3O6HA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A novel series of positive modulators of the AMPA receptor: structure-based lead optimization.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 261
sequence length 261
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o6hA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o6hA02
3PPOA 2DVCA 3BBRA 4LP2B 3U72A 2XXHA 3KSJA 2V3TA 1RYXA 3K01A 4DCYA 1N7XA 5L8DA 3FV1A 3K6VA 1B6HA 1DPEA 4GFRA 3HO7A 4X1DA 3UIFA 2DYXA 4OTEA 3TTMA 2Z22A 1RYOA 1A7LA 3OOAA 3G3GA 5I57A 3K02A 3K00A 1M5FA 1DSNA 2B3FA 2HAUA 2HEUA 2DE4A 4NF6B 4RPOA 3U94A 4F1VA 5HM4B 2GFEA 1Q1KA 2VD3A 1ANFA 4ELPA 3U8QA 1XVYA 2OBGA 3JYRA 3L6HA 1D3KA 3L6GA 4GOTA 1R6ZA 2YJPA 3ODBA 2ZYOA 3EHTA 2F78A 4XKPA 4N6PA 2H25A 4YB5A 1LB9A 5H8QB 3TMGA 4I1DA 1B3FA 4ELQA 4OENA 1Y1ZA 4E0WA 1FQEA 1MPDA 4RK9A 2NVUB 3RGYA 3DLNA 1KWHA 4EXLA 2YLNA 1ZBMA 2RCBA 3GLBA 4R72A 4YZZA 3VXBA 4EQ9A 1MDQA 1JVXA 5A5XA 1YCJA 1SI1A 4R2BA 4ND9A 3UN6A 1IXGA 1MXZA 3PPPA 1A8EA 1ZJLA 2WKYA 4WEPA 5M2VA 1XS5A 4YKIA 3KFMA 1JW4A 1TT1A 3KOTA 4IO2A 1TXFA 3IOVA 4IO6A 1JW5A 1US5A 3I3VA 2H9BA 3FJMA 1OLCA 3RPWA 1B05A 1WODA 3PPRA 4F1YA 1LBBA 1P1QA 4Z7EA 1B3EA 3FUZA 2ONSA 3KEIA 4U21A 5DEXB 4ZEFA 3PUZE 4F2QA 2I4CA 5AA4A 4YB6A 1H76A 3CVGA 3KG2A 1P99A 4ZZAA 1MQIA 3G3KA 4YKPA 2A5TA 1H45A 3IOWA 3D4GA 1UIVA 1B7ZA 1IXHA 1B0LA 3D4CA 3LR1A 1R1NA 4G8MA 1CB6A 3R7XA 3N26A 4JWOA 5EHSA 4ZZEA 1B4HA 2I6EA 3OO9A 4I8CA 3MWBA 3OELA 3CFLA 1NH7A 1Y9UA 3V8XB 1UTBB 2F7AA 2ZYMA 3SEXA 1II5A 3PUVE 4NF4B 4NEDA 2M8CA 3MZBA 3Q25A 2HZKA 4RA1A 5DVFA 5DYHA 2FYIA 4ECFA 3PD8A 1Y1MA 2F35A 3HHFA 2RC9A 3C36A 4WEDA 4YB7A 4BDNA 3ZS6A 1MRPA 3HV1A 1S9TA 3KN7A 2D5WA 4LA9A 2VOZA 3PV0E 