2H25A

Solution structure of maltose binding protein complexed with beta-cyclodextrin
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title A new strategy for structure determination of large proteins in solution without deuteration
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 70
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2h25A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2h25A01
5TPAA 3ECRA 1LGBC 1QW0A 1IUDA 1LB9A 3SEXA 1N76A 3N94A 4OQOA 2Z8DA 4KHZE 4LZ7A 1R1NA 2VGQA 2P2AA 2DVZA 4DE8A 3H4ZA 4E0XA 4U4XA 2PBWA 4P0IA 3U94A 2GHBA 3Q26A 2A5SA 2O69A 2AL5A 1XHYA 3TTLA 1LBCA 4OESA 5KZTA 4YU0A 2F6GA 1O7TA 4ELQA 3HN0A 3H6UA 1EZPA 1M5DA 1FQDA 1AH5A 1B6HA 3ZKKA 4QFLA 2H4IA 1YTVA 1ELJA 1N7XA 3V8XB 1ATGA 3MP6A 3MZ9A 1A8FA 1LAFE 5DVIA 2BJJX 4BDOA 2DE3A 2B3FA 3RN8A 4OMBA 4FAJA 3I5OA 3DP8A 3IJXB 3C31A 4HCWA 5FTIA 4EF2A 4BDLA 3W15C 2YLNA 2ONSA 4KPTA 1CE2A 3WAFA 3FV1A 3MVWA 1BKAA 4F19A 3H6WA 2O7UA 2DXYA 2Q88A 1B7ZA 2F35A 2F5XA 2A5TB 1P1QA 5FHMA 4IO5A 5FHOA 1EU8A 2F8DA 4P0GA 4EQBA 4JXIA 2ZXTA 3B6WA 4M1VA 3N26A 3MPLA 1OMPA 4PP0A 1UQWA 4I1DA 1IQ7A 3OO9A 3MVXA 1HSEA 4H8IA 1GGGA 1QJMA 2OCUA 1US5A 5CRYA 3U92A 5BWJA 1J1NA 2H99A 3SEUA 4DDDA 1AIVA 3CRBA 1P1UA 3MBPA 1UIUA 1I6AA 2RCBA 1LFHA 4XKQA 1RKMA 5I2KB 2XXWA 1KWHA 5H8NB 2NWJA 3SESA 5TP9B 4C1UA 2HFBA 4IY6A 4XIGQ 4R9FA 1PDAA 2A5TA 3FXRA 3T93B 2Q2CA 4ECFA 4R6KA 3TYHA 4WXJA 3H6VA 2G29A 1B51A 1B3LA 3QXMA 4F1YA 3D4CA 4LQ5A 4H65A 4RY1A 1OVBA 1SVXB 4H5FA 1S7YA 3M3KA 4R2FA 4OTEA 2Y7RA 1IIWA 2HAUA 3TZAA 3HCQA 2PX1A 4N13A 1D9YA 3QSLA 1LCTA 3SEWA 1FTJA 1MXWA 3PGFA 1QUIA 5I2KA 4PFYA 5H8NA 4OVJA 2O1LA 5TP9A 3CFLA 3KBRA 3IB2A 2RC9A 1SYHA 4NMYA 4RNSA 1B0HA 3IK6B 1VSOA 5H8QB 4GF8A 1UIVA 2V3UA 3T9HB 2ZYKA 2NOOA 3H7MA 4R73A 4ZE8A 1PB8A 2I3WA 1T0KA 2Y7KA 2DWIA 1Y4CA 2DVCA 3KFMA 2HCAA 1ZMGA 3F11A 1SW4A 4AQ4A 2XXPA 5IKBA 1MQJA 4EDPA 2ZNTA 2X26A 4XTCQ 3IR1A 3PMWA 5DT6A 1GV8A 1HSLA 1NL5A 