5AA4B

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with cell-wall tetrapeptide
Total Genus 145
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
145
sequence length
417
structure length
417
Chain Sequence
EGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
total genus 145
structure length 417
sequence length 417
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 4.2.2.-:
pdb deposition date 2015-07-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa4B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa4B02
3IOUA 1AH5A 3RT6B 4YU0A 4PETA 4ECFA 3IJOB 3K6XA 4QSCA 3HV1A 3K6WA 1RYOA 1Y3NA 2ZYOA 2F7AA 4U4XA 2ALUA 1B58A 2ZNSA 2Y7PA 1ZU0A 3OMBA 1A40A 4XKPA 4GL8A 2XXRA 2V93A 4P11A 4WEPA 2HCAA 1WDNA 2NXOA 4FECA 4G77A 4LUBA 4IO7A 4OFJA 4MLVA 3DP6A 1YTVA 1PBPA 4HS7A 1M5EA 2XXPA 3RGYA 4F3GA 3PMXA 1XS5A 3ODBA 2H99A 3G3HA 2PVUA 1MXZA 3U92A 2FA7A 2HXWA 5AA3A 1L5TA 2ZYMA 1P1OA 2ZYKA 4YB5A 3JYRA 5H8NA 1Z7ME 2XXYA 1TFDA 5ITPA 1B4HA 1YPNA 2F97A 1MH4A 4GRKA 3H06B 1SW4A 3PMVA 3SEWA 2IEEA 1VR5A 4KHZE 2RC7A 3RLFE 3MVYA 4TQUQ 1MH3A 4PFWA 3FIRA 3C9HA 3T22A 1IQ7A 1A99A 3N5LA 5IAIA 4OZ9A 3IAZA 1MQIA 4HW8A 3S2VA 2ZMBA 4H5FA 3TAJA 1D4NA 3MVZA 3CG1A 1RYXA 3QSLA 3TDJA 1A7LA 1H3DA 3WAEA 4G2ZA 2R9JA 3C33A 1A8FA 3QAXA 4YICA 2X7PA 1EZPA 3MWBA 3MC2A 1OQHA 4OFOA 5FHOA 2XD2A 3FVGA 3MW0A 2VGQA 1I6BA 4NF4A 2PMSA 1H76A 2QS4A 2P2AA 4I62A 2REGA 1IXCA 1Y4TA 4F19A 1N76A 1MM7A 2THIA 4ZEFA 2UVJA 1MG1A 1SYHA 3VVDA 3CIJA 1H45A 2RF1A 1BLFA 1B51A 1S9TA 3N26A 1B1HA 4OENA 1B3HA 1MXVA 1MY2A 3T9VA 3KZGA 1A54A 2DYXA 1SD3A 3TTRA 3E3KA 4LQ5A 4YB6A 1URGA 4KPTA 2F78A 1QKAA 1NNTA 2XD3A 3MPKA 2PX1A 2Z8EA 3SKPA 2O1MA 5FHNA 1N84A 1JVYA 1FCKA 5K2XA 4ZEKA 3RNNA 4KCDA 1YCJA 3K4UA 1MY0A 1FQEA 3MVWA 3C36A 1B5HA 2QS1A 4BLAA 1II5A 4PFUA 3DP8A 5ICQA 3ZS6A 3OENA 2AL4A 5CBRA 4E0XA 3T9UA 5AA2A 3RT8A 2W7YA 4GQOA 5I56A 2GRVA 1Z7NE 2OJTA 2REJA 1MDQA 1M5DA 5CI5A 2F35A 1MY1A 5IKBA 4EUOA 5I57A 4EF2A 