5KDTB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne0723
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
287
structure length
284
Chain Sequence
MSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
total genus 76
structure length 284
sequence length 287
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kdtB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kdtB02
3RQTA 1T0KA 1NNKA 4R2FA 4EXKA 4GRKA 1SW4A 4FJPA 4ELQA 1IXCA 1MDP1 3PD9A 5DEXA 3HN0A 3QXMA 3CSBA 4OYVA 1BKAA 1OVTA 3U1OA 3HHGA 5AA4B 1A8EA 4C1UA 1H76A 2V84A 1CE2A 3CFXA 3EHTA 2OCUA 1FQFA 3LSWA 5KDTB 2O7UA 5KCJA 4NF4B 1NL5A 2I3WA 3MP8A 4ZDMA 1P1OA 4IO4A 1MH3A 3MZ1A 2OWSA 2VGQA 4YKIA 2XXIA 3H6WA 1IEJA 2F6PA 3RTWB 4M4GA 1EZPA 3O9PA 1B3LA 3IO6A 3G3JA 1P1WA 3KSJA 4PQJA 3TQLA 3TTKA 2D5WA 3V5AA 5AA2D 5AA4A 3LSLA 3KG2A 1MQDA 1TT1A 1XVXA 3M3FA 2ABHA 1HSEA 2YJPA 5ELVA 4ZEFA 3K6WA 3EHSA 5TU0A 1LFHA 4AB6A 3N6UA 3TCGA 4F29A 1FTJA 4LONB 4C0RA 2XD2A 1A8FA 2QMWA 2OJTA 3DM0A 4KYEA 4PE5B 4KCDA 5KDTA 2R9JA 1SI1A 2UVHA 5CMCA 3FJ7A 4U23A 4ZEBA 4AB5A 5ISUA 1QVSA 3UK4A 5JK4A 3S9EA 1MM7A 1Z7NE 1ZU0A 4DZ1A 3PPRA 3T9HB 5B7DA 2REGA 5TPAB 4KYSA 3O97A 2V25A 4ZZEA 3UA8A 4F3GA 3IL1B 1EH3A 4OMBA 4ESWA 1B7UA 3HO7A 2ZNUA 2DWAA 1M5DA 3K6XA 4ZZAA 2Z8FA 3IAZA 3MC2A 4G68A 1P1QA 1VE4A 2FNCA 2Y7RA 4NWCA 1IXIA 2RINA 4U4SA 5CMMA 3WAFA 4IO3A 3PUXE 2GRVA 3OENA 3VLUA 2QPQA 1AOVA 4LA9A 1PEBA 5I58A 3OOAA 5AE4A 3E4RA 3G3FA 5BUUA 5F1QA 1LB9A 1WODA 3IR1A 1B0LA 3QUJA 3MBPA 4JWOA 1Y4TA 4YZZA 4DXCA 4Z7EA 2P2AA 1P1NA 2IEEA 2XX9A 3TTLA 1A55A 1P99A 2XXRA 1MM6A 3VLVA 5ICQA 4GF8A 2W7YA 3O29A 3P7IA 1IZ1A 1N04A 2F36A 4NF5A 2FYIA 3PMVA 3ECRA 4KYDA 4RJZA 2UVGA 3QSLA 2HZKA 3K2DA 1HSJA 2VHAA 3M8UA 2ZNTA 1AH5A 4UACA 1JW5A 1ZMGA 3MPKA 3SERA 2E1SA 3CIJA 3U93A 5L9OA 3HPIA 1QW0A 4K3FA 1ZBMA 4LP2B 4PETA 4MLQA 5ICTA 2RKMA 1FQCA 4GVOA 4MBPA 4PP0A 3T9VA 1JQFA 4PFWA 1B3GA 1UTHA 2CZLA 1M5FA 5L8DA 2NXOA 4DCXA 