3G7WA

Islet amyloid polypeptide (iapp or amylin) residues 1 to 22 fused to maltose binding protein
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
393
structure length
393
Chain Sequence
MKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAKCNTATCATQRLANFLVHSSNN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Atomic structures of IAPP (amylin) fusions suggest a mechanism for fibrillation and the role of insulin in the process
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein, hormone
source organism Escherichia coli
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, Islet amyloid polypepti
total genus 123
structure length 393
sequence length 393
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g7wA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g7wA01
1PC3A 1O7TA 1JW1A 1MDQA 5AE4A 4X1DA 2XD2A 3IOVA 1XHYA 3FV2A 1WDNA 4GL0A 4QFPA 3D4GA 3S9EA 5CMBA 3THIA 2VGQA 1UTBB 3GZGA 4QF9A 1DPEA 1FW0A 1MPDA 4KQPA 3EPEA 1N3WA 3K1MA 3TTRA 3SERA 3E4RA 1R9QA 4G4PA 4IB2A 2QMWA 1BP5A 1FQDA 3S9LC 1MXVA 1R9LA 4F1UA 2VD3A 3TTNA 3TTMA 4N07A 4F31B 4YICA 2D21A 2ZYNA 1SW4A 4ZE8A 2Y7WA 1MPBA 4ZZEA 4U4SA 3MP1A 1LFHA 1NH7A 4MBPA 4U21A 2B3BA 1QJMA 1B3LA 5ICTA 1IXHA 3I3VA 2QL3A 5KCJA 2QPQA 4QFLA 1MY2A 1H3DA 1AOVA 2F34A 3VVEA 3B6WA 1B0LA 3IL1B 2O1LA 3M8UA 1B1XA 2F36A 3HHFA 1FQFA 1GGGA 1MG1A 5AA4A 1H76A 3CRBA 3TCFA 3K01A 3FZVA 2Y7RA 1B9JA 4H1XA 1LFGA 1DMBA 3U93A 4RXLA 4XKPA 1R1NA 1US4A 3PMVA 4OETA 3QXMA 2Q2AA 5TP9A 5A5XA 5EHSA 1B3GA 1POTA 1PEBA 3M3LA 1CE2A 1IXGA 3H03A 3IJOB 1YPNA 4DXCA 1OLAA 4MLQA 2DQVA 5BUUA 4NWDA 2ZMBA 3PU5A 4OYVA 3KSJA 4WEDA 2DE2A 3K6XA 1VFDA 1FCKA 4G77A 1Y20A 2VP1A 2B65A 1XC1A 1SBPA 2HZKA 3FVKA 4DDDA 5AA2B 3MVXA 1LCTA 4POWA 1QUKA 4FEBA 3KOSA 2G29A 3EHTA 1B3FA 3MVYA 4EF2A 