3FVKA

Crystal structure of the human glutamate receptor, glur5, ligand-binding core in complex with 8-deoxy-neodysiherbaine a in space group p1
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvkA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvkA02
2QMWA 2I6EA 4IY6A 1XVXA 3SKPA 2Q2AA 2ANJA 3RLFE 4BDMA 2XXYA 1NMUA 1VFEA 4JDFA 3RUMA 1B4HA 3S9LC 3VV5A 3Q28A 1Y3PA 4LUBA 2DXYA 2OWSA 3PPPA 3LSWA 3UN6A 3PUVE 3Q27A 3QXMA 2QS4A 5L9MA 2IA4A 3C33A 1JVXA 4OXVA 2QL3A 3QYTA 1Z7NE 4KHZE 3T9UA 1EU8A 3BFTA 3CG1A 2DE4A 4I9DA 3M8UA 4OFOA 1N0TA 4H5GA 4LZ5A 1LGBC 1O7TA 4RPNA 1B3GA 2Y7RA 4ZE8A 1S7YA 3H6TA 1J1NA 4FECA 2UVHA 1Y1MA 4NF4A 4YKKA 3LUYA 3E13X 3RPWA 2DWIA 1F9BA 1QULA 1B05A 4HW8A 3KBRA 4G77A 2V3UA 5DEXB 2F8DA 3PU5A 5DVFA 3Q25A 4FIMA 2F6PA 1H43A 1N84A 1SQYA 4JWYA 4H8JA 1Y4CA 2E1SA 1B9JA 2RCBA 5DTBA 4EQBA 3MZ9A 1SW2A 2F36A 3V83A 2Q88A 3TPAA 3UA8A 1HSLA 1FTMA 1M5BA 5JEIA 4ZEBA 4GRKA 1USYH 2ZNTA 5ISUA 3TODA 3M3LA 4HTGA 1ZMGA 3MC2A 5CC2A 3THIA 2QS1A 1IQ7A 5LOMA 5F7VA 4O3AA 4OFLA 3PUZE 2XXWA 4POWA 5CM6A 4ESXA 4F22A 4I62A 2V3TA 1UIVA 3IL1B 1QKBA 2Q8JA 4R74A 2G93A 1SW5A 3JZJA 3TKDA 4ECFA 3PD9A 4FATA 3FVOA 4FEDA 5ICTA 3QIMA 1QUJA 1PEBA 4UA8A 5KCJA 2PX1A 1AH5A 2A5TA 3FJ7A 2DP8A 1JEUA 3H7MA 1MQDA 1MY3A 4LZ7A 2F7CA 4KCDA 3SEVA 1ZIUA 3Q26A 3R26A 3VLWA 4DCXA 4GQOA 1H44A 5FHNA 3RGYA 2GHBA 1IXGA 2RINA 3OENA 3UGWA 4ELPA 3CG3A 1LCTA 3ECRA 3PUXE 3IJXB 3VVFA 4Z7EA 4EXLA 4GF8A 4GL0A 4QFLA 3G3JA 4RPOA 3IJOB 5I2NA 2GH9A 1N04A 3F11A 3W9WA 3PGFA 3TFLA 3K6UA 5CI5A 2ONKE 1A99A 2DWHA 1LFIA 1US5A 3AXFA 3W15C 1LAXA 1LAGE 2YPNA 1FQDA 4TLMB 5CMMA 5FTHA 3ZKLA 3KOSA 3U8QA 4F1UA 2UYFA 4OFJA 3IOUA 2DE3A 5HBCA 1BTJA 3FVGA 2B65A 