1FQDA

Crystal structure of maltotetraitol bound to closed-form maltodextrin binding protein
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
publication title Crystal structures of the maltodextrin/maltose-binding protein complexed with reduced oligosaccharides: flexibility of tertiary structure and ligand binding.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 111
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqdA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqdA01
4U21A 1GGGA 4OMBA 1SW2A 1EU8A 1MH3A 4C0RA 5HM4B 3TAJA 3TTNA 1B7ZA 4ZECA 3N6UA 3RPWA 3T22A 3MJNA 5M2VA 1RKMA 4UA8A 5DYHA 3BFTA 5I58A 1URSA 1VFEA 5TPAA 2GHBA 3DP6A 3S9MC 2DWJA 3G7WA 3TODA 3IO6A 2H98A 4GD5A 4WKMA 3OSRA 3JV9A 4BDRA 4OEUA 1US4A 3VDFA 1DPEA 2Y7KA 4KR5A 5ITOA 5K2XA 3LBSA 1YCJA 2WKYA 1YPNA 5JTYA 1HSJA 5IAIA 5ITPA 4MF3A 2RKMA 1XOCA 1Y20A 1QW0A 5I56B 3HHGA 4PFWA 4R74A 3S2VA 2RINA 4N13A 2OJTA 4OYVA 1XS5A 1OQGA 4G68C 2GFEA 2RCBA 4Q0CA 5J1DA 2A5TB 3RN8A 3C35A 4ZEDA 2ANJA 4I1DA 4IB2A 3IOTA 3ZS6A 5ICTA 3VFJA 4F31B 3ZSFA 4ESXA 3EF7A 2X7PA 1A40A 1M5DA 4Q5TA 4IO2A 3TCGA 3MP8A 2DWIA 1FQBA 2THIA 3FASA 3VXBA 4PE5B 2Y7IA 2OLBA 2QRYA 2VHAA 3TTMA 4FEBA 4LQ5A 2I4BA 1FTMA 2PMSA 1B46A 3FXUA 1DMBA 2QS1A 2F6PA 1MPDA 4EXKA 2XD2A 1PBQA 3MPKA 3PPQA 1N76A 3KN3A 3G3JA 5AA1A 3K6UA 3MQ9A 1LFGA 2V84A 1SYHA 3HN0A 1US5A 4TLLB 5A5XA 3G3FA 4XKQA 3RY3A 1M5CA 4QHQA 3KOTA 3CSGA 3KJ7A 2Z8FA 4IY6A 4N6PA 2Q89A 1NMUA 3OMBA 3FXQA 1DTGA 1Z7NE 3IJXB 5I57A 1FTJA 1II5A 3UK4A 4RA1A 4NF5B 1P1WA 3VVFA 1GTKA 3IR1A 1MXUA 3FXRA 4BDNA 2D21A 1H45A 3IL1B 4YB6A 3K1PA 3N94A 2ZYKA 4GIZA 1USYH 2Z22A 1SBPA 2XX7A 5CMCA 4PQJA 5I2KB 1UIUA 1MPBA 3JYRA 1ZMGA 2PT1A 2Y84A 1TFDA 4ECFA 4C1UA 4M4GA 3B6QA 2Q88A 3A09A 1BTJA 1MS7A 2X7QA 4GOTA 4ELPA 2KLFA 4IGTA 4Q8RA 4OHNA 2D5WA 3PUYE 3OEMA 4QSCA 3K02A 3S9NC 1Y3QA 4KCCA 3SESA 3M3KA 4U2RA 4ZZEA 3CFXA 1MXVA 5H8FA 2XXPA 3IOUA 1FCKA 4R9FA 2XXWA 1UQWA 4RJZA 4H5GA 1FQEA 