3TZAA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the antagonist (s)-2-amino-3-(2-(2-carboxyethyl)-5-chloro-4-nitrophenyl)propionic acid at 1.9a resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
publication title A new phenylalanine derivative acts as an antagonist at the AMPA receptor GluA2 and introduces partial domain closure: synthesis, resolution, pharmacology, and crystal structure
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tzaA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tzaA02
4ELRA 5AE4A 1Z7NE 3JYRA 3PUZE 1D4NA 4MFIA 2Y7IA 1USYH 2FA7A 4IO6A 1B4HA 1F9BA 4ZEIA 1Q35A 5CBSA 5I59B 1B3GA 4KI0E 3G3GA 3ONMA 4FJPA 1N76A 3VFJA 2QJEA 1B3LA 3TTRA 5L9SA 4G68C 5CBRA 1ATGA 2GH9A 3PD9A 3TUSA 4E0WA 5I2KA 1H43A 1LFGA 3MAMA 3N94A 2Q2CA 1XVXA 3MP8A 3LBSA 1N0TA 3LC8A 3RLFE 3OD7A 5CRYA 2PMSA 5IKBA 1OIBA 3E4RA 4DCXA 4LP2B 1GTKA 4EQBA 5CMMA 2F8DA 3C36A 4EXKA 1B3HA 3V5AA 2F36A 2PT1A 2AL5A 5ISUA 2I3WA 4F2QA 3SEWA 2B3BA 3OXNA 3KBRA 1SI1A 3TCHA 2DQVA 3Q28A 2F78A 2GHBA 3LUYA 3RTWB 5JK4A 3LSXA 4H67A 4NE4A 3FJ7A 1N04A 5A5XA 3RT8A 3H03A 3V8XB 4FEBA 2LAOA 4H0WA 2Y7KA 1IXCA 5EHSA 4ZE8A 4EQ9A 2P1SA 4YMAA 1ZU0A 2QPQA 3BKIB 3A09A 1B9JA 4G8HA 2YLNA 2FNCA 1IQ7A 1B52A 2UXAA 2VD3A 3FASA 2Q8JA 3QUFA 4KCDA 1JW4A 1MS7A 1NH7A 1BIYA 3DP4A 3FV1A 1UTHA 2BJJX 2XX9A 3IB2A 4NMYA 4RXLA 1QUKA 3SEYA 2UVGA 4ONYA 1SVXB 4LZ5A 5M2VA 1H44A 2PT2A 4NF8B 2V3UA 1LFIA 2Y7WA 3DELB 4XKQA 3G3FA 1NKXA 3S9MC 1WODA 4IO3A 1P1UA 2ZYOA 1A54A 5I56B 3MVXA 1BKAA 1LAXA 1LSTA 4F3SA 4PFYA 4XKRA 4IO2A 2RC7A 2ONSA 4IGRA 4ZEBA 3K1MA 1FW0A 4GLIA 3Q25A 3TPAA 1EH3A 3E13X 4GL8A 2QRYA 2DP8A 2O69A 3B7DA 1H3DA 4GWOA 4EF2A 3FD3A 4YKJA 2X7QA 5B70A 1MRPA 4DXCA 5H8QB 1T0KA 2F7CA 5I57B 3W9VA 1WVJA 3LSFB 1SYIA 4OESA 1MQDA 3WAEA 1BP5A 3RNNA 2O6AA 4F18A 3KSJA 4X48A 3FZVA 1MY2A 1ELJA 2UVJA 3SEXA 2RCAA 1GR2A 3V83A 2HZKA 3KFMA 3TDJA 3VXCA 4R75A 2YPNA 3U94A 1II5A 3IOTA 2XXHA 1OQGA 4ELOA 1MG1A 4P0GA 