3SESA

Cu-mediated dimer of maltose-binding protein a216h/k220h by synthetic symmetrization
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEHAFNHGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An approach to crystallizing proteins by metal-mediated synthetic symmetrization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 124
structure length 370
sequence length 370
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3sesA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3sesA01
5KDTB 3K1PA 4E0WA 1R6ZA 4G8NA 1N7XA 3A3CA 3WAFA 4O3CA 2XXPA 2RCAA 3GBAA 4GIZA 4G68B 4F3SA 5KZTA 3P7IA 4GFRA 3G3HA 4LQ2A 1B5HA 2H99A 4WEDA 2H9BA 3EF7A 2VP1A 1FQBA 1AMFA 2DWJA 5H8HA 5I2KB 1Y4CA 2QS1A 5AA3A 3R26A 3RUMA 4PFUA 2QS2A 4BDLA 3MVWA 4ESWA 4ZEIA 4ZEFA 5EHMA 2ALUA 5DT6A 2XD3A 1MY1A 4KPTA 4PFTA 1Q1KA 1LB9A 3I5OA 5I84A 3K1NA 3GBBA 3D4GA 1JEVA 1UTHB 1A8EA 2YJPA 1GVCA 3THIA 4H1XA 2X7PA 4HCYA 2V3QA 3TAJA 2F6PA 4ELOA 4Q5TA 3MBPA 3E3KA 5DYHA 3O66A 1BTJA 2NWJA 3O2AA 1LB8A 1NH7A 3R6UA 1FTKA 2LAOA 2O7IA 3FATA 3TTKA 2NVUB 3FD3A 4ZEBA 4TLLB 1PBPA 1ZIUA 2Z8EA 1NMUA 3JYRA 4LONB 5CMCA 3V8XB 3CFXA 3IJOB 1LBCA 1B40A 5I2NA 1B4HA 5IAIA 4QRZA 4N07A 4JSDA 4F31B 4P0GA 5DTBA 1VE4A 4F1YA 3BKIB 3DP4A 3V89B 3PPNA 4YICA 3QYTA 1JW5A 4NWDA 3EQ1A 4YKJA 1OLAA 4F1UA 4YAHX 3IJXB 3KN8A 4RNSA 4GQOA 3FV2A 1FCKA 3MUQA 4QFNA 1QUKA 1JQFA 1XC1A 5FHOA 3FV1A 3CG3A 4OENA 1NH8A 2OJTA 1NFTA 2F6GA 4KQPA 1NKXA 4NF6A 2F36A 3DM0A 1QUJA 1P1WA 3EHUA 4Z0IA 3S9MC 3EHTA 1GV8A 2AYSA 4IO7A 2DOJA 3K00A 3Q25A 1B3LA 3IK6B 4DXCA 1UTBB 4C0RA 3KOTA 1OQGA 2DP8A 4NF8A 3B6TA 4RXLA 3PD8A 1P1UA 4K3FA 3N94A 4G2ZA 4RK2A 1R9LA 1B5JA 1LAFE 4EQ7A 5KDTA 3L6GA 2F97A 1OLCA 2B65A 1B9JA 1EH3A 3C32A 3N6TA 3TKDA 2AL4A 4EQ9A 4DCYA 5DEXB 2I3WA 5TP9A 4G68A 3LC8A 3IB2A 3SDFA 3M8UA 3TTRA 4H65A 4U21A 4BLAA 5TPAA 3ECRA 1N76A 5ITOA 4I62A 3UORA 4LQ5A 2QS4A 5L9MA 1MY2A 1MQHA 3C34A 4FEDA 4DE8A 4Z7EA 1N0TA 4BDNA 4UA8A 2ONRA 3B6WA 