3PPPA 5TP9B 1PEBA 2O69A 3KJTA 2HQ0A 3B6TA 3FV2A 4ZEIA 3V89B 3QAXA 3RTWB 4U4SA 2XXUA 2YJPA 1B7HA 3PGFA 4G68B 2I0CA 3VLWA 1NH7A 1JVYA 1P1UA 4NWCA 4QFLA 1IITA 3U94A 5EYFA 1AOVA 3TUSA 2D3IA 1QKBA 4F3SA 1QJMA 2DVCA 2R9JA 3U92A 3OEKA 3O6GA 3H4ZA 4XKPA 3JZJA 4IY5A 2I3WA 1DSNA 1NFTA 3PD8A 4ELQA 3OSQA 4ZZAA 4ZEKA 3VE1B 3DELB 4N07A 2RCAA 5I84A 3OD7A 2DWAA 2HCAA 2OK2A 4EUOA 4DLDA 3IORA 1LB8A 3TZAA 2REGA 4QSDA 1MDP1 2A5TA 1JVXA 2ZXTA 3UIFA 2DVZA 3H6TA 3UGWA 1A7LA 4HTGA 1LLSA 4JB7A 1NNKA 2XXXA 3KZGA 3E9XA 1B32A 3G3HA 4NF4B 5H8HB 3LR1A 4LONB 4X1DA 2ABHA 1H76A 3E3KA 3GBAA 1HSLA 4DXUA 3K6XA 1I6AA 2GRVA 3CG3A 3MBPA 3RLFE 2XXIA 2CZLA 4LATA 3USDA 4H8IA 5DVJA 3TPAA 1QKAA 2FA7A 4ELOA 1D9VA 3FJ7A 3HHFA 3SKPA 4U4XA 4OFOA 4NE4A 2V3UA 4G2ZA 4GVOA 1CB6A 2ALUA 1FTOA 2ONKE 4U1OA 2OZZA 4YB5A 5AA3A 4HS7A 3K2DA 2O6AA 4C1TA 2CMOA 4NF6B 1H43A 2F97A 3K00A 3KN7A 1B3GA 2PBWA 1SVXB 2OCUA 3VVDA 3I3VA 3C34A 3SDFA 1FTLA 3MUQA 4NF5A 1A8FA 3K4UA 3O28A 2XX9A 2YLNA 1OVTA 1IXHA 1P1OA 1Z7ME 1EZOA 4OZ9A 4F29A 4QSEA 1LAHE 2ZYOA 4F2OA 3A3CA 4ZE8A 5DEXB 3ZKLA 2AL4A 3TKDA 4RYAA 4JBZA 1B0LA 2I4CA 4FECA 5BUUA 3FATA 2XXTA 2F8DA 4XTCQ 2Q2AA 3TTRA 3CG1A 3HV1A 1MQIA 1ZLQA 2AIXA 4OXVA 5H8NB 1FTKA 5AA4B 1Y4TA 3W9VA 4BLAA 1NL5A 1B5HA 4XIGQ 3FJGA 4OESA 4PFYA 3O6HA 3ILTB 3R6UA 4DE8A 2XX8A 3QUFA 4R9GA 2G29A 1NNPA 3VXCA 2DOJA 5KZTA 3H03A 1EZPA 3L6GA 4P0GA 5ICQA 3HSTA 2DS9A 2RC9A 4ND9A 5TP9A 1FQAA 3N5LA 4AB6A 4BDOA 4IO3A 2Z23A 2Y7RA 4FORA 2QJEA 1A54A 3QYTA 4GF8A 5KDTB 4OQOA 3PPOA 2M8CA 2DSFA 1IXIA 4OTEA 4I9DA 1B7UA 1B51A 5KCJB 1PC3A 2DE4A 3K01A 1QUKA 3MZBA 4FAJA 4GXAA 2YPNA 4E0XA 2DXRA 4F3BA 3T9HB 1UTHA 4IGRA 3C4MA 1TT1A 1I6BA 3M3LA 2A5SA 3VV5A 4U23A 3OO8A 2Y7WA 2F36A 1M5BA 2XHDA 3TTLA 3L6HA 4QFOA 1KWHA 3SETA 3GBBA 2V25A 1MQHA 3FIRA 3LSWA 4R2FA 3DLNA 3EHUA 3KSXA 4EQ9A 4R73A 1DTZA 4DCYA 3O29A 3CRBA 2UVHA 3OENA 4YKJA 4LZ7A 1B3EA 2F5XA 1SW4A 4EXLA 3KN8A 4NF4A 5H8HA 1SW5A 2AYSA 1BIYA 1FQDA 3V83A 1BLFA 