3VVFA 3ZSFA 5L9SA 5CI5A 3TFLA 5ITPA 3VFJA 3CSBA 1MY2A 3FVGA 5H8NA 3RY3A 1OLAA 1SW5A 4PQJA 1DOTA 3KBRA 3TQWA 1PB9A 2VGQA 4OFOA 1A55A 1SYHA 3I5OA 3TAJA 3VE1B 3EN3A 1NKXA 3MVZA 4GD5A 5EHMA 3T9UA 3VLUA 1MY4A 2VHAA 2GHAA 1MPBA 3FATA 1SVXB 3M3KA 2D3IA 5H8QA 5I2NB 1URDA 4WXJA 4R9GA 2V3QA 4EQBA 3LC8A 1M5CA 2ZYNA 4THIA 3N94A 3ZKKA 1LAHE 2THIA 3IOUA 2Q8JA 4F2OA 5B70A 2QPQA 5H8FA 1IZ1A 2ABHA 1H3DA 1NNFA 2REJA 4H65A 4YKJA 1VFEA 3TEPA 4YU0A 4FEBA 1VR5A 1LSTA 4OWDA 3RUMA 5H8HA 2B65A 4HW8A 5I57B 4IO4A 4MH5A 4WKMA 4JXIA 4F29A 3RT6B 4ESXA 1URGA 3FJ7A 5IAIA 4R73A 3O6HA 1DMBA 3C33A 3OO6A 4IGRA 3U93A 5DTBA 1FTMA 1TFDA 2H5YA 4ZDMA 1OQHA 2X7PA 1D9VA 3K1NA 5ICTA 3JZJA 2UVHA 4U4SA 2Y7IA 4OVJA 3FVNA 4NF4A 1MQGA 1SBPA 2XD2A 1SQYA 1LAGE 1NNPA 3H6UA 2DWJA 3MP1A 2ESNA 1QUKA 4NWDA 3VVDA 3ILUB 3SETA 4RPNA 1LGBC 2H4IA 4FE8A 3OMBA 4NF5A 3B7DA 4YICA 2RINA 3SKPA 3KN8A 5TU0A 4EF1A 1Y3QA 4TLLB 3TTNA 3G3JA 1Y20A 2O7IA 2OWSA 1FQDA 4U1ZA 5JTYA 2O6AA 2HZLA 1I6BA 4QFLA 4MLQA 4DXUA 4F3PA 5EYFA 2GHBA 1EU8A 2XHDA 3GBAA 2O84X 3MP6A 3MZ1A 4LUBA 4YAHX 3TUSA 1FQCA 4FAJA 2P1SA 3G3HA 3O6IA 4GL8A 1YTVA 3VV5A 1A54A 3RN8A 3FV2A 4QHQA 4OZ9A 4DXBA 3PMXA 5I59B 1LAXA 3CIJA 2NWJA 1N04A 2DVZA 2IEEA 5FHMA 4XXUA 4AB5A 4R6YA 4TOZA 2G93A 3W9VA 2FNCA 4JBZA 2LAOA 2QS1A 3GXAA 4RK2A 4AQ4A 2XXTA 3CFXA 1OVTA 1L5TA 1N7WA 1ZLQA 3PPQA 4GL0A 1ZMGA 3DP6A 4POXA 3T9VA 3FVKA 1P1OA 3UORA 1JQFA 1S7YA 4LATA 3FASA 4GIZA 3BFTA 3MVWA 3IK6B 3BFUA 2O1LA 3G3FA 4N07A 4F31B 1VSOA 2CMOA 5DVJA 1PB8A 1FCKA 2DSFA 4G68A 1N0TA 3EQ1A 1JW1A 4IY6A 4O3AA 3Q28A 2I3WA 5TP9A 2PYYA 2OJTA 3IJXB 3KSXA 4Q30B 3O28A 3IORA 4TLMB 4KCCA 4QRZA 3FJGA 1GV8A 1CE2A 5AE4A 2CZLA 2DE2A 2OZZA 1HSLA 5CM6A 3MC2A 4P0GA 