4RYAA 3A3UA 1D9YA 2I3WA 5CMKA 5TU0A 4NF6A 3MVZA 4PFYA 1MXVA 5ITPA 2HZKA 4AB5A 1VE4A 3HHGA 3G3FA 4JBZA 5L9OA 3KGCA 1OMPA 2Z23A 3RY3A 3R6UA 4G8MA 1UTHB 4Q30B 2BJJX 3K2DA 3K4UA 1MY0A 3RT8A 3VE1B 2Q9TA 1MS7A 3EN3A 2V93A 4PFTA 5TP9B 5IKBA 3MZBA 3C9HA 3IO6A 2M8CA 4LVQA 1LAFE 2DQVA 4NWCA 3KFMA 1XVYA 2Z22A 1B46A 3OEMA 4O3CA 1R6ZA 3I6VA 1MY2A 2V84A 4QF9A 2NXOA 4L17A 1MH3A 4MH5A 5DYHA 3WAFA 3K6VA 4RXLA 4DCYA 1LAHE 4MLQA 1OVBA 3C31A 3OO6A 1XT8A 2OBGA 4FE8A 2Y7WA 4DXCA 3FJMA 3FIRA 1NNPA 1JW5A 3V5AA 3U93A 4NF8B 3O9PA 1YTVA 5AA2B 4POXA 3IR1A 1IXIA 3OO8A 1FTJA 1B1HA 3MAMA 4R6HA 4H5FA 4G4PA 1B6HA 3HV1A 1PB9A 1OLCA 3H6VA 3G3KA 4PQJA 3IB1A 5CBRA 4BDLA 1TFDA 3S9NC 4F1YA 5M2VA 1UIUA 3CIJA 3TCFA 3LC8A 3TDJA 3IOTA 2NOOA 1DPPA 4NE4A 4OYVA 1IZ1A 3RN8A 3MVYA 3T93B 4FEBA 1IXCA 2THIA 1I69A 4P0GA 2F78A 3IB0A 1QUIA 2YLNA 1OQHA 5JTYA 1URDA 2F7AA 2RKMA 3MW0A 2ZYOA 3K0VA 1SW1A 3QK6A 4C1UA 4XKQA 4R73A 1Y9UA 1LCFA 3O6IA 1HSJA 2XXHA 4QFKA 1VSOA 1AOVA 3KZGA 4EQ9A 4JXIA 1XC1A 2Q89A 2HCAA 4NF6B 3BBRA 4QFOA 2PMSA 3QAXA 3DP4A 1MQIA 4H67A 2DWJA 1FW0A 1B4ZA 1A8FA 3GZGA 1UQWA 1SVXB 3HSTA 2Z8EA 4QSEA 2PT2A 3I5OA 1EZPA 2O68A 4ND9A 1N3XA 4ZS9A 1JW4A 4YKIA 3PUWE 3PPQA 3H3GA 3H6WA 1RYOA 4PP0A 2FYIA 2XX8A 5H8HB 2UXAA 2DWAA 1US4A 2OJTA 3DLNA 4U1OA 4ELQA 3KOTA 4E0XA 5A5XB 2VOZA 3S2VA 1IXHA 3LR1A 4OEUA 1MY1A 4G68A 1PB8A 1M5DA 1FQBA 2D21A 3SETA 4JSOA 2QJEA 1FTLA 4U2RA 1NL5A 4JWOA 4R9GA 4G68C 1Y4TA 3I3VA 2I48A 3KSXA 4KFQA 4QSDA 3PMVA 5H8SA 4EQ7A 3JYRA 4QHQA 1JQFA 1DTGA 2O69A 1IIWA 1RYXA 3HN0A 3SERA 3CFLA 4NMYA 4NF5A 3V89B 2R9JA 4YKPA 4OETA 4G2ZA 4OMBA 1B3LA 1XOCA 4M4GA 4IO6A 1S50A 4JB7A 1GTKA 3HCQA 3E9XA 3ILTB 1WODA 2I4BA 2IEEA 4OZ9A 3DM0A 3MQ9A 