1AMFA

Crystal structure of moda, a molybdate transport protein, complexed with molybdate
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
GKITVFAAASLTNAMQDIATQFKKEKGVDVVSSFASSSTLARQIEAGAPADLFISADQKWMDYAVDKKAIDTATRQTLLGNSLVVVAPKASVQKDFTIDSKTNWTSLLNGGRLAVGDPEHVPAGIYAKEALQKLGAWDTLSPKLAPAEDVRGALALVERNEAPLGIVYGSDAVASKGVKVVATFPEDSHKKVEYPVAVVEGHNNATVKAFYDYLKGPQAAEIFKRYGFTIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords MOLYBDATE TRANSPORT PROTEIN MODA
publication title Crystal structure of the molybdate binding protein ModA.
pubmed doi rcsb
molecule tags Binding protein
total genus 75
structure length 231
sequence length 231
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1amfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1amfA02
3C31A 3VE1B 4FEBA 1NFTA 4QSCA 4R6YA 1JNFA 1O7TA 3FZVA 1DOTA 1MM6A 4FJPA 2H9BA 4HCWA 1LSTA 4AB6A 2AIXA 2O6AA 4JBZA 2R6GE 4MF3A 2ZYOA 4O3BA 3IB0A 4LONB 3TUSA 1IXIA 3K6WA 3TAJA 2M8CA 1FCKA 4GWOA 3DP6A 2DWHA 2QS1A 4H67A 4NF6A 4RK2A 1B7UA 2H99A 3S9EA 1A99A 1UTHA 3D4GA 1QUJA 4KFQA 1TFDA 1WVJA 3RT6B 1A7LA 1MQIA 1IIWA 4THIA 3H6UA 4F2QA 2XXYA 1MPDA 1N3XA 1OMPA 4JSOA 4PFTA 1J1NA 2VD2A 4KYDA 2V3UA 3O28A 4H6DA 1I6AA 1RYOA 3F11A 4N07A 3R26A 2ONRA 2UXAA 1FTJA 1B6HA 2P1SA 1MRPA 4RYAA 1DTGA 1WDNA 5I59A 2OCUA 3V5AA 1SW5A 4XKRA 3VXBA 1JW4A 4G8HA 3C35A 3PV0E 2PVUA 2Z8FA 1VFEA 5TU0A 4YB6A 3MAMA 1URGA 1NNTA 3TODA 5ELVA 3TKDA 2QS4A 1A55A 3OELA 5DEXB 1IXGA 1HSEA 1POTA 3TCGA 3ILTB 3HN0A 2Q2CA 3O29A 1NNKA 5KDTA 5I84A 2ONSA 4NWDA 4X1DA 2VOZA 5KCJA 4QFOA 5AA2A 3IX1A 3PPRA 5CC2A 4LP2B 3H6VA 2I0BA 2OBGA 1SBPA 4OZ9A 3VV5A 2NWJA 1VFDA 4KYEA 4OYVA 1B3GA 2B65A 4ISUA 4HW8A 1US4A 4R2FA 4Q0CA 5JEIA 2LAOA 3MPLA 2E1SA 3T9HB 3FJGA 4YAHX 2REJA 1R9QA 3L6GA 3N6UA 4MLQA 1O63A 2XXRA 