3FVKA

Crystal structure of the human glutamate receptor, glur5, ligand-binding core in complex with 8-deoxy-neodysiherbaine a in space group p1
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
total genus 84
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvkA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvkA02
3TELA 3O6IA 4JWYA 4F39A 3C33A 3H6TA 2F6GA 3B6QA 3UORA 3IR1A 1AIVA 4RPOA 2X7PA 3OMBA 1US5A 2PVUA 3PUVE 3L6GA 4DE8A 2XXQA 4OERA 3IOWA 3MVYA 3GLBA 3U92A 4ELRA 1WVJA 5I56A 5CM6A 1A8EA 2R71A 3OOAA 4H8IA 1NKXA 4KR5A 5I2NA 4JDFA 3H6VA 3G3KA 2HZLA 1UTBB 2HZKA 1N76A 4XIGQ 4YZZA 1JETA 4P11A 4QFKA 1MH4A 1TFDA 4GWOA 3IO6A 3QYTA 5ISUA 4XTCQ 4X48A 1BP5A 4IO3A 1MPCA 3C36A 4LZ8A 4F1VA 4TLMB 2QMXA 2DE2A 2Z8FA 2GH9A 4IO4A 4F3BA 3QUJA 1VFEA 1IUDA 2RKMA 2A5SA 4PE5B 4ZE9A 4NTLA 1Y4CA 5L8DA 1B32A 4QSEA 3OO7A 2VOZA 4PFTA 3SKPA 3ODBA 2RINA 1USYH 4UACA 3RTFB 1NFTA 1FQBA 4KI0E 4F3PA 5AA2B 2UXAA 3QAXA 1OMPA 2QS3A 1XVXA 5H8NA 4N07A 4DXUA 3CG1A 3MVZA 4ESXA 3MUQA 4QRZA 1ZJLA 1OVTA 1OQHA 5I2KB 1MQHA 1MM7A 3USDA 3KBRA 4EQ7A 3T66A 4DXBA 4NWDA 4GD5A 4ZEIA 2OJTA 3K6VA 3S9EA 5F1QA 3C34A 1B52A 3PU5A 1HSJA 2REJA 2UVGA 3TPAA 5H8QB 3L6HA 4LP2B 2Z22A 2Y7KA 4GF8A 3OSRA 1EZ9A 4KYSA 1USYE 5DTBA 1B2HA 4FE8A 3MQ9A 3W9VA 4ELQA 1PBPA 4M4GA 3CSGA 4KPTA 3IOTA 4OQOA 5DT6A 3IOVA 4RYAA 4EDPA 1LAXA 3PGFA 2F78A 3U94A 4XKRA 3HV1A 3FASA 2DVCA 5I57A 1SW2A 4JWOA 1GV8A 3TCGA 1MXVA 1LLSA 4MBPA 2DWJA 2XXWA 2V3UA 5H8FB 4F29A 1GGGA 3U8QA 5KZTA 4N13A 3TQWA 3U72A 4KYDA 4ONYA 1LAHE 1LBCA 2OLBA 4F19A 1H76A 4Q8RA 2RCBA 4G68B 1JW1A 1P1WA 1ZIUA 5F7VA 5ELVA 5JK4A 3SETA 4O3AA 3PD8A 4EF1A 1UTHB 1CB6A 2LAOA 2I6EA 3IAZA 1BTJA 1DTGA 3A09A 4FEBA 4FIMA 