2PVUA

Crystal structures of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein artj from the thermophilic bacterium geobacillus stearothermophilus
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
235
structure length
235
Chain Sequence
GATKKKVVVGTDAAFAPFEYMQKGKIVGFDVDLLDAVMKAAGLDYELKNIGWDPLFASLQSKEVDMGISGITITDERKQSYDFSDPYFEATQVILVKQGSPVKNALDLKGKTIGVQNATTGQEAAEKLFGKGPHIKKFETTVVAIMELLNGGVDAVITDNAVANEYVKNNPNKKLQVIEDPKNFASEYYGMIFPKNSELKAKVDEALKNVINSGKYTEIYKKWFGKEPKLDRLKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Geobacillus stearothermophilus
publication title Crystal structures and mutational analysis of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein ArtJ from Geobacillus stearothermophilus. Implications for interactions of ArtJ with its cognate ATP-binding cassette transporter, Art(MP)2
pubmed doi rcsb
molecule keywords ArtJ
total genus 79
structure length 235
sequence length 235
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2pvuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2pvuA02
2I48A 1QW0A 1EU8A 2Z8FA 4H67A 2F7BA 2Z8EA 2D3IA 3IOVA 1VSOA 3HV1A 5H8FA 3VVEA 2QPQA 2NUVA 1NNPA 4OFLA 4AQ4A 4PP0A 2VOZA 1ZIUA 1SBPA 2H9BA 2Y7KA 1LBBA 3H3GA 1US4A 4OQOA 1SI0A 5CMBA 5ICTA 4NE4A 3VXBA 4G8HA 5CBSA 4I8CA 4R6KA 4XKRA 4NTLA 4YU0A 4IO4A 4ZEKA 4O3AA 2NOOA 1PB7A 3PPRA 4MH5A 1POTA 1QUJA 1SW1A 1H44A 1MQGA 4OEUA 5AE4A 4IO2A 3FV1A 2ONKE 4KYSA 4YMBA 4OTEA 5I57B 3TTLA 4P0IA 5H8QA 2WKYA 2DE4A 1URGA 4NF4A 2OZZA 1Q1KA 2ZMBA 2DE2A 2P2AA 2H98A 2RC8A 1FQAA 3OEKA 4H8IA 2DWAA 3EN3A 2O68A 4IB2A 1FTJA 3CSBA 5L9SA 1LFIA 2X7PA 3TCHA 2KLFA 1LSTA 1P1QA 1Y3QA 1M5FA 4FIMA 4LP2B 4DDDA 1R9QA 1A54A 4XIGQ 3EF7A 3OXNA 3MP8A 1PB8A 2D5WA 4F19A 2UYEA 4NF5A 1OLCA 2O84X 4IY5A 4LONB 1ATGA 4MFIA 1RYXA 1TWYA 1AMFA 3SESA 1Y3NA 1B2HA 4KQPA 2XXIA 