP9A 3TODA 1DMBA 5TU0A 4AQ4A 5KDTA 4X1BA 4G77A 3VXCA 2RINA 1N3WA 1ATGA 4F2OA 3OO9A 1B4ZA 2NXOA 2ZNUA 1P1UA 3TEPA 1MM7A 4Z7EA 3ILTB 4QRZA 3RT6B 1NFTA 4QSDA 3OELA 3VDFA 5CM6A 5L9SA 3PUZE 4ZS9A 1P1WA 4ZE8A 3CFLA 1MQJA 3FATA 2ABHA 3D4CA 2QMXA 3C32A 4F1VA 3U92A 4X9TA 4GVOA 5DEXB 2Y7IA 1HSEA 5ICQA 1B5JA 1UTHA 1OQHA 2GRVA 1Q35A 4XTCQ 1EH3A 2RCBA 4IB2A 2R6GE 5AA4B 1IXCA 1TFAA 3SDFA 3GZGA 4LQ5A 4NF8A 4IO4A 4EXLA 3FV2A 3M3KA 5DTBA 3IX1A 4JSOA 1PDAA 3E13X 2R9JA 5JTYB 5EHMA 1R9QA 1MS7A 4R9FA 3LSWA 3PU5A 1F9BA 4R73A 1FTLA 1JNFA 2GH9A 2HQ0A 4ZEBA 4XXUA 4M1VA 1IZ1A 3UA8A 2ONKE 3G3KA 2FYIA 2V93A 2XXPA 4F31B 3MVZA 4JSDA 2DWJA 5JK4A 4QFPA 4YU0A 3MP1A 4R9GA 4TLMB 3RN8A 4AB5A 3FXUA 3N94A 4EQ9A 1S50A 2F6PA 3UK4A 4ELOA 2O6AA 2UVHA 3T66A 3IO4A 1MXUA 2GHAA 1B3EA 3CIJA 4N6PA 3TQLA 1LCTA 5DT6A 4KD5A 3PMVA 2H98A 3MVWA 1US4A 3VVDA 3OXNA 2O7UA 4U23A 4OHNA 4OMBA 3FASA 5J1DA 1MQGA 3IL1B 1R6ZA 3CFXA 5M2VA 5L9OA 4LZ5A 3TCGA 2RCAA 1P99A 4OFOA 3U94A 2ALUA 1B58A 4F39A 4R6YA 1JVXA 2OCUA 1Y9UA 4KCCA 1CE2A 2GFEA 3CG1A 1SI1A 1PBQA 4YMBA 3H4ZA 3PPRA 1OVTA 3O28A 2V25A 3PMWA 5ISUA 4L17A 1RKMA 3TELA 3MC2A 1MQIA 3F11A 2F34A 3O66A 3BFUA 5I2KB 4P11A 3V8XB 3QUFA 3EHUA 3G7WA 2XX9A 4ZECA 3HCQA 2Y84A 2ZNTA 3O6GA 5FTIA 3HN0A 5H8FB 4ZZEA 1QW0A 3MJNA 1UQWA 2PVUA 4F18A 4WEPA 3O29A 1NKXA 1XT8A 4H8JA 2UYFA 1YTVA 1N76A 3SESA 4BDMA 1B3FA 3T22A 2D21A 4G68C 2ZXTA 4KR5A 1MY0A 1BKAA 3U72A 4OEVA 4FE8A 4GRKA 5FTHA 1Y1ZA 5I58A 2IA4A 2QJEA 1KWHA 2O1MA 4MH5A 3MW0A 3OO8A 1PB8A 1NL5A 4LQ2A 3OMBA 1BLFA 4ELPA 3K6VA 2Z23A 3UGWA 4POXA 3B7DA 4PETA 2ZMBA 3IB2A 4X1DA 5L9MA 4ZEIA 2THIA 2UVJA 5H8NB 4YKKA 3PGFA 4LA9A 1O63A 1XS5A 2W7YA 1R9LA 3I3VA 2PT1A 3DP4A 1OIBA 2PMSA 2DYXA 2XXHA 3KEIA 4WXJA 3OD7A 4QFKA 3UIFA 1B46A 3W9VA 1O7TA 4NWDA 4GXSB 1D9YA 4OETA 3S2VA 4POWA 1USYE 1M5EA 4Q30B 3VFJA 3MBPA 3O97A 3O2AA 1AH5A 1N3XA 2ANJA 5BUUA 4QSCA 5F7VA 3HHFA 3PUXE 3KN8A 3KFMA 4XKPA 1IIWA 2HCAA 3V5AA 3SEWA 3VLVA 3C36A 1DTGA 3PV0E 4C1TA 4JWYA 3V89B 2Q2CA 1T0KA 3MAMA 1PB9A 4BDOA 4H6DA 3ZKLA 