3OO8A 2F36A 2F6GA 3QSLA 4O3BA 4POWA 2YPNA 3PUYE 2B3BA 3S9EA 1Q35A 2E0SA 2V84A 3VXCA 3QUJA 3V5AA 3OEMA 5I2NA 4KD5A 3T9HB 1EZ9A 1D9YA 2RKMA 4OHNA 4ZEBA 3O29A 5H8HB 3T9XB 3LSWA 5AA2D 2HCAA 5DT6A 3S2VA 4QFOA 1MQJA 4KPTA 5H8SA 1SI0A 3FZVA 2G29A 4IO7A 2AYSA 3IB1A 4MLVA 3TTRA 2Y7WA 1ATGA 3O97A 1MS7A 1QJMA 3QIMA 3ILTB 3EHSA 5CRYA 3SEWA 4DCXA 5AA2B 5B7DA 1TFAA 3MW0A 3VDFA 4DDDA 4H8JA 3TTLA 5BWJA 4FORA 4P11A 3MZ9A 4IGTA 1B46A 4NMYA 2AL4A 3TPAA 1USYE 4F3GA 4DE8A 2QSXA 5I59A 3TZAA 1B51A 1IXCA 2O69A 3OENA 3IR1A 1BIYA 1D4NA 3ONMA 5AA1A 2ZMBA 1POTA 2Q2AA 3G3IA 4MF3A 1B40A 3RQTA 1NL5A 1B3HA 2V93A 2D21A 1MY1A 1MXUA 2V25A 3EF7A 1S50A 1WDNA 4JB7A 2XD3A 5I2KA 1SW4A 2UVIA 4H8IA 4UA8A 5AA3A 3N6TA 3C34A 2HXWA 1ZU0A 1ELJA 1MQDA 2X7QA 1B3GA 4NF5B 5AA2A 2XXXA 3CRBA 1MXYA 1B3LA 2NXOA 3PMVA 4G8NA 4LZ7A 4NE4A 2QS3A 2I4BA 3LBSA 5ELVA 1PC3A 1NMUA 3TCGA 2R71A 2OWTA 4N13A 4C1TA 3ECRA 4EUOA 5CBRA 2HQ0A 5CMKA 1UTHB 2PMSA 4OYVA 3FGSA 3OXNA 1LFIA 3IOTA 4JWXA 4F3SA 3T93B 4OMBA 3S9LC 3MAMA 4X48A 3IL1B 5KDTA 1JVYA 1LAFE 2GRVA 3E13X 4PFWA 4Q5TA 1FTOA 3VVEA 3RTFB 4M1VA 4O3CA 4PFYA 4R6HA 4I62A 2XX9A 4H1XA 4ESWA 1N84A 3K1MA 4G4PA 5F7VA 5FTHA 1N76A 1WVJA 3QUFA 4R74A 3CFZA 3C32A 4H5GA 3UA8A 1I6QA 3LSFB 4H0WA 4NF6A 4F19A 5JEIA 4LQ2A 2PBWA 4G77A 3TCHA 4HCWA 2XX8A 3C4MA 2QMXA 4JSOA 3TTKA 4F1UA 4F39A 4KYEA 5CMMA 3HHGA 4H5FA 5I56B 1VFDA 2ZXTA 4QF9A 3SESA 5FHNA 4P0IA 3KZGA 1PDAA 4GLIA 3MPKA 3JV9A 3V83A 4KR5A 4XKRA 4KQPA 1IIWA 4U4XA 3W9WA 2OLBA 4G2ZA 4OERA 5TPAA 2PX1A 1AH5A 5J1DA 5H8FB 4PFTA 1GTKA 1QW0A 2NOOA 2P2AA 2QL3A 2QMWA 3Q27A 4FECA 4U22A 4G68C 3U92A 1AIVA 3KJ7A 1Y3NA 1BTJA 3MVXA 4Z0IA 4EXKA 3A09A 2H98A 2VP1A 4LZ8A 4AB6A 3RTWB 4GXAA 4QSDA 3TQLA 