1UTHB

Dntr from burkholderia sp. strain dnt in complex with thiocyanate
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
226
structure length
226
Chain Sequence
ALNTLETALTTRDSFDPFASTRTFNLAMTDIGEMYFMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPGAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFSELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription regulation
molecule keywords LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN
publication title Development of a Bacterial Biosensor for Nitrotoluenes: The Crystal Structure of the Transcriptional Regulator Dntr
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia sp.
total genus 58
structure length 226
sequence length 226
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
B PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthB02
1LBBA 5K2XA 3T22A 3E13X 5DVFA 2HEUA 2DE4A 2HZKA 4AB5A 1SQYA 1SW1A 1WODA 4F39A 1JETA 4OFJA 1YCJA 4TOZA 1SW5A 5LOMA 4DDDA 3SESA 3LR1A 4NF8B 3H6TA 1NNTA 1MRPA 4H8JA 2B3BA 3TMGA 5I2NA 3O28A 3IB2A 3ZKKA 3N5LA 4TLLB 3C9HA 3QK6A 3LSFB 1JW5A 4G8HA 5H8FB 1IXIA 4C1TA 2PX1A 2UVIA 3N6UA 4QF9A 4I8CA 2XXVA 2WKYA 5AA1A 5L8DA 2Q89A 2D5WA 2O51A 4ELPA 4ZECA 1HSJA 2Q2AA 3CI8A 1A99A 4YICA 4N07A 3T9XB 1OIBA 3OO9A 3BKIB 3S9MC 4R9GA 2REJA 3MZBA 1B7ZA 1TWYA 3WAFA 4OERA 1MXYA 4DE8A 1N04A 3IO4A 1B6HA 4GXSB 3IOVA 2HQ0A 3FVKA 2OLBA 2GH9A 4LONB 1TXFA 3TDJA 4DCXA 4NF4A 3TPAA 3SERA 1IXCA 1MH3A 3OELA 1ZJLA 3VLUA 2DOJA 3GBBA 4R9FA 3RT8A 1GGGA 3QYTA 1B05A 1EZOA 4ISUA 4HW8A 3W15C 3EHTA 1B1HA 4PETA 3IORA 1M5EA 4RA1A 2H5YA 1FTKA 5AA2A 4RPNA 1QUIA 3B7DA 1XC1A 1TT1A 2XXRA 2ZNUA 2VGQA 4PFUA 1VFDA 2B3FA 2ESNA 5TP9A 3KEIA 3PD8A 3CR9A 1BKAA 2E0SA 2O6AA 5L9OA 2NXOA 4XKPA 3IK6B 3GLBA 2DE3A 3OO8A 2OCUA 3FZVA 1FW0A 2UVJA 3A09A 