1SDXA

Crystal structure of the zinc saturated c-terminal half of bovine lactoferrin at 2.0 a resolution reveals two additional zinc binding sites
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transport protein
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Structure of the zinc-saturated C-terminal lobe of bovine lactoferrin at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
total genus 113
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-02-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sdxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sdxA02
4R72A 1N3XA 2DOJA 1IXGA 1ELJA 1PBQA 5IAIA 4ISUA 2H25A 1FW0A 1XC1A 1A8FA 4POXA 3WAFA 3QYTA 4GFRA 1FTOA 2RCAA 4IO5A 1QW0A 1DOTA 4DLDA 3K4UA 5KCJA 1TXFA 4LATA 4NF4B 5DT6A 4U22A 3A3CA 4NTLA 3USDA 3K01A 2PBWA 2CZLA 1NFTA 4KCDA 3RUMA 1NH8A 4OEUA 3PUXE 4FE8A 1BLFA 1JNFA 3K02A 2Z23A 1B32A 1IZ1A 2HXWA 2H5YA 5H8NB 3UA8A 3QIMA 3ILTB 4KYEA 1B0LA 2UYEA 4P0GA 4JWYA 1YAEA 4O3CA 3UGWA 3RT6B 4R75A 4XKNA 1B58A 2HZKA 3GBAA 2G93A 4YKPA 4YMAA 3JZJA 3G3IA 4R9FA 2UYFA 3KN7A 3SDFA 3FXUA 3D4CA 2IEEA 5DTBA 3VFJA 3E9XA 3O6GA 5KDTA 4U1ZA 3B6TA 3LSFB 3MWBA 5CMCA 4ELQA 3ILUB 1LCFA 3MZBA 4ZEBA 1GV8A 1AIVA 4ND9A 3GBBA 3VXBA 1JETA 1XHYA 4JWXA 2PT1A 1PDAA 1MQIA 5EYFA 4YMBA 2XXUA 4DXCA 4ZZEA 4IO7A 1R6ZA 4GXSB 2NXOA 3MVXA 5H8FA 1WODA 2NUVA 4BDNA 3SEWA 4R73A 2RINA 4RPNA 1PB7A 5CBRA 1MPDA 1B3HA 5I84A 2OJTA 3Q27A 5JEIA 4RXLA 4OETA 1OQGA 3WAEA 1JEUA 3M8UA 3OELA 3N6UA 3TKDA 3OO6A 4BDRA 1B2HA 3FASA 4I62A 2F7CA 3MVZA 3G3FA 2REJA 4PFUA 4RK9A 1MXYA 3M3LA 2DE2A 3TTMA 3O9PA 5J1DA 4LVQA 3KN3A 4GL8A 3Q29A 4G8HA 2XD2A 3E13X 5DEXA 4OESA 3TDJA 4F1UA 5CM6A 3TQLA 1QVSA 2GHBA 1JQFA 2I6EA 3SKPA 5K2YA 2NVUB 3G7WA 1XOCA 1VSOA 4ONYA 2F7AA 1POY1 4HS7A 2D21A 4H67A 3IJXB 5L9SA 5CRYA 2ZYMA 4ZDMA 5F7VA 3B7DA 3IO6A 4U21A 1PBPA 4P0IA 4LONB 1URGA 1Y20A 1B0HA 2I4CA 4DDDA 1OLAA 5CMMA 4F18A 3T9XB 1CE2A 1LAHE 3FUZA 4PFTA 1YPNA 4XKRA 1Z7ME 2DVZA 4GD5A 