3KFMA

Crystal structure of the glua4 ligand-binding domain l651v mutant in complex with kainate
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTVDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRTTAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYTEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEAGVLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Enhanced efficacy without further cleft closure: reevaluating twist as a source of agonist efficacy in AMPA receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 4
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kfmA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kfmA02
3TCGA 3TKDA 2DWAA 1PB8A 3RT8A 3KN3A 1MRPA 5ICTA 2XXVA 4RJZA 3OD7A 4AB5A 4PFYA 5TPAA 2B65A 2HCAA 4KR5A 2CZLA 1NL5A 1N7XA 1ZBMA 4RPNA 5I56B 3K01A 5CMMA 5EHSA 3CRBA 4NF6A 3FGSA 3KN7A 1LAHE 4YKPA 4F19A 2Q9TA 2DVZA 5I58A 2FYIA 4L17A 4GF8A 1GTKA 2R9JA 4KQPA 4K3FA 1Y3QA 1FW0A 3C4MA 1LGBC 2I3WA 1BLFA 2OWTA 1P1WA 1QUKA 2O68A 1N7WA 4BDNA 1CE2A 3C32A 2XXUA 1MPDA 1MQHA 3EF7A 3MP8A 2Q89A 3ZKLA 3I6VA 1NNPA 3PPQA 2GFEA 2Z23A 1FQEA 1TFAA 2DQVA 1FTKA 1H3DA 1HSEA 3MPLA 1FTJA 1HSLA 4EQ7A 4IO4A 2I4BA 2O1MA 1LCFA 5I2KA 4GL8A 2D21A 1AIVA 5KZTA 4ZS9A 3T66A 1IQ7A 2IEEA 2NVUB 4HS7A 1XHYA 2Y84A 3VVFA 3P7IA 1JEVA 2CMOA 1ANFA 4ZEKA 3R7XA 3CFLA 4EUOA 3IB1A 2AIXA 4U1OA 3W9WA 1SW2A 1N04A 2Q2CA 3O6GA 2HAVA 4ELRA 1PDAA 1VE4A 5KCJA 3O29A 4F1VA 2AL5A 3LR1A 4G8NA 2LAOA 5F1QA 5JK4A 3B6QA 4OYVA 1M5FA 4OFJA 4MH5A 5CC2A 3RT6B 3CG3A 4LA9A 1NMUA 1SW4A 4E0WA 4Q5TA 3FVGA 2QS3A 3FUZA 2F7BA 1NFTA 2THIA 1FCKA 3CSGA 4TLMB 3K1MA 5AA4A 3SEWA 1B5HA 1Y4TA 3TCFA 1B1XA 3FJGA 3QUJA 3TAJA 2F35A 2I6EA 2D5WA 3TPAA 3C35A 1B32A 4DXBA 2O7IA 5JTYB 3PUYE 2M8CA 2ONKE 4OENA 4R6KA 