3O6HA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
b'ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title A novel series of positive modulators of the AMPA receptor: structure-based lead optimization.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 84
structure length 261
sequence length 261
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o6hA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o6hA02
3M3FA 2VD2A 3S9LC 4UACA 4RYAA 1MY2A 2DE4A 2A5TB 1M5CA 4JSOA 4Z7EA 3G3GA 4QFPA 1B3FA 1GV8A 3PMVA 4OEVA 4F39A 1LFIA 4FATA 1MPBA 3K6VA 3USDA 1IXCA 4IGTA 2X26A 4YMAA 3QAXA 3TQWA 3W9VA 2V25A 4BDOA 3MP6A 2GHAA 2ZYMA 5I2NA 1YCJA 3VVEA 1F9BA 4NWDA 3TTMA 5DT6A 3CG3A 3KSXA 1MY3A 1B3HA 4TOZA 4KYEA 2HQ0A 4G68C 3K01A 3RLFE 3ZSFA 4F1VA 1NL5A 4E0WA 3FVGA 1MXWA 3H6WA 2NOOA 3SEXA 1BLFA 3S9EA 4KPTA 4LZ7A 4Q8RA 4KR5A 1XT8A 5BWJA 3DLNA 4IY5A 5FHOA 2R9JA 4RA1A 5ELVA 3TKDA 3S9MC 4M1VA 3FXQA 1US5A 3SDFA 5EHSA 1NNPA 1HSEA 4EF2A 4ZE8A 3KGCA 4OQOA 3VXCA 1UIVA 1B46A 1NH8A 5CC2A 4DLDA 2Z23A 1P1OA 3CG1A 4O3BA 4ZEIA 3IO6A 4I62A 3IOTA 3LSWA 1NKXA 2Y7WA 4GVOA 1OLCA 3R6UA 2GHBA 2QRYA 5H8SA 1B2HA 4R9FA 5JEIA 2XXRA 3P7IA 4P0GA 3PUZE 5JTYB 3GZGA 3KEIA 2Z8FA 3T9XB 1YTVA 1MPCA 3H03A 4F2OA 2DOJA 3ECRA 3HN0A 1DTGA 3RTWB 4FJPA 4U21A 5H8QA 2GH9A 4ZEKA 3IK6B 3HV1A 3RTFB 2G93A 4G68B 4XKRA 1UTHA 1R1NA 5FTIA 3RY3A 3FZVA 3OO6A 5I57A 4G8NA 5HBCA 4R74A 5ICTA 1S7YA 3OMBA 3KJ7A 3BBRA 2F7BA 5CBRA 3H06B 2OK2A 4PE5B 4TLMB 3CFXA 4FECA 4F3GA 2O7IA 4U2RA 1JEUA 1N3WA 4GRKA 5IAIA 2F8DA 4ND9A 3ZKKA 1Z7ME 4DCXA 1OLAA 1S9TA 1N84A 3E3KA 1H76A 1D4NA 2HAUA 1FTLA 4MFIA 4K3FA 1Y3NA 4H67A 5AA3A 3PMXA 1FQDA 4XIGQ 4YAHX 4YB7A 2Y7IA 3G3JA 2O68A 4DXCA 1POTA 2NVUB 5I2NB 