4POWA 1HSJA 3PMVA 4ELPA 3LSXA 3VV5A 2ANJA 5HBCA 3N6UA 4ELQA 2GHBA 4L17A 5DT6A 1ZMGA 2R71A 4F29A 3S9EA 1B1XA 4GOTA 4LUBA 4F3BA 3MPKA 2X26A 3GLBA 3RTFB 1QUIA 1NNFA 2Z22A 2Q9TA 4ZEDA 5TP9B 4EQBA 3USDA 1UTBB 4KYDA 5IKBA 3G3JA 1Y4TA 4NF6B 4KD5A 4PFTA 1B05A 3PPOA 1LLSA 3PUZE 3U8QA 1I69A 1Q35A 5F1QA 1RKMA 3M3KA 2H25A 3PMXA 5TPAA 1S9TA 3CFZA 4ELRA 4LZ8A 3N5LA 1FTLA 1FQEA 4GFRA 2PT2A 2QL3A 4ZE8A 3KEIA 3IOWA 5ITPA 4LA9A 4U21A 1MXXA 2DYXA 1IQ7A 3C31A 3MP1A 3CR9A 3GBAA 5H8FB 3B6TA 2I4BA 4H5FA 3DP8A 3IORA 5H8SA 3M8UA 2UVHA 4C1UA 2FNCA 3G3KA 4HCYA 1GTKA 3PUYE 4RY1A 2Q89A 4IO6A 3MZBA 4F1YA 4ZEBA 4EXKA 1WDNA 3TKDA 1B9JA 1WODA 1B51A 3W9WA 1SW4A 4IGTA 2I58A 1LFHA 1N7XA 4ISUA 1H45A 5DVIA 1NFTA 1F9BA 2ALUA 2IEEA 5LOMA 1P1WA 1DOTA 5H8QB 1O63A 1MQDA 4OERA 2VGQA 4DXCA 1BP5A 3DM0A 1POY1 2PYYA 3C34A 3OMBA 4NF4B 2Z8DA 3S9LC 3ECRA 4F2OA 4JB7A 3TFLA 3PUVE 3FJGA 4THIA 4R2FA 2HAUA 1FQCA 2ESNA 4ZS9A 3A3CA 3MC2A 5I84A 2QS3A 4RPOA 5CMCA 4O3BA 1B6HA 5AA4A 4QFNA 4H65A 4OFOA 4QFKA 2OLBA 4HW8A 2XXHA 1JVYA 3CVGA 3O29A 4KI0E 4NF5B 3QYTA 4JWXA 3UIFA 3Q27A 1N76A 4YICA 1L5TA 2QRYA 4DZ1A 4BDOA 1UQWA 1D9YA 1IEJA 2Y84A 3LSWA 5KCJA 1B46A 3IB1A 1II5A 3K6WA 4GD5A 3LBSA 5A5XA 3SDFA 4N13A 2OWTA 4DCYA 1LBCA 3PGFA 1USYE 2XXXA 3MJNA 2F6PA 2UYFA 3K6VA 1R1NA 1B4ZA 5K2YA 2DWIA 3C4MA 5H8NA 3IL1B 4BDLA 2P0SA 1YPNA 2XXVA 4FECA 4TOZA 1EZ9A 2HZLA 2LAOA 2NXOA 2QJEA 1B0HA 3CG3A 2HXWA 1H43A 4G68C 4OXVA 2ZYKA 5H8HA 3O6HA 3TEPA 4NMYA 1Y9UA 3AXFA 4ZDMA 3KN3A 1BKAA 3O6GA 2XX7A 4M1VA 1FTOA 4JSDA 2Z23A 3PMWA 5ICQA 3LSLA 3BBRA 4ONYA 2Y7IA 1LCFA 3P7IA 5TPAB 2E1SA 1XOCA 3RGYA 4YKIA 2QMWA 3FXUA 3CI8A 3VLUA 2DS9A 2DXYA 3SEXA 4LVQA 4BDQA 2V93A 3Q29A 4YB7A 2DE3A 1OQGA 2I6EA 5EYFA 2YPNA 3H06B 4BDRA 3KGCA 4XKNA 1XT8A 3O97A 1I6BA 3GXAA 2O51A 1B3GA 4C0RA 5DYHA 4R6HA 2VHAA 1OQHA 2XD2A 1LFGA 4ECFA 2QS1A 3I6VA 1B3LA 2VP1A 