5KDTB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne0723
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
287
structure length
284
Chain Sequence
MSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 284
sequence length 287
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kdtB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kdtB02
2Y84A 5B70A 1OLCA 2ZNTA 5KZTA 4HCWA 2IEEA 2QL3A 3MP6A 4RXLA 5J1DA 4F19A 1ZMGA 1YAEA 1N76A 3KZGA 3PD9A 4RK2A 3LSFB 1SQYA 1D9VA 4O3BA 2DWIA 2OBGA 4E0WA 3RT8A 4PFWA 3LUYA 4FATA 1JW5A 1TFDA 2XHDA 1BTJA 5I84A 3PUXE 4JSDA 1HSEA 2UVIA 2I0BA 3FJMA 5CMBA 4EXLA 2Q9TA 1B40A 2I48A 3MWBA 4RY1A 1IXHA 1QJMA 3Q28A 5CI5A 1US5A 2QS1A 3C9HA 5ISUA 3CG1A 2O84X 3OEKA 3IO4A 4O3CA 5IKBA 4G68B 4I1DA 1MPBA 4ELPA 1YPNA 1B7HA 3MVZA 1MQJA 4RNSA 1FQBA 3MVYA 4DCYA 2B3BA 3VVDA 1I6QA 4ISUA 1DPEA 1JEUA 4QF9A 4TLMB 3R7XA 3C33A 3MPLA 4EQ7A 2AYSA 2IA4A 5K2XA 1O7TA 3S9NC 2Q8JA 4KPTA 1PDAA 3OO8A 3S9LC 1MXUA 4U23A 3H6UA 4DLDA 2A5SA 1MRPA 4DE8A 3MBPA 1FQEA 3M3LA 5ICTA 4R6HA 4FEBA 3V83A 3PU5A 2HAUA 5I59B 2OK2A 4U21A 1LFIA 1IQ7A 4FECA 4HTGA 2UVGA 2FNCA 1B2HA 3KJ7A 1JVYA 3VVEA 1DSNA 1MXWA 2ONRA 3QK6A 1IITA 3EHSA 4H65A 4LATA 5DYHA 3EF7A 3RGYA 1B3LA 5H8QB 3IR1A 4F22A 2V3QA 1FTKA 3EN3A 3CSGA 3FD3A 4X48A 4ZEFA 4YB5A 3SDFA 2DE3A 2I6EA 2VP1A 5CM6A 4NF6B 4JXIA 5JTYB 1MXVA 3SEYA 5CBSA 2HQ0A 4Z0IA 4FEDA 4OFOA 5K2YA 1B1XA 3UORA 4PFUA 3FVNA 1MQGA 4LP2B 1N04A 5TPAB 4YKPA 3VE1B 3I5OA 1IXIA 2RKMA 2Z22A 1B7UA 3PPOA 2RC9A 2ONSA 3ONMA 1NNPA 5FTHA 1A8FA 3QYTA 4DCXA 3PMVA 2UVJA 3QAXA 1H76A 3RY3A 4ELOA 5DVFA 1LSTA 3CSBA 4MH5A 4ELRA 1JW1A 2HAVA 1QKAA 1Y4CA 2H9BA 3K1NA 5CBRA 2E0SA 1H43A 1TWYA 2F8DA 1VR5A 1LGBC 1UTHB 2AL4A 3LSLA 4H8IA 1EZOA 1B9JA 2Q89A 1MH4A 3KOTA 4GXAA 2NUVA 3GXAA 3TELA 3H03A 2XX9A 3TQWA 4OFJA 3MUQA 3H06B 1NNTA 3N5LA 5EHMA 3T93B 4N6PA 4LQ5A 4I9DA 5I59A 2R6GE 5KCJB 5AA2D 1B0LA 1ANFA 3OD7A 4P11A 2DQVA 4YICA 4NF8B 2NOOA 1M5BA 3L6GA 4MLQA 1QULA 4GL0A 1XVYA 2GHAA 1DMBA 3SEUA 5H8QA 2HEUA 4C1TA 2OZZA 4R9FA 2F78A 1WVJA 1FTLA 4QSEA 5ELVA 3G3FA 3N26A 2O1MA 4JWXA 5I2NB 1YTVA 3RNNA 1P99A 3K4UA 4XXUA 1VFEA 1MQDA 