1HSLA

Refined 1.89 angstroms structure of the histidine-binding protein complexed with histidine and its relationship with many other active transport(slash)chemosensory receptors
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
238
structure length
238
Chain Sequence
AIPQKIRIGTDPTYAPFESKNAQGELVGFDIDLAKELCKRINTQCTFVENPLDALIPSLKAKKIDAIMSSLSITEKRQQEIAFTDKLYAADSRLVVAKNSDIQPTVASLKGKRVGVLQGTTQETFGNEHWAPKGIEIVSYQGQDNIYSDLTAGRIDAAFQDEVAASEGFLKQPVGKDYKFGGPAVKDEKLFGVGTGMGLRKEDNELREALNKAFAEMRADGTYEKLAKKYFDFDVYGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords HISTIDINE-BINDING PROTEIN
publication title Refined 1.89-A structure of the histidine-binding protein complexed with histidine and its relationship with many other active transport/chemosensory proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Binding protein
total genus 68
structure length 238
sequence length 238
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-01-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hslA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hslA02
3TEPA 3JV9A 1MM7A 2HXWA 4G2ZA 4ZEKA 3T22A 4OQOA 4RYAA 1LFHA 3K6VA 1ZLQA 4NF6B 3UK4A 1MH3A 1DTGA 1B4ZA 4Q8RA 2PBWA 5H8HB 4KCCA 3PGFA 4GD5A 3H6UA 3MBPA 1ELJA 4H0WA 3FV1A 4OESA 1AIVA 2F6PA 5H8SA 2ABHA 4WEPA 5A5XA 3H4ZA 4N07A 2F6GA 4GL8A 3CG3A 4QFNA 3A09A 2XX8A 1JEVA 1Z7ME 4H5FA 3LSWA 2XXHA 4ESWA 4RXLA 1R6ZA 1MH4A 3SEUA 3H7MA 4QFPA 1QVSA 2R71A 1MQDA 4NF4A 4NTLA 3FUZA 3IJXB 4ZE8A 4O3BA 2DVCA 1M5CA 4YB5A 3LC8A 3RPWA 4U4XA 1GV8A 4C0RA 3DLNA 4JSDA 5AA4A 2XD2A 3ECRA 4ELPA 1Y1ZA 1XC1A 4YKPA 3K00A 4DDDA 2E0SA 1GR2A 2A5TA 3PMWA 1KWHA 4R9FA 1BTJA 2B3FA 2QMXA 4OFJA 4UA8A 1N7WA 5IAIA 2Y7IA 4RJZA 3VLUA 4I8CA 3N26A 4NF8B 3SKPA 1UIVA 4QSDA 1SBPA 3ONMA 3VLWA 3I5OA 1WDNA 3FXRA 1UIUA 4KYDA 4F2OA 1B58A 5A5XB 2BJJX 3GZGA 