1UTHB

Dntr from burkholderia sp. strain dnt in complex with thiocyanate
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
226
structure length
226
Chain Sequence
ALNTLETALTTRDSFDPFASTRTFNLAMTDIGEMYFMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPGAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFSELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN
publication title Development of a Bacterial Biosensor for Nitrotoluenes: The Crystal Structure of the Transcriptional Regulator Dntr
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia sp.
molecule tags Transcription regulation
total genus 58
structure length 226
sequence length 226
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
B PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthB02
1US5A 2DP8A 5CMKA 3IOWA 2DS9A 2QS1A 2XXQA 5HBCA 2VP1A 1QUJA 3CSBA 3EHUA 3IR1A 3VVEA 4R72A 2PYYA 4G68C 3KSXA 4GFRA 3V8XB 3HHGA 3G7WA 4O3CA 1RYXA 1R9LA 1DPEA 3H03A 3VXCA 1YTVA 1B3HA 3JYRA 2Z8FA 3G3HA 1Q35A 1CE2A 4GXAA 3PGFA 4E0XA 3QUJA 2AIXA 4PFWA 1IXCA 3VVFA 2DWAA 2XX9A 5H8HB 2V3UA 1SI1A 2DE4A 5CMCA 2FNCA 4GLIA 5B7DA 1SW4A 3IL1B 4EQ7A 1SYIA 4JBZA 4F3GA 1I6AA 2XXPA 2RC8A 1GV8A 2I49A 4YICA 4H1XA 3O97A 3B6TA 1M5DA 3FASA 1B5JA 2HAUA 1JQFA 2HQ0A 3EHTA 2REJA 4YB7A 3TTLA 4U21A 1ANFA 2H99A 3LSXA 1J1NA 5JTYB 3TODA 4G77A 2D21A 1SD3A 1QULA 3C36A 1IZ1A 3CFZA 1B1XA 4JDFA 4RY1A 1ZMGA 1SYHA 3E4RA 1B4ZA 4ECFA 5TPAB 4G2ZA 4FAJA 1QKAA 3PU5A 2NWJA 3HCQA 3I3VA 5I56B 1A40A 1XS5A 5ITOA 3K1MA 1QUKA 3RQTA 3A3UA 3P7IA 3LBSA 2IEEA 3Q26A 3UIFA 3EQ1A 3QK6A 1DTZA 2CMOA 4QFOA 4DZ1A 3MW0A 3TQWA 4KPTA 3D4CA 1Y20A 4H6DA 1UIUA 3FATA 3VXBA 4ZEKA 2GH9A 1RKMA 4QRZA 2GFEA 1OQHA 3MP1A 4AB5A 3O66A 2RKMA 4Z0IA 2P2AA 5AE4A 4K3FA 5ELVA 3MAMA 4RPOA 5KDTB 1EZOA 5H8FB 