4F18A 4XTCQ 3CI8A 3E9XA 3PGFA 1NH8A 4LQ5A 5KCJA 4EQ7A 4LVQA 2Z8FA 5DEXA 5AA4B 2DQVA 1B4ZA 4Q8RA 4KCDA 2ANJA 1MM7A 2XXQA 2Z8DA 4XIGQ 5DVIA 2V3UA 2H99A 3K6WA 1PEBA 4BDRA 1P1WA 1H44A 2QS4A 3OSQA 3I6VA 5LOMA 1PB7A 5JTYB 4ZEDA 3FXRA 1SD3A 1A8FA 1DPPA 1F9BA 3C9HA 4NF8A 4OEUA 2R9JA 1MDP1 2QJEA 1N3XA 2O7UA 1YAEA 5BUUA 1B9JA 1I69A 2RCAA 4GQOA 3K6UA 4X9TA 1UTBA 1B32A 4R75A 1SDXA 2XX7A 5K2XA 3TYHA 4F22A 4ELRA 2DWHA 2DOJA 2F34A 1MQHA 1BP5A 1O64A 2ALUA 2E1SA 2I48A 2RC7A 3H3GA 3MBPA 4JWYA 1IXIA 3H06B 1MY3A 3PUXE 3S9MC 2AIXA 1LCTA 4GF8A 3BKIB 4IO3A 2I0BA 5ITOA 5I58A 3THIA 1GVCA 1Z7NE 1B2HA 1M5BA 2A5SA 3O9PA 1NNKA 1B0HA 4NWCA 5L9MA 4U23A 1IITA 3FD3A 1US4A 3OEKA 4FATA 1OVBA 3IO4A 1MH4A 5CBSA 3MUQA 4IY5A 1MXXA 3A3CA 3N5LA 3TDJA 2DWIA 2Q88A 5ICQA 1FQBA 1URSA 4G8HA 3B6QA 2HFBA 1B1HA 1Y4CA 3OO7A 4GVOA 1AMFA 1HSEA 1QVSA 2I49A 4NTLA 4M4GA 4ZECA 1YPNA 5I58B 1OMPA 1GGGA 1QUIA 1LB8A 2GH9A 1B5IA 4BDOA 4DXCA 4F3BA 2DS9A 4G68B 1J1NA 3LSXA 2ZNTA 2R6GE 2REGA 3KN3A 3V89B 4RYAA 5IKBA 3H6TA 1H43A 2ZNSA 3DP4A 1ZKBA 5CMBA 1B58A 2UVGA 3CR9A 4YKKA 3K4UA 1QKBA 1NNTA 3Q26A 1FTLA 1IUDA 4NF8B 3QXMA 3SEYA 3EHUA 3FXQA 4ZE9A 3USDA 4OQOA 5KDTB 1MM6A 4XKQA 3H7MA 3IX1A 3HN0A 4JSDA 2OCUA 3IO6A 4QSCA 2F7CA 2F6PA 2DXRA 5HPQA 2ONKE 4QFNA 4HTGA 5I84A 4BDMA 5H8NB 1B7HA 3CG1A 3O6GA 3M3FA 5TP9B 4PP0A 1FTKA 3O66A 1VE4A 4LONB 4RY1A 1HSJA 1EZPA 1ZTYA 4K3FA 3G7WA 1O63A 4L17A 5CC2A 4QFKA 3HCQA 1JEUA 2UXAA 3H6WA 3IAZA 4KHZE 1POY1 3PUWE 1LBCA 1FTJA 2RC8A 4FIMA 3VLVA 2QS2A 4GXSB 4HS7A 5CMCA 3IJOB 4OFLA 3H6VA 4ISUA 4OETA 3PPNA 2UYEA 3N6UA 1EH3A 3WAFA 4E0XA 3S9NC 5F1QA 3AXFA 2OK2A 2VD2A 3MP8A 4KYDA 1MXWA 2ZNUA 4R2FA 5K2YA 4FJPA 1UQWA 2Y84A 1N3WA 2O51A 3LSLA 3U1OA 3RLFE 