4YU0A

Crystal structure of a tetramer of glua2 tr mutant ligand binding domains bound with glutamate at 1.26 angstrom resolution
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYITQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWRDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of the tetrameric GluA2 ligand-binding domain in complex with glutamate at 1.26 Angstroms resolution
rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
total genus 90
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4yu0A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4yu0A02
3MP8A 1LCTA 4IY5A 1B5IA 1H44A 3B6TA 2ZNSA 4FJPA 2QJEA 3ZSFA 1LFHA 1QKAA 2DE4A 3TQLA 5BUUA 1ATGA 1VE4A 2GHAA 2O69A 1VFEA 2QS4A 3O6IA 3H6UA 1B40A 4MH5A 4P0GA 1GV8A 1B6HA 3G3JA 4XKPA 1US4A 3TAJA 3FD3A 3PU5A 5TU0A 2F36A 4GFRA 3SEXA 1SVXB 3LR1A 3FVNA 1SW2A 4OEVA 4ZDMA 4OFLA 5AA1A 4Q8RA 4YU0A 1MXUA 3TDJA 1IXHA 4WEDA 3RLFE 2UVIA 4I62A 4YMBA 2Y84A 4YICA 2Q8JA 1MPCA 2F6GA 1ZLQA 3V5AA 4N07A 4QFNA 3PD9A 3R6UA 3VXBA 1PB9A 4YMAA 1JETA 5A5XA 1JEUA 4BDQA 2DSFA 4RK9A 2DWHA 4WEPA 2NOOA 3FASA 1QVSA 2DWAA 3GXAA 4OESA 5TP9B 1YTVA 2F35A 2WKYA 1YAEA 1MPDA 3SESA 4EUOA 5FTIA 4NF6B 3HHFA 4ECFA 4H8IA 1MM6A 3DM0A 2UVGA 1OVTA 2ANJA 3ONMA 1N04A 4K3FA 4X48A 1AMFA 5JK4A 2OWTA 3E4RA 3F11A 3O29A 3O6GA 4Z7EA 1SYHA 2KLFA 3UP9A 2O7UA 2VD3A 1P1QA 4EF1A 4MBPA 4EXKA 2DOJA 1B7HA 1II5A 1ZBMA 2OCUA 3K2DA 3LC8A 4XKQA 1TWYA 3LSXA 2ZYOA 5FHMA 4TQUQ 5HBCA 5JTYA 3CFLA 4NF8B 5HM4B 5EHSA 1RYXA 1USYH 2F7AA 2RC7A 3HHGA 5TPAA 4F19A 3UA8A 1T0KA 1Y9UA 2XXPA 3FGSA 3H3GA 2UVHA 4M1VA 4OEUA 3V8XB 5DVFA 4RY1A 3KJ7A 5I84A 3HPIA 1DTZA 3K6VA 4LQ5A 3TMGA 3KG2A 4GQOA 5I56B 1DOTA 1QUJA 2NUVA 3N6TA 4RK2A 3T9HB 1POTA 1IZ1A 4BLAA 1UTBA 3MP6A 