2DS9A 1RYOA 1JVXA 2ZXTA 4OERA 3RY3A 4BDOA 4NWDA 1A8FA 1QJMA 5CC2A 3KOTA 3MJNA 5AA2B 3CFLA 1UTBB 3K0VA 4LZ8A 5DTBA 5TU0A 3H7MA 1LAHE 3LSWA 1H76A 3IL1B 2DE2A 1OMPA 1SD3A 2A5TA 4PFWA 1B4ZA 3S4UA 4G8NA 4N07A 3MZ9A 1B5HA 3BFUA 2XXVA 4JWOA 1NNFA 4ZEFA 4DXBA 1P1OA 3UN6A 3U8QA 3OO7A 1MH3A 3CI8A 1FQDA 3MC2A 4LONB 4F39A 2QMWA 2A5SA 1IIWA 4PFTA 3TTMA 2OLBA 2DYXA 4F1VA 2H5YA 4XTCQ 1FTOA 5KZTA 2HQ0A 3K1NA 4H5FA 3ILUB 2ESNA 2PVUA 4JBZA 5I57A 3B6TA 1B3EA 1A40A 5JEIA 2OWTA 2O1LA 3ZKLA 1OQHA 4ZEDA 3VV5A 2GRVA 1P1QA 2DSFA 3MPKA 3U92A 3DP8A 1J1NA 4ISUA 2ONRA 4LVQA 3JZJA 4I8CA 4TLMB 5JTYB 5FHNA 1Z7ME 3MPLA 2QS2A 1RYXA 1JVYA 3F11A 3HO7A 2I4CA 2F6GA 3UP9A 3C35A 3S9NC 2I6EA 2I49A 4U4XA 1MQHA 4NF4A 5AA2A 3PD8A 1M5EA 1N7WA 2Z8DA 1IXHA 4F1YA 3SESA 5H8SA 4HTGA 3ILTB 1USYE 3QUJA 1MM7A 3A3UA 5I2KB 4Q30B 3O28A 1LBCA 3KOSA 3PMXA 1MY1A 2Q88A 5EYFA 4JWXA 2DWAA 2XXPA 3MWBA 3MP1A 3VLVA 2QSXA 1Y1MA 4YB7A 2P2AA 3FJMA 3FVKA 4EUOA 2OWSA 1XHYA 4EDPA 1L5TA 4Q0CA 3C4MA 2AIXA 4H5GA 3IB1A 3QK6A 1OLAA 1DOTA 4QFOA 2ZYKA 4IO4A 3TMGA 4F19A 3KJTA 3TEPA 1O63A 4R6HA 2I0CA 2FYIA 3T22A 2I0BA 2IA4A 1DPPA 5B7DA 3HN0A 4ZS9A 5DYHA 5JTYA 3TODA 2HAUA 5ITOA 4WXJA 4YB5A 1MM6A 2WKYA 2UYEA 5DT6A 3C33A 2KLFA 4X1BA 1EZOA 3OSRA 3OO6A 2V25A 3CIJA 1R9QA 2I3VA 3IAZA 4MLQA 2I48A 2VD2A 3CG1A 5KDTB 1EZPA 3S9LC 2O1MA 5L9MA 3KSXA 1MDQA 1UTHB 3M3LA 1D3KA 3TFLA 1NL5A 3H6TA 3IORA 3W9WA 3K2DA 4KCCA 1MXXA 2O68A 4ZZAA 2YJPA 1SW5A 3THIA 1LCTA 4F2OA 1SW1A 3I3VA 1IXIA 4H8JA 3VVFA 2OCUA 4FEDA 3K02A 3HPIA 5ELVA 1US5A 3H4ZA 1ZBMA 5EHMA 5F7VA 4U23A 3FJGA 4I1DA 2P0SA 1R1NA 4U22A 1XC1A 4IB2A 1CE2A 3I5OA 1PC3A 1B32A 1LAFE 2W7YA 4XXUA 4R72A 1DTZA 3IB0A 3SKPA 3HSTA 1LAGE 3TELA 2H4IA 4TOZA 4HW8A 4JSOA 3U1OA 1MQIA 4OHNA 4IO5A 1GVCA 4R2FA 1POY1 3CFXA 4F22A 3C31A 1JEVA 4AB6A 1MXYA 4F29A 2GFEA 1YPNA 4YAHX 2ZNSA 2ONKE 2ALUA 2ZMBA 3PGFA 1XT8A 3L6GA 4DZ1A 1S9TA 3FXRA 3WAFA 2RCBA 2XXYA 2DVZA 2UVIA 4ELPA 4GRKA 1B05A 4H8IA 4KYDA 1MPDA 5KDTA 