4YU0A

Crystal structure of a tetramer of glua2 tr mutant ligand binding domains bound with glutamate at 1.26 angstrom resolution
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYITQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWRDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
publication title Crystal structure of the tetrameric GluA2 ligand-binding domain in complex with glutamate at 1.26 Angstroms resolution
rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 90
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4yu0A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4yu0A02
4HS7A 1R1NA 1AMFA 2ZNUA 5TU0A 4E0XA 3IO6A 3E9XA 4Q30B 3ZSFA 5F7VA 5H8FA 4WKMA 4KCDA 4G8MA 3EF7A 2HEUA 4KPTA 3SEVA 4YAHX 4U4SA 3IJXB 4ZEDA 5I58A 5FHOA 4N13A 3C33A 4RA1A 3A3CA 3IOUA 4XTCQ 5K2YA 4DXCA 1XVXA 4ZE9A 2Y7KA 4GFRA 5AA3A 1B6HA 2B3BA 4FE8A 3IORA 4NF5A 1B46A 3S4UA 3TCGA 2ZMBA 1B2HA 3IB1A 3VLVA 4RPNA 3U72A 4F1UA 1USYH 4QF9A 1XC1A 4OEUA 1N7XA 3CG3A 4JSOA 3IOTA 2Y84A 3MQ9A 1WVJA 3U94A 2XXTA 5ICQA 3PUXE 4ND9A 2XXUA 3H6UA 3TKDA 1HSEA 2QMXA 3ONMA 4U1OA 3C36A 2X7PA 1B58A 3KBRA 1B1XA 1NNPA 1M5DA 1B7HA 2AL5A 4H0WA 4RYAA 3PMWA 3KN3A 4RJZA 5KCJA 4MLVA 2PT2A 4DIGA 5H8NA 3O6GA 3T22A 1RYXA 1H43A 3AXFA 2FYIA 1LCFA 5K2XA 1ZBMA 1M5CA 3MVXA 4JWYA 4YKPA 3Q26A 2V3UA 2H5YA 1ELJA 1SW4A 2Z8FA 2DWJA 5H8QB 2UVIA 4EQBA 3RY3A 3V8XB 3LR1A 3L6HA 3CFZA 1P1OA 3MP8A 1AL3A 4YKIA 4G68B 1QUKA 1TT1A 4TQUQ 4H67A 4POWA 4Q0CA 4BDMA 1Y4CA 1IXIA 2Y7PA 3F11A 3R26A 3RTFB 4ZZAA 4ZEKA 1UTBA 5DEXA 4EQ7A 2I4CA 1P1NA 4FECA 1VSOA 3SETA 3DELB 2FA7A 4QHQA 1I69A 2DQVA 1IIWA 3PPPA 4KD5A 1WDNA 1P1QA 1B32A 1B0LA 4PE5B 3SDFA 5ITPA 1BLFA 4U1ZA 3QSLA 4O3AA 4GXSB 1MDQA 3MVZA 1URDA 2Q9TA 3MP6A 3K02A 2XHDA 