4YKJA 4G8NA 1XVYA 3MVYA 4G2ZA 4XIGQ 3MVZA 4DLDA 5I57B 5L9SA 3MVWA 2PX1A 1MY1A 5F1QA 3QIMA 3OO9A 1LSTA 4N6PA 3TKDA 2AL5A 3KN3A 4E0XA 4EF2A 2GHBA 1JVYA 1H45A 3MBPA 3IJXB 1EU8A 4X9TA 4ELOA 1TFAA 2QS1A 3JYRA 3P7IA 3CFXA 3KOSA 3OO6A 3K02A 3OSRA 4JSOA 4ELRA 4ZZAA 3HN0A 1R9LA 2Z8DA 2O51A 1JVXA 4GRKA 1B3FA 4KR5A 4OZ9A 2V3QA 4ZS9A 3RY3A 3T66A 3VLWA 3TZAA 3ZKLA 3IJOB 4LZ7A 5DEXA 4R2BA 3T9XB 1MH4A 3DP8A 4F2OA 4QFOA 2FYIA 4IGRA 4G68B 1B1HA 1IITA 3OENA 4NF4B 4XXUA 1TFDA 1B9JA 1Q35A 3KN7A 3QAXA 4ELPA 1NNKA 3VVDA 4I9DA 4OMBA 3Q26A 5H8HB 3W9VA 4GL8A 2RC8A 3RQTA 2A5TB 3C36A 4OFJA 4AQ4A 4JBZA 3CFZA 1FQDA 2PVUA 2A5SA 3UGWA 1MY0A 3UK4A 4U22A 4UACA 4KHZE 3ZS6A 3H6TA 3C4MA 3PUWE 2G93A 1DPEA 1OMPA 1NH7A 4OENA 1IQ7A 3PUYE 1SDXA 4R2FA 3OEKA 3VVFA 3FXUA 2AIXA 1MXZA 2RCBA 2UXAA 1B0HA 1B58A 1PC3A 1MDQA 3FJGA 3VE1B 1Y1MA 4F2QA 1URGA 4NF4A 5DVIA 3E13X 1I69A 2X7QA 3KGCA 1QUKA 3IAZA 5I59B 1S7YA 2I58A 4RPOA 1GGGA 3MPLA 3RTFB 4YAHX 4DXBA 2W7YA 3SEWA 2Y7KA 3CG1A 4DCXA 1IXCA 1DMBA 3FJ7A 1OIBA 3MQ9A 4WXJA 3UN6A 2LAOA 1MQDA 5AA2B 2V93A 1MY2A 3T96B 3VFJA 3BFUA 2R9JA 4PFWA 2H5YA 3SERA 2HEUA 4RA1A 4FEBA 4NTLA 2Q2CA 4OQOA 4HW8A 4JDFA 5ICTA 2V3TA 3TELA 2OWSA 2Q88A 1P99A 2DE2A 2UYEA 3K1PA 1B4ZA 5L9MA 2I4CA 3IL1B 2XXTA 4QFLA 1EZ9A 1B5JA 3IR1A 1L5TA 4TLLB 4ND9A 3TTKA 4F3SA 3CIJA 5F7VA 5I59A 2XX7A 1WDNA 4LZ8A 2HFBA 1P1OA 3JV9A 3DP4A 1O64A 1MQIA 1FQCA 1N76A 1CE2A 3M3FA 1B5HA 1SW1A 5IKBA 1MS7A 4R9GA 4KPTA 2ZNTA 4FEDA 3BFTA 1POY1 1B0LA 3H4ZA 3K6UA 1UTBB 2R6GE 3C33A 3MZ9A 3RUMA 1MXVA 1N3WA 4ESWA 3PPPA 5ICQA 3OELA 1ZMGA 1NFTA 3VVEA 5I2NB 1LFGA 2P2AA 3LSFB 2B65A 4Q5TA 1DSNA 3FXRA 2RCAA 5EHMA 4BDRA 4DXUA 2OJTA 3IK6B 1HSLA 2I6EA 3OSQA 2YLNA 5FHOA 3OD7A 3UORA 3K00A 5AA3A 3THIA 4PP0A 3U8QA 4HCWA 2REGA 