3KOSA 2I6EA 1SW1A 3KBRA 4H0WA 2XXVA 1MG1A 2LAOA 1PB7A 3M8UA 3D4GA 4GXSB 1GV8A 4RY1A 1GR2A 4QF9A 3K0VA 5L9SA 1LAFE 3O6IA 2DYXA 5CMBA 4Q30B 3U8QA 3CIJA 5FTIA 4RXLA 3O97A 4MBPA 2V93A 1LAXA 1UIVA 4X9TA 3G3IA 2B65A 3U93A 3T93B 3KSJA 4KYDA 4NF6A 3LUYA 1HSEA 1YAEA 5EHMA 2HEUA 1N04A 3G3KA 5H8QA 1B3LA 2PVUA 1UTBB 4ONYA 1POY1 2ESNA 4F1VA 1ZU0A 4KFQA 5CBSA 5LOMA 4BDMA 3VLVA 3M3FA 4ISUA 3TTKA 5L9OA 4XKNA 2P2AA 2OBGA 3HCQA 1Y3PA 2HFBA 1I6QA 3RTFB 3CVGA 3SEVA 1JEVA 2QMWA 5I2NA 3ECRA 4HCWA 1SDXA 2QS3A 4KCDA 4PETA 1N0TA 3QSLA 2UVIA 5I59A 1LSTA 4OWDA 4G8MA 2H99A 4NMYA 1Q1KA 1ZJLA 4DCXA 4QFPA 1N84A 2XXYA 3O9PA 5B70A 1TFAA 1WODA 5CI5A 4ZE9A 3MVXA 2F7CA 3Q26A 4XXUA 5DVIA 2NOOA 2VGQA 4OFJA 4ZEFA 3GLBA 4G4PA 1JW4A 5I58B 3H06B 5TPAB 1D3KA 5CMMA 3O66A 2QL3A 2F35A 4JXIA 2F34A 4H65A 1LBCA 3FVOA 1IXCA 5F1QA 3FJMA 2UXAA 1A8EA 1URGA 4R6KA 3U1OA 2NXOA 1B0HA 5K2YA 3MZ1A 4OETA 4GLIA 2R71A 4ZEBA 1Y3NA 5KDTA 4JSOA 1RYXA 2H5YA 5FTHA 3CSBA 1B5IA 1XVXA 3KG2A 5L8DA 3TELA 4BDLA 3PMWA 4DXCA 2I49A 3DM0A 4DDDA 3TYHA 3MW0A 2QPQA 1OMPA 3IB0A 1PB9A 4L17A 5I56A 4GL0A 1B6HA 1N3WA 2O7IA 2XXQA 1B3HA 3H3GA 3OO6A 1R6ZA 2E0SA 4KI0E 3CR9A 2GH9A 4GL8A 2ZYMA 1VR5A 5TU0A 1CE2A 3OO7A 5EHSA 2O1MA 4IO5A 4F1YA 1N7WA 1IIWA 3MVZA 2PYYA 3PMXA 1FQCA 1QVSA 4YKPA 4TLMB 4H8JA 3IO4A 1A55A 2RC7A 1VE4A 2UYFA 1NH8A 3PUVE 1BP5A 4P11A 3N6TA 1ZKBA 1DOTA 1B05A 2VP1A 5A5XB 2XD3A 1Y4CA 4YMAA 2F6GA 3KEIA 1B9JA 4RK2A 4YAHX 3E13X 5FHMA 2ONSA 1JW1A 5I57B 3RNNA 4OENA 4AQ4A 3EPEA 3BFUA 3MVYA 3IB2A 4KPTA 5FHOA 3OXNA 3VLUA 4NF8B 1MPCA 1VFDA 2O7UA 2BJJX 4X48A 3QK6A 1PDAA 1B3FA 4OVJA 3LSLA 3FUZA 3KFMA 3C31A 3OO9A 4Z0IA 1S7YA 4RNSA 2Y7PA 3Q28A 1TXFA 3Q25A 1EH3A 3GXAA 3EN3A 4R6YA 4ZDMA 4YKIA 1SYIA 1S50A 2V3QA 1SI1A 2OWSA 3I6VA 4GFRA 5ELVA 1UTBA 2QS4A 3PD9A 4FJPA 1WDNA 3S9EA 2XXHA 4TOZA 3IK6B 5I2KA 4KQPA 5CBRA 3FVNA 4R72A 4RPNA 1B58A 5CM6A 4EF2A 3IAZA 1A99A 3OOAA 4JWYA 1TWYA 4H1XA 5H8FB 3HO7A 3ODBA 5ISUA 2ONRA 3TDJA 1MM7A 