1MPBA 4Q30B 3K6WA 3VVDA 2UYEA 3SEYA 4G68B 4HS7A 3I6VA 2B65A 2ZXTA 3IOWA 2GHAA 4GF8A 1NFTA 3MP8A 4K3FA 2DS9A 3B6WA 5CMKA 4ZDMA 5FTIA 2VD2A 4BDOA 1MY2A 1VSOA 2H98A 4QRZA 3SEUA 4ZS9A 1R9LA 4U2RA 4LQ5A 2XXQA 1IEJA 2QSXA 2R6GE 1JNFA 1FQDA 1PB8A 4HTGA 1OQHA 4RK2A 3TTNA 3IJXB 1AIVA 2XX9A 2CZLA 1EZPA 4YZZA 3KG2A 3MVZA 3Q25A 4WKMA 2Q88A 2DQVA 4LVQA 3OEKA 2H25A 4NF8A 1LCTA 1QULA 1B4ZA 1LB9A 3C4MA 3LUYA 1CE2A 1MY4A 3PPQA 1RKMA 2H99A 3MWBA 4KHZE 3Q28A 3M3FA 2X26A 4OXVA 4EXKA 2QRYA 2O1MA 5H8FA 1Z7ME 1LCFA 3UORA 3OSRA 4L17A 2Y7IA 1JVXA 3PU5A 3TQWA 3C33A 2DVCA 1IIWA 5EHSA 3RLFE 3TTKA 4H5GA 2XD3A 4EQ7A 3U8QA 2O7UA 4QSEA 4R2BA 5ELVA 3C31A 2F7BA 2PT2A 2ALUA 4FEBA 2AYSA 4R72A 3T9HB 3K0VA 3UK4A 4XKNA 5TPAB 3W9VA 3FVGA 1EZ9A 5L9MA 2QS3A 4UACA 3KSJA 1TFAA 3U72A 4YKJA 3MP6A 3RN8A 1FQEA 1Y3PA 1RYOA 3CG1A 3G3GA 1HSLA 3TCGA 3O9PA 2Y7WA 5ICQA 3WAEA 3S9NC 1B0LA 4ZEFA 4BLAA 1F9BA 2XXIA 3UGWA 1UTHB 3PUVE 3FGSA 3OENA 1LFIA 1UIUA 3MC2A 2NUVA 2QS4A 1H3DA 1QKAA 1USYE 3V83A 1LB8A 4POXA 2V3UA 2Y7KA 2QMWA 4RK9A 3U94A 1IQ7A 4IGTA 2DWHA 4PFWA 4LZ5A 1MXVA 1S9TA 4PFYA 4BDQA 1URDA 4F31B 4LZ8A 4XIGQ 1A55A 1P99A 4QFLA 4JDFA 4NWCA 5K2YA 4F1YA 2GRVA 3KFMA 4PFTA 4QFPA 1SD3A 3K6VA 5KDTB 1A8EA 3JYRA 1B3EA 4HCYA 3FVOA 3PUXE 4Q8RA 4X1DA 4F3BA 1PB7A 3Q27A 5DYHA 2Q8JA 1FTMA 2RC8A 5HPQA 3THIA 3G7WA 3QAXA 4JWXA 1XS5A 4WXJA 1AMFA 4GL0A 3H6UA 3MJNA 1B58A 2ONRA 2NVUB 3VDFA 1P1QA 3O2AA 2RINA 4OENA 2QS1A 4NF6A 3MP1A 2A5TB 2XX7A 1MQHA 5A5XB 4QHQA 3MPLA 3DELB 2VOZA 4OFLA 1FQBA 1JW1A 1B52A 2UVGA 2HFBA 3L6GA 5I56B 2I3WA 2ZYOA 3S2VA 1MS7A 4H5FA 2FA7A 5DTBA 1I6QA 2KLFA 5FHOA 2RC9A 1M5BA 3EHSA 4PP0A 4EUOA 2F97A 4FORA 4F22A 4OQOA 3OSQA 1D4NA 3FATA 4GL8A 1HSEA 4YMAA 1RYXA 5KCJB 4TLMB 4U4SA 5I57A 4MLQA 3MZ9A 4IO3A 1MXZA 2Y7PA 3SEXA 1Y20A 1XVYA 1II5A 1B3LA 3R7XA 1VFEA 