1N04A 4ELRA 3G7WA 1LSTA 2RC7A 3HO7A 4ZS9A 2ESNA 2F7AA 3RGYA 2AL4A 3QXMA 2DE2A 2QS3A 1MG1A 1MPDA 2VOZA 1QULA 3R26A 3RQTA 4GLIA 4OVJA 2WKYA 1B51A 2YJPA 2PYYA 3MPKA 3GLBA 3K1PA 4C1TA 4R9GA 4OFLA 4PFWA 4G4PA 1Z7NE 2ONRA 1AH5A 4OWDA 1DPEA 1SW1A 3N6TA 3H6VA 3JV9A 3ONMA 3ZS6A 4HW8A 3I5OA 4O3CA 3FJGA 3UGWA 1MQHA 3MZ9A 4X1DA 5DVIA 2ABHA 3DP4A 3QYTA 5TU0A 2P1SA 1ZKBA 4U1ZA 4FORA 1LB9A 1OQGA 4ELPA 5J1DA 2UVIA 2PVUA 1SBPA 2RKMA 2QS1A 3K0VA 2DS9A 5DYHA 4O3AA 3FXRA 3ODBA 2YPNA 2NXOA 1Y1MA 1SW4A 1ZIUA 3B6QA 3BFTA 1ANFA 3LSFB 4LP2B 3O66A 1WDNA 1USYH 3V89B 4XKPA 2QS4A 1PB8A 1PC3A 4LONB 2D3IA 3U93A 1EZ9A 1SW2A 1N7XA 5I59A 1VFDA 3IOWA 3T96B 3A09A 5H8QB 2Z8DA 2H98A 1H43A 1CB6A 2ZYOA 4YKIA 3ILUB 4G8HA 3H4ZA 3N26A 4FIMA 5B7DA 3PV0E 1II5A 3TELA 1IUDA 1MS7A 4GL8A 4LZ5A 1A40A 5AA2A 1H44A 1OVTA 1B3GA 1P1QA 2O1MA 1TXFA 3DELB 5I57B 1QUKA 5K2YA 1RYXA 2GRVA 2QL3A 2Q89A 1POY1 2X7QA 3TCFA 3G3IA 4YKKA 1B1XA 3MP1A 1UIUA 1N3XA 3C9HA 2V93A 2D5WA 4G77A 2B3BA 3KJTA 3TMGA 5DTBA 3IORA 3C33A 3K6WA 1DSNA 1Y4CA 4RK9A 2ZYNA 1US4A 1FW0A 4ESWA 1Y3PA 3FGSA 3MJNA 4WEDA 1MDP1 3K1MA 4L17A 3FUZA 1AIVA 4X9TA 1IIWA 2UVJA 2HFBA 2I6EA 1JQFA 4X48A 4FE8A 3HCQA 4N6PA 4NMYA 4F31B 2XXUA 1B0HA 3H6UA 5I2KB 2XD2A 3GBAA 4F1YA 3D4CA 4R73A 1WODA 3N94A 1SDXA 4POWA 1MH4A 3O9PA 5ICQA 3VE1B 1DPPA 1A8EA 3O6IA 1B4HA 2XHDA 3TTKA 3C31A 2I3WA 4HS7A 1IXGA 1ZTYA 3IOUA 3I6VA 1HSLA 4QFOA 2RF1A 3CSGA 3MP8A 4BDLA 4FEDA 1TT1A 3FJ7A 5FTHA 4JSDA 3KFMA 1H45A 1MXXA 2OWTA 1FTKA 2UYEA 3EHUA 1QJMA 1FTOA 3W9WA 2XXWA 3MZ1A 2DVZA 5F7VA 1Y4TA 1AOVA 5KCJB 3ZKLA 1MRPA 3RT6B 4H1XA 4PETA 4GF8A 3CSBA 5L9MA 2F6GA 4F2QA 4ISUA 4EXLA 3SEVA 3K2DA 2V84A 4OENA 3U1OA 4C0RA 3OO8A 3D4GA 2G29A 1GTKA 1DOTA 1Y9UA 3JZJA 5ISUA 