3QAXA 4R74A 5H8NA 1DTGA 1B7HA 2THIA 3M3FA 2PX1A 5CI5A 3UK4A 4OFLA 3TTLA 4I62A 2RKMA 1M5DA 4F3GA 4IO7A 2VOZA 3N6TA 3G3IA 4KPTA 1DPEA 3EHSA 3VDFA 2XD2A 1IZ1A 4ESXA 4EXLA 3G3KA 5BWJA 4BDMA 4XIGQ 1MXZA 3B6QA 4U2RA 1PEBA 3SEUA 4N13A 1N7XA 4F3PA 1MXUA 1NNTA 5TP9A 3IOVA 3VXBA 4EF1A 3PMWA 4NTLA 3FATA 4UACA 4QFLA 3C34A 3SDFA 4JSDA 1KWHA 2A5TB 3LSLA 1MY0A 4R6KA 3K00A 1QVSA 2V3TA 1P1WA 3DLNA 3RUMA 2D21A 5AA4A 4Z0IA 4HCYA 4KYEA 3EQ1A 2DE3A 2XD3A 4O3AA 3T9UA 2Q89A 4O3BA 4OETA 3ODBA 3PV0E 3KEIA 5L8DA 2Z23A 4GXSB 4NF6A 3P7IA 1PB9A 3K6UA 4OXVA 4GF8A 3K6WA 2DWIA 2PYYA 1A8EA 2ZNUA 3OEKA 4C1UA 5ITPA 2Z22A 2I58A 4KYSA 2XXRA 3QYTA 1SYHA 1NFTA 1JNFA 4LUBA 3Q26A 2XXIA 2F6PA 4UA8A 3KGCA 3EHTA 4OYVA 4RPOA 5CMCA 1D9VA 2Y84A 3UORA 1B7ZA 3KN3A 3CSGA 3KN7A 4PETA 3TCFA 2V93A 3MW0A 2R6GE 2NWJA 1A55A 2ZYNA 1MQJA 4LATA 3O9PA 1ZTYA 4RY1A 2DXYA 4WEDA 4RK2A 3TQWA 3D4GA 3EF7A 5IAIA 1MY4A 4YZZA 4YMBA 4JDFA 1B7UA 1RKMA 3MVZA 3GZGA 4NF4B 4YKKA 3O6HA 2Q9TA 2F5XA 4QSDA 1SI0A 4NF5B 3O6IA 3CFZA 1P1NA 1NMUA 2REJA 2F34A 4GVOA 4RYAA 2AL4A 3JV9A 5AA1A 3IO4A 3K6VA 1N3WA 3GBAA 2DOJA 1JETA 4HCWA 4OEUA 4Q5TA 2Z8EA 3VVEA 3MUQA 2B3FA 1FCKA 1N3XA 1JW5A 2XXUA 3H6UA 1TFDA 5I2NB 4QSCA 4P11A 3CSBA 3PUWE 2HCAA 1I6AA 1TT1A 3PUXE 2G93A 2HAVA 1YAEA 1Q1KA 4ZDMA 1MQGA 1FTMA 2DWHA 1I69A 4F3BA 3K1PA 4DCYA 4BDLA 3Q29A 1EU8A 3IO6A 2O7UA 1D9YA 4OMBA 2HXWA 5HPQA 3QXMA 4YKPA 3TCGA 3DP6A 5LOMA 1P99A 2OK2A 5DEXA 4U4SA 5DVFA 1OVBA 4BLAA 1TXFA 1Y4CA 4ECFA 4JXIA 1B0HA 1Y3QA 2CZLA 2XHDA 3PPOA 3IJOB 1AIVA 3ZKKA 3OOAA 4QFPA 3FV2A 3BBRA 3CRBA 3RQTA 4H1XA 3W15C 1IUDA 4GIZA 3M8UA 3PPNA 1N84A 5DVIA 4WKMA 2X26A 4X9TA 3IOWA 5I58B 1Y3NA 2UVHA 4NF5A 3TTKA 2B65A 4FECA 3H6WA 4POWA 1HSEA 4G68A 4NEDA 1CB6A 1UIUA 4MH5A 2UYFA 3S2VA 5I2NA 2VGQA 2QS4A 2HZLA 1A99A 4OQOA 3QIMA 4IGTA 2H9BA 4TLLB 3M3KA 4C0RA 2XX8A 1URSA 4OEVA 3G3HA 5K2YA 1ANFA 4PP0A 1URGA 5TPAA 4DE8A 2HFBA 2QS1A 1PB8A 2D3IA 4QSEA 2NXOA 2VP1A 1B1HA 5ICQA 4OFOA 3KN8A 4N6PA 