4G8MA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the agonist cbg-iv at 2.05a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein/agonist
source organism Rattus norvegicus
publication title Pharmacological and structural characterization of conformationally restricted (S)-glutamate analogues at ionotropic glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 82
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8mA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8mA02
3QUJA 2OBGA 3TTKA 3T9UA 3TQLA 5FHNA 4FIMA 4F31B 4UA8A 2Y84A 2RC8A 5AE4A 2B3BA 4OENA 4DXUA 3TPAA 1A55A 5H8SA 4H0WA 2V25A 1MPBA 3TTMA 2I48A 5DEXA 4PFWA 2Q9TA 5L8DA 3C4MA 4MF3A 4X48A 4OXVA 1KWHA 3PPOA 3M3KA 1NFTA 4N07A 4Q5TA 2DSFA 5I56A 3IL1B 1MXUA 1FTOA 1LFHA 1N7WA 1ELJA 2Z23A 1SQYA 3OELA 1UQWA 2I0CA 4YICA 3GBAA 1MRPA 3PMVA 4POXA 3TUSA 3H7MA 4YAHX 4YMBA 1URGA 1DPPA 4JWOA 2PT2A 4YB5A 5EHSA 4G8HA 3QAXA 2HXWA 4LONB 1BKAA 2OLBA 2KLFA 1AIVA 3DM0A 2AIXA 4YKPA 2ZMBA 1PB8A 4F18A 1O64A 4IGRA 2PT1A 4GRKA 2F7CA 2RKMA 4KYDA 1VR5A 3QUFA 2R6GE 3C32A 2XXYA 3EF7A 1QULA 5FTIA 3N26A 2P1SA 3WAEA 4IO4A 3R7XA 3M3FA 1BLFA 2P2AA 2OZZA 1P1NA 1I6BA 2AYSA 3BKIB 2O6AA 4FAJA 1B05A 3OEMA 2H4IA 4BDQA 5H8NA 3TTNA 3V8XB 4F2OA 2F78A 4OZ9A 1XVYA 1XHYA 2DXRA 2Z8DA 5ITOA 4M1VA 1MH4A 3O66A 1A8EA 4LZ8A 5CI5A 2GH9A 1LLSA 4PFUA 3B7DA 1SW5A 3G3KA 4EUOA 3WAFA 4F39A 2O84X 2A5TB 3FASA 4P11A 1HSLA 1GR2A 2ZXTA 1IZ1A 1YAEA 3OOAA 1MQJA 4IO7A 3LBSA 3FJGA 5AA4B 4IY5A 5AA2B 1OVTA 3LSFB 3K2DA 3KN3A 3VVFA 1N84A 1QVSA 2Y7RA 3H6VA 4QSCA 2I3VA 4XKNA 4F29A 1HSEA 4X1BA 4YMAA 3LC8A 5I59A 1BTJA 3BFUA 2OCUA 4UACA 1MG1A 1B51A 4ONYA 4U2RA 5CMMA 4F3SA 2B3FA 3VDFA 2OJTA 5H8QB 5M2VA 1TT1A 3T9XB 1A99A 2I3WA 3DP8A 