1EH3A

R210k n-terminal lobe human lactoferrin
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
b'RSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLDWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIKESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure and iron-binding properties of the R210K mutant of the N-lobe of human lactoferrin: implications for iron release from transferrins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
source organism Homo sapiens
molecule tags Metal transport
total genus 107
structure length 324
sequence length 324
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-02-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1eh3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1eh3A02
2XX7A 3PMWA 1SW5A 4OHNA 1DPPA 4KFQA 2OBGA 4OESA 2DWHA 2A5TA 4EF2A 4KR5A 5H8FA 3THIA 1XHYA 4F22A 4EQ9A 2I0CA 1DMBA 1IQ7A 3G3FA 2RC8A 4JBZA 2F5XA 4XXUA 4F2QA 1JEVA 3VLUA 3I5OA 2D21A 2B65A 4YAHX 2E0SA 2Q89A 1ELJA 1ZKBA 1US5A 1QULA 4IO7A 4N13A 4JSOA 4IB2A 3QUFA 2R71A 3U8QA 3K2DA 4H5GA 1DOTA 3A3UA 3SEUA 1Y20A 4G68B 1NNKA 4XIGQ 2H25A 3O9PA 4LVQA 3MBPA 1LBBA 4BDRA 4U1OA 2DXYA 1LCTA 3OXNA 3GXAA 3CVGA 4ND9A 4R2FA 2ZNTA 3TTRA 2A5TB 4JDFA 1T0KA 1TFDA 4GOTA 4OXVA 1O64A 5DYHA 5H8FB 2Y7KA 2ZNUA 4N07A 2DOJA 2UVGA 2Z8EA 4BDQA 1JW5A 4NE4A 4YMBA 4P0IA 1H43A 1A40A 1QKBA 1B46A 3TCHA 1MQIA 4R72A 1XT8A 1N3XA 4QFKA 2AL5A 3KN3A 5H8QA 1URSA 2XHDA 2ZMBA 4U23A 4DXUA 1SI1A 1ANFA 2CMOA 4PFYA 4JWOA 1SQYA 2W7YA 4LATA 3K01A 5IAIA 4IGTA 3N5LA 3TCFA 3PUWE 4GL0A 5F1QA 2V3QA 4GXAA 1NFTA 2NXOA 1ZU0A 1N76A 1PBQA 3SEXA 1RKMA 2Y7IA 1B2HA 4LQ2A 3KSXA 1QW0A 3N6TA 3RTFB 1MPBA 2Z8FA 4IO4A 4YKKA 3CSBA 4RXLA 2O1LA 2PX1A 1OQHA 1TXFA 4OFLA 3E9XA 4G8HA 4QSDA 1MXXA 2Z22A 1OLAA 4JB7A 1Y4TA 3FJGA 