1EH3A

R210k n-terminal lobe human lactoferrin
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
RSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLDWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIKESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Metal transport
molecule keywords LACTOFERRIN
publication title Crystal structure and iron-binding properties of the R210K mutant of the N-lobe of human lactoferrin: implications for iron release from transferrins.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 107
structure length 324
sequence length 324
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-02-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1eh3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1eh3A02
5JTYA 1N3WA 3FUZA 2Q89A 3G3KA 5H8FB 3ONMA 4F18A 5FTIA 2I3WA 3S9EA 5KCJA 1N84A 4ZE9A 1WODA 4I62A 2V93A 2RINA 2PBWA 3RN8A 2QS3A 2F78A 1FTLA 1A99A 1MY4A 4H67A 3N94A 4GXAA 1UIVA 2GRVA 3L6GA 4EUOA 1R9LA 1YPNA 2VGQA 1B7ZA 1OQHA 4ZEIA 1OIBA 3H03A 4AB5A 4NF8A 2A5TA 3HV1A 1ZKBA 2O6AA 4F39A 3CR9A 3MUQA 5KDTB 2Y7WA 4L17A 1POY1 1A40A 3DLNA 1B05A 2RC7A 3MZBA 4F3BA 3TDJA 1F9BA 1IXCA 4MFIA 3DM0A 3TEPA 4H65A 3IAZA 1QUIA 4PQJA 2Q8JA 4ELQA 1MY3A 3Q29A 4R74A 3SDFA 3GLBA 1MPBA 3EF7A 3BFUA 3C35A 3IO4A 3E9XA 3I3VA 4KYSA 1SBPA 1LAFE 3M3LA 2PMSA 4I8CA 1H76A 1XHYA 4NF6A 2DVCA 1TWYA 4DZ1A 5I84A 2DXRA 1BIYA 1QUJA 2PVUA 4G68B 5TP9A 1QULA 2Z22A 3C31A 1MM6A 4OWDA 2QSXA 4GL8A 1OLAA 4Q30B 2DS9A 1MRPA 4DDDA 3G3GA 4GD5A 1A54A 1N04A 4F3GA 3IB0A 2ESNA 4N13A 1B5JA 3S9LC 3MP6A 3V89B 4BDMA 4I1DA 4MLVA 3H4ZA 2F8DA 1FQAA 4YMAA 3RT8A 3OEMA 3BBRA 4NF5A 4QSCA 4H1XA 1VFDA 2D21A 4QSEA 4G8HA 5L9MA 1TT1A 3E13X 1B7HA 4ESWA 3KJ7A 4MLQA 5F7VA 2VD2A 5H8FA 3QK6A 3PUVE 2FA7A 4C1TA 2QL3A 4BDQA 