1UTHB

Dntr from burkholderia sp. strain dnt in complex with thiocyanate
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
226
structure length
226
Chain Sequence
ALNTLETALTTRDSFDPFASTRTFNLAMTDIGEMYFMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPGAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFSELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Development of a Bacterial Biosensor for Nitrotoluenes: The Crystal Structure of the Transcriptional Regulator Dntr
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia sp.
molecule tags Transcription regulation
molecule keywords LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN
total genus 58
structure length 226
sequence length 226
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
B PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthB02
2DYXA 1Y4TA 1N0TA 3EPEA 1CB6A 1L5TA 2LAOA 1ZTYA 2XXRA 2E0SA 2IA4A 3KOSA 5I56B 1PB7A 3C9HA 1D9YA 4KQPA 4LUBA 1LBBA 4KFQA 3PD8A 5AE4A 5HM4B 3MP1A 1ZMGA 4ZDMA 2PT2A 1LB8A 1B52A 2VD3A 5I57A 1B7UA 4OHNA 3SEYA 5KDTA 1FQAA 3CI8A 4OVJA 1SYIA 3VE1B 5DVJA 1TXFA 1SI0A 4TQUQ 3TTKA 2GHBA 3MPLA 3H3GA 3TEPA 4O3BA 1P99A 1LAFE 3KN3A 3N6TA 4BDQA 5ITPA 3U92A 2RF1A 3OXNA 5I2KB 4C0RA 4IB2A 3SEVA 4YKKA 1A55A 1I6QA 5H8HA 3A09A 3BFUA 4GF8A 4I9DA 1Q35A 2PBWA 2B3FA 4M1VA 3MVZA 3SESA 3TYHA 4ZEDA 4F2QA 3MAMA 3MJNA 3U1OA 1II5A 2XXPA 3TCGA 4YZZA 3PPQA 1XS5A 3QK6A 5FHOA 1MXVA 3Q25A 1P1NA 3RPWA 1EZPA 3MWBA 3OOAA 3G3JA 3U93A 1A54A 2XX8A 3PPNA 3W9WA 3A3UA 3UGWA 1PEBA 1H45A 1NFTA 4GXSB 1FQDA 3KBRA 3FIRA 2A5SA 4H5GA 1CE2A 3VVFA 2Y84A 2NVUB 3D4GA 3WAEA 4G2ZA 4F39A 1M5FA 1Y3PA 1FTMA 1ZBMA 2D21A 1OMPA 3K00A 3Q29A 3TELA 5FHNA 1B0HA 1YPNA 3K1MA 3N94A 1PB9A 1WDNA 4GD5A 2X7PA 4YB7A 2O68A 4EXKA 3H06B 4QFLA 5DVFA 1TFAA 3KJTA 