4X48A

Crystal structure of glur2 ligand-binding core
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title The Discovery and Characterization of the alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic Acid (AMPA) Receptor Potentiator N-{(3S,4S)-4-[4-(5-Cyano-2-thienyl)phenoxy]tetrahydrofuran-3-yl}propane-2-sulfonamide (PF-04958242).
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4x48A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4x48A02
4KI0E 1FW0A 3TTRA 2I6EA 3ILUB 3VLUA 1BLFA 1A8EA 3HPIA 1NFTA 2Y7KA 4IO3A 2RCBA 5A5XA 2A5TA 3OEMA 4ZEFA 3LSWA 1YAEA 3CFZA 3MP6A 3U94A 4KQPA 3TTNA 1R1NA 4MBPA 3OO6A 3V83A 3LUYA 4R6HA 1IXGA 3KJ7A 1URSA 1DMBA 3CRBA 4X1BA 5JEIA 4G68C 4DZ1A 1JVYA 4G77A 5DVIA 3TEPA 5I57A 3PMWA 1USYE 1MM7A 2I3WA 3FVGA 2DQVA 2VD2A 1VFEA 3A3CA 3S4UA 1SI0A 2DWHA 1FTOA 4QFOA 4H67A 3U8QA 4HCWA 2V93A 5L8DA 4DCXA 3T9UA 5DVJA 5BWJA 3ZKKA 4LVQA 4NEDA 3SKPA 1PBQA 2HXWA 3DP4A 3VVFA 1MXVA 2GH9A 2OK2A 4KD5A 3Q26A 2F6GA 1N7WA 1FCKA 3MZ1A 5LOMA 3VXCA 3QUFA 5CBSA 3A3UA 2PT2A 3FASA 1LAXA 1N3WA 5TPAA 1EU8A 3V5AA 3FIRA 1B4ZA 1N76A 1P1NA 3K1PA 3S9MC 1LSTA 1L5TA 5ICQA 2BJJX 1R9QA 2I0BA 2O6AA 1MQHA 4NWCA 5ITOA 3IOVA 2F78A 3N6TA 1AH5A 3OXNA 4F3SA 1JVXA 3SEVA 2XXTA 2YPNA 3MJNA 3HN0A 1B32A 1USYH 4DDDA 1MXYA 3JZJA 1YTVA 2DOJA 4FAJA 4OFJA 1M5DA 1HSJA 4NF4B 1PB7A 2OZZA 5I58B 1CB6A 2DVCA 4F1VA 4GL0A 2O7IA 3RTFB 5H8QA 5H8NB 3S9EA 4I8CA 2Q8JA 5L9MA 1GVCA 5I59A 1FQAA 2P1SA 5H8HB 4JWOA 4GQOA 5CMBA 4H5FA 2ZNUA 4R9FA 2QL3A 3A09A 1QW0A 1BKAA 4XKNA 3FVNA 4FEBA 1SVXB 1B0LA 5AA2A 3V8XB 2VP1A 1H45A 4U1OA 1IXIA 3RQTA 3TTLA 4YAHX 1QVSA 2DWIA 4YB6A 3K00A 3EPEA 3TTMA 3O29A 3UK4A 3FXUA 1SD3A 5CRYA 1QULA 3M3FA 2DP8A 4Z0IA 5K2XA 4YKKA 3RT8A 