5FHMA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with (s)-2-amino-3-(5-(2-(3-(aminomethyl)benzyl)-2h-tetrazol-5-yl)-3-hydroxyisoxazol-4-yl)propanoic acid at resolution 1.55 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Tweaking Subtype Selectivity and Agonist Efficacy at (S)-2-Amino-3-(3-hydroxy-5-methyl-isoxazol-4-yl)propionic acid (AMPA) Receptors in a Small Series of BnTetAMPA Analogues.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fhmA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fhmA02
4X9TA 4H0WA 3QK6A 3HSTA 3ZSFA 3IR1A 3FXQA 1MQGA 3QUJA 1ZIUA 1LCFA 2A5TB 3PUYE 3R7XA 3FUZA 1HSJA 3G3GA 3G3HA 5F1QA 3SEUA 1TFAA 2HZLA 2OWSA 2ZYKA 2CMOA 3DLNA 3FVGA 4GL8A 2ESNA 4NF4A 4EF1A 4NF5A 4HS7A 3M3FA 3K6VA 1B3EA 5IKBA 1BKAA 2ONRA 4IY6A 1B9JA 4TLLB 1RKMA 5H8FA 3FVOA 2QPQA 3QAXA 3QUFA 2QS3A 3E13X 4YB5A 4ZECA 1SBPA 5AE4A 4ZZAA 4IO4A 4IO3A 2X7PA 4HW8A 3I6VA 3MVYA 1QULA 3O29A 4YB6A 1FQBA 3MP8A 4YKKA 5ITPA 3F11A 1LB9A 2PX1A 4PQJA 3B6TA 4Q30B 4TLMB 4DDDA 3FATA 4OETA 4EQBA 3EHSA 3KSXA 2V3TA 3MUQA 4QRZA 1I69A 1B52A 3RUMA 1N3WA 1A40A 4YZZA 4KFQA 4QSCA 5JTYB 2DVCA 3ONMA 4R75A 1ELJA 4R74A 5HBCA 4XKPA 1RYOA 4M4GA 4F3BA 3IK6B 1MY4A 1LGBC 1XHYA 2FA7A 1S50A 1SW5A 2V25A 3TKDA 3FXRA 3PMVA 4DE8A 1O64A 1ZTYA 4NF4B 4NF5B 4G68C 1SVXB 4I62A 4ZEIA 3RQTA 5TP9A 1JQFA 3LC8A 1JW1A 4F1UA 3GZGA 4ZEDA 4PETA 5H8FB 2RKMA 2P2AA 1DPEA 1UIVA 2RCAA 3U8QA 4KR5A 1J1NA 3CI8A 4I9DA 4YMBA 1B0HA 3FZVA 1MXWA 1MQIA 2HQ0A 3KOSA 4MLQA 2PMSA 3UA8A 2DQVA 3GBAA 1BTJA 4Q8RA 1US5A 2XX8A 1B5HA 1GV8A 3K6XA 5EHMA 2ZYOA 1URDA 2I4CA 3W15C 1H3DA 4YAHX 3SETA 2Q8JA 1OQGA 3KN8A 3B6WA 1B7HA 2R71A 1Y20A 1YAEA 2DYXA 4XXUA 1ZU0A 1WVJA 3MVWA 4BDMA 3QSLA 3HCQA 3KN7A 1LLSA 5F7VA 2Q2CA 