1Y4CA 5BWJA 2Y84A 3S9NC 1MM6A 3IB2A 2O6AA 1B7HA 1LLSA 4LQ5A 1QKAA 2I49A 3PPQA 1P1WA 2Q88A 1SW5A 3K00A 3O97A 3ZS6A 3UIFA 3QUJA 3CG3A 4JXIA 2Y7WA 2QMXA 3VLUA 3CSBA 5KZTA 1AH5A 4R6KA 4IO3A 1T0KA 3VLVA 2O1MA 3LSLA 1IQ7A 5BUUA 5KDTB 4NMYA 3Q26A 3MUQA 1FCKA 4OWDA 2I0BA 3TUSA 4NE4A 4GOTA 1Y3QA 4GL0A 3RLFE 2I4BA 4X1DA 3FGSA 3M3KA 3FV2A 3MBPA 3HN0A 4L17A 2QSXA 5EHMA 3U8QA 2Z8DA 5H8FB 1D9YA 2AIXA 5I2NB 3MP6A 4H8JA 3OOAA 4U4XA 2M8CA 3KEIA 3OO8A 1QKBA 1B9JA 3W9VA 3G3GA 1LAGE 2Y7PA 2RC7A 1DMBA 2WKYA 4BDLA 4TOZA 3AXFA 1XVYA 3KN8A 1JEVA 1FQCA 4WEPA 1S50A 1OVBA 4DIGA 2XXPA 1B5HA 2CMOA 1NNKA 2X7QA 3G3KA 4KFQA 2HEUA 2Y7IA 5DEXB 4EUOA 1MH3A 3A3UA 3O6IA 4LQ2A 4Q5TA 4Z0IA 4F3GA 1R9LA 5EHSA 4HCWA 5I58A 1A8EA 1N7WA 1SDXA 1B6HA 3RTFB 2V3UA 3CFXA 3T22A 3E4RA 1NL5A 2ZNUA 4F2OA 3R26A 1EU8A 1GVCA 1LSTA 3C34A 4EQ9A 3MZ9A 4RA1A 3I5OA 4EF1A 3THIA 4XIGQ 4OHNA 2Z8FA 2DYXA 4ESWA 3SEUA 1DSNA 1B05A 3R6UA 4XKQA 4H6DA 2O7IA 1MQGA 4YB7A 5FTIA 3C32A 3SESA 3U92A 1MQDA 3P7IA 4KQPA 3V5AA 3IO4A 4G4PA 1ZJLA 3KJTA 3O29A 1B52A 4YICA 1VFDA 4BDOA 1P1OA 2F78A 4NWDA 3S9LC 1MS7A 1B3GA 1SD3A 1ZMGA 4H0WA 5I56A 3N6TA 2AL5A 3FVNA 2PX1A 3W9WA 2PT2A 3N94A 3CIJA 5ITPA 2A5TA 3S2VA 1US4A 1SVXB 2YJPA 2F8DA 1SW1A 5TU0A 4E0WA 2XXIA 1RYXA 3KZGA 1A7LA 3SEXA 2YLNA 4ZEKA 3IAZA 3IX1A 2O69A 5ELVA 1ZTYA 4THIA 1MPBA 4NWCA 1I6QA 2RF1A 2O51A 2FNCA 1JVXA 3KOTA 1Y3PA 2ZYKA 4N07A 2QL3A 3N5LA 4LP2B 5AA4A 3T9HB 3QK6A 3K6VA 4RYAA 4F22A 1MG1A 3EPEA 3KOSA 2OLBA 3ZSFA 1EH3A 1N04A 5I58B 3OSQA 5IKBA 2P0SA 4EQ7A 3RN8A 2XXYA 1NH7A 4QSDA 4R74A 2VHAA 3TMGA 3CFLA 2F7BA 5FTHA 3IOTA 1B51A 3DLNA 4PP0A 3QXMA 1FQEA 3M3FA 4IGRA 4YU0A 4EQBA 4OFLA 3TFLA 3RY3A 2OCUA 3IORA 3DP6A 3B6WA 4NF6B 2X7PA 5I2NA 4XTCQ 4YZZA 5CI5A 1XS5A 2ABHA 1S9TA 5ICTA 4OFOA 2GH9A 3VDFA 4G77A 1TWYA 2PMSA 4YKJA 2ALUA 1B1XA 4KI0E 4C1TA 2HQ0A 1HSEA 3C35A 2OBGA 1M5BA 2O84X 3TCGA 1JVYA 4ZE9A 4EXKA 3K2DA 4X1BA 3O28A 4KR5A 4GF8A 1B7UA 1Q35A 3E3KA 2DWJA 3GZGA 4RJZA 1I6AA 4OQOA 5I56B 