1NNFA

Crystal structure analysis of haemophlius influenzae ferric-ion binding protein h9q mutant form
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DITVYNGQQKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title High Resolution Structure of an Alternate Form of the Ferric ion Binding Protein from Haemophilus influenzae
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
molecule tags Metal binding protein
source organism Haemophilus influenzae
total genus 114
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nnfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nnfA01
4QSCA 4DE8A 3TZAA 1Y3PA 1IXIA 1O63A 2DWHA 2I0CA 3B6WA 5JTYB 4G77A 5L9MA 3K00A 3MVWA 5AA3A 1ZKBA 1T0KA 1DTZA 2P1SA 3T9VA 5I57A 4G2ZA 3T66A 5DVFA 4IO5A 5CMBA 1B5JA 1XT8A 1SQYA 3RLFE 1AOVA 3KN8A 3PV0E 1B7ZA 1Q35A 3RTWB 4DZ1A 2YJPA 4EDPA 2Z8FA 1OVBA 2YLNA 5I84A 1GV8A 5I56B 4XIGQ 1ZMGA 4H8JA 5KZTA 2Y7IA 4X1DA 4QFLA 4XKQA 1B7HA 1TFAA 4ECFA 3OMBA 3KFMA 4MBPA 4EXKA 3PMXA 4F22A 4IO4A 1MQIA 4ELPA 4U23A 1CE2A 2DWIA 1A55A 3FD3A 4NF5A 2IEEA 4NTLA 2F7CA 1ELJA 2QJEA 4BDRA 3TODA 1H43A 4PFWA 3DLNA 2PX1A 4NWCA 1UTBB 4OEUA 4C0RA 4R9GA 1OMPA 1MXYA 4LONB 3EQ1A 3OEMA 4H5GA 1N7XA 3OEKA 4JBZA 4QFOA 2H99A 4DXBA 1P1UA 2UVIA 1US4A 4G8NA 3MPLA 3RN8A 3ECRA 4GD5A 3EHSA 1AH5A 1XVYA 3TCFA 1A40A 3LSFB 1I6AA 4EF1A 4E0XA 2DYXA 1M5EA 3RY3A 4QHQA 1MM7A 4R72A 3OOAA 4IO3A 5TPAB 1M5CA 3IB0A 1FQAA 3FASA 1P1WA 1WDNA 3VE1B 3SERA 3B7DA 3EPEA 2H5YA 3I3VA 1R6ZA 3C31A 3Q29A 4OVJA 2V93A 1IIWA 4M4GA 1NMUA 2ZMBA 4IY6A 3MP8A 4TLMB 4ESXA 1GTKA 3Q28A 4ZZAA 3CFXA 1AMFA 2UVHA 1B05A 4KCDA 4FATA 3IORA 5TP9A 4MLVA 3IX1A 5I2KA 2Y84A 3KZGA 3KSJA 3O6GA 2NUVA 4NF5B 3TTLA 4LA9A 1YTVA 4X48A 4XKRA 3R6UA 1POY1 4NEDA 5F7VA 5H8HA 2F35A 