The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
92
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sequence length |
274
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structure length |
274
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Chain Sequence |
DPWQECMDYAVILARQAGEMIREALKNEMDVMIKSSPADLVTVTDQKVEKMLMSSIKEKYPCHSFIGEESVAAGEKTVFTEQPTWVIDPIDGTTNFVHRFPFVAVSIGFLVNKEMEFGIVYSCVEDKMYTGRKGKGAFCNGQKLQVSQQEDITKSLLVTELGSSRKPETLRIVLSNMEKLCSIPIHGIRSVGTAAVNMCLVATGGADAYYEMGIHCWDMAGAGIIVTEAGGVLMDVTGGPFDLMSRRIIAANSITLAKRIAKEIEIIPLQRDDE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase
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| source organism |
Mus musculus
|
| publication title |
Cloning, Expression, Purification, Crystallization and X-Ray Analysis of Inositol Monophosphatase from Mus Musculus and Homo Sapiens.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
INOSITOL MONOPHOSPHATASE 1
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| total genus |
92
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| structure length |
274
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| sequence length |
274
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature |
ec
3.1.3.25: Inositol-phosphate phosphatase. |
| pdb deposition date | 2012-04-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00459 | Inositol_P | Inositol monophosphatase family |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Fructose-1,6-Bisphosphatase; Chain A, domain 1 | Fructose-1,6-Bisphosphatase, subunit A, domain 1 | ||
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 | D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1FPD A; 1LBY A; 1FPL A; 1RDZ A; 3BIG A; 3KBZ A; 1FPB A; 3BIH A; 1NV3 A; 4GX4 A; 1G0H A; 2OX3 A; 2WEF A; 1DK4 A; 1G0I A; 4KXP A; 1NV6 A; 3D1R A; 5I3S A; 5A5L A; 5LDZ A; 1FRP A; 1FPK A; 5ET5 A; 4GX3 A; 2CZK A; 2DDK A; 1IMB A; 5EQ9 A; 3KC1 A; 1NI9 A; 2FBP A; 5EQA A; 4I40 A; 5EYH A; 1EYK A; 1NV5 A; 4GBW A; 2FIE A; 1RDY A; 2GQ1 A; 2HHM A; 1FPG A; 4O7I A; 2P3N A; 4GWU A; 1NV0 A; 1KZ8 A; 1LBX A; 3A29 A; 4N81 A; 1BK4 A; 1DCU A; 1YZ0 A; 1FPJ A; 1LBZ A; 1IMF A; 4GWW A; 2QVR A; 1NUX A; 5T3J A; 4GWY