4BDNA 1FTOA 3KSJA 2O68A 3LR1A 3MVXA 4FECA 1GTKA 4GRKA 3N26A 2H4IA 1IXGA 3O9PA 2RF1A 3DP4A 4EUOA 1QUIA 2D3IA 4M1VA 4GF8A 2Z8FA 5H8QA 4FJPA 4LQ2A 5TP9B 2H98A 3TQWA 3VVDA 3TCHA 2XXYA 3PPQA 5ICTA 3VLUA 2I48A 4RJZA 2Y7WA 4FEDA 1B3FA 3RLFE 1LSTA 4YICA 3KG2A 4RNSA 3TQLA 2PBWA 4MFIA 3R6UA 1Y3PA 3HV1A 4GFRA 1ZMGA 3FV1A 3B7DA 3UORA 3EQ1A 3H06B 4PE5B 2O1LA 5JK4A 4QSEA 1MDQA 4F18A 2XXXA 4GXSB 2PT2A 3MZ9A 1B7ZA 1R1NA 3TTMA 1OVBA 3IB2A 1FQEA 1N0TA 5A5XA 1MPDA 1Z7ME 4G8MA 2NUVA 4F29A 4ZEBA 3ZKLA 1R9LA 4OXVA 4POWA 3ZS6A 1N04A 2XXPA 1Y4CA 2F78A 3C35A 3VXBA 3RTWB 3GLBA 3HO7A 3TEPA 4RK2A 5DT6A 4OEUA 3BBRA 3SEXA 3M3KA 3W9VA 3TCFA 3H6UA 1FQDA 1S9TA 2VHAA 3JZJA 2NXOA 3LSXA 2QS2A 1VSOA 4LP2B 2H5YA 2H99A 2I58A 3MP6A 4YMAA 4ZZEA 2I0BA 1BIYA 4R6YA 1MS7A 5H8QB 4N07A 1JW4A 4U4XA 2NWJA 1N7WA 1Q35A 3RT8A 3EHUA 2YPNA 1Q1KA 1GR2A 2ZNUA 1B40A 1TXFA 1LAHE 4KYSA 3PPOA 1XC1A 1Y1ZA 1A54A 3W9WA 2V3QA 4KCDA 5TPAA 4GOTA 4OFJA 4X48A 4X1DA 1MPCA 3CIJA 2DWHA 3FJ7A 4PP0A 3TPAA 5H8NA 4DIGA 3CRBA 5A5XB 3G3FA 2PYYA 1QKBA 1I6QA 4OFOA 2DE3A 3TDJA 3Q26A 1P1UA 1YCJA 3IOTA 1PB7A 5AA4B 3H03A 4QFPA 3OELA 3E4RA 1USYE 5KCJA 5DEXA 2AYSA 4EXKA 2ZNTA 1LFGA 2P0SA 4FAJA 3UK4A 1B3GA 4OHNA 4F2OA 1SW1A 3G7WA 3LBSA 4GXAA 2RCBA 4OESA 1MXXA 4JB7A 1MXUA 5AA2A 2Y7IA 3LSFB 1Z7NE 5CM6A 5ICQA 1NFTA 5FTIA 2KLFA 3I3VA 1IIWA 4RYAA 2AIXA 1OLAA 5TU0A 3G3KA 4YKPA 4H5FA 3FD3A 1B7UA 2Z8EA 4R9GA 3CR9A 2AL5A 1JNFA 2Y7PA 3L6HA 1H43A 4ISUA 1B1HA 3O6HA 3PUXE 2M8CA 4G4PA 5AA3A 5TPAB 1EU8A 1CE2A 3CVGA 5H8NB 1DTZA 4BDQA 3T9HB 3O66A 1VFDA 3E3KA 1GGGA 3THIA 4ESXA 4JSOA 4KCCA 4HCYA 5J1DA 4NE4A 2REJA 5JEIA 4ZEFA 4GWOA 1OQHA 1FTKA 5CBRA 1XT8A 1SI0A 4OEVA 5DEXB 5KCJB 1KWHA 3FJGA 4EXLA 1Y9UA 4H8JA 4LA9A 3RY3A 4DXUA 3TTNA 5CI5A 