1AMFA

Crystal structure of moda, a molybdate transport protein, complexed with molybdate
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
GKITVFAAASLTNAMQDIATQFKKEKGVDVVSSFASSSTLARQIEAGAPADLFISADQKWMDYAVDKKAIDTATRQTLLGNSLVVVAPKASVQKDFTIDSKTNWTSLLNGGRLAVGDPEHVPAGIYAKEALQKLGAWDTLSPKLAPAEDVRGALALVERNEAPLGIVYGSDAVASKGVKVVATFPEDSHKKVEYPVAVVEGHNNATVKAFYDYLKGPQAAEIFKRYGFTIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of the molybdate binding protein ModA.
pubmed doi rcsb
molecule tags Binding protein
molecule keywords MOLYBDATE TRANSPORT PROTEIN MODA
total genus 75
structure length 231
sequence length 231
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1amfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1amfA02
4JWOA 4QFKA 2P2AA 1HSLA 2E1SA 2H9BA 2QRYA 4ESXA 2BJJX 3D4CA 4JWYA 4RNSA 3GXAA 4OFJA 2XXIA 4QRZA 4R9FA 3H6TA 5I59B 2XXPA 3FVOA 1OLCA 2ZYKA 1BLFA 1SBPA 3IOUA 2ZNTA 4BDMA 3JV9A 3VLVA 1AMFA 2YPNA 2ALUA 2F78A 4FEBA 1MY4A 3PPRA 1FTJA 4ZZAA 1JW4A 1WDNA 3DP4A 1Z7NE 5CM6A 1ZBMA 4PP0A 2YLNA 4FJPA 4THIA 1M5FA 1GR2A 1MY1A 1N3WA 1R9QA 1TWYA 1XS5A 1XVYA 3QK6A 5I2KB 3IOTA 3SEVA 3LSFB 4ZEDA 1S7YA 3SEWA 4P11A 2O69A 2RC7A 3FVNA 4H6DA 3RY3A 4OMBA 5IAIA 3IO4A 5AA4A 3CI8A 3FUZA 3VDFA 1EZ9A 2I58A 3U1OA 4KPTA 4U1ZA 3C34A 1JEVA 3C35A 3O97A 3R7XA 3VVFA 4LZ8A 5EHMA 3S9NC 4H0WA 4ZZEA 2Q88A 1OLAA 5I56B 1DTZA 3CFZA 1SYHA 2F5XA 1NH8A 2NVUB 3FATA 2B3BA 3O28A 4Q0CA 2FYIA 3PMVA 2XHDA 3WAEA 1R9LA 1TFDA 2RC8A 5IKBA 5AA1A 3A09A 3FZVA 3FXUA 5L9SA 2NXOA 4LUBA 4U4SA 2V3UA 4FE8A 1FQCA 3MW0A 1LAHE 1LB9A 2ESNA 3R6UA 1FTKA 4IB2A 5CMCA 4UA8A 1GVCA 5EHSA 4C1UA 1OVTA 3I5OA 3VFJA 4LQ5A 3MP8A 5BWJA 2XXRA 3MVYA 2DP8A 1LFGA 4DCYA 3KGCA 1IQ7A 2IEEA 2XD3A 4ND9A 4O3BA 4QFLA 4ZEKA 1Y9UA 1LAGE 4KQPA 3CVGA 3W9VA 1B52A 2VHAA 3K4UA 1JETA 2O1MA 1OMPA 3KZGA 4G8NA 3V89B 2PMSA 3N94A 4F31B 4HW8A 3PPPA 4R74A 5TPAA 5I57A 5KZTA 3S9MC 1IITA 2IA4A 1R1NA 3QAXA 4AQ4A 1XC1A 2O68A 1HSEA 3GLBA 3VVDA 2DE2A 1ZIUA 2VOZA 3HHFA 4JDFA 