1FQDA 4HTGA 1FTMA 4JWYA 4F31B 2H25A 4KI0E 1WDNA 2QL3A 4H5GA 4XTCQ 3U1OA 4R2FA 2Y7WA 5CMCA 3FZVA 3PMXA 2VOZA 3O66A 2RC8A 3FATA 3EN3A 2H4IA 2XXXA 2P2AA 3PUWE 1R9LA 1XVYA 3KN8A 4HCWA 3E13X 4R75A 3LSFB 3QSLA 2RKMA 1GVCA 3G3HA 4FE8A 4QRZA 4OETA 2ABHA 4G8MA 3B6WA 3H06B 4DDDA 3UA8A 2I0BA 2RINA 3MP1A 1D3KA 2DE4A 3QXMA 3K1PA 3PPPA 4X1BA 4GWOA 3ONMA 3FXQA 1US5A 1Q1KA 5DVJA 5I56A 2PX1A 3FV1A 5TP9B 4ELPA 1B3HA 2R71A 4PQJA 5ITPA 3IX1A 4H1XA 3T9HB 1USYE 2XXPA 1FQCA 4QSDA 1YAEA 3HHGA 3TYHA 3VV5A 3TFLA 5AA2A 3MVXA 1IIWA 1MM6A 3UP9A 3A09A 1QJMA 3T93B 1SDXA 5AA2D 3H4ZA 1MQIA 3CI8A 3IR1A 5I2KB 1A54A 3QUFA 3K6UA 5B7DA 4I62A 1MM7A 1Y3NA 4DE8A 4F2OA 3VDFA 4LQ2A 4LZ7A 1QW0A 2QMXA 4XKNA 4YMBA 3T9XB 2E1SA 3TTMA 1US4A 2RC7A 1B0LA 1LFHA 4U2RA 5H8SA 1Q35A 4DXUA 3N94A 4RYAA 4LATA 3TELA 1IUDA 4TLLB 4F18A 1Y3PA 3JZJA 2PVUA 5HM4B 2DSFA 1EU8A 3K0VA 1JQFA 4IGRA 1R9QA 5FHNA 3UORA 4UA8A 3I5OA 2ONSA 1UQWA 5K2XA 3SERA 1MDP1 1ZTYA 4P11A 5ELVA 4H8JA 3IOUA 4BDLA 1MH4A 1M5CA 3S9EA 1Y1MA 1LFIA 4QFLA 3PGFA 5EHMA 3U72A 1LBCA 2B3BA 4GFRA 3EPEA 3UN6A 3MZ9A 3BBRA 3F11A 1M5EA 3EQ1A 3B6TA 2NWJA 2H9BA 4Q8RA 1OLCA 3IB2A 1P1QA 1OMPA 1Y9UA 4OVJA 1PBPA 1ELJA 1LSTA 3OO7A 1S9TA 2O7UA 4GLIA 2ZNSA 3N26A 1ZIUA 3ODBA 3KFMA 2UVGA 1A8FA 3TUSA 1H43A 2B3FA 3T9VA 3ILUB 2V25A 4LQ5A 3T9UA 3V5AA 4XKPA 3IO4A 3ZSFA 3JV9A 1JW4A 2UVIA 5CBRA 4NF5A 3C33A 2Z8DA 2NOOA 3RTWB 1BTJA 1POTA 1UTHB 4U21A 1B4ZA 4BLAA 3JYRA 4FJPA 5AE4A 1OQHA 3MWBA 4LUBA 3MUQA 3IOVA 2H5YA 4NWCA 3MZ1A 3VLVA 2DWHA 2OJTA 1OIBA 1MQGA 4ZEIA 3Q28A 2D3IA 2I0CA 4I9DA 3CFXA 1IXGA 5AA1A 1B2HA 3FVNA 1VFEA 5AA2B 4YICA 4U23A 1S7YA 1WODA 4IY6A 1AMFA 3N6TA 5TP9A 1IXCA 1VSOA 2AL4A 4O3CA 4U4XA 4I1DA 1NNFA 4ZE9A 4IY5A 4Z0IA 3RLFE 3MVZA 2DYXA 3M3FA 3SESA 2PMSA 2RC9A 4H6DA 2R6GE 4GRKA 