4DXCA 2P1SA 3C9HA 4ZEIA 4LZ8A 3PUVE 2DOJA 4NTLA 5I2NB 2RC7A 4ZE9A 1NH8A 2A5TB 1LAGE 4OQOA 3H06B 2IA4A 3H6TA 3N26A 4R6HA 3V89B 3PUZE 3UP9A 2XXWA 1DSNA 4G68A 4DCXA 1URDA 1IITA 2UYEA 3L6HA 4GF8A 4DDDA 3O2AA 3QXMA 4TLLB 4FIMA 4OWDA 1VFDA 1B7HA 4GQOA 2UVHA 4UA8A 1B3LA 3KN7A 4P0GA 5DEXB 1MQGA 4QHQA 3SETA 5ISUA 4OMBA 3HV1A 3HN0A 5HPQA 4RK2A 3AXFA 1B58A 5B70A 1N04A 2V3QA 3OO8A 2Q88A 4G8HA 2FA7A 3BKIB 3OO9A 5IAIA 4FORA 3IB1A 5EHSA 2DVZA 2F7CA 3TKDA 2DXYA 1Y3QA 3MPKA 5DVJA 3H4ZA 3KG2A 1TXFA 4AB6A 5L9SA 3KFMA 1B05A 3RPWA 1RYOA 1SQYA 4R6KA 3IB0A 3TMGA 2OBGA 2Y84A 3PPQA 3DM0A 1MY0A 1Y4CA 2ZNSA 4OFJA 3WAEA 3MQ9A 3IOTA 2O68A 1NNTA 3U93A 1LBBA 1MXWA 1MQIA 2QJEA 2DWIA 3OEMA 4Q8RA 4KI0E 1MH3A 5DVFA 2X7PA 4KYDA 2O7IA 1GTKA 4KHZE 3K6WA 1LAXA 1JETA 1N3XA 2HZKA 2XXHA 3C33A 3PPNA 3L6GA 2O84X 1OIBA 3H7MA 2QSXA 3Q25A 4LQ5A 3CSGA 4N07A 2V25A 2R6GE 4EXLA 2H5YA 2X26A 2FYIA 4NF8A 4F22A 4EF2A 5ICQA 4OESA 4RK9A 4HW8A 4YZZA 3VLVA 3TPAA 1MDQA 3FJGA 1B3EA 4IO6A 1DOTA 4O3AA 1D3KA 2ABHA 1MY4A 5IKBA 1B0HA 3OO6A 3ZKLA 4TOZA 4XTCQ 2O7UA 1HSJA 2AYSA 3PUXE 2HCAA 2GHAA 3OXNA 2I4BA 1A55A 5CBSA 3G3FA 4KD5A 4O3BA 3K1PA 1Z7NE 1MXXA 4IO2A 5TP9A 1LFHA 3BFUA 5K2YA 3H6WA 3PPOA 1S50A 3QIMA 3T9HB 2I48A 1JW5A 2Y7PA 2REGA 3VV5A 1M5CA 1SW1A 3MPLA 1MQJA 4YKJA 4MF3A 4EQ9A 1QJMA 1FTOA 1JW4A 4QSDA 1L5TA 3BBRA 2Z8DA 1LB8A 4P0IA 2F97A 3S9MC 1LBCA 4NF5A 3RLFE 2F34A 2F5XA 1NNFA 2Q9TA 4OZ9A 4ZS9A 5I2KB 3FXQA 4P11A 3UGWA 4ESXA 4NE4A 5H8NB 4ZECA 4BDMA 4IY6A 1FQEA 1MM7A 2RC9A 4NF6A 1ZBMA 3SEWA 3PMXA 4LATA 3K4UA 3S9NC 3QAXA 3TELA 2Q89A 3B7DA 1JW1A 3RN8A 4GL8A 1O63A 4BDNA 3T9XB 1TT1A 3CFLA 3MVZA 4H8IA 4F3BA 1II5A 2YPNA 1LFGA 4Z7EA 3MWBA 4YU0A 3OD7A 1VR5A 3OENA 2B3BA 3I6VA 1NMUA 3N5LA 2XXTA 1FQFA 5AA2B 3RT8A 4Q5TA 4GOTA 3IAZA 1UIVA 2KLFA 4LZ7A 3MJNA 1POY1 