1LSTA 1JVXA 3G3HA 3G3GA 4DCXA 1NKXA 3CG1A 5CMKA 2Q8JA 3HHGA 1WODA 1B3HA 4AB5A 4QRZA 3MUQA 4XKNA 5FTIA 4PFUA 3BFTA 3I6VA 3N5LA 4WXJA 3KN7A 4G68A 4IGTA 2I4CA 1USYE 4F1UA 3T66A 4YU0A 4DLDA 5TPAA 3G3FA 4KR5A 1USYH 1JW1A 2VOZA 3M3LA 3B7DA 3EN3A 3RY3A 4POWA 3K6XA 3FJ7A 2ZYOA 3DP6A 3MP1A 4OFOA 1TXFA 4GF8A 1PB7A 4EXLA 4YMAA 2XX7A 3OEMA 4K3FA 5AA4B 5HPQA 2B65A 3QAXA 2H98A 5ITOA 3VXCA 5K2YA 3QK6A 4BDQA 4NWDA 3LR1A 3MP6A 4QHQA 2A5TB 3FVGA 1XVYA 4DZ1A 2R6GE 2Q9TA 4LQ5A 2DWAA 3N94A 3VXBA 3Q27A 1FTJA 3TQLA 3JYRA 4N6PA 2X7QA 1QKAA 5JEIA 1MQGA 3MQ9A 4OEUA 1FQDA 1VFEA 5FHOA 2UYFA 3VVEA 3MVZA 3KOSA 2XX9A 1TT1A 4NMYA 3VFJA 4R73A 1MXXA 4EQBA 2HZKA 1LAFE 2HAUA 2Y84A 4FATA 5DVFA 3RTWB 4NF5B 3SESA 1LLSA 3KSJA 4LUBA 2AL5A 1NH7A 1FQEA 4G68B 3OO8A 4ECFA 4Q30B 2DVZA 3LSXA 2CZLA 4GQOA 5TPAB 5BUUA 3RTFB 4LZ7A 2XXRA 1HSLA 3FVNA 1MXVA 2V3QA 2F7AA 1II5A 2DP8A 3MVXA 3O29A 2VP1A 4LATA 1B46A 2OWTA 2FNCA 4ONYA 2ZYMA 3MJNA 1AOVA 1MXYA 3S9LC 4JXIA 1R9LA 1MY2A 4PETA 2Z8DA 2HQ0A 3H6WA 1LFIA 1DSNA 1ATGA 2DWJA 3G7WA 4I1DA 1URSA 4XKQA 4IB2A 1N04A 2XXXA 3W15C 4ESXA 4RY1A 1D9YA 2DOJA 1FW0A 4IO6A 3OOAA 1LB8A 2REGA 4Z0IA 1BLFA 1Y4CA 2PMSA 3PUXE 2H5YA 3G3JA 1TWYA 3VLVA 3O6HA 1SW1A 2OBGA 2OLBA 2LAOA 4E0XA 2I3VA 3B6TA 4BDOA 1LBCA 3U8QA 1YCJA 1H76A 3C4MA 3UA8A 4TLMB 3TQWA 2V25A 3IL1B 4LONB 2DQVA 4X1DA 2ONKE 3HV1A 2QS1A 5LOMA 4EXKA 2WKYA 4DE8A 4R72A 1I6AA 3G3IA 4R75A 4H67A 5CI5A 4Q0CA 4OERA 4IO3A 3PPNA 1I6BA 3VVDA 1EZOA 4HS7A 3BBRA 1D3KA 1IXGA 1ZIUA 3AXFA 3OD7A 1SYHA 4LP2B 4G8MA 1URDA 1LBBA 3IORA 3O66A 1SQYA 3R7XA 1B40A 1B0LA 5JTYA 1PDAA 5DVJA 4LA9A 1O63A 3IB1A 1OVBA 2O84X 1MXUA 2DWIA 1PBQA 3PPRA 4YAHX 1J1NA 1M5FA 2Z23A 1DMBA 2W7YA 2PT1A 1LCTA 3V8XB 2QMWA 2PYYA 3QYTA 1SI1A 2H4IA 3KJ7A 3RT8A 2UVJA 5CRYA 4GWOA 3DP8A 5TP9B 2DXRA 5H8QB 3O97A 5I2NA 3QUFA 1H3DA 4KPTA 1EZ9A 3R26A 4L17A 2IA4A 1Y3QA 