3O6HA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A novel series of positive modulators of the AMPA receptor: structure-based lead optimization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 261
sequence length 261
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o6hA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o6hA02
4EF1A 1JW5A 1S50A 3QUFA 4L17A 3MUQA 5TPAB 4NF4B 5B7DA 5AA2A 3TKDA 4TLMB 4DZ1A 1Q1KA 1LFHA 1D4NA 1B05A 4BLAA 2F6PA 1B7HA 3DELB 3C31A 3OELA 5AA2B 1NFTA 3H4ZA 2FYIA 1A7LA 4DCXA 3IAZA 3MVXA 2O68A 4IO3A 1LGBC 3IOWA 1FQDA 5JTYA 4XKRA 3O66A 3U72A 1P1UA 2ONSA 3SEUA 4UACA 4KHZE 4BDMA 5FTHA 3UGWA 4YB6A 3JYRA 3VVEA 4R6HA 4JDFA 3SESA 1P1NA 5JTYB 3KOSA 3OMBA 4LONB 3EHTA 4F1UA 3OXNA 1R9QA 2VHAA 1DOTA 1TFAA 1A99A 1TFDA 4N07A 2A5SA 2XXHA 4UA8A 4ZE9A 3EHUA 4R6KA 3HV1A 3I6VA 3C9HA 1BTJA 2ESNA 3OO7A 3TCHA 1Y4CA 4YMBA 5ITOA 3H03A 3OSRA 4U1ZA 1NKXA 3RNNA 1MXUA 2VGQA 3K1PA 1I69A 4NE4A 4Q30B 2HZKA 4MF3A 2QRYA 3MC2A 4OHNA 4GXSB 3UORA 2I58A 4AB5A 3QUJA 2QS4A 4C0RA 2XX9A 3QIMA 1IXGA 2HCAA 3MZ9A 2ZYKA 5K2YA 2DP8A 1GTKA 3T9XB 3ZKKA 3IL1B 5CMMA 2DQVA 3OO8A 5H8SA 1CE2A 4XKPA 3SETA 4KFQA 3HPIA 4XKQA 4R2FA 3FV1A 2GRVA 3CRBA 3GLBA 3H6UA 1WVJA 4R72A 1MY1A 4GVOA 3U93A 3CIJA 1Y3QA 3IJOB 3CR9A 3TTKA 4OFOA 4F2OA 4LZ5A 3FJMA 1D3KA 3G3HA 2I0BA 3RT6B 2P0SA 3UA8A 4R74A 2XXUA 4QFLA 3IOTA 4E0WA 4KD5A 3LSWA 3U1OA 3GBAA 1N0TA 4H0WA 3N5LA 1B3GA 1NNKA 1DMBA 4GL0A 3EPEA 2D21A 1MPDA 2XXTA 3LSLA 2QPQA 4RK2A 4EXKA 2F8DA 3D4GA 3TQWA 3HHGA 3AXFA 2YJPA 3PUWE 4G8HA 4KCDA 3TTMA 2I0CA 2REJA 4OETA 4OQOA 1I6AA 1WODA 3FUZA 4XIGQ 1B0HA 1N3WA 1ZLQA 2DVCA 4WEDA 2I48A 5HM4B 3HO7A 4N13A 3H7MA 1LAFE 3N26A 1IEJA 1XS5A 2Q9TA 3TMGA 2ZNSA 1WDNA 3KJTA 5CBSA 3TTNA 2V93A 4WKMA 3K6UA 2Y7RA 4ESWA 1TWYA 4YKJA 5AA2D 4IO6A 4TLLB 2FA7A 3H6VA 2HQ0A 4GRKA 2NUVA 3K6XA 1CB6A 1YTVA 4G68C 3PMVA 4HW8A 2F36A 4BDNA 4ND9A 1P99A 4ELQA 4LUBA 1Y20A 3KBRA 1JEVA 5BUUA 3FXQA 4KYDA 5H8NA 5CBRA 1H76A 2GHBA 5L9OA 1POY1 2I3WA 1MH4A 1S7YA 1A8EA 2OCUA 3RGYA 4ZEBA 3PD8A 2UVJA 1XOCA 3HSTA 3A09A 2UVGA 2ZNTA 3FJGA 3ODBA 1IIWA 5H8NB 4FEDA 4O3AA 3QSLA 3OEKA 1FW0A 2ANJA 