1UTHB

Dntr from burkholderia sp. strain dnt in complex with thiocyanate
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
226
structure length
226
Chain Sequence
ALNTLETALTTRDSFDPFASTRTFNLAMTDIGEMYFMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPGAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFSELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription regulation
source organism Burkholderia sp.
publication title Development of a Bacterial Biosensor for Nitrotoluenes: The Crystal Structure of the Transcriptional Regulator Dntr
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN
total genus 58
structure length 226
sequence length 226
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
B PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthB02
2DE4A 1BIYA 2XXXA 4YMBA 3HSTA 2R9JA 4XKQA 3R7XA 3IL1B 4HS7A 4F31B 1OLAA 2DVZA 1N0TA 1GTKA 3TDJA 3T9HB 1A8EA 1P1WA 1MQIA 1ZIUA 1FTJA 3EHTA 3CRBA 2O7UA 3DP6A 1OLCA 1SW1A 4POXA 4ZEDA 4GL0A 4F1VA 5DYHA 5I57A 1FTMA 4KCDA 1JW4A 4IO2A 1D3KA 3MZ9A 4GOTA 3PUYE 4I62A 4GWOA 2Q8JA 3G3IA 4Z0IA 2VHAA 4XKRA 4GL8A 3LBSA 5ISUA 1MG1A 4KYEA 2O1LA 2OK2A 4H67A 1PBQA 1B9JA 3KN8A 1WVJA 3KSJA 3PUXE 1XC1A 2V3TA 1B1HA 3GBBA 2H4IA 1XHYA 3VVEA 2Z23A 3IB0A 3LR1A 2QJEA 3K2DA 2F5XA 3QXMA 5FHOA 3UIFA 5DVFA 3LC8A 1UTHA 2UVIA 2VGQA 3B6TA 1MXVA 3TAJA 5JK4A 2E1SA 3ILUB 3GXAA 5B70A 3IR1A 3LSXA 3OSRA 5I59A 3OENA 1VFDA 1Q35A 3PPRA 4MBPA 4FATA 3C34A 1IEJA 4OERA 2CZLA 1LFGA 2HAVA 1MH3A 4ZZAA 1QVSA 1DPPA 3MZBA 3HCQA 1UIUA 4IY5A 4I9DA 4KD5A 4R73A 4TLMB 4Z7EA 2O68A 1O7TA 3QAXA 3FV2A 1Y9UA 4YB7A 3FV1A 2BJJX 1QJMA 3U8QA 5HBCA 2V25A 3R6UA 3EHSA 1YTVA 5H8QB 2PT1A 4YMAA 1USYH 4GXAA 4DXUA 2DVCA 4L17A 5BWJA 4KCCA 3K02A 1FQDA 3FASA 4EXLA 3PPQA 5DVIA 3FJMA 1B46A 1OQGA 