1MY3A 1MQGA 1PDAA 3I5OA 4U21A 2I4BA 4TLMB 2F5XA 2XXIA 1GTKA 4IO2A 5CMMA 5DVJA 5AA4B 2QSXA 5KDTA 2XXQA 4F39A 3PD8A 4AB5A 4ISUA 3TCHA 3PPQA 3FJMA 4EQBA 5B7DA 3TYHA 2R71A 3BKIB 3CI8A 2Z8EA 4R6YA 3FZVA 1TT1A 2RC9A 1JW4A 5I2KA 3G3IA 4O3AA 3IB2A 1M5EA 1B51A 1PEBA 5KCJB 3M3LA 2DE3A 1B05A 3G7WA 4U2RA 1SW4A 3O9PA 4TOZA 1LB9A 1XT8A 4XKRA 3OMBA 5CI5A 4BDNA 4N13A 5AA2D 1AIVA 3ILUB 2I0BA 4FIMA 4RJZA 5A5XB 1P1UA 2D3IA 2ZNUA 2GRVA 3M3KA 4H67A 3DP6A 1A55A 4G4PA 2DP8A 3FXQA 3KBRA 4IO6A 3DELB 2Z23A 1MQHA 4QFKA 4R73A 3MZBA 2F97A 4IO5A 4OYVA 1FQAA 5H8QB 5BWJA 3G3KA 5AA4A 4F29A 2Y7IA 3MVXA 3HV1A 3TEPA 1MM7A 3TQWA 2IA4A 1ANFA 3FIRA 4XTCQ 3H6WA 4H8JA 3PUXE 3OO8A 4H5FA 4OXVA 3C35A 4ZEBA 2OBGA 1B1XA 1LB8A 4GXAA 4LP2B 3U92A 1Y1ZA 2OZZA 3TODA 2ESNA 2G29A 4LQ2A 2HQ0A 1VSOA 4OERA 1UIVA 2VOZA 3C32A 5CMKA 1NNFA 4Z0IA 1USYE 3FV1A 4ZEFA 4YB6A 2DWJA 5AA2A 4NEDA 3H7MA 2RKMA 1JW5A 3A3UA 4LATA 5TP9A 4F1YA 4LUBA 3N26A 1N3XA 3O66A 1LFIA 1SQYA 3I3VA 4YKIA 3T9VA 1Y4CA 1ZKBA 4JWOA 3LSLA 4RPNA 3B7DA 4MF3A 2RF1A 4RXLA 4P0IA 5DEXB 4PFUA 3SEVA 1Z7NE 4BDOA 5KDTB 1LAGE 3GZGA 5CMBA 1A99A 2ONSA 3CSBA 3O6HA 3EHTA 3MAMA 3IO4A 1B32A 1FTMA 4BDLA 1URSA 2E1SA 3G3FA 1NL5A 2XXXA 4H1XA 1MH3A 4GWOA 2GFEA 2NXOA 1A54A 2F34A 2YPNA 3U72A 4U1OA 2ONRA 3FATA 4NF8A 5H8FA 4EQ9A 3T93B 4ZECA 1OVBA 4GOTA 1A7LA 4GF8A 1H3DA 2QMWA 3K1MA 3VLUA 5H8NB 3E9XA 3RN8A 1SI0A 4LONB 3KZGA 1B3GA 4DDDA 5H8QA 4H5GA 3Q25A 4DIGA 2ZYMA 4KI0E 4JWXA 5CRYA 4NMYA 1B2HA 2B3BA 3T22A 2Q9TA 2Y7WA 1LAHE 3KEIA 4IO4A 4ZEKA 4R6KA 4L17A 3CR9A 3FVGA 2F7BA 3A3CA 3K0VA 4KCDA 2O68A 1BTJA 5CBSA 1FQEA 2HCAA 3O28A 2THIA 2XX9A 1Y4TA 3C34A 3ZKKA 2PBWA 4YZZA 3M8UA 3SKPA 4YB5A 4EDPA 1QULA 2DS9A 3QSLA 4KYSA 2O6AA 3PV0E 5H8FB 2ZYNA 1LGBC 2UVJA 3C9HA 3VDFA 5HPQA 2Q2AA 