4NF8A 5I59A 2UVJA 1FQAA 3B7DA 4I62A 2I49A 3OD7A 3UP9A 4F3SA 2ANJA 4H67A 3QIMA 4OTEA 3U72A 5I56B 2H99A 1SDXA 3HCQA 2Z8DA 3MW0A 3QYTA 4M1VA 1SYIA 4H8IA 2A5TB 3GZGA 4RK2A 5DYHA 2DWHA 4GXSB 2M8CA 1N7XA 4FATA 5DEXB 1I6QA 1ZLQA 2BJJX 1LAXA 5H8NB 1URGA 1A40A 1Z7ME 3LSFB 1N76A 4Q30B 5H8QB 1NH8A 2B3FA 1BP5A 1LB8A 3OO9A 4DCYA 5IAIA 1QULA 3FUZA 3IOVA 2QS2A 3A09A 3IJOB 4QFNA 4XKQA 1ZTYA 1NH7A 2UYFA 4BDNA 3A3CA 4U1OA 3BFTA 3H06B 3O6GA 2F78A 1GTKA 3R6UA 4NF6A 2PT1A 3CG3A 2DVCA 4XKNA 5A5XA 5I2NA 5I59B 5I84A 3KJTA 1M5BA 2A5SA 1XS5A 3C31A 1QUJA 3TZAA 2I4BA 3RY3A 5H8FB 4KCCA 4F3BA 1SQYA 3HSTA 4NWDA 1B5HA 1EZOA 2DP8A 4U2RA 3PUZE 4P0IA 3SKPA 3H4ZA 3VVDA 1XVYA 4KI0E 3TYHA 3QK6A 1HSLA 1B1HA 1M5CA 1D9VA 1TXFA 3EQ1A 3O6HA 4IGRA 2OK2A 2KLFA 4TLLB 4GLIA 4LZ8A 2Z22A 4U22A 3MVXA 1IXGA 3FASA 4EF1A 3S9MC 3VE1B 2XD3A 1ZIUA 3OO8A 3TCFA 1B51A 3FVOA 4G77A 5DVFA 2O6AA 3G3HA 4KR5A 4RYAA 2NWJA 1DOTA 3SEYA 3FVNA 4IO2A 3KOTA 4KQPA 1MY3A 1B5IA 3FJGA 4C1TA 2X7PA 2XXVA 4IO6A 1MPCA 3KBRA 4ONYA 3MAMA 2F35A 2VP1A 5HPQA 1LAGE 3T9XB 4LQ2A 2Y7WA 3IB0A 2UXAA 4GIZA 1IIWA 3L6HA 5CMBA 4GWOA 3S4UA 3H6UA 3SEUA 3SETA 4Q0CA 1US4A 5TPAA 3TKDA 2DOJA 4G68C 1SD3A 2IA4A 1JNFA 3C34A 3ODBA 4EXLA 5AA3A 3MP6A 4HCWA 4AQ4A 4OENA 1B3FA 2XXTA 3DP6A 3N5LA 2G29A 1H43A 3I6VA 3PUYE 2O1LA 1FTMA 1B7HA 3C35A 3FIRA 3UN6A 2GHBA 4G2ZA 4GOTA 1MDQA 1MY1A 1VSOA 1N3XA 1USYE 3BFUA 4OFLA 2QS4A 3GXAA 4F18A 4IGTA 3FXRA 4OEVA 5AA2B 2Q88A 5K2YA 5J1DA 4H1XA 1MXUA 4YMBA 3MZBA 1Q35A 4JSDA 4LATA 4XXUA 1R6ZA 3ZSFA 1S50A 1MQGA 1WDNA 2I58A 3MVWA 3N26A 4ISUA 4MH5A 4EF2A 3WAEA 1N7WA 2Q2AA 3ILTB 3BKIB 3TDJA 2NVUB 4O3BA 1Q1KA 4TQUQ 3HHFA 1R1NA 4EQBA 1VFDA 3F11A 1B3EA 2B3BA 3IO4A 1DPPA 1PB9A 1FQEA 4OVJA 1FTLA 1MH4A 2PBWA 1B9JA 1NNTA 3TCHA 4ZEDA 3DP8A 2AYSA 1UIVA 4MFIA 4QFPA 3U92A 3W9VA 3H03A 4YMAA 1PC3A 3CR9A 2O84X 4EDPA 2HFBA 1DPEA 1MS7A 4BDOA 4P0GA 2XX8A 2H5YA 4IB2A 4EQ7A 4X1DA 1YPNA 1UTBB 1F9BA 3IB1A 4FE8A 5I57B 