A; 1FSA A; 1Q9D A; 4AS5 A; 2VT5 A; 1FBH A; 5EYG A; 1IMD A; 2Q74 A; 3IFA A; 4GWS A; 1K9Z A; 4GBV A; 4QXD A; 3T0J A; 1NUY A; 4HE0 A; 4H45 A; 4GWZ A; 2CZH A; 3RPL A; 3RPL B; 1LEV A; 3LV0 A; 4G61 A; 5ET8 A; 2WBD A; 2CZI A; 1INP A; 1FBG A; 5DW8 A; 1KA1 A; 3RYD A; 1NV2 A; 2QVU A; 1FBP A; 3ROJ A; 3IFC A; 5J16 A; 3KC0 A; 1DBZ A; 1EYJ A; 5IZ3 A; 4IR8 A; 2JJK A; 5IZ3 B; 5EQ7 A; 1FBC A; 2F3D A; 4FBP A; 2Y5L A; 1FBE A; 1QGX A; 4MJO A; 1NV1 A; 1VDW A; 1IMA A; 2F3B A; 1NUW A; 4AS4 A; 1FPE A; 1XI6 A; 1LBV A; 1NV7 A; 2BJI A; 1D9Q A; 1FBF A; 1NV4 A; 2R8T A; 2FHY A; 3QMF A; 2QVV A; 5ESY A; 1FJ6 A; 5FBP A; 1YYZ A; 2FVZ A; 1FPF A; 4GWX A; 5EQ8 A; 1KA0 A; 2WBB A; 4I3Y A; 1CNQ A; 1FBD A; 1IME A; 2FIX A; 2P3V A; 3FBP A; 5IZ1 A; 4H46 A; 1JP4 A; 2OWZ A; 1NUZ A; 5ET6 A; 1IMC A; 1FTA A; 1RDX A; 4HE1 A; 1FPI A; 1SPI A; 4HE2 A; 1AWB A; 4HXV A; 2Q8M A; 1K9Y A; 1LBW A; 4PTK A; 3LUZ A; 2PCR A; 1FJ9 A; 4I3E A; 5ET7 A; 3B8B A; 5F24 A; 2QFL A; 4GX6 A; 1YXI A; 1EYI A; 2Y5K A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1H3D A; 2B3F A; 4KQP A; 4X48 A; 2F36 A; 4PE3 A; 5K2Y A; 1MS7 A; 1I6B A; 4NF6 B; 2Z8F A; 3CRB A; 3VVE A; 4DLD A; 1MH4 A; 3TKD A; 5EQ9 A; 2RCA A; 3FJ7 A; 1VE4 A; 3LBS A; 2F8D A; 1B3F A; 2B4M A; 1SQY A; 1FPJ A; 3LR1 A; 5FHN A; 2Z22 A; 5T3J A; 3UIF A; 3ODB A; 5I2N B; 3PTY A; 1DTG A; 1N3W A; 2F34 A; 4XKN A; 3WAF A; 3KOT A; 5DW8 A; 1N7X A; 3DLN A; 5J16 A; 2Q9T A; 1JW1 A; 3ZKL A; 2HXR A; 4JVC A; 4ZZE A; 4U1O A; 3FJG A; 4OEN A; 4JVD A; 3VLU A; 5TP9 A; 5H8H B; 1A8F A; 2O84 X; 1IMA A; 3G3H A; 2F7C A; 1A99 A; 2R8T A; 5FHO A; 5CBR A; 2X7P A; 1XVY A; 2XXV A; 3OO6 A; 2I58 A; 2Z8D A; 3KGC A; 1ZU0 A; 4F39 A; 3K6V A; 3S9N C; 4P3L A; 1RDX A; 2VD2 A; 4KCD A; 3A3C A; 1UIV A; 3DP6 A; 3DM0 A; 3TQL A; 4XKP A; 1LST A; 4R6K A; 2GFE A; 1LBY A; 1B1H A; 1FPL A; 3U92 A; 3ZS6 A; 1IZ1 A; 5CMC A; 3IR1 A; 5L9M A; 1NV3 A; 3OO9 A; 4GX3 A; 3KSJ A; 3K4U A; 3K6W A; 3KC1 A; 3K0V A; 4YMB A; 1LB9 A; 3VXB A; 3IJO B; 1GGG A; 4M1V A; 4BDM A; 3CSB A; 3RPW A; 1BK4 A; 2M8C A; 2XXI A; 3JV9 A; 4LVQ A; 1NNT A; 1IMF A; 4GWW A; 3QXM A; 2F6G A; 3SER A; 4KD5 A; 3HN0 A; 3MST A; 2DYX A; 4JWX A; 4YKP A; 4N13 A; 4DXC A; 4ZZA A; 1J1N A; 3IK6 B; 3O6I A; 4OWD A; 4NX1 A; 3Q26 A; 2XXP A; 4X8R A; 3D4G A; 4P0G