3O6HA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A novel series of positive modulators of the AMPA receptor: structure-based lead optimization.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 261
sequence length 261
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o6hA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o6hA02
3KN3A 3IB2A 3IX1A 1GV8A 3OSQA 1MY4A 2D21A 3SDFA 1AIVA 3UIFA 3N6UA 4GRKA 5M2VA 1PB8A 3KSJA 3G3JA 4F1VA 2NUVA 2XXWA 5H8NB 3CFLA 3BFUA 3FJGA 3EPEA 4MBPA 2VGQA 4IO4A 3ZSFA 3RT8A 3PPQA 3MZ1A 5I59B 2NWJA 5H8HA 1FTMA 1O7TA 5H8NA 3FIRA 4XIGQ 4OFLA 1ANFA 3C31A 1B0LA 2DWJA 2OK2A 3CSBA 3IOVA 4ZDMA 3VXCA 5I2NB 3K1PA 5L9OA 4I62A 3V8XB 4H1XA 4PFWA 2H5YA 4WEDA 2DQVA 2F78A 2Y7PA 3PPRA 4JSDA 3SERA 2UYEA 1A99A 2VOZA 2RC8A 1HSLA 2DP8A 3MVWA 3OXNA 4G8HA 1B0HA 3USDA 1P1WA 1MPBA 1PB9A 2F6GA 4R73A 4YKPA 4KI0E 1IEJA 2F7CA 2DVZA 3O6GA 1OVBA 4FE8A 4KCDA 1H45A 3K0VA 3LUYA 1B5HA 1NNTA 4KQPA 3PV0E 3TQLA 1QUKA 4KR5A 1B52A 1B9JA 3EQ1A 3TPAA 3VLWA 4F31B 3QIMA 4OQOA 1VSOA 2OJTA 4QSEA 4POXA 3UGWA 3PGFA 1USYH 4FIMA 1MPDA 2I4BA 1MXXA 3IOTA 3IOWA 4NTLA 1A7LA 4OTEA 3RNNA 3VXBA 4F29A 5L9SA 1N7XA 1IIWA 4LONB 2XD3A 1DSNA 3G3IA 3MPKA 3O9PA 3OELA 4YKJA 4PETA 4U4SA 4GD5A 2UXAA 4ND9A 4XKRA 4EQBA 4THIA 3CG3A 1R9LA 2F97A 2YLNA 2PYYA 4QF9A 3FVGA 3M3FA 3FXUA 5HBCA 1MQGA 3MQ9A 1B58A 3IO6A 3QAXA 3CG1A 3WAFA 1I6QA 2HFBA 1B51A 3IK6B 2HZLA 4H6DA 1OIBA 4KYDA 4YKKA 4ZZEA 3T9XB 4GXAA 3VE1B 4EDPA 3V83A 4YMAA 2HAVA 3CIJA 2KLFA 2CMOA 2R9JA 1ELJA 2I48A 2QS4A 3GXAA 3K6WA 1PBQA 4ECFA 3U72A 5FTIA 2AIXA 1Y3NA 2V3TA 3OENA 4R74A 5H8SA 1A55A 2Q89A 2XXXA 1UTBA 1M5CA 3Q26A 4RXLA 2PBWA 2XD2A 3RTFB 3U1OA 1LB8A 1SI1A 2ONSA 2GRVA 3E9XA 