1NL5A 2HXWA 1QVSA 2B65A 3JV9A 1Z7ME 5JK4A 3RY3A 3R7XA 1MDP1 3RTWB 1SVXB 4WEPA 2Z22A 3U94A 4OETA 1SW2A 1MH4A 5AA2D 1BTJA 4OHNA 1SBPA 3D4GA 3EHSA 2VHAA 2I0CA 5I57A 1QKBA 4IY5A 4QFPA 1MG1A 4IGTA 2F78A 4Q0CA 3O6IA 3K02A 1N7XA 4GIZA 1O7TA 1B3GA 2XHDA 4OENA 3UN6A 1B6HA 5FTHA 3TCFA 4HS7A 3WAFA 3OO7A 2OLBA 4GVOA 3FVKA 2OWSA 4YB5A 1CB6A 3T9UA 1JNFA 2CZLA 4JXIA 4XKQA 3HSTA 5AA1A 4I8CA 4JWYA 3VLWA 1BKAA 3T93B 4KCDA 4H5GA 4DCYA 4FECA 1MXYA 2HZLA 2Y7IA 2QMXA 3TTMA 3SEVA 1PC3A 4ELPA 4MH5A 2F6GA 5M2VA 4F19A 3FZVA 5ICTA 5AA4A 2O51A 3TFLA 2I3WA 2DQVA 1O64A 4YMBA 1HSLA 3FV1A 2I0BA 4KFQA 5TP9B 3MVYA 4U1ZA 2ONSA 3MP6A 1S9TA 4EQBA 3IJOB 3LSLA 3K2DA 2DWHA 4PFTA 3VVDA 2PX1A 3G3JA 1URGA 1UTBA 5F1QA 2F7AA 3G3IA 5A5XA 1TFDA 4WKMA 5L9MA 1TWYA 3CIJA 2AL5A 4IO3A 2Y7WA 3PD9A 3KN3A 3SKPA 1BIYA 3C34A 3CG1A 3E9XA 1Y3PA 2QS3A 4HCYA 3QYTA 4ZEFA 4JSOA 1P99A 5CI5A 1Y3NA 1R9QA 2OWTA 1LLSA 4LZ5A 4PFUA 5CM6A 4ZZAA 1P1QA 4I1DA 1P1WA 2OK2A 4ZEDA 1QW0A 2LAOA 2D5WA 4NF6B 3SESA 2NOOA 2V3TA 1PBPA 1ZJLA 4R73A 3RUMA 4R2BA 1LGBC 3MC2A 1UTHA 4TLMB 1D9VA 1A7LA 3UK4A 4LUBA 1ZTYA 1LCFA 1B9JA 2DE3A 2VOZA 1WODA 2UVGA 3KGCA 1SW5A 3O28A 4QFNA 4NF4B 1B46A 4PP0A 1XOCA 3OSQA 3IX1A 2F7BA 1NFTA 1Y1ZA 1PB8A 3PMVA 4YB6A 4M4GA 2HFBA 1I69A 2G93A 3FVNA 4I62A 4ONYA 3KN8A 3C32A 1M5FA 3K0VA 2F36A 1URSA 4F31B 4ND9A 1PEBA 3HO7A 4ELOA 4GXSB 3FVOA 3QUFA 1B7UA 4QF9A 5CC2A 3OOAA 3IOVA 1IIWA 2I4CA 3PD8A 3LSFB 5I57B 4EF1A 4F1UA 3U1OA 1MXZA 4G4PA 2XXVA 1Q1KA 2QPQA 5H8HA 2F6PA 4GD5A 4F2OA 4DIGA 1JVXA 2UVJA 3MZ9A 2RCAA 4EDPA 1VSOA 3SERA 2QS4A 3USDA 5ITPA 4PFYA 3SDFA 1T0KA 4OEVA 4H67A 1B1HA 4JWOA 3MVXA 3CRBA 2OZZA 4F39A 4LONB 3CR9A 4X48A 4EUOA 4LA9A 2PVUA 2AL4A 4POXA 1P1UA 4HCWA 4OFLA 5AA4B 5I59A 2F8DA 5HM4B 2M8CA 3KOSA 1MXVA 4R6YA 5LOMA 3LUYA 1B52A 2RINA 5TPAA 2PT1A 