1PC3A 5KCJA 2ZYNA 2QJEA 3M3FA 4THIA 1N7WA 4F2OA 1Y3QA 3SESA 1MY2A 3VVDA 1JNFA 4RNSA 4POXA 3G3JA 4NF6B 3CRBA 3TAJA 4YKKA 1SW5A 2XX7A 4XKPA 1MRPA 1FW0A 4YB7A 1SI0A 1ZKBA 3BBRA 3KGCA 1SBPA 4HCYA 1NNFA 4XKNA 1N3XA 3PMWA 1R9QA 2DWAA 2RC9A 4G4PA 5AA4B 1PB9A 3EPEA 1I69A 3JZJA 3MP8A 2O68A 4PETA 3U1OA 1ELJA 3FIRA 3PPQA 2XXHA 4GVOA 2W7YA 5CMBA 3VLWA 5DEXB 2QMWA 5EHMA 3MZBA 3RQTA 1Z7ME 5KDTA 3FGSA 1N84A 4Z7EA 3MPLA 2HXWA 2UVHA 4OEVA 1FTLA 3TTKA 1B51A 1MQJA 5ITPA 3O29A 4KQPA 1RYOA 5CMCA 1ZBMA 4ZEFA 4NF8B 3OEMA 1MXZA 1HSLA 1B1XA 1MH3A 3CFZA 5CBSA 2ALUA 4Q5TA 2VP1A 3PMXA 1D4NA 1MG1A 1EH3A 3T93B 2DYXA 2QPQA 1OLAA 1B3GA 3LR1A 4OXVA 3I6VA 3H4ZA 1B46A 5H8HB 1SI1A 1UIVA 4U21A 1QVSA 3KSJA 1NNKA 5DVFA 1GTKA 3G3HA 3K01A 4TLLB 3VXBA 4YB5A 2I48A 4EUOA 4GL8A 1DOTA 3TTLA 2FA7A 1KWHA 3RPWA 4FAJA 2P2AA 4H5FA 2GRVA 4QSDA 2RC8A 4H1XA 2HCAA 3A3UA 3RNNA 3MP1A 2DXRA 2IEEA 2ZNUA 2F97A 3VV5A 3MPKA 3N6TA 3SDFA 1SD3A 1B7HA 4U1OA 2F34A 1PEBA 4GIZA 3VLUA 3GBAA 4QHQA 4P0IA 4DIGA 2IA4A 1MY3A 4WEDA 1FQDA 4OFJA 1H3DA 4LVQA 2G29A 1SW4A 2DQVA 2GFEA 1MQIA 1QJMA 4NWCA 3BFTA 4RPNA 4HW8A 1A99A 3RT8A 3V5AA 4YAHX 4XKQA 2I0BA 2D3IA 4JB7A 4EQ9A 1I6QA 4IB2A 1UTBA 3M8UA 1MY1A 3TFLA 1IITA 3DLNA 3ZS6A 2VD2A 3R6UA 1B58A 3EQ1A 1B3HA 4BDLA 3TQLA 2HQ0A 1YPNA 1B05A 3FD3A 4MH5A 3IJXB 4WEPA 1MS7A 5TP9B 4H6DA 5I84A 4QSCA 2I49A 4OWDA 1B0LA 1QKAA 4DCYA 4PFUA 1B5IA 3MVWA 3OO8A 1H43A 2RC7A 5AA2A 4FORA 3KN8A 3H06B 1LFGA 4NMYA 1OLCA 3ONMA 4MLVA 1MPBA 1T0KA 4ZEKA 5FTHA 1POY1 5I2KA 3KJTA 2D21A 1O7TA 4KFQA 3K4UA 3GXAA 1R1NA 2H98A 4ZS9A 1LAFE 3SEUA 3OD7A 4U4XA 5H8QA 3UGWA 3TKDA 5EHSA 3BKIB 3PMVA 2RCAA 1DPEA 1FCKA 4R75A 2WKYA 1DSNA 4LZ5A 4LONB 4QFLA 2UYEA 1JVXA 1D3KA 3Q28A 