3O66A 4DIGA 5AA4B 1PEBA 3I3VA 4YKKA 1B4ZA 5F1QA 5FTHA 2I0CA 3PV0E 5H8QA 3MQ9A 1TFAA 3CSGA 3PUVE 2W7YA 1DTZA 3MVZA 1XOCA 1POY1 4G2ZA 1XC1A 1ZKBA 2F97A 4QSEA 3DP4A 4ELOA 2ALUA 3OO7A 3PUWE 3VE1B 3U8QA 1B5IA 5L9OA 2UYFA 3TTMA 2H98A 1MDQA 2VOZA 4YKIA 3PPRA 4EF1A 4BDMA 3LSLA 4Q0CA 5TU0A 3BBRA 5AA4A 4KI0E 4I8CA 5B7DA 4OEVA 4RPOA 3H6TA 1QVSA 5ICQA 2ZNUA 5K2XA 1N3XA 4QSCA 1TT1A 5I59B 4KD5A 2Y84A 2PVUA 3UGWA 4KYEA 4EQ9A 2HZKA 2ZYOA 4QHQA 1MS7A 3JZJA 4FJPA 3B6QA 1ZLQA 4G68B 1JNFA 2ZYNA 3IO6A 2DWAA 1UTBB 1JEUA 1FQBA 3ILTB 1GVCA 2F7CA 2YJPA 3IX1A 2PT2A 1URDA 1B7UA 1MDP1 4G68C 4FE8A 3RTFB 4F39A 5IAIA 4DXUA 4ZECA 3KSJA 4AB5A 4F22A 4TQUQ 4XKPA 2I48A 3BFTA 4GL0A 3K00A 2VP1A 4RK9A 3C36A 4EXKA 3IOVA 3ONMA 3FVKA 2ABHA 3IAZA 3C34A 4F3SA 4Q8RA 2DE2A 5I59A 3UK4A 5AA3A 1VR5A 5EHMA 1M5FA 2QMWA 3K02A 3VLWA 3IOUA 4YB6A 2VD3A 3SEYA 2RC7A 3IO4A 2HQ0A 5JK4A 1MY0A 2QRYA 5ICTA 4IO4A 3GBBA 3VDFA 3VVFA 4QFPA 2DSFA 1UTBA 1Z7ME 3H03A 4IO6A 1H45A 4DCXA 3Q27A 2Z22A 5HBCA 3E3KA 1IXCA 4DLDA 1JEVA 3TUSA 4WEPA 4F3GA 2HAVA 4H0WA 2HEUA 1DPEA 4F29A 3W9VA 1L5TA 3C32A 4F3PA 4OFJA 1MH4A 3PU5A 4GFRA 4OHNA 1Y1MA 1MPDA 3OMBA 2QS4A 4F2QA 3PPOA 1SYIA 2REJA 4ZDMA 3HHFA 1ZBMA 4OFLA 3OENA 3QYTA 4JWXA 4ZS9A 3V83A 1LSTA 1NFTA 1OLCA 3R26A 4Q30B 3N6UA 4FEBA 3CG3A 2XD2A 5JTYB 3KEIA 5FHNA 1I69A 2GHAA 1BIYA 2OLBA 5HPQA 3OSQA 4Z0IA 4FEDA 1AL3A 5CMKA 4RXLA 1DMBA 1O63A 4OFOA 3RNNA 4XKNA 1IITA 4LA9A 3SERA 3E13X 4F18A 4YKJA 1OVTA 4GXAA 3V89B 1JVXA 1Y3PA 4NF6B 2I58A 3D4GA 3O97A 4M4GA 3CVGA 1FTMA 4U2RA 2QJEA 3HHGA 4YMBA 4FATA 4JDFA 4UACA 5JTYA 3R7XA 3R6UA 2DP8A 3FVOA 4UA8A 2RC8A 2QS3A 2F36A 4TOZA 1VFDA 3TEPA 3MJNA 1QUKA 3VFJA 5F7VA 4O3AA 4DZ1A 1QKAA 2UYEA 3UA8A 2XXRA 5ISUA 3T22A 3W9WA 1A40A 3Q29A 1WVJA 4NF6A 4ZE9A 5EYFA 3MVYA 5DEXB 1SBPA 4GVOA 3FUZA 2P1SA 2GH9A 4F1VA 1MQDA 2I4BA 5A5XB 4LATA 5CBSA 2QL3A 4LVQA 3VV5A 2NVUB 4HW8A 2DXRA 3C35A 4H5GA 4RYAA 4R9GA 3E4RA 3S9LC 4QRZA 3OELA 1MY2A 