4XKNA 3K2DA 1XT8A 1PBQA 2XXRA 2FA7A 3SERA 4LZ5A 3PMWA 3TCFA 1TWYA 4EDPA 4IB2A 3DELB 4GWOA 2IA4A 1AL3A 3MQ9A 1PBPA 2F5XA 3ZKLA 2Q89A 1P1NA 4PETA 3K1PA 2F8DA 3C31A 5TPAB 2QRYA 4DLDA 4OFJA 3UGWA 4GRKA 2Q9TA 3KOSA 3K6XA 1XVXA 1DTZA 1LFGA 1FQAA 1XOCA 2A5TB 1XC1A 2I3VA 3MJNA 3O2AA 4ZEKA 4ELOA 3IB2A 3CSGA 3FXUA 4JDFA 4DIGA 1Y4TA 1USYH 1MH3A 3HSTA 4C0RA 4KI0E 2I0CA 3KGCA 4ZS9A 3FVOA 3SEVA 2XXPA 1T0KA 2ZYKA 1OIBA 3B6TA 3H03A 3T96B 1Y3PA 1MPCA 1B52A 2PVUA 4UACA 5KCJB 4MBPA 1QUJA 2UYFA 2W7YA 3B6WA 2F7BA 1R9QA 3OSRA 3CG3A 3A3UA 2Y7PA 1I6AA 1XHYA 1M5DA 5ISUA 5I56A 1LCFA 1A40A 1SW1A 1QULA 1BKAA 4KYSA 2NUVA 4QSEA 5A5XB 1P1UA 1JETA 4QFPA 4YMBA 1IQ7A 1B5JA 2DP8A 1FQFA 1MY0A 2XXIA 2HAVA 3E3KA 3S4UA 4R9FA 1IEJA 1B5HA 1SYIA 1ZIUA 2Y7KA 2Y7RA 3M8UA 5HBCA 3F11A 2X26A 3QYTA 4KFQA 4U1OA 3RNNA 1B7UA 1DTGA 2Q2CA 4BDQA 1UTHA 3LUYA 1A99A 1MG1A 1FW0A 1Z7ME 4RJZA 5L9OA 1JEVA 2Z23A 2DE3A 3RT8A 4R6KA 3TKDA 1O7TA 3M3LA 2XXUA 3E4RA 3T22A 3DP8A 3VLWA 3W15C 4I9DA 3EPEA 4Q0CA 2PT2A 1RKMA 3KJTA 4OXVA 1QKAA 4BLAA 4MFIA 1AOVA 1R9LA 4OESA 4HCYA 1OQGA 4DZ1A 1EZOA 4X1BA 3MVYA 4RNSA 4PE5B 3TELA 5KZTA 3R26A 3SEUA 4RXLA 4PFUA 4IO5A 4FEDA 2RF1A 3R6UA 2I58A 2AL5A 2KLFA 2XXWA 3FIRA 3IB0A 5FHOA 1BLFA 4ONYA 2XXYA 1JNFA 1LLSA 2DXYA 3H4ZA 5FTIA 1B1XA 3P7IA 3GBBA 5I2KB 5JK4A 1SW2A 3QK6A 3K0VA 4OEVA 3GZGA 2O1MA 2DWAA 3OD7A 4ZEIA 3T66A 3TODA 3SDFA 3UP9A 3WAEA 2BJJX 2Z8EA 3DM0A 4YMAA 2UVJA 3UK4A 2F97A 4H6DA 2O68A 1LFHA 4U2RA 3QAXA 3PD9A 3Q29A 1NFTA 1UIUA 3C35A 2ONRA 4ZE8A 2PT1A 4H67A 4C1UA 2XXVA 4TQUQ 4EF2A 2P0SA 1MXVA 3MPLA 1M5EA 3HPIA 1GR2A 4BDLA 3PU5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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