4YU0A

Crystal structure of a tetramer of glua2 tr mutant ligand binding domains bound with glutamate at 1.26 angstrom resolution
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYITQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWRDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of the tetrameric GluA2 ligand-binding domain in complex with glutamate at 1.26 Angstroms resolution
rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 90
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4yu0A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4yu0A02
2XHDA 4EQBA 3KSXA 3QAXA 4R72A 4U23A 5I57A 3QSLA 1NNPA 3H6TA 5FTIA 3BBRA 5TP9B 4QSCA 3ZS6A 3KBRA 1R1NA 1FQDA 3P7IA 3TAJA 4OESA 5AE4A 1YCJA 3KSJA 3QYTA 4F39A 3OEKA 3UN6A 4YB6A 3LUYA 3QUJA 4U1ZA 3V5AA 3Q25A 1AOVA 4NEDA 1B58A 2B3BA 4OZ9A 2QL3A 3HHGA 1UQWA 4RPOA 4KCCA 4OVJA 1A7LA 4ZE8A 4EUOA 1F9BA 4ECFA 1IXGA 5K2YA 2VHAA 3KJTA 4NF4A 2Q89A 3S2VA 4ELOA 2Y7WA 1QJMA 3CG3A 3OD7A 2DE4A 2YPNA 5JEIA 4X48A 4NF5A 3RLFE 3WAFA 2REGA 3EF7A 5DEXA 2F35A 1XVYA 3C9HA 4AB6A 4LZ7A 3MUQA 1P1UA 2VP1A 3ZKKA 1B1XA 2UVGA 3PV0E 2AIXA 5BWJA 3O6HA 3MZ9A 1D9YA 1Y4CA 1A8EA 3C32A 4R6HA 5TU0A 4P0IA 1JW4A 4UA8A 3PPNA 4EQ9A 1EZOA 1URDA 4DIGA 2HQ0A 3GBBA 4XIGQ 3VVEA 2O7IA 2R9JA 4RPNA 4PETA 3MBPA 4FEDA 2F6GA 3VLUA 1PBPA 5CI5A 3RGYA 4GFRA 2I58A 3U92A 3K2DA 3PMVA 4R6KA 3HV1A 4YKPA 4WXJA 1QKBA 3LSLA 2ZNSA 2OZZA 2M8CA 3CR9A 3M3LA 2ZYNA 3FJMA 1LAGE 3FASA 3K1MA 5AA4B 4Q30B 4F2QA 1XVXA 5B70A 1JW5A 2WKYA 4IO4A 2I48A 3IB2A 4F2OA 3I6VA 4NMYA 1TFDA 5CMBA 5I56B 1EZ9A 4OEUA 3S9NC 2XXIA 3T66A 2XXYA 1B05A 1MY2A 1II5A 2OBGA 5I57B 3GXAA 2F7AA 4F3GA 4NWCA 1ZIUA 1NNFA 1B5IA 2QS2A 1B0HA 3SEYA 2V3QA 2Z22A 4BDMA 1PBQA 3A3CA 4HTGA 4AB5A 2DXRA 3ZSFA 1FCKA 4R75A 1A8FA 1P1WA 3RTFB 4IO6A 1POY1 2Q9TA 1SI0A 5KCJB 4PFTA 1TWYA 3IO6A 2PT1A 1HSEA 2Y7RA 1YAEA 1MQDA 1IXHA 3FVKA 4EF1A 1LBCA 2D5WA 3GBAA 4N13A 1SW2A 1MXWA 4GD5A 1FTLA 1POTA 1QUJA 4FE8A 3EHTA 4F1YA 1AL3A 1NH7A 