1EH3A

R210k n-terminal lobe human lactoferrin
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
RSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLDWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIKESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure and iron-binding properties of the R210K mutant of the N-lobe of human lactoferrin: implications for iron release from transferrins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
total genus 107
structure length 324
sequence length 324
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-02-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1eh3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1eh3A02
1NNFA 3CSGA 4F2QA 1MQDA 4ECFA 3H03A 4F2OA 3L6GA 2XXVA 4NMYA 2E1SA 4IB2A 3CIJA 4WKMA 3WAEA 2RC8A 1M5BA 4H8IA 2XD2A 3RT8A 2M8CA 3FIRA 1TWYA 4QHQA 3G3IA 1WODA 3CG3A 4U2RA 5FHNA 4KFQA 1QUJA 3ILUB 5H8NB 5CM6A 1WVJA 1Y1MA 2ONKE 4DXCA 4N13A 1DTZA 4ZEIA 3UORA 2Z8FA 2RCBA 3IOVA 3QAXA 3DP6A 3VVFA 3BKIB 4JB7A 4NF4A 5CC2A 3V83A 3IJXB 4OXVA 3N5LA 4BDQA 4BDMA 2H98A 4RK9A 4IO5A 3IR1A 4F3PA 5JEIA 2QMXA 4R72A 3TAJA 5H8FB 1M5EA 4H5FA 3KGCA 4K3FA 1MY3A 1JEUA 1A55A 4GWOA 1LFGA 4KD5A 4DCXA 2P1SA 1ZU0A 1P1UA 3GXAA 3PMXA 3DELB 2P0SA 3F11A 2XXHA 1SI0A 1P1OA 5KCJB 3VXBA 1YAEA 1MQGA 1TFAA 4U1OA 3KEIA 2B65A 4X1DA 3ILTB 4GVOA 1D9VA 2DQVA 1N04A 1QKBA 3S9EA 1O64A 1CB6A 3QSLA 2ZMBA 2G29A 4POXA 1A8EA 3QYTA 3N6TA 4X9TA 3PGFA 2YJPA 1FQAA 1USYH 1M5FA 3PPOA 1IEJA 1MM6A 3OXNA 4R6HA 4XTCQ 3C31A 2I4BA 3H7MA 1MQHA 5TP9A 4NF6A 5CMCA 1BLFA 3C4MA 5AA1A 5AA4B 2AL5A 5AA2B 4RNSA 4G8HA 1B6HA 5CRYA 3VFJA 3UN6A 1P1NA 1QKAA 5IAIA 1IIWA 1USYE 3JV9A 1A8FA 3FVOA 3OEMA 1LBCA 5I57B 5AA2D 1B46A 2I3VA 5CBRA 5DVJA 4HTGA 1T0KA 1B5JA 4MH5A 5I84A 2XX9A 