3LBSA 2Y84A 1MQIA 3KN8A 1ZIUA 2CZLA 4YKPA 1QVSA 1PB8A 1UQWA 4I9DA 1SD3A 5B70A 5IKBA 4EF2A 2DE2A 5JK4A 2Q2CA 4TOZA 2BJJX 1HSJA 1Z7ME 3EF7A 3U94A 3T22A 3Q26A 5ELVA 2R71A 3V5AA 1H43A 1IITA 3MVZA 4O3CA 1QW0A 4NF8A 3SEXA 4R73A 4FAJA 2I3VA 1N3XA 3E13X 3H6TA 3IX1A 3PV0E 3OOAA 3B6TA 3MP1A 1DPEA 5CMKA 4EQ7A 5AE4A 1DPPA 4RPNA 3CVGA 3L6HA 1PBQA 3GBBA 3KEIA 4FJPA 1NNFA 4NF8B 5EYFA 1MY3A 4Z0IA 2V3TA 4F3GA 1OMPA 2D3IA 3G3JA 5I56A 5KZTA 3E4RA 3P7IA 1JVYA 4NTLA 2X26A 4U21A 4IB2A 5A5XA 2ALUA 4ISUA 2DWJA 5EHMA 3RN8A 3PMWA 4F2QA 2ZYMA 1FQEA 4M4GA 1NL5A 1SVXB 1MQGA 5I56B 3ZSFA 3T9VA 4C1TA 1Q35A 2DWHA 4G68A 1B3FA 3T93B 3O2AA 5A5XB 2RC8A 4P0IA 1BIYA 4HTGA 2VD3A 1DSNA 2DSFA 1T0KA 1LAHE 2H5YA 1A40A 4G68B 4P0GA 4RA1A 1D9VA 1JW1A 3KN7A 2OK2A 4JSOA 2D5WA 1QUJA 2XHDA 4OWDA 3V8XB 4EQ9A 3O6IA 5CMBA 2B3BA 2HZLA 1UIUA 3E3KA 1O63A 3IK6B 1MPCA 3TZAA 2UVHA 2P1SA 4GFRA 2PT2A 1B51A 3SEVA 3IOUA 1XVXA 1FTKA 2DXRA 3O6HA 1GGGA 3HN0A 2XXPA 3WAEA 5JEIA 1PC3A 3C33A 2ZNUA 4JWOA 1IXIA 3MP8A 5H8HA 1ZJLA 4WXJA 3VLWA 4PFTA 2OLBA 1BLFA 2XD2A 4F19A 1TT1A 4RNSA 3Q29A 1MXYA 3K2DA 2IA4A 4IY5A 3H3GA 4XKNA 4H5GA 1XVYA 1I6BA 1ZU0A 4H6DA 5H8HB 1XC1A 2RC7A 4X9TA 3FGSA 3B6QA 4YMAA 3FD3A 3TYHA 2HFBA 1RYXA 4N6PA 3K02A 1LCTA 1ELJA 4LA9A 3N94A 1VSOA 2H9BA 4KR5A 2AL5A 1LAXA 4G4PA 2XX8A 3MVYA 2I49A 3QK6A 3C32A 4YKKA 5ICTA 4R9FA 4QF9A 4IO7A 2QMXA 3RY3A 1IXCA 4R2BA 1QKAA 4E0XA 3T9UA 4EUOA 4H65A 1FQBA 3TFLA 5DTBA 2ONRA 4XTCQ 1QULA 1AL3A 4ZZEA 1PDAA 1AIVA 1YAEA 2NXOA 5BWJA 4AQ4A 3I3VA 1XT8A 2KLFA 4X1DA 4QFOA 4RPOA 1HSLA 5K2XA 2CMOA 4ZE8A 3EHSA 4JB7A 5KDTA 1N7WA 5TP9B 1MY4A 3G7WA 1LBBA 3MP6A 4JWYA 3U92A 1IQ7A 4LP2B 1M5DA 3KGCA 4KPTA 5I2NA 3V83A 3PUXE 2XXYA 5FHOA 1Y3PA 2XXXA 5KDTB 2E1SA 1SW4A 3O29A 1VFDA 3RQTA 4OESA 4RY1A 1MG1A 3UP9A 5I2NB 2OBGA 1OVBA 1FTJA 5ISUA 1VE4A 2RF1A 5I57A 3QYTA 1B4HA 3USDA 1H45A 1SW5A 2G93A 4QFNA 1GV8A 1B7UA 3OENA 1FTLA 4QFKA 1S9TA 1URGA 3LSXA 1PBPA 3O6GA 2F6GA 2Z8DA 3LC8A 3FASA 3PU5A 4YZZA 3KG2A 4IGTA 4PFUA 4PETA 4ONYA 5FHMA 5I57B 5DVFA 1B3EA 1O64A 1URSA 2M8CA 1PB7A 1MM6A 1HSEA 1DTGA 3BFUA 2ZYNA 2GHAA 4G8MA 3GXAA 2UVIA 2V3UA 1TXFA 3FXUA 1OQGA 