4FAJA 1Y4TA 1LB8A 1RKMA 4G77A 5LOMA 1JW5A 3UN6A 3PD9A 3TFLA 3PPRA 3TTKA 2RKMA 1JVXA 2B3BA 5DEXA 4R2FA 3HO7A 1DTZA 4F2QA 2AYSA 1US4A 2HFBA 4X9TA 1FTOA 1JW4A 1RYXA 1ZU0A 1MPCA 3IOTA 1Z7ME 4XKPA 3UORA 3ZSFA 1BTJA 4ELPA 4JB7A 4N07A 4IGTA 5H8NB 3T9XB 3S9MC 3ILUB 1LAXA 4H5FA 1B3LA 4TOZA 3R7XA 2YJPA 1PC3A 3IB2A 4Z0IA 3K1PA 4F3SA 3MQ9A 3RQTA 1WDNA 1M5DA 2RCBA 3N6TA 2NUVA 1B1XA 2Z8DA 4R2BA 5DVIA 3CFLA 4JDFA 2DWAA 4RK9A 3K6VA 3W9WA 5FHOA 2UYEA 3TTRA 3K0VA 1AH5A 3MVXA 4O3CA 1XC1A 4E0WA 4YU0A 3K4UA 1NNPA 2QJEA 1URDA 4BLAA 1D9VA 1OMPA 5F1QA 2F6PA 3VVFA 3BKIB 3B6TA 3IORA 4F31B 4KQPA 3SEXA 1B1HA 3KN8A 3TKDA 3CRBA 4YKPA 1DSNA 3MP1A 3OELA 1M5FA 2F35A 4GIZA 4RJZA 3M3FA 4TLLB 5B70A 5CMBA 3KJTA 4YB5A 1EU8A 1QKAA 3G3JA 3TELA 3P7IA 4RPNA 3K02A 2ZNUA 4IY6A 3JYRA 2Y7IA 1Y1MA 4NWCA 3QXMA 3FVNA 3LSXA 4GXSB 4THIA 5JEIA 2I4CA 1DMBA 2V3UA 3Q28A 3OEKA 2XD3A 4ZZEA 5HM4B 4H5GA 1Y20A 2O51A 1DOTA 2XHDA 1TFDA 2OWSA 3T66A 1IEJA 4PFTA 4AQ4A 2UYFA 4EQBA 1MDP1 4F29A 2RC8A 3FV2A 3AXFA 3VDFA 4LONB 3VV5A 3G3HA 3VFJA 1USYH 2M8CA 2XXYA 3PUWE 3U1OA 4Z7EA 3HSTA 2W7YA 1FTJA 1R9QA 5I58A 1P99A 2QS1A 3QUFA 5CI5A 1PB9A 2NXOA 3C33A 5AA2B 3FVKA 2ZNTA 3CSBA 1OLCA 4QSDA 4DIGA 1VR5A 1MXUA 1AIVA 1B52A 3KN3A 3H3GA 2AIXA 1XVXA 2QMWA 4DCXA 2X7PA 1J1NA 4NTLA 2NVUB 1TXFA 4GF8A 4R6HA 3PV0E 1R6ZA 1T0KA 1LB9A 1WVJA 4U1OA 4RY1A 1O7TA 2PYYA 4KCDA 4F3PA 4R6KA 3IOWA 1NL5A 5H8HB 3U72A 4X1DA 2THIA 1UTHB 1SYHA 3SEYA 1MG1A 4G8MA 1UQWA 2Z8EA 3O28A 2HCAA 3MZ9A 4HW8A 1S7YA 4FORA 2Q88A 1MXXA 3TCFA 3KZGA 4YB6A 4OTEA 2F7AA 4KR5A 2ONKE 3TODA 3UP9A 3W15C 4OETA 1SW1A 4ESXA 4ECFA 5CM6A 2E1SA 2F7BA 3V83A 1IIWA 2UVIA 2F34A 4YKJA 5H8QB 1ZIUA 5A5XB 3PPOA 1L5TA 2KLFA 4LZ5A 3ZS6A 3O6IA 2QRYA 4XTCQ 2A5SA 3VLWA 3KSXA 3IOUA 1B3EA 2F36A 4ZEDA 1GTKA 2UXAA 4IB2A 5AA1A 3SEVA 