5FHMA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with (s)-2-amino-3-(5-(2-(3-(aminomethyl)benzyl)-2h-tetrazol-5-yl)-3-hydroxyisoxazol-4-yl)propanoic acid at resolution 1.55 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
publication title Tweaking Subtype Selectivity and Agonist Efficacy at (S)-2-Amino-3-(3-hydroxy-5-methyl-isoxazol-4-yl)propionic acid (AMPA) Receptors in a Small Series of BnTetAMPA Analogues.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fhmA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fhmA02
1BTJA 1HSLA 3GZGA 2GFEA 2DXRA 4GFRA 2PYYA 2Z22A 4X1DA 2XX7A 3ONMA 5HPQA 2F78A 3OMBA 3Q29A 2UYEA 3N6UA 2V3UA 5H8QB 3RLFE 2IEEA 1NL5A 1T0KA 4YKIA 2HZLA 3LC8A 2G93A 3FD3A 3W9VA 1B6HA 2NWJA 1IIWA 4EDPA 1N7WA 4HCWA 3GBBA 3U8QA 5I56B 1XS5A 1ZJLA 3FVNA 2DWHA 2A5TB 4ZZEA 3R7XA 4RNSA 5TPAA 1A99A 4XKQA 4OEUA 4TQUQ 5H8SA 4YB6A 4U1ZA 1FTKA 3K1MA 5ITOA 3OSQA 1MY3A 3CVGA 4YKPA 3T9UA 5TU0A 2ZMBA 4GXSB 3FVGA 2QL3A 1SDXA 3PU5A 3N94A 4U4XA 4FE8A 3KSXA 5TPAB 1TWYA 3VFJA 4GD5A 3VVDA 4PFYA 1Y1MA 4JB7A 2V93A 3IB0A 1LFGA 4P11A 3HPIA 3K02A 1ZIUA 4F3BA 3FXQA 4RJZA 2OZZA 3S4UA 1JW1A 1LAFE 3BBRA 1JNFA 1M5FA 1FTJA 4XTCQ 1MPDA 2DXYA 3OO7A 4DXCA 2QMWA 2W7YA 3H6WA 4YU0A 3DP8A 1RYXA 4OESA 2H9BA 2XX8A 3K6UA 4QFLA 3TUSA 3SEYA 4QFPA 4P0IA 2RC8A 1FQDA 1YPNA 4PFTA 1A8EA 1CE2A 2ABHA 2Z8FA 1LB9A 3FJGA 3KN8A 5JTYB 4DXUA 3HV1A 2THIA 3FZVA 4GRKA 3MP1A 4OXVA 3TTNA 3PGFA 3K01A 1XVXA 3PPOA 1NFTA 2PBWA 5H8FB 4FECA 3EF7A 1QUJA 5FHNA 4GL0A 3K6XA 2HZKA 5AA2D 3O9PA 4NF6A 3G7WA 1SYHA 2ONSA 4KCDA 2F6PA 4UACA 3FV2A 3FIRA 4XXUA 4YMAA 4LQ5A 5EYFA 4NF5A 4PE5B 2DSFA 4TLMB 3H3GA 3SETA 5ITPA 3VVEA 3SDFA 2AL4A 3PD9A 5ELVA 5I2NB 2H25A 2D5WA 3TQLA 1D9YA 4ZEKA 3VXCA 1P1WA 1Y9UA 4NF6B 4MF3A 4JSDA 4C1UA 1LCTA 5DTBA 1QKAA 3JYRA 2KLFA 3ZKKA 2DQVA 4EF2A 2H99A 3VXBA 2V25A 3MUQA 4H65A 4NF5B 1HSEA 3TYHA 2IA4A 4R2BA 5ICTA 4M4GA 1XC1A 2ESNA 3MJNA 1Z7NE 2ZYOA 5CBRA 4TOZA 3T22A 4I1DA 