3O28A 3MVWA 3DP8A 1FQAA 2D21A 2AL4A 2HAVA 5KZTA 3H4ZA 2DS9A 1POY1 4FJPA 1M5FA 3I6VA 4H6DA 5FHMA 1B40A 3OO7A 5EHSA 4R75A 4IGRA 2M8CA 1RYOA 2NOOA 1UQWA 2GFEA 1UTHB 4YB6A 4HTGA 3TAJA 3IJOB 4OEVA 3H6VA 2F35A 1PB9A 2ESNA 4WEDA 3Q28A 4GD5A 4NF6B 2O1LA 3M3LA 4BLAA 1VFDA 2F7CA 3GZGA 3MAMA 4M1VA 3USDA 2O1MA 3FASA 3FGSA 1JQFA 2CMOA 1N7WA 5DVJA 1TFAA 2PVUA 1ATGA 4JB7A 3N26A 4IO5A 1MRPA 4Z0IA 3FV1A 4QSDA 1PEBA 2XXPA 1B3GA 1S7YA 5CI5A 3OENA 2R6GE 2NWJA 3C35A 4IO6A 1DOTA 2DE2A 4G2ZA 1Y9UA 5H8QA 1CE2A 4BDLA 1QVSA 4YICA 4DE8A 3PMVA 4ZEIA 4GLIA 3PUWE 3OSRA 3PPRA 3N5LA 4QFPA 4BDRA 4OESA 3C4MA 5AE4A 4O3BA 1JETA 1A54A 3TELA 3EHUA 3RQTA 1A55A 1AIVA 1UIUA 5CRYA 4YU0A 4HCWA 4ELQA 2XXRA 2UVHA 2Q8JA 3KOSA 2F36A 3EPEA 4ZEFA 1PDAA 1MS7A 4R6YA 5BUUA 2UVGA 1D4NA 1OQHA 4F2QA 3N6UA 4OENA 4C1UA 1FQEA 3ILUB 1ZLQA 2REJA 2Y7IA 5I2NB 1OLCA 3PPNA 1ZU0A 4OERA 2KLFA 1M5EA 3KG2A 4LUBA 1O7TA 3VV5A 4DCXA 2V3TA 3T66A 3TZAA 2OCUA 3KZGA 1JVXA 4LONB 3QYTA 2F34A 4H5FA 4R72A 4R6HA 1UTHA 5JK4A 3GXAA 5DT6A 3O29A 3O2AA 2I3VA 3PPQA 3OSQA 1Q35A 2OK2A 4RNSA 2FNCA 1ZMGA 3PPOA 1XVYA 3CSBA 4FIMA 4U21A 3FVGA 3MC2A 5J1DA 3PUYE 1IQ7A 1OIBA 4GL8A 1D3KA 1T0KA 3IAZA 3K00A 1H44A 1MM6A 2F5XA 1Q1KA 5ITOA 1B05A 4QFLA 2YJPA 4G68C 1AOVA 3KN8A 4GIZA 3B6TA 1QUJA 1B5JA 1MXUA 1QJMA 1OVTA 4KQPA 4U4XA 1GV8A 3WAFA 5IKBA 4RY1A 5H8NB 1SI0A 3KSXA 2F6PA 3IOWA 4Z7EA 4GVOA 2DXYA 2Y7RA 1JVYA 1FQDA 3LSLA 1L5TA 2UYEA 2UXAA 1MXWA 3CFXA 1NH8A 2HFBA 3HPIA 3PD8A 1POTA 4F1YA 2QPQA 3HV1A 1N0TA 3RTWB 1QUIA 1II5A 4QSEA 3T96B 4DXBA 3K6XA 1R9QA 1TFDA 3FJGA 4H8JA 1PB8A 3CG1A 4TLLB 3FUZA 4IO3A 2HQ0A 5L9SA 3M3FA 5I2NA 2DSFA 3VVDA 4G4PA 2I0CA 3IO4A 2NUVA 1MPBA 1Y1MA 4R9FA 1MPDA 3WAEA 2RC9A 3OEMA 2I58A 5AA1A 3CR9A 3ILTB 1B51A 1URGA 3D4GA 1BIYA 3K1PA 3TDJA 