4G8MA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the agonist cbg-iv at 2.05a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein/agonist
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Pharmacological and structural characterization of conformationally restricted (S)-glutamate analogues at ionotropic glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8mA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8mA02
2H9BA 2QS4A 3MW0A 5H8SA 4OETA 3TKDA 1ZIUA 1EZ9A 1NH7A 2HZKA 2Q2AA 2ESNA 3SKPA 4X48A 1H3DA 1CB6A 1OMPA 4RK2A 3MPKA 3KOSA 3QYTA 3IAZA 2QMWA 2DXYA 1LB9A 5AA2D 5I57A 5ISUA 3TTRA 3QK6A 2F6PA 4ZE8A 1NL5A 3S9NC 4O3BA 3IOUA 2ALUA 3CIJA 3LUYA 2PVUA 4NTLA 4IO7A 3G3FA 4ZEBA 3UK4A 4E0WA 2DE2A 4EDPA 3Q28A 1JNFA 3PV0E 4ELQA 3MPLA 5FHOA 4OFOA 3LSLA 5DVIA 1IXIA 1M5CA 4ZE9A 1A8EA 3CFZA 1B6HA 1LAFE 4ND9A 1AL3A 3FV2A 1WODA 2G29A 3SEWA 1MXYA 1QVSA 3Q29A 4U1OA 4HCWA 4LUBA 2XX7A 3TQLA 1H43A 3KSJA 3HO7A 4EXKA 5H8HA 2PX1A 4MBPA 4G68C 5H8QA 5I58A 3MZ9A 4FECA 3A3CA 3MVXA 5FTIA 4RYAA 2DE3A 4R6YA 1B32A 4LZ8A 3U1OA 3VXCA 3N5LA 2HAVA 3H03A 1NNKA 2R9JA 3GBAA 4JDFA 5DEXB 1DTZA 3CRBA 1B5HA 1Y3QA 1NFTA 1MXXA 4OTEA 4OHNA 1ZBMA 2PBWA 4GLIA 4EQ7A 4QSCA 2VOZA 4I8CA 1LCTA 5CBSA 3OO6A 1A8FA 4IY5A 2DWJA 4LZ5A 3E3KA 2V93A 5TPAB 4F3SA 3CSBA 4N13A 1TFAA 4G8NA 3PPQA 3RT6B 4X1BA 2OWTA 3OEKA 5EYFA 2XXHA 4ESWA 4IB2A 4I9DA 4WXJA 1F9BA 2RCAA 1IIWA 2KLFA 1NKXA 3IOVA 3HSTA 4F2QA 4DZ1A 1SVXB 1TWYA 3B6WA 3MJNA 1XC1A 1GVCA 1MH4A 1N76A 1O7TA 1QULA 1D9YA 3TCFA 4F29A 2NVUB 3PU5A 3IB2A 2OWSA 3C4MA 2P0SA 1B3FA 1HSLA 4ZZAA 5EHMA 4LATA 2I3WA 4YU0A 1AOVA 3M8UA 3PD9A 2P1SA 2ONKE 2FNCA 4Q8RA 1LFGA 1FQEA 1MY3A 5CC2A 2Y7PA 3L6GA 3A09A 4IO4A 1GR2A 3EN3A 3DELB 