3TZAA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the antagonist (s)-2-amino-3-(2-(2-carboxyethyl)-5-chloro-4-nitrophenyl)propionic acid at 1.9a resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A new phenylalanine derivative acts as an antagonist at the AMPA receptor GluA2 and introduces partial domain closure: synthesis, resolution, pharmacology, and crystal structure
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tzaA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tzaA02
3RPWA 2QRYA 5M2VA 2F34A 2F78A 3U93A 3HCQA 3V5AA 3OOAA 4F3BA 5A5XA 4OEVA 2E1SA 4LZ5A 2XHDA 1FTKA 1SDXA 4LZ7A 3TCHA 3TYHA 4POXA 1A8FA 1FQBA 1P1OA 3W9VA 1AOVA 2ABHA 3SERA 3KFMA 5CC2A 1PB7A 2ANJA 3PU5A 4MF3A 4YKPA 5DTBA 1US5A 3VLUA 2VD3A 4DCXA 2HAUA 1BKAA 5CRYA 2B3FA 5F7VA 2ONSA 1FW0A 3O6IA 4IO6A 2ZYMA 3TTNA 1MQGA 1NNTA 3G3IA 1ZJLA 3TCFA 2O1MA 4EF1A 1FQEA 1B3LA 4K3FA 2X26A 3FUZA 4H67A 1MG1A 5DEXB 1TFAA 1R9LA 2F6GA 1TFDA 2XXQA 3C33A 3CFZA 3G3GA 1Y4CA 3C34A 3G7WA 4KYSA 3T9UA 5ISUA 4U4XA 4OXVA 3R26A 1BTJA 3N6TA 1WODA 4FEDA 4E0XA 4IO3A 4H0WA 5H8HB 1KWHA 1MH4A 3IJXB 3VXCA 4HW8A 2NUVA 2XXWA 4NF5A 3S9LC 3W15C 5I56B 2DXYA 5JEIA 3HO7A 1T0KA 3Q26A 1OQHA 3HSTA 2O84X 3IB2A 3TODA 2RKMA 1NNKA 2D5WA 2DVCA 2G93A 2RC8A 3FGSA 4EQ9A 2DSFA 3PUYE 5BWJA 2RC9A 4JBZA 2HZKA 2WKYA 1Y20A 3MP6A 2X7PA 1B9JA 1MXUA 5I2KB 1D3KA 5H8FA 3N26A 4AQ4A 5CBSA 3OSRA 4QSCA 4NWDA 4IO4A 3KEIA 4OZ9A 3H7MA 1TT1A 3M3FA 4TOZA 4OESA 5CMMA 1PC3A 1IITA 5DVJA 5H8NA 4BLAA 1B3EA 3K02A 3DP8A 2X7QA 1N3XA 2UYEA 3H3GA 4OTEA 4UACA 4EXLA 2FA7A 1UTHA 1POTA 2QS1A 1FTOA 2I6EA 4NF6A 2VHAA 3A09A 1B3GA 1M5CA 1XC1A 2XX9A 3JYRA 3MZBA 5L8DA 4KI0E 1NH7A 3MC2A 3E3KA 1A7LA 2R6GE 3N94A 3CI8A 3TKDA 3PPRA 1MXWA 1B58A 4F2OA 4U4SA 1FTJA 4OFJA 3WAEA 2I0BA 1D9YA 2LAOA 3O6GA 4WKMA 2UVIA 3IJOB 3MW0A 1RYXA 1I6QA 3K6XA 4R9FA 3MPKA 4MLVA 3AXFA 4QFOA 4O3BA 4OVJA 4PQJA 3FVNA 3FZVA 1VFDA 3V89B 4IO7A 5AA3A 1J1NA 1GR2A 1A8EA 5FHMA 1MY1A 