1JW5A 4KCCA 4PFUA 4YKPA 3TTNA 3D4GA 3ZKLA 2F35A 3VLVA 3TCGA 3C35A 3G7WA 2ZNTA 1I6AA 2Y7RA 1B7UA 4FATA 3RPWA 5I2NA 3QIMA 4G68A 4G8MA 4RNSA 1USYH 4ZZEA 3MWBA 1MY4A 1ANFA 2FA7A 3HPIA 1VR5A 3K01A 4E0WA 3FJMA 5KDTA 1MXYA 5I59A 4BDNA 4WXJA 3RT8A 3QUJA 3EHSA 3FJ7A 3ZS6A 3KOTA 1EH3A 1ZLQA 3T9XB 2QMXA 5AA4B 3FXQA 3F11A 3K00A 1JNFA 3OD7A 1DTZA 2ONRA 3N94A 1ZTYA 3PD9A 4NWDA 1MPDA 2A5SA 4RA1A 1IIWA 4OYVA 3KFMA 4QSEA 3RTWB 1MXZA 3MQ9A 4ZEFA 1AIVA 3OO8A 3V5AA 3VVFA 5A5XB 2GRVA 4QRZA 4AB5A 1B58A 1QVSA 1B32A 1HSLA 2PT1A 3B6WA 1O7TA 4RK2A 3T96B 3OO7A 1VE4A 3GZGA 1D4NA 2Q8JA 2Q2CA 5H8NB 1GVCA 3K6XA 3JZJA 2UXAA 2GFEA 3MVZA 1QULA 2V84A 5ITOA 1AH5A 2VD3A 4KYEA 1OVBA 3H6UA 3K1MA 5H8HB 2XXYA 4EUOA 1WVJA 3T9HB 4F3PA 3Q28A 2F78A 2HQ0A 1N7WA 4IO7A 3EQ1A 3Q25A 4U23A 3TAJA 3SEVA 1M5BA 4H0WA 4Q0CA 4DXBA 1N84A 3CIJA 4WKMA 1EZOA 3TQLA 4OVJA 3VFJA 1P1UA 2RC7A 5JTYA 3MVWA 2O7IA 3QAXA 4MLQA 1A99A 2FYIA 4HTGA 4YB6A 3U92A 3M3FA 1D3KA 4R75A 4YZZA 1LAHE 2HEUA 3S9MC 3MVXA 3KJ7A 2NVUB 3TUSA 1NNTA 1B4HA 4IGRA 1FQBA 2QSXA 2REGA 4EQ7A 1JEVA 4YAHX 3T9UA 2H99A 4LQ5A 4I62A 2Y7PA 1B0LA 2PBWA 1PBPA 3OOAA 3KN8A 3MW0A 2ZYMA 1MDP1 1MPBA 4GLIA 2XHDA 3KZGA 1MG1A 2F34A 3O66A 4XKQA 1O64A 2GH9A 5FHNA 3ZSFA 2RINA 2UVGA 3U94A 2F97A 1JW4A 3E4RA 3KN7A 1IXGA 3T9VA 4G68B 4YKKA 3O2AA 5B7DA 1FW0A 3BFTA 2I4CA 3EHTA 2R6GE 1P1NA 1B52A 4H1XA 5KDTB 5F7VA 1H76A 1XVYA 2F8DA 5DVJA 4WEPA 3MPLA 4G77A 5M2VA 3G3HA 3TMGA 4U4XA 4F2QA 4FEBA 3VXCA 3SEUA 4OETA 2I3VA 1FTMA 2R9JA 1MY2A 4FAJA 1LAFE 5ELVA 5FTIA 4F1VA 1TT1A 4XXUA 3MZ1A 1FCKA 1S50A 1CB6A 4X48A 3DP6A 1MY0A 5DEXA 1MPCA 5L9OA 1ZJLA 4PFYA 4JBZA 2DXRA 3PPNA 1NH8A 2XX8A 3DP4A 4GF8A 3FZVA 2RF1A 3PV0E 4F3SA 1MM6A 3IO4A 1Y1MA 4PE5B 3TCFA 5I2KA 2CMOA 3K1PA 3U1OA 1Y4CA 4P0GA 4PFWA 5BWJA 4ESWA 4H6DA 3UGWA 5FTHA 1GGGA 2H5YA 3V83A 3TPAA 3FV2A 4F39A 1PDAA 2AIXA 1LGBC 