5H8NA 2QSXA 2ALUA 4ZE9A 2ONKE 5DVJA 4F39A 3L6GA 1B1XA 2F6GA 4JXIA 5L9SA 1Y1MA 2QL3A 3KN7A 4ELRA 3LSXA 5JTYB 1D4NA 1PBQA 3CVGA 1NNFA 4TOZA 3ZKLA 2HEUA 4IY5A 3Q28A 5LOMA 3S9LC 4KFQA 4R6KA 1A7LA 4WKMA 4R73A 4ZEKA 4NMYA 1LBCA 2F7CA 3FZVA 5H8SA 3JZJA 5TP9B 3CFLA 3VLWA 4HCYA 3TMGA 4I1DA 5DT6A 1B52A 1MG1A 1UTHB 4NF5B 1UQWA 2E0SA 4JWYA 1O7TA 2Q8JA 2XXQA 4JDFA 1DSNA 2NUVA 1A99A 2V3UA 1B3HA 3CFZA 4FORA 4HTGA 1LBBA 3JV9A 4OESA 2QS3A 3K1NA 1B2HA 1D3KA 3M3LA 3O66A 4JBZA 3C9HA 4R6YA 2AIXA 1ELJA 3PUWE 4OFOA 4OEUA 1FW0A 1MPBA 1R9LA 1QJMA 2A5TA 3QUFA 4OFJA 2OBGA 2ZYMA 3FGSA 4U21A 3TQWA 5CMKA 2DE2A 3MZ9A 1MXYA 1QKBA 4H5FA 1B6HA 1MQHA 3OSQA 4RK9A 2Y84A 4QSCA 4YKJA 5CC2A 1DTZA 4F1UA 2UYEA 3BBRA 1XT8A 1VFEA 3FV1A 3G3KA 5H8QA 5CM6A 2RC7A 3ONMA 2XXXA 3R7XA 4QFKA 1MPDA 4OZ9A 4RXLA 4XTCQ 1GVCA 2GFEA 2D3IA 2DE3A 2O1MA 3B6QA 3OEMA 4LZ7A 1GV8A 1AIVA 1D9YA 4X9TA 4NE4A 5I2NB 3C33A 3PPQA 1MXZA 1QUIA 3IOWA 4IY6A 4DXBA 3K01A 3RTFB 1NMUA 1IQ7A 1JVYA 3Q26A 3IX1A 4YICA 1AMFA 2NOOA 3KN8A 2RCAA 4KD5A 4UA8A 4XKRA 2RC9A 1Y20A 4DDDA 3FD3A 3O6IA 4R74A 1BTJA 1BLFA 3PU5A 4QFOA 4RPNA 3IOUA 4XIGQ 2I6EA 1B4ZA 3OXNA 2OWTA 2DWIA 2Y7PA 1Y9UA 1ZJLA 2F5XA 3Q25A 4OHNA 3H6TA 3PD8A 4R72A 2PVUA 5EHMA 3V8XB 4OERA 1SBPA 2HAVA 4G8NA 4I9DA 5FHMA 1Y3QA 3SESA 3DP4A 4LZ5A 1OQHA 1MY2A 3U94A 1H45A 5I57A 1NKXA 4FEDA 4QSEA 2D21A 3OSRA 3TEPA 4H8JA 4RY1A 4G8HA 2UVIA 3G3IA 4WXJA 3FV2A 3SEWA 1SI0A 3DLNA 3IORA 3M3KA 2HAUA 4Q8RA 3PGFA 4RPOA 2HCAA 3RT6B 1DMBA 5I58B 2I0BA 3K00A 1AL3A 3KEIA 4FECA 1IITA 2VOZA 4N07A 3UORA 4E0WA 3AXFA 3TFLA 1POY1 5JEIA 3KJ7A 3USDA 2VD3A 2OLBA 2XX7A 2XXWA 3PPPA 3C36A 1JEUA 1OMPA 4IO7A 4Q5TA 1QKAA 3VXBA 3TODA 1YTVA 4PFTA 1Y3PA 4N6PA 4BLAA 4L17A 1MRPA 2R71A 1YAEA 5CRYA 1H3DA 1URSA 3PMWA 4FEBA 4ZS9A 4GXAA 2XXUA 1VR5A 2V93A 1II5A 4JSOA 1B46A 1DTGA 1POTA 2ZMBA 3OEKA 3RT8A 5TP9A 1O64A 3PV0E 3V89B 1B4HA 3TTNA 4H65A 2XXYA 2V3QA 1LGBC 3LC8A 3K4UA 1MXXA 2HXWA 4MF3A 