1R6ZA 3KEIA 4IO7A 3K6XA 3RTFB 5KCJA 2VGQA 2O1LA 3GXAA 1IXHA 2DWJA 1POTA 3CG3A 1PB7A 1F9BA 5L8DA 4H65A 1A54A 4KR5A 4FEDA 1B4HA 5CRYA 3T22A 1FQDA 1R1NA 2ZYKA 2PBWA 1H44A 1B7ZA 1TFAA 2NXOA 1UTBB 1MS7A 4DXBA 1XC1A 4M1VA 2E0SA 3N6UA 1EZPA 5A5XB 3F11A 2G29A 2NUVA 1M5EA 3PV0E 3E13X 1MXUA 3TDJA 3S4UA 5KDTA 4OVJA 5H8FA 1H45A 3VFJA 3VDFA 2RCBA 3U72A 4H0WA 3HHFA 3MUQA 5EHMA 2QMWA 4G68B 1ATGA 3SEYA 2ZYOA 1XT8A 3CFXA 3TQLA 2ZYMA 3I5OA 4XKPA 3FUZA 4MLQA 3FXRA 4C1TA 3TCGA 3EPEA 3IK6B 1N76A 3S9EA 3N6TA 2R9JA 1VE4A 5H8SA 3GLBA 1D9YA 1MY2A 4NWDA 4AQ4A 4F3SA 1ZIUA 5I84A 4R74A 3RNNA 3E3KA 2GHBA 1UTHB 1WDNA 5DYHA 3VE1B 2H4IA 2RF1A 1USYH 1OVBA 3B6QA 4BDLA 4MFIA 3LR1A 3ODBA 1AIVA 4RXLA 2QS2A 3DP8A 2R71A 2VD2A 3DP4A 2BJJX 1IXIA 4OEUA 4GWOA 4XKRA 4HTGA 3C31A 2XXUA 2D3IA 4XXUA 3K6VA 2Q8JA 4N13A 1EU8A 4C0RA 4U1OA 4RPNA 2UXAA 1MQDA 4U2RA 1NNPA 4RYAA 5JEIA 3T9VA 3S2VA 4IO4A 3OMBA 4IGRA 2XX7A 4LQ2A 1B3FA 1Y9UA 1IXGA 2F35A 3IJXB 4OTEA 1MQHA 1N0TA 3EN3A 3DP6A 3KBRA 1FW0A 3K00A 2Q2CA 3ILUB 3W9WA 1FTMA 1GVCA 2PT2A 1MPCA 3O9PA 4PE5B 2ZNTA 4X1DA 3V83A 1EZ9A 2ESNA 1B40A 4YMAA 3SEUA 1N3WA 3TZAA 3FGSA 4ZEBA 1JEUA 4QSEA 3OSRA 4F1YA 3FV2A 4ELRA 1FQCA 4TQUQ 2THIA 3PPRA 3CVGA 4NF8B 3DELB 5CMMA 3IO6A 1H76A 2XXYA 3M3KA 3OELA 4YKPA 3G3KA 3C4MA 4OXVA 5J1DA 1QUIA 4POWA 1MRPA 3MZBA 3EF7A 4H5FA 1BLFA 2WKYA 4U4XA 2YJPA 4WXJA 1IEJA 1OMPA 1ZU0A 3ILTB 4GL0A 1Y1MA 3LC8A 2H9BA 2YLNA 1I6BA 4G8MA 5I59B 3QSLA 1WVJA 2V93A 4PETA 3TUSA 3T96B 1ELJA 2XD2A 1PBQA 1FCKA 4YAHX 2H98A 3A3CA 3U8QA 3DLNA 5KCJB 2Q2AA 2Y7RA 5CMBA 3KZGA 3S9LC 4ZZEA 1P1NA 3N94A 3ECRA 3MBPA 4MLVA 1H3DA 2E1SA 1HSEA 3G3GA 1YCJA 4PQJA 4QFLA 5EYFA 1B32A 1SI0A 5H8QA 3TTKA 2QRYA 1OQGA 5BWJA 1FQBA 3M3FA 3MVWA 3PPPA 4QSCA 4XKNA 3H6VA 3R6UA 4UACA 4MBPA 3KJ7A 4NF5B 1BP5A 3RGYA 4ISUA 3IO4A 