1SVXB 3K0VA 1Q1KA 3PPPA 2XXRA 3FV1A 2ALUA 4R74A 2I48A 2QS3A 1B1HA 3SEWA 5BUUA 1UIUA 4RXLA 3QIMA 1MXUA 1FQCA 3OD7A 1UQWA 5CBSA 1XVYA 1LGBC 2VHAA 2Y7IA 3RT8A 4ONYA 4QRZA 3ZS6A 3LSLA 2QRYA 3U72A 1FQFA 1YAEA 2I58A 5EHSA 5CI5A 4HS7A 2Q89A 4TLLB 3TAJA 3KOTA 4H5FA 4C0RA 1AMFA 3A3UA 4KYDA 3MWBA 4GL8A 3KN7A 1URGA 4G77A 5KZTA 1ZU0A 1PBPA 3E4RA 1SW2A 4HW8A 1MXXA 2AL5A 5H8HB 3V5AA 1TFDA 2DP8A 3MQ9A 3HSTA 2HCAA 1O63A 2F36A 3BKIB 1VR5A 1D9VA 1POTA 1MM6A 3JV9A 4R2FA 3GXAA 2VGQA 4G4PA 3USDA 1MXZA 4EQ7A 5AA4A 2ONRA 4RYAA 1O64A 4Z7EA 3ODBA 1MH3A 1FQEA 2I0CA 3MVXA 3K1NA 1EZ9A 1FW0A 3SESA 4XKPA 2DWIA 4F19A 2I3WA 2XD3A 1A54A 2REJA 4N07A 2OBGA 2ZNSA 4IY5A 3CSBA 1MY1A 2QS4A 3BFUA 4WEPA 1GR2A 3C36A 1VE4A 5JK4A 5KDTA 2NVUB 4KI0E 3G3KA 3ZKLA 1B4HA 4ZEFA 5A5XB 4DLDA 3TDJA 4RK9A 2DYXA 2P1SA 2ZYNA 3THIA 4I8CA 4MBPA 4G68A 1PDAA 1FCKA 2I4CA 1IZ1A 5TP9B 4DIGA 1M5CA 2QJEA 4EXKA 3MVWA 4FAJA 4EXLA 3S9NC 2V3TA 1B46A 4R72A 5F7VA 2O7UA 5DVFA 3QUFA 3CR9A 1B3FA 1B5JA 5B70A 5KDTB 4POWA 4BDMA 1XT8A 4KHZE 2ZXTA 1UTBA 3MVYA 1P1QA 1AOVA 2OCUA 1S50A 2RC7A 3UA8A 3OO6A 1MRPA 2PT1A 3G3IA 1QUIA 1MQJA 2HQ0A 3UORA 2B3BA 3O6IA 4NF8A 3IJXB 5DVJA 2Q88A 4NE4A 3FVOA 1MDP1 3KFMA 2QPQA 2XX9A 3C31A 3VVFA 4MFIA 2YLNA 2XXXA 1B2HA 1A8FA 2Y84A 5CMMA 2F97A 2RINA 4O3AA 3MW0A 3U92A 3PUXE 4YZZA 1H3DA 2CMOA 2DVZA 3B7DA 1JW5A 4YKJA 3V83A 2DE2A 3EPEA 4R9GA 2DWJA 3E9XA 1N76A 3RTFB 1SW4A 3R26A 3TEPA 4KFQA 1B58A 1OIBA 4GWOA 4QF9A 4ZDMA 1MS7A 1US4A 3K6WA 1Y4TA 3A09A 3G3JA 3RNNA 1B4ZA 4F3GA 1B7UA 3FVKA 1POY1 3RTWB 4H8IA 4H67A 3RGYA 2E0SA 2DS9A 3D4CA 4OZ9A 4DZ1A 4WEDA 4IO2A 1O7TA 4OWDA 3MPLA 1ELJA 3K2DA 1UTHA 4R6KA 4QSCA 2QMXA 4LVQA 1FTLA 1LFIA 1R1NA 2F7BA 1B51A 1JEUA 4F2OA 4JBZA 1OQGA 1QVSA 3H6VA 4F39A 3KJ7A 2QS2A 1D4NA 2Y7WA 2NXOA 1VFEA 2AYSA 3N5LA 4Q5TA 2XXQA 3PV0E 2REGA 4I62A 3UP9A 2NUVA 3QYTA 1I6QA 4LZ5A 3IOUA 3K4UA 1DOTA 1Q35A 4BDOA 1MDQA 2I0BA 3H7MA 1BKAA 3K1PA 4YKKA 1WVJA 4HCYA 1DPPA 2HXWA 1JQFA 3R6UA 1Z7ME 3SEVA 