2VGQA 3TELA 1SD3A 1HSLA 3VXCA 3CFLA 4U22A 4RY1A 2R71A 2DQVA 1B40A 1MPCA 1QKBA 3HN0A 3FVGA 1XVXA 4F39A 2UVJA 3TMGA 5K2YA 3KGCA 3O2AA 5ICTA 1B9JA 1EH3A 3V5AA 1FTOA 2X26A 2Y7KA 4R74A 3FJGA 1TFDA 4ZS9A 1HSEA 3BKIB 3BBRA 3FVKA 4R9FA 3CSBA 2ZNTA 1L5TA 2PVUA 4EQ9A 3S9MC 2CZLA 4JWXA 1B46A 3QUFA 4THIA 4BDOA 3TAJA 1URDA 2H25A 3ONMA 2V25A 3H4ZA 4KYEA 1ZLQA 4OQOA 5DEXB 5LOMA 4U2RA 4RA1A 4N07A 4HS7A 3CG1A 1BLFA 2Q2CA 1JNFA 1MQHA 3OO6A 1LBBA 2HFBA 3G3FA 1N04A 2PT2A 1EZ9A 4IO7A 2O7UA 4FEDA 3MJNA 1B3FA 1ATGA 1IXCA 1TXFA 5JEIA 4L17A 4DLDA 3K01A 2E1SA 5H8HB 5EHSA 4JXIA 2VP1A 1Q1KA 4FE8A 2THIA 4KYSA 1FTKA 3M3LA 1B3LA 4G68C 3EHTA 5FTIA 3IR1A 5EYFA 2DE4A 3C35A 2H4IA 3I6VA 3V83A 4BLAA 3O28A 2DE2A 1JVXA 1EZOA 3SEVA 5I58A 5AA2B 1TWYA 4GL0A 5ISUA 2GRVA 3E3KA 3O6HA 3DP8A 3MVYA 1A54A 5M2VA 1S7YA 2GFEA 1B5IA 2VHAA 1MQJA 3LBSA 1MS7A 4AQ4A 2G29A 1PBQA 1B4HA 1B6HA 4N6PA 5BWJA 2ABHA 4U1OA 3VLWA 4HTGA 1Z7NE 2V84A 3T96B 4I9DA 3L6GA 4YB6A 4NF6A 1SW2A 1JW5A 4MFIA 1NL5A 4OYVA 2ZXTA 2I3VA 3GBBA 1FTLA 4P11A 3CR9A 2KLFA 4GQOA 1JVYA 4ZEFA 3V8XB 3OSQA 1Y3QA 1LAFE 1Y3NA 2DVZA 3PD8A 2W7YA 4K3FA 3HO7A 1NNKA 2E0SA 1FTMA 2QS1A 3VV5A 3EN3A 1J1NA 1DMBA 1MDP1 4POXA 2I48A 2NOOA 3FGSA 3SETA 3T9HB 1I69A 1UTHA 4G8MA 3KJTA 2M8CA 2DE3A 3QIMA 3T22A 3W9VA 5I58B 2OWSA 4AB6A 2XXXA 3MAMA 3D4CA 4O3BA 3TTNA 3N26A 4YZZA 3H6WA 4LZ7A 4GWOA 1NKXA 3W15C 3LSLA 4ELRA 3TFLA 3T9XB 3C36A 5ITPA 2ONKE 5HPQA 1FCKA 2X7QA 3G3JA 3DP6A 4GXAA 3MVZA 4ZE8A 3DELB 1R9LA 4Z0IA 4JWYA 1MXUA 4M1VA 4GRKA 1YAEA 4NF6B 2QS4A 3G3IA 4LUBA 3SEUA 4IY5A 4KD5A 1US5A 3T9UA 2OLBA 4I1DA 1NNFA 1LFIA 4NF4A 2HEUA 1P1OA 3PPRA 3EF7A 2DXYA 3FZVA 4LZ5A 1URGA 3CI8A 4EQBA 5F1QA 3PUYE 4PQJA 1XOCA 2NWJA 4GIZA 3WAEA 3U92A 3TQWA 3PUXE 1HSJA 3TTRA 2AL4A 4KHZE 