1MY4A

Crystal structure of glutamate receptor ligand-binding core in complex with iodo-willardiine in the zn crystal form
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my4A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my4A01
1XT8A 4ZDMA 4EDPA 2Z22A 2Z8EA 3A3CA 2QJEA 4EF1A 4H0WA 3N6UA 1ZKBA 4MLVA 4AB5A 2XXRA 1B9JA 3MZ1A 2F5XA 3VDFA 4HCYA 4U4XA 3QK6A 1N3XA 3TYHA 3UIFA 2HCAA 4F31B 1O7TA 1N7WA 3EHSA 4H8IA 5FHNA 2Y84A 3K6UA 4NF8B 2XHDA 3CSGA 3K1NA 2ZXTA 5I56B 1Q1KA 3HSTA 5I2NA 3U94A 4QSCA 4RNSA 3FD3A 1I69A 4FJPA 4JWYA 3U8QA 4PETA 4ZEDA 3TKDA 4NTLA 3M8UA 3U1OA 3DP8A 1FW0A 3O6GA 2P2AA 4IO3A 2HAUA 4BDQA 4LQ5A 3LSWA 1J1NA 1N7XA 3CSBA 3HCQA 2QSXA 5CI5A 1DPEA 1S50A 2F36A 1ZTYA 2REGA 2DOJA 3MVXA 3H06B 3SEYA 1DSNA 4GRKA 4TOZA 3Q25A 3FATA 5M2VA 1DOTA 3HO7A 2Z8FA 3S9MC 4GOTA 4U1OA 3ECRA 3W9VA 4DDDA 3SDFA 1D9YA 1SW5A 2Z23A 1H76A 4H67A 2O7IA 3MP6A 1IUDA 4YU0A 4HS7A 1B0HA 3IL1B 2DQVA 1PBQA 5FTIA 3KZGA 4PFTA 5H8HA 3Q28A 4YKJA 1FTOA 3RTFB 3RT8A 4C1TA 4Q5TA 3AXFA 3HV1A 3VXCA 3E4RA 1MS7A 2NOOA 2ZNSA 3E9XA 1EZPA 3MPKA 4IY6A 2B65A 5CRYA 4ZEIA 4XKQA 2Y7PA 1MXWA 3KOSA 1LB9A 3ILUB 4ZZEA 5H8NA 3B7DA 2ZYOA 1M5EA 1M5BA 4R73A 1FCKA 4WKMA 4ISUA 3PUZE 4JXIA 4GXSB 3CI8A 1LGBC 3GBBA 4EXLA 3A09A 2VD2A 4JDFA 2Y7RA 1MY4A 3H3GA 2HZLA 1SI0A 4WEPA 2ANJA 2HEUA 5ITPA 3VVDA 5FHMA 5CMKA 1LBCA 3OO6A 3IOUA 1D9VA 5I2KB 3VVFA 4AQ4A 1XVXA 3KG2A 4I8CA 2XD2A 3VLWA 4YAHX 1JVYA 3OEKA 1T0KA 3V89B 1SDXA 1B1HA 1H44A 4FEBA 1TFDA 3TTRA 1Y4CA 4DZ1A 3C32A 2O69A 3H7MA 3MVWA 2A5TB 2XX7A 4GIZA 3MWBA 5DEXB 3QXMA 1VSOA 1A7LA 1QUJA 3BFTA 4F3GA 1D4NA 1B4ZA 4HW8A 2DE4A 4YKKA 4XKRA 5KDTB 4F19A 4L17A 1NNKA 1P1WA 4LA9A 3H6WA 4JWOA 4Q30B 3TELA 4P0GA 3PPOA 3SEWA 1XS5A 3KSJA 2XX8A 4ZEKA 3IOTA 1CE2A 1MRPA 2I58A 2DYXA 1GTKA 3R26A 3LSLA 4F22A 2F6GA 1R1NA 1B7ZA 5ICQA 3K1PA 1OIBA 3R6UA 3H4ZA 4YB5A 3CVGA 5JK4A 1BKAA 4KYSA 4ELPA 2R71A 4NE4A 4FAJA 4R2FA 2ONSA 3CR9A 1PB8A 4NF5B 3K6XA 3GZGA 3UA8A 2XXPA 4XKNA 2Y7WA 2FYIA 4QRZA 3IORA 5CMCA 1MY0A 1ANFA 2P0SA 4U1ZA 1IQ7A 4Q8RA 1URSA 4OTEA 1AIVA 1A8FA 3H6VA 4ZECA 2QPQA 1UTHA 2O1MA 3VE1B 4ZEFA 4R6YA 