4OFOA 4U4SA 1MPDA 4HW8A 2DQVA 2H25A 2XXVA 1R9LA 1B3LA 4TLLB 3K6VA 4P0GA 3SERA 3VE1B 2F7AA 3TYHA 1D3KA 3DLNA 3KN7A 5TP9B 2V3UA 4JWYA 5TU0A 1J1NA 5H8FA 1D9YA 1FQFA 1FQCA 2YJPA 2F35A 5BUUA 2QSXA 3PUVE 3SKPA 1WDNA 3CG3A 3PV0E 1B0LA 5KCJA 2XD3A 1OQGA 3A09A 1Y20A 5I84A 4ELPA 2Z22A 2O7IA 1MQGA 1B4ZA 2F6GA 1LFGA 4XXUA 1IQ7A 1MS7A 4NWDA 3FJ7A 1MPCA 3R26A 5ELVA 2VGQA 5JK4A 4H67A 4TLMB 4YZZA 3KOTA 5I2KB 1IXCA 4GOTA 3SEUA 3VVDA 4ZE8A 3I5OA 1T0KA 3CFLA 1EZ9A 3QYTA 3CFZA 3H06B 1BP5A 3MP8A 2UVIA 2O51A 4ELQA 4XKPA 2F5XA 3C31A 4QRZA 2XXQA 4IO6A 4EDPA 2F8DA 1LFIA 3O2AA 1IXHA 2QJEA 1POTA 3U94A 1MM6A 1N76A 3O29A 1IITA 3RQTA 1N04A 2CZLA 3IJXB 3RN8A 1Y3QA 5FTHA 3VFJA 4YKKA 1XT8A 4U21A 1UTHB 4RA1A 4GIZA 1UTBB 3KGCA 1FQDA 1LAHE 2UYFA 3PUYE 1M5DA 2F97A 2AL4A 1QUKA 1WVJA 4GF8A 3E9XA 2M8CA 2B65A 1FW0A 3U93A 3KBRA 1B3GA 1TFDA 3I3VA 3T96B 1I69A 1TWYA 3THIA 2VHAA 1N7XA 4H6DA 5DVFA 3OO8A 4LQ2A 2UYEA 3O28A 4KPTA 3TTRA 3TFLA 1AL3A 4IGTA 1B3HA 4RXLA 5DYHA 3U8QA 3KOSA 4NF5A 3VV5A 4WKMA 1B1HA 2PX1A 3RLFE 1PBQA 1MY3A 1A8FA 1SI1A 1MDP1 2X7QA 1MXWA 2XXHA 1ZJLA 4K3FA 4LATA 3FGSA 4LUBA 4WXJA 2F36A 1OQHA 1ZU0A 4R72A 2HZKA 1CB6A 3PUZE 1LCTA 4BDMA 2RCBA 4R75A 4HCWA 2R71A 3FXUA 3PPPA 3KEIA 5FHOA 4G2ZA 1GVCA 1NNTA 4I8CA 3SEXA 3KJ7A 3DELB 4YB6A 4ZZEA 4BLAA 1CE2A 3KSJA 3KN8A 2QMXA 1VFEA 1PB7A 2NWJA 1JNFA 4E0WA 5KDTB 5CC2A 2F34A 5DTBA 1P1UA 2HQ0A 2QS1A 4KI0E 4OESA 4ZEKA 3IB0A 1R1NA 2ZYKA 1M5FA 4L17A 4FATA 1SYIA 3PUXE 2DP8A 4H5FA 3Q27A 3TELA 3U72A 4C1TA 4BDLA 1EH3A 3EHUA 4RPOA 4N13A 4GL8A 4DXCA 2I49A 1FQBA 1ZBMA 1URSA 5I2NB 4GWOA 4DXBA 1VE4A 1SW2A 2CMOA 4G8NA 4OQOA 1FTJA 1Q1KA 4XIGQ 3E4RA 1H3DA 3TCGA 1QW0A 1JW5A 4OMBA 2XXRA 4ZDMA 2QPQA 1Y1ZA 2Y7KA 3O6HA 3K6XA 3OSQA 5A5XB 2XXPA 