1M5BA 4F18A 3QXMA 2VP1A 2QS2A 3MBPA 4OVJA 2O1MA 2NVUB 3CFZA 4EDPA 2Z8EA 3PUYE 4ZS9A 3RPWA 3DP6A 3O28A 4ZEIA 1MS7A 3VVFA 2DE3A 4OEVA 3GZGA 1SW2A 4KYEA 3IO4A 3PUVE 2DWAA 1QUKA 4YB7A 3C36A 3R6UA 2DE4A 5F1QA 2XXIA 5CRYA 2UXAA 1VFEA 2HAUA 3TODA 1B2HA 1IZ1A 2REGA 2AYSA 2PYYA 3ILUB 3ZKLA 3O97A 3KSXA 2FNCA 2F7CA 3KZGA 4M1VA 5F7VA 1M5FA 1LFIA 4NWCA 2QSXA 3IB1A 4F29A 1Y1ZA 4F3BA 2UYFA 3T66A 3PGFA 3TEPA 1PB9A 1N76A 2YLNA 3PUZE 3VE1B 1B1XA 3BBRA 1LB8A 1BP5A 1MM7A 4YU0A 5CI5A 1Z7NE 2DYXA 1I6QA 4RYAA 4BDRA 4ELOA 1JNFA 4LZ8A 4FIMA 1B3LA 1B46A 4JBZA 4ELRA 4I62A 4NEDA 3LR1A 3FVNA 4POWA 4F22A 2Y7PA 2I4CA 2Y7KA 3PD9A 4GXAA 1SI0A 3MPLA 1P1OA 4F1VA 2OWTA 1LB9A 4NMYA 2UYEA 2GH9A 3ONMA 1N04A 3LUYA 4NF5A 2PX1A 2Z23A 1SDXA 4QHQA 3K1NA 4U4SA 3G3KA 4OERA 3IOVA 3IJXB 2O69A 1ZTYA 2B65A 3W9VA 4OTEA 4NF5B 4I1DA 4G77A 3WAFA 3THIA 3S4UA 1LAGE 3O9PA 3G3FA 4ZDMA 3UK4A 4OMBA 1SYHA 1JETA 2H25A 4MLQA 1MH3A 1SYIA 3IB0A 1B58A 2AL4A 3IB2A 3M3FA 4NF6A 1UTHA 3K0VA 3D4CA 2ABHA 3FJ7A 4U1OA 2PT1A 2O7IA 1PEBA 4MLVA 1MQHA 4XXUA 1SQYA 2QMWA 3G3IA 4BDQA 4NF6B 3VXCA 3CSBA 1UTHB 3TUSA 3QAXA 3EN3A 3K6VA 3JZJA 3L6GA 1N84A 1EZ9A 4G2ZA 4YKIA 2XXQA 4H8JA 1MPBA 1IXHA 1FQCA 3IO6A 3DP4A 2Q2AA 4JWXA 4EXLA 1JW4A 2F5XA 3SEYA 4HCYA 2O7UA 4MBPA 4H67A 4FE8A 3PPOA 5DT6A 3G3GA 4GWOA 5FHNA 4ELPA 1B5HA 3E9XA 3SKPA 2QJEA 3FIRA 2AIXA 2Y7WA 4LZ7A 4THIA 3S9EA 3TAJA 4RJZA 5KCJA 1Y9UA 3DM0A 2OJTA 2QS3A 1ZMGA 1L5TA 2QS1A 3UIFA 2Z22A 4OYVA 4DXUA 3FXRA 4PFWA 4ECFA 4GL8A 1JEUA 3A3CA 5KCJB 1NH7A 4GQOA 3BFTA 3VFJA 1M5CA 4IY6A 2NWJA 3PPNA 3Q28A 1FQFA 1AMFA 3FV2A 1MXZA 1POTA 3TPAA 2RCBA 2X7QA 3KOTA 1A55A 2F7AA 1D9YA 3RTFB 3MW0A 4KI0E 2DWIA 4JSDA 2HEUA 1US5A 3MZBA 1MRPA 3R7XA 1B1HA 3KSJA 2PBWA 4LATA 3K1MA 4DLDA 4U22A 5ICQA 4NWDA 5I2KA 1FCKA 4GLIA 3H6WA 4Q5TA 3SDFA 4OFJA 3FVKA 1NNTA 2G29A 1OLAA 1B52A 3IR1A 1FTMA 4DIGA 2H99A 3VLVA 5I58A 1EU8A 1B40A 4DDDA 2A5TA 4OFLA 5I2KB 5L9MA 5TP9A 5I84A 4GF8A 3OO6A 1H44A 5AA3A 3CG1A 1OIBA 4AB6A 3TQLA 2RCAA 2DOJA 4BDOA 1URDA 5I58B 2A5TB 3HCQA 3VXBA 1UTBA 4IGRA 3S9LC 1ANFA 3N6UA 4ZZAA 3KFMA 4OXVA 2F35A 5HPQA 4LQ2A 3ECRA 4C1UA 2F34A 1RYOA 3UN6A 2V84A 