5KDTB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne0723
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
287
structure length
284
Chain Sequence
MSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
total genus 76
structure length 284
sequence length 287
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kdtB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kdtB02
4ONYA 1SBPA 2O7UA 1IUDA 3EQ1A 5B7DA 3SESA 4TLMB 1N7WA 3KGCA 1S9TA 2O1LA 1GR2A 2I58A 1DTZA 3CSGA 4THIA 4HW8A 3MJNA 4K3FA 4JSDA 2Y7PA 3ZSFA 3K6VA 2HCAA 4U4SA 1SYHA 3C35A 3UIFA 1TT1A 2ONRA 3PUVE 4JWYA 3A3CA 3EPEA 1IITA 2F97A 3O2AA 1N04A 4H1XA 4GXAA 1B5IA 4C0RA 5J1DA 2G93A 3TZAA 4BDLA 2O68A 5CMKA 2QL3A 4YMBA 3A3UA 5I58B 2RINA 3G3HA 1QKBA 2DVZA 2XXHA 4I8CA 4F2OA 2I4CA 3IB2A 4GWOA 3RT6B 4PQJA 4KR5A 2V3TA 1LCTA 4U22A 2F7AA 1LCFA 2ZMBA 4JWXA 1B7HA 4F29A 2F78A 3BFUA 3T22A 1MDQA 1RYXA 3S2VA 1ZMGA 1Y3QA 2Z8EA 3HV1A 2VOZA 3HN0A 3ZS6A 3ILTB 2I3WA 4QFLA 3Q26A 1PEBA 4XKPA 4ELOA 1CE2A 3OO7A 2ESNA 5ELVA 3TTKA 2YPNA 4FEDA 5I56A 4H5GA 4EQBA 5I59B 2YLNA 2XXVA 2B3BA 3TQWA 3O97A 2H4IA 2OLBA 3TUSA 3OO6A 2QS1A 2I3VA 1NMUA 1B52A 3IORA 5ITOA 1B9JA 3DELB 3Q29A 4GVOA 3KN7A 5F1QA 1B3GA 4EF1A 3LSXA 1A8FA 1MPBA 1LFGA 2DVCA 1XHYA 4FAJA 3M8UA 1FW0A 4GQOA 3ODBA 2QS4A 4DZ1A 3RGYA 2XXIA 5CC2A 1ANFA 3CFXA 2HZKA 1FQDA 3ZKKA 2F34A 2Q9TA 3VE1B 1II5A 4Q0CA 4BDRA 3VVFA 1R6ZA 2REGA 1GGGA 3F11A 1PB9A 3IOTA 3PUZE 1PC3A 4YB7A 5KCJB 4P11A 4YKKA 4U1ZA 3C9HA 4EUOA 3B6WA 1ELJA 2UYEA 3QUFA 1IXGA 3TQLA 4NEDA 3KBRA 2E0SA 1JW1A 5EHMA 2UYFA 3P7IA 2QJEA 3CR9A 2X7PA 5JTYB 5H8NA 3IO4A 5DVIA 2NXOA 4G8NA 1POY1 5H8QB 3UGWA 4KQPA 4RPOA 1ZLQA 1J1NA 4NWDA 3RN8A 2Q89A 4X1DA 4DXUA 2F5XA 2P2AA 