2Y84A 3KJ7A 4MH5A 5AA4B 1EU8A 1Y9UA 2OWSA 1FTMA 4GF8A 3KBRA 3N6TA 2A5TB 3V89B 3LBSA 5CMMA 2D3IA 3VLVA 1DOTA 2HFBA 4NF5A 1GTKA 1BTJA 1IITA 1JVXA 3R26A 1S50A 4AQ4A 5BUUA 3FJ7A 4KD5A 3W9WA 4YKKA 4F2OA 2X7QA 2XXHA 1N7WA 1OMPA 3BFUA 1NMUA 5DTBA 2F8DA 3B6WA 4JB7A 3P7IA 3SEYA 5HBCA 2HQ0A 3MJNA 4OVJA 1D9VA 3ILUB 4RPNA 3HCQA 2CZLA 3TODA 3G3GA 1B3FA 3LSLA 3Q25A 3FVOA 2DWAA 1LLSA 3FXUA 4IO4A 1POTA 1IXIA 4BDLA 1B3EA 5L9MA 1Q35A 2I49A 3OSRA 1IXGA 4U1OA 3S9MC 1FTJA 3KSXA 2Y7RA 1A8EA 2Z22A 1ZJLA 3DM0A 2Z8DA 4IB2A 2IA4A 5DVJA 3ILTB 3TMGA 3PPOA 4M4GA 4AB5A 4F3SA 1JW1A 3E4RA 5I2KA 4GD5A 2O84X 5I58B 2V84A 1D9YA 1B2HA 5CM6A 5FHMA 2F36A 3VXCA 3EN3A 1XVYA 4H8IA 4IY6A 4G68B 4LZ5A 3CVGA 5AA2D 4R2FA 1MQDA 3U72A 4OWDA 1VFEA 1R1NA 3FXRA 3GBAA 1GVCA 4Q0CA 3PPRA 1SYIA 3PUVE 4Q30B 3K6UA 4KQPA 2UXAA 4XKNA 4R73A 5H8QB 2PT1A 5I2NA 3PD8A 5H8HB 4I8CA 4RJZA 4GVOA 5HM4B 1PB9A 4F3PA 1FQBA 1DTZA 3O6IA 1FTOA 3V83A 2LAOA 3ZSFA 4ZZAA 3FV1A 3PUWE 4G8HA 4DLDA 5HPQA 3RTFB 4QFOA 3IB2A 1MY4A 2DE3A 3RN8A 1NH7A 3A3UA 2I3WA 1UTBA 3GLBA 3EHUA 3KOSA 4LZ7A 1NKXA 2XX8A 4PFYA 5CMCA 3F11A 1M5CA 2RC9A 1VE4A 3CRBA 1PC3A 2UVGA 5I59A 2B65A 1O64A 2O7IA 2Z8FA 4R6YA 1I6AA 5DYHA 3SEVA 2UYEA 4IO2A 1T0KA 2V3TA 2A5SA 4DCXA 1Y1MA 4F39A 3TCFA 2VD3A 3QUFA 2RKMA 1RKMA 3OELA 5EHSA 1SDXA 2DWHA 3N94A 4YKIA 2NWJA 5F7VA 3C4MA 2HZLA 4X1DA 3VXBA 1HSJA 2YJPA 1YAEA 3O97A 5B7DA 4OETA 5AA1A 4NWDA 3W15C 4ELRA 3IOTA 1P1WA 4U22A 2H4IA 4OYVA 4G8NA 4NF8A 3CR9A 3CSGA 3O28A 1NNKA 1N0TA 3B6QA 4OFLA 2DWJA 2DXRA 2I4BA 3R6UA 4KYSA 3H03A 2P0SA 3KEIA 4KYEA 3U94A 3ONMA 1MXWA 3QUJA 4DE8A 2OK2A 3G3JA 3O66A 4M1VA 1MDP1 3B7DA 3TFLA 3LSXA 5L9SA 3HN0A 3RQTA 1MQGA 2ZNTA 4ELQA 4FEDA 3LC8A 3EHTA 4ND9A 3HO7A 1J1NA 1JEUA 3Q28A 4QSDA 1P1NA 5DVIA 3S9NC 1CB6A 4DXUA 5JTYB 4ESWA 1NNPA 4NE4A 1LFHA 1XHYA 5L9OA 4TOZA 2I58A 2ESNA 1JW4A 5B70A 2XXQA 1EH3A 3K01A 1B5IA 1LCFA 4QHQA 3U93A 3RPWA 4OEUA 3BBRA 4H0WA 4TLLB 1USYH 1US4A 4G68C 2UYFA 3KGCA 3HHGA 2PYYA 5CBSA 