3PPNA 1IEJA 1B1XA 3FVNA 2UXAA 3IR1A 3MZBA 3MP1A 3SEYA 4KHZE 4AB6A 3TMGA 2A5TA 3N6UA 3MC2A 1A40A 3N94A 4R74A 5AA4A 5AA2A 2NUVA 4FECA 2HCAA 3E3KA 1I6QA 4BDRA 3K01A 1DTZA 4OEUA 2WKYA 1LBCA 1VFDA 3MZ9A 2QS2A 4POWA 3VXBA 2ZNTA 4IY6A 1S50A 3FV2A 3FJMA 5ICQA 3EN3A 3MJNA 3M3LA 2QRYA 3EPEA 4G68C 5H8QA 2Q89A 2ONSA 4GL0A 4NF6A 1SDXA 1PEBA 1MY4A 5DEXB 2I4CA 5F1QA 1GV8A 3N5LA 3IOVA 4RK2A 4JSDA 3U1OA 4ESWA 1FTMA 1SVXB 1MXYA 3VVEA 2LAOA 4KFQA 1NNKA 4XKQA 2V93A 1QKAA 3Q29A 4F1UA 1IIWA 3PUWE 4Z7EA 3O97A 5TP9A 5JTYB 5H8HB 4GXSB 4R9GA 4HTGA 5EHMA 4NEDA 5L9SA 3OD7A 1H43A 2RC7A 2H9BA 5CM6A 1NH7A 2H5YA 4G68B 1H44A 3LUYA 2RCAA 1MXXA 3G3JA 2OK2A 4GLIA 3C34A 2VD2A 1P99A 2GHBA 1JEUA 4Z0IA 3A3CA 3W15C 4FORA 1P1OA 1M5CA 4R6HA 3RTWB 3MQ9A 3MWBA 1DSNA 3K02A 3S9LC 1P1WA 5F7VA 2UVGA 4MFIA 5CBSA 3L6HA 4NTLA 5DVJA 3VXCA 5J1DA 1URDA 3RT6B 2HZLA 3OO7A 1NNFA 3TKDA 5I2KA 4O3BA 3T9VA 3KJTA 4GD5A 3D4GA 4WEPA 2I6EA 3GBBA 4EQBA 4ZZAA 4IB2A 2DE3A 2FNCA 1UIVA 1MDQA 4Q0CA 1OLAA 4PP0A 1JW1A 2XXXA 4DCXA 5EYFA 1M5BA 1B5JA 4MBPA 1B3FA 3KFMA 3EHSA 3G3IA 3UORA 1JQFA 4LZ7A 2V84A 3HHGA 4ZE9A 4OEVA 4NMYA 1OMPA 1B58A 3B6QA 3T9HB 3ODBA 2RF1A 5TPAB 4NF4A 2ZYNA 4THIA 4JXIA 4U23A 3IOTA 3ILUB 4U22A 2O1MA 3C35A 2YLNA 4OETA 3H6UA 2DWAA 1P1QA 3PPRA 3Q28A 3FZVA 1UTBA 4NF8B 1JVYA 1A54A 4PETA 1NMUA 3V83A 3IK6B 2DS9A 4NWCA 3RTFB 4QFOA 4R2BA 4FJPA 5FHMA 3IOUA 1XOCA 3KG2A 3H6TA 5K2YA 1R6ZA 2ZYMA 2X26A 2GHAA 3ZS6A 3MAMA 1LCFA 5K2XA 4PFYA 5I57B 3LR1A 4ZS9A 4ECFA 1Y4TA 2ANJA 2I0BA 4QF9A 3QK6A 1FCKA 3OXNA 3A3UA 4WEDA 3N6TA 3HO7A 1MY2A 2XXUA 3G7WA 1Y1MA 2XX8A 3Q26A 2DOJA 5I58B 4G8MA 1ZMGA 4EF1A 2XXIA 3VLWA 1B40A 1IUDA 4R6KA 5L9MA 3OMBA 1N0TA 5CMCA 1H45A 4PFTA 1SD3A 1Y3NA 4DIGA 5HBCA 1B5IA 1TXFA 4G77A 1FQAA 