3G3HA 3FJMA 1MXZA 5I57B 3C31A 1EZOA 3QAXA 5CMMA 1B3EA 1TXFA 3EHSA 5ELVA 4O3BA 4O3AA 5I56A 1SYHA 2XX7A 3L6GA 2PMSA 5CBSA 3VE1B 4F2OA 5JTYA 4I9DA 4BDQA 4U1OA 1WODA 1URDA 4X48A 3KN8A 5H8QB 2GRVA 1P1OA 3RY3A 3QIMA 5ITOA 3KFMA 5KZTA 3MWBA 3CFLA 4DZ1A 3H6TA 1QKAA 3BFTA 2UXAA 1HSEA 3FXUA 5KDTB 5H8HA 1LAXA 1MY3A 4R6HA 1JNFA 3WAEA 3N6TA 2I4BA 1LB8A 1TT1A 4AQ4A 3K6WA 4G8HA 4IY5A 1B7UA 1N04A 3TPAA 1EZ9A 4ZEIA 1N76A 1ZMGA 2X7PA 3PUXE 4EQ9A 3SEUA 2F6GA 1A99A 4RPOA 2DOJA 3U94A 4Q30B 4E0WA 4DE8A 5M2VA 4TLLB 3H7MA 3TDJA 2DWAA 2XX9A 1D9YA 1LAHE 2DS9A 4KPTA 3K4UA 4QFNA 4FEDA 2AIXA 4WKMA 3VVFA 1M5BA 3ZKLA 2HZLA 3VDFA 1B4ZA 2E1SA 4DXBA 4OEVA 1MQGA 2F7BA 2ONRA 3C4MA 1MY4A 5L9SA 1WVJA 1OVTA 2DYXA 4M1VA 4RPNA 1GR2A 3L6HA 4JWYA 1SW2A 4RYAA 3KSXA 1M5CA 2XXYA 3SEVA 4MF3A 1P1NA 1ZIUA 4EXLA 3TEPA 1USYH 3TAJA 2ZYKA 4JBZA 4ZEFA 1SI0A 3C33A 3SEYA 2OLBA 4THIA 2O7UA 3HO7A 3KZGA 2H99A 2ONKE 4IO7A 1FQCA 5ITPA 4DXUA 4X1BA 1JW4A 3ZS6A 5I2NB 3S9NC 4KYDA 3O97A 3T9VA 4H8IA 3IOTA 1SYIA 4N6PA 2RCBA 3H6VA 2O84X 4XTCQ 1XVXA 4ESWA 2IA4A 3PV0E 3RNNA 1ELJA 4P0GA 5IKBA 1DOTA 1T0KA 1NKXA 1P1UA 2I3WA 5J1DA 3CVGA 3DP4A 2X7QA 3T9XB 2Q2CA 3RTWB 3VVDA 3IR1A 3E13X 4QFKA 4ZEKA 2XXQA 2R9JA 2OWSA 4U1ZA 4NF6A 4GVOA 2M8CA 3OMBA 4JXIA 1NFTA 1B40A 3UGWA 1SVXB 2P2AA 3KEIA 4R74A 1FQBA 4NF4A 4ELRA 4F2QA 3H06B 1POY1 2RCAA 3MBPA 1HSLA 3B7DA 3SEXA 4ZZAA 3PUYE 3HPIA 5I59A 2UVJA 2Q88A 1UIUA 5I58A 3OO6A 3UA8A 4F29A 2V84A 3JZJA 1LLSA 1N84A 1FQEA 1AIVA 4IO6A 3DLNA 4HCWA 3TMGA 1JEUA 2ABHA 3TZAA 3C35A 1QUJA 3MVZA 3UN6A 1A8EA 3ODBA 1NNPA 1US5A 3PPQA 4F18A 3O9PA 1NNFA 1IXCA 4H5FA 5K2XA 3FD3A 3RN8A 2DP8A 2GH9A 2I6EA 3VXBA 1MPCA 2AL4A 3RTFB 2DXRA 4R72A 4E0XA 3JYRA 2YJPA 3MAMA 3MVWA 3LSWA 2UYFA 1FTJA 3VV5A 2XHDA 1UTHA 4JDFA 5TP9B 4GFRA 4IO4A 3V8XB 4RJZA 3FJ7A 1A54A 