3MP8A 3OXNA 2P1SA 4IY6A 4RPNA 2D5WA 3TTLA 1DSNA 1B32A 3LSWA 3U92A 1I6AA 2ZYNA 3IK6B 3TTMA 1JQFA 3QIMA 4X48A 3TYHA 1DTGA 3BKIB 4F2OA 4LZ8A 2XX7A 4HW8A 2VD2A 2NXOA 4TLLB 3JYRA 1ATGA 4JXIA 1B3FA 3KGCA 2AIXA 1S7YA 5DEXB 3OSQA 1N76A 3MVWA 5I58B 1KWHA 3C35A 5CBRA 4JWOA 4DIGA 2NWJA 4QF9A 4IGTA 1H43A 3CFZA 1MY2A 4F18A 4P11A 4U21A 3KZGA 1MM7A 2OWSA 3VDFA 1ZMGA 1NFTA 1MXZA 3TPAA 4F29A 4ZECA 4O3AA 1N04A 4LONB 5L8DA 4FECA 1R1NA 5BUUA 1MRPA 3TTRA 1EZ9A 4R9GA 3B7DA 5ITOA 5H8QA 2I48A 1M5DA 2PMSA 4U4XA 3PV0E 4QSEA 5CBSA 1MQHA 3O97A 3Q27A 5A5XB 1BTJA 2F7BA 2HFBA 3H6WA 3H4ZA 1I6QA 1P1NA 2Y7RA 3CG1A 2QS1A 4JDFA 1JW1A 3Q25A 3ZSFA 1ZLQA 2DYXA 4IO7A 1N3WA 4KFQA 2D3IA 3IB1A 2H98A 3CI8A 1FTLA 4R6YA 4RK9A 3KG2A 4TQUQ 3FATA 3TKDA 3ZKKA 5EHSA 4RYAA 4ONYA 2ZMBA 3TMGA 2QMXA 5KZTA 4BDLA 3VVFA 4FAJA 4P0GA 4G8MA 4MLVA 2XXWA 1IXGA 1SDXA 2HCAA 4LA9A 5DEXA 2I3WA 2O69A 3MP1A 4AB6A 5I58A 1FCKA 3OD7A 3DELB 3N5LA 1OMPA 1PB7A 1B0LA 4N13A 2OWTA 3O6HA 1ANFA 4PQJA 1EZOA 4IO5A 3OELA 1R9LA 4E0WA 1PB9A 2ONRA 3DP8A 3EN3A 1MQDA 1QKAA 2NOOA 1B7HA 1MDP1 2XXVA 1SYIA 4EF2A 1LGBC 3IB2A 3H7MA 1BKAA 1N84A 3QUFA 2I4CA 3TQWA 4U4SA 1JW5A 3VVDA 2RC9A 4OFLA 1ZJLA 3G3FA 3PUZE 1YCJA 4OEUA 3EPEA 4LQ5A 2ABHA 2Z8DA 3VFJA 3S9LC 2XXUA 3PMWA 4F39A 3MP6A 5ELVA 4DCXA 2XHDA 3HO7A 1B51A 1M5FA 5A5XA 3DM0A 3Q29A 4H8IA 4NWDA 5AA3A 3T66A 3PMXA 1DMBA 3CSBA 1IIWA 5HM4B 3K01A 2Y7KA 2QRYA 3OOAA 5AA2D 1CB6A 1B7ZA 1OQHA 2THIA 1B3GA 3MPKA 1B2HA 1SW5A 2F6PA 3ILTB 3PGFA 4ELQA 1LAGE 4PETA 4QFLA 4ZE8A 4NTLA 1MPBA 2OCUA 1IXCA 3W9VA 2XXPA 2GFEA 3VLUA 3U1OA 3T9XB 4XIGQ 4DCYA 1NMUA 3MJNA 4BDNA 4BDQA 1NNTA 5I2NA 2ANJA 4NMYA 1ZU0A 2REGA 3Q26A 1A99A 1VFEA 2A5TB 1H3DA 2DXYA 2H5YA 2FYIA 4WKMA 4GXSB 3O2AA 3T9VA 3THIA 4JSDA 1URSA 4LATA 1ZBMA 4PFYA 2HXWA 1LSTA 2AL4A 5DTBA 1QUJA 3BFUA 