4OERA 1NNTA 4LZ8A 4OZ9A 1MXWA 2A5TB 4WEDA 1YCJA 3KZGA 3V89B 3VXCA 2AYSA 3M3LA 1OQGA 4POWA 1Y20A 1URSA 4RY1A 1H76A 3PUXE 3FXUA 3SETA 1B7HA 2O6AA 3CR9A 5I2NA 1JNFA 4FAJA 1I69A 2QSXA 1IXIA 1B7ZA 4ESWA 5L8DA 4F1YA 2I4CA 2KLFA 4LZ5A 1D9YA 5FHMA 4PE5B 5AA3A 4GQOA 3G3FA 3OSQA 2ZYNA 1AL3A 3S9MC 2OBGA 1LAXA 5KDTA 2V84A 1OVTA 3H6VA 2I49A 4X48A 3S4UA 3TTKA 2NUVA 2F7AA 1QKAA 4MLVA 4ZZAA 3RTFB 3K6XA 1A55A 1LAGE 2XD2A 1L5TA 1B52A 2ZYOA 4FEDA 3S9LC 3RNNA 1B6HA 4JB7A 4YU0A 4R2BA 1RKMA 4DZ1A 4NE4A 1BIYA 4KFQA 5FTIA 1T0KA 1B40A 4X1DA 4EDPA 1DMBA 2G93A 5H8QA 5H8FA 2VHAA 3RY3A 5DVIA 3FVOA 4U4SA 3KSXA 3KBRA 1OLAA 2DVCA 2QJEA 2P1SA 3Q29A 3AXFA 4NMYA 1N0TA 3IORA 3Q25A 2I3VA 4F3SA 1M5DA 3SEUA 2XXWA 2QMWA 5CRYA 2Y7KA 4XIGQ 3GXAA 1LB9A 2F8DA 3N6UA 2V3UA 4G2ZA 2ZXTA 4F3PA 5A5XB 4Q0CA 2OCUA 4XKRA 3VVDA 4O3BA 3PD9A 3TEPA 4RXLA 4F3GA 2QS2A 1MXUA 1PEBA 3FD3A 4THIA 2REGA 1Y4CA 3V83A 1FQFA 2O1LA 3UIFA 4NF5B 1N3XA 4POXA 4YB6A 3IJOB 2XXQA 4WEPA 2BJJX 3W15C 5CBSA 3U8QA 2VP1A 4LP2B 4KCCA 4N07A 2ONRA 1XS5A 2HXWA 3M3KA 4ISUA 1PBQA 4ECFA 3LBSA 2ZNUA 2XXIA 5DVFA 4OHNA 4EQ9A 1SYHA 4G77A 1EZOA 3PUVE 2XHDA 2GH9A 2UXAA 1UTHA 1NH7A 3EHSA 1DTZA 4PETA 4QSCA 3TTLA 2ANJA 4TQUQ 5ITOA 3WAEA 4PFUA 2OLBA 5I57A 3L6GA 4NWDA 4DCYA 3TQLA 3KJ7A 3C9HA 3PPRA 4LONB 1BKAA 4N6PA 4KCDA 1UTBB 5L9MA 4ZE8A 4ELOA 4YB5A 3O9PA 2A5SA 4OFOA 1O64A 2PT1A 1LLSA 3KEIA 5IKBA 3I3VA 1MXVA 2F6PA 3MAMA 3K02A 2ALUA 4KYDA 4PP0A 4R74A 1QULA 2H99A 2F6GA 4DIGA 2HAUA 4G8HA 5I2NB 1Y1ZA 1LAFE 4GD5A 3E4RA 3TZAA 4Z7EA 1EZPA 4G68A 4HW8A 3V8XB 1JETA 4IB2A 4OESA 1A8EA 2A5TA 3BFUA 4PFTA 2GHAA 4R9FA 2V3QA 4H5FA 3GLBA 3GBAA 1QUIA 2QS1A 1VFDA 3H6TA 3C31A 3HN0A 5KDTB 1XC1A 3R26A 1ATGA 2GRVA 4FEBA 3FV2A 4QF9A 3EHUA 3FVKA 1I6QA 2OK2A 1B4HA 2V3TA 2RCBA 1JW1A 3S9NC 