1FQDA

Crystal structure of maltotetraitol bound to closed-form maltodextrin binding protein
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the maltodextrin/maltose-binding protein complexed with reduced oligosaccharides: flexibility of tertiary structure and ligand binding.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
total genus 111
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqdA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqdA01
2FNCA 3V83A 2R71A 4IO7A 2I4CA 2NXOA 1BKAA 1LFGA 2QS1A 2QPQA 4AB5A 4X1BA 2H99A 1MM7A 4FORA 4KHZE 3IO4A 3TAJA 3IJXB 2G29A 3TUSA 3PPRA 5KCJB 3CIJA 3LSXA 3MZBA 4OFLA 2PMSA 3IR1A 3S9NC 4PFTA 2Z8DA 5ITPA 3OO6A 1USYH 3ZS6A 1MPDA 3U8QA 4GF8A 1LAGE 4GXSB 4GL8A 5I2NB 2HZKA 4YKJA 4QFOA 4Q8RA 1Y1ZA 4RY1A 1MPBA 4DDDA 3IL1B 5H8NB 4FAJA 3LC8A 2DE3A 5KZTA 1B1HA 2WKYA 3DELB 2UVHA 1N3XA 3OO8A 2Z8EA 3DM0A 2F5XA 2I48A 3UN6A 1XVYA 3K6XA 2I0CA 4X1DA 1N76A 5ITOA 2I4BA 3E13X 2HEUA 3CSBA 4NE4A 3IK6B 4F18A 1O7TA 4H6DA 3VFJA 1KWHA 1B3HA 1S50A 3K02A 3U93A 4I8CA 2XXHA 3TEPA 4BDNA 1QUJA 3U94A 1H44A 3RTFB 4GOTA 2XXPA 2GHBA 3OO7A 3PMVA 4OFOA 1POY1 5HPQA 3I5OA 5DEXB 4QRZA 2HZLA 3EQ1A 2OZZA 3KOSA 1BP5A 2ALUA 1WVJA 3IOUA 1IQ7A 1WODA 1AH5A 1YPNA 2REGA 3SERA 3RLFE 4HS7A 1I6AA 3VV5A 3H6WA 2ONKE 3C32A 4IO4A 3RPWA 2Y7IA 1B7UA 3FIRA 5FTIA 3CSGA 2QS4A 1M5DA 3O6HA 4JWYA 2XXXA 5FHMA 1XS5A 2O69A 1NNPA 1Y4TA 1CE2A 2QRYA 4FJPA 2YLNA 3O9PA 2XXWA 1FQCA 4LATA 4XIGQ 3SEVA 1MY1A 3K4UA 2V3QA 5TPAA 1QUKA 4ECFA 3MAMA 5J1DA 3SEWA 4UA8A 4EDPA 2F6GA 1PC3A 3LBSA 1CB6A 3FVOA 4P0IA 4OHNA 1AOVA 1L5TA 1I6QA 2DSFA 4G77A 4X9TA 1DMBA 4KCCA 4EF1A 4BLAA 4WEDA 5CMMA 5ISUA 2O7UA 3FATA 1MS7A 2OWSA 3E9XA 4ONYA 1N3WA 4WEPA 1RYXA 3C4MA 4R73A 1JW1A 3HV1A 5CM6A 2O7IA 1AL3A 2X7QA 3VLVA 1DPPA 4E0XA 1D3KA 3QK6A 1Q35A 4BDLA 3E3KA 3I6VA 1SW4A 1MXZA 4LP2B 4GXAA 3S2VA 4FE8A 5I59A 2ZMBA 5AA2B 4TLMB 2RCBA 2ZNUA 3TMGA 4KYSA 4BDRA 1ZJLA 3T9UA 3TFLA 2NUVA 1IXCA 