3TZAA 1LAHE 1UTHB 2YLNA 1GTKA 3LR1A 3B7DA 3CFXA 3TTKA 3W15C 3FV2A 2X26A 5EHMA 3FV1A 1H43A 1MXZA 4TOZA 1OQGA 4F19A 2XHDA 1MM6A 1B3HA 4NF6A 4F31B 4ELQA 3JV9A 1XC1A 5HBCA 2V25A 4OFOA 3LSLA 4BDOA 4ZEBA 1P1WA 1B5JA 2O7UA 3OO9A 3OMBA 2ZNSA 1B1XA 1DSNA 1POTA 3MAMA 4ECFA 4EXKA 3FXRA 3L6GA 3MP8A 4Q30B 3M8UA 3DP8A 4EQ7A 1FTMA 5H8QB 1TXFA 1S7YA 1B0HA 3EN3A 3UP9A 5TP9A 1QUIA 4RK9A 3OO7A 3MWBA 2DXYA 1BTJA 5TU0A 3T9VA 4IY6A 4RYAA 2FYIA 3MVXA 1DTZA 3I6VA 1B7HA 4AB6A 3FJMA 4JB7A 4FJPA 2Y7PA 2THIA 4NMYA 1BIYA 1B3LA 2XXYA 3TCGA 4EF1A 4RK2A 4NWDA 3SERA 4P0GA 4YKPA 5CMKA 4C0RA 3U93A 4GRKA 3VV5A 4OXVA 4NF8A 3F11A 1URDA 3QIMA 2V3QA 2H25A 1NH8A 5AA2D 2ZYOA 4JBZA 1M5BA 5DYHA 1YCJA 3H6WA 5M2VA 3FJ7A 3KOTA 4G8HA 3FVOA 4LQ5A 1GR2A 3SEXA 4F1YA 3G3GA 1EH3A 3IR1A 3BKIB 2UVGA 3IB0A 1IITA 4JSDA 3C36A 1TWYA 5AA1A 3KEIA 2HZKA 2DE2A 4OENA 4G4PA 1RYXA 4H0WA 3C32A 5JTYB 1NMUA 1AL3A 4H5GA 4BDRA 1Z7NE 3MZBA 3ILTB 2AL5A 2PYYA 3N94A 2R6GE 5ISUA 4KCDA 4R75A 1TT1A 3KG2A 3LSFB 3B6WA 2ZMBA 1PBPA 4IGTA 2F97A 1O64A 4X1DA 3O6HA 4C1TA 1IXCA 1FQEA 4N6PA 4GIZA 4IO7A 2H5YA 2A5SA 2Z8DA 4TQUQ 2R71A 1EZOA 4ZZAA 1Y3NA 1A8FA 4BDMA 4Q0CA 4X48A 5FTHA 4RA1A 4HS7A 2UVIA 4IY5A 3U1OA 1B3FA 2LAOA 1B4HA 1POY1 1MXXA 5CM6A 1D3KA 1SQYA 5IKBA 4POWA 1ZJLA 4AQ4A 1DTGA 1PDAA 3EQ1A 2V3UA 1ZIUA 1RKMA 3HO7A 4G68B 1H44A 3TELA 3PU5A 1ZLQA 4E0WA 2XXUA 2XXIA 3V89B 4XKQA 3KSXA 1LCTA 4H8JA 1M5FA 4QHQA 2DSFA 1P99A 3CFLA 3OD7A 4F2QA 3QSLA 4NF4A 2HFBA 1MY2A 3PUZE 5I58A 2O69A 3T9HB 5I84A 1B2HA 3K1MA 5H8NA 5CMCA 4DE8A 4P0IA 2F8DA 3EHUA 3VVEA 1MXUA 1PB9A 4MH5A 1QUJA 2I48A 3KGCA 5H8HA 4U4SA 3MVWA 4R6KA 1M5EA 3SDFA 2VOZA 1OVTA 4OZ9A 4ELOA 3K6WA 2XX8A 5EHSA 3JYRA 4ISUA 1XT8A 4RNSA 1WODA 4EUOA 4PFUA 4YZZA 4YMAA 