2F7BA 5L8DA 3B6TA 3MAMA 4JWYA 5A5XA 2Y7WA 2Z23A 1QUIA 4RYAA 1VFDA 1QKBA 2O68A 3PUZE 4FIMA 4H65A 3T96B 3MZ1A 4OERA 4H6DA 3TEPA 2XX9A 4N13A 2X26A 1FQCA 1ZLQA 3MVXA 3G7WA 2PBWA 4WKMA 3VVEA 1H43A 3BFTA 3OSQA 3T9HB 2XXTA 2H25A 4Q8RA 1TWYA 1TXFA 1FQFA 1I6QA 2ZYNA 4U2RA 4JSOA 2OCUA 4POWA 4DZ1A 2ONKE 1UTHB 3OO7A 5EHMA 3TELA 3OOAA 4YZZA 2VP1A 5TPAB 1JQFA 2DE2A 3U8QA 4NF6B 2DVCA 3PPNA 4YMAA 2R6GE 4EXKA 4UA8A 3LSWA 2XXXA 5I56B 4F18A 4F22A 3KN8A 1Q1KA 4OTEA 1Y1ZA 3FATA 1M5FA 1Y3QA 5K2YA 4XKRA 5I57B 1LFGA 2ABHA 2QMWA 4MF3A 3FV2A 3TCHA 3K02A 4YB7A 2QS2A 4OQOA 5CMBA 1ATGA 3D4CA 3O6HA 4ELOA 4NF5B 1PDAA 4RK2A 1MPCA 3S9EA 5I84A 3S4UA 5LOMA 4LVQA 4N07A 1XT8A 3V5AA 2F5XA 1AL3A 3MZ9A 1PEBA 3FZVA 3TQLA 2RINA 4PFTA 4QRZA 1F9BA 2Q89A 4ZE8A 1MPBA 2I3VA 5FTIA 3I3VA 2XXWA 3M3KA 3Q27A 3KOTA 2YPNA 5CRYA 1IIWA 4UACA 4R72A 3C32A 4TLMB 4GXSB 3SDFA 3LSFB 4LA9A 2DWIA 1MRPA 3E9XA 2Q2CA 2I48A 1MQHA 1B5JA 2QSXA 3HPIA 5H8FB 4LONB 3EQ1A 3IL1B 1SBPA 4JWXA 2UVHA 4OMBA 4GIZA 4C1UA 5BWJA 4DXBA 1EZ9A 4QFPA 1N3XA 1B46A 1OVTA 1PB7A 1OLAA 2D5WA 3FXQA 2RCBA 4GWOA 1N3WA 4F1VA 2ANJA 2YLNA 4IGRA 4QF9A 1O7TA 2QRYA 1OVBA 2ZNUA 1H44A 4XXUA 3IK6B 1UIUA 2Y7KA 4L17A 4GOTA 1PB8A 3EPEA 4DDDA 2DP8A 3FD3A 3FJGA 3DP4A 1R6ZA 4DXCA 1N04A 1N7XA 2VOZA 5KCJA 4G8MA 1B4ZA 3CFZA 4ESXA 4Z0IA 5TP9A 3K0VA 2NOOA 4POXA 1SQYA 1QUKA 3IX1A 1SW2A 2HAUA 3EHSA 3M8UA 2R71A 1NL5A 1ZKBA 3O29A 3THIA 1LB9A 3PPPA 1HSLA 4DIGA 1P1QA 3PU5A 1B0HA 2RC8A 1XC1A 4R6HA 3H6UA 1B40A 4C1TA 2DOJA 3AXFA 2DQVA 4HCWA 1LAFE 2FYIA 3VE1B 4EQ9A 1CE2A 2I4CA 1M5BA 1R9LA 2HAVA 3BKIB 1MS7A 3SESA 3SERA 2O6AA 1OIBA 4XTCQ 3TZAA 5I59B 1SW5A 4YAHX 3KN3A 4LATA 1MY3A 1ANFA 4MBPA 3QYTA 5DEXB 1Y4CA 4P0IA 1P99A 2OBGA 3JV9A 1HSEA 1UQWA 4G68A 1Y3PA 1B7ZA 3CFLA 4QFLA 1WVJA 3IOWA 5EYFA 3T93B 2F7CA 3TCGA 1OLCA 4EF1A 2HEUA 3TUSA 3IJXB 4FATA 2QS3A 4MFIA 4DCYA 1FW0A 2ONRA 5H8QA 2I6EA 5H8HA 3UIFA 3UGWA 4KCCA 1QJMA 2XXIA 4HTGA 2DS9A 1AMFA 2QL3A 4JWOA 1NFTA 3MQ9A 4OESA 