4DCXA 2D21A 3ZKKA 2DVZA 4JWYA 3K2DA 1VFDA 4N6PA 3H7MA 3U93A 1YAEA 4X1BA 5JTYB 1FTKA 3W15C 3H4ZA 4OMBA 1BTJA 3FD3A 5CC2A 1JQFA 1B5IA 4OZ9A 1TFAA 4ND9A 1MXWA 1B7ZA 2I3WA 2DP8A 3T22A 4WEDA 3HN0A 4IO3A 5I57A 4GVOA 1MS7A 3HHGA 3I3VA 4F18A 4F1UA 1MQHA 3G3FA 1SVXB 2V3UA 1URSA 3RNNA 3IOUA 4KR5A 4EDPA 1BIYA 2BJJX 4QFLA 1MY3A 4GXAA 1MY1A 4FEDA 5K2XA 2I0CA 4TLLB 5I58A 1PC3A 3OELA 1ZKBA 4G4PA 2O1MA 1XVXA 5DVFA 2F6GA 3FATA 4KFQA 2XX9A 3UK4A 3C33A 1PB9A 1Y1ZA 4FORA 3RN8A 1GR2A 1XC1A 4RK9A 2RKMA 3TDJA 5L9MA 1DMBA 5BUUA 1IITA 2RCAA 3IK6B 2Y7WA 4H5GA 4NEDA 3K02A 3MBPA 3RUMA 3OSQA 3DLNA 4PQJA 1MDQA 3D4CA 2V3TA 4KHZE 5CRYA 1QKBA 1M5DA 4OHNA 1YTVA 1SQYA 3MVYA 2RCBA 2Q2AA 4RJZA 5J1DA 4U1ZA 4YMAA 2DSFA 4QSCA 4OWDA 3RT6B 2B65A 3TELA 4QHQA 1B3FA 2F7AA 2ZNSA 1M5EA 3L6GA 5I56A 4YB5A 4Q8RA 4RXLA 1A40A 3FGSA 5DEXB 4JXIA 3C32A 4RYAA 4F22A 3QXMA 1LB9A 3KSXA 5FHOA 3TTKA 4OENA 1OMPA 5JEIA 4UA8A 1QUKA 2X7QA 3MAMA 3PPPA 5AA3A 3CFLA 4JDFA 3JV9A 4U4SA 3IAZA 3VVDA 5I2KB 2B3BA 2O7UA 1TXFA 4Q5TA 2A5TA 2F5XA 5AA2A 1NH7A 3FVOA 1SW2A 3SETA 3TTRA 1LAXA 3PU5A 3S9NC 2AL4A 3MP6A 3C9HA 1SW5A 3N6TA 3VDFA 2VD2A 2M8CA 1TFDA 4Q30B 3O9PA 1MH4A 2O6AA 2NWJA 2YJPA 3PUWE 1KWHA 1OVTA 2OWSA 2F7CA 1J1NA 5KCJB 3GBBA 4U1OA 2HCAA 4NF8A 4AB6A 2ZNUA 1B3HA 4RPNA 3IO6A 4I1DA 5FHMA 3V89B 3EHUA 1AOVA 4G8NA 3K1NA 4ZECA 2UVJA 3LR1A 1B40A 2XXQA 1ZU0A 4DLDA 3TQWA 3MUQA 5CI5A 1MM7A 2XXUA 3G3IA 1B3EA 3HO7A 2OCUA 3R7XA 1JVXA 3FVKA 1IUDA 3L6HA 1CE2A 3Q26A 1EZPA 2O69A 2XD3A 1MH3A 3HHFA 4QFPA 4EF2A 3M3LA 4LZ7A 3CRBA 4X1DA 1S7YA 3K6UA 3FVNA 1MXVA 4LZ5A 3PPQA 2I0BA 3TODA 5I58B 4P11A 1PEBA 4M4GA 1DTGA 3TZAA 4XTCQ 3PUXE 4FJPA 1T0KA 2GHAA 4QF9A 3OENA 3RY3A 3N26A 3OSRA 2G93A 3TYHA 3DELB 2DWHA 2ZYOA 3KJTA 1LB8A 3QUFA 2AYSA 3O6IA 2OBGA 3OEMA 5KZTA 4E0XA 4IO5A 1Z7ME 2HFBA 5CBRA 3IOTA 4R73A 1QKAA 3QSLA 2PVUA 4JSOA 4OFJA 2F36A 