4GLIA 4ZEBA 2OBGA 2Q8JA 2PVUA 4RY1A 2H99A 3GBBA 3LSLA 3LSWA 4G8MA 3H6TA 1FQEA 3EN3A 4GIZA 4HS7A 3PMWA 2REGA 2DXRA 3CFZA 3IJOB 4RJZA 1ZJLA 4YKIA 3SEWA 1US5A 2F7AA 3SEVA 5CRYA 3W9WA 3A3CA 3KSXA 3W15C 5BWJA 4ZE8A 2I4CA 3MZ9A 1A8EA 3IR1A 1S9TA 1SYIA 2Y7IA 1Y9UA 2ZNUA 3KOSA 5DTBA 1L5TA 3V5AA 2YPNA 1TWYA 5F7VA 4BDMA 3QK6A 1MXYA 3I5OA 1B5JA 3FASA 1Y4TA 3H6UA 3PUWE 3O6HA 4R6YA 4XXUA 1NNPA 2IEEA 1WDNA 4F1UA 4GWOA 1FQDA 1SW1A 5JTYA 2UVJA 3HO7A 3SEXA 5JTYB 2Y84A 1DPEA 4YZZA 2DOJA 4KFQA 4DIGA 4ELOA 1B1HA 3ONMA 2V93A 4H8JA 4H8IA 1URGA 1NMUA 4LZ8A 4OXVA 3GBAA 4NF4A 1N84A 4H65A 4PFUA 4BDRA 4DLDA 1J1NA 4JDFA 5DYHA 1M5DA 2O1LA 5KDTB 3PD8A 1LBCA 2XXPA 5AA4A 2OWSA 5I56B 4X9TA 4LZ5A 3OSRA 2DWAA 3MAMA 5I59A 1BIYA 3M3KA 2F34A 1B1XA 4UACA 2XXHA 5IAIA 3UORA 4U22A 1LFGA 3W9VA 1M5BA 1P1QA 1SVXB 2DYXA 4NEDA 4G2ZA 4OMBA 3WAEA 4F19A 3S9EA 3THIA 3KN7A 1XVXA 3VFJA 1MH3A 4AQ4A 3TEPA 3KN8A 1B3LA 1MXZA 1IQ7A 4HW8A 1VFEA 1DPPA 3K01A 1DTGA 5CI5A 3FXQA 5L8DA 5JEIA 3E4RA 1QUJA 4YICA 4WXJA 1WVJA 1XVYA 4IGRA 2Z22A 3UA8A 4WEPA 1YCJA 2H25A 3IOUA 2QPQA 1HSEA 1B7UA 1BLFA 1MDQA 4R2BA 1UIUA 2QL3A 3IB1A 2E1SA 2OWTA 1B46A 5F1QA 4Z0IA 3VLVA 1II5A 1MXUA 1POTA 3HHFA 3RLFE 3C33A 4MLVA 1MDP1 2V3UA 3BKIB 3QUFA 4F1YA 2X7QA 3PUYE 1IITA 3FZVA 1PDAA 2F5XA 2UYFA 1O64A 3OO9A 1KWHA 1LCFA 2UVGA 3QXMA 5I57B 4QSCA 1JW1A 4KHZE 4HCYA 2VD2A 3N26A 3O66A 2GFEA 1NH8A 1GGGA 2OCUA 2O69A 2O6AA 3ECRA 3I6VA 4QFOA 2XHDA 4FORA 3U93A 1XS5A 1ZMGA 1OQGA 4QFKA 1D9YA 3RY3A 4O3AA 4OHNA 4RPNA 1XC1A 5H8QA 2H98A 4I8CA 2O7IA 3E13X 1MY1A 1UTHB 1ZTYA 1S50A 1N76A 1B4ZA 1A8FA 2HQ0A 2Q2CA 2ZNTA 1IZ1A 4H5FA 4LUBA 3O28A 3UP9A 3ZS6A 4EUOA 3I3VA 4GOTA 1MM7A 3DM0A 2QSXA 3KBRA 5TPAB 3A3UA 3FXRA 