3GXAA 4WXJA 4NF5A 5M2VA 4QF9A 3A09A 2UXAA 4U21A 3FUZA 5CBRA 4F18A 1VFDA 1B32A 4RPNA 4DCXA 4PFWA 3LSWA 2DXRA 4E0XA 2NWJA 2XD2A 4KYEA 4NF4A 3GLBA 3VXCA 3VLWA 1MXZA 1B46A 1CB6A 4P0GA 5JK4A 1NH8A 3FVNA 2DE2A 1IEJA 3N94A 1ZU0A 2DP8A 3U94A 1Z7ME 4I9DA 5DYHA 2Z8DA 4O3BA 4OWDA 4IO7A 4IY5A 3QYTA 2ZYOA 1LB8A 3W9VA 1QULA 3DP8A 5H8NB 3KG2A 5CI5A 1PDAA 3EHSA 1M5BA 1MY4A 3EHTA 3KEIA 3HCQA 3OSRA 4R9GA 3QAXA 4HCYA 1N0TA 4GRKA 1IXIA 3G7WA 4AB6A 4NF5B 2HAUA 1MY1A 4LZ5A 1EZPA 5K2YA 3IJXB 4QHQA 2RF1A 4IGRA 5L9MA 1MG1A 3HHGA 3QSLA 1EU8A 5DVJA 4KD5A 5JEIA 3TODA 1SI1A 1B5HA 1Y20A 3TPAA 2B65A 4EDPA 1IXCA 3CFLA 4OETA 4YU0A 2PVUA 3L6HA 2NUVA 4GF8A 1P1WA 1O7TA 5H8HA 1BIYA 1B7UA 2RCBA 1ZKBA 4FJPA 1MQHA 3TCGA 1SD3A 3FJ7A 1M5EA 2BJJX 3LC8A 3DP4A 4OEUA 2OWTA 4R2FA 4KI0E 2ALUA 3VFJA 2F6PA 3MVZA 1B3FA 4N13A 2QPQA 5DEXA 2R9JA 2XXRA 1BLFA 2HXWA 3EN3A 2M8CA 1XOCA 3T9HB 4ISUA 3U8QA 5BWJA 3MVXA 4F3PA 4BDNA 2QMWA 3MBPA 1BP5A 4HCWA 3C32A 1DOTA 2AL5A 3K1NA 4OENA 3K6XA 2ZXTA 3FVOA 5HBCA 3TELA 2Q8JA 1NFTA 4ZECA 5AA2B 3H6WA 1Y1ZA 5L9OA 4XXUA 3VDFA 2F7CA 2OZZA 5I84A 4MF3A 3K1PA 4ELPA 1B0LA 3O29A 1UTHB 4OFOA 3N26A 3M3LA 5CBSA 4PFYA 4LVQA 4NMYA 3CI8A 5H8HB 1LSTA 2PMSA 3B6TA 2A5TB 2RC7A 3RNNA 2XXPA 5TPAA 2ONKE 4H8IA 1UQWA 4F22A 1YPNA 3K2DA 1JW5A 3JZJA 1FQCA 1AH5A 1XT8A 1MQDA 4OZ9A 3MP1A 2P0SA 5DEXB 4IO5A 4Z7EA 4BDQA 1MS7A 2O1MA 3M3FA 1HSLA 4FEBA 1UTBB 1OVTA 1EZ9A 4FATA 2OJTA 2ZYNA 4YB6A 1B6HA 1YAEA 2XX8A 3C36A 3C33A 1Y3NA 4M1VA 4ZDMA 4ZZEA 3IOVA 3KSJA 3TFLA 2DWIA 1Y3PA 2AYSA 1FTKA 2VHAA 3O6GA 4F1UA 3H03A 3TMGA 4E0WA 4NF8A 5TPAB 2DOJA 1A54A 3PD9A 3HHFA 1I6AA 1KWHA 1BKAA 3VXBA 3RTFB 2ABHA 2XD3A 3FJMA 4ZE8A 3CVGA 2PT1A 1ZBMA 4PETA 1MY0A 1B1HA 4XKNA 2XXUA 2Y84A 