5FHMA 4DIGA 5DVJA 3KJ7A 1LB8A 2CMOA 1ZJLA 3PPQA 1LCFA 4AB5A 1O7TA 3MQ9A 5K2XA 3MBPA 4KQPA 4PE5B 1NH8A 4ND9A 4GQOA 1AL3A 1PB7A 2OZZA 4GOTA 2IEEA 4TQUQ 4QFKA 2E0SA 5H8NB 5I58A 4LQ2A 2PBWA 1ZLQA 4FATA 1PDAA 2H99A 4U21A 3OELA 2XXQA 3USDA 3MZ1A 4LA9A 2VHAA 2RC9A 4BDQA 3T96B 4OVJA 4O3CA 4ZE9A 4KD5A 4WEPA 2H98A 4KHZE 4DXUA 1PBQA 5KCJA 1QUIA 3FXQA 3FXUA 5ICTA 5CMKA 3R26A 5TP9B 1WDNA 2REGA 3A3CA 1ZMGA 3N5LA 5AA3A 3VLWA 3AXFA 4G4PA 2ZNTA 4R6YA 3RPWA 5I84A 3TTNA 1FTKA 1O64A 1OVTA 2R71A 3L6HA 1VR5A 5AA4B 4GD5A 3K6XA 1B5IA 3PPPA 1MXVA 1NNPA 3OENA 1FQEA 2M8CA 1QKAA 1HSLA 3O29A 4Z7EA 2HEUA 3T93B 4Q8RA 4OENA 4G77A 4RA1A 4R73A 4NF6B 3G3JA 1MXWA 3PMVA 1FTJA 3GXAA 3O97A 1VSOA 4QFNA 4E0XA 3RTFB 1VFEA 3TZAA 3MVYA 5FTIA 2Y7PA 4BDNA 5I59A 4QHQA 3HHFA 3N6UA 4G2ZA 1OLCA 1B3FA 1BLFA 3IK6B 1NNKA 3DM0A 1I6QA 4MBPA 4BDRA 4F1UA 4DDDA 4U1OA 1FTLA 2RINA 1GGGA 4QRZA 2NVUB 4XKNA 4THIA 5L9OA 3RT6B 2NUVA 4PQJA 1TWYA 5AA2D 4M4GA 3CG3A 1LBBA 3T66A 1A7LA 2G29A 2DVCA 2XX7A 2QMXA 4KFQA 1EZ9A 2RC8A 3PUYE 4FORA 2I4BA 3TQLA 3OMBA 5J1DA 3OSQA 1US4A 2X7PA 1VE4A 1AMFA 1AH5A 2XXTA 3IJXB 1M5CA 1IITA 2V3QA 1LB9A 4GFRA 2QL3A 1XOCA 4DLDA 5CM6A 2F7AA 3T9VA 5H8HB 1ZKBA 1B40A 1XVYA 3PPRA 3MP6A 4OFJA 1MY3A 3T9XB 3ZS6A 4R9GA 3UA8A 1IXGA 4OTEA 3TAJA 4P0IA 5FTHA 3ECRA 3S9EA 1FQAA 3IX1A 3CVGA 3FIRA 3OEMA 2AYSA 1Y4TA 3UGWA 4RJZA 3K4UA 1Y20A 3IOUA 4PFUA 2F7BA 3MVWA 2XXXA 1B6HA 5DEXB 3N26A 3I6VA 5H8FB 3RGYA 3EHUA 3FUZA 1BTJA 1MPBA 3VVDA 3T9HB 3CR9A 3R7XA 2E1SA 2Q2AA 4L17A 3FGSA 1DMBA 2R9JA 4JB7A 4ELQA 2O7IA 1LFHA 1B58A 4NF8A 1QW0A 1HSJA 3R6UA 3H3GA 1FQFA 3FVNA 1QKBA 5F1QA 3C9HA 3QSLA 3EN3A 1B1XA 4NWCA 1MPCA 4R2BA 5I56A 1FQBA 2O51A 4G68B 3MZBA 1B51A 1B46A 1M5BA 3K01A 5H8HA 4H65A 3G7WA 1YCJA 4ZEKA 2H25A 3U72A 1FQCA 1TFAA 1B5JA 5FHOA 5HBCA 3U93A 4GL0A 4IY6A 3E9XA 4YKIA 3GLBA 3D4CA 3IR1A 1Y3PA 5TPAB 1MDP1 3ZSFA 3SEVA 1JW1A 1GV8A 4MF3A 3HHGA 2DWJA 5HM4B 5H8QA 2ANJA 4ZZEA 1POTA 1SW4A 5H8FA 4FIMA 1DSNA 1VFDA 2OJTA 