3MZ9A 3W9VA 3GLBA 3H06B 1GTKA 2AL4A 3VLWA 1IXGA 3FGSA 3RNNA 2THIA 3PUVE 1NKXA 1M5CA 2V25A 4HTGA 4ISUA 5ICTA 4BDLA 2I4CA 3TQLA 3OO6A 4MLQA 2X7PA 1Q1KA 1A54A 1P1UA 2PYYA 1Y1ZA 2ZNSA 1PBPA 1RYOA 4G8NA 2XXPA 2P0SA 1NNFA 1P99A 4U4XA 4F18A 5I2KA 3O6GA 4IO5A 3AXFA 3PUZE 1SDXA 4Z0IA 4R9GA 1PB8A 4M4GA 3HHGA 4FECA 1IXIA 1MQHA 1FTLA 2HZLA 3M3LA 2OK2A 3N94A 4NF4A 3G3JA 2H98A 3K4UA 3FXUA 3T9UA 2ZYOA 2ALUA 1VFDA 1MY3A 5I84A 3TTNA 2UVHA 3PMXA 1LB9A 1M5BA 4R9FA 3H6WA 3LBSA 4KD5A 5CMCA 2ZYMA 4I8CA 3G3IA 1Y3PA 1M5FA 3VXBA 5AA1A 1H76A 4RNSA 4ELQA 3PV0E 4IY6A 3VE1B 4FAJA 1IXCA 2R9JA 1AIVA 1URDA 3CSGA 1Z7NE 4H1XA 2M8CA 4HW8A 4XTCQ 1BLFA 3OSQA 4LP2B 3TUSA 4Q30B 3S9EA 3IJXB 3PPOA 4RJZA 4WEDA 4EQ7A 3LSLA 1JEUA 3IO4A 5JK4A 3DP6A 3S9LC 2YPNA 1SW4A 3IOUA 5I2KB 1GGGA 2DVZA 2OZZA 4G68C 4XKQA 1II5A 2F7AA 5I56B 4GXSB 3OO8A 3Q28A 5AA2D 3T66A 4OYVA 1Z7ME 4R74A 3FVGA 1IUDA 4OMBA 4H8IA 5BWJA 4ELOA 4EXLA 3MC2A 4NTLA 3PMVA 4FEBA 3VLVA 3VXCA 4KYDA 4R6YA 4DIGA 3UORA 1MRPA 2O84X 3FV2A 2P1SA 3MP6A 3K6VA 4QFPA 3SEWA 3C9HA 4GLIA 4E0XA 1IZ1A 3MPKA 2PBWA 3U1OA 4YKIA 3KN7A 1B5JA 2FA7A 2NWJA 3FZVA 1IIWA 3LSWA 2UYEA 5H8NA 3R26A 4H0WA 3C32A 3QIMA 2VD2A 2XXYA 5KDTA 3RLFE 2DYXA 2XXTA 4THIA 3MAMA 2Y7WA 3FV1A 3V83A 4KCDA 5KCJA 3HCQA 5BUUA 2Z8DA 2REJA 3RT8A 5DEXA 1WVJA 3FVKA 5FTHA 5TPAA 1JNFA 3O66A 4QSCA 3K6WA 5IKBA 4O3CA 2P2AA 3FATA 1BP5A 4ZE8A 5I2NB 4WEPA 4Q0CA 2ZYKA 3V89B 3MVWA 4AB6A 1N3WA 3H3GA 1GVCA 1MXVA 1O7TA 2QJEA 3Q25A 1B3LA 4R6HA 1MXWA 5DVJA 3UN6A 4OENA 3IOVA 3FVNA 4JWYA 2BJJX 2DXRA 1LFGA 4U2RA 1BTJA 3C35A 1BIYA 2XX9A 3BKIB 4LONB 5H8HA 2UXAA 4JSDA 1ZLQA 2GHBA 1DSNA 2XXWA 4KCCA 1SBPA 2G93A 3U72A 4RY1A 3U92A 2CZLA 5A5XA 3GBBA 1WDNA 1NH8A 3KN8A 5ITPA 3T93B 3IJOB 1UTBA 1S7YA 5H8NB 1ZMGA 1MY0A 1FW0A 4RK9A 2IA4A 3KG2A 4TLMB 1YCJA 