4O3CA 3RPWA 3A3UA 1Q35A 3UK4A 5CBSA 4YMAA 1B9JA 1DMBA 1MY0A 4NF5B 5CC2A 1IZ1A 1ELJA 4LQ5A 1MPBA 1LGBC 1S7YA 1Y4TA 2O7UA 4NWDA 2NVUB 1M5DA 4TQUQ 1B7HA 3I3VA 4KD5A 1RKMA 4JWYA 1UTHA 3IAZA 3IK6B 3UORA 3MP8A 4H6DA 3ONMA 4RXLA 3DLNA 3T9HB 5I58A 4POWA 1VR5A 4U1OA 3MW0A 3FIRA 3N6TA 4HCYA 2OK2A 4DCYA 5ITPA 2RC9A 5EYFA 2HCAA 4QSDA 5I2KA 4IO3A 5ISUA 2V3TA 3TCGA 3T93B 3G3JA 1SW4A 2ALUA 4JWOA 4ESXA 4GXAA 5A5XA 2DWJA 5AA2A 3VVFA 5FTHA 3RT6B 2O6AA 1D4NA 4XTCQ 2XXTA 2KLFA 3B7DA 1QW0A 1Q1KA 3TUSA 3VV5A 1HSLA 1R9QA 2Z8DA 1EH3A 4LATA 4ELRA 4QF9A 1B51A 1DSNA 1LB9A 2I0BA 3S9EA 3EN3A 3VXBA 1GR2A 5I59A 1MQJA 5AA2D 3QIMA 2NWJA 3KFMA 1ZKBA 4Q5TA 2ZNTA 4GXSB 4ISUA 4R2FA 1SQYA 4LUBA 3EQ1A 2I3VA 3OEMA 1IXIA 1OVBA 2PYYA 4WEPA 4OERA 3S9MC 1LFHA 5BUUA 3AXFA 1URGA 3Q28A 2I4BA 4JXIA 1MDQA 3VVDA 1B4HA 4P11A 1B1HA 5L9SA 3IX1A 4DZ1A 2XXWA 4QFNA 3U8QA 2Y84A 3G3GA 1Z7ME 4R9FA 4G77A 1H43A 1XHYA 3LC8A 2ZMBA 1I6BA 5HM4B 3OSQA 1JVYA 4RK9A 3RTWB 4JSDA 1MY4A 4O3AA 3W9WA 2A5TB 3TYHA 4KPTA 5L8DA 3VE1B 5I84A 3TFLA 2Q2CA 2DXYA 1QKAA 1L5TA 4ZS9A 3ODBA 5M2VA 3TCHA 2E0SA 3G7WA 1O64A 3KN3A 1B3GA 2ZYOA 1LBBA 4OFLA 3H6VA 4LONB 4U4SA 3SDFA 3TMGA 4IO7A 2I6EA 3IB1A 1HSJA 4LA9A 3K6VA 2V84A 3WAEA 3N94A 4FATA 4I9DA 3TCFA 3JYRA 3PPQA 5JTYB 1Y20A 4QFKA 1IEJA 3SEUA 4KYDA 4YKKA 2DE2A 1BTJA 4OFJA 2UVJA 3C35A 5F1QA 2G29A 2XXVA 1JEUA 3CRBA 3VLVA 4E0XA 2B3FA 2H4IA 3OO9A 5HBCA 1M5BA 1R9LA 3KOTA 2ONKE 5FHOA 1KWHA 1WDNA 1Y3QA 5I2KB 1B32A 3MVXA 1OQGA 4X1BA 3MVWA 4KR5A 4NE4A 3I5OA 2QRYA 5A5XB 5AA2B 3CI8A 4H1XA 1ZTYA 1P1QA 1OMPA 3E13X 3FZVA 1SBPA 5ITOA 3E4RA 3RQTA 3KN7A 2GH9A 3QUFA 1MY1A 3O6GA 5TPAB 2XX7A 4PP0A 1AH5A 4LP2B 1EU8A 3C4MA 3TTLA 1BKAA 1DPEA 1P1OA 3KOSA 2O51A 3OSRA 1Y1ZA 2RCBA 3LR1A 2QS4A 1B5HA 4QSEA 3FJ7A 1O7TA 2XXQA 4QHQA 3MC2A 4YZZA 2NUVA 3U93A 3FVGA 1LCTA 4YB7A 2ZNUA 2Z8FA 3IOWA 3FV2A 4OTEA 1TT1A 1DPPA 1B2HA 2P2AA 4EQ7A 3PUWE 4Q0CA 3N6UA 4IO5A 5CMKA 3A09A 1B7ZA 5H8FA 3ZKLA 1MG1A 4PFUA 4ZEKA 3ECRA 3IOUA 1VE4A 2QPQA 3UGWA 