3OXNA 3RT8A 1N3WA 3TDJA 4F3SA 1LCFA 2O51A 1Y3PA 1RYXA 3ZKKA 4DZ1A 3PD8A 3S2VA 4I62A 4QHQA 3I5OA 2Y84A 1B40A 2F36A 4C0RA 2D3IA 1AMFA 4DDDA 1UTBA 2R9JA 2XX9A 4WEDA 3IOUA 1D4NA 1IEJA 1H3DA 4IGTA 4KPTA 5I57B 4ND9A 4DE8A 5ITOA 4YMAA 2FNCA 2Q9TA 1MQHA 3N94A 4RY1A 3KGCA 4PP0A 1R6ZA 3E9XA 4ZDMA 4F29A 1WODA 3L6HA 4LA9A 4O3CA 3MW0A 2Q8JA 5EHMA 4U1ZA 4NF5B 1HSLA 3TTKA 4GF8A 2UVGA 1URSA 2REGA 5L9SA 4GFRA 3KN3A 5DEXA 3QIMA 2XXPA 4ELRA 3VVFA 3U94A 3PPNA 3HV1A 4X1BA 3PUWE 4QRZA 5H8NB 3TTNA 2ABHA 1DSNA 1B7ZA 1A8FA 2HZLA 3ODBA 3LSWA 1LB8A 1UQWA 3FJ7A 2A5SA 1CB6A 2UVJA 3G3FA 5F7VA 2PYYA 5BWJA 2DXYA 1SYIA 3OD7A 4F39A 1N84A 3OSQA 2ZMBA 3EHSA 4I8CA 2RCBA 1MY4A 2YPNA 3MUQA 5H8SA 3D4CA 1SI0A 3TMGA 5FTIA 4ZZEA 2O1MA 2D21A 3P7IA 4GL8A 2QJEA 3T9VA 2XXHA 4PFYA 3R7XA 1B52A 2ZYNA 4IB2A 4F18A 4O3AA 1SI1A 2O69A 3WAEA 4ESWA 5H8FB 1PDAA 3SERA 2ZYMA 1ZMGA 3HPIA 3K6XA 2XXIA 4FEDA 4GD5A 1B5IA 1D9VA 3MZBA 3IJOB 4F2OA 3VLUA 2VGQA 3OENA 4OMBA 3ZKLA 2I58A 2V25A 5HM4B 4RXLA 3G3IA 1IQ7A 1PB7A 2RKMA 4RPNA 4QSDA 3LC8A 3FIRA 3A09A 1B1XA 3LSXA 2X7PA 3FVKA 4Z0IA 3EHUA 1EZPA 5DVIA 3EN3A 4R72A 3HHGA 2OLBA 4WEPA 4IO3A 4YKJA 3C32A 4KCCA 1Q1KA 1QJMA 1MY3A 4GIZA 2V3TA 2QMXA 4F31B 3Q26A 1NH8A 1I69A 2ALUA 5L9MA 2QPQA 4EXLA 3E4RA 1UIUA 4NF5A 4R6KA 3CIJA 3M3LA 1ZIUA 4LZ8A 3SDFA 1OVTA 3ECRA 1ZJLA 3U8QA 4EQBA 3LSLA 1XHYA 2YLNA 1B05A 1ZBMA 3H03A 1EZ9A 3RY3A 1NKXA 3PPOA 3TQLA 3O66A 3FATA 4OWDA 3KJTA 5FHNA 1FTKA 5AE4A 2YJPA 3FVOA 1B3EA 1O64A 5CBSA 5AA2B 4ESXA 1YPNA 1TXFA 4FECA 3GXAA 3KJ7A 3GBBA 2O7UA 2THIA 1SVXB 3IAZA 3ONMA 3V8XB 4ELQA 4Q30B 4GOTA 3BFUA 1I6QA 1GR2A 3SETA 1FTOA 3CG3A 5HBCA 5EYFA 5DTBA 2F5XA 1JQFA 3I3VA 2QSXA 3SEUA 4ZEIA 3LUYA 3MBPA 4R2BA 1MG1A 2ANJA 3UN6A 1MPBA 4EXKA 3H6WA 1MQDA 1BIYA 4R9FA 4EDPA 5I56A 2CMOA 5FTHA 4DLDA 4PFUA 