2G29A

Crystal structure of the periplasmic nitrate-binding protein nrta from synechocystis pcc 6803
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
385
structure length
385
Chain Sequence
b'NAPEVTTAKLGFIALTDAAPLIIAKEKGFYAKYGMPDVEVLKQASWGTTRDNLVLGSASGGIDGAHILTPMPYLITMGTVTDGKPTPMYILARLNVNGQGIQLGNNYKDLKVGTDAAPLKEAFAKVTDPKVAMTFPGGTHDMWIRYWLAAGGMEPGKDFSTIVVPPAQMVANVKVNAMESFCVGEPWPLQTVNQGVGYQALTTGQLWKDHPEKAFGMRADWVDQNPKAAKALLMAVMEAQQWCDQAENKEEMCQILSKREWFKVPFEDIIDRSKGIYNFGNGQETFEDQEIMQKYWVDNASYPYKSHDQWFLTENIRWGYLPASTDTKAIVDKVNREDLWREAAQALEVPADQIPSSPSRGIETFFDGITFDPENPQAYLDSLKI'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Atomic structure of a nitrate-binding protein crucial for photosynthetic productivity
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nitrate transport protein nrtA
source organism Synechocystis sp.
molecule tags Transport protein
total genus 135
structure length 385
sequence length 385
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-02-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13379 NMT1_2 NMT1-like family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2g29A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2g29A01
3MC2A 3PUYE 2R71A 3H03A 1UIVA 2AYSA 1YPNA 4F22A 1B46A 2E1SA 4HS7A 2O1LA 1RYXA 4P0GA 4GWOA 3TQLA 3K1MA 3PV0E 4P0IA 3T9HB 5L9OA 4N13A 1Y4CA 1FQCA 2XXIA 3C35A 2XX8A 4RJZA 3QSLA 3MZ9A 1EU8A 2ZNTA 4F39A 2DVZA 3ZKKA 1H76A 3O29A 3AXFA 1R9LA 3MVYA 2B65A 3OEMA 4OEVA 1Z7NE 1B4HA 1B32A 1R9QA 4AQ4A 2NVUB 4FIMA 1NH8A 3K6WA 4XKRA 3PPRA 4LQ2A 2ONRA 4ZZAA 1XC1A 2I49A 3IR1A 5CMKA 5CMMA 1MQHA 3N6TA 4QFLA 3M3FA 4EF2A 4POWA 5AA4A 3CRBA 2D21A 1B3LA 2GHAA 2DP8A 1MM6A 5KDTA 3C32A 1XVXA 4NF5A 2QS1A 3EHSA 4OFLA 3VLVA 1LB8A 3TELA 3KEIA 2F36A 3PUXE 3V83A 1SW5A 2X7PA 2ZYMA 4EXLA 4WKMA 1YTVA 2XXXA 1B5HA 4GL0A 1SYHA 5CMBA 1MXYA 5DEXA 1UTBA 4IGRA 2OWSA 2ZYKA 5I58A 5FHMA 3W15C 3MPLA 2O68A 4MF3A 3H6VA 5H8NA 1LLSA 3TDJA 1POTA 1TT1A 4F3BA 4F31B 1SW1A 5TPAA 4KYEA 3TTNA 2DYXA 4NF6A 2YLNA 5AE4A 1PB9A 3SEXA 5JEIA 4G68A 4G77A 4DLDA 4Z7EA 5A5XA 1ZTYA 