4WXJA 2F34A 3WAEA 5KCJB 4Z7EA 2OWTA 4FIMA 4F3SA 2HCAA 1B3HA 5DEXB 4MH5A 5TPAB 1PDAA 3UK4A 2ESNA 1B0LA 2O51A 4RPNA 3H6UA 2UVIA 1D3KA 2HQ0A 1P1NA 1FTKA 1O63A 1TWYA 3E3KA 3S9NC 3K1NA 3IR1A 4DCXA 4YB5A 4QFNA 1Y4CA 2OWSA 1LAXA 3OELA 5AA4A 3MWBA 3RGYA 3FD3A 5FTIA 5FHNA 2HEUA 2DSFA 3OEMA 1CB6A 3IB2A 1DTGA 1PB7A 3ZSFA 3QYTA 3EN3A 2GFEA 2AIXA 3CI8A 5H8HB 5DT6A 3S2VA 3FVOA 4KPTA 5I58A 1SI0A 3I6VA 5A5XB 1UTHA 4ZS9A 2XXUA 4X1DA 2I3VA 1UTBB 3RN8A 1XVYA 3IOTA 2XD3A 1F9BA 3LSFB 1B5IA 5CMBA 3QSLA 2HAVA 1I6BA 5EHMA 1B0HA 1OLCA 4LZ5A 1JW4A 3I3VA 3O28A 1MDP1 1BKAA 3V8XB 3O97A 2ANJA 4UA8A 3RT6B 1B05A 3IL1B 2V84A 3TAJA 3CIJA 2F8DA 1S9TA 3MW0A 3OO9A 4ZE9A 4F29A 4DE8A 1B3GA 3VDFA 3MP8A 5AA4B 1NH7A 4ZZAA 1NL5A 2DP8A 4M1VA 1HSEA 3LR1A 1L5TA 5ITOA 3KZGA 1N7WA 4RK2A 3HN0A 3K00A 2RKMA 3B6TA 2I58A 2QPQA 1Y1MA 2NOOA 2H4IA 1XVXA 4BDNA 4OEUA 3FJMA 4F1UA 1LB8A 3TQWA 5I58B 3RUMA 2ZYNA 1UTHB 5EYFA 5CC2A 1XC1A 3DP8A 1MY1A 4QFOA 2DWJA 3KSJA 4F2OA 3ONMA 1B1XA 2HZKA 5J1DA 3O6HA 5H8QB 1FQDA 4ONYA 3BFTA 3VVEA 3HHFA 4ZEDA 1MDQA 3QK6A 3H6TA 3PUYE 2QS3A 3IB1A 3KJ7A 3M3KA 3PPPA 1P1QA 3UGWA 3TTKA 3Q29A 2QS4A 3ODBA 5AA2A 3A09A 4GVOA 3U93A 1QKAA 1OVTA 3CFLA 3KOSA 4TLLB 4EQBA 2RC7A 2PMSA 1B1HA 4GQOA 3MP1A 1US4A 3FASA 5DVIA 1N04A 4EF1A 2I0BA 1Y3NA 5CBSA 4OQOA 1USYE 3UIFA 3SEYA 3U94A 3G3HA 4MFIA 4F31B 1ZBMA 1LSTA 4YKJA 1B5HA 2ONSA 3EHUA 2Q2AA 2D3IA 4F3GA 2XXRA 1B51A 2RCBA 2Z23A 2I4BA 3DELB 3RPWA 4YZZA 3RTWB 1FQAA 4ZEFA 1I6AA 5DVFA 3CR9A 3KEIA 3TFLA 3H7MA 1EH3A 4L17A 4QF9A 5HPQA 4YU0A 5EHSA 2F35A 3PPRA 4DZ1A 2DWIA 4POWA 4NMYA 5CMKA 1B32A 1P1WA 5B70A 2PVUA 4RA1A 1B7UA 1TFAA 4UACA 4U22A 1D9YA 1LLSA 5L9MA 1D4NA 5AA2B 2VHAA 3TTMA 3ZKKA 5ISUA 1I69A 3EQ1A 1A8EA 2QMWA 3MVYA 2YJPA 4YICA 3VV5A 4IGRA 4ECFA 4XKNA 3OMBA 2ONKE 2XX8A 2GHAA 