1B3FA 3H3GA 4L17A 3IL1B 3ZSFA 1Y3NA 4H0WA 4F2QA 5JEIA 3UA8A 1MRPA 2VD3A 5EYFA 1P1QA 3GLBA 3VVFA 4I9DA 5HPQA 1URSA 4PP0A 3FVNA 4NMYA 4ZZEA 3JZJA 1UTHA 2XD2A 4H67A 1EZPA 3MZ1A 3K6UA 1QW0A 1NNFA 2XXIA 1MM6A 2ANJA 3K01A 2DXYA 2XXTA 3FGSA 1QKBA 3SEWA 1GTKA 3PUZE 3CSBA 4F29A 3TFLA 4PE5B 3W9WA 2P2AA 1Y3PA 1SQYA 3M3KA 1AIVA 3SETA 4EXKA 3PMXA 1Z7ME 4JDFA 5K2YA 2HEUA 4IGTA 3T9XB 1PEBA 3A3UA 2HFBA 3FIRA 1VR5A 5JK4A 1A40A 1FQCA 4RPOA 1S9TA 2P0SA 5I57B 4BDMA 3S2VA 3H7MA 3IOTA 3BFTA 2QRYA 2REGA 2VOZA 3T96B 4YB5A 3RN8A 1B3EA 4OFOA 2X7QA 2PT1A 3OO7A 2DWAA 4U22A 4OHNA 4QFPA 4MLVA 1SW5A 3KSJA 4QFOA 1N84A 1OMPA 2F5XA 2Q88A 5DVFA 1S7YA 2A5TB 1UIUA 3Q28A 1UTBA 3FASA 1A7LA 2O1MA 1MDP1 4F3PA 1MQIA 1RYXA 1DPPA 1URGA 4QSEA 4KFQA 1R1NA 1MM7A 3PPQA 4GXSB 3DELB 3I6VA 3PPRA 2O69A 4IY6A 5BWJA 5AA1A 1JVXA 4FORA 1MY4A 4GOTA 2I4BA 2GFEA 3TTMA 3W15C 4G4PA 1LAGE 1MY3A 1I6BA 3CRBA 3PGFA 1H44A 4F3GA 3PPPA 5KCJB 2QMXA 3K0VA 3S4UA 4NF5B 4JB7A 1WVJA 3FVKA 3C33A 2AIXA 5AA4B 1FTMA 3M3LA 3PMWA 3K6VA 1OVTA 3O6GA 4TOZA 4ND9A 5FTIA 1ZMGA 1Y9UA 4N13A 3VDFA 4HS7A 1DTZA 1B32A 2DE3A 1MS7A 5H8FB 5ITPA 3KN7A 3OXNA 1L5TA 3USDA 4ZE8A 4C1UA 1PDAA 1PC3A 3KG2A 1IXIA 3H03A 3H6TA 3QUJA 3I3VA 1IXCA 2AL5A 1P1OA 4PQJA 3E4RA 3C36A 2Q89A 4YKKA 3VXBA 4GL0A 3IAZA 2Y7IA 2DWHA 3O28A 4JBZA 1XS5A 5FHMA 1TFDA 2DSFA 3L6HA 4ESXA 4R2FA 2XXHA 4IO6A 2RF1A 2Z8DA 3DP8A 1N7WA 3MP6A 4GL8A 5I56A 3OEKA 1B52A 4OFJA 1JW4A 3N5LA 3C35A 2RINA 2XXVA 4GWOA 3PU5A 4YB6A 1IUDA 4IO4A 4GXAA 3HO7A 1B0LA 2I6EA 3AXFA 4U4SA 4ZZAA 3QSLA 1MH3A 4YU0A 3TDJA 1D9VA 2OCUA 2A5SA 3LSWA 2XXWA 4KCDA 2V3UA 1A8FA 2Z22A 4POWA 2M8CA 3S9EA 1AL3A 3RY3A 3UN6A 3FVGA 3KOSA 1PBQA 5AA2D 2A5TA 2F78A 2Q2CA 3Q27A 4QF9A 2QMWA 1SVXB 3FZVA 1BLFA 2UVGA 3BBRA 3IORA 2DWIA 2D5WA 3KBRA 3G3KA 1ZJLA 3OMBA 4R74A 1Y1MA 2DXRA 3O9PA 4EF1A 1MPCA 1FTOA 1SBPA 4OESA 4OEVA 1NNTA 4OZ9A 1UQWA 3KEIA 4ECFA 1FQEA 4Q0CA 5DVIA 3MJNA 1HSJA 4FECA 3CG1A 3OENA 1J1NA 4MBPA 3SEUA 1F9BA 