2THIA

Thiaminase i from bacillus thiaminolyticus
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
ITLKVAIYPYVPDPARFQAAVLDQWQRQEPGVKLEFTDWDSYSADPPDDLDVFVLDSIFLSHFVDAGYLLPFGSQDIDQAEDVLPFALQGAKRNGEVYGLPQILCTNLLFYRKGDLKIGQVDNIYELYKKIGTSHSEQIPPPQNKGLLINMAGGTTKASMYLEALIDVTGQYTEYDLLPPLDPLNDKVIRGLRLLINMAGEKPSQYVPEDGDAYVRASWFAQGSGRAFIGYSESMMRMGDYAEQVRFKPISSSAGQDIPLFYSDVVSVNSKTAHPELAKKLANVMASADTVEQALRPQADGQYPQYLLPARHQVYEALMQDYPIYSELAQIVNKPSNRVFRLGPEVRTWLKDAKQVLPEALG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords THIAMINASE I
publication title Crystal structure of thiaminase-I from Bacillus thiaminolyticus at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Paenibacillus thiaminolyticus
total genus 115
structure length 362
sequence length 362
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.2: Thiamine pyridinylase.
pdb deposition date 1998-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2thiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2thiA02
3KN7A 4KI0E 1QJMA 1MXZA 1L5TA 1USYE 2F5XA 2UVGA 4QFKA 2FNCA 3KBRA 4RXLA 4FIMA 4Q30B 5CMKA 1FQBA 3FJMA 1LAGE 2GFEA 3SETA 3VVEA 3KJTA 4E0XA 4RY1A 4G68A 2Y84A 5KDTA 2GHBA 4F31B 3CG1A 3ZKKA 3G3FA 3HHGA 4LP2B 4OXVA 3KGCA 4X1BA 3FXRA 4XXUA 2YLNA 2AL5A 2WKYA 2HAUA 2OJTA 3T9UA 5K2YA 1BTJA 2XXIA 1IXCA 2Z23A 3ILTB 2R71A 3N6UA 2ALUA 4GXAA 5F7VA 3G3JA 5CRYA 3MZ9A 4DXUA 4R2BA 1A8EA 3CFZA 4PFUA 3PPRA 1NL5A 3TAJA 4JWYA 3TKDA 4EDPA 3UGWA 4H5GA 5CMBA 2I49A 4AQ4A 4NMYA 1TWYA 4G8MA 3W15C 4LA9A 2ONSA 1B52A 1B7ZA 5I2KA 4QFNA 1JEVA 2H9BA 1R9LA 3RT6B 1XVXA 1SBPA 1P1UA 1URGA 3PGFA 3RPWA 5TPAA 1JVYA 4K3FA 2DWHA 3MVWA 4XKQA 3TCFA 2UVIA 4ELQA 1FQAA 1MG1A 1B7UA 3EN3A 2Q9TA 1P1NA 1J1NA 5K2XA 3QIMA 2P2AA 3R26A 2R9JA 4RNSA 1LSTA 2QS3A 2PVUA 1H43A 5IKBA 2Z22A 3N5LA 1ZMGA 4YKIA 1O64A 3PUWE 3FVOA 1SQYA 4OZ9A 4LONB 3PD8A 3S4UA 3PUYE 4F3SA 3UIFA 4F2OA 4EF1A 4FE8A 3M3KA 1RKMA 3GLBA 3TQWA 4G68C 3HCQA 3KJ7A 2W7YA 3BFUA 2B3BA 3O2AA 1XVYA 4WEDA 1Y3PA 3O28A 1I6QA 2V84A 2VGQA 3GXAA 3S9MC 1B51A 2Q8JA 4Z0IA 5IAIA 