4FEBA 3O66A 2R9JA 2F6GA 2F8DA 4ELOA 3IB2A 3ZKKA 4I1DA 3W9WA 4G77A 3Q25A 2RINA 4H1XA 5CC2A 2O51A 1GR2A 4H8IA 1GVCA 4GOTA 4FORA 2DWIA 3EHTA 5TP9B 1S9TA 2HCAA 4NF8B 4XKPA 5ELVA 2Y7WA 4IGTA 5BWJA 2QMWA 1OQGA 3OO8A 4AQ4A 3FVKA 4ZEBA 3I3VA 2VOZA 3O9PA 3FIRA 1JNFA 2ZYOA 2D5WA 1JW5A 4PP0A 2YLNA 1SD3A 4RK9A 5DTBA 4XXUA 1I6QA 3T9HB 4HCYA 4IO7A 3VFJA 1TWYA 3H03A 1A99A 4ZDMA 1MXXA 4MBPA 2DE3A 4YZZA 1PC3A 2DWHA 2LAOA 3A09A 3T9UA 2F7AA 4TOZA 4WXJA 4UACA 3GLBA 1B3FA 3VDFA 4IO4A 3KJTA 1Z7ME 1GTKA 5JTYB 4R2BA 3UGWA 3PMXA 4EXLA 1ZIUA 2O84X 3M3KA 2XXHA 4ISUA 4XIGQ 3JV9A 2I49A 1FCKA 3SESA 2I3WA 2UYFA 2A5TB 1B52A 4N07A 3HO7A 3Q29A 2Q2AA 2RCBA 1LAFE 4F3SA 3FD3A 3H3GA 1JEUA 3VXBA 1XHYA 3BFTA 3O6HA 4KCCA 2BJJX 3V83A 2H25A 2NXOA 1N04A 4I9DA 4KYDA 1VFEA 1B0HA 2QS4A 1A8EA 1IEJA 2XX7A 4X1BA 2G29A 2A5SA 3EQ1A 4X1DA 4UA8A 3CRBA 3P7IA 1B1HA 4RK2A 1D9YA 3QAXA 3L6GA 4KYEA 1YCJA 3MVYA 5DVFA 2HZLA 2NVUB 2O7IA 5TP9A 3CI8A 3FV2A 1Y3QA 1PBQA 4NF8A 1MY3A 3I5OA 1JW1A 3KJ7A 1LFHA 3V89B 4IO2A 3UIFA 3Q27A 4BDQA 2I0BA 2ANJA 3LSWA 1QULA 1USYE 3UN6A 3OMBA 3G3JA 4XKQA 2E1SA 2OWTA 2HXWA 4ZECA 4JDFA 4EQ9A 4OFLA 2V84A 4R9GA 3TUSA 5CMMA 5L8DA 1BKAA 3K6WA 4PFYA 4ELRA 1LGBC 1J1NA 4LATA 1LAGE 5H8SA 2DXRA 1DPEA 2WKYA 1GGGA 2PYYA 1BP5A 3IL1B 3TTLA 1QKAA 1N76A 2ZNSA 3RNNA 3N94A 5L9OA 3TMGA 3RT8A 3IOVA 3QUJA 4GWOA 3CSGA 2XD3A 1IZ1A 4G8NA 1MY2A 1RKMA 3THIA 1WODA 2QS1A 3KFMA 3TFLA 4LZ7A 3OEKA 1JW4A 1F9BA 5ICTA 1SVXB 3C9HA 1XT8A 1LAHE 1VE4A 3G3KA 3B7DA 1P99A 2DOJA 2HAUA 4YMAA 3FXRA 4LP2B 5JTYA 3SEWA 1IITA 1NNTA 3K1MA 1FTOA 3DP6A 4EF1A 3VVEA 3T9XB 1NNFA 1A7LA 2A5TA 1MQIA 4PFWA 3TQLA 1NL5A 4LZ5A 3K4UA 3TTNA 3KEIA 3H6WA 5CMCA 1QKBA 4ONYA 2AIXA 3M8UA 4NE4A 3HCQA 3MBPA 3QK6A 2ONRA 4IY6A 1MQDA 3EHSA 2XX9A 1Y3PA 1QW0A 