4IO3A 4C1UA 1P1UA 1XVYA 3PMXA 4DXBA 2DQVA 4X9TA 2GFEA 4QSEA 3B6QA 3VLUA 4LA9A 3WAFA 3UK4A 2XXXA 2D3IA 3G3IA 5I2NA 2XXQA 3QK6A 3CG1A 1JW4A 3T9XB 1N76A 4IO6A 4MLQA 4KYSA 4NF8B 3VV5A 3W15C 1Z7NE 5KDTA 1JVXA 1Q1KA 4DE8A 4R6YA 3UN6A 3OSQA 5EYFA 3BKIB 4G2ZA 3TTMA 2ZYMA 3OO8A 3N5LA 1IIWA 1AOVA 5AA1A 2Y7RA 3SKPA 3E9XA 3U93A 3R7XA 3MWBA 3RTWB 3CIJA 1QJMA 3OO9A 4Q30B 2OWSA 2H98A 1H76A 2I4BA 4RXLA 4U23A 1LAXA 4R74A 1JVYA 5FTHA 2LAOA 2Q88A 3V89B 3VLVA 4IGTA 2Y7KA 4JB7A 3MAMA 4QRZA 3O6HA 4G68A 3PUWE 5AA2D 2F6GA 3FVGA 3E4RA 3OELA 1QVSA 2CZLA 5DTBA 4LZ7A 3ONMA 1A7LA 2H25A 3K6WA 2HAVA 4H0WA 3U92A 1N3WA 3ZKLA 3T93B 2KLFA 1B40A 2O6AA 1POTA 3K02A 1B58A 1NNTA 1Q35A 1LLSA 5I56B 3RQTA 3MZ9A 1FCKA 2HEUA 4EF2A 4KHZE 3UP9A 3FD3A 1MQIA 5EHSA 4GL8A 4XKQA 4P0IA 4ELQA 1SQYA 2QS2A 4YMAA 2VP1A 2DS9A 3UA8A 1IZ1A 3C4MA 4JXIA 3IB1A 4G68C 4JWOA 2PX1A 4WEPA 3N6TA 1IQ7A 5FTIA 4QFKA 3PMVA 3K0VA 3KJ7A 3N6UA 4JSOA 3AXFA 4H67A 1OVBA 5ICQA 3K6UA 4POXA 1LAHE 1MY3A 2XX9A 3OEMA 3I6VA 3R6UA 1WDNA 1TXFA 4UA8A 1N3XA 3S9EA 1LFHA 5TU0A 3IB0A 5I2KA 1ZTYA 4LQ5A 1OMPA 1T0KA 1US4A 4JBZA 4MH5A 1SYIA 4IO4A 4KCCA 2THIA 4ND9A 1AL3A 4M4GA 4XTCQ 3OD7A 1NNKA 1S7YA 2QSXA 2DWJA 1RYOA 1MXVA 3U72A 5DT6A 3SEXA 3TCFA 3IAZA 4WKMA 1SDXA 2P1SA 3PMWA 1R9QA 1UIUA 2I0CA 3UORA 4NF4B 3MPLA 1R9LA 4ZE9A 3S4UA 4F1VA 2GHAA 3FVKA 3MZ1A 4POWA 4LZ8A 4FE8A 2D21A 2Q2AA 4O3AA 5CMBA 2XXTA 5I2KB 4R2BA 3OOAA 1UIVA 3PV0E 3R26A 3SEYA 1R1NA 4OHNA 1O64A 4I62A 2HQ0A 3GZGA 2AL4A 1N7XA 5H8SA 5I57A 1XVXA 3MVWA 3H6TA 4GFRA 4HTGA 3IK6B 2UVIA 4OESA 5AA3A 3CG3A 4R75A 2V3QA 4YKJA 3FGSA 4PE5B 4PFUA 1QKAA 1M5DA 3D4CA 4QSCA 1FQFA 2V84A 3V83A 3MZBA 1PB7A 3TAJA 5HPQA 4RK9A 3GBAA 2O84X 3KOTA 3H3GA 3EF7A 1JNFA 2YJPA 