4RK9A 1JVXA 5DT6A 5ITOA 1FQDA 5AA4A 4NF6A 3H6VA 3KG2A 1A8EA 4NWDA 2GH9A 2HFBA 2PT2A 1US4A 2ZNSA 3ZS6A 3OO7A 1ZU0A 1MY0A 4YMBA 1H44A 1DOTA 3SEWA 4NWCA 1NL5A 2V84A 3K6XA 4P0GA 2BJJX 3R26A 4YKKA 1B1HA 4GFRA 4IO3A 3TKDA 1S50A 3QXMA 3PMWA 2VHAA 2V3UA 4DXCA 3K01A 4KFQA 2G93A 3O2AA 2XXYA 4AB6A 3DM0A 3KBRA 3RUMA 1FTOA 3CR9A 4TQUQ 1TXFA 2Z8FA 4KYDA 4QFKA 2XXIA 3FUZA 1UTHA 3MVXA 3DP4A 4XIGQ 2AL5A 1SW2A 3IOUA 1NNFA 3V5AA 2UVHA 5M2VA 3MAMA 3BFUA 2VGQA 4N13A 4R6KA 3TCGA 1MY1A 2ZMBA 1A55A 3HHGA 5EYFA 1LAXA 2O7UA 2HZLA 2Q2CA 4F1VA 1AL3A 4KR5A 4HS7A 3MJNA 3T9HB 4GXSB 4R72A 3FXRA 3JYRA 5KCJA 1F9BA 1QW0A 3OSRA 4OZ9A 5KDTB 1KWHA 3EQ1A 4BDOA 2XD3A 1H3DA 3TAJA 4YB6A 4ZECA 1JETA 5I56A 1H45A 1Y4TA 4LZ7A 2Y7WA 1NKXA 3T66A 1IEJA 2FYIA 3FZVA 4GF8A 4X1DA 1OQGA 2LAOA 3T96B 4KCDA 3H6WA 2OLBA 3ILUB 1SVXB 3WAEA 2VOZA 3KFMA 3ECRA 3RTWB 3SESA 2QMXA 3E3KA 3OSQA 4OYVA 1A40A 3N6UA 2Z8DA 1VE4A 3UIFA 3G7WA 1OQHA 2DVZA 5AA2A 5H8FA 5CMKA 4KCCA 3R6UA 3KGCA 1MY3A 1B05A 1QVSA 1B5JA 3KEIA 4THIA 1OMPA 3FVKA 4IGTA 4QFOA 2CZLA 4HW8A 1FCKA 2Q2AA 1LBCA 4G4PA 4FJPA 3U92A 2DYXA 2OCUA 4UACA 2YJPA 4LA9A 1TT1A 1GVCA 4OENA 2DE4A 4IO7A 1RYOA 4AB5A 2F7CA 1IZ1A 1Y20A 1P1UA 2XXQA 3CI8A 4PFYA 5BUUA 4P0IA 3BBRA 5B7DA 2Z23A 1PB7A 1GV8A 1MQIA 2H99A 1N7WA 4KYSA 1YCJA 3IO6A 4U1OA 3RTFB 4QSDA 4MLVA 4NF4B 4JWOA 3PV0E 1QUKA 4F29A 1PB8A 4EF2A 1WODA 3S9EA 3WAFA 1Q1KA 4IY6A 3OENA 5ITPA 1QUIA 3E13X 4XKNA 4XKPA 5FHMA 3OXNA 2ZXTA 3G3JA 5KDTA 1SYHA 1WDNA 3KJTA 3H7MA 4U4XA 4BDRA 4U1ZA 4M1VA 4KD5A 3MPKA 4KYEA 1UTBB 2Y7KA 1ZLQA 1FQCA 4ZEKA 1P1QA 4R2BA 1A7LA 3EHTA 3KOSA 3EPEA 3CVGA 2QS4A 1NMUA 4YKJA 5TP9B 4Q5TA 4QFLA 4PE5B 3K00A 3O9PA 4EQBA 2A5TA 3H6TA 2F5XA 5CRYA 2DXYA 3FJGA 3IK6B 3SERA 3PPRA 4Q30B 3O28A 3OO6A 5AA4B 2NVUB 1QKBA 1GR2A 2DE2A 3IORA 4H6DA 2OWSA 4G8MA 2XD2A 3IL1B 1O63A 3P7IA 3C34A 1URDA 3EHUA 2WKYA 3U72A 1B3GA 3SEXA 3BKIB 5HPQA 1FW0A 1MG1A 2I4BA 4PETA 3U94A 2DWAA 3TMGA 4BDLA 4F39A 3K1PA 3TFLA 3JV9A 3PMXA 2RF1A 1P1NA 3CFXA 3KN7A 4ZEDA 2O51A 4IO5A 3F11A 4POXA 3E9XA 1ELJA 4G68C 3G3IA 3IOTA 2Y7PA 5H8HA 2RCBA 5HM4B 2W7YA 1B51A 3KSXA 3TTRA 4NF4A 4DXUA 4EXKA 1SW4A 4OEUA 1N0TA 