1NL5A 1QUIA 4HTGA 3CG1A 2QPQA 3S2VA 1ZTYA 4RPOA 1CB6A 4NF8A 3UK4A 1SW4A 2V84A 1B32A 4OFLA 3L6HA 4BDRA 2HAVA 4YB7A 1Y4TA 2NXOA 3OENA 3VFJA 2XX7A 4HCWA 2UXAA 2P2AA 2H4IA 1N04A 3KG2A 1MXYA 1XVXA 1MRPA 1LGBC 3M8UA 4ONYA 4EQBA 2O7UA 5DT6A 1BIYA 2NOOA 4BDOA 4UA8A 3U72A 3FVKA 1JW1A 3CG3A 1R1NA 3KN7A 3PUWE 4H65A 5H8FB 4BDMA 2I4CA 3EF7A 2ZNSA 3MUQA 4MFIA 4DZ1A 1UIUA 2QS2A 4G8NA 5HPQA 3K1PA 3T66A 3ZS6A 2IA4A 3K1NA 1XHYA 2A5TA 1ELJA 1YAEA 3QAXA 4IY5A 3HPIA 1JETA 5CMCA 1NMUA 3O66A 1LFHA 2DQVA 3O28A 5FTHA 4ZEFA 2AL4A 3C4MA 2R9JA 3IR1A 2I3VA 3OSQA 4PETA 1AH5A 1JW4A 2VOZA 3FD3A 3HHFA 2XXYA 4NEDA 1S7YA 2ZYOA 3FIRA 3FVGA 3RLFE 2Y7RA 3FJ7A 3K1MA 2UVHA 3S9NC 3JV9A 2I58A 3MVWA 5EHSA 2XX8A 2DWIA 3TUSA 3OXNA 4EUOA 1QVSA 4HS7A 1UTBA 3H6TA 4GWOA 1IZ1A 4Q8RA 5CMKA 4YKJA 4H5FA 3I6VA 4KQPA 3V8XB 5KDTB 3O29A 1P1NA 2OCUA 2F35A 1QUJA 5CMBA 1LBCA 2XXRA 1MPBA 1B5JA 3GLBA 4U2RA 4IGTA 3CR9A 1NKXA 5AA2A 4PFUA 2W7YA 5F1QA 3TPAA 4DCYA 3IL1B 3QSLA 2YPNA 1YPNA 4LQ5A 4NF4A 1QULA 2RC7A 1LSTA 4P11A 1EZ9A 4LATA 4C0RA 5I2NB 3CSGA 5JTYA 3G3HA 1POY1 4Q30B 4M4GA 4RK2A 3MAMA 4OQOA 3C9HA 3LSFB 3C35A 2DWHA 4XXUA 4GL8A 2O6AA 1AL3A 3ECRA 4F3GA 4YMAA 4YKIA 2Y84A 3EHUA 4F31B 3TEPA 3IK6B 5TP9A 5ICQA 4LA9A 3UORA 2AYSA 4GLIA 2A5SA 3RN8A 3EHTA 2M8CA 3RGYA 3FV1A 1QUKA 1MPDA 4ESWA 4ZZAA 4F18A 2Y7WA 3LC8A 3LR1A 5I58B 1DOTA 2OLBA 3A3CA 2UVGA 2RCBA 1B4ZA 2F8DA 2OBGA 3BFTA 2GHAA 3RNNA 2DXRA 2HZLA 3H4ZA 4XKQA 4TQUQ 3KJTA 4F19A 3IOUA 1LAGE 2F5XA 2DP8A 3HN0A 4GRKA 4JWXA 4EQ7A 2HFBA 4DDDA 1B7HA 5BUUA 2XD2A 5H8NB 1FTLA 1N3WA 5I58A 2B65A 4ELOA 4R74A 3WAFA 1DPEA 1LAHE 3MP8A 4NF6B 1LFIA 3IOWA 4JWOA 1B52A 3MPLA 4I8CA 1HSEA 2IEEA 2THIA 3CSBA 4PFTA 4QF9A 5A5XB 5EYFA 1IXIA 1SI0A 1DTZA 3FJGA 1R6ZA 2O69A 4IB2A 3SEWA 2XD3A 4GXSB 4Z0IA 3GBBA 3LUYA 3U8QA 5KCJB 4FORA 1QKBA 3JZJA 3OEKA 2PBWA 1URSA 1B1HA 3FASA 2QSXA 1VE4A 2XXUA 1IIWA 3T96B 3TZAA 1SYHA 3ZSFA 3CVGA 4R2FA 4KHZE 4YAHX 2P1SA 1PBPA 3BKIB 3K00A 2O68A 2ZNTA 