1LGBC 5I56B 3B6WA 3IOUA 4OETA 3SERA 3O6HA 4U23A 3S9LC 3CI8A 3V89B 4IO2A 1O63A 3FV2A 3E13X 1L5TA 3EHTA 5I2NB 1Y20A 4ELOA 5HPQA 4F1YA 1LCFA 1IXCA 2Q2CA 1FTOA 2QS2A 2F7AA 3G3GA 1Y1ZA 3V83A 1QW0A 5H8FA 1XHYA 1B40A 1MQGA 1CE2A 1RYXA 3ZSFA 4OENA 3ECRA 2Y7IA 2PX1A 4EXLA 4ELPA 3HPIA 4G68A 3LSFB 3SEVA 4WXJA 3RUMA 1M5BA 3DELB 4NF4B 3K6WA 5H8SA 4ZZAA 1IXHA 4GL0A 3I5OA 1Y1MA 4OHNA 2QL3A 4AB5A 3QK6A 4AQ4A 5I58B 4K3FA 1EU8A 1IEJA 1R6ZA 4I1DA 3O66A 3C4MA 5CC2A 1FTMA 3U93A 3VFJA 3HO7A 4MLQA 1I6AA 4NF6A 3G7WA 3KFMA 3W15C 2HFBA 3E4RA 1MY4A 2O84X 4ZEBA 4H5GA 4OESA 1NH8A 1BIYA 2Z23A 3PD9A 4PP0A 1PDAA 3K1PA 1SDXA 4X1BA 4DCXA 5AA3A 5CI5A 5AA4A 3TMGA 1LFIA 1HSEA 1VE4A 3T9XB 2XD2A 2H5YA 3IORA 1SW1A 4IO5A 1B3LA 1H45A 2Z8EA 1M5CA 4I62A 3B6TA 4U1ZA 5TPAA 3FXRA 3FATA 1URDA 3H7MA 3CFXA 3MW0A 5JTYB 3M3KA 4YKJA 5CBRA 2R9JA 5L9MA 4RXLA 1URSA 3LSLA 3M3LA 4DXCA 4G68C 3C9HA 1OQGA 3EN3A 5I57B 3HCQA 5J1DA 3OENA 1B5HA 1US4A 4NE4A 3VE1B 1H44A 2ZYOA 4N6PA 1B4HA 1TT1A 4R9GA 1AH5A 3PPNA 3ZKKA 5I59A 3PUWE 4PFYA 2FYIA 3KJ7A 1B4ZA 1IQ7A 3KSXA 5FHMA 3PPPA 1D9VA 4YKPA 1NNTA 2XXXA 2B65A 1QUJA 2CMOA 3Q27A 4GFRA 2DWIA 3D4CA 2AL4A 1MXWA 2A5TA 5H8HA 1JVYA 1B1HA 5KCJB 3WAFA 4BDMA 4BDRA 2ZNTA 3T22A 3N6UA 2D5WA 2I4CA 1TWYA 3HN0A 1MXXA 2Z8DA 3KOTA 2PYYA 1DMBA 3PUZE 3LUYA 2XX8A 4RA1A 4EXKA 3R26A 3KEIA 2ONSA 4LQ2A 5A5XB 2OK2A 3KG2A 3H6UA 2DWHA 4RK2A 4G8HA 3IB1A 2Y7PA 4JSDA 1QKBA 3IO4A 3RN8A 2CZLA 1J1NA 4KCDA 3G3IA 3THIA 1PB7A 2XHDA 3UA8A 1ZU0A 4O3BA 2GHBA 2XXUA 4R73A 4JBZA 3MJNA 4BDNA 2OZZA 1FQEA 2OBGA 1ZTYA 2O51A 3MC2A 3B7DA 4NF5B 3CVGA 5CMMA 5M2VA 2GHAA 1IZ1A 2F36A 1SYIA 3H03A 1XC1A 3K6UA 3PV0E 5IKBA 4OTEA 1Y3NA 4GXAA 1GVCA 5EYFA 4E0WA 1QUKA 1MXYA 4HTGA 