1A8FA 3WAEA 2XXVA 4X1BA 5EYFA 2HXWA 3TTLA 3K6WA 1QKBA 2XX8A 3H6VA 4G8MA 4OHNA 5I58A 3IO6A 4F22A 2ABHA 5I57A 3U1OA 1B7UA 3CVGA 2NVUB 2Q89A 3B6WA 1EZPA 3N94A 4ZEDA 3S9LC 1XC1A 1HSJA 2I3VA 4NWDA 4OFOA 5ELVA 1FTLA 3SEYA 5H8HA 1WODA 4FECA 4G68C 4F3BA 1I6QA 1LAFE 4Q30B 4MFIA 2F78A 5M2VA 1PBQA 3Q28A 2H9BA 1BP5A 1LBCA 1NMUA 3QXMA 1AH5A 3FVOA 1SBPA 3OXNA 3TTMA 5LOMA 3MWBA 5ISUA 3CRBA 4FORA 1I6AA 2ONKE 4IO7A 3A09A 3PUVE 2Y7RA 1Y3NA 3W15C 2DQVA 1PB7A 4H0WA 4F18A 2VHAA 3RPWA 4G68A 1JEVA 5ITOA 4ELQA 2DYXA 2H99A 2DVZA 3D4CA 4R6HA 1MXWA 4EQ7A 3K4UA 1OLAA 1SYIA 3DLNA 3MUQA 4ONYA 4RNSA 3U93A 1MXXA 1P1WA 2Z8FA 1I6BA 3EHSA 1Y3PA 4YKKA 1S9TA 4ZE8A 2I3WA 3ODBA 4C1UA 4PE5B 4G77A 4ESXA 3GLBA 3IOTA 3PGFA 4AB6A 4F3GA 1EZOA 1A8EA 1ZTYA 3RGYA 1UTHA 2F7CA 4F31B 1XHYA 1SD3A 4NE4A 3VLVA 3WAFA 5DTBA 4Q0CA 2V3UA 1US5A 3N5LA 1KWHA 3FUZA 1SI1A 4FE8A 2E0SA 1MXYA 4GD5A 2H4IA 1QW0A 2ZMBA 3UIFA 1MG1A 1D3KA 2Y7PA 3FV2A 3E3KA 3IB0A 3ILTB 4KD5A 4PETA 3EN3A 3K1NA 4IGTA 1M5DA 2DXYA 2XD3A 4H6DA 4NF6A 1MRPA 4U4XA 5AE4A 5I58B 5ITPA 4G8HA 1S50A 2ALUA 3R7XA 4PFTA 4DXCA 4F1VA 1N84A 3K6XA 5KZTA 1IUDA 1Q1KA 2O7IA 3KJTA 1NKXA 3KSJA 4H65A 5KCJA 1RYOA 4YKPA 1B4HA 4OWDA 1FTJA 1D9VA 2REJA 3MW0A 1H43A 4U1ZA 2FNCA 1MY4A 1VR5A 3EQ1A 4KQPA 4KYEA 4HTGA 3W9WA 1B52A 5JEIA 4M4GA 2H98A 4EXLA 1OQGA 3R26A 4C1TA 4JXIA 4U4SA 4QSCA 1B3LA 4GIZA 1ZJLA 3VXCA 2ZYKA 4JSDA 3D4GA 4QSDA 2BJJX 1YCJA 3IOVA 4LA9A 2QS2A 3IOWA 4OETA 4O3BA 2X26A 5B70A 1AOVA 4NF5B 5K2XA 2HZLA 2DWIA 2QS3A 3MZ1A 4I1DA 1JNFA 3ECRA 1B3EA 2B3FA 2O84X 2RINA 1UTHB 3PMWA 4GL0A 4KCCA 4FATA 2FA7A 2QL3A 2F6PA 4OVJA 3IB1A 5TPAB 5FTHA 1Z7ME 1GR2A 2VD2A 3HSTA 3USDA 5CC2A 5J1DA 1B46A 1FW0A 3MC2A 1BIYA 2O1MA 2P0SA 2ZXTA 3EHUA 3PPRA 1MDP1 3RNNA 3RTWB 3IX1A 4PFYA 