4E0WA 3QYTA 2OJTA 4ZEFA 3L6HA 3T66A 4H8JA 1S7YA 2I3VA 2QS3A 3CR9A 1P1NA 5FTHA 2DWJA 1XT8A 4I1DA 2DWAA 2RINA 4G68B 1M5EA 3FXUA 5TP9B 4EF2A 1LAXA 3THIA 3EF7A 3K2DA 1MQIA 3SDFA 3BKIB 4FEDA 2D5WA 4LZ5A 3PPNA 1MH3A 2UYEA 5A5XA 3MP1A 2O6AA 2DE4A 4U23A 3H6VA 1OLCA 1A8EA 3G3JA 1GR2A 3U72A 1DPEA 3O97A 4QFLA 4C1TA 1B3FA 1B3GA 4N07A 3HCQA 2O1LA 1B5JA 2RC7A 2F6PA 3RTWB 1Y20A 4ZECA 5FHOA 1SYIA 3SEYA 2GFEA 1R6ZA 3MWBA 1MPCA 5H8HB 3TTLA 3QIMA 3MPKA 1P1UA 4U22A 3QXMA 4RXLA 5HBCA 4G2ZA 4R6YA 4GRKA 2V3UA 3IOTA 3PPPA 3KFMA 2XHDA 1DTZA 4RK2A 2F35A 3TTNA 3CG1A 3IB1A 1N7XA 5I57B 3TTRA 5KDTA 2Q9TA 4FEBA 3FVNA 4C1UA 1FTKA 1MDP1 2I6EA 1JW5A 3ILTB 2PVUA 3G3HA 4NF5A 4ZS9A 3N26A 3V89B 5CMBA 1VE4A 4TLLB 1POTA 2A5TA 3C31A 1Z7ME 4FATA 3LSWA 4F39A 3EHTA 2RKMA 4FIMA 3CFXA 1WDNA 2Y7PA 4H8IA 3ILUB 3ECRA 1NFTA 1N7WA 3TCGA 4U4SA 3PU5A 1GVCA 3I3VA 3L6GA 4Z7EA 2PBWA 2E0SA 1ZKBA 1Y9UA 4NF4A 2O51A 3H7MA 1II5A 1AIVA 3O6GA 4XKRA 3KJ7A 4AB6A 2P2AA 3K6WA 4C0RA 3FJ7A 2IEEA 2QL3A 4OEVA 3AXFA 3G3GA 4KQPA 3CFLA 1RKMA 3HO7A 2HCAA 3KEIA 3F11A 2OK2A 2O1MA 3T93B 4GQOA 4BDQA 2D21A 4RJZA 4ELRA 3U92A 4RPNA 1HSLA 3VVFA 1DOTA 1BTJA 5CC2A 3RNNA 3TODA 2DP8A 4DIGA 4JWXA 4NF6A 3EN3A 1HSEA 2OWTA 5DTBA 5I2KA 2Q89A 2Q2CA 1QKBA 1ZBMA 2X26A 1JQFA 1OLAA 1NNTA 2ZXTA 4DCXA 1PB9A 3KOTA 4ESXA 3K1PA 1D4NA 3W9WA 3OOAA 3TTMA 4F2QA 3SETA 3LSLA 4HCWA 4LA9A 3RN8A 3MW0A 1M5BA 2AL5A 3VXBA 1I6BA 4NTLA 3ODBA 4LUBA 3CRBA 3O6IA 5ELVA 2F34A 3T9VA 3IOWA 1MY3A 1MQGA 1IXIA 4YICA 4KYEA 2XD2A 1MDQA 4OFJA 4HW8A 3RUMA 4ND9A 1EU8A 3C34A 3CFZA 5I58A 2ZNTA 2NWJA 4ISUA 1MXXA 1R1NA 4OESA 3CG3A 1MXWA 2DVCA 1UQWA 4BDOA 4KI0E 5H8FB 2RC9A 4IGRA 3IAZA 1B46A 2FA7A 3MVWA 1AMFA 3BFTA 2E1SA 3VVDA 1FQAA 2ZNSA 1ATGA 4YU0A 3MVXA 3PD9A 5F7VA 2V25A 2FYIA 3MVZA 4POXA 3P7IA 3OMBA 4R2BA 1EZPA 3HN0A 1SW2A 4H1XA 4TQUQ 2PYYA 2XXTA 4UACA 5TU0A 3GXAA 2H4IA 3VLWA 4F2OA 1SQYA 2R9JA 1A40A 2ZYMA 4JWOA 3C36A 1FTLA 2H5YA 2XD3A 1A99A 3PMXA 1MH4A 3OEKA 