3V5AA 4GD5A 3KBRA 3RNNA 4BDLA 1MM6A 1UTBA 3HN0A 4Z7EA 3MZ1A 3Q26A 1MQJA 3GBAA 2H9BA 3MPKA 1WDNA 1JEVA 1MQGA 3B6QA 4O3BA 1MY3A 5TPAA 2DWJA 2DWIA 3FVNA 4EXLA 3RGYA 3M3KA 4F29A 3V8XB 5M2VA 2I6EA 3SEWA 1MQDA 3ZKLA 4G4PA 1XVXA 3PPPA 3TFLA 4F3GA 1MQIA 4FATA 1NH7A 4DZ1A 4RPOA 2OWSA 1ZTYA 4NF5B 4QSCA 5I59B 2HCAA 5ITPA 3DP8A 5H8HB 4XXUA 2ZYNA 4YB6A 4ZEIA 4RY1A 2XHDA 1B5IA 2PT1A 3OO7A 2FYIA 3P7IA 4LUBA 2I49A 4G77A 3PPOA 4DXUA 1XT8A 5HM4B 1MPDA 4FEDA 3IX1A 4RYAA 1EH3A 1NNPA 4X48A 2ZMBA 4U22A 1Y9UA 2LAOA 5KDTA 4UA8A 1OQGA 3GXAA 1MXUA 3RTWB 1IZ1A 1NKXA 2DE2A 3H7MA 2DXYA 3O66A 1BLFA 4H65A 3TELA 3MVYA 4QFKA 1US5A 4ZEDA 1S50A 2P1SA 1QW0A 3FV2A 4G8MA 1IUDA 3UIFA 2QS2A 2DWAA 4TQUQ 4ZE8A 3UA8A 3JZJA 3MQ9A 1DMBA 2GHBA 4ZEBA 2Z8EA 3H6WA 5CMBA 2H4IA 4DLDA 1BTJA 2A5TA 2UVHA 3FJMA 1PEBA 5H8SA 2Z8FA 2ZNSA 1OLAA 1FTJA 2QJEA 4F18A 3ILTB 3SETA 1Y4CA 3A3UA 2PMSA 4ZZEA 2DP8A 3HV1A 1FQCA 3TUSA 4EQBA 4AQ4A 1FTLA 1BP5A 3U92A 1MY1A 5BWJA 3PMVA 3QUFA 1SW4A 5JTYB 1ZKBA 3TODA 3PUYE 4R6YA 4F19A 2D3IA 4NEDA 5FTHA 3OEMA 5KCJA 1GTKA 3TAJA 1DPEA 2ONSA 1PC3A 3LC8A 4F3SA 3LSWA 4OESA 4X9TA 3PPNA 3FXUA 1DSNA 1GV8A 4YKKA 3VLVA 1MDQA 4BDNA 1ELJA 1Q35A 3E9XA 1PB9A 4IO5A 3SDFA 3JV9A 1P1NA 2OK2A 3K1NA 1B5HA 1AOVA 2O1LA 4WEPA 2OWTA 1DOTA 3OOAA 1QJMA 2R9JA 1A54A 4R74A 3RT6B 4GRKA 3TTRA 3PPRA 3EPEA 4YB7A 4IO4A 4C1UA 2VHAA 4XKRA 1M5DA 4H0WA 3EQ1A 4NF5A 5H8NB 3QIMA 1YTVA 3RUMA 1QUJA 4R2FA 2P0SA 3HPIA 4QFNA 5H8HA 4O3CA 4U23A 4GQOA 1TFDA 2RC7A 1LGBC 3C36A 4OZ9A 1H44A 2I58A 4OETA 2RCAA 1MXXA 2NOOA 2RF1A 3CIJA 5JEIA 5F7VA 5TU0A 4LA9A 4OYVA 3KOSA 5H8QB 3S4UA 4M1VA 4H6DA 4EDPA 4MLVA 5CMCA 3TTLA 1A7LA 5CM6A 1O7TA 1YPNA 1ANFA 1Y4TA 4Q0CA 3USDA 5ISUA 1IXGA 1BIYA 1B5JA 4R73A 1OMPA 1JW4A 2YJPA 3O97A 1LAFE 3SEVA 3S9EA 4G68C 4F1VA 4OTEA 3UP9A 3H3GA 4DIGA 3I5OA 