1TFAA 3L6GA 1Y20A 3VFJA 2A5TB 1VE4A 2UXAA 1UTHA 3CFLA 1FQFA 4AB6A 2O7IA 5I57B 3PPPA 3Q27A 4ZS9A 2W7YA 3DP8A 1P1OA 1VFDA 1I6AA 2Q2CA 4OEUA 5L9MA 3EF7A 1M5DA 1I6QA 1ANFA 5FHOA 5AA2D 2QS4A 5ICTA 1ZBMA 3BKIB 5TP9A 1CE2A 2XXVA 3OENA 2RF1A 4ZE8A 4XXUA 2OJTA 1MH4A 1UQWA 2Q89A 3IJOB 1B0LA 2DWAA 5CBSA 2XX9A 5CMCA 2XXYA 3UGWA 3VLUA 4KR5A 2I3WA 2DSFA 4IO7A 4MH5A 1QW0A 1LAFE 5H8HA 1Q1KA 3MUQA 4U1OA 1NL5A 3LSXA 1JW4A 1CB6A 2ALUA 3TCHA 4LP2B 1TXFA 4HW8A 4OFOA 4PFYA 4WEDA 5DVIA 3S9MC 2IA4A 1DMBA 3OO8A 4X1BA 1YAEA 4JB7A 3GZGA 3MVZA 3PPQA 5I59A 3PUVE 3TZAA 1TWYA 4F1YA 5ICQA 1US4A 4I9DA 3PMXA 4OESA 1DPPA 4NF4A 4G8MA 1O63A 2Q9TA 3RT6B 4BDLA 4PE5B 1B3HA 2V25A 2Z8DA 2NOOA 3OOAA 4H5GA 2OLBA 5FHNA 2UYEA 3WAFA 4ELQA 5F7VA 3VLWA 2BJJX 4RYAA 3LSLA 1OIBA 4R75A 4MFIA 1SDXA 4N07A 3TPAA 1XVYA 4LA9A 1B5IA 3PUZE 1MDQA 3QIMA 4GOTA 3TUSA 1ATGA 1HSLA 4BDRA 2VHAA 3IOTA 1OQGA 1MY2A 2H99A 2DXYA 1FQEA 4OERA 4YZZA 3TTRA 4FAJA 1MG1A 1MXXA 1PB8A 5JK4A 3QAXA 1Y3NA 3QXMA 3TEPA 4JXIA 5I56A 3C33A 1MY4A 4LONB 1LCFA 1IQ7A 3S9LC 2XXRA 2H25A 4Q8RA 5HBCA 2H5YA 4LQ5A 2O69A 2P0SA 3CI8A 3IB1A 2OBGA 1BLFA 2NWJA 1O64A 3ECRA 4XKPA 3FZVA 4DXCA 3MP1A 1S7YA 1SQYA 2A5SA 4ZEBA 3S4UA 3V89B 1RYOA 3K6XA 4I1DA 5I2KA 2UVIA 2DWJA 4HTGA 1XS5A 3U92A 3IOWA 4BDMA 1EZ9A 4YKPA 4JBZA 2XXTA 5LOMA 2RC7A 2Y7IA 3IO6A 1B2HA 4M1VA 4NF8B 3VVEA 3I5OA 4GFRA 2NXOA 1LFIA 1SBPA 5KCJB 1AMFA 3H6TA 4YKKA 2DE2A 4ISUA 1A8FA 4OMBA 5EYFA 4E0WA 1QJMA 4JWYA 1N76A 4R6HA 3RTFB 2GH9A 1IXCA 2NUVA 3ONMA 2ZNSA 2O1MA 2Z22A 3IX1A 3KN3A 1MQGA 2O7UA 3JV9A 3T9UA 4ND9A 1II5A 3UP9A 4FECA 1QULA 2UYFA 5H8SA 1R6ZA 2Z23A 3G3GA 4G8HA 1LSTA 1LAGE 1O7TA 4FE8A 1UIUA 5JTYB 4OWDA 1FTLA 4DXUA 2QS2A 4X1DA 3MP8A 4JWXA 4OETA 3QK6A 1B3GA 2I0BA 3FVOA 3VV5A 1KWHA 1A55A 1ZU0A 4KI0E 1MXZA 1URSA 2X7QA 3KOSA 5F1QA 2HAUA 4BLAA 4MLVA 2V84A 1Q35A 2YJPA 1S9TA 3LC8A 4R6KA 2AL5A 1H44A 1JQFA 1MXUA 3LR1A 4IGTA 2DOJA 2A5TA 1EZOA 3PMVA 3U93A 2Q88A 1ELJA 4NEDA 2FA7A 3KG2A 1B05A 5I57A 1P1UA 1H45A 1OVTA 2HZKA 1NNFA 1US5A 3IJXB 1EZPA 3IB0A 1HSEA 4F19A 2REGA 4RXLA 4YMAA 4ESXA 4QFPA 4EQBA 4KQPA 4C1TA 1LFHA 1AOVA 