4Q5TA 4TQUQ 1JW1A 2UVIA 2PT2A 3DM0A 1LGBC 2ZYNA 2PX1A 2XD2A 2OBGA 5H8SA 4RXLA 2DQVA 3KBRA 4PQJA 1B5IA 5AA1A 4GQOA 1B1HA 3MP8A 1MY4A 3K1PA 1GVCA 5DEXA 2OJTA 4QSEA 3RGYA 1QUJA 3TUSA 1IXGA 1YPNA 1BP5A 1VR5A 2NVUB 3H6WA 2RC7A 1QJMA 4JDFA 5I84A 1A55A 3MVYA 5DVIA 1A40A 3TAJA 1URDA 3IR1A 1Y20A 2Q2AA 2I48A 4RA1A 3CSBA 5I57A 1B52A 2DE3A 4EDPA 3QYTA 1P1QA 1NNFA 1MXWA 3K2DA 4PE5B 4FEDA 2E1SA 1B0LA 1TXFA 2DS9A 2HZKA 1OVBA 4NF4A 1QKAA 4QF9A 1SBPA 2OK2A 2DWIA 1FCKA 2YLNA 3MQ9A 3QIMA 3O6HA 1SW4A 3MP6A 4EQ7A 1AL3A 3N6UA 5CRYA 4JXIA 4LZ7A 2Z8DA 3A3UA 5HM4B 3FGSA 4F29A 3TTMA 1L5TA 1QVSA 2B3BA 3ECRA 4R75A 1I6AA 3H06B 4ELRA 3QUJA 3K01A 2ZNSA 5ELVA 1ZIUA 2ZYKA 4G8MA 1D9VA 2NOOA 1MH4A 2VD2A 4BDQA 2P1SA 3BKIB 4RYAA 5TP9A 5ITPA 2O1LA 3Q27A 4RK9A 2I3WA 5AE4A 5KCJB 1Z7NE 4P0IA 1LB9A 3K1NA 1MY2A 4NF5B 2WKYA 1SQYA 3G3IA 3H6UA 1ZLQA 3VVFA 3RY3A 3C31A 3H6VA 1A7LA 2DWAA 2UXAA 5CMMA 4C1UA 1JEUA 3U8QA 1B32A 1IUDA 4GL8A 1MDP1 2OLBA 4YKJA 3KOTA 4P0GA 1FTJA 4HCWA 3MZBA 1AMFA 1HSLA 3WAFA 3TKDA 5ICTA 1B7HA 5I2KA 1A54A 2XXXA 1QUIA 1Y3QA 4OVJA 4DCYA 2RF1A 4ND9A 1PC3A 3O9PA 1D3KA 1MPBA 3USDA 4RPOA 2B65A 4K3FA 4F3GA 3K1MA 4X48A 3IOTA 2LAOA 3PPQA 1B51A 2H9BA 3CG3A 1UTBB 4BDRA 4TLLB 3K4UA 1VFEA 3FV1A 2IEEA 3UN6A 4DXUA 3IOVA 3M3LA 3PPNA 4YAHX 2HEUA 3IB1A 2G29A 4FEBA 2I49A 4O3AA 3C9HA 1ZJLA 3VXBA 4KI0E 1WODA 4HS7A 1B05A 1B7ZA 1LFGA 3TFLA 3JV9A 5JEIA 4G8HA 4R72A 1UIVA 4KYDA 5HBCA 1B3GA 1IQ7A 1FTOA 3HO7A 4ISUA 3TTLA 2F7CA 2A5TA 4JB7A 4PFTA 3QAXA 4F3PA 3FJGA 4N07A 1H76A 2F35A 3W9WA 4ZDMA 5CC2A 4NF6A 2XX7A 2XXQA 4GWOA 2O51A 1MPDA 3MPKA 4RY1A 5H8QB 2REGA 1LFHA 3K6UA 3A09A 1LAFE 4FORA 1MPCA 2F7BA 4GXAA 4HCYA 3RPWA 4U1OA 5KZTA 1VSOA 5AA2D 3B6WA 4OXVA 4ECFA 4F1UA 3CSGA 1J1NA 1QKBA 2PBWA 2Z8EA 5I59A 4UA8A 1DTZA 5K2XA 3KG2A 3ILUB 1WDNA 1IEJA 3M3FA 2AL4A 1BIYA 3LSXA 2GHBA 4ONYA 4R6HA 3DP8A 4YZZA 2Y7KA 4U1ZA 3W15C 2FNCA 2F8DA 4Q0CA 4N13A 4KQPA 1B2HA 1FQBA 1N0TA 1HSJA 5K2YA 1LB8A 5CBRA 4LUBA 3C34A 1A8FA 3EHSA 3C33A 1B5HA 4H65A 5CI5A 4GLIA 2E0SA 3O6IA 4MFIA 