3V83A 1MPBA 2H25A 1P1NA 1RKMA 5DYHA 1XVXA 4XKNA 1M5FA 2Z22A 3TCGA 2I0CA 4QRZA 3H06B 1ZU0A 2DXRA 3V89B 5CBRA 4YB7A 4MLVA 1FQFA 1Y3QA 3L6GA 1O63A 2PT1A 3I6VA 4O3CA 1M5CA 1JW1A 2D5WA 4GLIA 2AYSA 3KFMA 3G3GA 3B6QA 3LBSA 4R9FA 3TFLA 3S2VA 4NF5A 4U23A 5H8SA 1H76A 3GBBA 2UYFA 1BLFA 5JTYB 1M5BA 2VGQA 3AXFA 3QUFA 3EF7A 2PMSA 3SDFA 2GH9A 5L9OA 4LVQA 4DCYA 4IB2A 2P1SA 2IEEA 3N6UA 5H8NA 5IAIA 4ZEIA 3TUSA 2XXYA 3KN8A 2XXRA 2I49A 1XOCA 2M8CA 4F1UA 1UIUA 4HCYA 1NNPA 4JB7A 5I2KB 3QUJA 3PPOA 4R74A 4BDMA 3HO7A 3SETA 4DE8A 3MJNA 1TXFA 1URDA 2F8DA 3C31A 4GXSB 3VV5A 1ZIUA 2HAVA 3KOTA 1N7WA 2O1LA 3CSGA 5K2YA 3PPNA 4GVOA 4R72A 4QHQA 4FAJA 3TTRA 4UA8A 3JZJA 1FTKA 1B3HA 3BBRA 4X1DA 4POWA 1OQHA 4IO3A 5FHNA 1DTGA 1D4NA 3O97A 3IOUA 3L6HA 1WVJA 1GVCA 2YJPA 4R75A 5L8DA 1BKAA 1ELJA 1HSEA 1LBBA 1LAXA 3IORA 1UQWA 3KSXA 4PQJA 4WKMA 2NWJA 3MPKA 3TTNA 1NNTA 3CG3A 4I8CA 1YPNA 1SW5A 3S9MC 3OEMA 3Q29A 2XXWA 5I2NA 2D21A 2A5TA 3PMVA 5DT6A 5CM6A 2CMOA 1EH3A 1VFDA 3PUZE 3S9EA 1N7XA 1FTOA 1B7ZA 3OO7A 4KFQA 3S9NC 1MQJA 3QYTA 3Q27A 3TPAA 2VP1A 4MLQA 4HS7A 1IEJA 3MP1A 4P11A 2QPQA 2AL4A 1O7TA 2QRYA 2V25A 2XXHA 1FQBA 1PBPA 4F3PA 2PT2A 3PMXA 3RT6B 1LLSA 3GBAA 2V84A 3HCQA 1J1NA 3FVKA 4THIA 3OOAA 2I48A 2XHDA 5CMCA 3TCFA 1AL3A 1IXIA 3SEUA 3O2AA 3EPEA 3H03A 1XS5A 1F9BA 1Y20A 2OK2A 4ZE9A 1FCKA 3LUYA 4QF9A 3S4UA 1IIWA 4DZ1A 4IY6A 3K01A 3T9UA 2DVCA 2QMXA 1OLCA 3QK6A 1R9QA 4RYAA 2X7PA 1LCFA 4QFPA 1R6ZA 4KYDA 1DPPA 4E0WA 4C0RA 1JQFA 1IXGA 4NWCA 2XD2A 1NH8A 5I56A 3G3HA 4LZ5A 1A40A 2OLBA 1N0TA 4QSEA 2CZLA 1QUIA 1CB6A 4OTEA 3RT8A 1PB8A 2HAUA 1D9YA 1QJMA 4POXA 2HZKA 3LSWA 4ZZEA 4JWYA 2XXUA 2PYYA 3U94A 1R1NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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