3LC8A 4WXJA 4F3SA 2D21A 2V3UA 2HXWA 4RPNA 4F3BA 4PP0A 1DTGA 4GQOA 1EZOA 1LB9A 2QS3A 4R75A 4OFLA 4EXKA 2Y84A 5F1QA 3FVNA 1B3FA 3W9WA 1FQFA 1A99A 4XKNA 4LQ5A 1DPEA 1PBQA 2Q8JA 3SEVA 4RJZA 3ZS6A 4ZE9A 3Q26A 2NUVA 2GHBA 1J1NA 2QRYA 2REJA 4Q0CA 1HSEA 2Q88A 1MY2A 2GH9A 1IXGA 2F8DA 1FTJA 4PETA 2KLFA 4YB7A 4C1UA 4GF8A 5I2KB 1JW5A 5BWJA 4KPTA 4OERA 4ZEKA 5DEXA 3Q29A 3JYRA 3SKPA 2O7IA 3RPWA 1FW0A 1IXIA 3EF7A 1MXYA 5DVFA 2FYIA 2RF1A 3RGYA 2ZYNA 3CFLA 3KSXA 5ICQA 4OTEA 4P0GA 2BJJX 2X7PA 4H65A 4I9DA 3U94A 1US4A 1N0TA 3O2AA 4THIA 4JWOA 5JK4A 4BDNA 1MRPA 1XS5A 3QUFA 1ZBMA 4R74A 4ELQA 1MQIA 3T9HB 1LFIA 4L17A 1YPNA 3MPKA 2OK2A 3U8QA 5FHMA 4AB5A 1JW1A 2G93A 3T22A 2XXQA 3FZVA 4KCCA 1RKMA 1FTOA 4DZ1A 4OENA 5K2YA 2PT2A 4EF2A 3G7WA 1LBBA 1B3EA 3PV0E 1ZMGA 4NF5A 1R1NA 4ESXA 5L8DA 3VV5A 1EU8A 1LAGE 4FJPA 2IA4A 1OQGA 3SEXA 3C32A 1ANFA 1TT1A 3A3UA 4QF9A 3IORA 2QS2A 5I2NA 4YMBA 2HQ0A 2DE2A 1H76A 3IB2A 1FTMA 3VDFA 5H8QB 3WAFA 1Q1KA 3MPLA 5JTYA 2ALUA 1WDNA 4R6KA 3K1NA 2DXRA 4QRZA 1S7YA 2OWTA 3K2DA 2PT1A 3BFTA 4GL8A 5JTYB 1B40A 1QUKA 1MDP1 4EXLA 1R6ZA 2H9BA 4DIGA 2I0BA 3G3GA 4Q5TA 1FTKA 1UTHA 2NWJA 2Z23A 5KDTB 4XIGQ 5I56B 1PB8A 1DMBA 3K00A 3QUJA 4ZEBA 3N6UA 3HHGA 1R9LA 2Q89A 1ZLQA 4IO7A 1NNKA 1XT8A 4Z7EA 3KN7A 4LA9A 5I58A 5CMKA 2F6PA 4IY5A 4OZ9A 1UQWA 3MWBA 3ZSFA 2UVJA 2DYXA 5L9SA 2OWSA 3K6VA 4F31B 4BDRA 3GBBA 3K1PA 3TELA 1PC3A 1RYXA 3ECRA 5ISUA 3TKDA 4FATA 4DE8A 4MF3A 1VE4A 4KYSA 3GLBA 2YPNA 4GFRA 1ZJLA 3OD7A 5H8NA 2A5TB 2PX1A 3LSLA 1I6AA 1MDQA 3U93A 3GBAA 1AIVA 2HFBA 2D3IA 3VLWA 4GD5A 3IK6B 4GLIA 5ICTA 1LGBC 4KCDA 1B3GA 1MXXA 4TOZA 4NF8A 2RC9A 4U22A 2QMWA 5A5XB 3TMGA 4QSDA 2R71A 2XXIA 1P1WA 1UIVA 1B0LA 3IOUA 5H8HB 4ELOA 4F1VA 2XXPA 4ZE8A 4NF8B 3MVWA 2Y7WA 4PFUA 3T96B 3MUQA 4LP2B 1B32A 4PE5B 2VD3A 