3H7MA 5H8HA 3SEYA 2PT2A 4NF8A 3KOTA 3QYTA 4AQ4A 3OEMA 3C34A 5CMBA 3IJXB 2DXYA 5DEXB 3ILTB 5H8QB 5H8FB 1P1NA 4GXAA 1N84A 5F7VA 1ZJLA 3VLWA 3OO9A 1XOCA 1XVXA 3DM0A 1O63A 3IL1B 4YAHX 2XD3A 1CB6A 3RQTA 1N3WA 2Q8JA 1B9JA 3TCHA 4JSDA 4QFPA 1A7LA 4WXJA 5DT6A 1NH8A 4IO6A 4ONYA 3PV0E 4YZZA 4FIMA 4Q30B 1DOTA 1YTVA 2VD2A 2DE3A 4PFWA 3RPWA 1SI0A 2RCAA 2YPNA 3D4GA 4KHZE 1GR2A 4RA1A 1DPPA 2DWIA 4R73A 1GGGA 3SEVA 2VD3A 4QHQA 3PMVA 2XX8A 1F9BA 2XXHA 3UK4A 2VGQA 3GZGA 3HPIA 1IITA 4RPOA 5HPQA 1MDQA 5A5XA 1VR5A 3ZS6A 1FQAA 3LSWA 1Z7NE 4YMAA 5IAIA 3KG2A 2GHBA 4ZZEA 1MG1A 1LCTA 4HCYA 3WAFA 3UGWA 3Q27A 3O97A 4QFNA 4QSEA 2X7QA 2V93A 1USYH 4IO5A 1SI1A 3PD8A 1O7TA 3O2AA 4F39A 3DP4A 3O28A 4EXKA 1JEUA 4OFLA 5I57B 4U22A 3A3UA 4MBPA 3OO8A 1H45A 3VVEA 5B70A 1GV8A 3QK6A 5ISUA 1MY1A 2Z8EA 4WKMA 3OSRA 1MQDA 2UVHA 1ZMGA 3K6VA 3H03A 2DWJA 3DP8A 5ICQA 1ZKBA 2XXTA 4G4PA 2Z8FA 1IEJA 4OQOA 1MQJA 3ZKKA 4DXCA 1UTBA 3FJMA 3A3CA 5HBCA 4GL0A 3OMBA 3LSLA 1B7UA 2W7YA 4G68B 1TWYA 1ZU0A 1RYOA 3O6HA 3R6UA 4YB7A 4OWDA 3TDJA 4M4GA 1A99A 3TQWA 2O84X 4OMBA 3GBBA 4KYSA 1B58A 4R72A 3LC8A 4H8IA 5H8NA 1D4NA 1IXHA 4OTEA 1R6ZA 3Q26A 4JSOA 4F2QA 3E3KA 2DP8A 1ZLQA 4E0XA 3CFZA 3DP6A 1UIUA 2WKYA 5BWJA 1MXZA 4XKQA 2PBWA 1SQYA 2DS9A 1PB7A 3MBPA 3RGYA 4JWOA 3LUYA 4GOTA 2OWSA 2F78A 1QUJA 4KD5A 5H8HB 1B5JA 4NF8B 3DLNA 3IB0A 3KSJA 3IOWA 1SW5A 3FIRA 2ZNTA 4NF4A 2XX7A 4BDRA 1D9VA 4ZEDA 1MPBA 3FJ7A 2I48A 4YKIA 4EXLA 4RNSA 2F97A 1NKXA 5CI5A 4RK2A 1LBBA 3PPNA 2QS4A 3MVYA 4ELQA 2F5XA 1B3EA 4ZEFA 1N76A 5DEXA 3ECRA 1B5IA 5BUUA 4FORA 2YLNA 5JEIA 3KOSA 2DOJA 3G3GA 3CSBA 3SDFA 1SYIA 1AH5A 2G29A 3G3JA 1YPNA 3K2DA 1AOVA 4EF1A 4RK9A 4H0WA 1FTOA 2F7CA 3C36A 2YJPA 3M8UA 5L9SA 2UYEA 2O51A 1URGA 1I6AA 4OXVA 1B05A 1DPEA 4GVOA 2UVJA 4R6HA 1TXFA 3MPKA 