4Q30B 2H25A 5H8FB 4ZEBA 3UP9A 4F18A 5I2NB 4YB6A 5CMBA 3TEPA 5DVFA 1A8EA 3PUYE 3TUSA 4HTGA 4OWDA 3CFXA 5J1DA 2P1SA 2GHAA 1VE4A 1NH7A 4G4PA 1JW5A 1XT8A 1MPBA 2AL4A 2XXWA 2B3FA 5H8SA 4KYEA 2AIXA 2NWJA 2H99A 1LBBA 1US4A 2RCAA 1LB8A 4R6KA 5ICQA 3HO7A 3LSLA 3MUQA 3PMXA 4IO4A 3H7MA 3IO6A 1PB8A 1URDA 3K6UA 3PPNA 4O3CA 3FJ7A 1MDQA 5DVJA 3RT8A 1PBPA 2OCUA 2V84A 4BDLA 5B7DA 5I58B 3MC2A 2ONRA 2XXXA 1VSOA 1N3XA 2DSFA 1B6HA 1MXYA 4R6HA 4XKRA 3S9LC 3IL1B 1P1WA 4JXIA 5CMKA 2RF1A 3W9WA 1MXZA 2ZNUA 5B70A 4R72A 1Y3PA 1JVXA 1NFTA 1XOCA 2QMXA 3PGFA 4IO7A 4MLQA 4POXA 5FTIA 3TTRA 3U72A 1AOVA 3ZKLA 4DXCA 2DWAA 1B32A 3OD7A 3Q28A 3MQ9A 2XXYA 4P0GA 4X48A 5DT6A 3TKDA 4GQOA 4OEUA 1UIUA 3OSRA 4H1XA 3EHTA 4RY1A 5DEXB 1J1NA 3F11A 4WEDA 3QSLA 4QSDA 5LOMA 1LCTA 4H8IA 4Z0IA 1MY0A 2OJTA 4GL0A 2R9JA 4QFOA 3N6TA 4JB7A 5KDTA 3OO6A 2Z8EA 4NF4A 1IUDA 5HBCA 4NF8A 4TLLB 4G8MA 2F6PA 1P1UA 5EYFA 5AA4B 5ITPA 4G8HA 1A8FA 2GH9A 2PYYA 1UIVA 4KD5A 2HXWA 4PFTA 3VV5A 1IEJA 2ZXTA 5KCJB 1H76A 2HAUA 2P0SA 2Y7PA 1ZTYA 3Q26A 4IGTA 2NOOA 4WKMA 4M1VA 3T93B 3MJNA 3LSXA 3OO9A 4I62A 4MF3A 4TLMB 4F22A 1S9TA 1NL5A 2YJPA 2I48A 2Y7WA 1EU8A 1B2HA 1URGA 2XD2A 3FASA 3FJMA 2F7BA 2ZMBA 3EN3A 4ZE8A 3OSQA 3VXCA 5HM4B 3H6VA 2REGA 2UYFA 4G77A 3GBAA 3IOWA 4F1YA 4U22A 4QF9A 1SVXB 2R71A 2AYSA 3HV1A 3T96B 4BDQA 2LAOA 4PETA 5AA2D 5TP9A 1LAXA 4IO5A 1QUJA 3ZSFA 2GRVA 1URSA 1IXGA 3E13X 2UYEA 3D4GA 4QSCA 1TXFA 4NF5A 2H5YA 3M8UA 1N84A 1NNPA 1R6ZA 3KSXA 3OOAA 4OETA 5CMMA 5KDTB 5CI5A 2D5WA 1B46A 2Z8FA 3N26A 4MFIA 4NF5B 4U23A 4XXUA 4C0RA 5L9OA 1H45A 4KHZE 1O64A 5F1QA 4FAJA 4M4GA 2NUVA 1I6AA 2FA7A 1MM6A 4R73A 1WODA 2UVGA 1O63A 3MWBA 4GWOA 5AE4A 1CE2A 1SW2A 2V93A 1PB9A 3VE1B 3CRBA 4WXJA 4LA9A 5I84A 1VFEA 4PFUA 3G3HA 1B0HA 2UVIA 2V25A 5H8QA 5CBSA 3S9EA 2DVCA 3HHGA 4ECFA 3H6WA 1N04A 3M3LA 1SI1A 3RQTA 1N7XA 4OYVA 2XXTA 2XX8A 5AA2A 4NF6B 4U1OA 4GOTA 2PVUA 2RC9A 3BKIB 1B51A 4F3BA 1Z7ME 2DWIA 3KSJA 4ZE9A 1WVJA 2KLFA 5L8DA 1A99A 2PBWA 3CSBA 4KYSA 3TPAA 1D9YA 1FTOA 3FVGA 3SKPA 1MY3A 