3OO9A 3HO7A 3RTWB 4LQ2A 3PUZE 4EQ7A 2XXYA 5TU0A 2ZYMA 3KJTA 5H8FA 4R73A 4YKKA 2OBGA 3PPRA 1UTBB 3OMBA 1FCKA 4YKPA 3OENA 5KCJA 4DLDA 1QVSA 3E9XA 3FVGA 3RQTA 4F18A 1OQHA 3TQLA 1YTVA 3IOWA 4AQ4A 2VHAA 2Q2AA 1SW4A 5DYHA 4KHZE 1MM7A 3TDJA 3T9VA 4H8JA 2VP1A 4TLMB 2O84X 3M3KA 1B58A 3E13X 2DE3A 3U92A 3HV1A 2DVCA 5J1DA 4GIZA 3TEPA 2DP8A 3I6VA 3RN8A 2O1MA 3TTKA 4YICA 5AA4A 3C9HA 5AA2A 1URGA 4Q8RA 1LCFA 2B3FA 3AXFA 4YKIA 3OO7A 4PFTA 1NFTA 4KQPA 1AH5A 3V8XB 2O7UA 4BDLA 1JVYA 2QPQA 3G3KA 5B70A 2LAOA 2CZLA 4IO2A 1US5A 4FE8A 2DSFA 5I57A 2ONSA 4F1UA 4U23A 5EHSA 3W15C 4NE4A 3TYHA 2UYEA 4E0XA 2X26A 2F34A 5LOMA 2XXTA 3KG2A 1D3KA 2XHDA 1NH7A 3DP4A 3FXRA 4FECA 1SYIA 3FUZA 3O66A 1XVXA 4ND9A 2XXRA 3V5AA 1M5DA 4FAJA 4IGRA 4EDPA 3BBRA 3QXMA 4G68C 2A5SA 4RXLA 4H5GA 3RLFE 4EQBA 3VVEA 4JSOA 3FJGA 1Y4TA 5ELVA 5KZTA 2XX7A 4QFLA 1FTLA 2AIXA 5FHOA 2HZLA 1JVXA 3SEUA 1S50A 2HCAA 4H67A 2W7YA 3OSRA 1MH3A 2GFEA 2V93A 3N26A 1P1QA 3H3GA 3LSWA 1A7LA 1JEVA 3C34A 2ZNTA 1B1HA 1YCJA 1QUIA 2XXXA 1O63A 1M5CA 4M1VA 1AMFA 1A54A 4H6DA 1MPDA 4G8NA 3THIA 4FEBA 3TCFA 1Y3NA 1FQEA 3HHFA 2I49A 4EF1A 2RC7A 2Y7IA 3O9PA 3USDA 2PMSA 5I2KA 3VVDA 3PUVE 4GXAA 1Y9UA 2NXOA 3U1OA 2O6AA 3N94A 4HCWA 4OVJA 2NVUB 3KOTA 4O3CA 2ZXTA 1BP5A 2QS4A 1IUDA 2H5YA 4G2ZA 3G3JA 1OLCA 3VLUA 2F78A 3MVYA 4WEDA 3O97A 2PYYA 4DXUA 1URDA 4XXUA 3PD9A 4MLQA 1P99A 5L9OA 1B0HA 3SETA 3PMWA 2O51A 4ZEDA 4QSCA 5TPAB 3H6TA 4ZS9A 3KJ7A 1B51A 1H45A 4M4GA 4UACA 3O6GA 3IAZA 3OOAA 1LAFE 1R9QA 3TODA 2WKYA 3CG1A 3EPEA 3MC2A 1ELJA 4LZ8A 3TTRA 1Y3QA 4LATA 4OHNA 4H0WA 1DOTA 1I6BA 1N76A 2DVZA 4OETA 4ESWA 2QS1A 4O3AA 3TZAA 4PQJA 2FA7A 4GOTA 1MS7A 1XC1A 3TQWA 3VXCA 3IO6A 1MQJA 3SDFA 4LZ5A 1MY1A 5CMBA 2I48A 1OLAA 4G4PA 1SW5A 4G68B 4RYAA 4YZZA 3Q27A 1Y20A 2IEEA 3FASA 4OWDA 3SEWA 