4LZ8A 1LB9A 2NVUB 4DXBA 2XXRA 1IUDA 3Q27A 2F78A 2O51A 3PUWE 1URDA 5DVFA 1XT8A 1ZTYA 3PMVA 2NWJA 3S4UA 1LBBA 2P1SA 1B4ZA 1GVCA 3QIMA 4F18A 4WXJA 4PFTA 2Z8EA 5HBCA 1ATGA 4YICA 4JSDA 3O2AA 1LCFA 4F19A 1LFHA 4LQ2A 4PFUA 3D4CA 3PUXE 4FIMA 3TMGA 1M5FA 2Q2CA 4WEDA 3A3UA 1BKAA 1VSOA 1MY0A 1EZ9A 4PP0A 2DWHA 4G68A 1MQDA 3SERA 4HCYA 5JK4A 1Y9UA 4RK9A 1OLCA 1LAGE 3PPRA 3T66A 4LZ5A 4EQ7A 2B3BA 1ZBMA 1IXGA 3Q29A 4QRZA 1B40A 1PBPA 1XVYA 1L5TA 2FNCA 3FZVA 3W9WA 2O1LA 4LVQA 5DTBA 3RT6B 2ZNUA 3R26A 1QULA 3C32A 4G77A 1H44A 3PV0E 4G8HA 3MWBA 1B4HA 4YB7A 1JETA 1M5EA 3CI8A 5AE4A 2G93A 2ZMBA 3K1MA 3H7MA 1MM6A 4EDPA 1SQYA 3P7IA 2P0SA 1NNFA 1MXZA 1I69A 3UN6A 4GRKA 4YMBA 2I48A 3ZKKA 4O3BA 4XKRA 2ZNTA 1SI0A 3IJOB 4M1VA 3PUZE 2RF1A 2NUVA 1DPPA 1IEJA 2VD2A 2Q8JA 3IOVA 1FQFA 4MLQA 4X1BA 1AMFA 2PT2A 4WEPA 3TQLA 5AA2B 4F39A 3S9LC 3RT8A 2B3FA 3GZGA 4U1ZA 1Q35A 3LSXA 1D9YA 3T96B 5B7DA 2UYEA 3B6WA 3K6VA 2F7AA 4GWOA 4MFIA 1WVJA 4RPOA 5H8SA 3UP9A 3VVEA 4NF8A 2UVJA 3C33A 4F22A 4AB5A 3R7XA 2Z8DA 2DE2A 4LUBA 1NKXA 1OQHA 4QFKA 2DP8A 3H6WA 3QXMA 5FHNA 1XHYA 4P0IA 1IZ1A 4IO6A 5DEXA 1MH4A 2QMXA 4KYSA 3TCHA 2REJA 1FW0A 2HAVA 5AA2D 4I62A 1OVBA 3H6VA 3SEXA 4OFLA 1AH5A 1OIBA 1O7TA 3IX1A 4ESWA 1POTA 3ILUB 1D4NA 3C36A 4ZS9A 1LCTA 1JNFA 3LC8A 1RYOA 5H8NA 4HW8A 3DP4A 1H3DA 5AA4A 3MAMA 2HZKA 4OEVA 1MXWA 2OWTA 3K6WA 3WAFA 1MXXA 3EHSA 3PU5A 4G8NA 5F7VA 3W15C 3AXFA 4F3GA 4F2QA 3OELA 4K3FA 1AL3A 4MH5A 3N26A 4F1UA 3EQ1A 4TQUQ 5CMKA 2R6GE 3H6UA 1MDQA 3HPIA 2IEEA 1MY4A 3SEYA 1MQJA 3MVWA 3I5OA 4DIGA 1MRPA 4FE8A 2X26A 3MPLA 1ELJA 2I58A 3UORA 4H67A 4UACA 2I3VA 5JTYB 3E4RA 1XC1A 4FEDA 4DZ1A 5CRYA 4YU0A 3MZ9A 3DP8A 3V5AA 5KCJA 4QFNA 5CC2A 3EHTA 1UTHB 4IO4A 1LFIA 1MXYA 4YKKA 3BKIB 4IO7A 1MY2A 3FGSA 4MLVA 3TEPA 4JDFA 1JW5A 1IQ7A 4KYEA 1R9QA 1JQFA 2O84X 1P1NA 2HAUA 3T9UA 3LSFB 3UA8A 4KD5A 1P1QA 2I0BA 3MP6A 3THIA 1LGBC 4POWA 4I8CA 3BBRA 4EF1A 3FVGA 5BWJA 1OLAA 3SEWA 2E1SA 1O63A 4E0WA 2IA4A 3MC2A 1P99A 3IOWA 