1QUJA 4IO7A 4H8IA 2RF1A 1PB7A 2OCUA 3U93A 3TTKA 3VFJA 4ELRA 1POY1 4F19A 2Q2CA 4OENA 1XS5A 3D4CA 3W9VA 3A3UA 3THIA 1ZIUA 3OD7A 3U92A 3CR9A 4H0WA 1BIYA 1NNKA 2VD3A 4R6YA 1A54A 3IO6A 3RTFB 3O66A 3PPQA 2Q2AA 1P1WA 1SW2A 1VFEA 1VE4A 1B58A 4AB6A 1B5IA 1MY3A 3DP4A 1AIVA 1UIUA 5JTYB 4U23A 2PT1A 5H8QA 4NF8B 1MH3A 4RPOA 5ITOA 3CRBA 5HBCA 4ELOA 5L9OA 4XKPA 2DE2A 4X9TA 1MDQA 2REGA 4KYEA 3C31A 3SEWA 2ZMBA 4MBPA 4THIA 3IOUA 3VXCA 4G4PA 4EQ9A 3G3GA 1B7HA 4IO2A 3LUYA 2KLFA 4QSDA 4F1VA 3Q29A 3D4GA 4GD5A 1H76A 1MQDA 1WVJA 1FTJA 1HSJA 4F1YA 3QUFA 3H6UA 4F3GA 1LLSA 4FJPA 4RK2A 1B46A 4EXKA 4F1UA 3BBRA 3GZGA 2Z8DA 1R9QA 1FTKA 4HTGA 3ECRA 2F8DA 2V3TA 4QSCA 1S9TA 2FA7A 3FXQA 2DYXA 3ZSFA 2NVUB 3PUVE 1NNFA 1D9VA 2UXAA 3JZJA 2O7UA 1VFDA 4OVJA 3MC2A 1ATGA 2HFBA 1FQCA 2PMSA 3E4RA 3RY3A 2HQ0A 2NOOA 3FVGA 4YB5A 2QS2A 2OZZA 5KZTA 3HHFA 2CMOA 1O7TA 2GRVA 4LVQA 1B3HA 3UA8A 2ESNA 5FHMA 3TQLA 3HSTA 4YMBA 4ZS9A 2ZNTA 1FCKA 1N7XA 2GH9A 3T66A 3TTLA 2I3VA 4MH5A 2O1MA 3MP1A 2XXPA 4JXIA 1MXUA 2RCAA 3H4ZA 1D9YA 1B1HA 4QFOA 3C9HA 1B3GA 2ZYKA 4I1DA 2Y7IA 3OO6A 3PUZE 1B5HA 2ANJA 5DTBA 4OFJA 4TLMB 1USYH 2THIA 4IY5A 5AA2A 1JW1A 4PP0A 4P0GA 3QK6A 1M5CA 3T22A 4F22A 2D21A 3K1PA 5AA4A 3SKPA 4YICA 4QHQA 3RUMA 4PFTA 4NF4B 2DSFA 4U21A 2QMWA 5I84A 3B6TA 3MVYA 1YAEA 1LCFA 1LFGA 3RQTA 3FD3A 1H3DA 2I0CA 2QL3A 3OELA 1RYXA 2ZNUA 1DOTA 3T93B 4LZ8A 3IORA 3A3CA 3C35A 5DEXA 1MH4A 4H6DA 4OFOA 2VOZA 3I6VA 5B7DA 1S7YA 3LC8A 3MUQA 4R75A 1P1OA 5H8FA 4FEDA 3CFXA 2I0BA 5L8DA 2H99A 1UQWA 3PU5A 1JETA 1N84A 4DE8A 3LR1A 1A7LA 2RINA 3FATA 3K02A 3IB1A 3EQ1A 1QUKA 5HPQA 4WXJA 4KR5A 1GGGA 1T0KA 1SVXB 3WAEA 4KYDA 1DPEA 1LFIA 3Q26A 2QMXA 1OVTA 1ZBMA 4GL8A 3GBAA 3LSWA 3MZ1A 4N07A 2XXWA 2XXUA 1A99A 1Y3NA 1N76A 1IQ7A 3A09A 1URSA 2REJA 4EQBA 1HSEA 2NUVA 3KFMA 1MS7A 2QSXA 4OEUA 4DCXA 2QS1A 3OSRA 2E1SA 3IJXB 3EPEA 4BDLA 2F36A 3B6WA 4F29A 3K2DA 4NF5B 3KOTA 1MXYA 3MP6A 5KCJB 5I2NB 1MQGA 1B3FA 2RC7A 3IX1A 1NFTA 5CMMA 4H1XA 3E13X 4MLQA 1AMFA 4LQ5A 4N13A 3L6HA 3IB2A 4QF9A 3IL1B 1SYIA 1DSNA 3U8QA 2HZLA 4TQUQ 4IO3A 2V3QA 