3FASA 4OHNA 1O63A 2DVCA 1MY0A 3K00A 5BWJA 4POXA 2E0SA 3QK6A 4L17A 1XT8A 4AB6A 4OENA 1OIBA 4DCXA 4OESA 3KGCA 4MFIA 2DE3A 4JWOA 4OFLA 4NEDA 3PPRA 5H8SA 4ZEDA 4LZ8A 1N7XA 3PPOA 1AL3A 2VHAA 3CG3A 3RPWA 2Q8JA 3C34A 2RC9A 4ONYA 4EF1A 4R75A 3IB1A 3SETA 4FE8A 2V3TA 2PT2A 4Q8RA 2QS4A 4MH5A 4IO2A 4IO3A 5JK4A 1JW5A 2OWTA 3VLWA 2Q9TA 3OO8A 3RT6B 2H25A 5I56B 1FTLA 1A40A 2XD3A 3MP8A 3GXAA 1MDP1 3C32A 4GXSB 2P0SA 1LGBC 3OEMA 2NUVA 3PUWE 2R71A 4AB5A 5H8NB 5AA2D 4OFOA 1D9VA 1B7ZA 5H8FB 2R6GE 3FV1A 4O3CA 1DSNA 4YB5A 4YMBA 5CMKA 2O1MA 1QVSA 4C1UA 2Z23A 4P11A 1LBBA 1XVYA 3H6UA 3MQ9A 3RLFE 4TOZA 5B70A 4ND9A 5ISUA 4OEUA 4QSEA 3CR9A 3IAZA 2ZYOA 1VSOA 4LVQA 2RF1A 1JVYA 3PMWA 4YB7A 3KN3A 2QS2A 2V3QA 2HCAA 1Z7NE 2KLFA 2Z8EA 4I8CA 2DWIA 4JB7A 1UTBA 4KYSA 3PMXA 1BLFA 2YPNA 3GLBA 2F8DA 1RYOA 4NF5A 3OEKA 3Q29A 4UA8A 4ELQA 2IEEA 2HFBA 2UYEA 3IB2A 1M5FA 3B6TA 1MS7A 3OSRA 3F11A 4G8NA 1NMUA 2XXRA 1B5HA 4OFJA 4H65A 4GIZA 3LSXA 5B7DA 5I2KB 4NMYA 3D4CA 3FVNA 3O28A 3R6UA 4EDPA 4ELOA 3TQLA 2QJEA 1PBQA 3CFXA 5TU0A 2PX1A 1H43A 3Q26A 1AMFA 3ECRA 2HXWA 3T93B 2ONSA 2LAOA 4WXJA 3MUQA 2GHBA 4LUBA 2F97A 2F5XA 1FTKA 3QUFA 4ZE9A 1ZTYA 2Y7KA 3TTLA 2CMOA 5DVFA 4F19A 1J1NA 3QUJA 3K2DA 4MLVA 5HBCA 3KBRA 3W9VA 3ILUB 1NH8A 3R7XA 5DTBA 1D4NA 1S50A 3IOWA 1VFEA 5CC2A 1QUIA 4OERA 3PPPA 2NVUB 1OQGA 1OLCA 4PETA 5CMCA 4BDOA 3FXQA 4GRKA 5F7VA 3U1OA 4XKRA 4ECFA 2Z8FA 2O69A 2QS3A 4NF4B 3Q25A 3KG2A 2AYSA 4R73A 3KJ7A 3MP6A 3MZ9A 2XXVA 2FNCA 4GL8A 4FIMA 5I59B 3MJNA 4OZ9A 4Z0IA 1PB7A 5I57A 1LBCA 1ZJLA 3LUYA 3O6HA 3CSGA 3PPNA 1O64A 1OMPA 3FUZA 4BDRA 1XOCA 4GD5A 4C0RA 2V93A 3H6WA 3I6VA 1LAGE 3FVGA 5CRYA 4PFTA 1VE4A 1SI1A 1NNKA 5DEXB 3HV1A 2V3UA 2HEUA 2OJTA 4G68C 1BIYA 3V89B 1B2HA 3FVOA 4U4XA 3H4ZA 3WAFA 4EQ7A 3BBRA 4IGTA 3O29A 4YKPA 2Z8DA 1M5EA 2GHAA 3S2VA 5FTIA 