4YU0A 2F8DA 3DP4A 4ZECA 2Y7WA 2H25A 1AMFA 2HAUA 3IB2A 4F18A 4KYEA 2VD3A 4POWA 3Q25A 5BUUA 3FVNA 1JW5A 1LAGE 2XXIA 3GZGA 2QSXA 1TXFA 4FEDA 3S4UA 3OXNA 5DVJA 3KN7A 3VDFA 4DLDA 2O1MA 2VHAA 2KLFA 3RY3A 1MXUA 2PT2A 4TOZA 2DSFA 3HHGA 3JYRA 4ZZEA 1S7YA 5B70A 2ANJA 4PQJA 1B3FA 3DM0A 1Q35A 1N7XA 1N3WA 2UVIA 5LOMA 1A55A 5DVIA 3PPRA 2NXOA 1YTVA 3K00A 3S9MC 3TEPA 2V93A 3FXQA 3TUSA 2THIA 4JSOA 1OVBA 2R6GE 4G2ZA 2ONKE 4F22A 3T9HB 2B3BA 4F3GA 2F6PA 2YLNA 4IO6A 2OWSA 3MZ1A 4G8NA 2DXYA 2V3TA 4GXSB 4I9DA 4JWXA 1VFDA 4QFPA 2E1SA 1A40A 1D9YA 2QS4A 3LC8A 3OO9A 4F2QA 2F5XA 3FVKA 3O9PA 3JV9A 3HSTA 4DZ1A 4YB6A 5ICQA 3MZ9A 4ZE8A 2ONRA 3FVGA 4FATA 2XXYA 2XXPA 3R7XA 3F11A 3UIFA 4OZ9A 4RK9A 3TODA 1WDNA 3IL1B 2F35A 2I3WA 2F7BA 2QRYA 3ILUB 3FUZA 3MVXA 1ATGA 1A7LA 5ICTA 2PT1A 4QF9A 4QFOA 1FQFA 2I3VA 1O64A 4G77A 4G8MA 1Q1KA 5K2YA 3S2VA 4YICA 2ZXTA 1II5A 2XXRA 4ZDMA 1XOCA 4IO7A 1DPPA 1XT8A 2DS9A 4LZ7A 1FTJA 5AA2D 3GBBA 5IAIA 2O7IA 2Q2AA 2FNCA 3DP8A 2AL5A 3KN3A 3DP6A 3C32A 4OEUA 4R74A 3LSWA 4NF4A 4LQ5A 4EF2A 2Y7RA 5HM4B 2O7UA 3ZKLA 5HBCA 1PB8A 2UVJA 3KOSA 1B9JA 3SEYA 5I58A 3RLFE 3N5LA 4OFOA 4DDDA 3H3GA 4X1DA 4F1UA 5DYHA 2DOJA 2X26A 3P7IA 1LBBA 2ZMBA 3C31A 3D4GA 2OCUA 4MF3A 2V84A 3FV1A 2P1SA 3TTNA 1MM6A 3WAEA 2RF1A 1ANFA 1JQFA 5K2XA 1YCJA 3EHUA 3O97A 4H0WA 3RT6B 3MAMA 4R6KA 3EHSA 1UTHA 4AB6A 5AA1A 4OMBA 3VVFA 1N0TA 3VXCA 4ND9A 4R2FA 1B6HA 1LCTA 3QUFA 5JTYA 5H8NB 1IXGA 2O6AA 2XD3A 1P99A 2I0CA 1M5FA 4GOTA 1LSTA 3K1NA 3IX1A 4ISUA 1S9TA 2F7CA 1B5JA 1YAEA 1QULA 1IXIA 3PPOA 3CSBA 3CG3A 4NEDA 4FECA 3OEKA 2PMSA 3CIJA 1R9LA 1Y3PA 3AXFA 1N04A 2XX9A 4IGTA 4Q0CA 3N94A 3IJOB 1JEUA 1M5DA 1Y4TA 4ECFA 4H8JA 1AOVA 4BDOA 3TZAA 2DVZA 3PUYE 4KHZE 