3D4GA 3GBAA 3O2AA 4BDLA 2QSXA 2RINA 4X9TA 1SBPA 2NOOA 2GRVA 3QYTA 2B3FA 5CBRA 3Q28A 3M3LA 3USDA 4BDNA 3T22A 1B05A 3T9XB 3L6HA 2DWAA 4R74A 3G3JA 3QXMA 2I4CA 4YKIA 2RKMA 3W9VA 1URGA 1MQIA 1UTHA 4U23A 1MDQA 3SEWA 4OETA 2GHAA 5IAIA 2UYEA 2OLBA 3DP6A 3OEKA 4WEPA 4OHNA 3N5LA 2F5XA 1OLCA 3T66A 4FIMA 2AL4A 1VR5A 4ZE8A 4FECA 4QFKA 3HHFA 4GVOA 1B3GA 3MBPA 4OESA 1MY3A 3OO8A 3K6XA 4KCCA 4U4XA 4K3FA 2HAUA 3K1NA 4F3GA 4TLMB 2ZYNA 3D4CA 5B7DA 3IB2A 5H8FB 5FTIA 2Y7RA 3H06B 3KN7A 1M5CA 2OBGA 3G3FA 3FJGA 5I2KB 1FTJA 1A40A 5I56B 1UIVA 2Z22A 1JETA 4GXAA 1PC3A 4LONB 4LZ5A 1Q35A 4UA8A 4M4GA 4RPNA 3FGSA 1SI1A 4KFQA 3O97A 5CC2A 2D3IA 1ZU0A 3QK6A 2IA4A 1NNKA 1O7TA 2ZNTA 4N07A 4FORA 4RXLA 3ZSFA 2UVJA 3LC8A 4F2OA 1N3XA 5DVFA 1A7LA 1MY1A 4LA9A 3FXQA 1ZKBA 2PMSA 1FQBA 3OENA 1B7ZA 4ZEIA 4OEUA 4H8IA 1MQJA 3GZGA 1I69A 2VD3A 5I2NB 3CG3A 3R7XA 4R72A 3TODA 1XS5A 3T93B 4JXIA 3TQWA 1Y9UA 4PQJA 2I58A 4ZECA 4L17A 5B70A 5K2YA 5JTYA 1NNPA 5KZTA 4JDFA 2ANJA 1JEUA 2ABHA 3FUZA 4IO2A 1LLSA 3CI8A 4DCYA 4EXLA 1IXHA 3AXFA 2QS3A 4GLIA 1LCFA 4KPTA 5FHOA 4KHZE 4OFLA 2G29A 4Q5TA 3K6VA 4MLQA 2REJA 2ONKE 1LB8A 4QSCA 1UQWA 4XXUA 1VFDA 2RC8A 4YMBA 3PPRA 1Y4TA 4BDQA 4GXSB 1MRPA 1MPCA 2RF1A 3IL1B 2VHAA 3IB1A 3CSGA 1MXWA 1ZBMA 1XVYA 4QF9A 1VSOA 4UACA 1A99A 5DTBA 5AA4B 3OSRA 5F7VA 3TUSA 2YJPA 3IOTA 3MP1A 3LBSA 2I49A 5AE4A 3U72A 4WXJA 2DXRA 2O1LA 2XX7A 1OMPA 3TKDA 2HAVA 2QS1A 2XXHA 4XIGQ 4GFRA 4U22A 1B7UA 1JQFA 3VFJA 3TCFA 4ZZEA 2DE4A 1US5A 4G68A 4TLLB 2KLFA 1WVJA 3EHTA 4F39A 4O3BA 3M3KA 3MZ9A 3MVYA 2H9BA 4LZ8A 3VVDA 2Z8EA 2HEUA 3HV1A 3ODBA 1A55A 2E1SA 2XXWA 3IO6A 2XXXA 1B52A 2QMWA 3KN3A 4DXUA 4DIGA 2QPQA 3IOWA 4O3CA 1VE4A 2AYSA 1HSLA 3PMVA 1OLAA 2Z8FA 4YKJA 3ECRA 2QJEA 4ZEDA 3KJTA 1OVBA 