4TQUQ 4G8MA 5FHOA 1SBPA 1Y3PA 1P1UA 3PV0E 3ZSFA 2PBWA 1QJMA 2OBGA 5B70A 4XTCQ 3FVNA 2DVZA 1OVBA 4G8HA 4QSEA 3DELB 2F8DA 5DVFA 3F11A 1OVTA 1HSJA 2ALUA 5HM4B 1B1XA 5H8HB 1LFIA 3L6GA 4POWA 1FTJA 1B0LA 3MVZA 4YB6A 1MDP1 2RINA 4GXAA 1H43A 3KSXA 5A5XB 3TODA 1B5JA 3IK6B 1P1NA 1B7UA 4PFUA 3OELA 2H25A 3LBSA 1B46A 4LONB 4F18A 5H8NB 1B51A 2G29A 3T9XB 3S4UA 1EH3A 3VFJA 5H8FA 3CG1A 1US4A 3E13X 4I62A 1B3LA 2DSFA 4PFWA 5I2KA 3EPEA 1USYH 2RF1A 2W7YA 2H5YA 3C34A 1A40A 1B32A 3W15C 1S9TA 2GRVA 4OMBA 1UTBB 4ESWA 3SEXA 4QFPA 3LC8A 1HSEA 4JWXA 2PX1A 5L9MA 3TTKA 3SERA 5CM6A 3GLBA 1B3HA 5DVIA 3SESA 4X1DA 1PBPA 5DEXA 2NUVA 3FASA 3G3HA 4RPNA 1JETA 3T66A 3K4UA 2Q2AA 3I6VA 3QUJA 3BKIB 1SYHA 2ZYMA 3SEVA 4DCXA 5KDTA 1EU8A 1ZJLA 1A55A 3OOAA 1NL5A 4F1YA 3K01A 2E1SA 1JQFA 4MLQA 2DP8A 4KFQA 1SVXB 1OQHA 3PU5A 1YAEA 1IXCA 5H8SA 3S9NC 4DXCA 4PQJA 3B6WA 4OWDA 3MBPA 1JW5A 3QYTA 3MW0A 3KBRA 3M3FA 2O7UA 1PB9A 3KGCA 2OJTA 4ONYA 5K2YA 2LAOA 2X26A 2Q9TA 2O1LA 4H8JA 3IO6A 4IO7A 5EHMA 5TPAA 1MPDA 3FV2A 2Q88A 1PB7A 3CIJA 2OK2A 3N5LA 2V3QA 1SW2A 2AL5A 2GFEA 2VP1A 1JW1A 5CMMA 2V84A 1CB6A 3M3KA 2RC9A 4NF5A 4ZEBA 2OCUA 4EXKA 3IJXB 3QAXA 2I4BA 1UQWA 1R9LA 1B40A 2FNCA 4FORA 1SYIA 4BDNA 1MPBA 1QW0A 2F7AA 4G8NA 2DWHA 5H8QA 1FTMA 3S2VA 1SD3A 3K00A 2I48A 4KQPA 3DP6A 3UK4A 4G2ZA 3RQTA 2D3IA 4BDOA 3CFLA 1N76A 2FA7A 3IR1A 4R6KA 3KFMA 3HHGA 3USDA 3MC2A 4F29A 4LZ8A 2IA4A 4OVJA 2UYFA 2YPNA 4EQBA 1UTHB 4FEDA 2CZLA 5CBRA 3FZVA 4E0WA 1MXUA 1KWHA 1JVXA 3JZJA 1P1QA 1POY1 4ZE9A 3FJ7A 3FUZA 5A5XA 1N0TA 4X9TA 2HFBA 2X7PA 1EZOA 2V93A 4DXBA 1ZIUA 3TDJA 3ILTB 3DLNA 5CMBA 4GFRA 1Y3NA 2PVUA 3MVYA 3RY3A 5KZTA 4OEVA 1JW4A 3UGWA 2QS3A 4R75A 4F2OA 2V3UA 2VOZA 3EHTA 1A8EA 4KD5A 1Q35A 1LFGA 1XC1A 4RY1A 3O29A 3K1MA 3K02A 1UTBA 3FVKA 1NH8A 3G3IA 2NWJA 3KEIA 5H8FB 2Y7KA 5J1DA 3S9LC 1DTGA 2QS4A 3OXNA 2I3VA 2DWAA 4NF4B 3K6WA 4XKPA 4U22A 2P1SA 3OSRA 2VHAA 2YJPA 1SI1A 4ZE8A 4LATA 3KJTA 1B2HA 3RN8A 2ABHA 4THIA 1FQFA 1N3WA 2DWIA 3SEUA 3LSFB 4O3CA 3MZBA 3PMVA 4RK9A 2AYSA 1MH3A 4P0IA 4DCYA 4UA8A 1B6HA 2X7QA 1OLAA 3C35A 4GQOA 3OSQA 2QS1A 1I6QA 4BLAA 3MAMA 4PP0A 4MBPA 