5IAIA 4OFOA 4MF3A 1PBPA 4DXBA 3FVNA 5HPQA 3A3CA 5KDTB 1LAFE 3VXCA 2I3VA 3E13X 5F7VA 3O6GA 4KYDA 2A5SA 4JB7A 2GRVA 5CMCA 1QULA 2KLFA 3FVKA 2QMWA 5I2KB 3PU5A 4ELRA 2Q2CA 1NKXA 3KBRA 3JV9A 1TXFA 1IITA 1GVCA 4N6PA 3I3VA 1M5EA 3E9XA 3O9PA 5DVJA 4XKNA 4U1ZA 1MY3A 5I56B 1MPDA 3H6UA 4C1UA 4OVJA 2OLBA 4R74A 4MFIA 4H0WA 4AB5A 2R71A 1RKMA 3RTFB 3T93B 4I8CA 3C9HA 3MVYA 3O28A 3PD8A 1B05A 3W15C 3S9MC 4YZZA 1J1NA 3OO6A 3RN8A 3MVXA 2RCBA 3IX1A 3T9UA 4GLIA 2A5TA 4UACA 3WAEA 1B3HA 4DZ1A 1VSOA 5I84A 4F2QA 4EQ7A 4AQ4A 2IA4A 3C33A 4FJPA 3EHUA 4QFPA 4U22A 4KI0E 5M2VA 1FW0A 2PVUA 2HZKA 2QS2A 1Z7ME 3V83A 5ICQA 2AYSA 1WDNA 5KDTA 2ZYMA 4I1DA 4R2BA 3K1MA 3G3GA 4Q0CA 3CFLA 4XTCQ 1JEVA 5B7DA 2G29A 1A8FA 4MLQA 1SBPA 3I6VA 2OJTA 2ALUA 2I0CA 5EYFA 3PUWE 2I49A 4X1DA 1FQCA 5I2KA 3KEIA 2ZYKA 4OTEA 4GQOA 2VP1A 4M1VA 2I4BA 1OVTA 2Z8EA 2Z8FA 1AOVA 1MM6A 1JEUA 1EU8A 4EDPA 5KCJB 3RLFE 5CM6A 1LB9A 4OESA 3WAFA 1TWYA 4H5GA 5TU0A 4QFOA 2XX8A 5I56A 2ZNUA 3OO8A 1PDAA 2GHAA 1US5A 3RTWB 2DE2A 2H25A 4Q5TA 4G4PA 4LP2B 4IO6A 1OVBA 4HCWA 5AA2B 4R72A 4KYSA 4G8HA 3FXQA 3GZGA 1II5A 1B5IA 3W9WA 3S4UA 1LCTA 1BLFA 1MQJA 3USDA 1CE2A 4DXCA 4GIZA 3HV1A 2XXYA 4POWA 1SVXB 3SEWA 4PFWA 4G68B 2PBWA 4NEDA 1AMFA 3TCFA 1SD3A 2RC8A 1I6BA 2XD3A 1LB8A 4ZZEA 2V3QA 4G68C 4OHNA 4PFTA 1LLSA 4FORA 1B6HA 3JZJA 3SKPA 2DWAA 2F35A 1P1QA 3RUMA 4F3SA 2FA7A 4OMBA 2Y7PA 3FXUA 3IO6A 4YICA 1N7XA 4OWDA 3KOSA 4ZDMA 1B7UA 4OENA 1B0HA 1FQBA 5AE4A 5KCJA 3N6UA 1Y4TA 3OMBA 3FJ7A 4QSCA 1TFDA 4RNSA 2G93A 4KHZE 2OBGA 3PD9A 4R9FA 4RK2A 5TPAB 1MS7A 3FIRA 5ICTA 3K1PA 3OEMA 3UP9A 4YKKA 3HHFA 3M3FA 1EH3A 1WODA 4RY1A 3RT6B 5AA2A 3MPLA 1QUKA 3G3JA 4PP0A 2ONSA 1US4A 1YPNA 3FD3A 1GGGA 1UQWA 1D4NA 3C4MA 4H65A 5JTYB 1M5BA 2RCAA 1IXIA 3SEXA 4XXUA 1TFAA 3IJOB 2Q89A 2REJA 3H3GA 3TCGA 3N94A 1SYHA 