1S9TA 3GLBA 3SDFA 4GVOA 4QSDA 4KQPA 4F22A 3PMXA 2Y7PA 5KDTA 1YTVA 4TQUQ 3H03A 3P7IA 3H4ZA 3MBPA 4IO3A 4ZEIA 2ZYOA 4F19A 2QL3A 4LP2B 2DWHA 4FE8A 5ICTA 1ZLQA 2DVZA 4I62A 1QJMA 2DVCA 4ELOA 3C33A 2NVUB 1RYXA 3IAZA 3BBRA 3K6WA 3S9NC 4KCCA 1B7UA 4OFJA 1AMFA 2DWIA 1D4NA 1YCJA 1MXVA 5I2NA 3IB1A 4YKJA 4ZEDA 3OSRA 1QUJA 4X1DA 4QFLA 2X7PA 1BIYA 4MLQA 2XXTA 3CSGA 3K1PA 1LB8A 3LSXA 1USYE 1US4A 3ZSFA 2REGA 1II5A 3TODA 1NKXA 2Q8JA 5A5XA 5DVIA 3AXFA 3RT8A 3G3FA 3FVOA 2OWSA 2GRVA 1MH3A 3TTLA 3ONMA 1O63A 1LAFE 1MQHA 3K4UA 1PC3A 4OWDA 1DMBA 4OVJA 4FEBA 1SW1A 1XVXA 1OIBA 2NXOA 4KYSA 3MW0A 2OWTA 3OEKA 3UGWA 3PGFA 4PE5B 3OO9A 2ABHA 4F3PA 3VLVA 3KZGA 4HS7A 4LA9A 3GXAA 2YPNA 4F1VA 4QSEA 3DP6A 2I4BA 3TEPA 4TOZA 1QUIA 3D4CA 5ISUA 3HCQA 2W7YA 2I58A 1F9BA 4GFRA 3CIJA 1DOTA 2FYIA 4NF5B 1ZIUA 3FATA 4R2FA 3FVKA 4OERA 1FTKA 1XC1A 4Q30B 3CR9A 3JYRA 5AA2D 3MP6A 2IEEA 4XTCQ 1B2HA 1JETA 5JTYA 2DE4A 5H8HA 3TAJA 2DYXA 4X9TA 3KSXA 3CFXA 4I9DA 4R9FA 3PPQA 4G68A 4I1DA 4DCYA 3CSBA 5HPQA 1HSJA 3G3GA 4QHQA 4RK9A 3H6WA 3MUQA 2R9JA 4LQ5A 2QS4A 2D21A 4O3CA 4DZ1A 1YPNA 4KYEA 2PMSA 3UK4A 2Y7IA 3OO6A 1PDAA 1MM7A 4M4GA 3K1NA 4JBZA 2UVJA 2XX7A 1DPEA 1DTGA 1Z7ME 3VLUA 3MVWA 3R6UA 4BDNA 1PB9A 5IKBA 3V5AA 3ILTB 4R6YA 1PBPA 3MVZA 1ATGA 3SEVA 3Q25A 2V3QA 4LZ5A 3UP9A 5I56B 4KD5A 3O6GA 4OYVA 2G93A 4C0RA 4MH5A 5CMKA 4H1XA 4ND9A 3IOWA 2UVHA 4DDDA 4ZECA 3USDA 1AOVA 1ZKBA 1Y4CA 1OVBA 3LSLA 2AL5A 2PBWA 4MLVA 2PYYA 2D5WA 3S2VA 5IAIA 3E13X 1FQEA 2E0SA 1LAXA 4KCDA 3TCHA 2XHDA 2HAUA 4JB7A 3QXMA 1B5HA 3IB2A 4OTEA 3QIMA 4EQ9A 1MY0A 4H65A 2HAVA 4G4PA 5TPAA 4IO5A 2ESNA 4E0XA 4ELRA 2XD2A 1B7HA 1VSOA 3W9WA 2Y7WA 3HHFA 4AQ4A 1IXGA 3S9MC 4RJZA 2D3IA 4OHNA 1JW4A 3T93B 1S7YA 4NF8A 1GGGA 3W9VA 4LVQA 3IJOB 