3TTMA 5HPQA 4O3BA 3QUFA 4GL0A 5KCJA 4R9GA 2AL4A 1R9QA 2RC8A 4U21A 5ICTA 1BTJA 1VFDA 2O68A 1MXZA 1YCJA 3RT6B 3VVEA 1FQDA 3G7WA 3RNNA 5AA2A 3VLUA 4EF2A 2DWJA 4BDLA 1Z7NE 5TPAB 4JSDA 4O3AA 4N07A 1LCFA 4NMYA 2QS2A 3TQLA 2XXXA 4UACA 4ESXA 1RKMA 4M1VA 2UVIA 4IO2A 2YLNA 4LZ5A 3PGFA 1PC3A 4GLIA 3QIMA 1SW1A 2H4IA 2F34A 2THIA 3IJOB 3K0VA 3MP8A 1B5IA 2XX9A 3N6TA 3R7XA 5DT6A 2PYYA 4F3PA 4F2QA 2OZZA 2I3WA 1B4HA 4F1VA 4LP2B 1D3KA 4EQ9A 5I59A 3CFZA 3OMBA 3THIA 3T9HB 4AB6A 1TFAA 2V3TA 5I84A 5H8QB 3FGSA 1USYE 4R6HA 3TTNA 3MQ9A 3Q26A 2H9BA 1B3FA 3U93A 1LAHE 3C33A 3SKPA 3Q27A 3O9PA 1GGGA 3D4GA 1LSTA 1O64A 3IX1A 4YICA 2OLBA 1NKXA 1MQIA 3N26A 3KOTA 4X48A 2I6EA 2XXHA 2O6AA 2UVHA 3M3LA 2HZKA 3OO7A 2DS9A 3T96B 4ZS9A 4LUBA 5ITOA 1LB8A 4F3BA 4IB2A 4KPTA 1OLCA 1H3DA 3T9UA 1POTA 1MQHA 4QSDA 5FTHA 4EUOA 1TWYA 2ZNTA 3IB2A 1VFEA 4QFOA 2GH9A 4FIMA 1SQYA 4TLLB 4IGRA 3L6HA 4OZ9A 1B3GA 3ZKKA 1WODA 4LZ7A 3D4CA 4U2RA 4H65A 3E3KA 4OFJA 4QFNA 1RYOA 4G68B 2GHAA 4GD5A 4FATA 4Q0CA 3O6IA 1OMPA 3RPWA 4NF4A 1Y9UA 1URDA 2Q2CA 3PUWE 3HPIA 1MXVA 2XXIA 5AA4A 1GV8A 1JEUA 3K2DA 3OD7A 3C4MA 3N94A 3EHUA 5TP9B 1JNFA 4YKIA 3U92A 4OHNA 5BWJA 4HCWA 3CG3A 2CMOA 3OO9A 1B05A 1N84A 2QMWA 3V83A 3WAFA 3QSLA 1I6BA 1QUIA 2B3BA 4P11A 1TT1A 4DE8A 2Q8JA 4MF3A 1DMBA 2R9JA 4FECA 1FQEA 5I58A 4OERA 5I57B 1XVYA 5CBSA 2PT2A 3PMXA 5DVJA 2D5WA 4NF6B 3OENA 3MP1A 5ELVA 1XOCA 3GBAA 2I0BA 1MY2A 4DIGA 3TQWA 1US5A 3FJMA 1FTKA 2F6PA 5ISUA 2F35A 4GL8A 5EHSA 2HQ0A 5KCJB 3IO4A 2KLFA 1L5TA 5BUUA 4NEDA 3IOVA 1PDAA 1AMFA 4E0XA 1O63A 2E0SA 3FXUA 3WAEA 1MM7A 4I1DA 3G3KA 1IXGA 5AA2B 4G77A 2RCBA 3H6UA 1AH5A 4R74A 3KJ7A 3MZ9A 3RGYA 3EN3A 3OEMA 3PUYE 1MQJA 3RTWB 1BP5A 3KN3A 3TZAA 3UN6A 4OXVA 2XXQA 2XXUA 2VD3A 1P1OA 2HXWA 2AIXA 1B3EA 1S7YA 2UVGA 2PMSA 4N6PA 3UORA 4IO6A 3K6VA 1NNTA 4OQOA 4WXJA 3B6QA 4F3SA 4EQ7A 3T9VA 3TEPA 3PD9A 1OQGA 5I59B 3IB1A 5L9SA 4QFKA 4ZZAA 2NXOA 5AA2D 4MH5A 3G3JA 1MY3A 1MXYA 2H99A 4RPOA 1Y3QA 4M4GA 3A3UA 4F39A 4MFIA 5F7VA 3FVOA 1LCTA 3B6TA 3PUVE 4H1XA 1DPPA 2NVUB 3T22A 2R6GE 4KR5A 1FQAA 4KYDA 2ZNUA 1Y1MA 1YTVA 4KI0E 4XXUA 2QMXA 4OETA 1IXHA 