3FV2A 2Y84A 1SQYA 4WEDA 1QW0A 3OEMA 2XXRA 3PMXA 4LATA 1MRPA 4UA8A 3QYTA 1AH5A 3HHGA 5AA2B 1O63A 4FORA 1ZBMA 4WEPA 3H3GA 1FTMA 1D9YA 4O3CA 1HSEA 3TFLA 4JSDA 3IOVA 2OWTA 1H44A 2RINA 4RY1A 1O7TA 4GD5A 4NTLA 2V93A 5I58A 2FNCA 3MQ9A 3OOAA 1OLCA 2G93A 2DP8A 2I49A 4FIMA 2PT1A 3GBBA 4JWYA 3P7IA 2F97A 4MH5A 5L9OA 4XIGQ 2F35A 3T9VA 4OFLA 2VGQA 1WODA 3RGYA 2ONKE 1LB8A 4OQOA 5L9SA 3QIMA 4E0XA 4E0WA 3FIRA 1UTBA 4H67A 1B46A 1USYH 3B6QA 4F39A 1N7XA 1A8FA 4BDRA 5IAIA 4H65A 4NF8A 2DWIA 2OJTA 4NF6A 5HM4B 1Y3QA 1QUJA 1IZ1A 1SW2A 3T66A 2AL4A 1NNPA 2UVIA 3T22A 4MF3A 4KYEA 1B5IA 4XKRA 4IO6A 1DPPA 1A99A 4BDLA 3O6GA 1FQFA 4JXIA 1MM7A 3C31A 3FVNA 5I84A 2XXQA 4RK9A 2GFEA 3USDA 3CG3A 5CC2A 1PC3A 1AIVA 3MZ1A 3CSBA 5AA1A 4AB5A 1N3XA 2F6GA 4MBPA 5H8SA 5CMCA 4F22A 1Y1MA 4RPOA 5DTBA 1US4A 5I58B 1T0KA 2VP1A 2W7YA 4NMYA 1IXIA 4JDFA 3WAEA 3VVEA 3SEVA 1TWYA 5I59A 3ECRA 2O6AA 2O69A 1CB6A 2XX7A 2ANJA 3IJXB 3DM0A 3RTFB 1UTBB 2UXAA 3C33A 2I6EA 1TFDA 3O6IA 4ELQA 1NKXA 4ZE9A 4NF8B 3TCGA 3D4GA 4NWDA 1P1QA 2UVHA 2VD2A 3AXFA 4IY5A 1FTLA 5H8HA 3K00A 4QFNA 3HN0A 4LONB 4KD5A 1UTHA 2O84X 4MLVA 4G77A 4LZ5A 4ESWA 2UVGA 3S9NC 1Y4TA 3M8UA 3PPPA 3C9HA 1NNFA 4H6DA 3SESA 3MPKA 3Q27A 1MM6A 2X26A 1GVCA 4R9FA 4UACA 5CBSA 2HAUA 2YLNA 4PFTA 3V83A 4K3FA 2F7CA 1MY1A 1EZOA 3TUSA 2OLBA 2XXIA 1SW4A 2NOOA 3K0VA 2GHAA 2CZLA 1PBQA 3S9MC 3H6WA 4ZE8A 2ONSA 3IO4A 3MZBA 2F34A 5I59B 4ZDMA 1ZJLA 1ZLQA 4YKJA 2NVUB 4F1VA 3H6VA 4QFOA 5BUUA 1II5A 4THIA 4LZ8A 4EDPA 3T9XB 5B7DA 1B0LA 4Q0CA 3OMBA 1ATGA 3IX1A 3SEYA 5I2KA 1IITA 4IO5A 4EQ7A 2ALUA 1ZKBA 4BLAA 4L17A 3EPEA 5FTHA 3V8XB 2ABHA 4RPNA 3V5AA 1PDAA 5H8HB 3RN8A 1SI1A 3Q29A 2UVJA 2ZXTA 3OO7A 3PUVE 3OO8A 3T9UA 5L9MA 3IAZA 1B5JA 1MDP1 4P0IA 2BJJX 4GQOA 5AA2D 2F7AA 1MXVA 