5DVFA 3K1MA 4O3AA 1PBQA 3KSJA 3Q26A 3KFMA 4LZ8A 2F6PA 1DSNA 2V25A 1TT1A 3PV0E 5H8SA 1NH8A 2VHAA 4IY5A 3GZGA 1KWHA 4X9TA 4U23A 1USYE 3IB1A 1FQAA 1OQGA 1XOCA 2OZZA 3OD7A 5KDTA 2HZKA 2XXVA 2P1SA 3K6VA 3EF7A 3IOVA 4R9GA 3FASA 4THIA 3VFJA 2AIXA 5H8NB 3H7MA 3PPQA 1AIVA 4LQ2A 3TTNA 5JK4A 3KJTA 3TPAA 1ZBMA 4GLIA 2V3QA 1GGGA 4U21A 3V8XB 1LB8A 1MXYA 4O3BA 3PMWA 3KN7A 4BDMA 1QVSA 3HSTA 3H3GA 3H4ZA 2QJEA 1B0LA 4KR5A 1IEJA 5A5XB 3KG2A 3MZBA 2KLFA 2DSFA 1NNFA 4ZEBA 5ISUA 3IO4A 3MPLA 1SI0A 4NTLA 4Z7EA 3TTLA 3MP8A 1BKAA 1BP5A 3D4GA 1S7YA 1JETA 3W9VA 3DELB 1XVXA 4NF4B 1B6HA 5TU0A 5FTHA 2AL5A 3JZJA 2GHAA 4RK9A 3M3FA 5ELVA 3I5OA 3K00A 1B05A 4ZEIA 2Q9TA 3K1PA 1URDA 5JTYA 4FEBA 4F31B 2Y7IA 2GHBA 3GBBA 4IGTA 1GV8A 4H8JA 1JW5A 2BJJX 4FE8A 4MLQA 3Q29A 1QUJA 1MM6A 4PQJA 3IORA 2E1SA 1LCTA 3U1OA 1LAHE 3H6TA 1IZ1A 4YMBA 1FTLA 3T9XB 5KZTA 1EZOA 3FGSA 3L6GA 4R74A 4JBZA 4EQ7A 3USDA 2XXUA 3C34A 3CI8A 2UVIA 2V3UA 3PD9A 4QFNA 2GH9A 1SW1A 3A09A 1FQDA 4JDFA 1BIYA 2E0SA 1ZTYA 1DPPA 3S9LC 5AA2B 4KYDA 4ZZEA 4OXVA 1SI1A 3OO6A 2Q8JA 4EDPA 2ONSA 1O63A 4F2QA 2H9BA 4FORA 4G4PA 3R7XA 3HHFA 3O2AA 5CC2A 4RNSA 4P0GA 2O51A 3MBPA 1B7HA 2DVZA 3G3IA 3RTWB 2I0CA 1Y20A 1UTHA 5JEIA 1MQJA 3UORA 1MPDA 3MP1A 5TPAA 5CMKA 5ITOA 4ZE9A 1LAXA 4NF6A 5DT6A 1MXUA 3K1NA 4I9DA 3O6GA 3QK6A 3SETA 4PE5B 3QIMA 3IO6A 2O7UA 2G29A 1B52A 4RXLA 3LR1A 2B3FA 3IR1A 2H5YA 3OO8A 4X1BA 3ZKLA 2FNCA 3OO9A 3I6VA 1SVXB 5M2VA 1LGBC 4I1DA 4IO5A 3G3FA 4YKPA 3TTKA 3UK4A 1IXHA 3OEKA 4U1ZA 2AYSA 1VSOA 5ICTA 1GR2A 4E0WA 4ZECA 4H5GA 4WXJA 3UN6A 2NUVA 3OXNA 4F29A 3FVNA 4F1YA 4ZS9A 2WKYA 3L6HA 1DMBA 5KCJB 2Q88A 3T66A 5AA4A 5I2KB 4NWCA 2Q2AA 3ZKKA 2A5TA 4EQBA 4C0RA 2M8CA 4K3FA 5TP9B 3N6UA 2DXYA 4O3CA 1MXXA 3O9PA 2OLBA 3CFXA 4U4SA 1LBBA 3OEMA 4BDRA 4QSEA 1FTKA 1D3KA 3H6VA 4GXAA 4YKJA 3TKDA 1I69A 1B7UA 3PUXE 4HCYA 4XIGQ 2I0BA 4ZDMA 2DE4A 4RA1A 1UIVA 2F34A 5H8FA 1JEVA 4ELPA 3WAFA 4F1UA 2H98A 3C31A 2VD2A 4GFRA 2QPQA 2O69A 5I2NB 1R9QA 1B1XA 2NVUB 