4POXA 1IEJA 2F34A 1DSNA 2Z8FA 2ANJA 4JB7A 4EXLA 5M2VA 3BFUA 1H76A 2AYSA 3IORA 1MM7A 3TTNA 5DEXA 4R74A 1H43A 2RINA 3K6XA 3LC8A 3TAJA 2UVHA 4YAHX 2R71A 1R6ZA 2O51A 4IO3A 4I62A 5A5XA 1B1XA 1MXUA 4OERA 4O3BA 3MC2A 4U22A 3T9VA 1MH3A 1AOVA 3OSRA 3PUXE 3OOAA 2DOJA 4RA1A 1EZ9A 2ZYMA 4GOTA 2F6PA 4U1OA 2DWHA 5ELVA 1FQAA 1EZOA 3H06B 4KCDA 3I6VA 3FVGA 5J1DA 3K1PA 3A3UA 4C1TA 2QMXA 3CFXA 2DE4A 3U72A 4YKPA 3PPNA 3RQTA 2OWTA 4OWDA 2XD3A 4HCYA 4GXSB 1B46A 2V25A 3L6HA 4K3FA 3TCHA 5I56B 1OQHA 4MH5A 3RUMA 3K0VA 3RGYA 3BKIB 4U1ZA 2X7PA 3IB0A 4ZEBA 1ZU0A 5ITOA 4TLLB 3PPPA 1B52A 3ZKLA 3VVEA 1IXGA 4PFUA 3EHSA 2D3IA 5BUUA 1MPCA 1YAEA 3V5AA 3HV1A 3N6TA 3C33A 3HO7A 4BLAA 2XX7A 5CC2A 4X1DA 1NH8A 4MLQA 1CB6A 2P0SA 5I57B 2ONKE 2PT1A 4DCYA 3KG2A 1IXHA 1GR2A 2OJTA 1Z7NE 4GL8A 3LSWA 4NF8B 1B40A 5I56A 2O68A 2F78A 1JW4A 5KCJB 3M3FA 3H3GA 3FJGA 4ELPA 2XXXA 2WKYA 4ZEFA 4Q5TA 2M8CA 1LAGE 2D21A 4OXVA 3AXFA 3DELB 2XXTA 3DM0A 1SI1A 1NNTA 4BDQA 1O64A 4GIZA 2I4CA 1P1WA 4OENA 4NF5B 5DVJA 4R6YA 4E0WA 1B3GA 1LAXA 3T9XB 4WKMA 3CFZA 2QS1A 4MLVA 1TFDA 3LR1A 3S9NC 1OLAA 3EPEA 4H8JA 5I57A 3TTRA 2UVGA 1NNKA 1B5HA 5AE4A 3GLBA 3LSXA 1B05A 4U21A 3JV9A 3MP1A 2Z8EA 4F2OA 4NF8A 3A09A 5KCJA 3L6GA 3G3KA 5DVFA 3IL1B 3E9XA 4FORA 4R2BA 1SW5A 4JBZA 1R9LA 3K6WA 4X48A 3TCFA 4ZEIA 3USDA 2F7AA 4XXUA 1S50A 1B4HA 3K1NA 4RPNA 4FIMA 4NF5A 3C4MA 4ZZEA 4PETA 4R6HA 3UORA 2ONRA 4PE5B 4ZZAA 4NF4B 2RKMA 4G68A 1DPPA 5DTBA 2XX9A 5K2YA 1N84A 2Q9TA 4JWOA 5I2NB 4KCCA 4MF3A 1H3DA 3RY3A 1US4A 1MY3A 1MXYA 2O6AA 3TPAA 3FVNA 3DP6A 1FTOA 3EF7A 2VD2A 3VXCA 5H8HB 4LZ5A 4JSOA 4G4PA 1M5BA 3TELA 3KN7A 2V93A 1QUJA 4X9TA 5H8FB 4N07A 2OWSA 1MRPA 3TKDA 3PMXA 3KGCA 1RYXA 1URSA 1VFEA 2AIXA 1SW2A 3G7WA 3FD3A 5CM6A 5AA2B 2FYIA 4NF4A 1P99A 2ZNSA 3T9UA 1SI0A 4FECA 3U1OA 5CMBA 2UXAA 5I2NA 1Y9UA 2GRVA 4N6PA 1EH3A 3MPKA 3VLVA 4R75A 1MPBA 3MAMA 3PPQA 2THIA 2XXVA 5CMCA 3G3GA 3O6HA 3G3JA 5H8HA 3SKPA 4I9DA 2HXWA 2XHDA 1MY4A 5H8SA 