4XKNA 1LAFE 1LCFA 3QYTA 1XOCA 3RT6B 3QUFA 4RA1A 1FCKA 1BP5A 1LLSA 1S9TA 1QKAA 3M3LA 3N6UA 3OD7A 2RCAA 1B2HA 4G8HA 4Q5TA 3QUJA 5DVIA 5ITOA 1MY2A 3K6VA 3KN8A 3CFLA 1SW5A 3T22A 4RXLA 1FQAA 2DVZA 5I56A 1RYOA 4QFNA 3OO7A 1P1UA 4QFLA 4C1UA 1M5EA 4G77A 4JXIA 5ITPA 2O51A 3Q27A 4M1VA 4R9GA 1F9BA 3PUZE 3PGFA 4F1VA 3D4GA 4O3CA 1AIVA 4ELRA 2ONRA 3DELB 4THIA 1B6HA 1B7ZA 2OZZA 3MZ9A 2Q88A 4WEPA 1DSNA 4KCDA 3EQ1A 3SEVA 4WXJA 4I1DA 1FQDA 4R6HA 3QK6A 2UVJA 4FE8A 4TLMB 3VLVA 4AB5A 1SW2A 3K0VA 3EPEA 3TMGA 4ND9A 3CRBA 3IO4A 1MQHA 4POWA 4F22A 5B70A 4X48A 2GHBA 4JSDA 4F3PA 1MS7A 4OERA 3BBRA 4GVOA 3RT8A 1B1XA 2DS9A 2E0SA 4KD5A 1MH3A 2DWAA 3K6UA 4PE5B 1R9QA 3DM0A 5FTIA 3KSXA 5KZTA 2XXHA 3H06B 2PX1A 3MP1A 4I62A 4U23A 3TDJA 4FAJA 1YTVA 2HEUA 3BFUA 1NNFA 1EH3A 2ZYNA 1P1QA 1EU8A 4R2BA 3UGWA 1JVYA 3H6WA 1OVBA 4LQ2A 5AE4A 5AA4A 2D21A 3CFXA 5LOMA 1B4HA 1XS5A 5JK4A 2G29A 2B3BA 2ZNUA 4QFKA 3UIFA 3FATA 2QS4A 3KN3A 2OJTA 3R7XA 1Q1KA 4O3AA 1B0LA 4OMBA 1Z7ME 2YJPA 4N07A 4NMYA 3W9WA 3GZGA 4H8JA 5I2NA 1OLAA 2Z22A 3KSJA 1ATGA 5JTYB 3U94A 1XT8A 1LBBA 2I0CA 2QL3A 4KYDA 2AIXA 4LONB 1UQWA 2BJJX 2DOJA 3ONMA 5H8HA 4G2ZA 4I9DA 3UP9A 2ZXTA 4IGRA 3F11A 5J1DA 3MJNA 1O63A 4AB6A 1M5DA 4OENA 4DXUA 2D3IA 3T9HB 1S50A 5K2XA 4RPNA 2AL5A 4XIGQ 5I57B 1OQGA 1OVTA 5AA2D 1H76A 1N76A 1MM7A 3FXQA 4G68A 4GL0A 1I6AA 1A40A 3O2AA 1CE2A 2Q2AA 4MLQA 3OO9A 4FIMA 4IO5A 4ZEDA 3Q25A 3VVFA 1NH8A 2XXPA 4DLDA 4F2QA 1QW0A 1GGGA 5I2KA 1JEUA 2FNCA 3IO6A 1H43A 3TTLA 3TCGA 1N0TA 2P0SA 4FJPA 2DE3A 4G4PA 2O7IA 3OMBA 3VE1B 3ODBA 3S9EA 1JVXA 1MXZA 1NFTA 1LFGA 2PVUA 3O9PA 1MQDA 4GD5A 3O97A 3RUMA 3T9VA 2CZLA 1MDQA 4YICA 1A54A 4F29A 2Z8FA 4ECFA 4QSDA 1UTHB 1OLCA 2VGQA 3LBSA 4JWYA 3C31A 5AA1A 2ESNA 4DIGA 3N5LA 3TQWA 3VLWA 2RF1A 1II5A 5HBCA 4F1UA 1LAXA 2A5TB 2QMWA 2O1LA 2Z8DA 4X9TA 5DYHA 4ISUA 5FHNA 1M5FA 5AA4B 4X1DA 5DEXA 1DMBA 1MXXA 3Q28A 3EHSA 1LCTA 2I49A 2OWSA 4ESXA 4BDLA 3MVYA 4QHQA 4R6YA 1B5HA 4ZECA 1AMFA 1H3DA 1ZMGA 2Y7IA 