3MPLA 2P2AA 1QJMA 2ZYKA 3TMGA 1MY4A 1S50A 1B1HA 1FTKA 4OERA 4ZE9A 3KN8A 4EQBA 2GFEA 3IOUA 1EZ9A 1SW5A 3QUJA 2DVZA 3C9HA 1Y1ZA 1SW1A 3N26A 3RPWA 1N7XA 4YICA 1B9JA 5FHMA 3RN8A 3C35A 5EYFA 3OSQA 1DPPA 4MFIA 3RY3A 1O63A 2F7CA 2ONSA 4IB2A 3U92A 1IUDA 4OYVA 4GL8A 2Z23A 3HCQA 4N13A 4JWXA 2QMXA 3IORA 1IEJA 1Z7ME 4GOTA 1Y3PA 1SDXA 3IO4A 5AA3A 4IO6A 4EQ9A 3MQ9A 1ELJA 4JWYA 5DEXB 4ONYA 2WKYA 3SESA 2HZLA 2Q89A 3IK6B 3UIFA 1MS7A 4ESXA 3VDFA 4DXCA 3RGYA 4PFYA 4OMBA 2Q2CA 1UTBA 1Y1MA 1OIBA 3H6TA 3PUVE 4C1UA 1LB9A 3E13X 3PGFA 3TCHA 3MW0A 4GF8A 3RLFE 2Q9TA 2DE3A 1FQCA 3W9WA 2OWSA 1LGBC 4U21A 3K02A 4LUBA 5KCJB 3UA8A 4I9DA 4OEVA 3H3GA 3I5OA 5H8FA 2XXVA 1N84A 2H98A 3QAXA 1LBCA 1BP5A 3G7WA 3C33A 4FEDA 2XD2A 1S9TA 3IAZA 1MH3A 3IX1A 5I2KA 4HCYA 2UVHA 5I56A 3KFMA 1D9VA 2NUVA 3C4MA 5H8SA 4YU0A 3H4ZA 1Q1KA 2O1MA 2F7BA 1NNFA 4F18A 2I0CA 1JNFA 3FD3A 2AIXA 1OQHA 2RCAA 1QUKA 3E4RA 2H4IA 3CIJA 3KSJA 4YB7A 1SYHA 1MQGA 4POXA 1JEVA 1LFGA 3PUYE 4QFNA 4KYEA 3TAJA 2HCAA 3EHSA 1A54A 4ZEKA 1P1UA 4G8NA 3PD8A 2XXPA 1ZTYA 5KDTB 4R2FA 3TDJA 1B6HA 1EZPA 2B65A 3MUQA 3VLWA 3TFLA 3VLVA 4NTLA 3B6QA 1YPNA 4QSEA 2F34A 3CSBA 5F1QA 1HSEA 3PPPA 4GD5A 1D4NA 3RNNA 5I2NA 3S2VA 4IO5A 1J1NA 4ND9A 3PD9A 4PFTA 1F9BA 2Q88A 4NF5B 3O9PA 1UTBB 2Q2AA 3BFTA 3K2DA 1Y20A 3CVGA 2ALUA 2ZYMA 1B40A 1H76A 3N6UA 4KR5A 2XXRA 1TFAA 1SW2A 4EF2A 1MPDA 3RUMA 2V3TA 3ONMA 3Q29A 3IJOB 3O6GA 1PEBA 3Q27A 1I6QA 3C31A 1IIWA 2I4BA 2O84X 2PX1A 2DS9A 3H6VA 2XXQA 1LBBA 4RJZA 4QFPA 4HW8A 2Y7WA 5A5XB 2A5TB 4KYSA 2REGA 3DM0A 4ELPA 3RTWB 4PE5B 4G2ZA 1JW1A 2Y84A 2QS4A 2VGQA 1DPEA 4PFWA 4F1UA 2ESNA 3ZS6A 1FQDA 2NWJA 2X7PA 1P1QA 3OOAA 5CMMA 3O6IA 4ELRA 4PP0A 1B5HA 4IO4A 4I1DA 3G3IA 1P1OA 3WAFA 3R26A 4THIA 3GBBA 4WEDA 