4U22A 1L5TA 4EQ7A 4QSCA 4RNSA 2XD3A 3K01A 1MQIA 1NFTA 2QJEA 3QYTA 2VD3A 4ZEFA 3R26A 5H8QB 1A99A 1F9BA 4NMYA 1AH5A 3C4MA 1JEVA 3O97A 4LATA 3G3IA 1Y3QA 1AIVA 1URGA 2XXPA 3G3FA 5DTBA 2H4IA 4H8JA 1Y3PA 4GD5A 4GVOA 1RKMA 4Z0IA 1LAHE 4RPNA 3SEWA 3TQWA 1Y4TA 4LVQA 2PBWA 1MY1A 4TLMB 4YKIA 4XIGQ 4L17A 4F1VA 1OLCA 3C9HA 3TTLA 2IEEA 3IL1B 3KN8A 4HCYA 2E0SA 1SI1A 5CBRA 4YMBA 1N84A 3OXNA 4YAHX 5IKBA 3TODA 3N6UA 3OELA 2ZMBA 4H6DA 4OTEA 4ZEDA 2XHDA 3FIRA 2OWTA 1PC3A 2HZLA 1MH3A 3UORA 4PFTA 4QSDA 2F35A 3E9XA 3B6TA 2V3QA 1MY0A 1MDP1 2H9BA 1AL3A 1LGBC 1LBCA 5CM6A 3B6QA 3RY3A 1P99A 2F7CA 1OLAA 3S9NC 2XX7A 2DWIA 1JVXA 1ZKBA 2RKMA 1IUDA 5EHMA 3K02A 3CFXA 3MBPA 1XT8A 1B3EA 2CZLA 3CG1A 3G3JA 2LAOA 5KDTB 1ZIUA 1B52A 2KLFA 3OSQA 2R6GE 3OMBA 3KSXA 4GLIA 1POY1 2RC9A 1QKAA 3FVKA 1JVYA 1IXIA 4IO3A 4I62A 2QSXA 1QVSA 5H8FB 1ZMGA 3A3UA 3IB2A 1I6BA 4TLLB 5DVFA 5I58B 3C31A 2REJA 3D4GA 4JSDA 3RN8A 5H8NB 4IO6A 1D3KA 2O84X 3TCFA 3K6UA 4KYSA 2D3IA 3DLNA 3A09A 2FYIA 5KZTA 1B58A 2Y7RA 5TPAB 1SW4A 3BFUA 5EHSA 1OQHA 3E3KA 4NE4A 3Q25A 3KJ7A 4OZ9A 4EXKA 2ZXTA 3Q28A 4G2ZA 3KBRA 2XXUA 3PPNA 4ESWA 2F97A 4H5FA 3H7MA 3RT8A 3O2AA 1UTHB 5AA2B 1B40A 1USYH 4ZECA 1LAXA 1PB7A 4GXAA 3IO4A 1VFEA 1B4ZA 1XHYA 4EQ9A 3C36A 3R6UA 2R9JA 3U72A 3A3CA 2H98A 4OYVA 3LSFB 4R9FA 4U4SA 3MWBA 5J1DA 5AA3A 4GXSB 3HHGA 4R2BA 3SEUA 1NKXA 1XOCA 1SW2A 3OD7A 2ONSA 2ZYOA 3DM0A 3VXBA 5HPQA 5DYHA 1QUKA 2F6PA 4F2OA 3HSTA 3SDFA 3H4ZA 4IO5A 4U1ZA 3N26A 5FTHA 1DOTA 4U21A 3QUJA 4GIZA 4KCCA 3MVXA 3RLFE 2Q2AA 5H8HB 4OXVA 1QUJA 2ESNA 1QKBA 4U23A 1LFGA 4PP0A 4IO4A 2RC8A 3K6VA 1TFDA 3R7XA 4M4GA 4G68C 3BFTA 3KZGA 2QRYA 3E13X 4JDFA 3GXAA 3PMWA 2Y7KA 3TCGA 2D5WA 2GFEA 4Q30B 3IOUA 1SYIA 4NF4B 1NH7A 1FQAA 2P2AA 4F18A 3DP6A 2QS3A 1P1NA 4KFQA 3OSRA 4BDOA 3P7IA 4POXA 1NMUA 3SERA 1B6HA 1B5JA 2DXRA 2PT1A 2V3TA 3KN7A 3RUMA 3I6VA 3O66A 5DVJA 1MM7A 2QL3A 1WODA 4PETA 1T0KA 3S9EA 3M8UA 5ITOA 3FXQA 2GHBA 3JZJA 2PYYA 1J1NA 1NNKA 4BDNA 3O9PA 5L9SA 2OK2A 3H6WA 1LBBA 3FXRA 1N7WA 4EF1A 4KHZE 4IY6A 1MS7A 1N0TA 3IOVA 4ELOA 1LCTA 4F1UA 1BKAA 3HPIA 3FVGA 3OO9A 4R2FA 3FASA 3VVFA 4DCXA 