3H4ZA 4BDOA 1N76A 4N13A 2OBGA 1JETA 1PEBA 2Q89A 3R26A 1JEVA 1MQHA 3RPWA 2Q9TA 1B1XA 3OO6A 4F19A 1A55A 4U23A 4QHQA 5I56A 4EF2A 1OIBA 3TTRA 3TZAA 4GIZA 4F3GA 3C4MA 3KEIA 1SDXA 1UQWA 3A3UA 2REGA 4YU0A 4KPTA 1IXCA 3EHTA 2H9BA 3UP9A 3TYHA 4NEDA 3PGFA 3N94A 2WKYA 4QSDA 2Z8DA 3D4CA 2RC7A 3BKIB 5I2KB 3VE1B 2GHBA 5DYHA 3PUZE 2O7UA 5LOMA 3V89B 4C1TA 2HXWA 2QS4A 3IORA 2O51A 3Q25A 1NH7A 5BWJA 1B4HA 2XXHA 3DP8A 3OXNA 2I0CA 3IB1A 1FTJA 1SYHA 3TTLA 2THIA 3MPLA 4PFYA 3S4UA 3SEWA 1R9QA 2F5XA 3TMGA 1LAXA 1I6BA 3FGSA 3PD8A 3ILUB 4AB6A 3MAMA 3U93A 5I56B 5M2VA 4OWDA 3K4UA 2XHDA 2H25A 4X1BA 1POTA 4C0RA 4IO7A 2HAVA 1LFIA 1BP5A 4RA1A 3OD7A 2UYFA 4N6PA 3G3IA 1A8EA 4XKQA 1B58A 1MH4A 4OZ9A 2DWJA 5ELVA 1DOTA 2HZKA 3KGCA 3ODBA 3VV5A 3PD9A 4Z0IA 3SERA 4YB7A 2Y7RA 3SKPA 5ITOA 3DP6A 3OEKA 1B2HA 2HFBA 5K2YA 3S9LC 3N6TA 4OYVA 3MW0A 2B65A 3K2DA 1EZ9A 2XXTA 4P11A 1D9VA 3MC2A 1OMPA 2IA4A 4R6KA 1F9BA 3IOUA 3LSLA 2F36A 1M5BA 1PB9A 4GL0A 2D5WA 3T96B 2F6PA 5ISUA 3VLVA 2XXUA 3K01A 1XVYA 4R72A 4KI0E 4WKMA 4KQPA 1QJMA 3U72A 1EZPA 3IO6A 3U92A 3H6TA 4R2BA 1B05A 4DZ1A 2Y7KA 3KFMA 3O28A 4U22A 1B6HA 4HTGA 3UGWA 1ANFA 3K1MA 3RT6B 2DXYA 4TQUQ 3IJOB 1WDNA 4H1XA 4P0GA 4PFUA 3CSGA 2I4BA 2DXRA 2ZNSA 3VDFA 3BFTA 1B4ZA 1FCKA 3FJMA 4KYDA 2Z23A 3O2AA 1LAGE 3OSRA 3WAFA 5DVFA 1B51A 1MQJA 2ZYNA 4GLIA 1MPBA 1FW0A 3C32A 3IB0A 1JEUA 5CMBA 4DCXA 1B3LA 4OMBA 2F8DA 2ZMBA 1HSLA 1M5FA 5L8DA 4JWXA 2OZZA 1MG1A 3VXCA 2Q2AA 4TOZA 4QFKA 3JV9A 2XD2A 4QFLA 2Q88A 5FHOA 4DLDA 1TT1A 4LUBA 1SYIA 2R9JA 2HEUA 2B3BA 2G29A 3KZGA 3C34A 2QSXA 1PB8A 2DWAA 2QMWA 1AMFA 4JBZA 3L6GA 1I6AA 5I2NA 3VFJA 2GRVA 1IUDA 5CRYA 2O7IA 1D4NA 4WXJA 5EYFA 3OENA 2DVZA 3K02A 1OVTA 3VVFA 3PPRA 2ZYMA 3QXMA 1NH8A 2P1SA 1URGA 4JWOA 4OTEA 3A3CA 