3ILUB 1QULA 4KCDA 2NWJA 1S50A 4HTGA 3VV5A 1B9JA 1TFAA 4BDMA 4YKKA 5H8FB 2F78A 2V3TA 2XXQA 3TELA 2ONRA 1H45A 2ZNTA 3C32A 2YJPA 1EZPA 2Y7KA 3FASA 2VD3A 1I6QA 3T9UA 3E13X 1FTLA 4U1OA 3QXMA 3O28A 5KDTA 1IITA 1FCKA 4JWYA 4OMBA 4OFLA 2I58A 3C36A 3CFXA 3MVYA 3EHUA 5JTYB 1ANFA 2OWSA 3T9XB 3IOWA 4F3PA 2YLNA 1LAXA 4EQ7A 3FV2A 3U94A 3OEKA 1AH5A 3KEIA 3H03A 3HHFA 4ZZAA 5I56A 1GVCA 2AYSA 3W9WA 2QSXA 1MPBA 1NNPA 4FECA 3FXUA 4ZEFA 1QJMA 1BIYA 4ZEDA 2DXYA 2Q88A 3RGYA 1B3EA 3K01A 1YPNA 3H3GA 3WAEA 5I2NB 3IX1A 3KOTA 1MY3A 2REJA 4OWDA 3UGWA 1EU8A 1NH8A 4HCWA 3RT6B 3HN0A 5L8DA 2AIXA 5DVIA 3U1OA 2HFBA 4DXBA 4IO5A 1NNTA 1Y4TA 4NE4A 2RC8A 5EHMA 5CM6A 3MVWA 2RC9A 4U22A 3USDA 1T0KA 1FQFA 1JW4A 1LFGA 3IB0A 5KDTB 4YZZA 2DWHA 1A54A 2NVUB 3HPIA 1IEJA 2XXVA 3FZVA 4M1VA 2VD2A 3K0VA 4BDLA 3C35A 1N84A 1QUIA 2AL4A 4KYEA 3THIA 4PFWA 1MY0A 4RK2A 2F7BA 4C1UA 4GOTA 1ZJLA 2QL3A 2P2AA 3Q26A 3SEXA 2V84A 1IXHA 2QRYA 5HBCA 4H5GA 4U21A 2GFEA 1AMFA 2Q89A 1IQ7A 5I56B 4EQ9A 3MW0A 3LSFB 4LVQA 3TCFA 5CBSA 3T9VA 3U92A 3OXNA 1MPDA 2XXIA 3VE1B 2ZNSA 3GXAA 2Z8FA 3OSRA 2ONSA 4NF4B 3TZAA 4G77A 3H6VA 3IB2A 5DEXA 5ICQA 4ZE9A 1MXZA 4G8HA 1F9BA 1LCFA 3PUWE 4OENA 2PX1A 1ZBMA 2RKMA 4OYVA 1N3XA 1XHYA 3ODBA 1LB9A 2DE3A 4FEBA 3F11A 4KHZE 4ND9A 4FE8A 3N6UA 4FEDA 5CMMA 2XD3A 2Z22A 3LBSA 2I0CA 3ZS6A 3V89B 4LZ5A 5CMBA 4H1XA 3SEVA 4MLQA 4GL0A 3A3UA 2NUVA 2O1MA 1ZKBA 3Q28A 4GXSB 2CMOA 4JSOA 1B4HA 4GLIA 4EUOA 3PUYE 2UXAA 4AB6A 1I69A 3UORA 2O51A 1IUDA 4H8IA 5KZTA 1MY4A 1OVTA 1UTBA 3FVKA 3MP8A 4IY6A 1YTVA 4P0GA 4UACA 1TFDA 5L9MA 1S7YA 4EF1A 1BP5A 1B05A 3PUZE 1P1QA 1P1UA 3KSXA 1MDP1 2E1SA 2HEUA 1VSOA 3K4UA 5EYFA 3MZ1A 4F22A 4C1TA 1Y20A 1B2HA 2XHDA 2F7CA 1VR5A 4JDFA 2D21A 2FA7A 5DEXB 3TCHA 3ILTB 1MDQA 4RNSA 2RCAA 2V93A 1D9VA 1POY1 3L6HA 2X26A 5ITPA 3RUMA 2GHBA 1OQHA 1XVXA 4HCYA 1JNFA 3K6WA 5FHNA 3TCGA 2FYIA 4PQJA 4F18A 