2XXTA 3O97A 1AL3A 4KCDA 1AOVA 3FIRA 1A54A 3P7IA 3TUSA 5AA3A 1BLFA 3G3FA 2ONKE 5JTYB 2F78A 1P99A 3FXQA 3V5AA 4G68A 2ZYKA 2XXWA 3I5OA 2RCAA 1MM6A 3VLVA 3FVGA 4OFOA 4N13A 1UIUA 2ESNA 2A5SA 1MG1A 4RA1A 5CC2A 1B52A 3S9EA 4H6DA 3O2AA 4PFYA 4OFLA 1M5FA 1YPNA 5EYFA 1IIWA 5LOMA 4NWCA 3BFUA 1M5DA 2UVJA 3IAZA 1Z7ME 5IKBA 1N04A 2G93A 2VGQA 4HTGA 5TP9A 4R9FA 3PPQA 4WEDA 4G4PA 3LR1A 3FJGA 3MJNA 4KHZE 1PEBA 3TMGA 3TPAA 2F7BA 1ATGA 3PPPA 4LQ2A 3UP9A 2DE3A 1FQCA 3DP4A 5AA4B 2I49A 4KYEA 3TCHA 5JEIA 3JYRA 2ONRA 4YMAA 3FXRA 3IB0A 5I57A 4U4SA 4QHQA 3O6HA 4JBZA 3VV5A 3LSXA 1MQGA 3I3VA 2Z8DA 4H5GA 4NF6A 5K2XA 3EF7A 3SETA 4IY5A 2PT1A 4NWDA 4YKPA 5DYHA 2UXAA 2V25A 5I58B 4BDMA 3TCGA 1NH7A 4GVOA 4ELOA 1IITA 1VR5A 3ODBA 3PUXE 1WVJA 1QKBA 4IGTA 1IEJA 2GHBA 1TXFA 5DTBA 4JB7A 5HBCA 3HHFA 2QRYA 1LFHA 4NF8A 3IOWA 2OWTA 2Y7IA 5I56A 1B58A 1I6AA 4DLDA 2IEEA 1ELJA 1XHYA 1SW4A 4YMBA 2WKYA 3JV9A 4BDRA 3FV1A 3VXBA 1HSLA 4OYVA 3ZKLA 1FTLA 1H45A 1IXIA 3G3GA 4LVQA 1EZ9A 5I2NB 2HAVA 1LAFE 2DVCA 1IZ1A 4U23A 4G68C 4PE5B 4ECFA 2XXYA 4XIGQ 3TAJA 3T93B 1JEVA 2OWSA 2Q89A 1FQBA 1MQDA 3O28A 4TLMB 1NNFA 1URGA 4C1UA 1WDNA 1ZMGA 1GR2A 1ZU0A 4RYAA 3ZS6A 1QUKA 4X1BA 1LLSA 1LBBA 2ZYNA 5B7DA 4POXA 2ZMBA 4DXUA 3C36A 3W9WA 4Z0IA 3LUYA 3PPNA 1QKAA 3V8XB 4QFLA 5AA1A 2RC7A 2QL3A 5JTYA 3Q29A 1II5A 3GXAA 4KCCA 3DM0A 5L8DA 3RUMA 4R72A 4ELRA 3CRBA 3CFXA 4F1UA 1UIVA 3U72A 1Y1ZA 2RKMA 3HN0A 1MY1A 4RK2A 4GF8A 2B3FA 2REJA 1LAXA 3O66A 4GWOA 4OESA 1ZBMA 1B5HA 1NNPA 2I4CA 1Y20A 4IO5A 1LAGE 3KN8A 4Z7EA 1M5CA 1Y4TA 1DTZA 4YZZA 4OEUA 3BBRA 3C9HA 4QF9A 2XXVA 5IAIA 3RLFE 4FE8A 1RYXA 3MUQA 3EQ1A 4YB7A 3MPLA 1MXXA 1QVSA 3TTLA 4JSOA 5TU0A 1F9BA 3KN7A 3OO8A 4IO4A 3H6TA 1NFTA 1MH4A 4OENA 1ZLQA 2F7CA 4ND9A 1B7HA 2D21A 1MDQA 1NMUA 2XD3A 1BIYA 2UYEA 3PMWA 3TFLA 3C31A 3ONMA 2A5TA 2F97A 2M8CA 1GVCA 2DXYA 1R6ZA 2H98A 1VE4A 3TCFA 3PD8A 3PPRA 1MPCA 2BJJX 3H03A 1A99A 1QULA 2DE2A 5F1QA 4C0RA 4I9DA 4H5FA 2O84X 4K3FA 4ELQA 4R2BA 2DXRA 4RXLA 4RJZA 2O51A 5AE4A 5L9OA 2I0CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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