3M8UA 1IUDA 1RYOA 2RCAA 4EQ7A 2O1LA 2X26A 2F7CA 2I0BA 4OEVA 4RA1A 2ABHA 1B4HA 1LCTA 3LUYA 2B3FA 1MS7A 5DVFA 2XX7A 3RPWA 2HXWA 5I2KB 3S9NC 2B65A 3S2VA 1SI1A 2QMXA 4DXUA 4H0WA 3DP6A 4F1YA 1QVSA 3O66A 2P0SA 3IL1B 1PDAA 1IZ1A 5CBRA 1HSLA 2UVGA 2ONSA 3SEUA 1JETA 1BLFA 3TQLA 3K2DA 2D3IA 1H43A 2PX1A 2VD3A 1FQBA 2XXTA 5DTBA 1CE2A 4LQ2A 1LLSA 1PBQA 4OXVA 2HAUA 4RNSA 3O97A 1PEBA 4GLIA 5AA3A 1DPPA 1NFTA 4NE4A 3RY3A 3VVDA 4NEDA 1A8EA 1OQGA 1P1NA 1Y4CA 3KGCA 4LATA 4ZZAA 4ZEBA 1O63A 3CSGA 3R26A 1EZ9A 4I9DA 2Z8FA 3JZJA 4PE5B 5I56B 3MPLA 2OLBA 3D4GA 3EN3A 4XXUA 3MVYA 4XKNA 3H6UA 4F2OA 3DP4A 4OFLA 3CIJA 5K2XA 1MM7A 4P0IA 2HQ0A 4YKIA 4PP0A 2RF1A 3KN7A 3FJGA 3ODBA 3KBRA 2DXYA 3SESA 3UGWA 1JEVA 5I59A 3FVGA 4IO4A 1TFAA 3PPPA 4H6DA 1ATGA 4O3BA 2X7QA 1EZOA 4JBZA 1UTBA 4FECA 1NNFA 4EXKA 5B7DA 1MQJA 2ZYNA 4OQOA 4IO3A 3ZKKA 2HAVA 3H6VA 4F19A 3MVZA 3IB1A 3LBSA 4FATA 4ELRA 4HCWA 4F1UA 1OVBA 4OVJA 4TQUQ 4KPTA 2F97A 2Y7PA 2FYIA 1GGGA 4WXJA 2I6EA 4K3FA 5CRYA 1YTVA 3T9UA 5CBSA 5I57B 3K6WA 3T93B 2G29A 3EPEA 3IK6B 4QFPA 3TAJA 5ISUA 2O7UA 2I48A 5KDTA 3MW0A 3DELB 4YMBA 4RPOA 2XD2A 2I3VA 3PPQA 5TPAB 2AL5A 3FV1A 5CMCA 3IO6A 1B51A 1LFGA 2XXUA 3GBBA 3OOAA 3IJOB 3MWBA 4POWA 4DCYA 4MH5A 5BUUA 4YKKA 3C34A 2XXRA 1USYE 4EQ9A 4BDOA 2DVZA 3KG2A 5AA2D 2V3TA 4LQ5A 3VVEA 2DE4A 1SQYA 1EZPA 1P1OA 1SYIA 3K00A 5AA4B 3FD3A 4G68A 5H8SA 5L8DA 1MQGA 1Y9UA 2O1MA 3G3FA 2HEUA 1MQIA 2OK2A 1S9TA 2WKYA 4LP2B 4EXLA 3C32A 3IX1A 4U23A 1B5IA 3N5LA 3T22A 1JW1A 4KYEA 1MPDA 3MZ1A 5ICTA 3RTWB 1JEUA 4KI0E 4DLDA 5L9OA 5EYFA 1SW4A 3PUYE 1H45A 5CMKA 1ANFA 1SVXB 1Y3QA 4QFLA 3RLFE 2G93A 3O9PA 5EHSA 4IO7A 1KWHA 3U94A 4OENA 2OCUA 3HPIA 5I2NB 2DSFA 5CMMA 3N6UA 1NNKA 1I6AA 3GZGA 3CFZA 4JWXA 2DOJA 3FIRA 4PFUA 3HCQA 1NH8A 1LFHA 3MP8A 4KFQA 3KEIA 3V5AA 2REJA 4GL0A 