4HCYA 3IB1A 3E3KA 4F1YA 3A09A 2I6EA 4RK2A 1MY0A 2Y7PA 1IZ1A 3H6UA 1JNFA 1EZPA 4I8CA 5I59A 2D5WA 5H8QA 3K01A 5HM4B 4N6PA 2V25A 1PB9A 2ESNA 2DOJA 4RPOA 2QSXA 5I59B 3TTMA 1BKAA 3A3CA 3IL1B 1ZIUA 3RY3A 3IO4A 3MP1A 2Z8DA 1JETA 3Q25A 4H1XA 2P2AA 3PPNA 5KDTA 2Q2CA 5I56A 3CRBA 3K0VA 2THIA 2UVHA 1SBPA 4OQOA 2Y7RA 2YLNA 3KZGA 1VR5A 4P11A 3EHTA 4XKRA 3H6WA 3HN0A 3FJ7A 3PUXE 1XHYA 3MAMA 4X48A 2F7AA 4G77A 3CI8A 1II5A 4YKJA 1LLSA 1NNTA 3CVGA 4ONYA 3TPAA 2E0SA 1I6QA 2Z8EA 1N7XA 1EH3A 1SW2A 1VSOA 3LR1A 2VOZA 1DPPA 1IQ7A 1ZKBA 2AL4A 1MXVA 3RUMA 3FXUA 3C36A 2ABHA 2ZNSA 1D4NA 4JSDA 3E4RA 2REGA 4YU0A 1B4HA 4EQ9A 1NNPA 2ANJA 3G3HA 2A5TA 3UA8A 3B7DA 3I3VA 3PPPA 3QK6A 3M8UA 4IY6A 2F7BA 4F19A 2XX8A 3DM0A 1F9BA 4R2FA 2UVIA 2VGQA 1SYHA 5A5XA 2F5XA 1KWHA 5CMMA 4HW8A 4MLVA 3MQ9A 5H8HA 3CFZA 4JDFA 4NTLA 3KFMA 4U1ZA 1H43A 4IO6A 1MG1A 1DSNA 4C0RA 3S9LC 4QSEA 3UIFA 2H4IA 2DE4A 2PBWA 1Y4CA 4YB5A 4R9GA 3H6VA 1B4ZA 2V3TA 2F97A 1Q35A 1XVYA 3FATA 1UTBA 1UIUA 1NH8A 1B3HA 1I69A 4X1BA 3MZ9A 4F22A 1AL3A 4DDDA 1B52A 4N07A 2VD2A 1B2HA 3D4CA 1GTKA 1H44A 3KBRA 4Q30B 3MVZA 2R6GE 4LVQA 4OMBA 1B7UA 1MY4A 5EHMA 1MXZA 3L6HA 3PPQA 3JZJA 3V89B 4NF4B 3LSFB 1MH4A 4JXIA 3SERA 3KN8A 3LUYA 1Y3PA 3LSXA 4XKQA 1OMPA 2HEUA 2DWJA 1IITA 4R6YA 3SEYA 2OLBA 2ZYOA 3S9NC 1B5HA 4ZEFA 5DVIA 2AYSA 3OO6A 3R26A 3EHUA 4U4SA 1B9JA 4TQUQ 3C35A 1AOVA 4U21A 3LBSA 3O29A 3H4ZA 1NL5A 1LCTA 1LAHE 3K6WA 1N3WA 4QFPA 4HS7A 3T93B 3IX1A 2PVUA 3T66A 2I4CA 2NOOA 3PUWE 1GR2A 2I3WA 1FQCA 2HAUA 1QJMA 4OFJA 4E0WA 5AE4A 4OESA 2Q9TA 3M3LA 3TTNA 1HSJA 3CFXA 3VLVA 4O3BA 1B3LA 4ZDMA 3EHSA 3H06B 2RCAA 4QFOA 4KYDA 3KOSA 1GVCA 3K6XA 2CMOA 4NEDA 3PMVA 1NMUA 2ZNUA 3BFUA 3B6QA 3TTLA 4KYEA 4TLLB 3S4UA 3O6HA 5TP9B 4ZZEA 4YAHX 4NF6B 2GHAA 1VFEA 1HSLA 4ELRA 1S9TA 3IOTA 