1YCJA 4ZEKA 1B6HA 4Z7EA 2H4IA 2PVUA 3HHFA 3R26A 1H3DA 2YPNA 1UIVA 1UTBB 4FEBA 3PMXA 1MY0A 5L8DA 3VLUA 1ATGA 3FVGA 3Q25A 3C4MA 4OENA 4X48A 2IEEA 1IUDA 3M8UA 1O7TA 1SBPA 2I6EA 2Q89A 1B32A 4WEPA 2Q8JA 1ZKBA 4EQBA 1A54A 1LFGA 5ITPA 3V89B 4QSCA 1FQAA 5H8FA 1QKBA 1Y4TA 3PPQA 3OD7A 2PMSA 2VD2A 1KWHA 1R9LA 4LVQA 1AOVA 4YICA 2V25A 1US4A 1Y1MA 3OEMA 4IO5A 4F3SA 5CMCA 3I5OA 1OVTA 4FECA 5H8FB 2DXYA 4R9GA 5IAIA 4RK9A 3TTLA 1B5IA 3VVDA 4QRZA 2X7PA 1USYH 1QJMA 2WKYA 3MZ1A 4FORA 1A8FA 2F97A 3W9WA 1YPNA 3T9HB 2XXRA 2O84X 2OWSA 1N7XA 1SI1A 4ZEFA 4PFYA 4KYSA 1NMUA 4POXA 5AA1A 3C35A 1R6ZA 4F1YA 3SEWA 2W7YA 4ZECA 1LSTA 1Y3NA 3B7DA 4Q8RA 2XXWA 1B9JA 5LOMA 3JV9A 3MJNA 3K00A 1MQDA 4ESXA 4GIZA 4KCCA 2O6AA 2O1LA 4IO2A 4TQUQ 4HCWA 3CSGA 1F9BA 4LQ5A 5FTIA 1P1QA 3K6WA 2RC9A 3PPPA 3H06B 1MXWA 2XX7A 3S2VA 3S9MC 2F78A 4X1BA 5AA4A 3B6WA 3CI8A 3VDFA 4FATA 1USYE 3PPRA 1B7ZA 4F39A 3BKIB 2V3QA 3F11A 1MQJA 2Q88A 4G8NA 3KN3A 4Q0CA 3U8QA 3RTWB 4GD5A 4P11A 4PQJA 3SERA 3S9NC 5AA4B 1MXXA 1GVCA 3LSFB 3FVOA 3Q27A 4MH5A 2F7BA 4PE5B 3FATA 3DP8A 4ZEDA 4DCYA 2H98A 5HBCA 5EHSA 2NOOA 1FTOA 3CG3A 4F31B 1MY2A 1EZOA 3M3KA 4O3BA 5DEXA 2DS9A 3DLNA 4OZ9A 1II5A 2I4BA 5J1DA 3OO9A 3MPKA 3EQ1A 2B3FA 4IO4A 1LBCA 3CFLA 2HAVA 3W15C 1NNPA 4QSDA 4KQPA 2ONKE 3RLFE 5DEXB 1MXVA 5CM6A 4HS7A 1VR5A 3T96B 3CFXA 1OQHA 3TTRA 4YB5A 5H8QA 5TU0A 3C34A 4I8CA 2HXWA 1R1NA 2ZMBA 4H5FA 2ZYOA 4JXIA 3N6TA 3VV5A 4U4XA 4DXCA 3TCGA 1SW1A 1B0LA 3RUMA 1OLCA 1EH3A 1DTZA 5CC2A 2Z8FA 4K3FA 5H8QB 5DYHA 4U23A 4F3PA 5I59A 3MWBA 4BDLA 4DE8A 1M5EA 2O51A 3ILTB 3RT8A 3K01A 4U2RA 3MVWA 2XD3A 3MAMA 3TCFA 2P2AA 4RXLA 1JQFA 2LAOA 3A3UA 2R9JA 1B5JA 5DVJA 3TDJA 5I59B 2XXVA 1P1WA 1JVXA 4GOTA 3TELA 1J1NA 2R6GE 1BKAA 1B4ZA 1LLSA 1MDQA 1ZBMA 4QFPA 2THIA 2RKMA 5L9SA 2GFEA 5DVIA 2E0SA 1MDP1 4R75A 4R6YA 4DXBA 3FZVA 4OEUA 1QUIA 3MQ9A 4MFIA 3OSQA 3KJ7A 4PP0A 1LCFA 1GR2A 3ZS6A 3K4UA 3M3LA 1XHYA 4QSEA 1B3HA 2Y7IA 5TPAA 1EZPA 1AH5A 4NF4A 1NH8A 2OZZA 2QL3A 3IORA 4H1XA 2DVZA 5M2VA 4H8IA 4YAHX 1RKMA 2RINA 2VOZA 2ZXTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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