A; 1O7T A; 3TFL A; 3T93 B; 1A55 A; 1MXV A; 1NNP A; 2D3I A; 1EYJ A; 3EF7 A; 3K00 A; 4GWO A; 1NL5 A; 2WYK A; 4IO7 A; 4ECF A; 1Y9U A; 3EQ1 A; 5AA3 A; 5F7V A; 1TT1 A; 4YU0 A; 1FBF A; 2UVG A; 1YAE A; 1FQD A; 2Z23 A; 3Q29 A; 1IXH A; 4ZS9 A; 5FBP A; 1MXZ A; 4JBZ A; 4NF5 B; 1VSO A; 3RT8 A; 5JTY B; 5H8Q B; 3IB1 A; 1NNF A; 2VOZ A; 5TU0 A; 3B6W A; 1IMC A; 3RTW B; 1R9L A; 1FTA A; 4Q5T A; 2NVU B; 1P1O A; 5ELV A; 2PVU A; 3O66 A; 1LBC A; 1LAG E; 4MFI A; 5I3S A; 1DMB A; 2Q2C A; 2PT1 A; 4UAB A; 1T0K A; 1F9B A; 1B1X A; 3DP4 A; 1SYI A; 3N94 A; 1ZJL A; 4QFN A; 1ZTY A; 1B7H A; 1NNK A; 3W9V A; 3TCG A; 1MQI A; 1LBZ A; 1UIU A; 4ZEK A; 2ANJ A; 5B7D A; 5DEX B; 4BDQ A; 3RNN A; 3OSQ A; 2NOO A; 4G68 C; 1LCT A; 5I57 B; 3T0J A; 4G8M A; 3EPE A; 4KYE A; 3UA8 A; 1LEV A; 3V89 B; 2ONR A; 3G3J A; 2KLF A; 1AL3 A; 4DXB A; 1JNF A; 4YKI A; 2A5T B; 2JJK A; 2CMO A; 1HSJ A; 4FBP A; 4ZE8 A; 5I2N A; 5F1Q A; 4MJO A; 4NE4 A; 3K02 A; 1MXY A; 3FVG A; 2CEX A; 4WEP A; 3RN8 A; 3MC2 A; 2H4I A; 1B51 A; 2PFZ A; 2XXQ A; 4MF3 A; 4FED A; 4ELR A; 4FJP A; 2OWZ A; 2XXY A; 4EQ9 A; 3HPI A; 1TXF A; 4HE2 A; 2AL4 A; 5I2K B; 1PB9 A; 4EF2 A; 4JWY A; 1ZIU A; 3PMW A; 4POW A; 2V84 A; 3U65 A; 4QFP A; 4PBH A; 1RDZ A; 4RK9 A; 4LP2 B; 4N15 A; 2PYY A; 4PAF A; 2DDK A; 1PB7 A; 3N5L A; 1NI9 A; 2FBP A; 3FVO A; 4YAH X; 1RDY A; 4RYA A; 1NV0 A; 1QUI A; 2XWO A; 2Y7R A; 4Z7E A; 2HCA A; 2RF1 A; 3M3L A; 1ZMG A; 2F7B A; 1B3L A; 1JVX A; 2REG A; 3A09 A; 1JEU A; 3AXF A; 3CI8 A; 3IO6 A; 3IB2 A; 4HS7 A; 3CFZ A; 1M5D A; 4F1Y A; 1POT A; 2O6A A; 4N4U A; 1PEB A; 3PUV E; 2WBD A; 2UVH A; 4N07 A; 1B05 A; 3W15 C; 5IZ3 A; 3ZSF A; 1MXW A; 1QJM A; 4IGR A; 1CB6 A; 5TP9 B; 4TOZ A; 2F5X A; 3PPR A; 1VDW A; 4C1T A; 3ISP A; 4XEQ A; 2BJI A; 1KWH A; 3W9W A; 2QVV A; 5EHS A; 3E78 A; 5H8F A; 1FJ6 A; 4F3G A; 2GHB A; 2UVJ A; 4GF8 A; 2OWT A; 2FYI A; 4R6H A; 2E1S A; 1H43 A; 3CR9 A; 4PAI A; 3IOU A; 3HHF A; 3T1B A; 4MEV A; 1RYX A; 5DVJ A; 3FGS A; 5I58 A; 4I9D A; 3T9U A; 4H65 A; 2ZNS A; 2H9B A; 3FXU A; 3I5O A; 3OO7 A; 1EYI A; 3USD A; 1B32 A; 4NF5 A; 1A54 A; 1M5F A; 5JTY A; 2YJP A; 3T9V A; 1DK4 A; 1UTH A; 2D5W A; 5LDZ A; 2PBW A; 2ZNU A; 1FPK A; 1SYH A; 2VPN A; 2O7I A; 2F6P A; 4ZED A; 3V83 A; 3O6G A; 2FIE A; 2RC8 A; 4MHF A; 3S9E A; 2B3B A; 4GL0 A; 1B58 