1H43A 1QKBA 3PPOA 5I58B 4X1DA 5ICQA 3TTRA 5AA2B 3MUQA 1IXHA 1DMBA 4OYVA 1JW4A 4PE5B 1IXCA 1M5EA 1BKAA 2I3WA 4NE4A 2PMSA 3MPLA 1O63A 3TTNA 1LAHE 1MH4A 4PFTA 5KCJA 1MXWA 5CC2A 1NNKA 2RCBA 3O6IA 4LP2B 3G3FA 1SD3A 5J1DA 1CB6A 4U1ZA 3MP6A 3H4ZA 4BDOA 5EYFA 4ELPA 5DEXB 5AA2A 3KFMA 3TZAA 2A5TA 2I0BA 3DP6A 4ZEFA 1Q35A 1TFDA 4ISUA 2QJEA 1GVCA 2ANJA 4F22A 4EXLA 3G3HA 1YPNA 3G7WA 2P0SA 1ZIUA 1SYHA 1USYE 2DXYA 2ZYNA 1FQBA 5I84A 2F6PA 3K2DA 3U94A 4R6HA 2UVIA 5CMBA 3C4MA 3PMXA 3T9UA 2P2AA 3MBPA 4ELQA 2AL5A 1AL3A 1T0KA 1N7WA 3MP1A 4F3SA 4U2RA 2A5TB 5I2NA 3HPIA 1VR5A 3LSFB 2Z8DA 2NXOA 1Y20A 2I58A 5DEXA 4GL8A 4GXSB 4RNSA 4EF2A 1Y3QA 1JQFA 5DVFA 5KCJB 2G93A 4ZEIA 1N04A 3MP8A 3TUSA 1N3XA 4P11A 1F9BA 1MQDA 3L6GA 5LOMA 2RCAA 1EZ9A 4DCYA 3CRBA 3C9HA 5TP9A 3B7DA 3VVFA 3CFXA 1MPCA 1SDXA 1LFIA 1B5IA 2GHBA 1R9QA 2H9BA 2ONKE 2Z8FA 2A5SA 1TT1A 2I49A 1UTBB 2G29A 4M1VA 5DVIA 3JZJA 3R7XA 4Q8RA 1B3HA 5K2XA 5ICTA 4NF6A 3PPNA 2DE4A 3F11A 4POWA 1B3GA 3N5LA 5DT6A 2RF1A 2ZMBA 5B7DA 4E0XA 2XXQA 3TKDA 2I3VA 4I1DA 3MVYA 4NF6B 3TYHA 4F3BA 1H76A 2Q9TA 4KPTA 2DE3A 2XX7A 4H67A 1GTKA 4NF5B 4U21A 3VDFA 2Y7KA 1B6HA 3DLNA 3FVKA 3M3LA 4LQ5A 4QFNA 5FHNA 1B7ZA 4OFOA 4DXUA 3PPPA 3ODBA 1LCTA 2P1SA 4G8NA 1HSJA 3SESA 1FTOA 1R1NA 1MXVA 1SI0A 2ZYMA 3TDJA 5I57A 1FQCA 1QW0A 4MFIA 3K6XA 5I56A 1PEBA 1B7HA 3FUZA 3H03A 3HN0A 5K2YA 3IJXB 2ZYKA 3S2VA 3SETA 3MZBA 3P7IA 3T93B 3TCHA 5H8FA 5KDTA 2V25A 1BP5A 1H3DA 3A09A 3Q29A 1OVTA 3Q28A 4N07A 4JB7A 2HCAA 2VP1A 2QMXA 2V84A 3RT6B 4ESXA 1B4HA 1H44A 1XT8A 3N94A 4JSOA 3TCFA 4YB6A 4QHQA 4RYAA 1RYXA 3RPWA 2ZNSA 4JWYA 3OO8A 1LB9A 2W7YA 4C0RA 3K1MA 3EF7A 4OWDA 3RUMA 3D4CA 1TFAA 1B40A 4F39A 3LBSA 4U1OA 3OEKA 3R6UA 1FW0A 1JETA 4G68B 