3OD7A 4RA1A 5TPAA 4KCDA 3VDFA 3OELA 1JVXA 3VVEA 4H6DA 4F22A 3PU5A 4U1OA 4EXLA 2ONKE 1A8EA 3T9XB 5I84A 4EQ9A 2QS1A 3EHTA 4QHQA 4P11A 1PB8A 4GOTA 4QFNA 1D4NA 4U22A 3UN6A 4MF3A 4JDFA 2RC7A 4R73A 1MQIA 1B0LA 4FAJA 3DP4A 3MC2A 3T9HB 1MXWA 1EH3A 3M3LA 4ECFA 1M5EA 1NNFA 1LFIA 4IGRA 4WEPA 4GFRA 3O6IA 4F29A 1OVTA 3G3FA 4MFIA 2HAUA 2PYYA 3T96B 4HCYA 4ZEIA 1A8FA 1MY4A 1MM6A 1LLSA 3TQLA 3TQWA 5JEIA 1LFHA 4KI0E 1QW0A 1SQYA 1BKAA 1DTGA 3S2VA 1B9JA 2ZNSA 3U72A 2H9BA 5H8QB 2V3UA 5JTYB 4ZE8A 4EUOA 3VFJA 4POWA 4BDOA 5AA4B 4UACA 1UTHB 1GTKA 3V8XB 1AOVA 1PBQA 1FW0A 1OLAA 2RC9A 3G3KA 3PUWE 4F1VA 1MY1A 2M8CA 4YB5A 2YLNA 4PFWA 5L8DA 3TTNA 5K2YA 2UVHA 3K02A 2ALUA 4R2FA 3TODA 2NUVA 3TTRA 4QFKA 3H03A 3K6XA 2W7YA 4FEDA 2I4BA 2R9JA 1QUIA 2THIA 1OIBA 3IJXB 3IX1A 1SW5A 2QMWA 2ZYKA 1DSNA 2ZYMA 1O64A 3QAXA 5AA2B 2X26A 3ODBA 2DXRA 2ZYNA 2OK2A 4PFTA 1JEUA 1ZJLA 2O84X 1US4A 1D9VA 4E0XA 2F34A 1JETA 2DS9A 2HXWA 3K2DA 4F3BA 3KSXA 1PBPA 1VE4A 4ZEBA 4BLAA 1ZKBA 4GRKA 1ELJA 3Q27A 4P0GA 4ESXA 2XXHA 3B6TA 4HCWA 2Y7PA 5H8SA 4NTLA 3IL1B 4Z0IA 4YKIA 3S4UA 3EHUA 3PMVA 2QS2A 3MZ1A 1XVYA 4RXLA 4X1DA 4KPTA 4AQ4A 1MH4A 3O6HA 1YAEA 4RJZA 1M5BA 1SVXB 2DVCA 5H8NA 3CFXA 4OFOA 1IXIA 1SYHA 3N5LA 1FTOA 4OQOA 3MW0A 2ZYOA 5CMKA 5AA4A 4F2OA 1HSLA 2H25A 5JTYA 2DSFA 2QSXA 3H6UA 1ZU0A 3HSTA 4R6HA 3IB2A 2QL3A 2A5TB 4ELOA 4NWDA 3IOWA 5ITOA 3OEKA 2QRYA 1R9LA 3RN8A 3EHSA 2BJJX 1LCTA 4Q30B 4TLLB 1B2HA 4THIA 3SERA 2HFBA 3HN0A 5H8HB 3O6GA 2ANJA 4QFOA 2Z23A 5TP9B 4KYDA 5DVIA 2ZMBA 4EQBA 3G3IA 1MY3A 4F3SA 1QKBA 1P1OA 2DOJA 3E4RA 3MZBA 3O97A 1N3WA 2FYIA 4RK9A 1H76A 3TKDA 2O1LA 2ONSA 3MVXA 4GL0A 4IY5A 3UK4A 1B46A 1NNTA 1UQWA 3EQ1A 3K01A 2F8DA 3DP8A 5J1DA 1AMFA 5I2KA 2AIXA 2XXTA 1UTBA 5CC2A 4DLDA 1NNPA 5I2NB 1B3EA 3C35A 3O66A 4NF8A 1MXYA 4DCYA 4R2BA 4R6KA 5KCJB 5ICQA 1BP5A 