3RQTA 3EPEA 4RPOA 2OJTA 4G4PA 1QUJA 4JB7A 1QW0A 3MPKA 1B5HA 4OEVA 5DT6A 5CMCA 3CSBA 3FVOA 4MF3A 4G68C 2UYEA 2I48A 3QUJA 5ISUA 4NWCA 1MY1A 1VE4A 4QSCA 4Z7EA 5I57A 1B3LA 1PB8A 3HSTA 1JETA 3EQ1A 3FD3A 3L6GA 4IO2A 3H06B 4R6KA 4PE5B 1SYIA 1OMPA 2XXUA 4MBPA 2DYXA 4IO7A 2QJEA 3D4CA 5AA2D 3UP9A 2H9BA 2O1LA 1UTBB 4FIMA 4DIGA 1B3GA 2F8DA 3C34A 4TLLB 3OO7A 3SERA 2I6EA 4ELOA 3GBBA 1HSJA 4O3AA 1NL5A 1JVYA 4X48A 5IKBA 3V5AA 3TDJA 2Y7WA 3CI8A 4ZEBA 5L9SA 1L5TA 2IEEA 4U1ZA 2D5WA 3B6QA 4N13A 4F39A 1B1HA 3IAZA 1PBPA 1OLCA 4YB7A 4F2QA 1JW5A 4ELRA 3JZJA 2X7PA 4U4SA 2B3BA 3M3KA 2ANJA 3E3KA 1MPCA 4XKRA 3PPOA 5H8HA 5I2KA 2UVGA 2ZXTA 3MZ9A 1RYXA 1M5DA 1A40A 2P0SA 3OO6A 3E9XA 1UTHA 1O64A 1MRPA 2F36A 1B3FA 2DE4A 1Q1KA 2RF1A 2OCUA 1A8FA 4QFOA 1MM6A 4TOZA 1B52A 3UIFA 4RA1A 4R74A 3C33A 5ELVA 2O7UA 4XTCQ 4JWXA 3D4GA 3TMGA 3FJGA 2KLFA 2Y7PA 3T96B 1MG1A 5AA1A 1N7XA 3SEYA 1SW4A 1FTOA 3E4RA 4F3SA 1FTKA 2HCAA 3KFMA 2O7IA 4THIA 2ZNUA 1P1OA 3PPQA 3T9HB 4ISUA 2DSFA 3TAJA 2M8CA 5FTHA 1D4NA 1OQGA 1IIWA 2V3UA 1BKAA 1OLAA 5M2VA 1P1NA 4MH5A 1Y1MA 1QUKA 1MQIA 3RNNA 2GHAA 1NMUA 4XXUA 3KZGA 1IXCA 4X9TA 3K1PA 3DM0A 5I2KB 1PC3A 4KFQA 1PEBA 4NF8A 3CFZA 2RC7A 1DPPA 3V83A 3IO4A 3OSQA 3G3KA 5DTBA 1UTHB 3N6TA 1B5IA 2NXOA 4WKMA 1S9TA 3KGCA 3FIRA 1B7UA 4GXAA 3OMBA 4U23A 4H6DA 4YMBA 4ZS9A 4IGRA 3EHTA 4JBZA 4X1BA 2ALUA 4FAJA 3O6GA 1FQAA 1M5BA 3O2AA 1LGBC 2HZLA 2OK2A 3C31A 1IZ1A 4PP0A 1B0HA 3M8UA 2PT2A 3B6WA 4PFTA 3S9EA 1SDXA 3PU5A 2HAVA 5HM4B 2QPQA 5TU0A 2P1SA 4R2BA 5H8NA 4BLAA 1RKMA 3S4UA 3IK6B 4KQPA 4MLVA 1Q35A 1JEUA 3TTKA 4OVJA 3SEWA 4ZDMA 4JWOA 2Q2CA 3CIJA 3K2DA 3TPAA 2F5XA 4KI0E 4IO4A 4ZECA 1MQJA 3IOVA 3PMXA 1LAGE 2H25A 3IOTA 3KN8A 4YKJA 4H8JA 2H99A 2QS4A 4OXVA 5I59A 5I58A 1US5A 3TUSA 3EHSA 3PD9A 3MAMA 3KN3A 2NOOA 3KJTA 3TTNA 3VDFA 2O6AA 3SETA 3GLBA 1HSEA 3DELB 3FATA 3H6TA 1RYOA 2D3IA 4DXUA 