4YB7A 3V89B 1LB9A 3RY3A 4P0IA 4C1UA 1NNPA 4YU0A 1O7TA 2Z8EA 2ZNSA 1EZPA 3UIFA 2O69A 4NF6B 3UA8A 3M8UA 1M5EA 2HFBA 1US5A 1OLCA 5H8NB 3OENA 4FEDA 1SI0A 5AA1A 5I57A 3IX1A 3I6VA 2DWJA 2HEUA 4GXAA 3JZJA 1NH8A 1EZOA 1LAGE 2Q2CA 1SYHA 3TQWA 5JEIA 3SEWA 3MPKA 3RNNA 3PMWA 4ZEBA 1JEVA 1ZTYA 2G29A 3G3HA 2BJJX 3MVXA 4RNSA 5I58A 3C9HA 5CRYA 4JWXA 4RY1A 4DE8A 2V3TA 2O68A 1I6AA 2NOOA 4OFLA 4JDFA 1B4HA 1A7LA 4KR5A 3FUZA 1UTHA 1Z7NE 3FD3A 2E1SA 4ISUA 4ZEFA 5KZTA 5I59B 1ANFA 2RC9A 2F6PA 1QKBA 3HV1A 3IO4A 4JSOA 2PVUA 3ZKKA 1LBBA 3ZKLA 3LSWA 4RYAA 4AB5A 3PD9A 3IO6A 3FIRA 5B7DA 4EXLA 3TCFA 3HPIA 3PU5A 4QFNA 3HSTA 1Y3PA 1POY1 3H3GA 4DLDA 3C36A 2XX9A 3K1MA 1L5TA 1GTKA 2DE2A 4H8IA 1MQDA 3RGYA 4EF2A 3TZAA 3EHTA 4F2QA 5LOMA 1MXZA 1TFAA 2XXWA 2ONKE 1B0HA 4RPNA 2THIA 4QFKA 3UN6A 1FTLA 3RPWA 3RUMA 5AA3A 3BFTA 1B32A 3MPLA 1D9VA 4YKIA 4U1ZA 5H8FB 2VD3A 2ZNUA 4BDOA 3EQ1A 2VOZA 2QS3A 5CBRA 2H98A 3FV1A 1B3EA 1MQIA 5B70A 3K00A 3SETA 5KCJB 4NF4B 5DT6A 2QMWA 3CVGA 3PD8A 3S9EA 3MZ1A 3F11A 3CRBA 2DXYA 2Q88A 1B52A 2Z8FA 1EU8A 3FXQA 1R9QA 3TDJA 4ESXA 4PQJA 1USYH 1XS5A 2RINA 1MY1A 4EQ7A 2F7BA 1SBPA 3FVGA 1B46A 1N3WA 3GZGA 4H8JA 4F3GA 2FA7A 4O3AA 3T66A 1JVXA 3FXRA 1LGBC 2P0SA 4GQOA 2O7UA 4IO2A 3JV9A 1WODA 2REJA 3SESA 3CG1A 3T22A 5CMBA 3S4UA 4EXKA 4Q8RA 1B9JA 4F3BA 1B7ZA 4R73A 4QFPA 3K6UA 1AH5A 4U1OA 4F1YA 1UIUA 4N6PA 3O9PA 1LSTA 3ECRA 2H99A 2ALUA 4XKRA 3U92A 2ONRA 1Y9UA 1NL5A 1N3XA 3B6WA 5BWJA 2O1LA 1RYOA 3IORA 3HN0A 1Q35A 3B6TA 2GFEA 3L6GA 3O6IA 3K0VA 3DP4A 5L9OA 2IA4A 5HM4B 3QSLA 4NE4A 1RKMA 1H76A 4H5GA 3CI8A 2Q2AA 1SW4A 1B6HA 3MVYA 2VP1A 1IXIA 4U4XA 2A5SA 4HCYA 5ITPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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