4R9GA 2ZYOA 3EHUA 3E3KA 2DXRA 3R26A 1JW4A 2REJA 3OMBA 4F22A 3HV1A 3C4MA 3TTMA 3FXUA 4ELPA 1JVXA 1ANFA 4G4PA 4F2OA 4GQOA 1L5TA 3MVZA 1B05A 1I69A 4QRZA 1MXVA 2Q9TA 2R6GE 2Z23A 3O28A 2F7AA 4KPTA 4OQOA 2O69A 1B0HA 1LFIA 1O63A 2O51A 3K6UA 4BDMA 3K6VA 3OO6A 2DWJA 4DIGA 3MPLA 1OLCA 4X48A 3D4CA 3LBSA 5H8HB 2AL4A 4F1VA 1SW2A 5H8FA 1OQGA 2G93A 1LCTA 1JEVA 3Q29A 3PPNA 4R9FA 4THIA 2I0CA 4G8MA 3EN3A 2ESNA 5KCJB 4YAHX 1LLSA 1MQIA 4R6HA 4DXUA 2DXYA 4FIMA 4R2BA 2H98A 2PX1A 3CSGA 4OXVA 4PFYA 2YPNA 3SEVA 4OETA 1MQJA 2V3TA 3E9XA 2DYXA 4GL0A 4ND9A 1IUDA 1NNPA 1WVJA 2HQ0A 4H5GA 4P11A 2ONSA 3RGYA 2O7IA 3VDFA 3TPAA 1GGGA 5H8HA 3T9UA 5BWJA 2XXHA 5CBRA 5JTYA 2XXPA 2P1SA 2F7BA 3VXCA 4F1YA 4MLVA 2PYYA 1QUKA 1PDAA 2RF1A 3RPWA 4F2QA 5EHSA 3FJMA 4HW8A 3H7MA 5I2KA 4IO5A 1I6AA 3DELB 1NFTA 1FQDA 3KOSA 3EPEA 2ZNSA 3KSXA 2WKYA 3RUMA 2I48A 3MWBA 4LVQA 3C32A 3UGWA 3OELA 1B40A 1N84A 4YU0A 3FVKA 4GD5A 3TAJA 2VD2A 4ECFA 5CBSA 1R9QA 1ATGA 2HZLA 3IB2A 3O2AA 3OO7A 3KGCA 4R75A 5FHNA 3N94A 1Y3NA 1LCFA 3LUYA 5A5XB 5I2KB 2H25A 1XHYA 4POWA 2P0SA 3IK6B 4YKKA 4DLDA 3K1PA 1Y4CA 3VVEA 1OVBA 3PMXA 4ZEIA 1KWHA 1RYOA 1YCJA 4G68B 1B58A 4OWDA 2THIA 3CI8A 1PB7A 2Y7KA 1JW1A 4JWXA 1GR2A 3B6TA 1SYHA 2OZZA 3MJNA 4YB7A 2Y7IA 4ESXA 3VFJA 4ZECA 3G7WA 2RCBA 4PFUA 2ZYKA 2ONRA 3IJXB 3GLBA 4Z0IA 3TUSA 3PUVE 4ELOA 5L9MA 1EU8A 1FQBA 2F34A 1PBPA 3VV5A 5DVIA 3UIFA 1SVXB 2I4CA 1B32A 3KN3A 4GL8A 4LQ5A 1US5A 4NF4A 3MVYA 4U4XA 1UIUA 2F97A 1B7ZA 1URDA 1PB8A 3CRBA 3E13X 3H6VA 4X1BA 1H44A 4BDRA 1P1UA 3MP1A 4HS7A 4H0WA 4NTLA 2Z8EA 4EQ9A 5FHOA 1XOCA 5M2VA 1S9TA 1LAHE 1SW1A 1SW5A 1TWYA 2PT2A 3B6WA 3D4GA 2H9BA 4YKPA 1ZKBA 4JB7A 4F19A 5KZTA 1TFDA 2DSFA 5DTBA 2RC8A 3K02A 2DVZA 3V83A 1MXWA 4BDLA 2DS9A 2O68A 4O3AA 3THIA 2X7QA 5I56A 2AL5A 3PPOA 5CI5A 3FXQA 3K0VA 3KZGA 3W15C 3RLFE 1OIBA 4YB5A 3SEXA 5IKBA 2GH9A 4RA1A 4WEDA 5HBCA 1XC1A 2LAOA 5FTHA 1N0TA 4H6DA 3U8QA 5HM4B 2XHDA 4LUBA 4BDQA 2H4IA 1USYH 3ZKKA 