1ZTYA 2D21A 1SW5A 3CRBA 1BLFA 1AL3A 1IITA 4R6HA 4NMYA 4AB5A 3KG2A 4XKRA 4LONB 3PMWA 3TTMA 3MZ1A 3MBPA 3OO8A 4F3PA 2XHDA 5DVIA 1N3XA 2NOOA 3WAFA 3FJ7A 3TQWA 1I6BA 2P0SA 4G8HA 5M2VA 1B3HA 4Q8RA 1USYE 5I58A 4YB7A 4KYSA 1JVXA 1URSA 2PT2A 3EHTA 1AH5A 4G68C 2DE3A 4OEVA 2OWSA 2XD2A 1R9QA 5K2XA 1MQIA 3SERA 4QHQA 4ESWA 1QKBA 2RCAA 3C4MA 4F1YA 2UXAA 4JXIA 1LAHE 3RUMA 2WKYA 2O1LA 4QFOA 3K6VA 1LSTA 4POXA 3PMVA 2O69A 1I69A 2UYFA 3DP6A 3PMXA 4H0WA 1LAGE 1SI0A 2I4BA 2Z8EA 4DE8A 2Z23A 3IOVA 1LBCA 1LB8A 3MP6A 1RKMA 3T93B 5H8NA 2XXPA 3T96B 3O97A 2F7AA 4ECFA 3EHUA 3B6WA 5CMBA 4WXJA 4BDQA 1J1NA 2V3QA 2UVIA 4ZEIA 3GBAA 3IB1A 4E0WA 3IAZA 2OJTA 3IB2A 3MZ9A 3MPKA 4JWOA 2AIXA 1R9LA 4KQPA 4KD5A 3O29A 4UA8A 3OSRA 3M3FA 3B6TA 2H98A 3EHSA 3UK4A 1JVYA 3TMGA 3K00A 1GVCA 4OETA 1SI1A 5J1DA 2DE4A 3UGWA 3JZJA 1ATGA 3H06B 4GXAA 4O3CA 1NNFA 5I57A 3HCQA 2PVUA 3I6VA 1DMBA 3H4ZA 5DT6A 2I3VA 2X7PA 1B1XA 3V89B 1B05A 4I9DA 1EZOA 4YICA 3KOSA 5L9SA 3PUWE 3CG1A 1B5HA 2Y7RA 3S9LC 3U94A 4YAHX 5JEIA 3TFLA 4EQBA 4IO4A 1VSOA 2B65A 4PFUA 1Y1ZA 4GOTA 1QUKA 1BP5A 2PX1A 2LAOA 2RKMA 3OEMA 1OLAA 1B7ZA 4GIZA 3IO6A 1B5IA 1B52A 4IO5A 4PQJA 4LZ7A 4BDLA 4DCXA 3KBRA 3M3KA 4X48A 1XHYA 3G3GA 4G8MA 4GLIA 2DWAA 4R73A 1P1OA 2E1SA 1SYIA 1NNKA 4ZE8A 1B0HA 3H6TA 4E0XA 3Q28A 1Y3PA 3SKPA 4FORA 1USYH 2ZNTA 1IXGA 1TT1A 3E13X 4M1VA 4RA1A 1DTZA 4ELPA 3IX1A 1ANFA 3ECRA 2D3IA 4EF1A 3RQTA 5AA4B 1MG1A 1NMUA 4OFOA 3TTLA 1JETA 1XOCA 1P99A 2OK2A 1NH7A 3LSXA 4KPTA 1S7YA 4YMBA 1B40A 1F9BA 4F2QA 1M5BA 2ZYKA 2O51A 1MH4A 2I6EA 4R75A 3C34A 3IR1A 1WDNA 5ICQA 2UVHA 3CSGA 4BDRA 2XXUA 3FUZA 5BWJA 4DCYA 1MY2A 4G68B 1OLCA 3SEUA 4GVOA 1QJMA 5I84A 5DEXA 4DXBA 4F22A 3T66A 4BLAA 2I49A 3IORA 2GRVA 5KCJA 4YB5A 5B7DA 1SQYA 2Y7KA 2XXHA 2Q9TA 2XXVA 5FTIA 3OENA 3F11A 3FJMA 4LP2B 1LLSA 5AA1A 1UTBB 4Z0IA 3U93A 4C1TA 1H45A 5HM4B 3HO7A 1WODA 4NF8B 3O66A 1B3LA 1TXFA 4ZEDA 1DSNA 1L5TA 1D3KA 3O2AA 4PFWA 1YCJA 4F31B 3RPWA 3MZBA 2QS1A 3PUVE 4FJPA 4QFKA 2CZLA 