1NH7A 2M8CA 4F3SA 2Q89A 2ESNA 5DEXA 4GQOA 3MBPA 3FZVA 4R6YA 3OSQA 3K02A 2YPNA 2PBWA 2ZNSA 3SEXA 1P1NA 3LSXA 3C35A 1LB9A 3TTRA 4R2BA 1OIBA 1DTZA 2Q9TA 1BKAA 1MDQA 1BLFA 3FXUA 1MY0A 4OVJA 2I4BA 4TQUQ 3Q26A 4H65A 1M5EA 3G3FA 3K6XA 4BDQA 5A5XA 3UK4A 2XXTA 4R72A 5L9OA 4NF8A 2G93A 3O6GA 4C0RA 5AE4A 4JXIA 4P0GA 3O2AA 3PUXE 4OFLA 3CR9A 3I3VA 4UA8A 5FHOA 3QSLA 4X9TA 4C1UA 1MQDA 1VR5A 1NMUA 1URGA 5FHNA 2HEUA 4HS7A 4NF5A 3T96B 5TPAB 2YJPA 2E0SA 2H9BA 2O69A 1ZMGA 3BFUA 3VLVA 4KD5A 1LFHA 1FTKA 2ZYKA 2DP8A 1QUIA 2ABHA 2H4IA 3LBSA 4RY1A 4U4SA 1JEVA 3TDJA 1FQCA 1MDP1 2Q88A 1VSOA 1F9BA 2QS1A 1LB8A 2B3FA 4Q30B 3H6WA 3W9WA 1ZLQA 1NNPA 4KCCA 4F31B 3E9XA 4L17A 3RGYA 4IY6A 1S50A 1IIWA 4YMBA 3EF7A 4FJPA 4H67A 3QXMA 3KZGA 4PFWA 3FVOA 5I59B 3FJ7A 4HCWA 1FQAA 2Q8JA 1XVYA 3UN6A 3RTWB 4OYVA 1UQWA 5CRYA 1A8FA 1A54A 3OO6A 4YKIA 5ITOA 4U2RA 3IB0A 3IK6B 3HHFA 3ILTB 1EZPA 4QFNA 5B7DA 2AYSA 3UP9A 1EZOA 4ESWA 5KDTB 2A5TB 3QIMA 5BWJA 3FJMA 3T9UA 2P0SA 2V3QA 4LATA 4E0XA 4R9FA 2ZYMA 3TYHA 3SEWA 3MP6A 1JW4A 4YMAA 3T9VA 1I6BA 1B0HA 5CMKA 5TU0A 1MPDA 1WODA 4XXUA 3TTMA 3TCFA 3S9NC 2UYFA 2DE3A 3TCHA 1SYHA 4R6HA 2NVUB 1B7ZA 4I8CA 1Z7NE 1TFAA 2DE4A 3A3CA 3MWBA 1Y9UA 4ZEDA 3O28A 3E3KA 3VVEA 4RJZA 5L9SA 4MFIA 3OELA 1P1UA 4IY5A 1UIUA 4LUBA 2X7QA 2Y84A 1XS5A 2H99A 4GRKA 1P1OA 2I58A 4U22A 2AIXA 5JEIA 3CFLA 5TP9A 2NOOA 3K2DA 2O1LA 4C1TA 2BJJX 4M1VA 1P1QA 2OWTA 4IGRA 2HAVA 2V25A 3FJGA 1GR2A 4Z0IA 4LA9A 3N26A 5FTIA 3K0VA 2XXVA 1NL5A 2REGA 2NUVA 4BLAA 2VGQA 1POTA 3V8XB 1B7UA 1B3EA 2NWJA 1RKMA 1PBQA 3K1MA 4GLIA 1AL3A 1SVXB 4WKMA 3Q29A 1SQYA 4O3CA 4EQBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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