4TQUQ 5KDTA 3OELA 1JEVA 5AA1A 2RC7A 4X9TA 4G68B 1IQ7A 1DPPA 4GWOA 4IO5A 4F3SA 1GTKA 1N0TA 2BJJX 2NWJA 4LQ2A 4KR5A 1TFAA 5JEIA 2QSXA 3FATA 2GFEA 3UIFA 5LOMA 3KJTA 4HTGA 4ZDMA 4C1TA 4H5GA 4YKIA 3TODA 1Y1MA 4OQOA 5L8DA 2RKMA 1DTGA 2DWJA 4G2ZA 4GQOA 2OK2A 2RC8A 4R2BA 3MPKA 4NTLA 1TFDA 1URGA 1GVCA 4QSCA 1YTVA 3RQTA 1IEJA 2O68A 1R6ZA 3E9XA 4H67A 1S7YA 3MZ1A 3UK4A 4LQ5A 2UVIA 4F22A 1MRPA 4KCCA 2OCUA 4YB6A 4BDNA 2REJA 2ZXTA 3ONMA 4H8JA 3MZBA 4LZ7A 1B05A 5CBRA 5KCJB 2DXYA 2O51A 3IORA 2ALUA 2QRYA 3TCHA 3UP9A 5L9MA 3PD8A 2W7YA 5I2NA 5AA4B 1I6QA 1MY1A 3EF7A 2XXIA 5L9OA 2QS1A 1B3HA 1B58A 5A5XB 4BDLA 3ZKKA 3TCGA 5EHMA 4ZEBA 1B4HA 4GXAA 2XX8A 3TTKA 2XXUA 4KYEA 3MPLA 1MH4A 4ZS9A 3G7WA 4I1DA 2A5TA 4EUOA 2XXWA 1Y3QA 1Z7ME 3EHUA 3N5LA 5EYFA 2ZNUA 2V25A 3W15C 2OZZA 4XXUA 1OQHA 2F7CA 2ANJA 1I6AA 2Q89A 3GBAA 2Z22A 4UACA 3RT8A 2ESNA 3IB0A 3W9WA 5CI5A 4NF5B 3K6UA 1SW1A 4XKNA 1BTJA 1MXYA 3TUSA 4YKJA 3IO4A 3UORA 2I0BA 3PGFA 2Y7PA 2XXXA 3IJXB 4GF8A 3TYHA 1LAFE 1Y9UA 1SW5A 5TPAA 1ZLQA 1B52A 1N3XA 3CIJA 3LSLA 2I48A 3G3KA 3VLUA 2P1SA 1TWYA 5DVIA 4FAJA 1JQFA 3GBBA 4OVJA 2F6PA 1IIWA 5JTYB 1ANFA 2DE4A 1VR5A 3K02A 2CZLA 1PDAA 3OD7A 3CSBA 3G3FA 2FYIA 4YU0A 2ZNSA 4U23A 1S9TA 4KCDA 2F78A 3OSQA 3RUMA 3K0VA 3K6VA 3DP8A 1P1WA 3LR1A 4U2RA 4FORA 4DIGA 4NF8A 5H8HB 2D5WA 2Y84A 3BKIB 4HCYA 3KOTA 2DWHA 4FECA 1SDXA 3VLVA 3H3GA 4FJPA 1BKAA 1PB9A 4ESXA 1URSA 3S9MC 3O66A 3LBSA 4TLMB 4ELPA 5HM4B 2I4CA 3B6QA 1N7WA 3T9HB 2THIA 3A3CA 4R6KA 3OENA 3MC2A 2XXPA 4QFOA 5FTHA 5FHNA 3T96B 4F39A 1YCJA 1M5DA 4HW8A 3TKDA 1YAEA 3FGSA 1AH5A 1RKMA 4H0WA 1P1QA 3QSLA 3U72A 2PBWA 3EQ1A 4NE4A 1A55A 1H45A 1NNTA 3TQWA 4EQBA 4I62A 4DCYA 2RINA 2QMXA 4XIGQ 2I0CA 3M3KA 1JETA 1Q1KA 2WKYA 1GV8A 3IOUA 1MQIA 1QKBA 4OTEA 2UVGA 4QHQA 4OMBA 3ZSFA 2F35A 1EU8A 5DVJA 4U22A 