2V3TA 2O68A 5L9MA 3TCFA 4YZZA 1B5JA 1MQGA 1NNTA 3IB1A 2HXWA 3F11A 4O3AA 2GHAA 2HZLA 2UVGA 4Z7EA 1ZIUA 2DQVA 4POXA 4JWXA 4OERA 4LP2B 1JEUA 3RQTA 1F9BA 2QSXA 2H25A 2VD3A 1YTVA 1B2HA 1PB8A 3CFLA 3C9HA 3FVKA 3KGCA 4F3PA 4EQBA 1R1NA 4NTLA 1B1HA 2PX1A 1R9LA 5AA2A 4R75A 4ELRA 4THIA 2ZNSA 5HPQA 1B1XA 2DE3A 3WAEA 4H6DA 2H4IA 3MP1A 3TFLA 3K1NA 4U22A 3TQWA 1J1NA 5DT6A 2VOZA 1N7XA 3QUJA 5H8QB 1QUIA 1AIVA 1T0KA 1QUJA 3ONMA 3U72A 1S9TA 3V8XB 5JEIA 5IKBA 3SEUA 1N3XA 1Y1MA 2DXYA 2Q9TA 1SD3A 3PPNA 4LA9A 3FV1A 5I2NB 2FYIA 3RUMA 2QS2A 4NWDA 3FD3A 1Y1ZA 3T9VA 4GQOA 4FATA 4NEDA 1ANFA 5I59B 4O3CA 3T9XB 4JWOA 4R2BA 3RGYA 1MY3A 2H9BA 2W7YA 4H5FA 2RC8A 1USYE 1B52A 1MY1A 3G3GA 1O64A 3B7DA 2ZYNA 3CFZA 2F7BA 4BDQA 4R6HA 2AL5A 4KHZE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4U21A 1EYIA 1GGGA 4OMBA 1SW2A 2VPOA 1EU8A 1MH3A 4C0RA 5HM4B 2ZZXA 3TAJA 3TTNA 1B7ZA 4ZECA 3N6UA 3RPWA 2MKZA 2ZZVA 3T22A 3MJNA 5M2VA 1RKMA 3RYDA 4UA8A 5DYHA 3BFTA 1NV1A 5IM2A 5I58A 1URSA 4PBHA 1VFEA 5TPAA 2GHBA 3DP6A 3S9MC 2CZHA 3RPLB 2DWJA 1RDXA 3G7WA 3TODA 3IO6A 2H98A 1Q9DA 4GD5A 4WKMA 3OSRA 3JV9A 4BDRA 4OEUA 1US4A 3VDFA 1DPEA 4PGNA 2Y7KA 4KR5A 5ITOA 5K2XA 3LBSA 1YCJA 1FPDA 2WKYA 1YPNA 3ISPA 5JTYA 1HSJA 5IAIA 2F3DA 5ITPA 4MF3A 2RKMA 1XOCA 1Y20A 4O7IA 1QW0A 5I56B 3HHGA 5IZ3B 4PFWA 4R74A 3S2VA 2RINA 4N13A 2OJTA 4OYVA 1XS5A 1OQGA 4G68C 2GFEA 4PFRA 2RCBA 4Q0CA 5J1DA 2A5TB 3RN8A 3C35A 4ZEDA 4NG7A 1YZ0A 2ANJA 3E79A 4I1DA 4IB2A 3IOTA 3ZS6A 5ICTA 3VFJA 4F31B 3ZSFA 4ESXA 3EF7A 2X7PA 1A40A 1M5DA 4Q5TA 5EQ8A 4IO2A 3TCGA 4O7MA 3MP8A 2DWIA 1FQBA 2THIA 3FASA 3VXBA 2XA5A 4PE5B 2Y7IA 2OLBA 2QRYA 2VHAA 4MAGA 3TTMA 4FEBA 4LQ5A 2I4BA 1FTMA 2PMSA 1B46A 3FXUA 1DMBA 2QS1A 2F6PA 1MPDA 4N15A 4EXKA 2XD2A 1PBQA 3MPKA 3PPQA 1N76A 3KN3A 3G3JA 4OVTA 5AA1A 3K6UA 5EYHA 3MQ9A 1LFGA 2V84A 1SYHA 3HN0A 1US5A 4TLLB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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