2V93A 3FV1A 2YLNA 3FATA 3U94A 1QUKA 1B3LA 2F7CA 3MQ9A 4ZEDA 4JBZA 4O3BA 4DLDA 2DQVA 4H5GA 1A54A 1MXUA 3TEPA 1LAFE 3W15C 2XX9A 3OMBA 3MVYA 4XKQA 1JNFA 4IGTA 3K01A 3OENA 3H4ZA 4G2ZA 5B7DA 1Z7NE 3PD8A 1B3EA 3L6HA 4F19A 1QULA 4HS7A 4OHNA 4NTLA 3MJNA 2VD3A 3CFZA 2O1MA 5KDTA 4G68C 3B6TA 4OFOA 3TPAA 2HXWA 1PC3A 5H8QA 1N7WA 3ILTB 1MM7A 1H76A 3HPIA 4IGRA 3O9PA 4DXUA 3M3FA 1CE2A 1NMUA 1US4A 3TQWA 2G93A 1TXFA 4G68A 4I8CA 2HAVA 1I6QA 4TLLB 5DVFA 2P0SA 2D3IA 5EHSA 3R6UA 5EHMA 4DE8A 2VGQA 4IB2A 1JQFA 4M1VA 2FA7A 2AL5A 5H8HA 3O97A 1ANFA 2XD3A 1DTZA 4RY1A 1FTMA 2GRVA 4XKPA 3FXUA 4BDRA 4NF4B 4Q8RA 3V8XB 5CBRA 1D9VA 4R2BA 5H8NA 1J1NA 4PQJA 4NF6A 3PPOA 3MAMA 4X9TA 3V89B 2ESNA 3M8UA 2R71A 3RY3A 2HFBA 5L9MA 3OELA 1YTVA 3BFUA 4ONYA 4WKMA 3H6WA 4YU0A 2RC7A 3OO7A 2UXAA 5DEXB 1WODA 2F36A 4MF3A 2RC8A 4ZDMA 1USYH 5IKBA 2IEEA 3HSTA 4BDOA 4IO2A 1MXYA 2REJA 2CMOA 2Q88A 4YICA 2PMSA 3PGFA 1GTKA 3MZ1A 1UTBA 4LZ8A 1Y1MA 5H8FB 4BDLA 2HZKA 3T9XB 3QXMA 2XXXA 3C34A 3CSGA 4GQOA 4U2RA 4K3FA 4JSOA 1LFIA 4RJZA 3IOVA 1FQEA 1MH4A 3CSBA 5J1DA 3FJGA 1NL5A 4OYVA 2XXUA 5CRYA 2P1SA 3H6UA 3TKDA 3PUZE 1LSTA 1MPCA 3DP6A 3MP1A 1SDXA 2I4CA 4YMBA 2OWTA 4LVQA 1Y9UA 3DP8A 1I69A 1MRPA 1MH3A 1SD3A 4THIA 4ZEIA 2Y7PA 3E3KA 1S9TA 2DVCA 1FQBA 4MH5A 3N5LA 1JEVA 4UACA 1US5A 1OVTA 4G8MA 2RKMA 2H98A 3Q29A 5DTBA 2W7YA 3TTKA 2O1LA 3C33A 1LFGA 4H65A 5H8QB 2V3UA 4C0RA 1N76A 3HO7A 4H8IA 1ZU0A 2XD2A 4FAJA 3SEWA 2ONSA 4JWXA 1ZLQA 1PB7A 4GF8A 5I2NA 2HAUA 4G68B 3K00A 2I3WA 3R7XA 3D4GA 3V83A 1N3WA 3SKPA 5CMMA 4EXLA 2DYXA 1LAHE 3UP9A 5AA3A 4YB5A 3Q27A 4GL8A 1YPNA 1ZBMA 1VFEA 3C36A 1GGGA 3PMXA 2UYEA 2H99A 4F31B 5DYHA 4N6PA 1FQCA 1FTKA 5KZTA 3IR1A 3FXRA 1M5EA 1B7UA 1M5CA 1XC1A 1ZJLA 3VLWA 1Y3NA 1IITA 2UVHA 3O2AA 4OQOA 3GLBA 3PPRA 4U21A 4RYAA 1VFDA 4C1TA 1SYHA 5FHNA 1PB8A 2F78A 2XXHA 3TZAA 3U72A 3FVNA 3O29A 3Q26A 3K6WA 4ESWA 1AIVA 1P1NA 1H3DA 2XX8A 3DP4A 4R73A 4R9GA 1ZMGA 2ABHA 1NNKA 2GFEA 3VFJA 1UTHB 1MS7A 1P99A 2Y7IA 4ND9A 2Y7KA 3TELA 1B6HA 