2VOZA 3TUSA 3B7DA 3CI8A 3T9VA 1ELJA 3OO9A 3TMGA 2V84A 4ND9A 1FTMA 4IO2A 3G7WA 5JTYB 1I6BA 3O29A 3SETA 2H4IA 3MJNA 2F6GA 2P2AA 4C0RA 2HZLA 2PT2A 4XKQA 3ECRA 1AOVA 1N7WA 4EF1A 3OXNA 1N3XA 2XXPA 4NF4B 3UA8A 4KCCA 4ZEFA 5H8NA 3PMVA 1B3GA 5IAIA 1MY0A 2Y7RA 5DT6A 1IXGA 4DXCA 3QIMA 3O2AA 3E4RA 2Y7KA 4NF8B 3LSWA 2DWIA 3TCHA 4IY5A 2A5TB 4BDNA 5HPQA 2BJJX 4Q5TA 1XVYA 1YCJA 1URSA 1FTKA 3SERA 1XS5A 4X48A 4YZZA 4KYDA 2O7IA 3F11A 4IO5A 3OO7A 3ILTB 3B6QA 3WAEA 1MH3A 1URGA 4Q0CA 1Y1ZA 2R71A 5DYHA 2R6GE 2YPNA 5DVJA 2XX8A 4YAHX 3PUXE 1VFEA 4NF6B 4WEDA 3U93A 2ONRA 1IQ7A 1P1UA 1LAHE 3EHUA 1P1WA 2QS2A 5TP9B 4KD5A 2D5WA 2V3QA 4H8JA 1QJMA 2ANJA 3FXRA 3WAFA 1LGBC 3Q27A 4R73A 3T96B 1AMFA 4LZ7A 3KOTA 3FASA 2PT1A 2Z23A 4IO6A 3A3UA 3U92A 3PGFA 4HS7A 2NOOA 1ZBMA 4M1VA 4QFOA 5J1DA 4U22A 1MQDA 1I69A 4R72A 3I5OA 4ELOA 2DP8A 2UVJA 3QYTA 4LZ8A 3MVWA 4U4XA 3PMXA 4NF5B 4JWOA 4OFJA 1MXVA 4F22A 4PFYA 5AE4A 2H99A 4JXIA 1M5CA 2O84X 5FHMA 4KHZE 4NWDA 4R75A 4U4SA 3IR1A 3I6VA 3O6HA 2H5YA 2XXIA 3RT6B 4ZS9A 4FEBA 1SI0A 2DE2A 4N6PA 4NF4A 2YLNA 4YB7A 4P11A 3LR1A 1OVTA 4NMYA 3PU5A 4BDRA 1B32A 1HSEA 5FTHA 1CB6A 2OWTA 4GWOA 5AA2A 3PPNA 5DEXB 2ZYKA 1A55A 3VE1B 2QPQA 4GVOA 3OSRA 4GOTA 2Y84A 1JVYA 1JQFA 2XXQA 4WEPA 1MY1A 1SW2A 2IEEA 5HBCA 4RK2A 1MXZA 2XXXA 3UK4A 4X1BA 1MXWA 2E0SA 1R1NA 5H8HA 3U8QA 1FCKA 1A8FA 1UTHA 3VXBA 3L6HA 1VSOA 1HSJA 4GRKA 4QHQA 1O64A 4U2RA 2QS4A 3LSLA 1PB8A 3FZVA 1A7LA 3K6UA 3UIFA 3TZAA 1B3HA 2GH9A 4QRZA 2I58A 4FE8A 1EH3A 5H8QA 3TCGA 4DXBA 2H9BA 3TTMA 4GFRA 5A5XA 4ZECA 1D4NA 2REGA 2I0CA 3MBPA 2NWJA 1Y3NA 2DE3A 3S4UA 1B0HA 1ZLQA 1AL3A 2ALUA 2GHBA 1NNTA 4M4GA 3SKPA 3CG1A 4O3AA 1LBCA 2UVHA 4FIMA 1IXIA 5EHMA 2Q9TA 1M5BA 1B2HA 4QFKA 3FXUA 2DWHA 1S50A 4OZ9A 5BWJA 4BDLA 1XOCA 2FNCA 1POTA 4E0XA 2P1SA 2H98A 5I2KA 2GHAA 