1JVXA 1OLCA 5H8FA 3G3JA 3MPKA 3MZ1A 4EF2A 4GRKA 4U2RA 2DE3A 3HCQA 4OENA 3OO8A 3KSJA 3AXFA 4C1UA 4NE4A 4XTCQ 3HHFA 3KG2A 1UTBB 4NF4B 1ZTYA 4UA8A 4MLVA 1MQJA 1JW5A 3K00A 1GTKA 1IUDA 4BDLA 3TCFA 3E13X 5AA4A 1M5FA 4BDRA 4F3GA 4AQ4A 3CFLA 3KEIA 4M1VA 4TQUQ 4JWXA 4ELOA 3DP8A 1YTVA 2DYXA 2HXWA 1F9BA 5ITPA 4KQPA 3I6VA 4R9GA 3C33A 4OFJA 1LLSA 1PEBA 1D3KA 2Y7WA 4DXBA 3N5LA 4U22A 2PBWA 1QUKA 3B6WA 5CBRA 4JXIA 4NEDA 2FA7A 3SEYA 2ZNUA 3UK4A 4WKMA 4Q5TA 2QL3A 1FQFA 3MVWA 4OXVA 3IK6B 4XKQA 5B70A 5K2YA 4YB7A 4F3BA 1CE2A 2DE2A 2F35A 1LFIA 1RKMA 3TTRA 4ZEDA 3K1PA 1S7YA 5IAIA 3KZGA 3T22A 5H8HA 3UIFA 2E0SA 3O9PA 4H8IA 3TTLA 2OJTA 4G8NA 1QW0A 2ESNA 2F97A 4R74A 3BKIB 2UYFA 1MS7A 1FQDA 2H98A 3QK6A 3PU5A 1I6BA 1MXYA 2WKYA 2RC7A 3C36A 1MDQA 2ONKE 4X9TA 2QMWA 5A5XB 3FUZA 3M3FA 4M4GA 2Z23A 3TYHA 2RC8A 4OETA 3T66A 4IY6A 5L9OA 3VFJA 4N6PA 3IO6A 4OESA 1NL5A 3FASA 3HO7A 4JWYA 3USDA 1II5A 4FE8A 4F19A 1MY0A 3MWBA 4H5FA 2XXUA 4BDQA 4HTGA 1N0TA 1FQBA 1N7WA 4NF4A 2I4BA 3IR1A 2A5TB 2Q89A 3EPEA 4NF8B 3KFMA 1LAGE 1SYHA 4LQ5A 1MH4A 1JW1A 1HSJA 4EF1A 3LR1A 3RUMA 4IO6A 4C1TA 1LAXA 3W15C 5M2VA 3O6IA 4AB5A 1MDP1 3K1MA 2PT2A 4ZS9A 3PPQA 3IORA 2F6GA 5DT6A 2I3WA 4WXJA 4ECFA 4OVJA 3R6UA 4I1DA 4BLAA 4H65A 2V93A 4TLMB 1B3FA 2GRVA 4ONYA 4QFKA 2HZKA 3S9MC 4GVOA 4JWOA 2ZNTA 4BDNA 1IZ1A 4RK9A 4U4XA 2Q88A 1EH3A 3RTWB 1B7HA 3K01A 2XHDA 5I2NA 4QFPA 3N6TA 3IO4A 2UVHA 3PUVE 3U1OA 3T93B 5JTYB 5DVFA 3IOVA 3PD9A 2F78A 3UP9A 2DS9A 3OEMA 2RF1A 3C34A 1MY2A 4YKKA 4X48A 4I9DA 3MQ9A 3LBSA 3MJNA 4G4PA 2HCAA 1R9LA 2F7CA 3H3GA 4JDFA 3S9NC 3UGWA 1N04A 4OTEA 2VHAA 4OERA 1VE4A 3KOTA 4E0WA 1URDA 5TPAB 4F1YA 2BJJX 3RTFB 3MP8A 3K6UA 4MH5A 5I56B 2KLFA 1DPEA 4PFWA 1IITA 2DE4A 1GV8A 2I48A 3K4UA 2DVZA 3PMWA 3U92A 5A5XA 3FXQA 2UVIA 4IO5A 3Q29A 3KN8A 2DWJA 1US5A 