1MY4A

Crystal structure of glutamate receptor ligand-binding core in complex with iodo-willardiine in the zn crystal form
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my4A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my4A01
2DVCA 2V3QA 1AIVA 1D4NA 1B5HA 4U1OA 3K1PA 4EF1A 4LATA 1DTGA 1FQCA 5I56A 4YB5A 3E4RA 2I3WA 3K6UA 3T9VA 5DTBA 4EDPA 3LBSA 4PE5B 3C35A 1IITA 1EZOA 2ZNTA 2PBWA 4RXLA 1J1NA 3D4GA 4IO2A 4P11A 3PUYE 5AA2A 4H8IA 3ILTB 4I1DA 3DP6A 3IO6A 1WDNA 2DWJA 2A5SA 1US5A 3O6IA 4LONB 5I84A 4G4PA 4OVJA 2F97A 5B7DA 5J1DA 1JW1A 5TU0A 3MP1A 2QMXA 1URSA 4PQJA 3SEYA 3F11A 4U4XA 2Y7RA 1Y1MA 4POXA 1SVXB 3U1OA 3IB2A 3B6QA 1MG1A 4YZZA 1Y3QA 1FQAA 3PMWA 2F78A 1H3DA 3SETA 1NNPA 4LUBA 2X26A 2HAUA 4IO5A 4MBPA 1JEUA 2D21A 4ZZEA 4NEDA 3PU5A 2M8CA 2FA7A 3V89B 5CMMA 2XXIA 1ZTYA 4ZEIA 3C33A 3OSQA 3QIMA 4YMAA 2PMSA 5H8NB 1LAXA 1Z7ME 5JTYB 3IK6B 1EZ9A 5AA3A 2HZKA 3FVOA 4NTLA 3CFXA 1A99A 1IXCA 4WEDA 1PBPA 3TDJA 3R7XA 4M1VA 3OOAA 3MZ9A 3MZ1A 4U21A 3CIJA 2F6PA 2B3BA 2ONSA 2KLFA 1JW4A 2F7CA 1IZ1A 3C4MA 4XXUA 1IXIA 3IOUA 4HTGA 3BBRA 1DMBA 1QW0A 4G77A 4H5GA 1MQIA 3U72A 4LA9A 1O7TA 3PPOA 2AIXA 1DSNA 1S50A 2DQVA 4FEDA 2QS1A 1US4A 3FJGA 1FQFA 4PETA 4H65A 1MY3A 1P1OA 5I57A 4JXIA 2XXWA 2ZYNA 3TODA 4XIGQ 3PUWE 1Y3PA 1SYIA 1DOTA 1WVJA 4GLIA 1H43A 2CMOA 3MPKA 2NUVA 5DEXA 4RYAA 3FZVA 2RC9A 2I0CA 3SEVA 1SI1A 3BKIB 3TTLA 3DELB 3M3KA 3TMGA 3PGFA 1B5IA 5CI5A 1B9JA 2QS2A 1PEBA 1TT1A 3V8XB 3CI8A 3MJNA 3G3IA 1XC1A 3PPPA 4Z7EA 3FD3A 4GL8A 2O1LA 3PMXA 1O63A 1JNFA 1RYXA 3A3CA 4KD5A 4KI0E 2ZYMA 1GGGA 4ELQA 5A5XB 3ZKLA 4EF2A 4FEBA 3H6VA 4QFNA 4ZE9A 4G68A 5JK4A 4DLDA 1WODA 4TOZA 4THIA 4DIGA 4BDOA 5I56B 1D9YA 4X9TA 1JETA 3USDA 4H8JA 3T93B 3MVWA 4P0GA 3MQ9A 1B32A 2HZLA 5H8SA 1II5A 4F1UA 3MZBA 3TKDA 2I4BA 2QSXA 3PUVE 4Q0CA 1KWHA 4N07A 5ELVA 5AA2B 3MC2A 2H99A 3PPNA 1R6ZA 3B6TA 2XXYA 2DVZA 2Z8DA 3K6VA 3CG1A 4F3GA 4ECFA 1LFGA 3T66A 2X7QA 4NF4B 2Z8FA 2VP1A 4QFPA 4OESA 1URDA 2QL3A 2XXRA 1ZLQA 1H44A 4ZEFA 1R1NA 4LVQA 4F3SA 4F39A 4H67A 3TFLA 4OTEA 4R6KA 4GD5A 4EQ9A 4GRKA 4JDFA 3UA8A 3AXFA 2QPQA 1NH8A 1B40A 3VE1B 4ONYA 