3SETA 2PT2A 3K01A 1A55A 1IXHA 1I6BA 1P99A 4GQOA 1SVXB 3FV2A 3S4UA 4KPTA 4YB5A 4FEBA 1ZLQA 5K2YA 2UYFA 3IAZA 3MWBA 3HV1A 4ZEKA 3PPOA 3KJ7A 3DP4A 1B3HA 4NF8B 3L6GA 1USYH 3SEXA 1M5BA 2DYXA 2CMOA 2ZYKA 4ZEBA 3ZKLA 2V3QA 5KDTA 5H8SA 2F7BA 3LSXA 1SI1A 3UN6A 4N6PA 5L9SA 2F7CA 4U21A 4ZZEA 3OO6A 1DTGA 1NNPA 4N13A 4PP0A 4RNSA 5DVFA 2PT1A 4JSOA 1Q35A 5TPAB 1B3FA 3RTWB 4DXBA 3KOSA 2NVUB 4DE8A 3MQ9A 4Z7EA 4NF5B 3SESA 4NF4B 1HSJA 1FTMA 1N7XA 1P1WA 1WDNA 4LVQA 4OWDA 4QSEA 3RTFB 2H98A 1VR5A 3MVXA 4RK9A 3B6WA 1OIBA 1PDAA 2H5YA 2REGA 5IAIA 4ZDMA 1B40A 2GRVA 4MH5A 1B7UA 3TAJA 4KYEA 1MXVA 1Y3QA 3LSWA 1B5IA 3K6WA 3MZ1A 1SYIA 3PUVE 4XKPA 3HHGA 1DPPA 1QJMA 1IXGA 2R71A 3DLNA 4YB6A 4BDQA 3PV0E 3U1OA 2Q2CA 3PPPA 2DE4A 3H6UA 3TELA 3EN3A 5ELVA 1I69A 2Z8EA 2H25A 4GIZA 3IB0A 4OFOA 4MBPA 1JQFA 4LZ8A 3GBAA 1ANFA 4Q0CA 2Q8JA 4XKRA 1WVJA 2I48A 3S9MC 2XXIA 4RYAA 3FXUA 4G68C 2REJA 3FJMA 2I4BA 1UTBB 1SQYA 2XXXA 1MY4A 4GFRA 1LB8A 3PMXA 4U1ZA 3ILUB 3SEYA 2ONKE 1B0HA 3Q29A 3TFLA 2XXVA 1N7WA 2VP1A 4ZE9A 2DWJA 1Y3NA 1SBPA 1H45A 2V3TA 3PMVA 5FHOA 5H8QB 3TTKA 3VVEA 4P0IA 4F1YA 2KLFA 1TWYA 1Y1ZA 2Z23A 3E9XA 3LSLA 1L5TA 1JW5A 3R6UA 4IO2A 1PB8A 4YKKA 3TTRA 2HXWA 3MBPA 4ZE8A 4YMBA 1A99A 1US4A 4TLLB 3MVZA 4U1OA 5TU0A 3IORA 5B7DA 5I59B 1SD3A 1N84A 4KR5A 5L9MA 3T93B 1JNFA 1GVCA 3T9XB 4QFPA 4R72A 2H99A 3VVDA 1B51A 1PB9A 1IXCA 4PFWA 5CI5A 5TP9B 4OETA 3IOTA 3B6TA 1Y9UA 3I3VA 4KCCA 3K2DA 1MY0A 1FQCA 1URGA 1ZKBA 2ALUA 1Z7NE 2Q89A 1B05A 3M3KA 3OEMA 3SDFA 3IX1A 1MDP1 1Y3PA 3IOVA 4C1TA 1IQ7A 4YU0A 3DP6A 1RKMA 2QJEA 4BDNA 2Y7KA 3D4CA 3U92A 3O6HA 3SEUA 1MQJA 1MPCA 3PPQA 1LB9A 3SKPA 1MQIA 3G3KA 4OHNA 3VXBA 4EDPA 4F3SA 3V83A 1FQFA 1IEJA 4H8IA 3I5OA 3KOTA 4NE4A 3B7DA 5L9OA 4H5GA 2DE2A 2ZMBA 4ZEIA 5CM6A 5I57A 1ZIUA 1PBQA 2OK2A 1OMPA 3PUXE 4OEUA 4WEDA 1SW1A 3G3FA 3FXRA 2V93A 4QRZA 1VFEA 3TQLA 3H03A 5AA2B 1XVYA 4IY6A 3IB1A 4RY1A 2Q9TA 4R75A 3TTMA 4E0WA 3K4UA 5KCJA 4YZZA 2OWTA 4DXCA 4GOTA 3ZKKA 1ZBMA 