1OVBA 3UIFA 5AA3A 1A40A 1PC3A 1PEBA 4JSOA 3PPRA 4GF8A 5FHMA 4ELOA 1H44A 3KJTA 3V8XB 5I56A 1B3EA 1B0LA 3G3HA 2A5TA 1DPEA 1SD3A 4H5GA 4K3FA 3VDFA 3QXMA 3L6HA 1NNPA 1ZBMA 3CFZA 3QK6A 4F3SA 3B6QA 4OHNA 2RC9A 5L8DA 3C33A 5FTHA 3OO9A 4OTEA 5HBCA 3DLNA 3OEKA 4OVJA 5CRYA 4IO6A 4F1UA 2HAVA 2GHBA 4ELQA 3TKDA 2DVCA 1MY4A 3W9WA 4FEDA 2P2AA 3AXFA 2OLBA 4ZS9A 2H4IA 1N0TA 2Q8JA 4EUOA 3FATA 3DP4A 4OENA 3PD8A 3IOTA 1I6AA 1LCFA 1EH3A 3E3KA 4RY1A 1IQ7A 1NNTA 4MH5A 3O6HA 1UTHB 3HN0A 2R9JA 1Y3NA 3LBSA 1MXYA 1Y4CA 1PB9A 2R71A 4FEBA 3BFTA 2O84X 3M3LA 1MQDA 4QFNA 3GLBA 3VLWA 1B32A 4KCCA 1B7HA 3DELB 1A55A 1ZKBA 4RK2A 4DDDA 4IO7A 1TFAA 1FTMA 2X26A 4AB6A 2Q2CA 1SBPA 3D4GA 5JTYA 3FXUA 1II5A 4F1VA 3C35A 2H5YA 3Q25A 1IUDA 2HAUA 1PB7A 4LA9A 3Q26A 5H8FA 1S9TA 3IL1B 1N84A 1QW0A 4NWCA 2ZYMA 1EU8A 4IGRA 2G29A 3TPAA 2F35A 3T9VA 3IOWA 4IB2A 1HSJA 5I2KA 1JW4A 4U4SA 3O6GA 3CG3A 2UVJA 1M5DA 1ZMGA 4MLVA 1GV8A 2VD2A 4BDNA 4Q30B 1A7LA 1N7XA 2F7CA 4ESXA 5I58B 5I2NA 3RT6B 3QAXA 4THIA 2ZNUA 1MY0A 3CFXA 1UIVA 4HTGA 2VP1A 2QSXA 2VD3A 2RF1A 4WKMA 1IXIA 4X1BA 5I2KB 1MXWA 5FHOA 4GQOA 3ILTB 3CIJA 1M5EA 1MM7A 4IO3A 4NWDA 3PUZE 3VV5A 4OERA 2UVGA 3TZAA 3FGSA 3FASA 3TCFA 1OMPA 3S9MC 3IJOB 3H6UA 4ZECA 2F5XA 5AA2A 1OQHA 3KEIA 5DYHA 5EHMA 4AQ4A 5H8NB 2A5SA 3IO4A 3M8UA 4G2ZA 3CFLA 2Z8DA 2FNCA 4ISUA 4G8NA 4KR5A 1LBBA 3TELA 4OMBA 4X9TA 4F18A 1N04A 1H76A 3W15C 2ONKE 4IGTA 3RN8A 5AA2B 4H6DA 5LOMA 4QSDA 4ND9A 1MPBA 2BJJX 2XXIA 3LR1A 3MC2A 5L9OA 4OFLA 1NH8A 3N26A 2F34A 4MLQA 1B3GA 5H8HA 3TCHA 1MQHA 1PB8A 3L6GA 4QSEA 1AIVA 3MVZA 4OYVA 2VOZA 3LUYA 4JDFA 1FTOA 5I57B 4R9FA 3TTKA 1US5A 3DM0A 3S9EA 2RCBA 1ZLQA 3OOAA 5AE4A 3PPQA 4PP0A 5IKBA 4RPNA 1N3WA 3VLUA 2YJPA 4RPOA 1QULA 2Q2AA 3OXNA 3C32A 4EQ9A 3OELA 1LAXA 4NTLA 3C9HA 4IY6A 2XXWA 3G3FA 2HFBA 2B3FA 3KGCA 3LSFB 1FQBA 5A5XA 3T9HB 3PUYE 3I5OA 3N6TA 4P0GA 3QUJA 5CC2A 1FQAA 3T9XB 2F8DA 1MPCA 5L9MA 5CM6A 5TP9A 5IAIA 2XXTA 1H43A 1MQGA 2GHAA 2ANJA 1JEVA 4U22A 1URDA 2PMSA 