1FCKA 1LAFE 2HFBA 2I4CA 2DE3A 2RCAA 4YAHX 3E3KA 5H8HA 5KDTA 3VVEA 3IOTA 4FE8A 3WAEA 5CBRA 1MPCA 1SW5A 2HQ0A 3KFMA 1QJMA 4ZDMA 3IO4A 2XXUA 3T9XB 1SW4A 4R6HA 4AB5A 3P7IA 4WKMA 4NMYA 1FQEA 5DT6A 2PX1A 3CVGA 1ANFA 1Z7NE 3KJTA 3MPLA 4IY6A 4QHQA 3KSJA 4OZ9A 2A5TA 4KHZE 2HCAA 3BFTA 2Q89A 5CMCA 1F9BA 1MRPA 5TP9A 1LBCA 4YKPA 3LSWA 2XD3A 1JQFA 3K1NA 5HPQA 4YICA 2XD2A 4GL0A 2F5XA 1B4ZA 1NFTA 4ESXA 2AL4A 3I3VA 4YKJA 1DPEA 1LFHA 4ELPA 2IEEA 4QFKA 3OENA 3VVDA 1OLCA 4RA1A 2Q88A 3D4CA 4LZ5A 1NMUA 4Z0IA 1XVXA 5B70A 2UVGA 5I58A 4QSDA 3KSXA 4RNSA 4FAJA 4R74A 2DWAA 4NF6A 3V83A 4KCCA 3G3FA 3JV9A 1M5FA 3TYHA 3O66A 4JWXA 3W9VA 4TLMB 4KYSA 4PFYA 3DM0A 3L6GA 2F7AA 2F6GA 1EU8A 4XKRA 3PPRA 1AMFA 1Y20A 3TUSA 1LSTA 4R2FA 5TPAB 1N7WA 2B65A 2RINA 4BDMA 4FJPA 2DE2A 3KEIA 2E1SA 1SI0A 2OK2A 4ZECA 5DEXB 3H6WA 3R6UA 1B2HA 2H25A 1B6HA 4FIMA 4KCDA 2UYEA 3MVZA 1MXWA 4F31B 5F7VA 3SERA 4O3CA 1LAGE 3TCFA 5DVFA 3H3GA 5AA4A 4RPNA 4OFOA 4O3AA 2P1SA 4ELOA 2ZNUA 3FV1A 3IB0A 2Y84A 1MY4A 5BWJA 2BJJX 3I6VA 2XXTA 3FXQA 4IY5A 4LP2B 4LQ5A 1MH3A 1B7HA 3RT6B 5FHNA 3H03A 3T96B 2V25A 2I48A 4C1TA 3RNNA 2Z23A 2Z22A 3GXAA 2I58A 5CBSA 5I2NA 4ZEDA 4IO3A 1B3GA 5AA2D 4ZEBA 2P2AA 1MS7A 4EQBA 1M5EA 3G3HA 1B0HA 5FTIA 3SDFA 4DZ1A 4G68B 5L8DA 3OEMA 1P1WA 3TZAA 2R9JA 2DOJA 3N94A 4IO7A 1AH5A 3W15C 4IGRA 2NOOA 3O6HA 4KFQA 1FTKA 5H8QB 2UVIA 3IOVA 3VXBA 5F1QA 2O69A 4RY1A 4UA8A 3O2AA 3O9PA 2V93A 4ESWA 1QKBA 1USYH 1LAHE 3FVNA 4OYVA 5ICTA 1Y3NA 4TQUQ 5EYFA 4PFWA 3RGYA 3QXMA 1B7ZA 3SEWA 3RTFB 4DXBA 4NF5A 3MP8A 3CR9A 2V84A 2ZXTA 3Q27A 1UTBA 3K2DA 3HO7A 4I62A 4AB6A 2DSFA 3S9LC 3ODBA 2I6EA 1FTLA 3KGCA 3Q25A 2DWHA 3S9NC 2UVHA 5KCJA 3RUMA 2XXXA 1LLSA 1CB6A 4R9GA 3IJXB 2ALUA 5ICQA 3CSBA 3OELA 1MDP1 5I2KA 3BFUA 2RF1A 3IJOB 5ITPA 2XX9A 4XKPA 5KDTB 2D5WA 3PUZE 4H1XA 3U93A 4F1VA 2REJA 3IORA 3VXCA 4OEUA 2E0SA 5FHMA 1XS5A 1JW5A 2PT1A 4JB7A 1PB7A 2DWIA 4QF9A 3IOWA 4U4SA 3IB1A 3S9EA 2QS4A 1MM7A 1B46A 5I59A 2F34A 2Q9TA 2HXWA 1OLAA 4GF8A 2IA4A 4QFOA 4JWYA 2V3TA 4BLAA 2P0SA 3VVFA 4C1UA 1EZPA 2O7IA 2H9BA 4N13A 4BDLA 4NF8B 1GVCA 5L9OA 5DVIA 1PB8A 1LB8A 3I5OA 3KN3A 4NE4A 