4FIMA 3QK6A 3EHUA 4ZZEA 2AL4A 3USDA 5I58B 3MPLA 3TTRA 1A99A 4JDFA 1PB9A 2DWAA 3H7MA 4MLQA 1B4ZA 3T22A 1B5JA 4OMBA 1UIVA 1OLCA 3F11A 3O66A 4YKIA 3KJ7A 4G8NA 4F22A 2NXOA 2DVZA 3K1NA 3PUYE 5IAIA 5KCJA 2OLBA 1JETA 3HN0A 3DM0A 4Z7EA 2THIA 4KCDA 3L6GA 4BDNA 2RCAA 1DTGA 4GWOA 4ZECA 5DVIA 3EHSA 4QRZA 2QJEA 3G3FA 4FECA 3BFTA 3THIA 3JZJA 3MZBA 3H06B 1D3KA 5I59B 1NNTA 3FGSA 3PUVE 1I6AA 4POXA 3SEVA 5ELVA 1B52A 4IY6A 3RN8A 3T9VA 2FNCA 2DWHA 5I2NB 1B0LA 1VSOA 4DXBA 4OXVA 3W9VA 3IL1B 2O69A 4MLVA 2Z8EA 1TFAA 3K4UA 1FTOA 3K6XA 4H5FA 2XXPA 3MP6A 5CM6A 4YAHX 1FQAA 2OJTA 1H45A 2BJJX 4F1UA 3LSWA 4I1DA 3VXCA 1PDAA 3D4CA 1OLAA 2F8DA 4GRKA 3TTMA 3K0VA 3OOAA 1B3FA 3IOTA 3B6QA 3IO4A 3FUZA 1MM6A 3T96B 3S4UA 4GL0A 4FORA 5H8SA 2OCUA 3FVOA 5DT6A 1FTJA 3RUMA 3CFXA 3KEIA 3R26A 4DCXA 1IXCA 3VDFA 2R6GE 3TTNA 3IORA 1LAXA 2O84X 4TLMB 4E0WA 3MVZA 2QSXA 3IB0A 2OWSA 2DE3A 4AQ4A 3G3HA 4ZE9A 3H03A 2H5YA 4QFPA 3MWBA 4ZEFA 1N7XA 1IIWA 4NF8A 4GIZA 4HW8A 3IJOB 4BDQA 1M5FA 2YJPA 2FYIA 2XXRA 2IA4A 3O6IA 1WVJA 1N84A 1JW1A 3KZGA 2A5SA 1SYIA 1UIUA 4GOTA 2Q2AA 1NFTA 5AA1A 2LAOA 2PT2A 4U4XA 1BP5A 2DP8A 3EPEA 3TODA 1MXZA 4P0GA 4LQ2A 3H3GA 1B3HA 4MFIA 4JB7A 3OO8A 4F29A 2H9BA 3K02A 2QMXA 2QMWA 3BKIB 2B65A 5CMCA 1A55A 2Q8JA 4GVOA 1GV8A 3KN8A 3TDJA 4G8HA 1MXXA 3CVGA 4QFOA 3RNNA 2RF1A 1XOCA 2VOZA 4C1UA 3CIJA 3KG2A 4Z0IA 4ZEBA 3K1PA 2RINA 4I62A 3JV9A 4KQPA 1NKXA 4IY5A 3PMWA 4FJPA 4TOZA 1PEBA 2NOOA 1H44A 4H67A 1JVXA 1N3XA 3N26A 1LCFA 3OO6A 4X1DA 4KYSA 1N0TA 2A5TA 4R6YA 4DXCA 3OXNA 3UA8A 2ZYKA 1FQFA 1AMFA 4U22A 3MPKA 4FEBA 4RK2A 2GHBA 3DELB 4EF2A 3G3KA 1LLSA 1BIYA 4QFLA 4GLIA 2VD2A 4OWDA 3FXQA 1B46A 4WEDA 2UVIA 3SERA 2I0CA 3PU5A 1LB8A 2ANJA 2E1SA 1A40A 4EDPA 4N07A 1EZPA 1IQ7A 4OEVA 3CG1A 4BLAA 5JTYA 4RA1A 2QS1A 4KI0E 1QUIA 5TP9A 4KYEA 3ILUB 3M3KA 1USYE 5L9OA 2DSFA 3K6UA 1RYOA 5HPQA 1B40A 1ATGA 2X7PA 4OETA 2D21A 2PBWA 3SETA 2ZYMA 4M4GA 4H0WA 2QS3A 2ONRA 4LZ5A 3U1OA 3FD3A 3C31A 2F34A 4PFYA 1MXVA 1CB6A 4XKRA 5K2XA 4MBPA 