1LSTA 4NF5A 1KWHA 2VGQA 3IOVA 5I58A 3K6XA 5ISUA 3D4CA 5AA4A 3W9VA 4YKIA 4NTLA 1QVSA 4OETA 5B7DA 1FTLA 2H5YA 5A5XB 2HZKA 1WODA 1IXGA 1Z7NE 1SI1A 3T9VA 2PYYA 3T22A 1DTGA 3LBSA 4U4XA 3JV9A 4ONYA 1RKMA 3U92A 1CB6A 1OQHA 2H98A 1MPBA 1M5CA 3LR1A 1P99A 2XXRA 3VXCA 2ZNSA 2P1SA 4OYVA 1MXVA 2D3IA 1ZTYA 3FJGA 4WEPA 4WKMA 2OLBA 4ELPA 3CIJA 3HN0A 2XX8A 3VLVA 4YMAA 3DLNA 5F7VA 3N6UA 5H8SA 1IQ7A 3E9XA 3HSTA 4H5FA 3IB1A 2ZNUA 1US5A 4BDQA 3PD9A 4LA9A 1TT1A 2D21A 4YMBA 4EUOA 3OD7A 2RC7A 1II5A 1VFDA 2QJEA 4NEDA 2Y7WA 2GH9A 5LOMA 1D4NA 4RA1A 2F35A 4O3BA 4F1VA 2HAVA 2I48A 2ZXTA 4QSDA 5IKBA 4N6PA 4QFLA 3G3JA 5I2KA 5I59B 1IZ1A 4JWOA 4G68C 4JXIA 3VVEA 1IEJA 4XKNA 3MPKA 3U8QA 4HTGA 4HW8A 4KR5A 4AB5A 2Y7PA 1QULA 3VVDA 5ICTA 1Y1ZA 4RPNA 3TQLA 2PBWA 3UGWA 1DPEA 1H43A 4G77A 1VFEA 3CR9A 3IB0A 2I3VA 2R6GE 4YZZA 3ZKKA 4POXA 1D3KA 1HSLA 4FJPA 2CMOA 3B7DA 4JWXA 1FQFA 1N3WA 3SEVA 3MWBA 3SEYA 2UVIA 1I69A 4TLMB 3ONMA 2O1LA 2O51A 2XXQA 1JNFA 2PX1A 5CRYA 3MVXA 4GVOA 3UK4A 1LAXA 3U93A 3FXRA 3O29A 2I0BA 3TCHA 1S50A 5HBCA 4ELQA 4LUBA 3TYHA 5EHSA 4R73A 1B2HA 1MH4A 5M2VA 2OZZA 4OWDA 4KHZE 3VLWA 2QPQA 3H06B 3CFZA 5A5XA 3QK6A 5ICQA 3TZAA 4F19A 3FJMA 2CZLA 2E0SA 1B7ZA 3UP9A 1OVBA 3RTWB 4JWYA 2Y7RA 4WXJA 3C9HA 1YCJA 1LCFA 4U1ZA 3ODBA 5H8HB 5H8NB 1GR2A 1WDNA 1O7TA 5DVJA 1IIWA 4ZDMA 3TODA 4P0IA 4LP2B 1IXHA 3T9UA 5H8QB 4BDRA 2G29A 4YB7A 3ZS6A 1LCTA 3H6UA 2E1SA 3E13X 2KLFA 1SD3A 1USYH 2UXAA 1YPNA 4F3BA 1B0HA 4HCWA 1EU8A 4M1VA 5B70A 3S9NC 1LFHA 5CC2A 2O84X 4G8HA 5DEXA 1Y3QA 2UVJA 5HM4B 3IO6A 4R9FA 4E0XA 2YPNA 3PUYE 2WKYA 1A99A 4R6YA 5JTYB 3IX1A 1EZ9A 4LZ7A 1SYHA 3FXQA 3LSXA 3T9HB 1H76A 5I59A 3B6QA 2I58A 4H5GA 3VLUA 2OK2A 2IEEA 1B1HA 1OIBA 2V3TA 3HPIA 5I2NB 2O68A 4NWCA 1AOVA 2HXWA 4DXUA 1BIYA 3KZGA 4R9GA 3ZKLA 2HAUA 1FQDA 3EHSA 3RPWA 3O6IA 4FIMA 1QUIA 1SI0A 2ZYOA 2V84A 4IO2A 1N3XA 3TEPA 2V25A 1A55A 1N04A 1POTA 3OSQA 3VE1B 2DS9A 2FYIA 1A54A 3VV5A 4NF6B 2H25A 2OBGA 1LGBC 3HHFA 2ZNTA 2FNCA 3A09A 