2QRYA 2X26A 5CRYA 4ELPA 3SESA 4BDMA 3CRBA 3H4ZA 4NF4B 5FHOA 3K6UA 4F19A 1ATGA 3OSRA 4F3BA 3SKPA 1R9LA 4K3FA 5M2VA 3FJ7A 3QAXA 3WAFA 4O3AA 5L8DA 3ILTB 3Q27A 4IO6A 5I57A 1LFHA 2OCUA 3SERA 3FXRA 4OFJA 4KQPA 2Y7PA 2I49A 1PC3A 1N0TA 3VVFA 1SVXB 3IORA 1SYHA 3JV9A 3KBRA 4YKPA 3TODA 3FUZA 2XXHA 4F3PA 4KHZE 2QL3A 2RCAA 1RYXA 4AQ4A 4LZ7A 4QHQA 5H8SA 2NUVA 4ZEIA 4OERA 2O6AA 2RC9A 1MM7A 4G2ZA 4QSEA 2XXXA 1I6QA 5JTYA 1MQDA 4JWXA 1VFEA 4F1YA 4YB6A 3RY3A 3HV1A 4H8JA 4I62A 4TQUQ 3OO7A 3G3GA 3O6IA 4TOZA 4XKPA 1B4HA 2HAUA 1R9QA 1QVSA 2QSXA 1JQFA 1ZIUA 2B3FA 2F7BA 4NF6A 4KYEA 2Y7RA 3BBRA 4LZ8A 1NNPA 4G77A 4X9TA 3C31A 3EHTA 5B7DA 2AYSA 2ABHA 1M5EA 3LSXA 2A5SA 4U21A 1USYH 1LGBC 1AMFA 4ZECA 4H65A 2D5WA 1FQCA 4G4PA 1MG1A 5DTBA 5K2YA 5AE4A 4R75A 4IO3A 3BFUA 1MH3A 4ZZEA 2PT1A 4H67A 1LAFE 3E4RA 1ZJLA 3G3KA 1H45A 4GFRA 4X1BA 3GBAA 2VD3A 4E0WA 2F36A 2O1MA 3MPLA 4HCYA 2V93A 5KDTB 4WKMA 1FTMA 1NMUA 1JW1A 5JEIA 1MH4A 5JTYB 2FYIA 3TKDA 1URGA 4POXA 1B58A 2Y84A 2VGQA 4H5FA 1POTA 3TTLA 4NF5A 5KZTA 4NWDA 3M8UA 3MZBA 4GF8A 4ESWA 3CG1A 1Q35A 1MY2A 3VFJA 4LA9A 1GV8A 4Q8RA 4NF6B 2R6GE 2F78A 3FXQA 2DE3A 2DE2A 2VOZA 5F7VA 1MQJA 1N84A 1MXZA 1EU8A 2O68A 3K02A 4R2BA 2O69A 2V3UA 4ZEKA 1AH5A 3R6UA 2XXVA 4F39A 1H3DA 3PPQA 4GWOA 3ECRA 2HXWA 1UQWA 3UA8A 4R73A 2DE4A 1FQFA 3OEKA 4R6KA 3IAZA 4YB7A 1FTOA 1PEBA 1JETA 1DPEA 4NEDA 2PT2A 3EHSA 2IEEA 3PU5A 3TPAA 1FQBA 1VE4A 4LQ5A 5L9OA 1FCKA 3VVDA 2I3WA 4FATA 3TEPA 3A3CA 1JVYA 3PD8A 2OJTA 4PFUA 4NF5B 5K2XA 3TZAA 3KJTA 3C36A 1AL3A 1VR5A 5LOMA 2Q88A 3ZS6A 1QUKA 4KYSA 3IO6A 3K6XA 4FEDA 1KWHA 3QUJA 1B6HA 3K1MA 4PFTA 1B9JA 2X7QA 3SDFA 4OZ9A 1HSLA 4Q5TA 4C1TA 1LAGE 3CFZA 1QJMA 5L9SA 3MZ1A 1LBCA 3IOWA 4PP0A 3GZGA 4PQJA 3O29A 3IK6B 4MBPA 1UIVA 4C1UA 3TCGA 5ELVA 3EPEA 1J1NA 1LAHE 2OLBA 3K0VA 1YTVA 