3MP6A 2QL3A 3RTFB 3OO8A 4ISUA 3M3FA 1URSA 3TFLA 2H99A 2DXYA 2V84A 3W9VA 4G8MA 3K4UA 1FQBA 3D4GA 2O1LA 4R9FA 5EYFA 4GL0A 3IB0A 4EUOA 4PFWA 2X7QA 1LSTA 1POY1 4KI0E 3U72A 3UP9A 3TCGA 1ATGA 3OEKA 5DTBA 2FNCA 1A40A 3KN3A 2XXUA 3DP8A 4ZECA 3MBPA 1H3DA 3I5OA 4JWXA 3TCHA 3MVXA 1LAXA 1PBPA 3UGWA 4UA8A 3EQ1A 3QIMA 5FTHA 1RYOA 5DT6A 2F7CA 3FJMA 4JBZA 1IXHA 2OZZA 4BLAA 3P7IA 1PEBA 5ITOA 1L5TA 3MW0A 3CSBA 3OELA 3PD8A 2DWHA 4IO4A 5L9MA 3FD3A 1B7ZA 1SW1A 1SDXA 3O28A 1MPBA 4GXSB 5M2VA 1SQYA 5TPAA 4NWDA 4FIMA 4BDOA 3B6TA 4F3GA 2V3QA 1N84A 3MZ1A 1B7HA 3MP8A 4R2BA 3VE1B 1FQDA 5DEXB 4F39A 2ZYKA 3K6UA 1OIBA 5F7VA 1MPCA 2H25A 3KSJA 1TFDA 4JWYA 2RINA 1SI1A 3R7XA 4F29A 3FV2A 4U4XA 4OEUA 1JW4A 1SD3A 4I1DA 1Z7ME 2O69A 4C1TA 1NKXA 1ZTYA 2XD3A 3K02A 2HZKA 3CR9A 3GZGA 4G68A 2R9JA 3R6UA 1OVBA 1VFDA 5HBCA 4FORA 2OCUA 3C33A 4IGTA 1BTJA 1TXFA 4QFKA 2RKMA 1XOCA 3HCQA 4I62A 1B5IA 4LZ7A 4DCYA 1OVTA 1Y1ZA 4WEPA 3MZBA 3MJNA 5IKBA 4POWA 3IJOB 2B3BA 1GV8A 2F6GA 4IO3A 4RA1A 4NF5B 4OFOA 1POTA 5B7DA 4OYVA 1QW0A 2XXWA 4LUBA 5CBSA 3RNNA 3SESA 2O68A 1N7WA 1SVXB 3FVKA 5BUUA 3HPIA 2GRVA 3FGSA 2ONRA 4AB6A 4ELPA 1MXUA 1LFHA 4NWCA 3B6WA 3ODBA 3G3FA 5FTIA 3RT6B 3S2VA 1EZ9A 5I2NB 3FXQA 2Y7KA 5HPQA 1Z7NE 1PDAA 2QJEA 4LONB 3T9UA 3PU5A 1IXCA 1CE2A 2DS9A 3Q28A 1O7TA 3PUYE 3UK4A 4DXBA 3FV1A 4XKPA 4ZZAA 3EN3A 3S9MC 3ZKKA 3ZKLA 4MBPA 4KR5A 3OSQA 4P0IA 1B05A 2Z22A 2UYFA 4RY1A 2F36A 2I0CA 2HAVA 5H8SA 4FEDA 2I58A 3K1MA 4YB6A 1BIYA 1LB8A 3DLNA 1UTHB 5CI5A 3T9XB 5K2XA 1D9YA 1QULA 4Z0IA 2F35A 1PB7A 3ONMA 1B1XA 4YMAA 5AA3A 2OJTA 2DWAA 2DWIA 2UVGA 4QFNA 3TUSA 1MXWA 4GRKA 4MFIA 3HSTA 5ITPA 1JQFA 1N3XA 4PFYA 1GGGA 5I58B 2UXAA 4OEVA 3O6IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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