4FORA 3VLUA 2VGQA 3A3UA 2NVUB 4JSDA 2Q2AA 4G8MA 4PP0A 3LUYA 4ZEKA 4MH5A 2Y7WA 3DLNA 1IXHA 3MUQA 3Q29A 2OBGA 4OMBA 3DP8A 1ZKBA 4NWDA 4I9DA 1IUDA 3OSRA 3OO7A 2RCBA 2GRVA 2REGA 1HSLA 3QAXA 5H8FB 1VFDA 3RY3A 1UTHB 1LB9A 4NF6B 3PD9A 1MDQA 2RC7A 3VLVA 1FTJA 5L9SA 1B1XA 1IEJA 4OQOA 2AYSA 3MAMA 3ZKKA 4PFTA 2B3FA 3FGSA 3TELA 3OEKA 4M4GA 1YCJA 1USYE 2O7UA 4QRZA 1P1UA 1PB9A 1XHYA 3MW0A 3PD8A 2Z8EA 4PFUA 3L6HA 3VFJA 5H8NA 2Q8JA 3N6TA 3OO8A 1T0KA 3PV0E 5JTYA 3UIFA 3OD7A 4FATA 1MQJA 2GH9A 1OVBA 2YLNA 3OXNA 1MXUA 3MVXA 5HBCA 1Y9UA 2H98A 3KOSA 3CG3A 4MF3A 1GV8A 2F35A 2O68A 1ELJA 4GWOA 2VHAA 2GHAA 3RPWA 3GZGA 1BP5A 1P1QA 1B3EA 4OFLA 3TAJA 4X1DA 3IAZA 3VV5A 4E0XA 2Y7IA 1QUIA 3T22A 3EQ1A 1I6QA 2PT2A 3FJMA 3DP4A 1B51A 1TFAA 2R6GE 1QKAA 2W7YA 4IO4A 2PVUA 1O64A 2G93A 2OWTA 1VE4A 2R71A 2PYYA 1B0LA 3LR1A 4ELRA 4JSOA 3C31A 5AA1A 3CFZA 3KBRA 1P1NA 1ZU0A 3N26A 4N6PA 1VR5A 3V5AA 3K1MA 3HCQA 4EXKA 3QSLA 2H5YA 1BLFA 3H06B 4X1BA 3Q28A 2O6AA 4KYEA 4LQ2A 4BDQA 2O1MA 1R9QA 2XX8A 1B3LA 1YTVA 3FUZA 3UORA 2DYXA 3TTNA 1B58A 3TQWA 4H5FA 4EUOA 1BTJA 3SKPA 1SW1A 1AOVA 1PBQA 3O29A 3VDFA 3RQTA 2ZNSA 4MFIA 1NNKA 1LCTA 4U22A 1DTZA 1N04A 5AE4A 2OCUA 5HM4B 3GBBA 4QSEA 1B52A 3N6UA 4HS7A 1NKXA 1A7LA 5K2YA 2QJEA 2XXPA 5CM6A 4EQ7A 3TEPA 3K0VA 4HCYA 2G29A 4QSCA 3KG2A 1QUKA 5I57B 2QMWA 3T9HB 3W9WA 4BDNA 3VLWA 1FQDA 3B7DA 2THIA 3E9XA 3U94A 2OZZA 3FASA 1SBPA 1POTA 3TTKA 1M5BA 1RYOA 5EHSA 5K2XA 2H4IA 1YPNA 4OERA 5DYHA 3FXUA 1FTOA 4POWA 5I59B 2UVJA 3UP9A 4LZ8A 4OXVA 1ATGA 1SD3A 2ABHA 3QUFA 3FIRA 5EHMA 4RK9A 1MQGA 1QULA 5ITOA 1N7XA 1MY1A 3SEXA 1FW0A 4R75A 3H6TA 3H6UA 4ZZAA 3G3GA 1OQGA 3C34A 4NF4A 3EHSA 3M3LA 3OO6A 1VFEA 3A09A 4G8HA 1OQHA 1S9TA 1MXYA 4P0IA 3GBAA 4QFLA 1YAEA 2D3IA 2XXHA 3CRBA 4GFRA 4F3BA 4E0WA 3C32A 4F18A 3OO9A 4F22A 2FNCA 1UIVA 4Q5TA 4OEVA 3O97A 1MPDA 2F7BA 1SYHA 3FVKA 5FTHA 4XKQA 3TQLA 2QS3A 3TCGA 1R9LA 4XKNA 4IO6A 1JVXA 1OIBA 1IIWA 3TTRA 2F36A 1BIYA 1MQDA 3KN8A 4KYDA 3FJ7A 3TTMA 1JVYA 1MY2A 1SW2A 4YU0A 3G3JA 4YB7A 3IR1A 4GXSB 2UXAA 1URGA 5DVJA 2UYFA 4EXLA 3K01A 4TLLB 3HN0A 5CC2A 1B05A 4I8CA 5CRYA 4U2RA 4G8NA 