3E9XA 1QVSA 1SVXB 4QFOA 3T22A 2I58A 1DSNA 1RYXA 5I84A 3HO7A 3BFTA 3LSXA 3OEKA 1J1NA 2NXOA 1Z7ME 3T96B 2HZKA 4OEUA 3L6HA 4C1TA 5LOMA 3VFJA 1MH3A 4EF2A 2HFBA 5J1DA 3HCQA 3KGCA 3RUMA 3VE1B 1B0HA 4JXIA 3MZBA 3THIA 4DLDA 4GXSB 3TMGA 5I59B 2E0SA 3K4UA 3U94A 3G3IA 3O6IA 1MS7A 1EH3A 4FECA 4TOZA 4YKJA 5M2VA 3W9VA 1FTLA 4ESXA 3PUZE 1P1UA 5K2YA 5TPAB 1MXXA 1JVXA 4M1VA 3KJTA 4NF6B 3G3KA 4ND9A 3HSTA 4ZEBA 2XX9A 3VLUA 1HSJA 1JW5A 2ZMBA 5FHOA 1I6BA 4IO3A 1P99A 3K6WA 5I58B 4BDMA 4R6YA 3HHFA 3HV1A 2F36A 3QIMA 1MY2A 3CIJA 4YKKA 3CG1A 4MFIA 4R9GA 2Y7RA 4NEDA 1IZ1A 4OEVA 2X7PA 3OENA 2OZZA 3USDA 3QAXA 4JBZA 2UYFA 5H8NB 4F3BA 3OELA 2XXRA 4F1UA 4IO2A 1XT8A 2FA7A 3BKIB 3PU5A 1H44A 5TU0A 3PPOA 5FTHA 2ZYMA 3SKPA 1POY1 1PC3A 3TTNA 1B3FA 2DE2A 3EHTA 4MF3A 4GIZA 4P0IA 1LB8A 4X9TA 1B46A 1B3GA 3B7DA 4JDFA 5CMKA 2Z22A 5L9OA 3IK6B 2Y7IA 5EYFA 1JVYA 1II5A 4UACA 4DCXA 1SBPA 4NF4B 4IGTA 1FQBA 2P0SA 3OO6A 1NNKA 2Q88A 3U92A 4FATA 3K00A 1S50A 4H67A 1WVJA 1PB9A 2PYYA 4H65A 3CVGA 5KCJB 4U1ZA 2QRYA 3N5LA 4ZDMA 2HQ0A 4LVQA 3H6WA 3G7WA 1DTGA 1MPCA 4F29A 3PMWA 1KWHA 4XXUA 3S2VA 3MP6A 1QKBA 3IOTA 2FNCA 2HZLA 3FXRA 1MXYA 1SD3A 1MY0A 4P0GA 4F22A 4AB6A 2HEUA 3H6UA 3TODA 1BP5A 3FASA 5AA4B 1MY4A 1URDA 2RF1A 3IO6A 5DYHA 2XXYA 1B1HA 1TFDA 3MJNA 5CM6A 1TT1A 3MC2A 4IO7A 4C1UA 1A40A 4ZECA 4C0RA 3VXBA 1R1NA 1P1OA 1UIVA 3K1NA 1B3LA 4MLQA 4G68C 4O3AA 2Y7PA 3SEXA 3OXNA 2H98A 1M5BA 4BDOA 4JWXA 3TTRA 3U93A 1B51A 4KYEA 4QFKA 5JTYA 1MY3A 3OOAA 5DTBA 2Q2AA 3MQ9A 2REJA 3D4CA 3MVWA 2DXRA 1SW1A 2F34A 1EZ9A 2IA4A 2ZYKA 4BDQA 4KPTA 3IAZA 4I8CA 1OVBA 3DELB 3MW0A 4N13A 2QPQA 2X26A 4NTLA 2ESNA 1LFGA 2O69A 4EQBA 3RN8A 3H3GA 5I59A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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