4N13A 4G68C 1EZ9A 2LAOA 4IO5A 4MFIA 1RYOA 3LR1A 5AA4A 1MQHA 4EXKA 3FV2A 4KFQA 3HPIA 3PUWE 4YKKA 4ELPA 2HXWA 1A54A 3PUXE 1SBPA 2DS9A 4M1VA 2DVZA 4MH5A 4K3FA 1UTHA 5L9MA 3FVKA 2XXIA 4PQJA 4H5GA 4YKIA 3QUFA 5ICTA 1MM6A 2F7BA 3C33A 4H65A 4NWCA 3KN7A 1J1NA 4FECA 3EHUA 3M3FA 4QFNA 4YB5A 2GRVA 3TQWA 4F1YA 3PGFA 1YCJA 1UTBA 5H8QA 4H5FA 1MRPA 2F36A 3SESA 3T9HB 5I84A 1QVSA 3VXCA 4O3AA 4PFUA 3T96B 3A09A 1N0TA 1OVBA 2A5SA 3RGYA 3FASA 4F3PA 4IO3A 4Z0IA 1M5CA 2X7PA 1QJMA 2Y7WA 1B40A 3VDFA 2F97A 4R9GA 4DCYA 4F22A 5LOMA 2PT2A 2Y7RA 4WKMA 5DVIA 4OYVA 2V84A 2Z22A 4ZDMA 5M2VA 3RT8A 3RQTA 5I56A 1US4A 3VLUA 4RA1A 4QFPA 4NF8A 2B3FA 4YZZA 4F1VA 4LZ7A 3FZVA 1B0HA 1DTGA 1Y1MA 1JEUA 3TDJA 3K1MA 3B6QA 2B3BA 4MLVA 1D9VA 1A8FA 5JTYA 3W9VA 2DXRA 2Y7KA 4GVOA 1SW1A 4OERA 4Q0CA 3ZKKA 4F29A 1H43A 1HSJA 1P1OA 3S9MC 1VFEA 5EYFA 3K0VA 4U4XA 1OQGA 5CMCA 3FD3A 2HAUA 4PFYA 4IGTA 2ZYOA 3MBPA 2XX9A 4ZEIA 5KCJA 4F3GA 4BDMA 3HSTA 4R75A 3CVGA 2I3WA 2XXUA 4H0WA 1OVTA 5H8SA 1B3EA 3WAFA 1LCFA 4OTEA 1XHYA 5I2NA 3UA8A 1H76A 4P11A 1ZTYA 2BJJX 3GBBA 1FQFA 5K2XA 3H3GA 4QF9A 3LUYA 3PV0E 4NMYA 1US5A 1B7ZA 3FJGA 1I69A 1ANFA 2UVIA 1B58A 4M4GA 1Y3PA 4YB6A 2GH9A 3Q28A 3A3CA 1SW5A 5TPAB 5CBSA 1MXVA 3FUZA 3PUZE 4GLIA 4KR5A 3FXQA 3N94A 2REJA 1FQEA 1MQDA 4IB2A 4IY5A 4EQ7A 1B52A 3DP4A 4XXUA 4LVQA 3W15C 2RF1A 4U1ZA 1OIBA 4HCYA 5DEXA 4OVJA 4F19A 1NMUA 3MQ9A 4JSOA 1FTMA 3SKPA 1XC1A 4R9FA 3SEXA 2UVGA 1QUIA 1SI1A 3T9XB 1LFHA 4ELOA 3O29A 3TQLA 2ANJA 5I59B 2YPNA 4MBPA 1YTVA 4Q5TA 1TXFA 2W7YA 4OXVA 5K2YA 4QSCA 4XKQA 3FVGA 4TOZA 3H6TA 4YMBA 1R9LA 2ZYKA 4I9DA 5AA1A 1O63A 1FW0A 1IXGA 3MVYA 4U21A 2UXAA 3TTKA 2VD2A 3TCFA 4GD5A 4OEUA 3JV9A 2YJPA 4LZ8A 1TWYA 2XXRA 4XKNA 3MUQA 1MY4A 2DXYA 2H9BA 3G3FA 2VGQA 3B6WA 2CZLA 5A5XB 2I0BA 1P99A 3PD8A 1MXUA 4PP0A 2AYSA 2V3TA 2UYFA 1BLFA 2Z23A 3JYRA 4G8NA 1Y3NA 1ZLQA 4JB7A 5DT6A 1LBBA 3Q27A 3ZKLA 1QULA 4JDFA 2ESNA 3KJTA 3S4UA 3TCHA 1Y4CA 1MXYA 1LSTA 2G93A 1B51A 1TFAA 