4QSDA 4LP2B 3RPWA 3TEPA 2UXAA 5BUUA 4EXLA 4RK2A 4ZEIA 1KWHA 3C4MA 3LR1A 4YMBA 1UTHB 2UYFA 3Q27A 4H1XA 4Q30B 4QFNA 1QKAA 4U21A 3TCGA 3VLVA 3IAZA 4GL8A 4X1BA 2F36A 4NWDA 3K6VA 4KI0E 4PFYA 2I6EA 3GBAA 2QS2A 2DWJA 4IGRA 2FA7A 3A09A 4N13A 1R9QA 3S9LC 3KEIA 1ZIUA 3FXUA 1MRPA 4OFJA 2ALUA 4KCCA 4JSOA 1PDAA 1MH4A 4HW8A 2A5TA 4WEDA 4PP0A 4WEPA 4IO2A 3M8UA 4JWOA 1VSOA 5AE4A 2Z22A 4NF4B 1Y20A 1VFDA 3N6TA 2XXWA 5DTBA 1ANFA 5B7DA 3S9NC 1TT1A 1UIVA 4KFQA 3QXMA 3K0VA 5I57B 3IO4A 1OLAA 4YKJA 2I58A 1B3EA 3OXNA 4BDMA 4ELQA 1POTA 3LSXA 3PPPA 1GVCA 5FHNA 1JETA 3VDFA 3RT6B 1DSNA 3MP1A 4TOZA 3H3GA 4LVQA 4DCYA 2ZYOA 3THIA 1MXWA 3C32A 3HHGA 3MW0A 4C1TA 4I62A 3CG3A 1I6BA 1MPDA 2VOZA 4BDQA 4NE4A 5H8NA 5CM6A 4DXCA 3KOTA 3LSWA 2HAVA 2Z23A 2NXOA 3FUZA 2O84X 1PC3A 2XXHA 5HM4B 5AA2D 3PUWE 4ISUA 1B4ZA 5FHOA 3FV2A 2A5TB 4F31B 4XXUA 1A8FA 3RNNA 4DCXA 2F78A 4GOTA 1P1NA 4Z7EA 3OO9A 2GHBA 1IXGA 1N0TA 3H6TA 3MBPA 3IK6B 2O69A 2F7BA 1B2HA 3U8QA 3VXBA 4BDNA 2I49A 3BFTA 4R2FA 1AIVA 1FW0A 3HHFA 1N3XA 3GXAA 4YKPA 4RPOA 4UACA 5H8FA 3TYHA 1EU8A 3CIJA 1JQFA 1LAGE 2O51A 1I6QA 5L9OA 1LAHE 3K2DA 1CB6A 3IOTA 3ODBA 3OO8A 4OFOA 2XXRA 1B7UA 4PFUA 4H5FA 1SYIA 1SYHA 4DIGA 5KDTA 2BJJX 4EUOA 2HCAA 4GXSB 2UYEA 5L8DA 2RCBA 4F1YA 4PFTA 4ZEDA 4H8IA 3ILUB 1FQFA 2XHDA 5IAIA 1DOTA 5TP9B 5I2KB 4LATA 4YICA 3U94A 5H8NB 3PU5A 3FVNA 1QW0A 1WODA 3Q25A 2O7IA 2ZNUA 5I2NA 4WXJA 1IXHA 5ICQA 3IOWA 1R1NA 2H9BA 3O29A 1Z7ME 3C9HA 1AL3A 3BFUA 3SKPA 3UN6A 5TU0A 1QUKA 2ONSA 2QS3A 2F34A 1ZBMA 4MLQA 1PB8A 4ZEBA 3A3CA 1LLSA 1MM6A 1LFGA 3N94A 1B51A 2Q89A 3UIFA 2V3TA 4YB5A 3C34A 4R73A 3ZSFA 1RYOA 2GH9A 3SEWA 1MY3A 2RKMA 2ZYKA 2XXVA 5H8FB 2XXYA 1N84A 4XKNA 5FTHA 3E9XA 3TCHA 1LB8A 3IB1A 1MG1A 1UIUA 1SI0A 3V89B 4OENA 1D9VA 5KDTB 2ZYNA 2RC9A 