3PPPA 5L9MA 4DIGA 1B4HA 2THIA 4G8HA 3DLNA 1B58A 1XVXA 4U22A 4HCYA 4G8NA 4XTCQ 4ZE8A 4ZZEA 5A5XA 1B5IA 1EZPA 3B7DA 2KLFA 1A54A 1SW1A 3CIJA 1RKMA 4QSCA 2I49A 3MW0A 4XKRA 3VXBA 1FQAA 5AE4A 3G3HA 1UTBA 4PP0A 1M5EA 3O66A 1S7YA 1Z7ME 3FV1A 2I0CA 2F6PA 3O29A 1Q35A 3T9VA 3T22A 2DVCA 2PYYA 4OQOA 4LQ2A 5H8NA 4EUOA 5TP9A 2DP8A 2REJA 3TYHA 5I56B 2V25A 1EZ9A 5F7VA 1IXGA 3Q29A 1J1NA 3QUFA 1ZTYA 2I4CA 5AA3A 1LCFA 4GVOA 3TZAA 3HN0A 2QS2A 1ZKBA 4TLLB 3FV2A 1M5FA 5DVJA 2NXOA 1XHYA 3SEVA 4OETA 2O7IA 3A09A 5CMCA 4R9GA 1POTA 3TTLA 3OOAA 1JW4A 1I69A 4R2FA 5AA2B 5H8FB 1LLSA 4JBZA 4GD5A 3VLVA 3VV5A 4AQ4A 1AMFA 1PBQA 3TTKA 2XXTA 1Y1ZA 5I2KB 4YZZA 4QFNA 3HV1A 4ECFA 5I57B 2D21A 2Y7RA 3KN3A 1PB9A 1LAGE 3PUZE 2H98A 2QRYA 3RQTA 4IB2A 4F2OA 3FXUA 3H4ZA 3RT6B 3IB1A 2B65A 1D4NA 1MDP1 1M5CA 1MS7A 4X9TA 1MY4A 2UYFA 1Z7NE 3GLBA 4QRZA 1II5A 4LUBA 3W9VA 1OLAA 3K6WA 5HBCA 3TUSA 3RPWA 1IUDA 2DSFA 4OTEA 3SKPA 2P1SA 3C31A 4GOTA 3MVWA 1NFTA 4ELQA 1OVTA 4RJZA 1N84A 1R9LA 2GHBA 3B6QA 3VVFA 1NH7A 3O97A 1VFDA 2XXPA 3MZ1A 4TOZA 3ILTB 4NF5A 1R6ZA 2XXVA 2CMOA 1UQWA 4NE4A 5DEXA 4OMBA 5EHSA 2GRVA 2R9JA 3UK4A 4ZE9A 1B4ZA 3V8XB 3B6TA 3SETA 2XXWA 1I6BA 3TODA 1TFAA 3PPNA 3PUWE 3HPIA 1ZBMA 3MP8A 4F1YA 2PVUA 4R6YA 1USYH 3TTNA 4GLIA 3DP8A 3S4UA 2YLNA 3N94A 1DTGA 1NH8A 1LBBA 1XOCA 2REGA 4YU0A 1BIYA 4BDQA 1MDQA 3VDFA 1MH3A 3N6TA 1SI1A 4OVJA 1ZJLA 3Q25A 2M8CA 1BKAA 4RYAA 1QUJA 1DTZA 2A5TB 1MQHA 4QHQA 4F2QA 3KN8A 2G29A 4RA1A 4I8CA 4H0WA 4FORA 2V3TA 1JNFA 5I2KA 1JQFA 3OELA 4C0RA 3U8QA 1EU8A 5I57A 1HSJA 5AA1A 1MY2A 2X26A 4NMYA 3I6VA 4YAHX 2PBWA 3TCHA 4OERA 2DS9A 3C4MA 4IGRA 4Z7EA 3H3GA 2R71A 4GRKA 3CFLA 3IOVA 2RCAA 1R9QA 2AIXA 4F3PA 1Y3NA 3MP1A 4H8JA 4MF3A 4OXVA 3ZSFA 3O6GA 1MM7A 2RINA 4GIZA 3S9MC 1BP5A 1SW5A 3FIRA 3LR1A 1O64A 4POWA 1DPPA 1PEBA 4I62A 5H8HB 5I58B 2I3WA 1NNKA 1Y3QA 3K1MA 1LFGA 1Y9UA 3PD8A 1GGGA 1R1NA 5ICQA 4ESXA 1AOVA 5F1QA 1M5DA 2PMSA 1AIVA 4WKMA 4ND9A 3K2DA 3LBSA 3PGFA 3OO9A 4LZ8A 4IO4A 1OVBA 1B32A 5A5XB 1B52A 2QPQA 3G3GA 1MPDA 3GZGA 1JEVA 4RPNA 1MXZA 1XS5A 2F35A 3AXFA 5FTIA 2UXAA 1B6HA 2E1SA 4PQJA 4F3BA 3RLFE 2X7PA 4MFIA 2ZYOA 3W9WA 1B5HA 2P0SA 4F1UA 