1NNFA 4IO6A 2Y7KA 3OEKA 2RC8A 1DMBA 4MBPA 2V3UA 3G3HA 5I59B 4F3PA 3H3GA 1FTJA 2F36A 4M4GA 4KCCA 2XXXA 1O7TA 4ZEDA 4Q0CA 3N6UA 3PUXE 2VGQA 4U4SA 2FA7A 2F34A 3TYHA 1LB8A 5AA2B 3TFLA 3VFJA 2F35A 2O1LA 2I0BA 1SQYA 1B5JA 5DEXA 3FXUA 5AA1A 4H65A 3CFLA 3RT8A 3OSRA 2D21A 4KFQA 1R9LA 2R6GE 4XKNA 3G3KA 3SEWA 3CR9A 1ZBMA 4YICA 5I56A 4U4XA 2F6PA 3Q26A 3HHGA 4QHQA 4OFJA 3O97A 1EU8A 2FYIA 5IKBA 4POXA 2XXPA 2ZYKA 3KN8A 4R72A 4OZ9A 4H0WA 5FHNA 2XXYA 4OETA 1VFEA 3VVFA 3QSLA 4U1OA 3RUMA 3HSTA 4JXIA 1MQIA 4EQBA 3TTNA 3TPAA 3E9XA 4GL0A 3Q25A 1O64A 3TODA 3F11A 3MVZA 1MQDA 1B7HA 1R6ZA 1KWHA 4OESA 3UORA 5I58A 2DVCA 4ELQA 3O6GA 1P1NA 5JK4A 3IJOB 2AL5A 4KCDA 3C34A 4GWOA 5AA4A 4QFKA 4QSEA 2DE3A 3V5AA 1AMFA 1OVBA 4JWXA 4NF8A 3O29A 1LAXA 3UN6A 3IB0A 4GIZA 3V8XB 5CBSA 3EN3A 1A54A 1SI0A 2XXTA 1J1NA 1B4ZA 4TQUQ 5HM4B 3MBPA 3OO9A 4MF3A 1QUJA 2ANJA 4ZZEA 2Q2CA 1XS5A 3PUYE 4OYVA 4Q30B 4IO5A 3KOTA 2B3FA 1LBCA 3PGFA 3KN7A 3VV5A 3U72A 1JW1A 3IO4A 4GOTA 3M3KA 4FAJA 3FVNA 4DXBA 4ECFA 1MQJA 2ONSA 3UK4A 4NF4B 2I0CA 3Q28A 5FHMA 1B0LA 5I2KA 3RPWA 2Q2AA 5H8HA 3LR1A 1Y1ZA 4NF6A 5ITPA 1NFTA 1D9YA 2O69A 4IO2A 3K1NA 4PFUA 4IO4A 1OMPA 2Y84A 2H9BA 2ZNUA 3TTRA 4F3BA 5I84A 3E13X 3BKIB 1BP5A 2YLNA 1WVJA 2Z8EA 2OZZA 4AQ4A 1B52A 3MWBA 2OBGA 5L9SA 2DWIA 1PEBA 4JB7A 4EQ9A 2OWSA 3SEYA 5DEXB 1MXUA 4OTEA 1LGBC 4E0XA 4YZZA 5K2XA 3UA8A 5KCJA 1P1UA 3MC2A 5BUUA 4QFLA 2GFEA 4F22A 1UQWA 5I56B 2RCAA 3VDFA 3TCGA 1MDQA 3MVXA 5DVJA 2XXVA 1JW4A 2ZMBA 1URGA 2XXIA 4IO7A 2BJJX 2DQVA 1MM6A 3EPEA 3OEMA 1N7WA 1M5DA 1A99A 4TLLB 4GQOA 5AA2D 1B5IA 3CRBA 1LAGE 4H6DA 4KI0E 1T0KA 4DZ1A 1B3EA 1PBPA 3OENA 1GR2A 3MZBA 1ELJA 1OIBA 2R71A 2P0SA 5I58B 2PT1A 1PB9A 3KBRA 4XKQA 3A3UA 3O28A 3EHSA 3CI8A 4P0IA 