3RQTA 1B3LA 3VLWA 1MRPA 3S9LC 2X7PA 3T96B 2O69A 1WVJA 4BLAA 4M4GA 5I56B 4H1XA 5DVFA 1MDQA 4OTEA 1GV8A 4BDNA 4DZ1A 4I62A 2CMOA 2VD3A 4XKQA 2DWHA 4OESA 4THIA 3CR9A 1IXHA 3L6HA 4IO2A 1I6QA 3TCFA 4XKRA 1SDXA 1UTHB 4R6KA 3T9VA 1OLAA 4EQBA 4DLDA 3MZ9A 3IB0A 1QUKA 4YKIA 4QFOA 4NF8B 3PUVE 4MLVA 3L6GA 2H4IA 3G3GA 1Q1KA 1A99A 1USYH 3GBBA 3S9EA 2QMWA 3FVKA 3MPLA 4G4PA 4RNSA 2V3UA 3Q29A 1XC1A 1LFIA 1AOVA 1PEBA 2F97A 5A5XA 5CMKA 2DE2A 1VFDA 4IO6A 4R2FA 3TQWA 3VLUA 4DXCA 4I9DA 2NWJA 5EHSA 2ONSA 4Q8RA 2XX8A 3KOSA 1TWYA 3G3HA 2H25A 4UACA 5I2NA 1FQFA 3LC8A 1LLSA 3DLNA 3T93B 3K00A 2Z22A 4G68A 4EF2A 4KYEA 4DIGA 1I6BA 1POY1 1JW5A 3ZSFA 3FXQA 3THIA 4NWCA 1JQFA 3PUWE 2RC8A 3VE1B 5KCJA 1DPEA 3FIRA 4NF5A 3SEYA 2XD3A 4H8IA 1II5A 3KSJA 3HHGA 4YB5A 4OZ9A 3E4RA 2XXVA 5BWJA 2QS3A 3IOUA 1NNTA 5CMBA 4I8CA 3QK6A 3OSQA 3U93A 3R26A 4IO3A 3PMXA 3OEKA 1N04A 1PB7A 2HXWA 2F36A 2D5WA 1LAGE 1TT1A 2HZLA 3KN7A 4ZEFA 3RNNA 2XXIA 3C4MA 1EZOA 3S9MC 4H67A 3FUZA 3OO7A 1LAXA 5TPAB 3IAZA 3PPOA 1FQEA 4MBPA 4EUOA 4FATA 4OWDA 1URSA 2V3TA 3N5LA 4ELQA 2I0BA 3D4GA 2DXYA 4XIGQ 3CRBA 4H5FA 4PFYA 4QFNA 5AA4A 1XVYA 1P1OA 1FTKA 2XXWA 3EHTA 3I5OA 4O3CA 4EXKA 5FHMA 3GLBA 5AA3A 3TTNA 4OFLA 5JTYA 1XOCA 4QFLA 3KGCA 2QRYA 1H44A 2DVZA 3LSFB 3WAEA 4GOTA 4Z0IA 2AIXA 4E0WA 4RPNA 3FJ7A 1A8EA 1MH3A 5HPQA 4ESWA 3FZVA 3KJ7A 1S9TA 3HSTA 2ESNA 1B3HA 2I3VA 4FAJA 5H8QA 3EF7A 4GD5A 4NMYA 2F7AA 2QPQA 3LSLA 4R74A 4G2ZA 1H45A 5FHOA 1Z7ME 4NEDA 3UORA 1B6HA 3TMGA 3K0VA 2XHDA 3MVXA 4KHZE 1B4HA 2H5YA 1M5FA 4O3BA 1QULA 3SKPA 1MQDA 1O64A 1SW1A 1RYXA 3HV1A 1FQDA 4DCXA 3E9XA 2OWSA 3G3JA 1SYHA 4IGRA 4F22A 3FXRA 2REJA 3QXMA 4U4XA 3IK6B 1Y1MA 4GF8A 3H7MA 3ODBA 3TYHA 4H0WA 3JYRA 1XVXA 5I56A 3H3GA 1SYIA 1SD3A 4YKPA 4C0RA 3FVNA 2Q9TA 3DP6A 1IITA 3H03A 4G8NA 4DE8A 5B70A 5H8FA 2DSFA 3N6TA 4R2BA 1M5BA 1NH8A 4I1DA 1PBPA 4LP2B 1TFDA 1N84A 4PP0A 4PFWA 2O7IA 3HPIA 2VHAA 3IO6A 4ZEDA 4GFRA 1JETA 4JBZA 1ZKBA 3R7XA 3OO6A 5EYFA 4F3BA 3TZAA 2UVGA 3DELB 4KYSA 4ZEKA 5I57B 1B9JA 2P0SA 3FVOA 4WKMA 1FW0A 