1XOCA 1A8FA 5TP9A 1FTJA 1S50A 3TDJA 1XS5A 3F11A 4OETA 4DXBA 2LAOA 3IB0A 4ESXA 1R1NA 2F7CA 3ILUB 3EF7A 2E1SA 5HM4B 1MPCA 1Y3QA 3KFMA 3B7DA 3TMGA 4HCWA 3K1PA 4EDPA 4YMAA 1NNTA 3MUQA 2HFBA 3MVXA 5CBRA 1OIBA 1QUJA 2G29A 3FIRA 4GIZA 5CM6A 1A7LA 1MY4A 1OQGA 1IEJA 3M3FA 4NF8A 2O7IA 3CFXA 4MF3A 3E13X 4XKRA 4IO2A 5I56A 1B4ZA 4O3BA 3QXMA 4OEVA 1H44A 1LFIA 4EXKA 2F97A 2I48A 1EZPA 4X48A 1WODA 3HPIA 3DLNA 4I9DA 2QS2A 4RPOA 2GH9A 1QUIA 5AA3A 5CI5A 4ELRA 4EUOA 1JVXA 3JYRA 3TELA 3N6UA 3IX1A 5TP9B 3S4UA 1MXUA 3H03A 4DDDA 1MXYA 4BDOA 1B40A 3T96B 2DS9A 2XXQA 1VSOA 1DTZA 3Q26A 2KLFA 4AB5A 3G7WA 4IY5A 3DP4A 4OTEA 4FORA 1TT1A 3PPNA 3SETA 1B7ZA 4HS7A 1M5DA 4NWCA 2GRVA 3RQTA 1POY1 2RINA 2QMXA 3OOAA 2B3BA 3UP9A 2H99A 3LC8A 3D4GA 3JZJA 5I59A 2O7UA 3USDA 1B52A 3T9HB 3W15C 2YLNA 3CG3A 5TU0A 2V3TA 4BLAA 4H6DA 1CE2A 1EZOA 4N6PA 4KI0E 2F6PA 2NVUB 4NF8B 2Q2CA 4RYAA 3C4MA 5CMMA 3HO7A 3C33A 3O2AA 3B6QA 2VP1A 5HBCA 3PUXE 3N26A 2Q9TA 1OMPA 4DXCA 1LCFA 3OENA 1AOVA 3W9WA 5I2NA 3V5AA 1SYIA 1SW1A 2UYFA 2DVCA 1GR2A 2Q8JA 3SEVA 1FQEA 3T9VA 3KOTA 3PD9A 2H9BA 4JXIA 3H6VA 4PETA 4P11A 4G8MA 1OVBA 2XD2A 4OFOA 4OWDA 3MQ9A 3ZKLA 4U1ZA 1B3EA 3D4CA 1YAEA 1ZTYA 3L6HA 1B7HA 1PB9A 3KGCA 4FJPA 1SD3A 3C34A 4GRKA 2DWAA 1SW2A 1A99A 1MQGA 2REGA 2F6GA 1P1OA 3PGFA 4FE8A 5I59B 3T22A 2I6EA 3L6GA 4GD5A 1EZ9A 4F1VA 2XXIA 1Y9UA 4C0RA 3R7XA 3T9XB 3TYHA 1UIUA 1N7XA 1A55A 2QS1A 2FNCA 1MPDA 1IXHA 2ZXTA 4P0GA 4DCYA 4I1DA 3MVZA 2RF1A 5FHMA 2ONRA 2UVJA 3HSTA 4LUBA 2WKYA 4U4SA 1B3FA 4PFWA 3P7IA 4QRZA 2DQVA 4OVJA 3DM0A 3S9MC 4ZEBA 5I57B 1HSJA 1MM6A 1D9VA 5ICQA 4DLDA 3MJNA 4QFLA 1IITA 3OD7A 4G68A 4MLVA 4GL8A 1R6ZA 3B6WA 2H5YA 1MS7A 4ZDMA 3LUYA 4PE5B 1YPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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