3HCQA 2ESNA 1D9YA 1MQDA 2RC9A 2RCBA 2UYEA 4MLQA 2QL3A 3QAXA 2ZYNA 1M5FA 4NF8B 4M4GA 2Y7KA 3TTLA 2NXOA 4DIGA 3ILUB 2XXUA 4OEUA 2ZMBA 2ZYMA 4OTEA 4DDDA 1POY1 2DE4A 1MXUA 1US4A 4R72A 1B05A 5I57A 3MQ9A 4MF3A 3HV1A 1FW0A 4F22A 1T0KA 5TP9B 2QS3A 2XXXA 3F11A 3QUFA 5CMKA 4ISUA 5TPAB 1MG1A 4U23A 3OSRA 2F8DA 1MXYA 1VSOA 2HZLA 4ELRA 3OO8A 5FTHA 5H8NA 2RKMA 4Q30B 4GLIA 3R7XA 2XHDA 4OFLA 3TTNA 5F1QA 2DVZA 3PUXE 4XXUA 5AA2B 2HQ0A 4KI0E 5H8QA 3TCFA 2REJA 4IO3A 1O63A 4OVJA 1EZOA 4XKRA 4ZECA 4KYDA 1MXXA 3U72A 3K02A 4EF2A 2VHAA 3PV0E 4I1DA 1IITA 1M5BA 1NNKA 4ZS9A 4LZ8A 3C31A 2Z23A 2R71A 2YLNA 3ILTB 4R6HA 3V5AA 4KD5A 4MH5A 5FHNA 4LZ5A 2XXYA 4F2OA 4OQOA 3RQTA 5KCJA 1TFAA 3S9LC 5JTYA 3RGYA 2Q2AA 3K2DA 5CM6A 3RT8A 3KFMA 3VFJA 1GGGA 1SW4A 3SERA 3MPLA 1UIVA 2Q9TA 3G3FA 1CE2A 3CFLA 1LAHE 1BP5A 1ZKBA 4ZE9A 4U2RA 2XX7A 3DP6A 3SKPA 1JEUA 4FEBA 5H8FA 4X9TA 3MW0A 3IOWA 1MQGA 2BJJX 4YKPA 3MVYA 4OERA 2X26A 3C4MA 3PUVE 4FAJA 2B3FA 1DSNA 1RYOA 3FXUA 3SEXA 4THIA 2Q8JA 4KCCA 1FQAA 2VD2A 3CI8A 2F7BA 4MFIA 1NNPA 4F18A 1ZU0A 1B46A 2I4CA 3KJTA 1DOTA 2O6AA 1M5DA 3O6HA 3PPOA 4H8JA 1URDA 1PB8A 1LLSA 4BDOA 1USYE 1B4ZA 2W7YA 2I49A 1R9QA 3QXMA 3HHGA 2R9JA 3TPAA 2DQVA 2GRVA 4NF4B 3EPEA 3OEMA 4AB6A 4EXLA 4R2BA 2PVUA 4IO5A 3CVGA 3MP8A 1HSEA 2O7UA 3Q26A 1ANFA 4IY5A 3OOAA 1P1NA 4XIGQ 4KYEA 1ZBMA 2NUVA 4R75A 2DYXA 3PMVA 1I6AA 1MXZA 3KJ7A 1TXFA 5AA2A 1PB9A 4GD5A 1FTJA 2G93A 1JETA 1SW1A 4QFKA 4PETA 4OMBA 2F7CA 4U1OA 3MAMA 3LSFB 3KGCA 3MZ9A 3TMGA 2NOOA 2F34A 3GXAA 4DLDA 1JVYA 4Q8RA 1SDXA 3TQWA 2B3BA 3WAEA 1QKAA 3G3IA 1YTVA 2GHAA 2V93A 1SYIA 4TQUQ 1JW1A 2I0CA 1LBBA 3LUYA 3V83A 4JSOA 4ZEKA 1M5EA 3H6WA 4C1TA 5L9SA 3LSLA 3N26A 3RTFB 3MP1A 3OO9A 3MC2A 3T93B 5CBRA 2DE2A 1O64A 2PMSA 5AE4A 3O97A 5I56B 1XOCA 3TELA 1ATGA 4H6DA 4PFWA 4P11A 1H3DA 4EQBA 4ZEDA 1B7HA 3K1MA 3KSXA 1SW2A 5CBSA 1MDQA 4DZ1A 1AH5A 4XKPA 4QHQA 1MPDA 2UVHA 4QSCA 4O3AA 4UACA 4R6KA 3K6WA 1ELJA 1DMBA 3FJ7A 1XVYA 4X1BA 2DVCA 3Q29A 