2B65A 1GVCA 5CMCA 4DXUA 2D5WA 4DZ1A 1MH3A 3B6WA 3PD9A 3OO8A 4ZEKA 2OLBA 2XD2A 1MDP1 3IO6A 4LQ2A 4F1YA 3AXFA 1MXXA 1JQFA 3FASA 3IORA 3VLVA 4NE4A 2NWJA 4G8MA 3ILUB 2CMOA 3W15C 4JXIA 3ZKLA 5BWJA 4QSDA 5AA3A 1FQEA 4FIMA 4X48A 4ZEFA 2VP1A 3OO6A 3K1PA 4QF9A 4ESWA 3FD3A 4RK2A 2I0BA 1UTBB 3USDA 3S9NC 2Q2CA 5CI5A 5EHSA 3FV2A 3LBSA 3M8UA 4X1BA 4F19A 1LGBC 4ELRA 3FATA 3FJGA 2ABHA 4L17A 3MUQA 2V93A 4MLVA 1LSTA 1JW1A 4IO6A 4NF4B 4ONYA 3T9VA 4XKNA 2Z22A 3IAZA 4YMBA 5BUUA 1B1HA 4IO4A 2PT1A 5I58A 1B5IA 5FTHA 1B5HA 1UTHA 1XVXA 2XXQA 4R6YA 1FQBA 5L9MA 3SKPA 3JV9A 3HHFA 1AH5A 2UVJA 4U2RA 5L9OA 4DIGA 2I58A 3FUZA 5CMMA 3TCHA 1DPEA 1Y1MA 2CZLA 2F7CA 4EF2A 3EF7A 3GLBA 5DEXB 5I59A 1R1NA 1B3HA 3CSBA 3LR1A 4Q5TA 4QRZA 3SEWA 2H99A 5DTBA 4YMAA 3G3GA 4ZZEA 3S9MC 1SBPA 2AL5A 2P0SA 2R6GE 2FA7A 3CFZA 1I6BA 3BFTA 3K6VA 4IGTA 3V5AA 2F36A 4HTGA 4PETA 1QJMA 1Y3QA 1S50A 3MQ9A 2H98A 4ELQA 3ONMA 4FATA 4IO7A 2RINA 1OQHA 3IJOB 4H1XA 3U94A 4G68B 2H4IA 2QJEA 2OWTA 3O9PA 4FECA 2A5TA 4R74A 3TFLA 1Y4CA 3OENA 3IOTA 2XHDA 3CR9A 3RT8A 4FJPA 3CG3A 4G77A 2O7UA 4EDPA 4XKPA 1O7TA 2X7QA 4G8HA 1LB9A 2I3WA 5I2NA 1N04A 4F3GA 4MH5A 1LAGE 4NF6B 5ELVA 4FEBA 3MPKA 1IITA 4H8JA 2Q8JA 3RTWB 5F1QA 1MXUA 2F7BA 2F35A 2Y7WA 2IEEA 3N6UA 4JBZA 3RQTA 4AB6A 3FVGA 4BDRA 3PPRA 1NH8A 1LBCA 3QYTA 4I1DA 2ZXTA 2GFEA 1MQGA 3JZJA 2UYEA 1F9BA 1M5CA 1POY1 4IO3A 4PFUA 5A5XA 4ZS9A 1N76A 5ISUA 1Y1ZA 3HCQA 4OERA 4WEDA 4JWXA 5FTIA 4YU0A 5CBSA 1Y20A 4LVQA 3IO4A 2QPQA 3TTLA 3M3KA 2XX7A 4F18A 5DEXA 4BDMA 1QUJA 5I59B 1MPDA 1B4ZA 1URSA 1QUKA 1SW4A 3P7IA 3PUVE 1SDXA 3BBRA 4QFPA 1I6AA 3GBAA 1MDQA 1Q1KA 2I49A 3I6VA 3L6GA 1MY0A 1VSOA 3FVKA 3HHGA 1ANFA 1DPPA 4U23A 2Y7IA 3G7WA 3MVYA 2UXAA 2DWJA 3H6TA 3VLUA 4ZE9A 3A3CA 4ELPA 1TWYA 4R75A 1OVBA 4NF5A 2NOOA 3TDJA 4R9GA 1JW5A 1ZLQA 1GV8A 2P2AA 