3C32A 3B6WA 5H8NB 4F31B 2X7QA 3T9UA 4YKIA 3TTMA 3I3VA 1BLFA 4U2RA 4R73A 2F7BA 1S9TA 2ALUA 4FE8A 1AH5A 2FA7A 2HZKA 3THIA 4JDFA 2I3VA 4LONB 3QSLA 3HSTA 1XC1A 5BWJA 1T0KA 5CC2A 3UP9A 3LC8A 3LSXA 3USDA 3UA8A 2DOJA 3FASA 3TEPA 3MZ9A 4IO2A 1CB6A 2HCAA 4H5GA 1OIBA 2OJTA 3RN8A 2F34A 2D5WA 2VD3A 4KHZE 4GWOA 4DXBA 2Q88A 2H4IA 2ZYNA 4X1BA 3MZBA 1Y1MA 5TU0A 3W15C 3K6VA 4ZS9A 1L5TA 4ONYA 3BFTA 4ESWA 3OEMA 1MPCA 2RC8A 2RC7A 5DVIA 1SI0A 1HSLA 4OFLA 1MXYA 3HHFA 1USYE 4YB7A 4OWDA 4G77A 4R75A 5H8SA 2DWJA 2F7AA 4G68A 1RYXA 3HO7A 2XXHA 2QMWA 5I58A 1B3FA 3K0VA 2QJEA 4C1UA 1UIVA 4F3SA 1PBPA 1ZIUA 5DTBA 3TPAA 1LFHA 2QS3A 4GQOA 3D4CA 4JWYA 1B46A 5CMMA 3CFZA 4XKQA 2V93A 3C35A 4EF1A 4BDMA 5JEIA 2XXXA 4NF5B 1Y3PA 4DDDA 1SBPA 3FVGA 1GTKA 5DEXB 4O3AA 4ZEBA 2ZYMA 4WEDA 1LAFE 4EDPA 2ONKE 3M8UA 5L8DA 3FVOA 3M3KA 2H25A 3Q27A 1B7ZA 2OWTA 3A3UA 4WXJA 5JK4A 5LOMA 1N7XA 4OEVA 3V89B 2Z8EA 4KI0E 4M4GA 4R74A 3DP6A 1SD3A 2QSXA 3U1OA 4U4SA 3O6HA 1N3WA 3IB2A 2HXWA 3TQLA 4Q8RA 4Q0CA 4K3FA 3G3KA 2O1LA 1P1OA 4OESA 4IY5A 3MQ9A 1EH3A 2Y7IA 1MM6A 4JB7A 4H5FA 4L17A 1B3EA 4FAJA 3C36A 3ODBA 2P2AA 2YPNA 4DZ1A 3ZKKA 4NTLA 3FATA 3UGWA 2ANJA 5JTYA 1URGA 4BLAA 4PFTA 4FIMA 2D3IA 3FJ7A 3L6HA 1IXCA 3HCQA 2NWJA 4WEPA 1PC3A 5IAIA 1IIWA 1FTMA 2B3FA 3OMBA 3T9XB 4UA8A 3ZKLA 1POY1 4F18A 2ABHA 5TPAA 2XX8A 2I58A 1FQFA 3M3FA 2O6AA 4GL8A 3D4GA 1B3HA 4QFPA 4JSOA 1I6AA 2F97A 5L9OA 3GBBA 3IB0A 3IX1A 1LB8A 5FHOA 2VD2A 3PUYE 4ZZAA 3IJXB 2O68A 1UIUA 3PPQA 2UYEA 3IAZA 3E4RA 4OHNA 3QIMA 1URSA 3PUVE 2XX7A 4F3GA 3K6UA 2GFEA 3TCFA 3UN6A 3MC2A 1LCTA 1CE2A 1ATGA 1LAHE 2DXRA 4EQ9A 4YMAA 3O6IA 3JZJA 4ZEIA 3CRBA 3A3CA 3Q26A 4KQPA 3CG3A 4NEDA 1LB9A 1A99A 3K02A 2H5YA 3FGSA 3VLUA 1N3XA 3VLWA 1SDXA 3TDJA 3IJOB 2XXUA 4G2ZA 3DELB 3FXQA 4H67A 5L9SA 2ZYKA 4LZ5A 2O69A 2PT1A 3VXCA 4ZDMA 3GBAA 1D9YA 1D3KA 2F36A 1FTJA 1SYIA 2XXRA 3QUJA 4LVQA 4NF8A 3LSWA 4BDNA 4IO6A 5FHNA 2DWHA 4H1XA 4RPOA 2ZNUA 3VFJA 3S2VA 2PX1A 2F6GA 1P1WA 4MBPA 1MXXA 1VSOA 3U93A 2ESNA 1B0HA 3IOWA 5I2NA 3KSJA 4E0XA 4N07A 1XT8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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