3OSQA 4O3AA 4F31B 2DOJA 1S7YA 3KN3A 1QUKA 1FQAA 1P1OA 3PUWE 1DTGA 1NMUA 4EQ9A 3G3JA 3S9EA 4POXA 1VE4A 1QKAA 4DXCA 4U4SA 5FHMA 1IXHA 1P1WA 4NF6B 2VOZA 1B3HA 2E0SA 4LZ7A 1LBBA 4IGRA 1DSNA 2I3VA 3OO9A 2V84A 4Q5TA 1PBPA 2X7QA 3CFLA 5HPQA 3CG1A 2FYIA 4ELRA 4KHZE 1VR5A 3PMWA 3HHFA 2QJEA 2RC9A 5KDTA 1M5CA 3K6WA 2V3UA 1RYXA 1IEJA 4RXLA 1IQ7A 5I57A 5I2NB 3LSWA 1H45A 4OERA 4OVJA 2XD3A 5DVJA 1SD3A 3N6UA 3E9XA 1BLFA 1D3KA 1URSA 5KZTA 2D21A 3T93B 2IEEA 2QS1A 3UN6A 1YTVA 3IL1B 3ILTB 3IOWA 2I3WA 2UYEA 1L5TA 4NWCA 1B32A 4QF9A 3KOTA 3PV0E 2QL3A 4U21A 2RC8A 4I1DA 4Z7EA 1H76A 1UIUA 3KBRA 4F3PA 4PFWA 4R73A 4R6HA 2DE2A 3LUYA 3TODA 5CMMA 4OENA 1LCTA 1QVSA 1NL5A 3TELA 1UTHB 1M5EA 5EHSA 5AA4A 1MY3A 2B3FA 1A7LA 3H7MA 4ND9A 3BFUA 3HPIA 3K1PA 4GVOA 1JVYA 2HCAA 3FXUA 5DVIA 1M5DA 3A09A 3VLWA 4ELOA 1VFEA 5KDTB 2DSFA 4G68A 1EH3A 3RNNA 5I57B 4ZS9A 1JVXA 1YPNA 1LAFE 1P99A 2E1SA 1AOVA 2PVUA 1P1NA 3CFZA 2XX9A 1MY2A 1NNTA 2VD3A 5B70A 2O1MA 2Z22A 1LBCA 4G2ZA 4FE8A 4AQ4A 4ZEKA 3TAJA 3MVZA 1R6ZA 3FVKA 2OK2A 1XS5A 1DMBA 1POY1 4H8IA 3U94A 3MP1A 2OCUA 4ELPA 3GXAA 4YKIA 1N84A 4O3BA 3DELB 2GH9A 3Q28A 1MXYA 1MY0A 3KJ7A 1MXZA 3MJNA 4U2RA 4IO2A 3MBPA 4ECFA 4DCYA 4LQ5A 2A5TA 3MWBA 4I8CA 3S2VA 4IB2A 4F2QA 2LAOA 3CFXA 4LVQA 1MH3A 2XXVA 4G68B 3TTKA 3EN3A 2DE4A 3N5LA 4HCWA 3EF7A 4G8NA 4IGTA 4U1OA 1NNKA 4DXBA 4FATA 2XXWA 2A5SA 5K2XA 3O97A 5FHNA 3FASA 3K1NA 3UIFA 4U1ZA 2QRYA 3SDFA 3ZKKA 4G8HA 4H5GA 1XVXA 3PPNA 1AL3A 2F7BA 3M3LA 4XTCQ 2QMXA 3C36A 1MQDA 1LFHA 4R2FA 4XKNA 3K6UA 2YJPA 5CMKA 3JYRA 4C1UA 1XOCA 4ONYA 3U1OA 4FEBA 3PU5A 3I5OA 4F1YA 2DS9A 1Y3NA 2R6GE 1FQCA 4F3SA 3KJTA 1JW5A 5JTYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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