1F9BA 3C33A 2R6GE 1AOVA 4K3FA 1H45A 1MM7A 3MP8A 2D3IA 3IJOB 1HSLA 4LZ8A 1Y4TA 4AQ4A 2A5TB 3H03A 4C0RA 2VGQA 2Z8EA 3VVEA 5TP9B 5DVJA 4QSEA 4ELRA 3MZ1A 2V3QA 1O64A 2ZYOA 3PUZE 4WEDA 1MXVA 3H6VA 1B4HA 1B3FA 3OSRA 3TODA 4ZE8A 1H3DA 4FJPA 1SW4A 4YKKA 4QSCA 1POTA 3BFUA 2F6GA 3C31A 1FQDA 1FQFA 3PU5A 4PETA 4RNSA 4NF8A 3K6XA 1IEJA 3PD9A 4P11A 1P1UA 3H06B 3IR1A 5I59A 2REGA 3IOVA 4XKPA 1MH4A 3IL1B 1ATGA 2AL4A 2P2AA 3PGFA 4TQUQ 3ONMA 1PB8A 1HSJA 5AA4B 4G8MA 3U1OA 3SEYA 2IA4A 3MQ9A 3EN3A 3ZKLA 1WVJA 3IOUA 2R9JA 2DWAA 4G68A 4GRKA 2HAUA 1H43A 2OWSA 4KHZE 2OK2A 2O7UA 4R6HA 3R7XA 4Z7EA 5F1QA 1L5TA 3RTWB 4F1YA 5AA2D 1P1QA 3IB1A 5M2VA 2RCBA 1DPPA 5CMKA 5HBCA 3UP9A 1EZ9A 5H8HA 1FTKA 4DCYA 3CI8A 4UA8A 4DXBA 4PFYA 2QS2A 2RC8A 3CR9A 4F29A 1FQAA 1LAXA 4FORA 2Q2CA 1OQHA 3F11A 5B7DA 5DYHA 1IXCA 1D3KA 3KG2A 2DE3A 1OVTA 3JV9A 3Q25A 1SBPA 4U23A 2ANJA 3FVGA 4F3SA 3FJ7A 2HCAA 1O7TA 4ZZAA 3VXCA 1MXXA 2PVUA 3BKIB 3V8XB 2I48A 1XT8A 1II5A 1N76A 5ISUA 2V93A 3EQ1A 3K6UA 1LAFE 3FD3A 3VV5A 3CFZA 4X48A 1S7YA 4F1VA 5H8SA 1QUIA 2ONKE 4QFKA 1P99A 2GFEA 3PD8A 2F35A 2GHAA 2Q9TA 1LB9A 2XHDA 1PEBA 4MF3A 4IY5A 3K1MA 3FJMA 4F39A 2VOZA 5JTYB 2D5WA 3LSXA 2E1SA 4ZECA 3MW0A 4JWOA 2F5XA 3ZKKA 5FHOA 5I2KA 3I6VA 2XXWA 4MLVA 3LSWA 3PUVE 5A5XA 1JW5A 1Y9UA 2DWIA 1M5EA 3L6GA 3TCHA 1KWHA 4I9DA 2G29A 4RY1A 3EHUA 1BTJA 5AA3A 4IB2A 3TPAA 3OEMA 4G2ZA 1VR5A 3UN6A 4GVOA 3T93B 3HPIA 3VVDA 4WKMA 3TYHA 4NF5A 4U1OA 3S9MC 3U94A 3OMBA 1USYH 1YCJA 4ZS9A 4R9GA 3TELA 3O2AA 1MY0A 3ODBA 1AMFA 4GIZA 3G3HA 4N6PA 3DM0A 2DE4A 4NF6A 4DZ1A 5L9OA 2ZNSA 3FXQA 2XXHA 1NKXA 3TTKA 3FIRA 1FTMA 1ZIUA 4NF8B 3CRBA 4FEBA 1IXIA 3U72A 5I59B 3LBSA 3GXAA 1TFAA 1SI1A 3HV1A 1N3WA 1B7ZA 2P1SA 3I3VA 3K0VA 4WXJA 1B40A 4IGTA 4MH5A 4G68C 2VP1A 2UXAA 2Y7RA 4G68B 3ECRA 3TTRA 3LR1A 2O68A 4OEVA 4QF9A 4F3BA 2OZZA 2Q89A 4MBPA 3U93A 1MQHA 1WDNA 2VD2A 1LBBA 3MJNA 3TCFA 2NOOA 2X26A 4BDMA 1CB6A 5CMBA 2QS4A 5H8HB 1UQWA 4E0XA 3DELB 3FVKA 3MC2A 2V3TA 5TP9A 2H9BA 2B3BA 