4KCCA 2HFBA 3Q27A 3K1MA 5A5XA 5ICTA 1B9JA 4K3FA 3EQ1A 4ZEIA 1MXVA 3LSWA 5I2NA 1VFDA 2Y84A 3E4RA 1B4HA 1MH4A 1POY1 2OBGA 3A3UA 3OEKA 2A5SA 3DP8A 3OENA 3OXNA 4MH5A 4X9TA 3UK4A 4E0XA 1MPCA 1ZMGA 3IR1A 3M3KA 3H3GA 1QW0A 3ONMA 4AB5A 4ELQA 5I56A 1B58A 2XXQA 1B5HA 4H67A 3L6GA 1D9VA 1SW5A 2UVHA 3T22A 3MPLA 3PUZE 4L17A 1MM7A 3SEYA 4RA1A 2AL5A 3R26A 4RYAA 4YU0A 2GHBA 3VLUA 3ODBA 1SW1A 3VXBA 4F29A 5I59A 1MG1A 2RKMA 3H4ZA 4R9GA 2ABHA 3BBRA 3C33A 3PV0E 3PPOA 4RK9A 1D3KA 1FQFA 3FXRA 5TU0A 1P1QA 1QKAA 3K0VA 1FQDA 3TQLA 2QSXA 3FD3A 1UTBA 2HAVA 3K01A 5JK4A 1XVXA 1B5IA 1M5EA 4UACA 3EPEA 1L5TA 4DLDA 1H3DA 1OIBA 3E3KA 1A40A 3K6XA 4HCYA 3WAFA 3QYTA 1P1NA 1MXUA 3OO8A 3S4UA 1MPDA 3LC8A 1MQGA 3IOVA 2QS4A 3IB0A 3KN7A 4AB6A 1I6BA 1H43A 3ZS6A 3K1NA 4YKPA 1MXWA 2ANJA 3QUJA 2A5TA 1PB7A 3T9XB 4F3SA 5CBRA 1ANFA 1B3GA 4DXUA 5ISUA 1UTBB 1A55A 4DCXA 3UA8A 1USYE 3V83A 4RXLA 2ZYMA 5F7VA 3UN6A 5AA2B 4EXKA 1MQIA 1ZLQA 3ZKKA 3B7DA 3E9XA 5K2YA 3MPKA 4IO6A 1A7LA 1ZJLA 3DLNA 2Z22A 3FJGA 3KBRA 3O66A 4FIMA 4POWA 5CRYA 1SW4A 3U8QA 1USYH 3A3CA 2Z8DA 1Y1MA 1ATGA 2PX1A 1II5A 2O51A 2OK2A 3G3GA 2H4IA 2OWSA 3MP6A 1RYXA 3N5LA 3PD9A 1GV8A 4F3PA 5AA3A 1I69A 2X7PA 3EHSA 3PUWE 4XKNA 2Q8JA 3TAJA 2VD2A 2QMWA 2ZNSA 3UIFA 2ONSA 1DOTA 1IIWA 1GGGA 3MVZA 1TFAA 1FQAA 2FNCA 3G7WA 1PDAA 4OFOA 3CG1A 1CB6A 4I8CA 4NF4B 1YAEA 3JYRA 3TDJA 4DZ1A 3MVXA 4F3GA 4NEDA 4NMYA 3UORA 4EQ7A 2I4BA 4DE8A 4OQOA 1N0TA 1P99A 1M5CA 2DYXA 2XX7A 3H6UA 3IAZA 4P0IA 5DTBA 1EZOA 2RCBA 3IJXB 3MZ9A 1D4NA 3FIRA 1EZPA 2I49A 3LR1A 1Y4TA 5K2XA 3M3FA 4YMBA 1LFIA 3TMGA 2Y7KA 4ZECA 4HCWA 2E0SA 2RINA 3IB2A 1LFHA 2F97A 4G68A 3EHUA 2ZYOA 1QJMA 2X7QA 2VP1A 3QIMA 4YKIA 3SEUA 3ILTB 2GFEA 3I3VA 1IXIA 3TCFA 3IORA 3SESA 4PQJA 2DE3A 2G93A 2F6GA 4ZS9A 1NMUA 3KOSA 3T9VA 3PUVE 4RJZA 4ISUA 4E0WA 2I3WA 3USDA 4OESA 3U94A 5FHNA 3OO7A 2CZLA 1ELJA 4N13A 4YB7A 4RK2A 1MH3A 4QFNA 4RPOA 4FATA 4IY6A 1JVYA 4LP2B 1S50A 5TP9B 3TCHA 4OVJA 5H8FA 2UXAA 3O6HA 3O29A 1DPEA 4U2RA 3T9HB 4EQ9A 4OEVA 4BLAA 3DP6A 2DQVA 