4PFYA 3PV0E 2XXPA 1MS7A 3WAFA 1P99A 3KBRA 3FXQA 4NF5A 3QSLA 1B7ZA 1B32A 4HW8A 1YAEA 4IY5A 1SW5A 5AA2A 4XIGQ 5AA3A 4QF9A 2F35A 5EHSA 3HCQA 3A3CA 3MC2A 5H8NB 2XXTA 1ZU0A 5I84A 2O68A 4WEDA 1OIBA 2VGQA 2GH9A 1SD3A 1B6HA 3LUYA 2ZMBA 4YKIA 3MWBA 1UQWA 1XS5A 1A55A 4POXA 2GRVA 2THIA 4FJPA 1DPEA 1O7TA 3CR9A 1FTMA 1WVJA 3UN6A 3P7IA 3FGSA 4QFKA 2UVIA 3K02A 1MQHA 2I0BA 5I59B 2ZYNA 5I58B 1N76A 2G29A 1B1XA 3ZSFA 1NNFA 2VHAA 1CB6A 2I3WA 3S9MC 3IJOB 4OETA 3CFLA 4OZ9A 2YPNA 3MPLA 3TTRA 4F31B 5AE4A 1CE2A 3Q29A 2R9JA 1GGGA 1Y9UA 5DYHA 4E0WA 3SDFA 2UVHA 4EF2A 4H65A 2F97A 1Y3NA 2RINA 2QS2A 3IR1A 4GFRA 3DP4A 5F7VA 4DXCA 1VFDA 3K1MA 1QKBA 4F3GA 3U72A 3ZKKA 2I49A 4R9GA 4XKPA 1ZTYA 1NNKA 4NEDA 5AA2B 3RLFE 3S2VA 1B7HA 3TTMA 1B5JA 1NFTA 4YB6A 5ICTA 4P0IA 3HO7A 1DOTA 2QS3A 1PB9A 1M5EA 3W9VA 3TODA 3IOUA 2F34A 4ZZEA 5F1QA 4LQ2A 4KYSA 1P1WA 3PD8A 3FJMA 4GVOA 4Q5TA 1Z7NE 2Q2AA 5FHMA 4F1VA 2I4BA 1URGA 3S9NC 5K2XA 3TKDA 4M4GA 1A99A 4RPNA 3C9HA 3TYHA 3CVGA 3LSLA 2G93A 5TP9A 5H8QA 1N3WA 2DE2A 5L9OA 4MFIA 4O3CA 3K6UA 3BFUA 1FQBA 4BDNA 3PMVA 1A7LA 4R6YA 1IXIA 4G8NA 4F3BA 4P11A 3BKIB 5KCJA 3VVFA 1R1NA 4BDRA 1B51A 5H8FA 2A5SA 5B70A 4QFLA 4ELQA 3T93B 1GTKA 3Q25A 2RCBA 3EF7A 3ZKLA 4DCYA 5CC2A 4OTEA 1MXWA 1XT8A 4NF6A 3GBAA 4R6HA 4GIZA 3O9PA 3I3VA 5BWJA 4FORA 1LAHE 4F1YA 4F29A 4ZEIA 3IO6A 5JK4A 2PVUA 1H43A 4QSEA 4GRKA 3MZBA 4OHNA 3M3FA 3RN8A 3PUVE 3K1NA 3QIMA 4TQUQ 2O69A 4YICA 1N0TA 1SW2A 1AL3A 2Z8EA 5I57B 4AQ4A 2XXYA 5J1DA 3PPPA 1SVXB 3CRBA 4R2FA 3TFLA 3U93A 3O6IA 1JQFA 4KD5A 2XXWA 1DTZA 3R6UA 3OENA 5B7DA 4RK9A 4F19A 3TTLA 5CBRA 4EDPA 3CSGA 2ZYKA 3KG2A 1Y3PA 2DS9A 1A8EA 1SI0A 1H44A 1ZMGA 1FQCA 1XOCA 3OELA 4LZ8A 3OO9A 5KCJB 2ESNA 4U2RA 4I9DA 1US4A 1R9QA 2OZZA 4I62A 1POTA 1EH3A 2Y7RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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