2Q8JA 4TLLB 4PQJA 1P1NA 2OWTA 4R6YA 4YKIA 3SEVA 2V84A 4OMBA 3EF7A 1A99A 3K6WA 4UACA 4HTGA 1EZOA 3CVGA 4QFOA 1R9QA 3KGCA 4NEDA 1B4ZA 4FEDA 1A40A 1MY2A 2ESNA 2YPNA 1LGBC 3L6HA 3H6WA 3GLBA 2GRVA 4GXAA 2XX9A 2R71A 3MP1A 2XX8A 1SI0A 2DP8A 4Q0CA 4MFIA 2HZLA 3JYRA 4LA9A 1MY3A 3EHSA 1QUJA 1OMPA 2UVIA 4FIMA 4HW8A 2I3VA 1JW4A 4GWOA 4AB5A 5LOMA 4LZ7A 2A5SA 5AA2A 2QS3A 1Y3NA 5I2KB 3PPNA 3CG1A 1OLCA 5A5XB 3FVOA 1A55A 2BJJX 2F6PA 3KJ7A 4HCYA 1PB9A 3MVWA 1URDA 3O66A 4BDQA 5AA1A 5L8DA 4FAJA 1IXHA 4EF2A 3H6TA 4NF5B 3KSXA 3C9HA 1RKMA 3RPWA 3S9EA 4H65A 3UK4A 2XXRA 4QFLA 3PV0E 1H44A 2I0CA 3PPPA 4JBZA 3K1NA 4RK2A 1JW1A 4X9TA 5H8QB 4U4SA 1FQBA 2ZYNA 5DVFA 2UVHA 4DCXA 1IUDA 2F36A 1VFEA 3OD7A 4IO2A 3VVFA 3MPLA 4C1UA 4YAHX 3PPOA 2QS1A 1N84A 2B3FA 3H3GA 5AE4A 3IK6B 3BFTA 1UTBA 3KFMA 5JTYA 1ZLQA 1AL3A 3HHGA 4QRZA 3H4ZA 4FATA 4Q30B 4GQOA 1FTLA 3N26A 3OO7A 3HCQA 4DE8A 4H8IA 3RGYA 2XD3A 2FA7A 3RNNA 3K1PA 1RYOA 5HPQA 2RKMA 4ECFA 4JB7A 3Q28A 1UTHA 1Y1ZA 1QUKA 2QRYA 3DP8A 4KYSA 4O3BA 3MVYA 4GLIA 4OENA 4AB6A 3QUFA 1MXUA 4H5FA 2XXVA 4IY6A 3C36A 1YTVA 3T9VA 1MPCA 1LFIA 1B46A 3B6QA 3T9UA 2W7YA 3FZVA 5FHNA 4DXUA 3V83A 4O3AA 3PMWA 5KCJB 1B1HA 5CBSA 1US5A 3W15C 4ESXA 1ANFA 1LFGA 3PPRA 4XXUA 3S4UA 1QULA 4OERA 1M5FA 1ZKBA 1IIWA 3RQTA 2DS9A 3EHTA 5K2XA 2PYYA 1USYE 1NNFA 5TPAA 2XX7A 3SERA 4FECA 3D4GA 5AA2B 1NNTA 4OXVA 1UIVA 3UORA 1B5IA 1DTZA 2ONRA 1H76A 2FYIA 2DXRA 3T66A 1Q1KA 4YB5A 3TQWA 3KBRA 4G8NA 3SETA 3LC8A 3FJGA 1R1NA 4U2RA 3PUWE 5I57A 1SYIA 3QAXA 4MLQA 3FV1A 4R2FA 4KCCA 2QPQA 1IITA 1BKAA 1I6BA 2DVCA 3T96B 1URSA 3TTNA 2DSFA 1SW2A 1MY1A 1MXWA 3C4MA 4ZEFA 1MDP1 1B3EA 2DWHA 2QMWA 2I58A 1FTJA 5ITOA 3TTLA 1NMUA 3PMVA 4Q8RA 3MAMA 4QFNA 4OYVA 2Q2AA 1DPEA 4H5GA 2UVGA 4LUBA 2XXXA 1Y1MA 1QJMA 4NF4A 1MY4A 2HFBA 1M5CA 2ZXTA 1MDQA 4YB6A 1I69A 4POWA 4OFJA 3IOWA 2I3WA 2B65A 4I8CA 4R2BA 3TZAA 1UTBB 1J1NA 2E0SA 4OZ9A 3LUYA 3CSGA 3OXNA 4M1VA 4JSDA 1VE4A 4KPTA 4QHQA 5H8NA 3FATA 3A09A 4M4GA 4I1DA 2VD3A 2XXTA 3RT8A 