4AB5A 4Q8RA 1M5FA 1DSNA 3IL1B 2PBWA 3FV2A 1PBPA 3PPPA 2Z22A 1MQGA 4TQUQ 1M5CA 3BFTA 3FZVA 3S9NC 4MFIA 1H45A 3G3FA 1DMBA 1FTOA 2UVJA 3IOUA 1B3HA 2RC8A 3USDA 2V3UA 5B70A 4OERA 2DE3A 4GIZA 4YICA 1URDA 1S50A 1XS5A 3QIMA 4RJZA 2RCAA 3G3JA 4EQ9A 2REJA 2QRYA 5CM6A 2PYYA 2O51A 3O6IA 2O7IA 2OBGA 4I1DA 1EH3A 3C31A 3FASA 1A55A 3DM0A 3TYHA 3G3KA 2H5YA 5DVFA 3H4ZA 3SEVA 2FA7A 3K4UA 3OMBA 4U4XA 3T66A 2PT2A 4NF6A 1B7ZA 1D3KA 1MXUA 1FTJA 3OEKA 1PBQA 1NH7A 1I6QA 1FQAA 2I48A 1SW2A 3RUMA 4H6DA 1US5A 1Y1MA 5I58A 3H6VA 5AA4A 3ILUB 4AQ4A 2DWAA 2DSFA 3PPNA 4OFLA 4R73A 2F36A 1OLAA 4G8HA 3I3VA 3WAEA 4RA1A 2DE4A 1Y4TA 2E1SA 4GD5A 4N07A 3ECRA 1LGBC 1LFIA 4BDMA 3MVYA 4YAHX 2H9BA 1B0HA 3IOWA 4LONB 4H8JA 3T96B 4R9FA 4C1TA 1B05A 1B1XA 1IXHA 3MC2A 4KPTA 1RKMA 2OK2A 4F31B 3H6UA 1ATGA 3GBBA 3BBRA 1MRPA 2I0BA 1FTLA 1GVCA 2Y7WA 1VFEA 1A8EA 1BTJA 2Z23A 4KFQA 1LB9A 3PPQA 2FNCA 1P1QA 1NNPA 2ZNTA 1D9YA 5I59A 4NF6B 3CRBA 1YCJA 3IO6A 1DTGA 1LAGE 3KOSA 3MP8A 1MXXA 1JQFA 3QXMA 4U2RA 4Z0IA 4OVJA 1WVJA 2UVGA 2RKMA 4RK2A 1GV8A 1SW1A 4XKRA 4QFNA 5AA4B 1ZJLA 5CMMA 3KJTA 2AIXA 3SEUA 4EQ7A 3O28A 4R6HA 4ELRA 4FIMA 2OCUA 2ONSA 1A99A 1URGA 2HZLA 3HSTA 3V5AA 2ZNUA 3FIRA 3THIA 3S9MC 1MM6A 3TEPA 2IA4A 4LQ2A 5L9SA 2VD2A 4IO2A 5FHNA 3DLNA 5KCJA 4H5FA 3IJOB 2QMXA 4WEDA 3K00A 3K1MA 3OXNA 3LSFB 3HO7A 4NE4A 2I6EA 3FXQA 3CSBA 1I69A 4RYAA 1MQJA 2F35A 5JTYA 2D5WA 2Y7IA 3EHUA 1URSA 5LOMA 4QFOA 3FV1A 4MBPA 1JETA 5H8QA 3M3KA 3IR1A 3TCHA 5ISUA 1MXWA 4NTLA 4KYDA 4G77A 4R72A 3MPKA 1LBCA 1I6BA 1VE4A 1OQHA 5ICTA 3PGFA 3H7MA 1B3EA 1FQEA 4GXSB 4Q5TA 2R71A 5I2NB 5KZTA 3O66A 3SEWA 2GRVA 2DWHA 3KSXA 2CMOA 1A40A 3L6GA 5KDTB 1B4ZA 2DXYA 3HPIA 3CFZA 4MLVA 4ZEBA 5A5XA 1GTKA 1D9VA 1TFDA 2H99A 