3K1NA 4K3FA 5CM6A 1DTZA 3G3IA 4XKQA 3IO6A 3SEWA 3O2AA 3IK6B 4G8MA 4Q5TA 3RGYA 4BDMA 1OVBA 3V83A 1EH3A 4OWDA 3OO9A 1KWHA 1D3KA 4GOTA 5FHMA 5ICQA 2XXTA 3T22A 4KHZE 4YAHX 1IXIA 1FTMA 4R2FA 5I84A 4KFQA 1LSTA 5H8NA 2HAVA 2B3FA 2OBGA 4H6DA 1IZ1A 3N26A 1FQAA 5H8FA 1PBPA 4HS7A 4PQJA 3ILTB 1RYXA 1A8FA 3VFJA 4R6YA 1CB6A 2VOZA 3O6IA 5DYHA 3OOAA 1I69A 5HPQA 4F1VA 1IITA 5F1QA 2I49A 1I6BA 2A5SA 4Z7EA 2YLNA 3E3KA 4RK9A 4ZECA 1MQDA 3TFLA 3K1PA 4NF6B 3V5AA 4LP2B 2H5YA 4ISUA 4N13A 3FIRA 2NXOA 5K2YA 1MM6A 1ZU0A 3T66A 3HCQA 1MQJA 1A7LA 1MXUA 2H4IA 4IGRA 4RA1A 3MW0A 5AA2A 1MQHA 1ZBMA 3HHGA 4PP0A 1B1HA 3FXRA 3PD9A 4F1YA 3EN3A 5I58B 3TELA 1EZPA 1HSJA 3HN0A 1B7HA 1B0HA 1B32A 4IY6A 5IAIA 2G93A 3JV9A 4RK2A 2NOOA 1B51A 5I2KA 3QYTA 3T9UA 2XXHA 1UQWA 4RNSA 1USYE 5FHOA 4R9GA 3Q28A 4KI0E 1QW0A 4LATA 3SKPA 3USDA 4FATA 2HQ0A 2PVUA 1Q35A 3DP6A 1NL5A 4BLAA 3CFZA 5H8QA 2UVHA 3LSFB 2I58A 4QSDA 1Y1ZA 3HSTA 1B5IA 3CI8A 4Q0CA 3Q27A 3S4UA 3C36A 1UIVA 4PFYA 2ZNTA 2HAUA 3KN7A 3VXCA 1UTHB 3O6GA 4JWXA 1Y3NA 3G3GA 1Y4TA 3R26A 2O6AA 3IX1A 4DLDA 3U8QA 1SQYA 1MH3A 2ZYMA 3OO7A 4R9FA 1B5JA 2A5TB 2D3IA 3N94A 2DVZA 2F7AA 3M3FA 1SD3A 3SESA 3P7IA 2H9BA 1XS5A 2PYYA 2VD2A 5DT6A 1ATGA 2H98A 1FTOA 4GLIA 3DELB 2FA7A 4YKKA 1LB9A 3SDFA 4F3GA 1QULA 4KD5A 4YMAA 2PT1A 1MXWA 1Y4CA 4F3BA 4PFUA 1II5A 5TPAB 4PFWA 1B6HA 4EXKA 1MXXA 1ZKBA 3BFUA 3DM0A 1PB8A 4PE5B 1H44A 5AA3A 3G3JA 2I3VA 1IUDA 3FJGA 4WEPA 3LC8A 5DEXA 3PUZE 1JVXA 3A3UA 3PUVE 4M4GA 4NWCA 4QRZA 1MM7A 3N6UA 2DSFA 3A09A 4RY1A 3I5OA 1P99A 4P0IA 2REGA 1LFIA 2AL5A 4JSDA 1F9BA 4NF8B 4F3PA 1LCFA 3OXNA 4OXVA 1Y3PA 3U92A 4YZZA 2Y7IA 4JSOA 3AXFA 2O7IA 4G68A 3C9HA 4LONB 3CG1A 1L5TA 2X26A 1B46A 4LZ5A 4LA9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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