3O6GA 1NH7A 3RNNA 2XXHA 4LUBA 4R6YA 1PBPA 4ISUA 2ZNSA 3PD8A 4OYVA 4TLMB 4ZEKA 3Q26A 3RGYA 3EQ1A 2F5XA 4WKMA 1LAGE 3TYHA 3TTNA 3EHSA 2OJTA 1LSTA 1UIUA 4JWYA 2R9JA 1P1QA 4H8IA 4Q8RA 3OENA 1Y3PA 1Z7NE 1B6HA 4LA9A 1DTGA 1FQDA 5FHNA 3A09A 1FQFA 4OEUA 2I49A 1XT8A 1B0LA 3H6TA 3RUMA 5ICQA 3OMBA 3C36A 1LFIA 4R9FA 1US5A 4U21A 3MC2A 2OZZA 4XKRA 1MXYA 2O69A 3USDA 3E3KA 1MY2A 5I58B 3R6UA 3PUZE 3CG3A 4JSOA 3DP8A 3H7MA 1B46A 1I6QA 3LC8A 4FEDA 1Q35A 2Q2AA 1ZMGA 3TTLA 1ZJLA 4GQOA 3HN0A 5I56A 1H44A 3FJMA 3FJ7A 1YAEA 1B7UA 1N0TA 1BKAA 1N76A 4G8NA 3VLVA 4P0GA 4AB6A 3OO8A 2Q2CA 1SW5A 4DE8A 2CMOA 2AL4A 1II5A 4R9GA 3FXQA 3SEWA 5KZTA 2IA4A 4ZDMA 4QFNA 4ONYA 3RTFB 4UA8A 3TQWA 1ZTYA 3MAMA 1H3DA 3GXAA 3CVGA 3M3KA 3B6WA 1DPEA 4JSDA 3TPAA 5TU0A 4HTGA 4PFWA 3D4CA 3K1NA 1GV8A 4C1UA 2VP1A 3EHTA 5M2VA 3V8XB 1PB7A 2RC9A 4OHNA 3H6WA 5ELVA 1JNFA 1MH4A 2DWJA 3THIA 3GBAA 4YICA 2OBGA 4MF3A 2HZKA 4OERA 3OD7A 4XIGQ 5I57A 1BP5A 4EF2A 3FVOA 5ITOA 1NKXA 3OO6A 2CZLA 3OSQA 3W9VA 1LCFA 1FW0A 3BFTA 5KCJB 1NMUA 3K6XA 3LSFB 5K2YA 5TPAA 5JK4A 2ZYMA 3KFMA 2O68A 1B3FA 1D3KA 2DQVA 4OFOA 3VXCA 3FGSA 3N26A 2XX9A 3QAXA 4F1VA 3IJXB 3MPKA 4HCYA 5CC2A 3H06B 4ZE8A 3CFXA 3K01A 4OMBA 2LAOA 3PMWA 3KOSA 1VE4A 3HHFA 1B5HA 3FATA 1Q1KA 5AA4A 1GVCA 5IKBA 3C4MA 3C9HA 3Q25A 4G4PA 4MBPA 1B58A 2DYXA 1LBBA 2ZYOA 2GFEA 2VHAA 2XXWA 4POXA 3ZKLA 2V25A 3KSJA 1FQEA 1MDQA 1B40A 4G2ZA 5L9SA 1N7XA 3JV9A 1QUKA 1MQHA 4U1ZA 3G3IA 4IGRA 1IXHA 4EDPA 2ZMBA 3VLUA 4OESA 1SD3A 5ITPA 4PETA 1GR2A 4RYAA 5I2NA 3QSLA 4QF9A 4G68C 1B9JA 4UACA 5I59B 1QW0A 3IOVA 1QKBA 1M5EA 3QUJA 3T9HB 3K1MA 1D9YA 2I4BA 1UTBB 2ZXTA 1FQCA 2H25A 4FJPA 1IITA 3HHGA 1SDXA 3A3CA 1B4ZA 4RXLA 4LVQA 2XXVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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