5F1QA 1LBCA 1B32A 4FJPA 4JSDA 3GXAA 1ZMGA 4RPOA 3E13X 4XKQA 4H67A 4IO3A 3VDFA 4NEDA 2RCAA 3TQWA 2XX7A 4F3BA 3IB0A 4BDOA 3SEXA 1US5A 4ZEDA 4JXIA 1UTBB 1DPEA 4WEDA 3M3LA 1ZIUA 4ONYA 4KFQA 1QULA 3SEUA 3MP6A 3VV5A 3UA8A 4OHNA 4IO6A 5I58A 3MUQA 2PT2A 4PP0A 1POY1 4R6KA 5J1DA 3K2DA 3PGFA 3RY3A 2ZXTA 1P1UA 2GFEA 1WODA 3CG3A 4AB6A 5AE4A 4LP2B 2OWTA 2D21A 2O1LA 3VVFA 1LAGE 3QXMA 1ELJA 3RUMA 4R2BA 1JNFA 2CMOA 3VLUA 3A3CA 2F6GA 4KI0E 1LSTA 4EXLA 3H6WA 3PUYE 4BDQA 1B3GA 1AOVA 4NF8B 4X48A 3UP9A 3G3KA 3TTMA 3TYHA 2QMXA 3DLNA 4GL0A 3C35A 3FVKA 1TFAA 1IUDA 4R75A 4OEVA 3CSBA 3FJMA 3ECRA 5KDTB 1B3LA 1QW0A 4ISUA 1A55A 4Q5TA 4FAJA 2B3BA 4RY1A 4NMYA 1B9JA 1URSA 4QFKA 5DEXA 4N6PA 2XHDA 2G93A 3FUZA 1DTGA 3LUYA 1LFIA 4BDNA 4H1XA 4R9FA 3VLWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IOUA 1AH5A 3RT6B 4MMPA 2HXRA 3IFAA 4YU0A 4PETA 4ECFA 3IJOB 3K6XA 4QSCA 3HV1A 3K6WA 1RYOA 1Y3NA 2ZYOA 2F7AA 4U4XA 2ALUA 4MAGA 1B58A 2ZNSA 2Y7PA 1ZU0A 3OMBA 2FVZA 1A40A 4XKPA 4GL8A 2XXRA 2V93A 4P11A 4WEPA 2HCAA 1WDNA 2NXOA 2QFLA 5IM2A 4H45A 4FECA 4G77A 4LUBA 4IO7A 4OFJA 4MLVA 3DP6A 1YTVA 3QMFA 5IZ3A 1PBPA 4HS7A 1M5EA 2XXPA 3RGYA 1FJ6A 4F3GA 3NOHA 3PMXA 3D1RA 1XS5A 3ODBA 2H99A 1KZ8A 3G3HA 2PVUA 1MXZA 2B4LA 3U92A 2FA7A 1AWBA 2HXWA 5AA3A 1L5TA 4O8MA 2VT5A 2ZYMA 1P1OA 2ZYKA 4YB5A 3JYRA 5H8NA 1Z7ME 2XXYA 1TFDA 5ITPA 1B4HA 1YPNA 2F97A 1MH4A 4GRKA 4GX4A 3H06B 1SW4A 3PMVA 3SEWA 3SZPA 4N6DA 2IEEA 1VR5A 4KHZE 2RC7A 3RLFE 3MVYA 1FPDA 4TQUQ 1MH3A 4JVCA 4PFWA 3FIRA 3C9HA 3T22A 1IQ7A 1A99A 2V4CA 3N5LA 5IAIA 4OZ9A 2P3NA 3IAZA 1MQIA 4HW8A 3S2VA 2ZMBA 4H5FA 3TAJA 1D4NA 3MVZA 3CG1A 1RYXA 3QSLA 3TDJA 1A7LA 1H3DA 1IMCA 3WAEA 4G2ZA 2R9JA 3C33A 1A8FA 3QAXA 4YICA 2X7PA 1EZPA 3MWBA 3MC2A 1XI6A 1OQHA 4OFOA 5FHOA 2XD2A 3KC1A 3FVGA 4P8BA 3MW0A 2VGQA 1I6BA 4NF4A 2PMSA 1H76A 2QS4A 2P2AA 4I62A 4UABA 2REGA 1IXCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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