3SERA 1BKAA 5AA4B 3OXNA 1NNKA 1L5TA 1BIYA 4UA8A 1ATGA 5A5XA 5H8FA 4NF8B 4KYSA 3UP9A 1Y20A 1XC1A 1EZOA 2H5YA 4QRZA 1M5EA 3B6TA 4IY6A 4R6HA 3OELA 3TEPA 1B58A 4KD5A 4ONYA 4BDNA 1FQEA 3TZAA 4EDPA 1B40A 4QF9A 3IL1B 2I4CA 1FQCA 2REJA 4MLQA 2H4IA 4OFOA 1IXHA 3CFZA 1ZLQA 2OCUA 2REGA 4H5GA 2OLBA 2NWJA 3PUWE 2O6AA 3T9UA 3V83A 2QMXA 4EXKA 5HPQA 4R75A 2O51A 1XVYA 1R9QA 5TPAB 4BDMA 3MQ9A 3DP8A 3QUJA 2ONKE 5H8HB 4ESXA 4HCYA 4NF6B 5EHMA 3SKPA 1B5HA 5KDTB 1MY1A 1URDA 3S2VA 1DTZA 4OMBA 2HZLA 2NUVA 4N13A 3MVWA 3ILTB 1MH3A 1EH3A 1QUIA 2V3TA 3KZGA 5CRYA 3FASA 3T93B 3T22A 4BDRA 4H8JA 3PUVE 3PPRA 1B7UA 2OJTA 4EQ7A 3TUSA 2DP8A 3GXAA 4R2BA 1A8FA 1PBQA 4R6YA 4PFYA 1LFGA 4NEDA 2DWAA 3FIRA 4PFTA 1I6BA 1NMUA 4LVQA 2HEUA 3C35A 4YU0A 3KSJA 3IB1A 2E1SA 5F1QA 1QKAA 2PBWA 4Z0IA 3EHTA 4F29A 1VR5A 3PD8A 2CMOA 2DYXA 4YMBA 1EZPA 3VLVA 1B05A 3PPNA 4NF4A 4F1UA 2H25A 3TAJA 2X7PA 2UYFA 5CMBA 1LFHA 2PMSA 3GBBA 1YAEA 3TTLA 4QSDA 1SI1A 3W15C 1IEJA 1MY4A 5H8NA 4X1BA 1MXVA 3K00A 3L6GA 2RCBA 1B6HA 3MVYA 4GXAA 1A7LA 1USYE 2XXHA 4MLVA 1I6AA 4EF1A 3PPOA 3LUYA 1XOCA 5A5XB 1I6QA 5H8FB 1N0TA 1NNTA 4I8CA 3WAFA 3OSQA 1URSA 3B7DA 5ITOA 3EF7A 3DM0A 1D9VA 3T66A 2F7CA 2I49A 1ZMGA 3SEUA 2VP1A 3TCHA 3S9NC 2P2AA 3FVKA 3VXBA 3K02A 1SYHA 4U23A 3IJXB 3C32A 2FNCA 4THIA 3QK6A 3M3LA 1LCTA 2V3QA 3OD7A 4ZEFA 5M2VA 3L6HA 3THIA 1PB7A 4LZ8A 4F19A 4YB6A 1MXZA 1VE4A 1UTBA 1ZJLA 3U8QA 2HCAA 4OXVA 2ALUA 2AYSA 1JEVA 2DXYA 3PMWA 4G2ZA 3S4UA 1A55A 5TP9A 2QJEA 5CMKA 3RN8A 2QPQA 5KZTA 1YPNA 4RNSA 4F3SA 3H6TA 1IXIA 1PDAA 1RKMA 1O63A 3MPLA 5CMMA 1LAFE 1LLSA 4FEBA 1B32A 1IQ7A 2IEEA 4XXUA 4G8MA 3LSXA 4LUBA 4R2FA 4ZDMA 1LBBA 4BLAA 4KQPA 2W7YA 4WKMA 3C4MA 1IITA 3DP6A 4GD5A 2XX9A 3Q29A 4AB6A 3RNNA 1B7ZA 