4F3SA 3G3IA 1PB8A 4GWOA 3IX1A 2QMWA 5BWJA 2Q8JA 4R72A 5B70A 4N6PA 3IB2A 1ZMGA 5HM4B 3KGCA 4OZ9A 3KBRA 4ZZAA 1IXHA 1FQBA 1LAFE 4GL0A 1EH3A 1B4HA 5AA2A 3UORA 2Y84A 3R26A 3E4RA 2QS2A 1LLSA 2H98A 4YAHX 3MC2A 3KSXA 3G7WA 4QSEA 3TKDA 1LB9A 3USDA 4IO6A 3Q26A 1OMPA 1JW4A 3JZJA 3O66A 2O68A 4WXJA 3MP6A 4PETA 5DVJA 4X48A 5KDTB 5IKBA 2OBGA 3T22A 1PEBA 5F1QA 5EHSA 4PFWA 4G68A 1JNFA 1IIWA 3K6UA 2R6GE 3OO9A 4MF3A 5TP9A 4EUOA 1SDXA 3K01A 4NF5B 2HAVA 2ABHA 4IO2A 1B32A 4DXCA 3IOVA 3DP8A 4POWA 3OELA 2A5TB 2CMOA 1Z7NE 1YAEA 1P1QA 2DWIA 4EQ9A 4ZEDA 5AE4A 1S9TA 3U1OA 2D3IA 3PMWA 4YB7A 3KSJA 2DQVA 1TFDA 1JVYA 1SYHA 4OMBA 4ZEBA 5FHNA 1URGA 3ONMA 5L8DA 2RCAA 3PUYE 1LGBC 1MY0A 4NF4B 4R74A 3FJMA 1FTJA 1B4ZA 1B5HA 3TPAA 1QKAA 2F7AA 3N6TA 5BUUA 4OQOA 1UIUA 3QAXA 5H8HA 2XX8A 1NNKA 2DWHA 1JETA 3FXRA 3R7XA 1LAHE 4OETA 4DZ1A 2PX1A 2ZYNA 2F78A 4Q30B 1B05A 3DLNA 1SI0A 5I57A 5JK4A 3HHFA 3OXNA 1H3DA 4ZE9A 2NOOA 1JVXA 3A3UA 4P0GA 4ZZEA 4NF6B 4U2RA 3K6VA 1IUDA 1B5IA 1T0KA 1MY2A 3D4CA 5I2KB 1R9QA 1SVXB 3K1NA 4LONB 3C9HA 2B65A 4DE8A 4THIA 4JXIA 1QW0A 4F1UA 2AL4A 4QFKA 4PE5B 1N84A 3V8XB 1XVXA 1MG1A 1NKXA 3KN3A 4EXLA 4F31B 3BBRA 4XTCQ 1FCKA 5EHMA 3H4ZA 1N04A 3KN8A 3EPEA 3V5AA 5L9OA 4ZE8A 2OCUA 1VSOA 2QJEA 3KG2A 3QUJA 1NNFA 4LQ2A 3EHSA 4KD5A 4KCDA 2GHAA 1B1XA 4R2FA 3R6UA 4JSDA 3RY3A 5CI5A 3M3KA 2DYXA 3MZ9A 3MPLA 4R6KA 1IZ1A 1XOCA 3N5LA 2I58A 4F3BA 3DP6A 5I58B 4QSDA 1B9JA 3LSFB 2DE2A 1SD3A 2F8DA 1URSA 2XXQA 2DOJA 5CBRA 2IA4A 2F7CA 5JEIA 1LCTA 1FTOA 5B7DA 2ONRA 2V93A 2UVJA 3UK4A 1B3LA 3S9LC 1DSNA 3VVEA 2XXYA 3OSQA 3PUVE 2I49A 3Q29A 3SEUA 3ZSFA 5AA2D 2QMXA 2Q88A 3MP8A 1PDAA 1VR5A 3H6UA 5CRYA 1M5FA 1Q1KA 1OQHA 4JBZA 1BIYA 2HFBA 4NEDA 4O3BA 4O3CA 1USYE 5DVFA 3S9EA 2XXVA 1IITA 3PPOA 1PBPA 2VD3A 5H8NA 2OLBA 2QSXA 3Q25A 4RNSA 5L9SA 2PT1A 3UGWA 1O64A 1A55A 4RPOA 5CMKA 4RYAA 5AA4B 1NL5A 4NWDA 3C35A 1LFIA 3TYHA 4AQ4A 2NVUB 1GV8A 3CI8A 4OWDA 1LB8A 3H06B 1LBCA 2XX7A 3GBAA 3TELA 5ICQA 