4LQ5A 4F31B 4R9FA 3KG2A 3TKDA 3SERA 3E3KA 2F35A 3BFTA 1URDA 1B2HA 3TYHA 2Z8FA 1JEUA 3FVOA 4ESWA 3FVGA 1LLSA 1UQWA 2V84A 3HCQA 4IY5A 1M5FA 4OZ9A 2ABHA 3LR1A 1SW2A 4HS7A 4RPNA 3UIFA 3O6GA 1YTVA 3VE1B 3SETA 3PUVE 4XKPA 3H6VA 1S50A 4I9DA 4EQ7A 2NOOA 2RF1A 3O66A 3EPEA 2O84X 1SQYA 1UTBA 3OO8A 4RK9A 2D5WA 3V89B 1ZIUA 2ZYMA 3B6WA 5KCJB 4YICA 4FE8A 4AQ4A 4LZ7A 2QS3A 1LGBC 2XXWA 3OO9A 5BUUA 1SBPA 4ZECA 4U1ZA 3VLUA 4JWYA 2DE4A 4K3FA 1XS5A 2DXRA 4YB6A 4MLVA 1QULA 2F97A 4X1DA 4H6DA 3Q27A 4KR5A 1JQFA 1UIVA 1Y9UA 1B0LA 3PU5A 4C1TA 1AOVA 3GBBA 3KZGA 4QF9A 1S7YA 1I6BA 1H45A 2GHAA 5CMBA 2Y7RA 3O2AA 3C32A 4GXAA 4G8MA 4OWDA 1R6ZA 1IEJA 1QUJA 3HV1A 4M1VA 5A5XB 1PBPA 4FAJA 4RNSA 1Y1ZA 2OBGA 1SDXA 1R9LA 3H06B 1MH4A 3RN8A 4POXA 4YU0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ELRA 5AE4A 1Z7NE 4AS4A 3JYRA 3PUZE 1D4NA 4MFIA 2Y7IA 1USYH 2FA7A 4IO6A 1B4HA 1F9BA 4ZEIA 5IM2A 1Q35A 5CBSA 1NV4A 4HE1A 5I59B 1B3GA 4KI0E 3G3GA 3ONMA 4FJPA 1N76A 3VFJA 2QJEA 1B3LA 3TTRA 5L9SA 4G68C 5CBRA 1ATGA 2GH9A 3PD9A 3TUSA 4MNPA 4E0WA 5I2KA 5EYHA 1H43A 1LFGA 3MAMA 5EQ7A 3N94A 2Q2CA 1XVXA 3MP8A 3LBSA 1N0TA 3LC8A 3RLFE 3OD7A 5CRYA 2PMSA 3A29A 5IKBA 1OIBA 4PTKA 3E4RA 4DCXA 4LP2B 1GTKA 4EQBA 5CMMA 2F8DA 1FRPA 3C36A 4EXKA 1B3HA 3V5AA 4O8MA 2F36A 2PT1A 2AL5A 5ISUA 2I3WA 4F2QA 3SEWA 2B3BA 3OXNA 3KBRA 1NV7A 1SI1A 3TCHA 2DQVA 3Q28A 2F78A 2GHBA 3LUYA 3RTWB 5JK4A 3LSXA 4H67A 4NE4A 3T0JA 3FJ7A 1N04A 5A5XA 3RT8A 3H03A 3V8XB 4FEBA 2LAOA 4H0WA 2Y7KA 1IXCA 2P3NA 5EHSA 2XXKA 2XA5A 4UABA 4ZE8A 4EQ9A 2P1SA 4YMAA 1ZU0A 2QPQA 3BKIB 3A09A 1B9JA 4G8HA 2YLNA 2FNCA 1IQ7A 1B52A 2UXAA 2VD3A 5EQ8A 1LBVA 3FASA 1FJ6A 3IFAA 2Q8JA 2FHYA 3QUFA 4KCDA 1JW4A 1KZ8A 1MS7A 1NH7A 1BIYA 3DP4A 4NQ8A 3FV1A 1UTHA 2BJJX 1FPGA 2XX9A 3IB2A 4NMYA 5LDZA 4RXLA 1QUKA 3SEYA 2UVGA 4ONYA 3QMFA 3T1BA 1SVXB 4LZ5A 5ET5A 5FBPA 5M2VA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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