1DOTA 4NF4B 2V84A 1JW4A 2AL5A 3EN3A 4NTLA 1MXVA 5ITOA 3PPPA 3VVEA 4E0XA 1N7XA 5H8NA 1NNKA 3Q25A 2XXRA 4F19A 2HFBA 3P7IA 1B0HA 1M5DA 2Z8FA 3QSLA 4RJZA 3EQ1A 4FIMA 4KPTA 2Q89A 3PD9A 4DDDA 4KFQA 1US5A 3ZS6A 3VV5A 5AA2B 4OYVA 1YCJA 4YMAA 2NUVA 3RUMA 3GXAA 1MY1A 3BBRA 1MXXA 2OWTA 1GGGA 2XXYA 5TP9B 4QHQA 5LOMA 4YB7A 3MZ1A 1ZTYA 3BFTA 1N7WA 3K6XA 4XKNA 3KJTA 3N26A 3S9NC 2I0CA 1JEVA 3IJOB 4U4SA 3OEMA 5H8HB 1NH7A 2I58A 2QS2A 2H99A 1D4NA 1OMPA 4HTGA 2VGQA 5KDTB 4KCDA 5F1QA 3TCHA 4H5GA 1H3DA 2ZYMA 3IORA 4IGTA 3Q28A 3M8UA 3PUYE 5TPAA 2BJJX 3KZGA 4OEUA 4LVQA 3OSRA 2DP8A 2XXTA 2O84X 3MUQA 2I4CA 1LCFA 2QS4A 2F5XA 1IXIA 1SW2A 2YJPA 3JZJA 2OZZA 4GIZA 2A5SA 3T9UA 4FJPA 2QL3A 3MWBA 1EU8A 1LBCA 1URGA 1ZMGA 1Y3NA 4LZ8A 4OQOA 3IOWA 3OENA 1SW5A 3Q26A 2R71A 1SI0A 1EZPA 2Q88A 3RT8A 1UIUA 2YPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3B8BA 2Y7WA 1NNPA 4U2RA 3LUYA 2RKMA 1VDWA 2QSXA 3U1OA 2Y5KA 3KSXA 4G61A 4IY6A 2A5TB 4PFRA 2XXUA 2ZYOA 1MG1A 1GR2A 3TPAA 2D3IA 4P1EA 1NMUA 2Y7RA 3LR1A 1YAEA 1ZU0A 2F78A 3RTFB 4NF6B 1IMDA 1B1XA 5ESYA 1LBBA 4LATA 4ESXA 2DE4A 3CFZA 4F1YA 4BDLA 2WEFA 2I6EA 1FPEA 2P2AA 3FBPA 1FBGA 4MF3A 4MIJA 1FPFA 4YB6A 1FJ9A 2QVRA 1DPPA 2X7QA 4F3SA 4N8GA 1YZ0A 5I59B 4MLQA 4IY5A 5ET6A 4QXDA 1MQHA 1Y4CA 4GX3A 3FVGA 3SEUA 1FPGA 1R1NA 1NV0A 2VOZA 3C35A 4OENA 4OFJA 4U21A 3ONMA 3SEXA 4GWZA 1RYOA 5B7DA 1LAHE 2QFLA 2DXRA 2QS1A 3K6WA 1FTMA 2HAVA 5I3SA 1NV4A 5ET7A 3I6VA 3TDJA 4DXBA 4JVCA 4GX4A 2F6GA 1B7UA 3FJMA 3H6TA 2HXRA 5CBSA 3R6UA 4NF0A 1FQAA 1S7YA 4HW8A 3PD8A 3CVGA 5L8DA 2ONRA 3KC0A 4EF1A 3V83A 1SVXB 4OERA 3T9HB 2VP1A 1AIVA 4U22A 1VE4A 4GWYA 1MXZA 1P1NA 2I4BA 2M8CA 5IKBA 3FD3A 3MYUA 1UTBA 4N15A 5DVJA 2B3FA 3AXFA 2G93A 3EPEA 2FA7A 3GBAA 3G3FA 1H43A 4GL0A 4ZE9A 2AYSA 4PAIA 3ZKKA 4RK2A 5IAIA 3S4UA 2V3QA 3RTWB 3IJXB 1ELJA 5FHNA 1OLCA 4IO5A 4YICA 2RC9A 4TOZA 1MXYA 1ZBMA 1Y3PA 3RLFE 5DYHA 3A3CA 3TTRA 3SEVA 5I58B 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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