3DLNA 1JNFA 1MQHA 2OZZA 1P1WA 2OWSA 5EHMA 3CIJA 2YJPA 3H6VA 4KYEA 1B6HA 1MPBA 5AA2D 3PGFA 1JEVA 3H7MA 1LAXA 2DQVA 3K0VA 1HSJA 1MQJA 2VD2A 2UYFA 4KCCA 1MQDA 1XHYA 3VLWA 3KOTA 4IY6A 4RYAA 1B4HA 3LUYA 1S9TA 4P0IA 5EYFA 3S9LC 3C4MA 4JSOA 2D3IA 1N7XA 4YKPA 2I6EA 1FTKA 1RKMA 5I56A 3Q26A 4OTEA 3V89B 3OMBA 4QSCA 4OWDA 4OEVA 1ZIUA 3MP8A 1AIVA 2DP8A 2VOZA 4QSEA 3T66A 3DELB 3PMWA 4NF8B 3RUMA 3QUJA 5KCJA 2XXUA 3B6QA 3QXMA 1M5DA 1N3XA 1XC1A 4OESA 3W9VA 2V25A 3N26A 3D4CA 3ZKKA 2Q9TA 2GHAA 5CRYA 1RYXA 3THIA 1MG1A 3KEIA 5FHMA 2F6PA 2PX1A 3OSRA 1AL3A 1IXCA 1UIVA 2PVUA 4O3AA 4UA8A 3RGYA 4G8NA 4IO5A 4FORA 4GXAA 3KZGA 4WKMA 1IZ1A 3C31A 3FZVA 3C36A 4LP2B 4U21A 4XKQA 4NEDA 3T22A 4BDNA 1OQGA 2G93A 4NF5B 4N07A 5IAIA 2UVGA 3GBBA 4GIZA 4GVOA 4Z7EA 3DM0A 4FE8A 3DP6A 3GXAA 4E0WA 1MY2A 2XXIA 4KR5A 2F5XA 4LQ5A 1EZOA 1N84A 1VR5A 1NH7A 3SEUA 1LFGA 4LZ8A 4XIGQ 3K4UA 2FNCA 3IB1A 5AA1A 2ESNA 3HPIA 3KN8A 3Q28A 3TPAA 2KLFA 4PP0A 2RKMA 4JSDA 3KJ7A 4MLQA 1NKXA 1Y9UA 5H8NB 4YICA 3MP6A 3ZSFA 4JWOA 3ZS6A 4PE5B 1A99A 5I58B 1T0KA 1QULA 3IOVA 3SEXA 2QMXA 4R9FA 5JK4A 1RYOA 2DWIA 2VGQA 4OXVA 4GWOA 4G68C 4O3CA 1B7HA 3KGCA 1A7LA 3PPPA 4F1UA 5F7VA 3C33A 5IKBA 4XXUA 4GL8A 3FJ7A 1D3KA 3MZ9A 1B7ZA 3L6HA 2V3TA 4ISUA 3S9EA 3GZGA 1GR2A 3O28A 4F31B 4LZ5A 4U4SA 3RLFE 5CBRA 4NF4A 3IB0A 4EF1A 2OBGA 1Y3NA 2HEUA 1KWHA 1MXZA 2HCAA 3TCFA 2OCUA 3V83A 1EZ9A 1YTVA 2REGA 5H8FB 2H5YA 3RNNA 4K3FA 3ILTB 3PPOA 2Q2AA 4RPNA 1ATGA 5HBCA 1B1XA 1IXHA 1Z7NE 3HV1A 2DE2A 5B70A 3FXRA 4RY1A 4GQOA 4H67A 1DMBA 2F78A 4OMBA 3I5OA 4TLMB 1FCKA 4MBPA 1H3DA 2O51A 3QSLA 5TP9A 3RT6B 1IXGA 3KFMA 4AB5A 2I3VA 3PUXE 3WAFA 1BIYA 4LONB 1MS7A 2XXVA 5TU0A 3RTFB 1LAHE 1B3FA 4NWCA 4YKJA 2Y7RA 4I62A 1TT1A 4XTCQ 1NMUA 4PQJA 4U1ZA 1H44A 1YCJA 2HZLA 1GGGA 5H8FA 2G29A 1MM7A 2O1MA 4F3PA 3OO9A 1SW1A 3LSFB 