3VE1B 5H8FA 1UTHB 1PB7A 2P0SA 2HQ0A 4ESWA 1JEVA 3OEMA 3WAEA 1MQJA 2O84X 3IORA 1ZIUA 5IAIA 4EQBA 3IB0A 4L17A 2VHAA 3K00A 4XKPA 2KLFA 4H67A 4R6HA 1B2HA 3TZAA 4ZEKA 2RC8A 3IO6A 3O28A 2Q2AA 1GGGA 3M8UA 4QHQA 4GIZA 1ELJA 2AIXA 1NH7A 1H45A 5H8QB 1UTBB 2P1SA 4HTGA 4ELQA 1B7HA 1B0LA 4G4PA 3N6UA 3BFUA 2ONSA 2H25A 3FV1A 3OENA 3MJNA 3H03A 1VFDA 4DXBA 3MZ1A 1GTKA 3OSRA 3O2AA 3G3KA 1TT1A 3B6TA 1A7LA 1D9YA 1F9BA 4IY6A 4LQ5A 4DXUA 3UP9A 2THIA 2Z8FA 3HHGA 4MLQA 3IJOB 3D4GA 3GZGA 2M8CA 3OD7A 1P1WA 4YMAA 3FGSA 1B6HA 4G8MA 1Y3QA 4YKPA 5I56B 3KZGA 1URDA 3GLBA 4NF8B 1EZOA 4OENA 3RT6B 1FQDA 3PPQA 4GFRA 2VOZA 3B7DA 5AA3A 4G8HA 4KYDA 4DLDA 1UIVA 1ZU0A 2VP1A 5JTYB 3UIFA 4RK9A 1IEJA 3QSLA 1NH8A 4U1OA 4I62A 5DYHA 1PBQA 3M3LA 4KPTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FNCA 3V83A 2R71A 4IO7A 2I4CA 2NXOA 4NGUA 1BKAA 1LFGA 2QS1A 2QPQA 2HPGA 4AB5A 4X1BA 2H99A 1MM7A 4FORA 4KHZE 3IO4A 1IMAA 3TAJA 3IJXB 2G29A 3TUSA 3PPRA 5KCJB 3CIJA 1G0HA 3LSXA 3MZBA 4OFLA 2PMSA 3IR1A 3S9NC 1FJ6A 4PFTA 2Z8DA 5ITPA 3OO6A 1USYH 3ZS6A 1YZ0A 1MPDA 3U8QA 4GF8A 4DI3D 1LAGE 4GXSB 4GL8A 5I2NB 2HZKA 4YKJA 4QFOA 4Q8RA 1Y1ZA 4RY1A 1MPBA 4DDDA 3IL1B 5H8NB 4HE0A 4FAJA 3LC8A 2DE3A 5KZTA 3HFUA 1B1HA 2WKYA 3DELB 2UVHA 1N3XA 3OO8A 1FTAA 2Z8EA 3DM0A 2F5XA 2I48A 3UN6A 1XVYA 3K6XA 2I0CA 4X1DA 1N76A 5ITOA 2XWVA 2I4BA 3E13X 2HEUA 3CSBA 4NE4A 3IK6B 4NQ8A 4F18A 1O7TA 4H6DA 3VFJA 1KWHA 5J16A 5EYGA 1B3HA 1VDWA 1S50A 1FPLA 3K02A 3U93A 4I8CA 4PF6A 2XXHA 4PDDA 3TEPA 4BDNA 1QUJA 3U94A 1H44A 3RTFB 4GOTA 2XXPA 2GHBA 3OO7A 3PMVA 3T0JA 4OFOA 1POY1 5HPQA 3I5OA 2VT5A 4MCOA 5DEXB 4QRZA 2HZLA 3EQ1A 2OZZA 3KOSA 1BP5A 2ALUA 3FXBA 1WVJA 3IOUA 1IQ7A 1WODA 1AH5A 1YPNA 2REGA 3SERA 3RLFE 4HS7A 1I6AA 3VV5A 3H6WA 2ONKE 3C32A 4IO4A 1QGXA 1FBPA 3RPWA 2Y7IA 1B7UA 3FIRA 5FTIA 3CSGA 2QS4A 4QBAA 1M5DA 3O6HA 4JWYA 2XXXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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