1S9TA 1XS5A 3OELA 5FHMA 4MH5A 2Y7PA 1B0HA 4YB7A 2LAOA 2DP8A 3A3UA 5CMCA 3FXQA 2UVGA 3H6UA 3UP9A 1H76A 4YMAA 1M5BA 1B32A 1LB9A 3VVFA 1LAXA 3IOUA 4ELOA 2B3FA 5I2NB 1IUDA 2X7PA 1Y1MA 3W9WA 2PYYA 2V3QA 4ZECA 4I8CA 1OQGA 1EZPA 1B5HA 3WAFA 2Z8EA 3PD9A 3KJ7A 4TLLB 2PMSA 3RQTA 1IQ7A 2HQ0A 1Y9UA 2QRYA 3M3FA 2HXWA 3Q26A 1LGBC 3QAXA 4P0GA 2F97A 3CFZA 4P0IA 2VD2A 2Q88A 2NVUB 2R9JA 3O9PA 3ZKLA 4AB5A 1USYE 1IEJA 5KCJA 1M5DA 2CMOA 1PEBA 2B65A 1VR5A 2XD2A 3TQLA 3S2VA 4QSEA 2OJTA 1FQDA 2XXIA 2GHAA 4QFKA 5CI5A 4OXVA 1SBPA 4LZ8A 4JSDA 2I0BA 2OBGA 1O7TA 1SDXA 4LQ2A 1LSTA 1MPBA 1NNTA 3EHUA 4UA8A 4JB7A 4RK9A 1N3WA 4HCYA 3SESA 2DS9A 2HAUA 3N5LA 2HZKA 3PUVE 1NH7A 3TTKA 1B52A 4HCWA 4OZ9A 2IA4A 2O6AA 4GF8A 3FXRA 2DXRA 4GLIA 3T93B 4F29A 4U4SA 2ESNA 3PUZE 3VVDA 4H65A 1VFEA 1XC1A 1B1XA 3KG2A 4ZE9A 3UORA 1II5A 2Q2AA 3HPIA 2RC8A 2OCUA 2DOJA 3R7XA 3E4RA 1FTJA 3MZ9A 4ND9A 5TPAA 4R6HA 3FVOA 4TQUQ 5KCJB 1LBCA 3IB2A 1LCTA 5B70A 5A5XA 4NF8A 2F6PA 3FJ7A 5L9SA 2D3IA 4Q8RA 1MQGA 2QPQA 3MUQA 2DSFA 3UK4A 4ONYA 2ONRA 1FQCA 1P99A 1MY4A 2D21A 1USYH 1S50A 4ZZEA 3S4UA 1JW4A 3G3KA 4LQ5A 4RXLA 3G7WA 3PPOA 1A8EA 5CC2A 1JW1A 4KYDA 4PETA 3P7IA 1UQWA 1PBPA 3K6WA 4G4PA 4C1UA 4OMBA 4XTCQ 1B1HA 4YU0A 3H03A 1A99A 4FJPA 4YKIA 2V3UA 3TPAA 3LUYA 2OK2A 3M3KA 4GVOA 5I59A 2F8DA 4WKMA 2YPNA 1F9BA 3TKDA 3PMWA 3C33A 4RJZA 3FIRA 2VD3A 4DXUA 2ANJA 3MPKA 4O3AA 3K02A 1SW5A 3E13X 2I4BA 1D9YA 3U93A 4XKPA 2XXPA 5DYHA 1RYXA 1M5FA 1BTJA 5CBRA 3MP6A 3PPQA 1MY0A 5A5XB 4NF8B 2DVCA 4O3CA 1QUIA 1OLCA 4QF9A 4YAHX 1WVJA 3IJOB 4DDDA 3QSLA 2XD3A 1NH8A 3QUJA 5DEXA 1MXVA 2HZLA 1H44A 5EHMA 2G93A 5ITOA 3FJMA 3K1PA 1NNPA 1PB7A 3OD7A 2WKYA 1SW4A 3CSGA 1VE4A 1MH3A 3KOSA 4ESWA 2F7AA 3JYRA 2DWAA 1ZU0A 4F1UA 3B6TA 4RNSA 3MQ9A 5H8QA 1FQBA 5AA4A 