5I2KB 3HO7A 1JVYA 2IA4A 2G93A 3HHFA 4G8NA 4IB2A 1POTA 2AL4A 4HCWA 1ZIUA 2Z8DA 1AH5A 3T93B 1XHYA 3VVFA 2O84X 1ZMGA 1NNFA 4U4XA 3GZGA 2Q9TA 2E1SA 4AB6A 1M5CA 4QSDA 2ZYKA 4KQPA 4OVJA 4U1ZA 4ELQA 4ZEKA 3N94A 1Y3QA 4QFOA 4RXLA 1GVCA 4KYSA 1NNKA 1QVSA 3LSLA 4YB5A 2X7PA 4GFRA 2V3QA 2FNCA 4G68A 3T96B 3R26A 2OBGA 5JTYA 4Z0IA 1N76A 4MH5A 3OMBA 2X7QA 2Z22A 1Q1KA 1MY0A 3N6TA 2ONKE 2I48A 3ZSFA 4P0IA 4ELRA 3VLWA 4R6HA 3G3IA 1N3XA 3KGCA 4FJPA 4JSDA 1H43A 3IOUA 1Z7NE 1T0KA 1ATGA 5I84A 3RTFB 4E0XA 1MDP1 3B6TA 1O64A 4YAHX 4ND9A 2OJTA 4R75A 4RJZA 3RQTA 3PUWE 1URSA 3OD7A 4WEDA 4R6KA 1N7XA 4LQ2A 3FXRA 3O29A 5AA2B 1B40A 4ZE9A 1N84A 3VXCA 1QUKA 3PGFA 1N0TA 2F35A 4U1OA 1B2HA 3H06B 4ONYA 2GFEA 4DCYA 4JWYA 5H8NA 2DXRA 2XXWA 1Y1MA 1B7UA 4ECFA 3TEPA 5AA4B 1EU8A 1URGA 2P2AA 3DP6A 3RY3A 3OO6A 3U93A 2DSFA 1JEUA 1SDXA 1B7HA 1SW2A 3MUQA 3TKDA 1R1NA 2F6PA 2R71A 1H45A 4GVOA 3K01A 2F8DA 4JB7A 1ZLQA 1FQFA 4MFIA 3K4UA 1NL5A 1I69A 5H8QA 3I3VA 4OMBA 3KOTA 3ONMA 2ANJA 1B0HA 2ZYMA 3IB1A 5L9SA 3F11A 4LZ7A 5I58B 4GLIA 2V93A 3CSGA 4I1DA 2RCBA 2V25A 3K00A 1D9YA 1ZBMA 2DYXA 2HXWA 5IKBA 1D9VA 4GXAA 3C35A 2QL3A 2F7AA 3TCHA 1NMUA 2OZZA 3C34A 1UTHA 2F36A 3HHGA 3PMXA 4PE5B 4BDRA 5CBSA 4X1BA 5DEXB 5I2KA 1LSTA 3O6GA 1UIVA 1VR5A 4EF1A 2F6GA 4PQJA 3T9UA 2ZNTA 4OFOA 1LAHE 5HBCA 1LFGA 3IAZA 3FXQA 3V89B 1JQFA 3M3LA 4XTCQ 3CRBA 1KWHA 2AL5A 2HAVA 3QUJA 3OXNA 1QKBA 3W9WA 2Q2CA 1B9JA 4IY5A 3MBPA 3MVWA 4N6PA 1B51A 5ITOA 2IEEA 1USYH 3RPWA 2D21A 2PBWA 1R9QA 3QSLA 2I4CA 1SI1A 2PYYA 1Y3NA 1WVJA 3IL1B 3ECRA 1SVXB 3ZS6A 4H8IA 4P11A 3MW0A 1NH8A 3M8UA 3TCFA 3VVEA 1LAGE 3LBSA 3PMWA 3IB0A 4N13A 4I62A 4KI0E 4M4GA 4YMBA 4MBPA 2Y7RA 3FIRA 5J1DA 3HSTA 2Z23A 1B3FA 2I4BA 4NTLA 5A5XA 5CRYA 4KYEA 2THIA 3D4GA 2YPNA 3FJ7A 3CSBA 2O68A 1I6BA 3E4RA 5B7DA 4JBZA 1B32A 3DM0A 2AIXA 5I56A 