3KGCA 5FHNA 4OFOA 2THIA 1B7UA 1VR5A 1MXVA 1H45A 3R6UA 2O7UA 1LAXA 2PX1A 2OWSA 4U2RA 3SERA 2V93A 4GF8A 3R7XA 5CMKA 3K0VA 3G3GA 5AA4A 5I2KB 4PETA 1HSJA 2HZKA 4DCYA 3RPWA 1ZKBA 3BBRA 4DDDA 5CBSA 4PFUA 4ZS9A 3H06B 2RKMA 1N3XA 3PD9A 3SEXA 1ZTYA 1KWHA 3PUZE 1NMUA 3O97A 3VE1B 1MY0A 2QS2A 4R74A 4TLMB 3EN3A 1FQBA 1NH7A 2VGQA 1B7ZA 5L9MA 3T9VA 1Y4TA 5I84A 5AA2D 4YB5A 4Q5TA 1SW1A 2RF1A 1MY1A 4NMYA 1YTVA 4F3GA 2O68A 2QJEA 4R2FA 2VHAA 4F22A 1O63A 1MPCA 2ONKE 4EXKA 4L17A 2OLBA 1MXZA 5DYHA 2QRYA 3S9EA 2UVJA 4QSCA 2YPNA 3PGFA 1SW2A 4QFOA 1R9LA 2V25A 3OOAA 5EYFA 1A40A 3G3HA 2OZZA 2O69A 4F31B 3TCHA 2P2AA 1EU8A 3TTMA 4EUOA 4Q8RA 2VD2A 5KDTB 5HM4B 1N3WA 4OZ9A 4LQ2A 3HHFA 3SKPA 3RT6B 2RC8A 5H8HB 3UORA 1NFTA 4PQJA 2QSXA 4F19A 2P1SA 4OYVA 4QRZA 3C31A 4OQOA 3TYHA 2XXWA 1ZJLA 2H98A 1DMBA 4NF4B 3FVOA 2G93A 2CZLA 1HSLA 3U8QA 1LCTA 1BTJA 1N84A 3H6TA 1D9VA 3K6VA 5I2KA 3JZJA 1EZPA 4NTLA 4XKNA 1MH4A 1MM7A 4MFIA 4IB2A 2XXIA 3ZS6A 2I4BA 4HW8A 3G3FA 2OJTA 3HHGA 3IB0A 3K1NA 3O6IA 2ZXTA 4MLQA 1LBBA 1LBCA 1DSNA 4POXA 3FXUA 4EDPA 3U93A 5I56A 5HPQA 4YKKA 1FQFA 5M2VA 1B3HA 3LUYA 4THIA 2Q2CA 3FJ7A 3MPKA 3TEPA 2ZYNA 2ALUA 1TXFA 4JXIA 5B70A 5AA2A 2QS3A 1IUDA 4NEDA 4OMBA 4OHNA 2XXQA 2RC7A 3RGYA 4GL0A 3G7WA 2D3IA 2GRVA 3FATA 2I6EA 1M5BA 4U23A 1CB6A 1OLAA 4I8CA 3S9NC 4GRKA 4F18A 4ELPA 3MUQA 4R73A 4DXUA 1LFIA 4ZZEA 3B6QA 4M4GA 3V5AA 3BFUA 4KFQA 3OD7A 3TQWA 3TTKA 5TPAB 1I6BA 3RN8A 2VP1A 2H4IA 4RPOA 4MH5A 1SQYA 2V3QA 4H5GA 4GQOA 3CIJA 4P0GA 3T93B 1ANFA 3TCFA 2Z8EA 3MW0A 4BDNA 4XKRA 3FVNA 2F7BA 1JEVA 3TODA 5ISUA 1FQCA 4OWDA 3C32A 1B5HA 4BDOA 3S9LC 5KDTA 4FATA 4ECFA 5H8HA 3U92A 2Z8DA 5FTIA 1MXYA 3GBBA 4LVQA 3GBAA 5HBCA 1DPPA 3MPLA 3S9MC 3PV0E 3VLUA 1LLSA 4NF4A 3LSFB 1H76A 3E13X 1NKXA 1XOCA 4R6KA 4YMBA 