1BP5A 4KYDA 1M5DA 2XXQA 2H4IA 2UVJA 4QFPA 4IO4A 1B3LA 1D9VA 1BIYA 5CC2A 3H7MA 1N7XA 4F19A 2H99A 3QSLA 4OTEA 1UTHB 1DTGA 1EZPA 4RPOA 3H6UA 2ONSA 2NWJA 4KD5A 3HSTA 1B5JA 4ELOA 3OO9A 4ZEIA 3BBRA 4IO6A 1GGGA 4PE5B 3TEPA 3G3JA 4OVJA 4ZEDA 3MPKA 4F2QA 3FXRA 5H8QA 1N0TA 1TT1A 3KSJA 3PUYE 1A54A 3VLWA 4EDPA 1MQJA 3OENA 1ZBMA 2QJEA 3HHFA 4ELPA 4LZ5A 2V25A 1LBCA 1ZU0A 3TAJA 3OEKA 1XVXA 1NNPA 2KLFA 2O1LA 5B70A 3HO7A 2H98A 2ZMBA 1OIBA 5DVIA 2ZNTA 2Y7KA 2THIA 4JDFA 1MXZA 4TLMB 2AYSA 1LB8A 1Z7NE 1PC3A 5TPAB 2RC9A 1LCTA 4H1XA 5HM4B 5FHMA 1SYHA 1D4NA 4BLAA 4JSOA 1O63A 2F34A 5L9MA 1TFDA 2DQVA 4N13A 1MRPA 2F97A 2HAVA 1GR2A 3VE1B 2LAOA 3O6HA 1LFHA 1SQYA 5ICQA 3PMXA 3V89B 4EXLA 1GTKA 4F31B 5I57B 4F3PA 5JK4A 4PFWA 2DXYA 2Z22A 3IB0A 1UIUA 3DP4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3WAEA 1JEUA 3M8UA 3OELA 3N6UA 3TKDA 3OO6A 2HPGA 4BDRA 1B2HA 3FASA 4I62A 1NV6A 2F7CA 3MVZA 3G3FA 2REJA 4PFUA 4MNPA 4RK9A 1MXYA 3M3LA 2DE2A 3TTMA 3O9PA 5J1DA 4LVQA 1KA0A 3KN3A 4GL8A 3Q29A 4G8HA 4N17A 2XD2A 3E13X 5DEXA 4OESA 3TDJA 4F1UA 5CM6A 3TQLA 1QVSA 2GHBA 1JQFA 2I6EA 3SKPA 2L5VA 5K2YA 2NVUB 3G7WA 1XOCA 2Q74A 1VSOA 4ONYA 2F7AA 1POY1 4HS7A 2D21A 4H67A 3IJXB 5L9SA 5CRYA 3LUZA 2CZKA 2ZYMA 4ZDMA 5F7VA 3B7DA 3IO6A 3ROJA 1AWBA 4U21A 1PBPA 4P0IA 4LONB 1URGA 1FBPA 1NI9A 1SPIA 1Y20A 1B0HA 2I4CA 4DDDA 4PFRA 1OLAA 5CMMA 4F18A 3T9XB 1CE2A 1LAHE 3FUZA 4PFTA 1YPNA 4XKRA 2FBPA 1Z7ME 2DVZA 4MEVA 4GD5A 4DI3D 1Y4CA 1NV4A 5BWJA 2Y84A 2QVVA 3S9NC 1MM6A 3IB2A 2O6AA 1B7HA 1LLSA 4LQ5A 1QKAA 3QMFA 2I49A 3PPQA 1P1WA 2Q88A 1SW5A 3K00A 3O97A 3ZS6A 3UIFA 3QUJA 3CG3A 4JXIA 2Y7WA 2QMXA 3VLUA 3CSBA 1DBZA 5KZTA 1AH5A 4R6KA 4IO3A 1T0KA 3VLVA 2QVRA 4I40A 2O1MA 3LSLA 1IQ7A 1IMBA 5BUUA 5KDTB 4NMYA 3Q26A 3MUQA 1FCKA 4OWDA 2I0BA 3TUSA 4MJOA 4NE4A 4GOTA 1Y3QA 4GL0A 3RLFE 2I4BA 4X1DA 4GWUA 3FGSA 4OVTA 3M3KA 3FV2A 3MBPA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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