4RK2A 3CIJA 1B0LA 4G8MA 4ND9A 5H8FA 3QAXA 1XT8A 3O6IA 2Q2AA 1BLFA 3QIMA 3KZGA 3B6TA 1SD3A 1B2HA 2G93A 1RYOA 3K01A 3PD8A 5AA2A 5AA2D 3EN3A 3HPIA 2NUVA 2E1SA 4H6DA 4KYSA 5L9MA 3FATA 1P1OA 4BDRA 5CBRA 4QFKA 1USYH 4H1XA 5L8DA 1ANFA 4LP2B 2LAOA 4ZEKA 3MP8A 1FQFA 4ISUA 3O6GA 3EQ1A 2PMSA 2DYXA 3CR9A 4XKRA 5KDTB 1A55A 4ESWA 4GWOA 4GLIA 4LONB 1TWYA 3QUJA 2GFEA 2UVJA 2Q89A 1P1NA 3U93A 1PB7A 5CI5A 1LFGA 3K6VA 4TLMB 2I0BA 2VHAA 1LCFA 4NTLA 1OIBA 2XXHA 3O9PA 1I6QA 3IOWA 3KOSA 4G77A 4IGRA 4ZEDA 4Z7EA 4IO7A 1M5CA 4IO2A 3O2AA 4YB5A 3PD9A 4ONYA 4YZZA 1NKXA 3K1MA 4C0RA 2R9JA 4ELRA 1NMUA 5EHSA 4PFWA 4X1BA 3RTWB 3C9HA 4NEDA 3KSXA 5KDTA 4GRKA 3RPWA 2Y7IA 3TTKA 4OZ9A 2H25A 2H5YA 1QULA 3MUQA 3FASA 1SW1A 3ILUB 5AA1A 1DOTA 3OEKA 2B65A 1AMFA 2PYYA 3CG1A 1IXIA 1B5JA 2D5WA 3P7IA 4O3CA 3UIFA 3JYRA 3FJ7A 1Y3NA 1N0TA 1S9TA 1MXZA 1GTKA 1MQGA 4U23A 1POTA 2XXYA 4GQOA 3TFLA 3SEVA 1WODA 2F7BA 4KR5A 4EUOA 2NXOA 3THIA 3SETA 1MXXA 5ITPA 3S9EA 1URGA 1F9BA 2V3TA 3K2DA 2XX8A 1ZTYA 5LOMA 1B9JA 4OEUA 4JWYA 2DQVA 3OO6A 4DXBA 1USYE 1YPNA 4AB6A 2Y7WA 2DWJA 3M3LA 2UVIA 1LFIA 3LBSA 1QKBA 1D9VA 4H67A 3LSFB 1PC3A 4F31B 4NWDA 2CMOA 2XXQA 1DTGA 4R72A 3KJTA 3MW0A 3GBAA 5CMMA 1B3EA 5I58B 5HM4B 3OXNA 3SDFA 3Q28A 3CSBA 3GXAA 3T96B 1I6BA 4THIA 1MQHA 3FXUA 1H44A 2I6EA 1LAHE 2IEEA 2KLFA 4LUBA 4OYVA 3KOTA 1IZ1A 4G8HA 3TDJA 1ZIUA 2O7IA 3T66A 3LUYA 3G3IA 4QFNA 2Y7PA 2AL4A 3Q25A 3IOTA 1UTHB 4EQ7A 5I58A 1LB8A 2R6GE 1TXFA 3TMGA 1JVYA 1PB9A 1FQCA 4JSDA 3S9MC 4PQJA 3MZBA 3OEMA 2OZZA 4IY5A 3FZVA 5JEIA 3RT6B 3ZSFA 1B3HA 1Q1KA 1Y3QA 1Y1ZA 1Q35A 1JW5A 2FNCA 1FW0A 1JETA 1NNPA 1B7HA 1D3KA 3PUYE 1FTKA 3IJOB 2XXIA 1YCJA 3UN6A 1A8EA 1II5A 1ZJLA 4KYDA 3GZGA 2CZLA 2QPQA 1N04A 3CI8A 1SQYA 3QK6A 1UTHA 3S4UA 2H9BA 1MM6A 2QS2A 3DLNA 1MG1A 4RJZA 1WDNA 1D4NA 1A99A 3K4UA 2B3BA 2XXUA 1XS5A 3VVDA 1OQGA 1PBPA 4HS7A 3FIRA 3KN8A 2OBGA 2O84X 1A54A 2O1MA 1B58A 4NE4A 1FQEA 3EHUA 3MZ1A 1NH7A 1NNFA 1M5EA 1VE4A 