2QS3A 3FXRA 5CMCA 1B4HA 2RC9A 2I49A 1H43A 3FXUA 3RY3A 4X1BA 3KZGA 1MH3A 4DIGA 3PUYE 4OYVA 1MY2A 1JEUA 3MP6A 3K01A 3JV9A 4ZEKA 2GH9A 4N6PA 1QUJA 3PPRA 1SW5A 4F1YA 2F8DA 4ZEFA 3MQ9A 4DLDA 2ZNSA 4OMBA 1LBBA 3OENA 5TP9A 2Q2CA 4G68B 3TTLA 4HS7A 3SDFA 1SI0A 4ECFA 3IX1A 1QUKA 4QSDA 5IAIA 1Y9UA 3V8XB 3PUXE 1SVXB 4KCDA 1B5JA 5BUUA 4YKIA 4YB5A 1H44A 1HSEA 2XX7A 4ZS9A 1HSJA 4IY6A 4EXKA 5A5XB 3DP6A 5H8FA 5F7VA 1FTMA 2ZYKA 1EZOA 3KN3A 1SW4A 2X26A 2O69A 3FJGA 4BLAA 3LR1A 5HM4B 4OEVA 1TFAA 5FHOA 4F19A 3KN8A 3TDJA 1USYH 1DPPA 4F3SA 3H06B 4X48A 3G3GA 4JDFA 4EXLA 1JEVA 4DCYA 5FHMA 3W9WA 4PFTA 2V93A 3S9LC 4OXVA 5TP9B 2NVUB 3B7DA 3QUJA 4FORA 1USYE 2ANJA 5AE4A 3TTRA 4DXCA 5AA2A 1P1NA 4QFPA 2UVHA 3VVDA 1UTHA 1VR5A 3PD8A 3SERA 1MXYA 3LUYA 1P99A 1XC1A 1O63A 1OLCA 5H8FB 4F39A 2A5TA 3RLFE 3C34A 3O9PA 1ZIUA 3SETA 1NNFA 2FYIA 4OTEA 3MW0A 4RNSA 1B3LA 3Q27A 3T9VA 3LSLA 3PU5A 2VGQA 4LATA 1WODA 1OIBA 1B51A 4H65A 4F3BA 1NKXA 1MPCA 5K2XA 2R6GE 3LBSA 4ESWA 4ESXA 1UTBA 2IEEA 2NOOA 3TKDA 2W7YA 3JYRA 3PPOA 4G4PA 4ZEDA 1H3DA 4TOZA 4LP2B 4GL0A 5CRYA 3RT8A 3KFMA 3T9UA 1P1OA 2WKYA 3E13X 4GLIA 1LAFE 5L8DA 1QUIA 1OQGA 3MUQA 4UACA 4ZEIA 2XXWA 1VSOA 3VVEA 1F9BA 1MH4A 4L17A 4YKPA 2VD3A 4O3CA 1FQBA 3Q25A 1PB8A 2Z8FA 4ZZAA 5I57B 4OQOA 3U1OA 2GHBA 2DYXA 1AMFA 2X7QA 1TWYA 1MPDA 4LUBA 4TLLB 1L5TA 1B2HA 2XHDA 4U1OA 4F3GA 4IB2A 1D4NA 2V25A 5ITPA 4F2QA 2F7BA 1AIVA 1Y4CA 1DPEA 1NL5A 4R6KA 2XXYA 3I5OA 2A5SA 4GOTA 4NWCA 1N84A 2B3FA 3E3KA 1QW0A 4PP0A 4XIGQ 1YTVA 1MM7A 4FECA 4BDOA 3RPWA 4DDDA 3D4GA 2HFBA 3FATA 4RY1A 4OFJA 2G29A 4YZZA 1MDP1 3TTNA 4G8MA 5IKBA 3Q28A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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