3KZGA 4XKQA 3FJ7A 1UIVA 4GQOA 4MH5A 1FQFA 4JWXA 4OESA 3SKPA 4L17A 4PFYA 1NFTA 1EZOA 4TQUQ 4R72A 4R75A 4ESWA 2Q88A 4DDDA 5H8HB 4BDLA 2QS3A 1FTLA 1TXFA 3G3KA 4FJPA 3TAJA 2DWIA 4QFPA 2PT1A 1RKMA 3K6VA 4EXKA 1GR2A 3S9MC 3DELB 3FVNA 1QJMA 1UQWA 3RN8A 1MRPA 2Y7RA 3KOTA 3TFLA 1B32A 2O84X 4H0WA 2O1MA 2DSFA 1XOCA 3IORA 1XHYA 1MQIA 1FQAA 3HCQA 3OMBA 4IO3A 2H4IA 4JBZA 2XXTA 5EHMA 3S4UA 5AA3A 2I0CA 3DP8A 3Q27A 4NF4B 5A5XB 3Q25A 4LA9A 4XTCQ 4GVOA 1SW2A 1LBBA 4F2QA 3UN6A 2AYSA 2CZLA 1MS7A 5L9MA 4JXIA 4EQ9A 5AA2D 2YJPA 3FD3A 1MY2A 2UVHA 1VFDA 2Z23A 1US4A 4GFRA 3K1NA 5CMKA 3B6WA 3U92A 1LLSA 5ISUA 1OQHA 4M4GA 5H8QB 2QRYA 4Z7EA 1EZPA 4ZEDA 2ONRA 1MY3A 3LC8A 2B3BA 4N6PA 5DVJA 1BTJA 3U8QA 4F2OA 3C36A 4AB5A 4DXBA 3G3GA 2F8DA 3T9HB 3ZKKA 1ZBMA 5I2KA 4R9GA 1QVSA 4QRZA 2DE2A 3C34A 1R6ZA 3T66A 5HM4B 2M8CA 2FA7A 4OVJA 4LATA 3PU5A 3H3GA 4FECA 4LQ2A 1LGBC 2F36A 1A40A 2R6GE 3CR9A 4KYEA 5CBSA 3JV9A 2VHAA 3E3KA 4IY6A 1DOTA 3GZGA 4G77A 4ZS9A 4ZZAA 3H06B 4NF8B 4JWOA 1POY1 3H7MA 3K00A 4U4XA 1EH3A 3K4UA 3MW0A 4MF3A 4NWDA 4X1BA 5H8FB 3SEUA 1Z7ME 3TQWA 2HAUA 4E0WA 3EHTA 3IL1B 1NKXA 4GL0A 1M5FA 4ONYA 3VLUA 2Q2AA 1WODA 3D4GA 3MJNA 3MVXA 4YAHX 2ESNA 3LSXA 1B2HA 1ZKBA 3FGSA 1CE2A 4GF8A 4OZ9A 3R26A 4RK9A 5JK4A 4KD5A 2OLBA 3IO4A 4RK2A 5FTHA 4F3PA 3B6QA 4Q5TA 2BJJX 2NVUB 3T96B 3GLBA 1FTJA 4NF8A 4YU0A 5A5XA 4I9DA 3FV2A 3RGYA 1B05A 1D4NA 1NL5A 4BDNA 4EF1A 2PX1A 4AB6A 5TP9B 1AOVA 3TCGA 2XX8A 4DE8A 2DS9A 4F18A 5TU0A 4FEDA 4IY5A 4G68C 4YB7A 5FHMA 3MVZA 1URDA 3KJ7A 4OEVA 4DCXA 4OENA 3OOAA 3OO7A 2Z8EA 4O3BA 1LAGE 3KJTA 4WKMA 3RTWB 4IB2A 3TODA 5AA4B 5AE4A 2XXRA 3FATA 5FHOA 1B3EA 1S7YA 2XX9A 4OEUA 5ELVA 2ZYOA 1Y1ZA 1OMPA 1LAFE 4DXCA 4ELRA 1P1OA 5IKBA 