5JTYA 3EF7A 4IO2A 2F35A 4F19A 1AL3A 3V8XB 5ITOA 2D3IA 3W15C 2D21A 3B6TA 3MZ1A 1SD3A 3UGWA 2F36A 1IZ1A 2XX9A 1Q1KA 1FW0A 1EH3A 3LUYA 4GXSB 1SDXA 4NF6A 4OHNA 2ZYNA 3IJOB 1JNFA 3HPIA 4I9DA 4OZ9A 4G68B 1SYIA 2X26A 2OZZA 3ILUB 4OERA 4G2ZA 5H8HB 4EDPA 3Q29A 3KFMA 2I4CA 2HEUA 1LSTA 3K00A 4NF8B 2Z23A 3H03A 1B40A 3K1PA 1NNTA 1Q35A 3K6WA 3OMBA 3TTMA 2DS9A 3VLWA 4LONB 4X1BA 2WKYA 1MXXA 1PEBA 3CIJA 3PU5A 5DVIA 4GF8A 1B3FA 3TYHA 4MLVA 1Y3NA 2F34A 1OQGA 3FV1A 4YB5A 3VVEA 2Q2AA 4O3AA 3IX1A 3FGSA 2DVZA 1N76A 2QL3A 1Y4CA 4NTLA 4GD5A 1T0KA 3OEMA 4KCDA 1B3HA 2O1LA 3JZJA 2H98A 4LATA 3RPWA 4GL8A 1B05A 1Y1ZA 2QPQA 2QS1A 3CFLA 3RT6B 2PT2A 1NKXA 2QJEA 3C36A 2THIA 4H5GA 2DOJA 1FQEA 1B0LA 1FTLA 2O84X 3L6HA 4H65A 4XKQA 3DELB 4JBZA 3SETA 1AH5A 4GRKA 4NE4A 3MAMA 3TELA 1ZU0A 3P7IA 4XTCQ 3KN3A 3PD8A 3PUXE 4IY5A 5TPAB 3KJTA 3MBPA 4ELOA 5I57B 4C1TA 4HS7A 4GXAA 1BKAA 1YTVA 2DWHA 3LBSA 3O6IA 1B3LA 2F8DA 3SEXA 1B7HA 4PFYA 4XIGQ 3RNNA 4XKPA 4FECA 4F1UA 1HSJA 3V5AA 1FQBA 4R75A 4ZDMA 2V3QA 4FORA 1GTKA 5KCJA 3K2DA 4LZ5A 1KWHA 1MQDA 3G3JA 1MDP1 1OQHA 3KN8A 1I6QA 3RLFE 3CR9A 5A5XB 2F7AA 2Y7RA 1MS7A 2VGQA 5JEIA 4YAHX 4OXVA 4QHQA 1DSNA 4ELPA 2XXHA 4KYDA 4BDOA 1RYOA 3I6VA 4ESWA 1POTA 4FEDA 5DEXA 1JW1A 1B3EA 2M8CA 4WEPA 2DE4A 1UQWA 4OTEA 4EF2A 1JEUA 2PT1A 1Y20A 3O9PA 2HZLA 2CMOA 2DXRA 3T66A 4U21A 3U93A 4IGRA 4ZEFA 3KG2A 2O7UA 2Q9TA 1VR5A 3K02A 4Q8RA 3HCQA 5H8HA 3TTNA 5L9MA 5FHMA 2VD3A 4F39A 3G3IA 2W7YA 3FV2A 3HSTA 4ELRA 3IB1A 4DIGA 4Z7EA 2F7CA 2R6GE 4ONYA 1B4ZA 4MBPA 3QUFA 3RGYA 3RTFB 1YPNA 2B65A 5I58A 1TT1A 1MQHA 4H5FA 4NWDA 3BFTA 3TFLA 3TTKA 3Q25A 3CG3A 3ECRA 4RPNA 3DM0A 1B1XA 3PMWA 1B1HA 3THIA 3FXQA 1UTHB 1QVSA 2QS2A 3KOTA 4GFRA 4EXLA 1YCJA 2REJA 3K6VA 4QFPA 2HZKA 5M2VA 4DDDA 3GZGA 2OLBA 2Q2CA 1PBQA 3C4MA 4LZ7A 4OENA 2I0BA 4BDNA 4F2QA 2G29A 1RKMA 4H8JA 3B6QA 4YKJA 1BP5A 1OVBA 4F1VA 2QS3A 4N07A 4YKKA 2O6AA 2DXYA 2HCAA 3SDFA 5H8NA 2V3TA 5ELVA 2ONKE 1M5DA 3TODA 1B5JA 3S2VA 4EF1A 4LQ2A 3RN8A 2OWTA 4KR5A 1LBCA 2I6EA 1BIYA 1US5A 