4K3FA 4R75A 2QL3A 2CMOA 4G2ZA 4G68A 4RPOA 1NL5A 5L9OA 3A3UA 2DOJA 5CI5A 5TP9B 2NVUB 4BDRA 4PFUA 2DWIA 1B4HA 3KJTA 1ELJA 3R26A 3CIJA 1EZPA 4ISUA 4IO4A 3V8XB 4FEBA 4F1YA 4OXVA 3S9NC 4EUOA 1O64A 3QK6A 1B4ZA 2Q9TA 4YKJA 2M8CA 4BDOA 4ESWA 4HTGA 3F11A 2XXIA 4LZ5A 1MY1A 4YKIA 2O6AA 1TT1A 2P2AA 4H8JA 1LFHA 4QSDA 1IQ7A 3G7WA 5TPAA 1FTKA 3MZ1A 3TELA 2DE3A 4NF5B 2B3FA 2PYYA 2RKMA 4F3GA 4R6HA 2FNCA 2Y7WA 3MUQA 2D21A 3H03A 4IB2A 2O84X 5LOMA 3GBAA 1IZ1A 2Y84A 4ELPA 1LFIA 4H6DA 1R9QA 3HPIA 1IUDA 5JTYA 2UXAA 3K6VA 2UVHA 4LQ2A 1MXXA 4QFNA 3SEYA 3VLWA 1B3LA 2RINA 3FVOA 2IEEA 4EXKA 3CR9A 3SERA 4TOZA 3D4GA 4EF1A 1FTOA 3H06B 4WEDA 3IO4A 3K1NA 1L5TA 5TP9A 2X26A 4X1BA 4JBZA 1SQYA 5L9MA 2UVGA 5FHNA 1YAEA 1VR5A 2B65A 3E3KA 5IKBA 3PPOA 2AL5A 4F3PA 4WEPA 1ZKBA 3CVGA 1QW0A 3TUSA 1B1XA 1RYOA 3TTKA 4ZEBA 4GRKA 3RY3A 3UK4A 3VLVA 1JNFA 4C0RA 2F78A 2XXTA 1MY0A 3RT8A 2DWHA 3EQ1A 3C36A 3U72A 1A54A 1LCFA 2QS3A 2GH9A 1FQEA 1DPEA 3S2VA 3TQLA 4F19A 1QUIA 4F1UA 1LBBA 3QYTA 3FZVA 3IORA 4NF5A 4N07A 4UA8A 1B40A 2UVJA 1NNKA 4LVQA 1XVXA 2XXQA 3ZS6A 4R2FA 1LBCA 3C32A 5H8HB 5AA4B 2P0SA 2H9BA 2H99A 4WXJA 1MH4A 2DQVA 2OZZA 3IAZA 3RPWA 5K2YA 1AL3A 3L6GA 4U1OA 1PB8A 3FXRA 1H44A 3FVGA 3IOTA 4C1TA 4LZ7A 1N7WA 4O3CA 3T96B 3PMVA 2O1MA 4NWCA 2WKYA 1BP5A 3VV5A 2VD3A 3IOVA 3FGSA 1GR2A 3UORA 2R6GE 1ZTYA 2O7IA 1Y3PA 3RGYA 1H76A 3IJXB 1F9BA 2DWJA 1XOCA 3CSGA 1GV8A 2YJPA 2X7PA 3TODA 3BBRA 1D9VA 3PPPA 1O63A 2F7CA 2YLNA 1Y1MA 3G3KA 1Y20A 1B52A 1P99A 3AXFA 5L9SA 4JWYA 2XX9A 4GD5A 3LUYA 4ZEKA 1DOTA 5DT6A 1T0KA 4LUBA 3H6TA 5H8FB 5CRYA 3KOTA 2NUVA 2I6EA 4DE8A 2XXRA 1NH8A 3A09A 2ZNSA 2HQ0A 4FEDA 3HN0A 5ITPA 1MPCA 3TEPA 3SETA 1LAXA 1UTBB 3DLNA 4GF8A 4Q30B 5JEIA 3N26A 1B5JA 2F6GA 5FTIA 4U23A 2PT2A 3ODBA 2V84A 2QPQA 3K6WA 5EHMA 5H8HA 5AA4A 2ONKE 1PC3A 4ZEIA 