1T0KA 1UQWA 4DIGA 2UXAA 5AE4A 4KD5A 4I62A 1M5EA 5IKBA 1PDAA 3QUFA 1JW1A 5AA1A 2FYIA 4YB6A 1PB8A 2QSXA 3V89B 2REJA 1VFDA 4F22A 3MUQA 2QJEA 4KR5A 1H76A 3PMXA 4GFRA 3T9VA 1B46A 2RF1A 4DLDA 2ZNTA 4LP2B 5M2VA 3U8QA 3CVGA 4YMAA 2NOOA 4GIZA 3HHGA 3FXQA 4R6KA 3H3GA 2F78A 4DCYA 3IX1A 4HW8A 4THIA 4OQOA 3EHTA 3MWBA 4LA9A 2A5TA 1MXZA 1R9LA 3FZVA 4PE5B 4P0GA 1MPBA 1POY1 3MP1A 4FORA 2Q8JA 2CMOA 2Y84A 3TUSA 1B3EA 3OSRA 3QIMA 4F31B 4P0IA 3D4CA 3K1NA 1EH3A 3G3JA 4OZ9A 4O3AA 3FATA 1PC3A 4EQ9A 4ELRA 2F7CA 3BBRA 1Y3NA 5CMCA 5H8FB 1NNTA 5A5XB 1P1WA 3K4UA 4DDDA 1M5FA 3TQWA 2M8CA 1MS7A 4OFJA 5I2KB 1XOCA 1I69A 1SW4A 2QMXA 3E4RA 3O66A 2I6EA 1BIYA 3MZBA 5L8DA 3E13X 4QFOA 2V84A 1L5TA 3H7MA 4ZEKA 5AA3A 3FVOA 3SEXA 3U72A 1MXVA 3T9HB 3ZS6A 2XXRA 4KYEA 5KCJB 5I56B 2O1MA 5DEXA 2GHBA 4IY6A 3I6VA 1SYHA 1S50A 2AIXA 4OYVA 5DVJA 1N3XA 2OCUA 3CG3A 4ZEDA 2V3QA 4YZZA 2DWIA 2HCAA 2B65A 4XIGQ 4RJZA 5TPAA 2I49A 3G7WA 2QPQA 3FXUA 3V8XB 3VVFA 3CSGA 1B58A 4R9FA 4GXSB 3C9HA 5FTHA 3OMBA 4NF6B 2XXXA 2ZNSA 2XX8A 5CMMA 3SESA 2RCBA 3B6QA 2DVZA 1ZMGA 3G3KA 2WKYA 4JWYA 4HS7A 2Q9TA 2LAOA 1FQAA 4QRZA 4QSEA 3SETA 4NE4A 4UA8A 3TTNA 5CBRA 3K6XA 1B7ZA 4QFPA 1H45A 3TZAA 4L17A 3EHSA 3K1PA 1XVXA 3RN8A 3TTLA 1TXFA 1VFEA 4RPOA 3MVYA 2RC8A 4QF9A 3LSWA 2FA7A 2B3BA 4U2RA 3IR1A 4IO5A 5EHSA 2A5SA 1Y3PA 1A99A 4XKRA 3TELA 5ICTA 1OVTA 3UORA 3CI8A 5F7VA 3K2DA 3BFTA 4OENA 1MY1A 2ZYNA 1MM7A 5FHMA 2UYEA 4GD5A 4H5GA 3MVZA 4KI0E 5DYHA 1ZJLA 3QAXA 2X7QA 2I0BA 3LSXA 3T96B 4ZZEA 1P1UA 1B05A 4C0RA 1R6ZA 4R2BA 1P1OA 1OLAA 4DE8A 5CRYA 2ZNUA 1D4NA 4IO3A 3C31A 3I5OA 1Y1ZA 3TAJA 4TOZA 2A5TB 2XXPA 4U23A 2O69A 2O7UA 1OLCA 1QUKA 3K01A 3IO4A 2DOJA 2X26A 4BDRA 4F1VA 4NMYA 1WDNA 4QFKA 2IEEA 2ANJA 2DWHA 3S4UA 