4OEUA 3UN6A 5ICTA 1LBCA 5DVIA 2RKMA 3KJTA 4Q5TA 3K6UA 4THIA 4YKIA 3IJOB 4P0GA 1P1OA 2I0BA 4OHNA 4LATA 3A3CA 5F1QA 4FAJA 3IO6A 3G3FA 3DP4A 3MAMA 5AA4A 4F3PA 1LFHA 3KSXA 4F2QA 3DLNA 3BFUA 5KZTA 4DXBA 4BDMA 2BJJX 4RNSA 1B46A 3K2DA 1MH4A 2VD3A 3D4CA 1POY1 4YU0A 1FCKA 4OEVA 3KN8A 4U21A 2QPQA 1B3GA 4DXCA 4NF6B 4KCCA 3K6XA 1O63A 4EQ9A 1DTGA 3H03A 2Y84A 2XXUA 5I58A 1J1NA 1MPCA 3CFZA 1FTOA 4FE8A 2O69A 3CG3A 2XD2A 4KPTA 1M5FA 2DVZA 4GWOA 4IO7A 1FQAA 1B4HA 5I59A 3FJGA 1GR2A 1MM7A 1XOCA 3EN3A 3KJ7A 1SI0A 5DEXA 2XXTA 4G2ZA 3TTMA 2NWJA 4POWA 5BUUA 5AA3A 2ABHA 5I57B 1CB6A 3C32A 2XXHA 5FHMA 2XXYA 3G3HA 5FHNA 4F1UA 3KN3A 5IAIA 3E3KA 4NE4A 3VXBA 1N3WA 1UTBB 4IO2A 3FASA 1MXWA 2HZLA 2F34A 2V3TA 2F7CA 3FD3A 1DTZA 4H67A 3CVGA 1Y1ZA 4F2OA 1PBQA 1ZU0A 1SYIA 1A8FA 1L5TA 2PVUA 5CC2A 3VE1B 1AL3A 2M8CA 1IITA 3G3KA 5EYFA 1S7YA 4IGRA 4I9DA 4ELOA 5I2NB 3VV5A 2I0CA 3VFJA 4IO6A 4KFQA 4KYDA 2XX8A 3SKPA 1P1UA 1D3KA 1I6AA 3PUZE 3O6HA 2UYFA 3LSXA 3HCQA 3U1OA 4E0WA 1H76A 2W7YA 1B1XA 2A5SA 4FECA 1LAXA 3R6UA 4JSOA 1B3HA 2G29A 1MG1A 3O6IA 4LP2B 3PD9A 2UXAA 4ZZAA 2XXPA 2HAUA 4GIZA 5DVJA 4YKPA 1SYHA 1PBPA 3ODBA 3K1PA 3KN7A 2VP1A 2V84A 4NF4B 4NWDA 4EF2A 3K1MA 1R6ZA 3Q29A 5JK4A 4MF3A 4JXIA 3EHUA 3ILUB 5AA2D 2CMOA 5B70A 4FIMA 3QXMA 3L6HA 4XKQA 4OWDA 4H1XA 1DPPA 1IXHA 3PV0E 1N7WA 5EHMA 3IOTA 5TP9B 2XXXA 1PDAA 3MVXA 1US4A 5DT6A 2O7IA 3BFTA 3FV1A 2F5XA 1VE4A 4GOTA 3CFXA 4KD5A 3KZGA 3H6VA 1A40A 4NMYA 1OVBA 3TYHA 3CFLA 4ESXA 1OLCA 2I3VA 1OVTA 2F78A 5CI5A 3EF7A 5AE4A 3H4ZA 5CMMA 4JWOA 3FUZA 4O3AA 1UQWA 3T66A 3G3JA 4ESWA 3IR1A 3T9VA 3K02A 1YAEA 2QMXA 4C0RA 3N26A 2YLNA 1P1WA 4KR5A 3BBRA 1LLSA 3TQLA 3AXFA 2REGA 3S9LC 4KCDA 5CBRA 4IY6A 1SBPA 3TZAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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