3Q27A 1IZ1A 1F9BA 1ZU0A 2Z8FA 3M8UA 1NH8A 2DE4A 4M4GA 1IITA 4DDDA 4QSEA 5I58B 4ZEKA 2ABHA 3HPIA 1BKAA 2R6GE 4R2FA 1OIBA 4MFIA 5AA2D 4NWDA 5I59A 1DMBA 4U4SA 4IO4A 2H25A 4BDNA 3OO8A 4RYAA 4Q8RA 4GIZA 3SEXA 2DS9A 1VR5A 4G8HA 3SEVA 4JB7A 3VLWA 2XXHA 4OYVA 3H6WA 4LATA 3TEPA 4MLVA 1LGBC 3CSGA 1EH3A 2XX7A 5I57A 4EUOA 1B4ZA 4QFPA 3DELB 5FTIA 2D3IA 2G29A 3K00A 3EF7A 3ZKLA 1FQFA 5BWJA 2IEEA 5CI5A 4NF4A 3TTRA 2DXRA 2Q88A 3M3FA 4DLDA 1AH5A 1IXHA 1SW1A 3KN3A 1M5FA 2F97A 4DXBA 5L9MA 1IEJA 2YJPA 1ANFA 4NF6B 4P0IA 4YAHX 3R6UA 1VSOA 1MY2A 5LOMA 4KCCA 1H44A 4O3BA 1MPDA 2PT2A 1FTOA 2NWJA 4YMAA 2O51A 1QKBA 1B2HA 1AL3A 3FVNA 2X26A 3USDA 2DXYA 4ND9A 1Y4TA 4LUBA 4EQ7A 3T9XB 4R6HA 5AA3A 1UTBA 3KN8A 3SESA 2DQVA 1XHYA 5AE4A 1PB8A 3K1NA 3K6UA 3FIRA 2OWTA 3CFLA 1TXFA 4FATA 1MM6A 2HXWA 3MPLA 3LSFB 1I69A 3T9HB 3IK6B 4F3BA 3E9XA 3TDJA 2QJEA 3HV1A 5FHNA 2HEUA 3CI8A 3V89B 2CZLA 5TP9B 1O63A 3DP8A 3UK4A 1FQEA 4RA1A 3EHTA 4C1TA 3SDFA 3C36A 4DIGA 4JWXA 2NXOA 1P1QA 5HM4B 1OQGA 5BUUA 5H8NB 2UYEA 4NF5A 3IAZA 2DP8A 5TU0A 1MRPA 5I2NA 4X48A 5H8HB 4GLIA 4H5FA 3UP9A 3WAFA 4IGTA 3K6WA 2DVCA 2P0SA 4L17A 1NNPA 4JSDA 3OO7A 3V8XB 3QSLA 1ZTYA 4G68B 1QULA 4KFQA 4ZECA 1LAHE 2DVZA 4C0RA 5KDTB 4E0WA 4OQOA 4Q0CA 2Y7PA 1OVBA 4YB7A 5I58A 4N6PA 3KZGA 2V93A 1B3LA 2M8CA 3QAXA 4BDQA 3Q25A 2RKMA 4ONYA 2ZNSA 3C33A 3TTNA 4YB6A 2BJJX 2RC9A 1QUIA 3GBBA 2XHDA 4OTEA 3JYRA 1IIWA 3B6QA 4OWDA 1OQHA 3IR1A 4U4XA 3MWBA 3FASA 1QVSA 5FTHA 2Y7WA 4KCDA 1NH7A 2I6EA 1WODA 1ZJLA 3K01A 1P99A 3O97A 1GV8A 3PUXE 1GVCA 3V83A 4P11A 3TODA 3IJOB 1IXGA 3T96B 2ZYNA 4BDOA 5I2KB 4NE4A 4O3AA 4MF3A 4R72A 1LB9A 1SW4A 4IGRA 3U1OA 1Z7NE 4KD5A 4LZ7A 2E0SA 3DLNA 3KOSA 2I4BA 4ZEDA 4BDRA 4O3CA 4PETA 1Q35A 3PMVA 1PC3A 1UIVA 4POXA 3FV2A 4PQJA 4F3PA 2AL4A 3V5AA 3I3VA 3VXBA 3RN8A 1HSLA 4U22A 3HN0A 3G3IA 3M3LA 3PPOA 4ZDMA 3TUSA 3ONMA 3C4MA 1D4NA 2O7IA 4X1DA 3CVGA 1FTLA 4RPNA 3OSQA 3I5OA 1II5A 4EXLA 3UORA 4YKKA 4IY6A 1JW5A 4DZ1A 1B05A 4FORA 3TYHA 2VHAA 3EHSA 3FUZA 3L6GA 1I6AA 1LAFE 1BLFA 2X7PA 4KQPA 4RK9A 1MXVA 1BP5A 4H67A 1RYOA 4ELPA 3CG3A 