1EU8A 3SESA 3MVZA 4YKPA 3KOSA 4PETA 5TP9A 4XKPA 1OVBA 4U21A 1B9JA 4GXSB 3PUZE 2I0CA 3VVDA 2A5TA 4R73A 3IJXB 4NF8A 4DXUA 5AA4B 3OMBA 2PT1A 3GZGA 3QYTA 1DMBA 2QS2A 3T9XB 2Z8EA 1UIVA 1JETA 2IEEA 2DXRA 3JZJA 4GXAA 1B2HA 3MVXA 1Y4TA 2Y7RA 1AL3A 1AOVA 3A3UA 3KN7A 2RINA 2R71A 4MFIA 3CSBA 4F1UA 3K6VA 2Y7IA 3M8UA 1IXHA 4G8MA 4YZZA 1FQAA 1PB9A 1MXXA 4OFOA 5ISUA 4PQJA 4H5GA 2Y7PA 1ANFA 4LVQA 1MXUA 3FJMA 3JV9A 1LFGA 3FVNA 3KSXA 3PMVA 2NXOA 3DP4A 1Y3QA 2OZZA 3EQ1A 4N13A 1Y20A 4OFLA 5JTYA 1OQHA 2XX8A 5I58B 4IO7A 5KZTA 5DYHA 4PE5B 1XOCA 2PX1A 1XC1A 1MXWA 4EUOA 3Q28A 5H8HB 1GVCA 2HQ0A 3CVGA 3RNNA 3PPPA 4GL0A 3TCHA 3W9VA 5K2XA 1Q35A 1QKAA 1T0KA 1H44A 3FV2A 1FQEA 4KD5A 3W9WA 3DM0A 2B3FA 2W7YA 4QF9A 4G2ZA 5TPAA 3TPAA 1N76A 2V3QA 4ZE8A 2AYSA 1P1UA 5CMKA 3MP6A 3CFZA 4RA1A 3B6TA 3CSGA 1B46A 1TT1A 5I2KA 2V84A 2D5WA 1P99A 3M3KA 2AL5A 3G3KA 1JEUA 1LGBC 2NUVA 2Z8DA 1BP5A 1A40A 1B5HA 2F34A 3U93A 2PMSA 3G3HA 2DOJA 2XXVA 5CMBA 2HEUA 1MXVA 4YB5A 3U72A 2HAVA 4KYSA 3ZS6A 1M5BA 5BUUA 1P1QA 4LZ5A 5F1QA 2RC9A 3JYRA 3VVEA 4G68C 4P11A 5H8QB 1S9TA 4RJZA 2RCAA 1B5JA 1M5CA 1SQYA 3VLVA 1OLAA 2F6PA 3K02A 3IB2A 3OSRA 1JVYA 1GGGA 3RGYA 3IOWA 1OQGA 3OOAA 1ELJA 5AA2D 2NOOA 3OEKA 5ICTA 2O7IA 3RN8A 5IKBA 5I2NB 2HFBA 2NVUB 4HCYA 4F1VA 3MP1A 3PUYE 1JEVA 1NNFA 2DSFA 1B0LA 2Q2AA 3G7WA 1SW2A 5I58A 3B6QA 1MH3A 5AA1A 4IY5A 1ZKBA 1H76A 3H7MA 2ZYKA 5JK4A 4F3PA 5ICQA 4G68B 1FQCA 4POWA 3PMXA 1M5DA 3RLFE 1MPCA 3O6HA 4ZEFA 1MXZA 4YU0A 3VDFA 3EHTA 3OO7A 2VD3A 3V83A 4H0WA 4NMYA 2I6EA 1B4ZA 2XX7A 3MC2A 3O97A 4YICA 1VSOA 4TLLB 3B7DA 1Y1MA 3OO9A 1FTMA 2F8DA 2UYEA 4IGRA 4OQOA 1LFHA 1B0HA 2P0SA 1B1HA 4U4SA 2O68A 1SDXA 3VXCA 5TP9B 5FHMA 3EF7A 2IA4A 1LAFE 1P1NA 4P0IA 3CFXA 1LB9A 4OHNA 4P0GA 1H43A 3QAXA 1LBCA 1PC3A 2P2AA 1QUIA 1BLFA 4ZZAA 4XXUA 4Q8RA 