4E0WA 4KCCA 3W9VA 4XIGQ 4BLAA 1MY1A 5TU0A 3Q28A 5FHNA 1UQWA 5I2KA 2DSFA 4LVQA 2GRVA 1MPBA 3CI8A 3MP8A 3FJMA 4ZE8A 2H25A 5H8NA 3T66A 3TTRA 2ONKE 3PMWA 4N6PA 1DTGA 1JEVA 2O6AA 3MZ1A 1MY3A 3K01A 1IQ7A 4RNSA 3M3LA 3PUYE 4YKKA 2ALUA 4R9FA 4EXKA 5I58A 1AOVA 1NNKA 1H43A 4DXUA 1LAFE 1GGGA 4F29A 5DTBA 1KWHA 4RA1A 3FD3A 3IOUA 1FTKA 1OVTA 5AA2A 2QL3A 2B3FA 2NVUB 4THIA 4KYEA 1S7YA 4FEBA 1XVYA 1B51A 3GZGA 2ANJA 1GR2A 5FTIA 2UVIA 4BDQA 4U22A 2XXXA 4DE8A 3RT6B 4H8JA 3GBAA 3IB2A 4RJZA 2VD3A 2I3VA 2Z8EA 5CBRA 4NEDA 1OLCA 4U4SA 4KYSA 1PDAA 1OLAA 1FQAA 2HAVA 1YPNA 5L9OA 5FHMA 1NH7A 2OJTA 2HEUA 2A5SA 3OEKA 1A8FA 4JB7A 3B6WA 4F2QA 3Q29A 3JZJA 1SDXA 4FJPA 3TYHA 2XX8A 3TAJA 1D4NA 3HPIA 4NMYA 4G8NA 3BFTA 3UA8A 1ZLQA 5BUUA 4LP2B 1FTJA 3TCHA 1P1OA 4Q30B 2Z23A 3K1NA 4ZDMA 3FIRA 3PUWE 5F7VA 1N84A 4ELQA 1A99A 3ZS6A 2OCUA 5KZTA 2I6EA 4JSDA 2I58A 2P0SA 5JTYA 4YKIA 3FJ7A 1JVYA 1LCTA 3UORA 1LB9A 4F3PA 1M5BA 2XXIA 1MM6A 2ZYNA 1USYE 1YAEA 3V5AA 5FHOA 1US4A 2PMSA 1IUDA 4C1UA 5AA3A 4NWCA 4L17A 4R2FA 4FE8A 1DMBA 3KSJA 3O29A 3U92A 3H3GA 5I56A 4OFOA 3KOTA 1B5IA 3ONMA 4R75A 1ZKBA 1LFIA 3R26A 2V84A 3VLUA 1AL3A 3FVGA 4ESWA 4X9TA 4FATA 3H6UA 3M8UA 4KQPA 4GRKA 5DVIA 1EH3A 5DT6A 3SEXA 2DXRA 2ZXTA 2ZNUA 3C35A 4OYVA 4IB2A 4F1VA 1MPDA 5H8QB 4WEDA 4U23A 4BDRA 4DLDA 3KJTA 3ZSFA 3Q27A 3TEPA 2Y7KA 2O1MA 3GBBA 1I6QA 4OERA 1DPPA 2DYXA 3W15C 3A09A 1B5HA 2XXRA 5I2NA 3FXUA 2A5TA 3THIA 1B2HA 2X7QA 1NKXA 4QFKA 4X1BA 1FTLA 1Y4TA 2O69A 3ZKKA 2ONRA 2DVCA 1AMFA 1XVXA 4BDOA 1N7WA 2W7YA 2UYFA 1B0LA 3K6UA 1LAHE 4I9DA 2ZMBA 1PB9A 2DE2A 3IORA 1VFEA 1AH5A 5DEXA 3LSWA 1XHYA 1LSTA 4IO5A 4JWXA 4F18A 3TTNA 4R9GA 5K2XA 5I58B 3O6HA 1A8EA 2XD3A 4NF4A 3O6GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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