5CC2A 3BKIB 1A8FA 4OETA 3PPNA 5B70A 2HCAA 5JTYA 5TP9A 4NF8A 4G8NA 1Y3QA 1PBQA 4OEVA 2XX9A 3RNNA 2D5WA 2Y7RA 1MQHA 3N26A 3MPKA 4FAJA 1PBPA 3H7MA 4JBZA 1LAXA 2GHAA 1POTA 3OENA 2ZXTA 1YCJA 3FJ7A 5DVFA 2XXTA 2XXVA 5H8HA 4OHNA 3S9LC 2H98A 1IXIA 4U2RA 2DWJA 2F34A 3IOVA 1FTMA 3LSXA 2QRYA 3K6XA 3OOAA 2G93A 4ESWA 4QRZA 1B1XA 4OERA 3PD9A 3TCGA 3H6VA 5L9SA 4OFLA 5H8QB 5ELVA 3BFTA 3MBPA 3OO9A 2PX1A 2OWSA 3RTWB 1JVXA 4FECA 5DYHA 1SW5A 1Y1MA 1N0TA 1MXWA 1H45A 4R9GA 3W9WA 5I56B 1LBCA 1SI0A 1YTVA 1A55A 4ISUA 3PV0E 4KHZE 1JW4A 1M5EA 1EZOA 4TLLB 2XD2A 1N04A 4PFWA 3K0VA 1M5DA 3OEMA 4HCYA 1URDA 3VDFA 4YKPA 4Z7EA 4JSOA 3PMWA 4ZEIA 2LAOA 2ZYOA 2OLBA 1NNTA 5A5XB 1B40A 4DCYA 4DXCA 1B32A 2I48A 2I4CA 3IB0A 3G7WA 1TFAA 1S50A 4HCWA 4R73A 4I62A 4GF8A 3OXNA 4XTCQ 4R9FA 4AB5A 1PB9A 2DOJA 5DVIA 3O6IA 3VVFA 2Y7KA 3VVDA 4R74A 5ISUA 3S2VA 4BDMA 3O6GA 4G2ZA 3F11A 1TFDA 4GQOA 1DPPA 1WDNA 4F2QA 2H5YA 4UACA 1SD3A 3OMBA 3RGYA 3MW0A 5J1DA 2F7BA 2HZKA 3KSXA 1QKAA 1OMPA 4XKNA 3OEKA 2XXRA 2O84X 3QUJA 1LB8A 4OESA 1D3KA 1ELJA 5DT6A 3TZAA 1B0HA 2XX8A 3ILUB 1Y9UA 1MQIA 3H3GA 1Y1ZA 4GVOA 1PDAA 4IB2A 4RJZA 4LQ2A 1MY4A 4HW8A 2AIXA 1DTZA 4GOTA 4PE5B 4U1ZA 1XT8A 3PMXA 2ONRA 1EZPA 5EHSA 3VLUA 1MPCA 3G3KA 4KPTA 1US4A 4R6KA 3TPAA 5H8SA 2V25A 3IO4A 2VP1A 4POWA 4ZEBA 5AA2B 3UN6A 3B7DA 2XD3A 4GRKA 3G3HA 1Q1KA 2O6AA 1UTHB 3PPPA 5AA4B 3AXFA 3CIJA 1B0LA 4YKJA 1B5JA 1ZKBA 3KG2A 4ZE8A 3ZS6A 3KSJA 1MY0A 4I9DA 2A5TB 2X7QA 2XXQA 3VLVA 1MM7A 4H8JA 3R7XA 1NMUA 5DEXB 2F35A 1R6ZA 2QS4A 3K6VA 3U72A 1US5A 1LCTA 4WKMA 3FZVA 2H4IA 1MDP1 3LBSA 5H8FB 2ONKE 2DE3A 1EZ9A 4JDFA 1QW0A 3Q28A 3RLFE 4Q5TA 2UVJA 4QFLA 1N3WA 3O29A 1OLAA 1SYHA 2OBGA 1ZLQA 3VE1B 3MZBA 5ITPA 4PFYA 4HS7A 3N94A 3RT8A 1Y20A 5DVJA 2DWAA 1N3XA 2O68A 4ZE9A 2IA4A 1XOCA 5KCJA 1JNFA 2B65A 3DP6A 3MP8A 3P7IA 3TELA 5I56A 4C1UA 2O69A 3FVKA 3SERA 1B9JA 5EYFA 4YZZA 2QPQA 1CB6A 3VV5A 1PEBA 2HAVA 3S9EA 1GTKA 4ZZEA 3TFLA 4EF2A 4NTLA 4LZ5A 4UA8A 1MY1A 1DTGA 1B6HA 4XKRA 2I58A 1JQFA 1LFHA 3MQ9A 2F6GA 4NEDA 3TTMA 2XXYA 4G77A 5A5XA 1M5BA 1Y4CA 3TCHA 2DWIA 