5CI5A 2A5SA 4GFRA 4GXSB 4DDDA 2RC9A 4HCWA 2Z22A 2PX1A 3M8UA 4WEPA 2RINA 3K6XA 1VSOA 3PPPA 1MM7A 4ELOA 4U22A 1FTMA 1AL3A 3H7MA 4I1DA 1D3KA 2XXQA 1TFDA 1LCFA 4JWYA 4PQJA 3UIFA 5L9OA 3EQ1A 3O6HA 4RJZA 3B6WA 5TPAA 3VVDA 2HXWA 1LAHE 1M5FA 1JETA 2ZNTA 1N76A 2I58A 4YB5A 2H99A 4NF5A 3BFUA 4RY1A 4R6KA 5CMCA 2DSFA 5KDTA 1Y3QA 2Q9TA 4KHZE 5H8NB 3WAEA 2Q8JA 2I48A 4QSCA 1XHYA 5B70A 3LSLA 4EUOA 1TFAA 4LQ5A 1SW5A 2LAOA 3QIMA 3MUQA 2E0SA 3E4RA 3FJMA 4ZE9A 3FD3A 1ZU0A 3U94A 2UVHA 1B9JA 3K4UA 4N07A 1GGGA 4H5FA 3FV1A 2A5TA 2VD3A 1NH7A 2AIXA 4NTLA 3T9HB 1MY0A 4PP0A 5L8DA 1MXYA 3VLUA 2Y7PA 4Q5TA 1I69A 3U92A 5AE4A 4JWOA 3IR1A 2DWHA 3SESA 1JVXA 1SYIA 2THIA 3C36A 4IB2A 3PD9A 3QUFA 4C1UA 3T9VA 1QKBA 3CVGA 5EYFA 1SD3A 3IOVA 3OO7A 5CM6A 2QMWA 4OEUA 2ZXTA 4XTCQ 2XX7A 2O7UA 3Q27A 4YKPA 1UTBB 3LBSA 4ZZAA 1B3LA 2B65A 3FATA 3KN3A 1H3DA 1IZ1A 4KYDA 1RYOA 4LATA 4RPNA 1SVXB 4LQ2A 1FQAA 4IGRA 3MW0A 3CIJA 2UXAA 1B1HA 2O84X 4BDQA 1Q35A 5TP9B 2HAVA 1BTJA 3VLWA 4P11A 3TDJA 3PPQA 3TQLA 3PU5A 4DE8A 3LC8A 3KG2A 2IA4A 4WXJA 1P1WA 2XD3A 1JW5A 1M5BA 4MH5A 1UTHB 2F78A 2Y7RA 1S50A 1JNFA 2I3VA 2F97A 3G3FA 2KLFA 5LOMA 1HSJA 4RPOA 4OERA 3OOAA 3AXFA 1QVSA 4JBZA 3K6UA 4JDFA 3N5LA 4I9DA 2XX8A 2DWJA 4HTGA 4NWCA 1CE2A 2HZKA 4DCYA 4ZECA 2UVGA 3HHFA 1TWYA 4IO3A 3IAZA 3JYRA 4RK2A 3MAMA 1Q1KA 4F18A 2ZNSA 2F5XA 4ZEBA 1QW0A 4H8IA 2CZLA 1OQHA 1GVCA 4RXLA 4DXUA 4QFNA 2M8CA 4NF5B 5JTYA 1FQBA 2Q88A 4NE4A 1JVYA 1FCKA 3HPIA 3I3VA 3KOSA 1FQFA 3A3CA 3O2AA 2PT2A 5DVFA 3SETA 3IB2A 3FV2A 3R7XA 4LA9A 1XVXA 2QSXA 4G68A 3FVOA 3IX1A 2QS2A 2VHAA 2I4BA 4YKJA 1P99A 2DXRA 4DIGA 4OHNA 1MQGA 4AB5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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