1N7WA 5I59B 1QJMA 4U4XA 3ZKKA 1QVSA 2PT1A 2XX7A 2RC7A 3K1NA 2REGA 3ZS6A 3L6HA 4F3SA 4ZEKA 4OHNA 3K1MA 2D5WA 1DTGA 2Y7WA 5ELVA 1YPNA 4H67A 4JDFA 5CMMA 5AA2A 4FIMA 1B58A 1SW1A 5J1DA 3RGYA 4ZDMA 4FORA 5H8SA 3N6UA 3O66A 4OESA 2A5SA 5AA1A 4G68A 4KQPA 1ZTYA 3FATA 2P2AA 5JK4A 4KR5A 3PPNA 1MXXA 4G8HA 1OQHA 4NMYA 4MF3A 1H45A 2O1MA 3OO7A 2Q8JA 4F3GA 3K6XA 1Y4CA 3H06B 3D4GA 3K4UA 3UA8A 4F3PA 3K6UA 2RINA 4QRZA 4RPNA 2QMWA 1SI1A 5IKBA 2PBWA 5CMKA 5CBSA 2XXUA 3I5OA 1JEUA 4OWDA 3MVXA 3TDJA 4OERA 1OIBA 3GZGA 3CVGA 2Y7RA 4F1VA 3IOVA 3U1OA 4OTEA 1Y1ZA 1D4NA 3MZBA 4X9TA 1QULA 3IL1B 1IITA 3TUSA 5H8QB 4H0WA 4R6YA 1MY1A 1MDQA 5AA4B 2XXTA 3FV1A 4Q0CA 3JZJA 1B3HA 2XX8A 3R26A 4U1ZA 1URSA 2FYIA 5DVJA 2Z8DA 4FECA 1H3DA 1BIYA 1OVTA 3KBRA 2OWTA 2R6GE 2QL3A 4R2BA 2AYSA 3SEYA 1YCJA 4OFLA 2OZZA 4PE5B 3SEXA 4YKKA 2RF1A 3G3HA 1B3GA 4FEBA 4G68B 3ILTB 4E0WA 3KN7A 3HSTA 3USDA 3VLUA 1NFTA 3LC8A 2P0SA 1BKAA 2O1LA 4F18A 1QUJA 1MQDA 3MC2A 1BP5A 2H98A 4F2OA 4KPTA 3KSXA 4FAJA 2QMXA 3HCQA 2Q9TA 4OEVA 4R75A 4IGTA 3B6QA 3TTMA 4F19A 3AXFA 2XXQA 3G3GA 4RYAA 1LCFA 4POWA 5JTYA 2ZYMA 3U72A 1ZJLA 4Q5TA 4R6KA 3S9EA 2I4CA 1RKMA 1Y4TA 3PGFA 3RT8A 5DT6A 3PMVA 3H6VA 2O68A 3CRBA 3DM0A 4BDLA 1MY2A 2B3BA 2FNCA 1XHYA 1FQEA 3QK6A 5CRYA 3RTFB 3SDFA 2XX9A 4GFRA 3IO6A 1P1QA 5I56A 4IO6A 2F6GA 1GR2A 1PB9A 2RCAA 3OSRA 2F5XA 4EF2A 3HV1A 2REJA 1DPPA 3O6IA 1MXZA 5DVIA 2AL5A 3DP4A 4OETA 1D3KA 3UGWA 1N76A 3OENA 4F3BA 4F2QA 1O64A 4QFPA 3MZ1A 3VVEA 1B0LA 1A7LA 5HBCA 4H6DA 1JEVA 4IB2A 3F11A 3GLBA 2QSXA 3H7MA 3VFJA 3MWBA 1SVXB 3RUMA 3QYTA 3IJXB 3KN3A 1DPEA 5K2XA 1UTBA 3O97A 1GGGA 3JV9A 1IZ1A 4EQ7A 2AIXA 2ZNSA 2I3WA 1LFHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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