3KZGA 4F3PA 3QUJA 1B5JA 4DXUA 1TWYA 1LFIA 4JWOA 1ZIUA 3UN6A 4U23A 1A54A 3C36A 4YKIA 1HSJA 1AL3A 4DCYA 2ONKE 3EN3A 2O51A 1B3HA 3LSFB 3RT8A 4XTCQ 3HV1A 4GVOA 2Q2CA 3TPAA 3U8QA 3EF7A 2LAOA 3O6GA 5M2VA 1DPPA 4R73A 3OMBA 5H8HB 4G2ZA 1B4HA 4F29A 1ZJLA 4ISUA 3HPIA 1B1HA 1MY0A 4YB6A 1Q1KA 2ONRA 2ZYKA 2I0BA 1XOCA 3HSTA 3U92A 3FVGA 1LCFA 2QRYA 2I49A 4LZ7A 4RK2A 2DE4A 3K02A 4R2BA 1SDXA 1MM6A 3EHTA 1N76A 4Q8RA 3ZS6A 1Q35A 3K4UA 3S2VA 2OWSA 2A5TB 3PMVA 4OETA 3CFLA 1QUJA 4HCWA 1MQHA 4ND9A 4GOTA 2DXYA 1M5CA 5TP9B 4IGTA 4X48A 5TPAA 4KQPA 1CE2A 1I6AA 1QVSA 4YKKA 2XXVA 3THIA 5L9MA 4R72A 1NH7A 2OJTA 1SQYA 3JYRA 4F2OA 4Q30B 2NWJA 1N3WA 3IL1B 4G68C 4AQ4A 1S7YA 4DE8A 3K00A 3PPQA 3QYTA 4H6DA 3M8UA 1IQ7A 3IX1A 5KZTA 1NL5A 1HSEA 1TFDA 4MLQA 5CMBA 1MXZA 2OLBA 1TXFA 4DCXA 3MWBA 1D9VA 4H0WA 5I58B 2VD2A 4BDRA 4GXAA 1LGBC 4O3BA 4WXJA 3FATA 4R6YA 2Y7PA 5CMKA 4RPOA 1MXXA 4WEPA 4DDDA 2Y7KA 4K3FA 2I3VA 4RJZA 3HHGA 3RTWB 4OFJA 2XXQA 3EHUA 5IKBA 2DXRA 3LSXA 4MLVA 1D3KA 5ISUA 3E13X 5JEIA 3ZSFA 3M3FA 3GLBA 3S4UA 2HAVA 2X7PA 5H8QA 1M5DA 3MBPA 1MPBA 1IXGA 1OMPA 3SEUA 5BUUA 1OVTA 4F19A 2ZYOA 4IB2A 4HW8A 1MH4A 1LBBA 2ANJA 3ECRA 3KN7A 1FQBA 5AA4B 1XVYA 3KJ7A 4F1YA 1FTMA 3CSGA 2GHBA 1I6BA 5FHOA 2F8DA 4KR5A 2YJPA 1L5TA 2VD3A 2YPNA 3T9UA 3LC8A 1MXVA 2RC8A 3G3KA 3S9MC 1Y1ZA 3QK6A 1RKMA 4KPTA 1P99A 1GR2A 5I2NB 3TCHA 3JZJA 3SESA 1Y4CA 3HHFA 1H76A 2GFEA 3K6XA 3Q26A 3EPEA 5LOMA 1A8EA 2V3UA 4F2QA 1BKAA 1Y4TA 2WKYA 1B3FA 3UK4A 1JEVA 4FECA 4ZS9A 1I69A 3G7WA 1NNFA 2NXOA 3H4ZA 3ONMA 2O84X 2ZMBA 2ESNA 4ZE8A 4NWCA 1A55A 2FYIA 3FXRA 4GQOA 3H7MA 3R26A 1N0TA 1POY1 1EH3A 3B6WA 4L17A 3RN8A 1N84A 4NF5B 1ZBMA 2CZLA 4GIZA 1GTKA 5IAIA 1ZMGA 1UTBB 1N3XA 2HEUA 4UACA 1A8FA 4YMBA 3RLFE 4OHNA 3K6WA 3C9HA 4NF8A 3LSLA 3N5LA 1NNTA 4R9FA 2DS9A 1XT8A 2RKMA 2VOZA 4U1ZA 4C0RA 1UIUA 4DXCA 1B7UA 5KCJB 2XX7A 3MP6A 3MVYA 1A40A 2DP8A 4OENA 1PDAA 1PC3A 5I2KB 1VSOA 3KOTA 3FV2A 3ILUB 2XHDA 4OWDA 5A5XA 1H45A 5H8FA 3PUXE 3O28A 3UGWA 1UTHA 1UQWA 4JBZA 3WAFA 2AL5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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