4OVJA 1YPNA 2THIA 3K1MA 1PEBA 1YCJA 3PPNA 5B7DA 1DOTA 4LQ2A 5ICQA 2Q88A 5H8FA 5ITPA 1SQYA 5A5XA 3PUXE 3R6UA 4KYSA 1Q1KA 2XX9A 1J1NA 3K6UA 5I2KA 1Y9UA 3MC2A 3O28A 4RA1A 1B5JA 3SEYA 2XXVA 1B1XA 1BKAA 1H44A 4EUOA 3M3LA 3TTMA 3MP8A 3S9MC 1N7XA 4R73A 1MQGA 2RC9A 1MPCA 1P99A 1I6AA 1RYXA 1DTGA 1MY4A 1FQCA 1MXUA 2XXYA 4Q30B 5B70A 5L9OA 1SW5A 2DS9A 5KCJA 5I56A 4IGRA 1EZOA 1SDXA 1Y1MA 2Z8DA 4MFIA 3T66A 1IEJA 1LFIA 1P1NA 4G2ZA 3BFUA 3FJMA 1B7UA 5F1QA 3LSFB 4IO6A 1IXCA 2D21A 4H0WA 4KPTA 1LLSA 2F6GA 3TODA 2F8DA 1MQJA 3O97A 4DXCA 4ZECA 4H1XA 1KWHA 3OENA 2CZLA 2ABHA 4XKNA 4AB5A 4ZEFA 2RKMA 3W9VA 3MBPA 1QUIA 4F3PA 2H99A 4AB6A 3ILTB 1XVYA 1MM6A 3FXRA 4NF6A 3MP6A 4JXIA 3K02A 4XKPA 5AA4B 3FIRA 1QKAA 4IGTA 1URSA 2OJTA 4RXLA 4ELOA 1PBQA 2NUVA 4GWOA 4C1UA 1JETA 4MH5A 4TLLB 4MF3A 1Y4CA 1QJMA 1B2HA 1SW2A 3ONMA 4LZ7A 1B5IA 4G8HA 5CMKA 4G8MA 1Y4TA 2YLNA 1B4ZA 1SYIA 2VGQA 4ZDMA 1D3KA 3C34A 3S9EA 3PPPA 5H8NB 5I59B 2I58A 4ZS9A 3H6TA 2DP8A 4GVOA 1LSTA 4BDOA 2GHAA 4N07A 1FTJA 4NF5B 1VSOA 4GRKA 3TCHA 2XXUA 5ITOA 1FCKA 1MDP1 2QRYA 1BTJA 3EF7A 3FVKA 1PBPA 3PMWA 2PMSA 1BLFA 3IOTA 4PFTA 4GQOA 1HSJA 1MY2A 3VVEA 4YAHX 3KG2A 3KFMA 3SERA 2OLBA 3KJ7A 3GXAA 1YAEA 3EHUA 3KN3A 2VHAA 4NF8A 3TMGA 3C36A 2DYXA 3FASA 4U4SA 2GH9A 1MH3A 2ZYMA 2F7BA 2R6GE 3USDA 3MZ1A 3TFLA 1I6QA 3HN0A 2DVCA 3IJXB 3L6HA 4U22A 5HBCA 4EF1A 1B9JA 2AYSA 4GL8A 1LCFA 3FGSA 4R9GA 1QW0A 2AL4A 1DSNA 5KZTA 3FUZA 1ATGA 2I48A 4YKKA 3OO9A 2W7YA 3PUZE 3VV5A 3QUJA 3H4ZA 4C1TA 4BDQA 4ISUA 5J1DA 3C32A 1MQIA 2H5YA 1D9VA 3GZGA 3UIFA 2REGA 1IXHA 2O6AA 2ZYOA 3GBBA 3QSLA 1O64A 3BKIB 1XHYA 1PB9A 4NWDA 1M5BA 3VFJA 4BDLA 5HM4B 1VE4A 4FJPA 3UN6A 4F19A 3MAMA 3N6UA 3O9PA 5FHNA 3AXFA 1LAHE 4NWCA 3RUMA 2AL5A 1A40A 