5F1QA 2ONSA 4MF3A 2ZNTA 3HN0A 5I57B 4KYSA 1I6AA 4X48A 1B3LA 2OBGA 3QUFA 1IXGA 3ZKLA 4OVJA 1Y3NA 4F3PA 4ESXA 4F3BA 2H9BA 1FTLA 4DLDA 2RCAA 5AA4B 5B7DA 5I59B 1MY4A 2W7YA 3SEYA 2QL3A 3KSJA 4I62A 1US4A 3VLWA 2DVCA 1NNKA 3B6WA 4OETA 4E0WA 3MP1A 3BKIB 3FZVA 3LBSA 1OVBA 3U1OA 3K2DA 3D4CA 1LFGA 3DLNA 4C1TA 1EZ9A 2REGA 3VXCA 4JBZA 4K3FA 3FXQA 4O3CA 3H7MA 4WEPA 2GH9A 1PBPA 1OMPA 1MQHA 4FEDA 4AB5A 4JWOA 4P11A 2DWAA 2IA4A 1SDXA 4QFKA 1SYHA 4FAJA 3N6TA 1EZOA 2X26A 1SI1A 4KI0E 1SBPA 5TPAA 2XXYA 1EH3A 1FTKA 3W15C 3IX1A 1YAEA 3MWBA 1URSA 3S2VA 4G68A 4IY5A 1LSTA 3UA8A 2PBWA 3E4RA 4ESWA 5IAIA 3CFLA 4F29A 1LB9A 4F39A 1MH3A 4H65A 3MZBA 2Z22A 3SEUA 1UIVA 2ABHA 5A5XB 4AB6A 3G3IA 3VVFA 2DP8A 3W9VA 3A3UA 1YPNA 3RUMA 2P0SA 5CBRA 1A8FA 2Z23A 2DYXA 2Q88A 1B9JA 1Y20A 1Z7NE 1O64A 1FW0A 4NWCA 3LC8A 1P1UA 5LOMA 1SYIA 3MJNA 4OXVA 4LQ5A 2DVZA 4PFTA 5I57A 3DP4A 1B5IA 1FTJA 5CM6A 4YB7A 4X9TA 1Y1ZA 1P1WA 4KR5A 3DM0A 4N6PA 3E3KA 5FTHA 1H3DA 3OELA 2GHBA 2AYSA 5H8FB 5I59A 2I48A 4ZE8A 3RLFE 5EHMA 3OXNA 2F97A 4LZ8A 1XS5A 1R6ZA 4F2OA 3C34A 4NWDA 1MQGA 1SW5A 3MZ1A 2PT1A 5I58B 3K6UA 1B3EA 4NF6A 4LA9A 1B4ZA 3K01A 4G8HA 4YKJA 1PB7A 5DVIA 1AH5A 4RXLA 2O6AA 5I56B 4NF5B 4F1VA 3HSTA 3IR1A 2H99A 2GHAA 4C0RA 3TTRA 1IXCA 5AA2B 1B4HA 2VD3A 1FTMA 4OTEA 2XD2A 2ZYKA 5CMBA 1IXHA 4JWXA 3JYRA 1S50A 3QIMA 4P0IA 4QFNA 3PU5A 3TPAA 3UP9A 2ZYMA 5KCJB 2B3FA 4KHZE 2X7QA 2Q89A 3FJMA 3KOTA 3KN7A 1MQJA 2DE4A 3PUVE 3QXMA 4JSDA 3OO6A 4DZ1A 1MDP1 2XXVA 3ODBA 1US5A 2PMSA 1LB8A 2XX8A 5A5XA 2XXXA 2B65A 3OO9A 4U22A 3IK6B 4GXAA 4OFJA 2IEEA 3ECRA 3MZ9A 2R71A 1DTZA 1MG1A 2F78A 2E0SA 1UTBB 3UK4A 1DTGA 3LSXA 5DEXB 5JEIA 4EF2A 3CVGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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