A; 3O28 A; 4OVT A; 2QJE A; 1LAX A; 2QS1 A; 3KZG A; 3UK4 A; 5JEI A; 2D21 A; 4ELQ A; 1M5B A; 1B4Z A; 3LSX A; 3VXC A; 1NV2 A; 4LA9 A; 2VPO A; 4MAG A; 1DSN A; 3C34 A; 4QF9 A; 4ESW A; 3Q28 A; 1II5 A; 2XX9 A; 4HW8 A; 1JET A; 2WKY A; 4OEV A; 4NWD A; 3K1N A; 4PCD A; 4YZZ A; 2G29 A; 4P1E A; 5J1D A; 3BFT A; 2MKZ A; 1SI0 A; 4Q8R A; 1FPF A; 2H25 A; 1KA0 A; 4NF4 B; 1CNQ A; 1OMP A; 2I4C A; 3BBR A; 4I8C A; 4PET A; 1NUZ A; 4FEB A; 4RPO A; 4HCY A; 4NMY A; 2H99 A; 3K6U A; 3FAS A; 3PU5 A; 1IXI A; 4R72 A; 1G0I A; 4IO6 A; 1FCK A; 4OXV A; 4G4P A; 1MY1 A; 2XWV A; 4C0R A; 1SW2 A; 4N6K A; 5I2K A; 3FV1 A; 1R1N A; 4MBP A; 3K6X A; 1MG1 A; 3MAM A; 1DCU A; 4QSD A; 1GV8 A; 2DVZ A; 4JVI A; 1P99 A; 1MH3 A; 1QUL A; 1I6Q A; 1MY3 A; 4HE0 A; 3QUJ A; 4U21 A; 2IEE A; 1IXC A; 3IOR A; 3LV0 A; 2Z8E A; 3FUZ A; 2QMX A; 2HAV A; 3IFC A; 3E9X A; 3TTK A; 5EQ7 A; 3ILT B; 3PPP A; 3KFM A; 1BTJ A; 2P1S A; 4YB5 A; 3PPN A; 3TDJ A; 3M8U A; 2PFY A; 3PD9 A; 4R2B A; 4F29 A; 1NMU A; 4IO4 A; 2ZZV A; 4XKR A; 1AOV A; 3H6W A; 1ZBM A; 5EQ8 A; 2OWS A; 1EZ9 A; 1B2H A; 4RPN A; 4GQO A; 2YLN A; 2RC9 A; 4XXU A; 1B0H A; 4PFU A; 5AA2 D; 2P0S A; 3FJM A; 4OVP A; 4ZE9 A; 2OBG A; 1LBW A; 5ET7 A; 4F3B A; 5F24 A; 2QFL A; 3IJX B; 2ALU A; 4F2O A; 4X9T A; 3TCH A; 4MIJ A; 4P56 A; 4R73 A; 4EQ7 A; 2XWK A; 3D1R A; 4G8N A; 5CMB A; 1AIV A; 1EU8 A; 2CZK A; 2OLB A; 5EYH A; 1HSE A; 1B6H A; 2OJT A; 2P3N A; 1KZ8 A; 2I49 A; 4DI4 B; 4ZDM A; 1MQJ A; 4QFL A; 2QSX A; 2QVR A; 1SW1 A; 1N0T A; 3CHG A; 4JSD A; 4ZEF A; 5EYG A; 3OO8 A; 3TTR A; 1NH7 A; 3OEK A; 2XA5 A; 5IZZ A; 2XD3 A; 3F11 A; 3IO4 A; 4MLV A; 4X1D A; 1USY H; 2HFB A; 2UXA A; 3RLF E; 3VLW A; 5I5P A; 5CRY A; 5IAI A; 4YKK A; 3NOH A; 2Q89 A; 4PFB A; 5IZ3 B; 3VVF A; 2F78 A; 2XXT A; 1PBP A; 2Y5L A; 3PD8 A; 4F19 A; 1B52 A; 5CC2 A; 1QGX A; 3UN6 A; 1NUW A; 4EF1 A; 3QAX A; 4PFT A; 5CM6 A; 4R9F A; 4O3B A; 5H8F B; 1MM7 A; 2X26 A; 1D4N A; 1B40 A; 1HSL A; 4MH5 A; 1VR5 A; 4N6D A; 2HZK A; 1MDP 1; 1IME A; 3UGW A; 4LQ2 A; 4WED A; 4O8M A; 3VV5 A; 5FTH A; 1EZP A; 4NG7 A; 4NF0 A; 4HXV A; 3LUZ A; 1WOD A; 5I58 B; 4PF8 A; 4LUB A; 1YXI A; 1OLC A; 4F1U A; 2Y7W A; 3ILU B; 2WYP A; 3GBA A; 2VP1 A; 4NF4 A; 4GL8 A; 5H8S A; 4DXU A; 3MW0 A; 5A5L A; 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