5AA2A 2XXWA 2Z8DA 1URDA 1XOCA 1POTA 3K6UA 3KSJA 3OEMA 3B7DA 3O2AA 4TOZA 1OLCA 3PUZE 4C1UA 2DWAA 2HQ0A 3H4ZA 2RCAA 3K1NA 3FJMA 3TMGA 1JW4A 2DXYA 4JWYA 3IOUA 3VXCA 1B05A 5CM6A 1PDAA 1EU8A 1MPCA 1BTJA 1B32A 2REJA 3C32A 3FGSA 1PC3A 4H5FA 2B3BA 5CMBA 4G4PA 3RY3A 4DDDA 4EQ7A 2VHAA 4KYSA 2QS3A 5HPQA 3E9XA 3M3FA 3UP9A 3LSLA 1B5JA 3UIFA 4XKRA 1Z7ME 3VXBA 3FVOA 1JVYA 5L9SA 1NL5A 2Q89A 2XD3A 2I48A 2Y7KA 3EN3A 3IR1A 3LSXA 4LZ7A 4RNSA 4YB6A 5LOMA 1FQFA 3UORA 1SW2A 1FTLA 5KZTA 4IO2A 4DXBA 5TPAB 5A5XB 3JYRA 4H65A 1P1UA 4I8CA 4KHZE 3MVWA 3PV0E 2PMSA 1B51A 3ECRA 2YPNA 4NMYA 4BDLA 3R26A 3HO7A 3I3VA 3FXQA 1B3LA 4H0WA 4HS7A 4PFYA 4OYVA 4OEUA 4ZZAA 1J1NA 3CRBA 2ONRA 4C1TA 1FTJA 1USYE 5B7DA 5ICTA 2GRVA 2UVIA 4HW8A 4Q8RA 2DE3A 3KG2A 1SI1A 2O6AA 4H8IA 3TAJA 2F97A 3E3KA 1QVSA 3FV1A 3KN7A 4OENA 3U8QA 4NF6A 3QIMA 1VFDA 3H6WA 4KD5A 3R7XA 1I69A 3OO7A 3SDFA 2WKYA 3TTMA 3CSGA 3CVGA 1A40A 3F11A 4LATA 4DCXA 1R6ZA 2XXYA 2DWHA 5K2XA 4N13A 2RC8A 3VVDA 1MRPA 1FQCA 2V3QA 4DE8A 1DTZA 3BKIB 4G68A 1WODA 3FVNA 2O7IA 3FXUA 2QS4A 1XT8A 1R9QA 3SETA 2R71A 3TZAA 2DVZA 1QKAA 2I4CA 2Q88A 1DOTA 2Z8EA 3O29A 2F7AA 4POXA 4OETA 2GH9A 3CG1A 5H8QA 1IIWA 1P1QA 2E1SA 3TUSA 2V84A 2OJTA 3PUYE 2I0CA 3R6UA 4M4GA 1USYH 3IK6B 5I57B 4OFLA 5KDTB 1NNKA 2XXXA 4DXCA 1B58A 3LC8A 2AL4A 2P1SA 3LSWA 3T9UA 2ZNUA 2NXOA 3UA8A 1N7WA 3CFLA 1LCFA 5DT6A 1B3GA 1UIUA 3G3HA 3MBPA 4N6PA 4OFJA 2DE4A 2Z8FA 2AYSA 4JB7A 3T93B 4GLIA 1URGA 4LA9A 5DYHA 1HSEA 1WVJA 1US5A 4X9TA 3E13X 1B40A 1O63A 1BLFA 2RCBA 4ZECA 1IUDA 4ND9A 1IEJA 4U4XA 2F6GA 2O69A 4YAHX 4OZ9A 3PMXA 1VFEA 3QUFA 4RPOA 3C34A 4R72A 4WXJA 5M2VA 2HZKA 1TFDA 1H43A 2XX9A 3K6WA 3VV5A 1IQ7A 2HAVA 4Q0CA 3OSQA 1S7YA 1SD3A 2ZNTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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