2DSFA 4JBZA 4PETA 2H4IA 2BJJX 4Z0IA 2PYYA 5KDTB 1NNFA 2Z8EA 1LBBA 2QS1A 1LFHA 4M4GA 1SW1A 3VVDA 4TQUQ 5I2NB 2OK2A 3W15C 3OEMA 3IO6A 3OD7A 4FAJA 1LBCA 5TU0A 3OELA 4OFLA 3JYRA 3Q27A 3HV1A 2I3VA 4F1UA 4FATA 4KCCA 1QKBA 4EQBA 5AA4A 1MDQA 4WEDA 2VD2A 3OXNA 4P11A 1POTA 3IB1A 4YKJA 1FW0A 3S9LC 4YKIA 3GLBA 4XKQA 3KGCA 4PFYA 3IB0A 3T9UA 4KHZE 4YB7A 4DXUA 1OIBA 3G3GA 3TPAA 4HTGA 3HCQA 1FTLA 4GL0A 2O84X 2XXWA 1B4HA 3MVWA 1IITA 1MQDA 3UA8A 1MY0A 4G77A 1FTKA 1LAXA 2DXRA 2HQ0A 1JEVA 1JVYA 1XS5A 4U1ZA 4HCYA 2O51A 4KFQA 4PFUA 3RLFE 4O3CA 1B0LA 1B52A 3RT8A 5H8NA 4KYDA 5I59A 3PPOA 3CG1A 4QHQA 2Y7KA 4LQ5A 4RK9A 4NF5A 4ESXA 1BP5A 1N0TA 4DXBA 4PFWA 4I1DA 1O63A 1URGA 4POWA 1IQ7A 1Z7ME 3H06B 2HAUA 3IOWA 2Z22A 4RPNA 3FD3A 1RYOA 4QSDA 3C35A 1MG1A 3N26A 4Z7EA 1ZTYA 2QS2A 4WEPA 1NNPA 3H6VA 2ZXTA 4F2OA 3O6GA 3VDFA 2X7PA 3WAEA 1FQBA 3EPEA 3LBSA 3DLNA 5IAIA 4NF8B 3PMVA 2V3UA 3DP8A 3G3HA 1Z7NE 1N3WA 3KN8A 3K6WA 1N7WA 3F11A 1EU8A 3ODBA 2XD2A 4ECFA 3VE1B 2V25A 3KBRA 1AH5A 4R75A 1MQHA 3JV9A 1JEUA 1R1NA 2UVJA 1TFDA 1OVBA 4MLVA 2XXIA 5L9MA 2UVIA 5DVFA 1IZ1A 3LC8A 1SD3A 2ONRA 3OO8A 3HHFA 4OXVA 1AMFA 1A54A 4F3GA 4FEDA 2I4BA 3U92A 4PQJA 2IA4A 1FTOA 4F1YA 4H67A 1XT8A 4DCXA 5DT6A 3KOTA 3T22A 3RY3A 3TYHA 1FQDA 4BLAA 1B3GA 4G68B 3Q26A 2OZZA 5CM6A 4H8IA 4LONB 1MPDA 4YMBA 3E9XA 2E0SA 5BWJA 1VR5A 5KDTA 1RKMA 2UVGA 3RTFB 3EQ1A 2DE4A 4UACA 5I2NA 3ILUB 1P1QA 1QUJA 2Y7IA 5HPQA 1LB8A 2NXOA 3U93A 1DMBA 2VP1A 4NEDA 4H6DA 1UTBB 4XTCQ 3OO7A 3TTKA 3DM0A 3ZSFA 4R72A 3P7IA 4MLQA 5AA2B 1FQFA 1JW5A 5JTYB 1UIVA 3O2AA 4BDNA 3LR1A 4TLMB 1SI1A 1B1HA 4U4XA 1AIVA 3FVGA 3B6TA 2HFBA 4FEBA 2O68A 3SEUA 4NF4B 4QFLA 4X1DA 3R26A 1A7LA 4ZEIA 1SBPA 3PUYE 2VD3A 3ECRA 3THIA 4R2FA 4XXUA 3V5AA 1N84A 