3DM0A 3U94A 4IO5A 1JEUA 3H6TA 4F18A 2FYIA 2UYFA 3K1MA 3H06B 4U1OA 4ECFA 1MPBA 3TMGA 5JEIA 4YU0A 4ESXA 1A40A 1EU8A 1I6BA 4F39A 3K4UA 1NKXA 1MQJA 4FEBA 2OK2A 5CM6A 1GR2A 3JV9A 3C34A 2A5SA 3O9PA 5AA1A 5I59B 3H03A 2XXXA 2B3FA 1LBBA 5TPAB 4ZEFA 2RC8A 3SEUA 5FHOA 3FJGA 4KYSA 3KEIA 4GWOA 4NWCA 4XIGQ 4NF6A 5F1QA 2Q89A 4WEPA 2ZYMA 1XC1A 3SEYA 1B4HA 4ZZAA 1SI1A 3N6TA 2V3UA 3FXUA 4GFRA 2F78A 5M2VA 5CBSA 2Z8EA 5ICTA 5I57B 4GL0A 1CE2A 3FGSA 1AOVA 1UTHA 3CSBA 2O1LA 3MVZA 2PBWA 3HO7A 1YPNA 3LSLA 1Z7ME 4H65A 2AYSA 1FW0A 1SDXA 3MJNA 3QYTA 2YPNA 1KWHA 1B3EA 3EHUA 1OLCA 2P1SA 2A5TA 3T9VA 4TOZA 1FQDA 5EHMA 2VD2A 4OMBA 2PYYA 1N7WA 3E3KA 3S9NC 1TT1A 3FV1A 4IO6A 3QXMA 5JK4A 4M1VA 2F6PA 3C32A 2I3WA 2F7AA 3IOWA 3ODBA 3MAMA 4BLAA 4GXSB 3IOTA 5CBRA 1UTBB 4I8CA 5ICQA 5H8NA 2RCBA 1IUDA 2UVHA 3O6HA 2F7CA 3MVXA 1R1NA 5CMCA 1MXXA 4JWOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KN7A 4KI0E 1QJMA 1MXZA 1L5TA 1USYE 2F5XA 2UVGA 4QFKA 2FNCA 3KBRA 4RXLA 4FIMA 4Q30B 5CMKA 1FQBA 3FJMA 1LAGE 2GFEA 3SETA 3VVEA 3KJTA 4E0XA 4RY1A 4G68A 2Y84A 1NV0A 5KDTA 2GHBA 4DI3D 4F31B 3CG1A 3ZKKA 3G3FA 3HHGA 4LP2B 2MKZA 4PBHA 4OXVA 1FBPA 2HHMA 5IZ3B 3KGCA 4X1BA 3FXRA 4XXUA 2YLNA 5ET8A 2AL5A 2WKYA 4N17A 2HAUA 2OJTA 3T9UA 4GWZA 5K2YA 1BTJA 2XXIA 1IXCA 4HE0A 2P3NA 2Z23A 3ILTB 1NUYA 2R71A 3N6UA 2ALUA 4GXAA 5F7VA 3G3JA 5CRYA 3MZ9A 4N4UA 1YZ0A 4DXUA 4R2BA 1A8EA 3CFZA 4PFUA 3PPRA 1NL5A 3TAJA 4JWYA 3TKDA 4EDPA 3UGWA 1G0HA 4H5GA 5CMBA 2CZKA 2I49A 4AQ4A 4NMYA 1TWYA 4G8MA 3W15C 4LA9A 2ONSA 1B52A 1B7ZA 5I2KA 4QFNA 1JEVA 4GX3A 2H9BA 1R9LA 3RT6B 4JVCA 1DCUA 2WYPA 1XVXA 1SBPA 1P1UA 4PE3A 1URGA 3PGFA 3B50A 3RPWA 5TPAA 1JVYA 4K3FA 2DWHA 3MVWA 4XKQA 2JJKA 3TCFA 2UVIA 4ELQA 1FQAA 1MG1A 1B7UA 3EN3A 4N6KA 2Q9TA 1P1NA 1J1NA 5K2XA 2XWVA 4N91A 3QIMA 2P2AA 3R26A 1FPFA 2XXKA 5ET6A 2R9JA 4RNSA 1LSTA 2QS3A 2PVUA 1H43A 5IKBA 2Z22A 3T1BA 2ZZWA 4LN5A 3N5LA 1ZMGA 4YKIA 1O64A 3PUWE 2CEYA 2PCRA 3FVOA 3HFUA 1SQYA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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