4R2BA 5AA4A 3KOSA 3UORA 4R6YA 5I57B 1R6ZA 3THIA 4YB5A 2B3BA 2M8CA 3MVZA 3H03A 3PMXA 3PUXE 4MLVA 3GXAA 1US4A 1NH7A 1XVXA 2NXOA 4EDPA 4F3BA 2QS2A 4Z7EA 3O28A 3DLNA 1ANFA 2FA7A 2G93A 4XKRA 3HSTA 3K0VA 5ITPA 5TPAB 3RT6B 3WAEA 1R9LA 2H99A 3T96B 2F6PA 1SW4A 2NVUB 3KZGA 3BBRA 3FVKA 3S9LC 4LQ2A 1N04A 2D5WA 4OTEA 3R6UA 2OWTA 2GHBA 5HM4B 4DXBA 4RY1A 3G3KA 1LFHA 1ATGA 2IEEA 2W7YA 5DT6A 3SEYA 1AOVA 3UGWA 3K4UA 1AIVA 4FE8A 1B58A 3TQLA 1UIUA 2QRYA 1B5IA 3GLBA 2FNCA 1B51A 5I59B 5FHNA 1FTLA 2CMOA 3PPNA 1QKAA 2F36A 1I6BA 1RYOA 1MPBA 4DLDA 2P0SA 4GWOA 5AA2B 4ZDMA 4HTGA 1Y4CA 1Y3QA 1LAGE 1GGGA 1I6AA 2PVUA 1QKBA 4RPOA 5HPQA 2OCUA 2D21A 3SEUA 4XKPA 3I3VA 4OVJA 1AMFA 1B3EA 1NNTA 2Y7IA 5DEXA 3MPKA 3FZVA 2PT1A 3H7MA 2XX9A 1XHYA 5ICTA 4LATA 4MF3A 4H1XA 3EF7A 3Q25A 3B6TA 3UN6A 5L9SA 2RC7A 3IJXB 1JW5A 2DYXA 3P7IA 5CI5A 2CZLA 4QRZA 1DOTA 1MG1A 1B46A 4OWDA 2UYFA 1NKXA 3FATA 4Q8RA 4QFLA 4ESWA 5KCJA 4NF6B 4FATA 3MC2A 2R9JA 4OQOA 5JK4A 3PPOA 3CR9A 4XTCQ 1D9YA 3C34A 2DWJA 4O3AA 2HQ0A 1KWHA 3SETA 5L9OA 2I3VA 3O66A 4KYDA 3BFUA 3S9NC 4JSOA 4R9GA 3DELB 4NE4A 2ONRA 4LZ7A 2PBWA 1NL5A 5BUUA 1MQDA 4IGRA 5ELVA 1GV8A 1MY0A 1TFDA 4ZS9A 4P11A 3HHGA 3PUWE 5TP9B 4AB5A 1IQ7A 2O68A 3PPQA 4E0XA 4PETA 4F29A 3H6UA 4U1ZA 2F35A 3KBRA 1WDNA 1IZ1A 2OJTA 2XD3A 4QSDA 2O51A 3ZKLA 4R73A 3E3KA 1FQFA 2UXAA 5KDTA 4BLAA 1MDP1 3TPAA 1II5A 1PB8A 4I62A 1H3DA 4F3PA 4NF8B 3CG1A 4LP2B 3G3HA 2RC9A 2V84A 1MH4A 1LAFE 1CE2A 1N0TA 1ZMGA 4WKMA 3VE1B 4NF5A 3LSXA 3PV0E 3K6UA 3K01A 4U2RA 3TYHA 1LFIA 4H65A 3OELA 4G8MA 1JW4A 2E0SA 3VXBA 2ZXTA 3E9XA 4M1VA 1SYIA 1XOCA 2X7QA 5J1DA 1T0KA 4H6DA 2F7AA 4F22A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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