4KQPA 1UTHB 4OWDA 4ONYA 4JWOA 5JEIA 1GV8A 5TP9B 4IO2A 4RNSA 3HPIA 3N6TA 2H25A 4QFNA 5BUUA 3K6VA 3O29A 3SEVA 5CMBA 4OEVA 1MRPA 5CI5A 1DPPA 1B51A 1Q35A 2HEUA 2O1LA 3CFLA 4LVQA 4EXLA 1USYH 4X9TA 4F18A 2XHDA 1OQHA 3TCGA 3JZJA 3KSXA 3FVNA 3TEPA 3IJOB 4R74A 4JB7A 1YTVA 4EF2A 1II5A 4GF8A 1FTMA 1MXWA 2F97A 3UGWA 3KJTA 2D5WA 2Y7RA 4F39A 3I3VA 2XXTA 2GRVA 4KCDA 3DP6A 1NH8A 2G93A 4POXA 2Z8FA 2OBGA 1Y20A 4GXAA 3SDFA 3RQTA 2ONSA 3D4GA 5I57B 2HZLA 2RINA 3RTWB 3KN7A 1UIUA 3V83A 4YKPA 1URDA 3Q25A 2UYFA 1B7HA 4H65A 5K2YA 5LOMA 4OEUA 1B40A 2UVHA 4K3FA 3M3FA 1JVXA 4M1VA 3G3IA 2Q89A 4RY1A 4WKMA 3OSQA 4F3BA 4Q0CA 1US5A 1JQFA 1ZU0A 3VLWA 3WAFA 4BDMA 3PD8A 1ELJA 2Z23A 1JW4A 4FE8A 1LGBC 4E0XA 5H8HB 3O6HA 2I0CA 5H8QB 1S7YA 2DQVA 3MQ9A 4YICA 2NWJA 4N6PA 5I58B 4G68A 3K0VA 5K2XA 3R7XA 4PP0A 1N04A 4R6HA 3ZKKA 3IK6B 5JK4A 3S2VA 4H5FA 4JSOA 1B0HA 2QS3A 2R71A 4Q5TA 1A55A 2B3FA 2XXQA 1LAGE 1USYE 3FJ7A 1ZLQA 3CR9A 1B3LA 3PUWE 1PB7A 2F34A 3K00A 1HSEA 1R9QA 4G4PA 2F36A 4U21A 5DTBA 3FJGA 1EZPA 3A3UA 1IUDA 3RNNA 2H98A 1SI0A 3O6IA 1UTBA 2PT2A 2F7AA 3CFXA 5ELVA 2GFEA 1IXGA 3KEIA 3FV1A 3KZGA 2I4CA 2E1SA 3W9WA 3RPWA 3VLUA 3H6UA 5AA2A 5JTYA 2YJPA 4JSDA 3T9XB 3C33A 3OOAA 4ELPA 4NF4A 4AQ4A 2O7IA 2Q2CA 2Y7WA 4YB5A 1WVJA 1DPEA 2PT1A 5I84A 3B7DA 2F5XA 2F35A 2QL3A 2ZYKA 3PGFA 1M5DA 1NMUA 1S9TA 1UTHA 3ZKLA 3VLVA 5TP9A 4OESA 1GGGA 1GTKA 3N94A 3PPRA 1ANFA 4OERA 4OMBA 1B3HA 3UP9A 4FIMA 3IORA 1OQGA 3TDJA 3DP4A 2ZMBA 2XD3A 3M3KA 1CE2A 4JWXA 3U94A 2HXWA 2V3TA 1I6BA 2YPNA 3VXBA 3PUVE 4GOTA 1TT1A 2DWAA 5L9SA 3T93B 2P2AA 1US4A 3H6WA 1ZKBA 4H8JA 3IL1B 2RC7A 3RGYA 3QXMA 2D3IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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