3MP8A 4U23A 2O7IA 4N13A 4OQOA 2Y7PA 4NF4A 2YPNA 3P7IA 2XXYA 1CB6A 3HHFA 3KN3A 3UN6A 1KWHA 2O68A 3A3CA 1NKXA 4ELRA 4LATA 1VFDA 3O28A 1PBQA 4ZE9A 2O1MA 1YTVA 1MXVA 2OWTA 5I59A 3TCGA 3LSWA 1GGGA 4U1OA 1GTKA 1IXCA 4XKNA 2X7QA 3KSJA 3ILUB 1R6ZA 1IEJA 4NF4B 5CMKA 4FATA 2V84A 2GH9A 1P1UA 4KYEA 4OFJA 3Q27A 3MAMA 3ZSFA 5CMCA 4XIGQ 3HHGA 3EQ1A 4N6PA 1B9JA 5ISUA 5I59B 4JWYA 3I3VA 3KZGA 2HEUA 3EN3A 4O3BA 3FXRA 4LZ8A 3RY3A 1P1NA 4ZEBA 4F29A 2O6AA 1LFHA 2R6GE 1Y3QA 3SEXA 4H8JA 5DEXB 3TODA 4LQ2A 2FA7A 3CI8A 3QSLA 4R6YA 3PPNA 5KCJB 1DTGA 3IK6B 3VLVA 4ZZAA 4L17A 4NEDA 4PETA 2DOJA 4U21A 1SW1A 4JWXA 2FYIA 3WAEA 1Y20A 3H03A 3TTRA 4U2RA 3U1OA 3VE1B 1RYOA 2M8CA 5H8QA 4FIMA 1IXHA 4Q0CA 5F1QA 1EZPA 3S2VA 4H1XA 4LUBA 5K2YA 2F6GA 1OVTA 1BIYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BTJA 1HSLA 4HE2A 3GZGA 2GFEA 2DXRA 4GFRA 5IZ3A 2PYYA 2Z22A 4X1DA 2FHYA 2XX7A 3ONMA 5HPQA 2F78A 2WBBA 3OMBA 3Q29A 2UYEA 3N6UA 4NN3A 2V3UA 5H8QB 4FBPA 3RLFE 2IEEA 1NL5A 1T0KA 4YKIA 1RDXA 2HZLA 3LC8A 2G93A 2DDKA 3FD3A 3W9VA 1B6HA 2NWJA 1IIWA 4EDPA 1N7WA 4HCWA 3GBBA 3U8QA 5I56B 1XS5A 1ZJLA 4MMPA 3FVNA 2DWHA 2A5TB 4ZZEA 3R7XA 4RNSA 1LBXA 5TPAA 1A99A 4N8YA 4XKQA 4OEUA 2WBDA 4TQUQ 5H8SA 4YB6A 2HXRA 4U1ZA 1FTKA 3K1MA 4GWYA 5ITOA 3OSQA 1MY3A 2QVRA 3CVGA 4YKPA 3T9UA 5TU0A 2CZHA 1G0HA 2ZMBA 4GXSB 3FVGA 2QL3A 1SDXA 1IMAA 3PU5A 3N94A 4OVRA 4U4XA 4FE8A 3KSXA 5I7IA 5TPAB 1TWYA 3VFJA 4GD5A 3VVDA 4PFYA 1Y1MA 4JB7A 2V93A 3IB0A 1LFGA 4P11A 3HPIA 3K02A 4N91A 1ZIUA 4F3BA 3FXQA 4RJZA 2OZZA 3S4UA 2ZZWA 1JW1A 1LAFE 3BBRA 1JNFA 3FBPA 2MKZA 1M5FA 1FPJA 1FTJA 4XTCQ 1MPDA 2DXYA 3OO7A 4DXCA 2QMWA 2W7YA 3H6WA 4DI3D 2WYPA 4YU0A 3DP8A 1RYXA 4OESA 2H9BA 2XX8A 3K6UA 4QFLA 3TUSA 3SEYA 4QFPA 2CEXA 4P0IA 2RC8A 1FQDA 1YPNA 4PFTA 1A8EA 1CE2A 1FBDA 2ABHA 2Z8FA 1LB9A 3FJGA 3LUZA 3KN8A 5JTYB 4DXUA 3HV1A 2L5VA 2THIA 3FZVA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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