3FUZA 4F22A 5CMMA 2HEUA 3RNNA 3ONMA 3HHGA 3BFTA 1IXHA 2ESNA 4KQPA 3UA8A 2RC7A 3L6HA 4NF6B 2O51A 4F3BA 1S50A 5F1QA 1XS5A 2UYEA 3TTNA 2Q88A 3SEUA 4EQ9A 3KJ7A 3KFMA 4IGRA 1XVYA 3RQTA 1HSJA 2F36A 1URGA 4RXLA 1SW4A 3VXBA 5H8NB 2HAUA 3V5AA 1XT8A 4G8NA 3N6TA 1JVYA 3H6VA 3O6IA 1MXYA 3K6UA 1FQAA 3PUVE 1SI0A 1HSEA 4ECFA 4H5FA 3FJGA 1AH5A 5CC2A 2F7AA 1DTZA 3MAMA 2LAOA 2DP8A 4FIMA 3OO9A 3OO7A 3EF7A 4YU0A 3CFXA 1MXUA 2QSXA 5FHMA 3PPNA 5H8FA 1VE4A 3QSLA 4BDMA 3O66A 3MVZA 3CG3A 3LSFB 3M3LA 1B3EA 3MW0A 4ZE9A 1LAHE 3P7IA 4NF8B 3KN7A 1S9TA 3LSLA 4ND9A 2F8DA 1A55A 2Y7IA 4QFKA 2V3UA 2VOZA 5AA1A 4FE8A 1Y3NA 1MDQA 1P1OA 3I5OA 1UTBA 1URDA 1USYE 2XXHA 1Y4CA 3DP4A 2W7YA 1Z7NE 4QHQA 2E0SA 2F97A 4NF4B 3SEVA 4YKPA 4JSOA 4O3BA 5CMBA 1RYXA 4BLAA 1FQFA 1NNPA 4YB6A 4NE4A 1HSLA 3TZAA 5H8SA 4RA1A 2I58A 4NF6A 4YAHX 1B5HA 2B3BA 3M3KA 2PX1A 5I2NB 4OQOA 4Q8RA 3QUJA 4M4GA 4GVOA 3UN6A 1POTA 2RF1A 3OEKA 4H1XA 2HZLA 2DS9A 3K00A 5K2XA 4QRZA 1NNFA 5H8NA 2UYFA 4X9TA 4GFRA 2GHBA 4P0IA 3S9EA 4OEVA 2XD2A 4YB5A 3KN3A 4E0XA 1B58A 4PE5B 3TCHA 4KR5A 4JWXA 2F34A 2I0BA 4DLDA 1MXWA 1UIVA 5CMKA 2ZNTA 1R6ZA 4U2RA 2X7QA 1MQGA 3K4UA 3SESA 4G77A 5J1DA 5I57B 4RJZA 5FTHA 2ZXTA 3Q28A 4THIA 3K0VA 3M8UA 2DSFA 1QKBA 2Q2AA 3IOWA 1H45A 3VE1B 1PEBA 1Y3QA 3UGWA 3E4RA 3K6XA 3ECRA 3V89B 3D4CA 3MQ9A 1JETA 1SW2A 4NF8A 1Y1ZA 4ZS9A 3O29A 4ESXA 4OETA 3MBPA 3B6WA 2ZYOA 3G3HA 1POY1 2YPNA 3U93A 2QS4A 4OZ9A 4HCYA 4OFJA 4NF4A 3TFLA 1A7LA 3SDFA 1M5CA 1P1UA 4MH5A 1MY4A 3MC2A 1NH7A 3T22A 3IOUA 1UTHB 3U94A 1AIVA 2Z22A 4ELOA 1D9YA 1A40A 3MWBA 1N3XA 1OIBA 4R6KA 4DDDA 4OYVA 1Q1KA 4KPTA 5I59B 4XKPA 4ZEFA 3ZKLA 4IO3A 2V93A 4EQBA 1I69A 1SI1A 3GLBA 2DXRA 3B6QA 3KSXA 1JVXA 3C31A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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