1QUIA 3KEIA 1XHYA 4EUOA 5H8NB 3C32A 3GBBA 1FTMA 4KFQA 4EQBA 5H8QB 1LGBC 4TOZA 5BUUA 2XXVA 1LLSA 4YZZA 5CC2A 4OFLA 4LVQA 4R2FA 1DMBA 3O6GA 2I0CA 3TQWA 3RUMA 4JWXA 3CSGA 1UTHA 4GVOA 1MY2A 4G68C 4I1DA 3O2AA 1QUKA 3MZBA 2A5TB 3G3FA 1B7ZA 4PFWA 3RTWB 1PC3A 1F9BA 3FVKA 4PE5B 3B6WA 4QSEA 3BFUA 4TQUQ 4N6PA 5FHOA 4JSDA 3TZAA 1LCFA 2DWJA 2O7IA 2UVJA 2I3VA 5HPQA 2HQ0A 1AIVA 4R2BA 1H44A 4F2OA 1DTGA 3C31A 1IXHA 4U4XA 4YICA 2XXUA 3AXFA 1FCKA 3H06B 3MP1A 1ZKBA 4Q5TA 1N7WA 3G3KA 4R6YA 5DYHA 1Y3QA 1NNKA 1P1OA 4NWCA 3IK6B 3OELA 1A54A 1QULA 1IXCA 4GLIA 5I2KA 4GIZA 1LAFE 2Q89A 4IO3A 1JQFA 3HN0A 3MVWA 1SQYA 4DXBA 1B7UA 4YMAA 3N6UA 1SI0A 1NNFA 1BTJA 3KJ7A 4JSOA 2Y7IA 1QKBA 3C9HA 3SERA 1MQJA 1MRPA 4KI0E 3TCGA 5FTHA 3TTLA 4BDRA 3QXMA 1O7TA 4X1DA 3PPQA 3T9UA 5JTYB 1DPPA 1M5BA 3U92A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QFKA 2QRYA 2ZZWA 4ESXA 4QRZA 3SZPA 2YPNA 5EYGA 1JW4A 1Z7NE 2BJIA 4FJPA 3SEWA 2O69A 3IO4A 1JEVA 3C35A 3R7XA 3S9NC 5EHMA 1SYHA 3FATA 3O28A 3PMVA 5IKBA 2R8TA 2ESNA 4C1UA 1OVTA 4LQ5A 3MP8A 2DP8A 4ND9A 2XD3A 4O3BA 4ZEKA 3W9VA 1B52A 2O1MA 1FPDA 5TPAA 1EYJA 1IMEA 4QBAA 2DE2A 5H8FB 3UP9A 2H25A 5DVFA 4LN5A 1FBGA 2GHAA 4G4PA 1MPBA 2AL4A 2XXWA 2B3FA 4KYEA 2AIXA 2H99A 5ICQA 3MUQA 4IO4A 3PMXA 1PB8A 3K6UA 1MDQA 4PFRA 2OCUA 2DSFA 1MXYA 4R6HA 2RF1A 1MXZA 2ZNUA 4FBPA 5J16A 2DWAA 1XI6A 3HFUA 3Q28A 4P0GA 3EHTA 1J1NA 3F11A 4OVQA 1LBVA 4OVRA 2R9JA 3OO6A 4NF4A 1IUDA 4MJOA 5HBCA 4NF8A 2F6PA 1P1UA 2PYYA 4PFTA 3Q26A 3T93B 2XXKA 2Y7WA 1IMAA 5HM4B 2UYFA 1SVXB 3HV1A 3T96B 3ZSFA 2Z8FA 1K9ZA 3N26A 3QMFA 4KHZE 1O64A 5EQ8A 4FAJA 5I84A 3VE1B 4WXJA 4DI3D 4GX3A 2V25A 3S9EA 2DVCA 1N04A 1N7XA 2RC9A 2DWIA 3KSJA 3TPAA 1MY3A 4KCCA 4K3FA 3E4RA 1B4HA 3OXNA 4LZ7A 3OEKA 2A5SA 3M3KA 4N81A 4MEVA 2VPNA 3U65A 3L6GA 2UVHA 4EXLA 1AOVA 3R26A 3VLUA 3ODBA 1MG1A 3H4ZA 4RK9A 1FPGA 1FQFA 3FXRA 1QKAA 3FD3A 2P3VA 1B5IA 2ZZVA 3E3KA 3WAFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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