4QSDA 3QK6A 1MXUA 3I5OA 1A7LA 3JYRA 4G2ZA 2XXPA 4U22A 4PETA 4OEVA 4R6YA 2DWJA 2I49A 5I56B 1B5JA 1OIBA 3LC8A 4XKPA 1P1OA 3H03A 1MQJA 3U72A 5I2NB 1URDA 2IA4A 1QJMA 3KOSA 2HZKA 1MQIA 3IB0A 5HM4B 2B3FA 1SD3A 3WAFA 1JETA 2ABHA 2DQVA 4GL0A 4LATA 1R9LA 3UORA 2P1SA 4H8JA 5I59B 3A09A 3W9VA 1UIUA 3H6WA 3HCQA 3R26A 3S4UA 1PBQA 3E3KA 2A5TB 2H4IA 4EF1A 5AA2B 4EQ9A 3PD8A 1A8EA 1ELJA 3K0VA 4R74A 2XXTA 1FQDA 3FIRA 1YCJA 3FUZA 1NL5A 1SI1A 3IJOB 4U2RA 4GXSB 3CG1A 3BFUA 4GWOA 4TLMB 4F31B 5CMMA 1NMUA 1R6ZA 1IXHA 4TQUQ 4NF8B 1UTHA 4ESXA 1Z7NE 4UACA 1SDXA 2CZLA 2E0SA 4QFOA 4ZEIA 1JEUA 3A3UA 3SEWA 2W7YA 5IAIA 4GIZA 3FVGA 3IR1A 2V3QA 3H6TA 1OLAA 5CM6A 1LCTA 2OK2A 1DPEA 2G29A 2OJTA 3CFXA 5ISUA 4IY6A 2DOJA 2THIA 3WAEA 3ILTB 1BLFA 3THIA 1GV8A 5AA1A 2RC9A 1IZ1A 4POXA 1SYHA 1A55A 2REJA 2XXWA 3ONMA 3H6VA 3E13X 3SERA 3KG2A 4JWOA 4BLAA 1Y3PA 3S2VA 4FE8A 1MRPA 1B7HA 1IXCA 4R9GA 4DE8A 2ZYNA 1N3XA 2QS2A 1XS5A 1ZBMA 5L8DA 3OO9A 3B6QA 4KCDA 2V25A 5TU0A 4EXLA 3VE1B 1DSNA 1B5HA 2ZXTA 3BKIB 2UVIA 1D9VA 1N04A 5HPQA 2XXRA 3SEYA 3OO6A 3G3GA 2HAVA 4ZZAA 1FQFA 4HCWA 4NWCA 5CMKA 4N07A 3RLFE 3T93B 3IX1A 1Y20A 3SKPA 4DXUA 1XHYA 4BDMA 4Z7EA 3ODBA 1AL3A 1N3WA 4MF3A 5EHSA 3FXRA 3ILUB 3LSFB 4R72A 4I9DA 5JK4A 3VLWA 3C36A 4GQOA 4KPTA 1M5CA 2PX1A 2Q88A 1N0TA 2O1LA 1I6QA 1JW1A 1SYIA 4MLVA 4O3CA 4GL8A 1A8FA 2AL5A 3TTMA 3K4UA 1P99A 1NKXA 5EHMA 4X9TA 2ONSA 4GRKA 2PMSA 3KBRA 5AA2D 1LAGE 3EPEA 4DIGA 3E9XA 4ELOA 3HSTA 1VFEA 4YKJA 1RYOA 2QS4A 3KSJA 4C1TA 1UIVA 3IJXB 1DPPA 3RQTA 4Z0IA 4R2BA 4R9FA 5B70A 3T66A 3B7DA 1H3DA 5TP9A 3CSGA 3UP9A 4MBPA 1UTBA 4LQ2A 1UTHB 4NF6A 1IXIA 1B1HA 3MZ9A 4HS7A 4OESA 4F3GA 3R6UA 4K3FA 3IB2A 1NNKA 3O28A 2DVCA 3LUYA 5DTBA 3V8XB 3UA8A 1HSEA 2YLNA 4ZE9A 1US5A 3UN6A 3FASA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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