1URDA 1HSLA 2GFEA 2HCAA 2QMXA 1IUDA 3P7IA 4FECA 3C36A 4H6DA 2Y7PA 1GTKA 5H8QA 2FYIA 2YLNA 4GXAA 1MY3A 3PD9A 3KZGA 4HCYA 3PD8A 4X1BA 3H6VA 3VV5A 3PMWA 2V3UA 4FATA 5ICTA 5HM4B 2HQ0A 1D9VA 3CIJA 2F36A 4P0GA 1UIVA 2VD2A 3RY3A 4G68B 1EZOA 1EZPA 2I3WA 4OYVA 4XTCQ 1H44A 1O7TA 3QIMA 1GV8A 4ELQA 3VDFA 1TXFA 2XXTA 4U22A 5I59A 3OO8A 1BLFA 3G3JA 3KBRA 1Y1MA 3PPNA 2PMSA 4LUBA 3KGCA 2F6PA 4PFYA 2F7AA 3USDA 4F39A 4LP2B 1B46A 3GXAA 4R73A 4NWCA 1D4NA 4R6KA 1YCJA 3ILTB 5EHMA 3C32A 5I84A 4GF8A 4RJZA 2RINA 1O64A 1VSOA 1USYE 2F97A 1JEVA 3E13X 5CBRA 3RQTA 3THIA 2GH9A 3QXMA 4JB7A 3OELA 5TPAA 3A3UA 4JDFA 4ZS9A 2QS3A 4H1XA 3E4RA 1PEBA 4ELPA 3FVOA 1ZU0A 4EF2A 4G8MA 3B6QA 1MM6A 2V25A 4KFQA 4NTLA 3UA8A 5IKBA 4EXKA 4L17A 2H9BA 2PYYA 2NWJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F78A 3V5AA 1FBEA 4POXA 1P1OA 5DTBA 3VLUA 1US5A 2VD3A 2HAUA 1BKAA 2ONSA 1MQGA 5DEXB 3FUZA 1TFAA 1TFDA 3G3GA 3C33A 3KBZA 3G7WA 3T9UA 4U4XA 3R26A 1BTJA 2NUVA 2QVVA 3W15C 3HO7A 3HSTA 4XEQA 2RKMA 2DSFA 3MP6A 1B9JA 5I2KB 1IMCA 5CBSA 4TOZA 2HXRA 5DVJA 4P47A 5H8NA 1B3EA 2CZHA 3DP8A 3H3GA 2UYEA 1KA1A 2CEYA 2QS1A 2VHAA 2XX9A 3JYRA 2R6GE 3CI8A 2CZKA 4U4SA 1FTJA 4O3BA 3V89B 4IO7A 3RPLA 1MY1A 1CNQA 4NF8A 4NG7A 4PF6A 2XX7A 1XVXA 1MRPA 4EQBA 4PTKA 1JW1A 1XI6A 3CG3A 4BDMA 4XFEA 3EF7A 4G8NA 3QAXA 1NMUA 3O66A 3C4MA 2R9JA 4PETA 3FD3A 1S7YA 4O7IA 2Y7RA 2L5VA 1EYIA 3JV9A 2I58A 2XX8A 1QVSA 4GWOA 4O7MA 3V8XB 1FBDA 3O29A 2F35A 1NKXA 2W7YA 4DCYA 1FRPA 3CSGA 4Q30B 4M4GA 5F24A 3C9HA 3LSFB 4F3GA 3ECRA 2Y84A 4F31B 3TEPA 5TP9A 4LA9A 2AYSA 1QUKA 1MPDA 4F18A 5I58B 2OLBA 3A3CA 4OEUA 2GHAA 2XXKA 3H4ZA 3IOUA 3HN0A 3ISPA 4JWXA 5BUUA 4DDDA 5I58A 1FTLA 1NV1A 4PFBA 4NX1A 1B52A 4I8CA 2THIA 5IZ3B 2XD3A 4Z0IA 4FORA 1QKBA 4F19A 2WYKA 3TZAA 3K00A 1LCFA 3RT6B 3QUFA 2FVZA 4Q5TA 2Y5KA 3K6VA 3KN8A 3T22A 5I56A 1P1UA 2O51A 4R9GA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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