1MY4A 1LSTA 4NF8B 4QSDA 2QRYA 3RN8A 4F31B 4FAJA 5AA2A 1OLAA 3I5OA 4QFLA 4XKPA 2CMOA 4TLMB 4NEDA 1LAFE 1B5JA 2F8DA 2QS1A 4ZE8A 5AA1A 4RNSA 3T93B 2GHAA 1TFAA 3ILUB 4KHZE 1RKMA 1FTOA 3TELA 1RYXA 3S9NC 1LFGA 1N3WA 2I3VA 3GBBA 3SDFA 2PMSA 2Q2CA 4E0XA 3MQ9A 3ZS6A 1CB6A 5F7VA 3IOTA 2ZXTA 1EZ9A 4QHQA 3FVGA 4GFRA 4YB6A 3FATA 5FTIA 5B70A 1BIYA 4WEPA 3T66A 4NF6B 4EUOA 5K2XA 4DE8A 4F3PA 1FTKA 2B65A 4O3CA 2X26A 1MY0A 1UTBA 3KFMA 3MUQA 4POXA 2YLNA 1S7YA 5ITOA 5EYFA 3TTRA 2QMXA 3A3UA 3N6TA 1M5EA 4N13A 3EF7A 5ITPA 1JETA 2Q89A 3CG1A 3G3GA 3GBAA 1A54A 3S2VA 3T96B 4I8CA 2ZYNA 2DE4A 1IXHA 1FCKA 1I6BA 1Y1ZA 3H3GA 3JYRA 3Q27A 4QF9A 4U1ZA 3T22A 3LR1A 2QJEA 3W9WA 1J1NA 3K1MA 3VVFA 2DQVA 3I3VA 3QAXA 2FA7A 3RNNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O94A 1IXCA 1EYIA 1MDP1 3PD9A 5DEXA 3QXMA 4XFEA 1IMFA 3CFXA 2OCUA 2O7UA 2XWVA 2I3WA 3MP8A 1MH3A 5LDZA 2VGQA 3H6WA 2F6PA 1XI6A 1B3LA 5IZ1A 3TQLA 5AA2D 1TT1A 1HSEA 2YJPA 3N6UA 2CEYA 3TCGA 1A8FA 2QMWA 4KYEA 2GQ1A 4U23A 3UK4A 1MM7A 1Z7NE 2REGA 3O97A 3UA8A 4OMBA 2DWAA 1M5DA 4DXUA 2Y7RA 5CMMA 4IO3A 3PUXE 1NV7A 1AOVA 4LA9A 3OOAA 5AE4A 3E4RA 4IR8A 4JVCA 4JWOA 1P1NA 1A55A 1P99A 2F36A 4RJZA 3PMVA 3QSLA 3K2DA 3M8UA 1JW5A 3MPKA 4PAKA 3SERA 4PETA 1QW0A 4PP0A 1FQCA 4GVOA 3RYDA 3T9VA 1B3GA 2NXOA 4P1LA 3UP9A 4H67A 3QIMA 4OTEA 4GX6A 1SDXA 3HCQA 3GZGA 1N7XA 4FATA 1ZLQA 4Q30B 4QFNA 4XKQA 2QS2A 1NH7A 2UYFA 3A3CA 1FPEA 1FPJA 2F78A 1GTKA 1NV3A 1M5BA 3C31A 4MNCA 4F3BA 3RY3A 3HSTA 1VDWA 3VVDA 3TYHA 3QK6A 2XWKA 4GLIA 4EF1A 2XD3A 1B51A 4X8RA 3BIGA 2NWJA 1DOTA 3KOTA 4KQPA 4C1TA 3MAMA 1LAGE 5LTCA 2UXAA 4GIZA 4N81A 4MMPA 4GWOA 4Q0CA 4N6KA 4EXLA 5IGAA 3E79A 3DP6A 2G29A 1H43A 3I6VA 3PUYE 1LBWA 3C35A 3UN6A 1MDQA 1USYE 4NG7A 3GXAA 4F18A 4OEVA 2Q88A 3MZBA 3MVWA 3TDJA 4O3BA 1FBFA 3HHFA 1B3EA 1FTLA 1NNTA 2AYSA 4QFPA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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