3HHFA 2HCAA 4GQOA 1D9YA 3KJTA 2PVUA 2OZZA 1D9VA 1P1QA 3KOTA 3LBSA 1IXHA 4RA1A 4Q5TA 4QRZA 1NNPA 4YU0A 4RY1A 1MY3A 2AIXA 3T9XB 4H8IA 3FUZA 3UK4A 3O6GA 3IAZA 4H1XA 5HM4B 3N94A 4ZEIA 1DPEA 3FXUA 3B6WA 1USYE 1R1NA 4DDDA 4ELRA 3N5LA 3O28A 2PT2A 2QPQA 4MLQA 3E4RA 4DE8A 3OO7A 1HSJA 3EHTA 2I48A 3K0VA 3IORA 2ONKE 4DZ1A 5I84A 2V93A 5B7DA 2RCAA 2Y7WA 5I2KB 4P11A 3Q26A 3FD3A 3SEYA 5ISUA 3U94A 2DE4A 4H0WA 1JNFA 3GBBA 3T22A 5I2NB 2I4CA 3LSWA 4ONYA 3EN3A 1FQDA 1QUIA 1Y1ZA 1IZ1A 1GGGA 1FQBA 1VR5A 4TQUQ 3VE1B 4KYDA 3MJNA 4ZDMA 4ECFA 1PBPA 2ZYNA 3GBAA 4OQOA 3ZS6A 3B7DA 3EHUA 4FORA 1PEBA 4R9GA 4NWCA 4IO2A 4DCYA 4R6YA 3UIFA 1SI0A 1BIYA 3GLBA 3O6IA 3CSBA 5ITPA 4ZEKA 3OEKA 4YB5A 2PX1A 4MBPA 3DP4A 2Q8JA 1S50A 3MPKA 3L6HA 3QUFA 3CVGA 1FTMA 5H8FA 3CG3A 2QMWA 3MAMA 3TFLA 4G4PA 4F3SA 2VP1A 3PPOA 4TOZA 1JETA 5CRYA 4C0RA 2THIA 5AA1A 4EDPA 4YB7A 3K00A 3HV1A 3O6HA 1Y9UA 1A7LA 1NNTA 2ABHA 3Q29A 4GRKA 1N3WA 4H65A 2UVJA 4N6PA 3CFZA 1WVJA 1EH3A 3VDFA 1FW0A 4I8CA 1PDAA 1FTJA 2I6EA 1MPCA 1IXGA 4PFUA 2RCBA 3TAJA 4E0XA 3H3GA 2O6AA 4NTLA 3ILTB 3MZ1A 3PU5A 2VD2A 3CR9A 5AA2A 3C34A 1IIWA 3MW0A 2HXWA 1M5EA 1B7HA 3H6UA 5CI5A 3IK6B 3MQ9A 1JW5A 3ODBA 3RGYA 2F7AA 5K2YA 2XXWA 3TMGA 3MVWA 3CSGA 5AA4B 2CMOA 4G8NA 2Y84A 3W9WA 1Y1MA 1N7XA 3SESA 3EQ1A 4LZ5A 4NF5B 1ZLQA 3D4CA 3M3LA 4LZ7A 1DTZA 1MQDA 1MPBA 4R74A 5FTIA 5ELVA 3HO7A 3ZKLA 4THIA 4XKNA 4DXBA 2XXHA 2YPNA 1DTGA 4GF8A 4OFJA 4X48A 4QFKA 5DEXB 1UTBB 3PGFA 2F78A 3MZBA 1BP5A 4DIGA 3CIJA 4IB2A 2ANJA 2VGQA 4Q0CA 5TU0A 1VSOA 3THIA 1OMPA 5DT6A 3G3HA 4F3GA 2DS9A 2G29A 4O3AA 4F3PA 1SVXB 4QFNA 3K2DA 3TTMA 4U4XA 4NF6B 1DSNA 2F8DA 4QHQA 2XD2A 3OO6A 2UVHA 4G68B 4PQJA 1A8EA 2DQVA 3FV1A 3U8QA 5A5XB 3RPWA 2I3VA 3BBRA 2QMXA 4LZ8A 4OHNA 3LUYA 3EPEA 4K3FA 4FEDA 4XKQA 1MPDA 3FVNA 3JYRA 4ELPA 4FJPA 3W9VA 2AL4A 4F2QA 1IITA 3UN6A 3RNNA 4NF8A 3M3KA 2ZNUA 1JEUA 1FTOA 5KCJA 4F29A 2F6GA 1Z7ME 3T66A 1FCKA 1GTKA 2FNCA 3K4UA 1MQJA 3ILUB 3U1OA 5L8DA 1URDA 4OENA 3MP6A 3T9VA 5TP9B 3F11A 3KSJA 4NWDA 3FJGA 4WEPA 1M5BA 3KGCA 1A54A 4AB5A 3SETA 4R72A 1M5CA 3DELB 1GR2A 3H06B 3UA8A 4EUOA 2I4BA 4R73A 1N3XA 3SEVA 