1AIVA 5AA3A 4DCXA 5B7DA 3WAFA 2OWSA 4XIGQ 1P1WA 3TEPA 1LCTA 3H4ZA 5L8DA 4U23A 2G29A 1N7XA 4K3FA 4Z7EA 1PBPA 4LATA 3PUXE 2DWIA 3DLNA 1L5TA 2QS3A 3SEWA 3C4MA 5CMCA 4POXA 5FHOA 3TTMA 3FXUA 1SD3A 1QKBA 1B4HA 4EQ9A 4FIMA 2I3VA 5H8QA 4ZE9A 4F22A 3A3CA 1YCJA 3Q27A 3PGFA 2H4IA 2GH9A 2H25A 3H06B 1OIBA 2XXQA 2H5YA 3FVGA 2XXWA 3S9LC 1MM7A 2DP8A 1ATGA 3RQTA 2OWTA 5CI5A 2VP1A 1A8EA 3IB1A 2CZLA 1DPPA 4ZEKA 1QULA 2B3BA 1XVYA 5J1DA 3N26A 3QSLA 4DXCA 1M5EA 3CR9A 3QUFA 2DQVA 3BBRA 4TOZA 2G93A 4QSEA 1NNPA 1SW4A 4FATA 3SEXA 1DTZA 2XD3A 1S50A 1A54A 4OEUA 5HPQA 2ZXTA 2GHBA 3QUJA 4RPOA 4ZECA 2I4CA 4JB7A 1MQGA 3RPWA 4G68A 4LUBA 1PB8A 2O1LA 5DVJA 1Y9UA 2X7QA 3V89B 3O2AA 4H1XA 4QFNA 1Z7ME 3LSFB 2FYIA 1P1OA 1D9YA 2F7BA 4HS7A 5CM6A 4GLIA 4R75A 2XXXA 2ZNSA 3H6TA 1B32A 3CI8A 3G3GA 1ZU0A 1Y4CA 2Y7KA 4NTLA 1B58A 5I2KB 1QVSA 3UA8A 1Y3NA 4KCDA 1NMUA 4XKNA 1ZLQA 1MY1A 1USYH 3C9HA 3GLBA 4RNSA 4NWCA 4E0XA 3TFLA 4ZEBA 4MBPA 1XVXA 1KWHA 3K2DA 3FV1A 2AL4A 1FTLA 1TFAA 3THIA 1LAHE 2HAUA 4NF6B 2DWAA 4UACA 3SKPA 5CRYA 4QFLA 1YAEA 1FW0A 4OEVA 1LBBA 1UTHB 3K0VA 2Z22A 3O6GA 1B3HA 2O84X 3TELA 5LOMA 5I57A 2XXTA 4LZ7A 3IL1B 1POY1 4KHZE 3Q25A 3T96B 1AH5A 2QRYA 1B51A 3BFTA 2GFEA 3QXMA 3GBAA 3TQWA 3OO6A 4GQOA 1USYE 1H45A 5I59B 2DVCA 4JSDA 4DIGA 5CMMA 2I49A 1R1NA 3MZ9A 3ZSFA 4IO4A 1XS5A 2F7AA 3E3KA 4ELPA 3CG1A 2GHAA 4BDOA 1NH7A 1BKAA 3SEVA 3FGSA 4FORA 1PBQA 1B3LA 4L17A 4KR5A 2XD2A 3K1NA 1TWYA 3S4UA 1Z7NE 3CRBA 1SW1A 3KBRA 3FXRA 5EHSA 4DCYA 3TZAA 4R6HA 3T9UA 1IXCA 4YMBA 4BDMA 3MVYA 4G77A 4U1OA 4LQ2A 5KDTB 1Y1ZA 5H8NA 3ILUB 5KCJB 1XT8A 3FD3A 4FAJA 4IO2A 2X26A 4YKIA 2OK2A 1VR5A 1BTJA 1EZOA 3DELB 3IOTA 3HSTA 3UORA 4H8JA 3VLWA 4EQ7A 4KI0E
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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