3KGCA 4O3CA 2LAOA 4BDQA 4ZECA 3M8UA 1MY0A 4QSDA 1D9VA 3CSGA 2XXUA 4OERA 1I69A 2REJA 3PUZE 1LFHA 4K3FA 1Y4CA 1OLCA 4DZ1A 4H5GA 3PMVA 1ATGA 4RPOA 3CVGA 3SEYA 4IO6A 3N6TA 3PUVE 2PT2A 4HTGA 4KCCA 4MLQA 2XXVA 4FEBA 2QMWA 2R71A 4ZEKA 5CMMA 3FJMA 3RQTA 3TTMA 3QYTA 3VVEA 3V89B 3ZKLA 5AA1A 4ZE9A 1IXGA 2FNCA 1PB7A 3BFTA 3IAZA 4HCWA 1JNFA 5CMCA 4TOZA 2HEUA 3ILTB 3LR1A 2ABHA 3FVOA 3T22A 1YAEA 2O7UA 2QS2A 2VD3A 4KYSA 2B3FA 1VE4A 1SW4A 3VV5A 2RKMA 4OETA 3T9VA 3EHUA 3IB0A 2DVCA 4Q0CA 2GHAA 4U23A 5BUUA 4LVQA 1LAXA 2RC7A 1LSTA 2ALUA 1I6AA 1EU8A 2F7BA 3L6HA 3EHSA 1P99A 4IGTA 1D3KA 4N13A 1B3FA 1JVXA 1QKAA 4LZ7A 3TMGA 2FYIA 5I58A 4IO2A 1PC3A 4G68A 4IO5A 5ITOA 1RYOA 3OEMA 5TPAA 1OLAA 2ZXTA 3FV1A 5ITPA 1NNFA 5KZTA 2QS1A 1MQHA 2GH9A 2XXIA 3BBRA 1N0TA 3UK4A 5B70A 1FCKA 3PD9A 1MQJA 4NMYA 3TTLA 1AMFA 5HPQA 3HSTA 1JVYA 1Q1KA 2RINA 1UTHA 1NH7A 4EQ7A 4OFJA 1ZU0A 3DP4A 3QUJA 1JEUA 1SBPA 2O51A 2Y7WA 3H6WA 3MC2A 4QFLA 4FAJA 4PP0A 2E0SA 4TLMB 1N3WA 3TELA 1AH5A 1IUDA 1Z7NE 3QSLA 2O68A 4P0IA 3MWBA 1YTVA 2D5WA 2D3IA 2THIA 1Y3PA 3AXFA 2NOOA 3B6TA 3O97A 3CI8A 4P0GA 4R9FA 3OD7A 3VVDA 2WKYA 3KG2A 2IA4A 5EHSA 2B65A 4C1TA 2X26A 4F3GA 4G4PA 4BLAA 1P1NA 1A54A 3H6VA 4YMBA 4R6KA 3PUXE 1ZLQA 4PQJA 1JEVA 3K02A 4RA1A 4TLLB 3C35A 3HHGA 3KEIA 1QULA 2F35A 2HXWA 1FTKA 1P1UA 2V3QA 4XKNA 1IXIA 1I6BA 3ILUB 1MM6A 1JW5A 5CM6A 5I2KB 1PBPA 3C32A 4UA8A 4FATA 3S9LC 2RC9A 4NF5A 2DWHA 2HZKA 1URSA 2OZZA 2X7PA 4C1UA 1SQYA 2XXYA 3O2AA 4R2FA 4XKPA 1QUIA 3OO6A 4IO7A 4NWCA 2AL4A 1MG1A 4YB5A 3HV1A 3TTKA 3O29A 1Y1MA 3JYRA 3S9NC 4X48A 1DTZA 3K6UA 5CBRA 1SW5A 2I6EA 4Q30B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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