4F3PA 1MQGA 1MQHA 3LBSA 2V25A 2X7QA 4NF8B 4OENA 2ZXTA 5KDTB 1S50A 4L17A 3IJXB 4XXUA 3UIFA 5TPAA 4ELQA 2AYSA 1SW5A 1O63A 5FHMA 2DOJA 1XS5A 2CZLA 5ICQA 1OIBA 2PVUA 4KHZE 4YKJA 1SVXB 4R74A 2DS9A 2F6PA 4F1VA 3S9LC 3TQLA 1QVSA 2F97A 4F18A 1MY3A 2X26A 4EXKA 4KFQA 1GVCA 3SEXA 4PFWA 5DVJA 3HCQA 2H25A 2F5XA 2I49A 5H8HB 4ZZAA 1NH8A 3SESA 1XT8A 1R6ZA 4ELPA 5F7VA 3E9XA 1N04A 2Z23A 3GZGA 3B6WA 2F7BA 1T0KA 5H8NB 3O28A 4NF6B 1SI1A 2HZLA 1MDP1 4G4PA 3T9UA 1SW1A 1IUDA 4HCWA 2PX1A 3HHFA 5ICTA 2O68A 3LSXA 4RNSA 4H8JA 1URSA 3G3IA 1DOTA 3KGCA 2DWIA 2UYFA 4DDDA 5AA4A 4XKNA 1OQHA 4F3BA 1FW0A 2HEUA 1MQIA 3RT8A 4PE5B 3PPPA 1Y3PA 2GHAA 3PUXE 1RYXA 1BLFA 1MPDA 5I56A 4F3SA 5LOMA 3CFLA 5JK4A 1UTBB 3PD9A 3LSFB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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2OZZA 2M8CA 3CR9A 3M3LA 2ZYNA 2FIXA 3FJMA 1LAGE 3FASA 3GYYA 3K1MA 5AA4B 4Q30B 4F2QA 1XVXA 5B70A 1JW5A 2WKYA 4IO4A 2I48A 3IB2A 4F2OA 3I6VA 4NMYA 1TFDA 5CMBA 5I56B 1EZ9A 4OEUA 3S9NC 2XXIA 3T66A 2XXYA 1B05A 1MY2A 1II5A 2OBGA 5I57B 3GXAA 2F7AA 4F3GA 4NWCA 1ZIUA 1NNFA 1B5IA 2QS2A 2WEFA 1B0HA 3SEYA 2V3QA 2Z22A 4BDMA 1PBQA 3A3CA 1JP4A 1KA1A 4MIJA 2ZZXA 4HTGA 4AB5A 1FPJA 2DXRA 3ZSFA 1FCKA 4R75A 1A8FA 1P1WA 3RTFB 4IO6A 1POY1 2Q9TA 1SI0A 5KCJB 4PFTA 1NV5A 1TWYA 3IO6A 2PT1A 1HSEA 2Y7RA 1YAEA 1MQDA 1IXHA 3FVKA 4EF1A 5DW8A 1LBCA 2D5WA 3GBAA 4PGNA 5ET7A 4N13A 1SW2A 2MKZA 5FBPA 1MXWA 4GD5A 1FTLA 1POTA 1QUJA 4FE8A 3EHTA 4F1YA 2F3BA 1AL3A 5ET5A 1NH7A 4O3CA 3RPWA 3A3UA 1Q35A 3UK4A 5CBSA 4YMAA 4PAFA 2Y5LA 1B9JA 4PFRA 1DMBA 1MY0A 4NF5B 5I3SA 5CC2A 1IZ1A 1ELJA 2XWIA 4LQ5A 1MPBA 1LGBC 1S7YA 1Y4TA 2O7UA 4NWDA 2NVUB 1M5DA 4TQUQ 1B7HA 3I3VA 4KD5A 4GWSA 1RKMA 4JWYA 2HPGA 1UTHA 3IAZA 3IK6B 3UORA 3MP8A 4NX1A 4H6DA 3ONMA 4RXLA 2ZZWA 3DLNA 3T9HB 5I58A 4POWA 1VR5A 3ROJA 4U1OA 4PFBA 3MW0A 2KQZA 3FIRA 1NV1A 3N6TA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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