3USDA 1GVCA 5IAIA 2DWHA 1B1HA 4OVJA 3VVDA 2HEUA 5JTYA 2Y7PA 4QF9A 4JWOA 4X9TA 4FATA 1B3FA 3FATA 2X26A 2HQ0A 4BDQA 1B0HA 1B7ZA 2F5XA 4QSEA 2F7BA 5BWJA 2UVGA 4RPOA 4H67A 4KPTA 1MXWA 2I58A 1H43A 2VOZA 5I59B 1SD3A 2G93A 2PMSA 3S2VA 1H3DA 1ZJLA 3PUWE 3HCQA 3RQTA 4GL8A 1B9JA 2GRVA 3T96B 3KFMA 2Z8EA 4C1UA 1FTKA 1B51A 1LB9A 4UACA 3VXCA 2HFBA 5CC2A 4HCWA 3TKDA 1P1WA 3PD8A 4KD5A 4U2RA 4FEBA 1GV8A 4XTCQ 1D4NA 1B1XA 1IEJA 4YB6A 5I2NA 2O51A 3HN0A 4PFWA 3PD9A 4O3CA 2WKYA 3G3KA 1MRPA 5BUUA 2RINA 3V8XB 2B3FA 4O3BA 4QFOA 2HAVA 3TTKA 4IY5A 2B3BA 1MXVA 3I3VA 3FGSA 4RK9A 3ZSFA 1YCJA 4RK2A 2DVCA 3T93B 1JW1A 4WXJA 3WAEA 3SKPA 3FV2A 3K1PA 5H8QA 2F34A 4YKJA 1OVBA 2M8CA 5K2XA 3FJ7A 4UA8A 1WDNA 3V5AA 2P1SA 1I69A 1N04A 1BTJA 3FJMA 2V3UA 1A40A 4YICA 2I0CA 1B7UA 4KCDA 5B70A 3TYHA 1PBQA 2OCUA 4JSOA 2DE3A 1M5FA 3G7WA 4ZZEA 2XXQA 4ZE9A 4LUBA 3RTWB 3K1NA 5I56B 5M2VA 2Z8FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MC2A 3PUYE 2R71A 3H03A 1FBPA 1UIVA 2AYSA 1YPNA 4F22A 1B46A 2E1SA 4HS7A 2O1LA 1RYXA 4P0GA 4GWOA 3TQLA 3K1MA 3PV0E 4P0IA 3T9HB 5L9OA 2DDKA 4N13A 1Y4CA 1FQCA 2XXIA 3C35A 2XX8A 4RJZA 1YZ0A 3QSLA 3MZ9A 1EU8A 2ZNTA 4F39A 2DVZA 3ZKKA 2QVVA 1H76A 4PGNA 3O29A 3AXFA 4XFEA 1R9LA 3MVYA 2B65A 3OEMA 4OEVA 3LUZA 1Z7NE 1B4HA 1B32A 1R9QA 4AQ4A 2NVUB 4FIMA 4HE2A 1NH8A 3K6WA 4XKRA 3PPRA 4LQ2A 2ONRA 4ZZAA 1XC1A 2I49A 3IR1A 5CMKA 5CMMA 1G0HA 1MQHA 3N6TA 4QFLA 3M3FA 4EF2A 4POWA 5AA4A 3CRBA 2D21A 1B3LA 2WBBA 5ET7A 2GHAA 2DP8A 1MM6A 5KDTA 3C32A 5EYHA 1XVXA 4NF5A 2QS1A 1DK4A 3EHSA 1FPJA 4OFLA 3VLVA 1LB8A 3TELA 3KEIA 2F36A 3PUXE 3V83A 1SW5A 2X7PA 2ZYMA 4EXLA 4WKMA 1YTVA 2XXXA 1B5HA 4GL0A 1SYHA 5CMBA 1MXYA 4NN3A 5DEXA 1UTBA 4IGRA 1NV2A 2OWSA 2ZYKA 5I58A 5FHMA 3W15C 3MPLA 2O68A 4MF3A 3H6VA 5H8NA 1LLSA 3TDJA 1POTA 1TT1A 4F3BA 4F31B 1SW1A 5TPAA 4MEVA 4KYEA 3TTNA 2DYXA 4NF6A 2YLNA 5AE4A 1PB9A 2QVUA 5T3JA 3SEXA 5JEIA 1NUXA 4G68A 2XXKA 4O7MA 4G77A 4DLDA 4Z7EA 5A5XA 1ZTYA 1TFAA 3L6GA 1Y20A 1K9ZA 3VFJA 2A5TB 5IZ3B 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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