4OXVA 1QJMA 4H8IA 2HCAA 3OO6A 2THIA 3GZGA 3IOUA 5L9OA 3SESA 2UYFA 3RLFE 3H6VA 4DCXA 1B6HA 3U1OA 1Y20A 1B3HA 4XTCQ 5ELVA 1H45A 3RT6B 1BKAA 3RNNA 1B7UA 1MY0A 5TU0A 3TCGA 3IR1A 3FUZA 3OELA 3UIFA 4GF8A 1MQJA 2QSXA 2F7AA 3IO4A 2PT2A 4NF4A 5L8DA 4RJZA 2OWSA 1XHYA 4IGRA 4PFYA 3KN3A 1Y4TA 1MXWA 4DXBA 4F39A 3QIMA 3G7WA 2Z8FA 5CI5A 4KYSA 2ABHA 2ONKE 5I58B 4G8MA 2ONSA 1LFIA 2RC8A 1B3GA 1ZLQA 4FATA 4XKQA 4FE8A 2Y84A 4RYAA 3K4UA 4LVQA 5CMBA 1B1XA 1XT8A 1I6QA 2GHBA 1XVXA 3MZBA 3MVZA 4X48A 1B5IA 4EDPA 1B58A 5CMMA 3TUSA 3FVOA 4RK9A 3CSGA 4NE4A 3U94A 2FA7A 1PB7A 3EN3A 5K2XA 1B51A 2IA4A 3M3FA 2H4IA 3G3GA 2XX9A 3T66A 5BUUA 3H4ZA 1YAEA 3BFUA 4RY1A 2OWTA 1LFGA 4IB2A 5J1DA 4X1DA 4I8CA 1NL5A 2ZYKA 1Q35A 4GRKA 1TWYA 4AQ4A 4LATA 3PUWE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FPEA 5KDTB 3K1PA 4E0WA 1R6ZA 4G8NA 1FPFA 1N7XA 3A3CA 3WAFA 4O3CA 2XXPA 2RCAA 3GBAA 4GIZA 4G68B 4F3SA 4PAFA 5IZ3A 5KZTA 4P9KA 3P7IA 4GFRA 3G3HA 4X8RA 4LQ2A 1B5HA 2H99A 4WEDA 4PTKA 2H9BA 3EF7A 2VP1A 1FQBA 1AMFA 2DWJA 5H8HA 5I2KB 1KZ8A 1Y4CA 2QS1A 1Q9DA 5AA3A 3R26A 3RUMA 4PFUA 2QS2A 4BDLA 3MVWA 4ESWA 4ZEIA 4ZEFA 1NUWA 5EHMA 2ALUA 2MKZA 5DT6A 2XD3A 1MY1A 4KPTA 4PFTA 1Q1KA 1LB9A 3I5OA 5I84A 3K1NA 4QXDA 3GBBA 3D4GA 5ESYA 1JEVA 1UTHB 1A8EA 2YJPA 1GVCA 3THIA 4H1XA 2X7PA 4HCYA 2V3QA 1EYJA 3TAJA 2F6PA 4ELOA 4Q5TA 3MBPA 3E3KA 4O8MA 3O66A 5DYHA 1BTJA 2NWJA 2Q74A 3O2AA 1LB8A 1NH7A 3R6UA 2CZIA 1FTKA 2LAOA 2O7IA 3FATA 3TTKA 2NVUB 3FD3A 4ZEBA 4TLLB 1PBPA 1ZIUA 2Z8EA 1IMAA 1NMUA 3JYRA 4LONB 5CMCA 3V8XB 3CFXA 3IJOB 1LBCA 1B40A 5I2NA 1B4HA 5IAIA 1DBZA 4QRZA 4N07A 4JSDA 4F31B 4OVPA 4P0GA 5DTBA 1VE4A 4N81A 4F1YA 3BKIB 3DP4A 3V89B 4PFBA 3PPNA 5LTCA 4YICA 3QYTA 1JW5A 4NWDA 1NUZA 3EQ1A 4YKJA 1OLAA 2F3DA 4PF6A 4NQ8A 4YAHX 4F1UA 3IJXB 3KN8A 4RNSA 4GQOA 3FV2A 1FCKA 3MUQA 4QFNA 1QUKA 1JQFA 1XC1A 5FHOA 3FV1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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