5B70A 1JQFA 2QSXA 4LQ2A 3IB1A 4QF9A 4QFOA 2YPNA 1N3WA 4P11A 1N7WA 4HTGA 3O29A 3PMVA 3FV2A 4QSDA 3VLUA 2Z23A 3EHTA 3TQWA 4WEDA 3TODA 2I3VA 5I84A 3UP9A 3N5LA 1B32A 1PBQA 3RT8A 4YB7A 3ZS6A 3MWBA 4PFTA 3WAEA 1BTJA 3FXQA 2RF1A 1MXVA 4F1UA 3ODBA 1JW1A 4MFIA 1Y20A 2FA7A 4BDNA 1FCKA 3B7DA 3QUFA 3FGSA 5DYHA 3M8UA 3TQLA 1B3FA 4POWA 1FTLA 2Q8JA 4NWCA 1XVXA 2RCAA 2IA4A 3G3HA 3PUZE 2I49A 2ZMBA 3A3CA 4YMAA 4IGTA 1R9QA 4IB2A 1A7LA 5TPAB 2V84A 2ESNA 4DXCA 4F3BA 5L9SA 4OETA 1SDXA 3KJ7A 4MBPA 2V3QA 1Y4TA 4LZ8A 2DS9A 1MY1A 2OK2A 2REGA 4ESXA 1HSJA 3FJMA 2E0SA 3K6UA 3S2VA 3VXBA 3TCGA 4GD5A 3RLFE 3HSTA 2HZLA 3KN3A 1B1HA 4KQPA 4L17A 1MQIA 1XVYA 4YICA 1BP5A 1LLSA 4G8NA 3OD7A 4KFQA 1LBBA 3G3FA 3O28A 2X7QA 4U4SA 3OO8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5TPAA 3ECRA 1LGBC 1QW0A 1IUDA 1LB9A 3SEXA 1KA1A 1N76A 3N94A 4OQOA 2Z8DA 4KHZE 4LZ7A 1R1NA 2VGQA 2P2AA 2KR0A 3RYDA 2DVZA 4DE8A 3H4ZA 4E0XA 4U4XA 2PBWA 2PCRA 4P0IA 3U94A 2GHBA 3Q26A 2A5SA 2O69A 2AL5A 1XHYA 3TTLA 5ET8A 1LBCA 4OESA 5KZTA 5ESYA 4YU0A 2F6GA 1O7TA 4ELQA 2Y5LA 3HN0A 3H6UA 1EZPA 1M5DA 1FQDA 1AH5A 1B6HA 2WYPA 3ZKKA 4QFLA 2H4IA 1YTVA 1ELJA 1N7XA 3V8XB 1ATGA 3MP6A 3MZ9A 1A8FA 1LAFE 5DVIA 2BJJX 1FPKA 4BDOA 2DE3A 2B3FA 3RN8A 4OMBA 4FAJA 3I5OA 3DP8A 3IJXB 3C31A 4HCWA 5FTIA 4EF2A 4BDLA 3ROJA 3W15C 2YLNA 2ONSA 4KPTA 1CE2A 3WAFA 3FV1A 2XA5A 3MVWA 1BKAA 4F19A 3H6WA 2O7UA 2DXYA 2Q88A 1B7ZA 2F35A 2F5XA 2A5TB 1P1QA 5FHMA 4IO5A 5FHOA 1EU8A 2F8DA 4P0GA 4EQBA 4JXIA 2ZXTA 3B6WA 4M1VA 3N26A 3MPLA 1OMPA 4PP0A 1UQWA 4I1DA 3T1BA 1IQ7A 3OO9A 3MVXA 1HSEA 4H8IA 1GGGA 4N91A 4QBAA 1QJMA 2OCUA 1US5A 5CRYA 3BIGA 3CHGA 3U92A 5BWJA 1J1NA 5I7IA 2H99A 1FJ6A 3SEUA 4DDDA 1AIVA 3CRBA 3E78A 1P1UA 3MBPA 1UIUA 3B50A 4NGUA 1G0IA 1I6AA 2RCBA 4GWWA 1LFHA 4XKQA 1RKMA 5I2KB 2R8TA 2XXWA 1KWHA 4FBPA 2NWJA 5H8NB 3SESA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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