1N7XA 3CSGA 1OIBA 1MG1A 2ABHA 2GRVA 4GOTA 1Y1ZA 5ELVA 2DSFA 3PMXA 4YMAA 4H1XA 4N6PA 1P1NA 3MWBA 3KN8A 4Q5TA 2RC8A 4ZZEA 3UP9A 4WKMA 4IO4A 3TQWA 4R72A 3KG2A 4I8CA 5EHSA 3O2AA 3MVWA 3HHFA 1WDNA 2GFEA 3K00A 2UVIA 5DVIA 1A40A 1SDXA 4F3PA 1VR5A 1NNFA 2H98A 1R1NA 3D4CA 1O64A 1BIYA 4U22A 3QUJA 4UACA 5H8FA 5I56B 1Z7ME 2DS9A 3IOVA 4KQPA 2HAUA 1JETA 1MDP1 3BKIB 3MP8A 3IAZA 1GR2A 4I1DA 2F34A 1B3HA 4GL8A 3C36A 3FATA 2D3IA 4LQ5A 5DT6A 3PPNA 5I59A 3PV0E 3O29A 4YAHX 4TQUQ 2ONRA 1ZLQA 2P2AA 3H6UA 3H4ZA 2REJA 3A09A 4XKNA 3PD8A 1FQEA 5AA4A 4ZEFA 3T22A 4EDPA 3EPEA 2O84X 5I2KA 3G7WA 3MBPA 3S4UA 4G68B 4R2BA 1QW0A 4R2FA 3O97A 4GLIA 4P11A 2LAOA 3OXNA 4O3BA 3FXQA 2VHAA 1PDAA 3E4RA 2ZYMA 2XD3A 1TT1A 4U21A 4KYDA 1DPEA 3TELA 2RC7A 3E3KA 4X48A 4FAJA 2I3VA 2CZLA 1M5CA 4XIGQ 5H8NA 1OLAA 3ZSFA 1N7WA 4YKJA 3VVEA 3MP1A 4F3GA 1MQGA 3SEUA 4DDDA 4ZECA 3EHTA 1FQCA 3G3HA 1GVCA 1RKMA 3EHUA 5H8QA 3DP8A 3ILUB 3OO7A 2F97A 1B52A 4IO7A 3H03A 1S9TA 1R9QA 5K2YA 4RA1A 5I57A 5CMCA 3OSRA 3CFXA 3KN7A 4JWXA 3W9VA 1D3KA 3FVKA 1Q1KA 4DXBA 5AE4A 2ESNA 3TEPA 4X1DA 1B7UA 1O63A 1B3EA 4LATA 4NF4B 1VFDA 3MVXA 3VLUA 2I49A 1SYHA 3K1PA 3CFZA 1HSEA 4G8HA 2XXUA 2HXWA 4H6DA 3TCHA 1DMBA 5I84A 2UVGA 3KN3A 2AYSA 1TFAA 3D4GA 4LA9A 1A54A 2H4IA 3OSQA 1USYE 5KDTA 2V25A 4DLDA 3TZAA 3KJ7A 5I58A 4MLVA 3QUFA 4ZEKA 1LSTA 4KR5A 4GXSB 4QFPA 4PETA 5CMBA 4E0WA 1P1QA 4FJPA 1N76A 3MJNA 3VDFA 2Y7PA 3V8XB 2HZLA 5KZTA 1XS5A 1MQHA 3SEXA 3O6GA 2P1SA 1OQGA 5I59B 4LZ8A 3GBBA 1XHYA 3CSBA 4MF3A 3BFUA 2DVZA 2F35A 3K6XA 1UTBA 2F7BA 3RT6B 4ONYA 4F3SA 3PPOA 1OVTA 4ESWA 2A5SA 2DVCA 5B70A 5HPQA 2ONSA 1B5HA 2W7YA 4F31B 3FVNA 5KCJB 4F39A 3HPIA 3USDA 5IAIA 3IOWA 5TPAA 3GBAA 2A5TB 4RJZA 4YZZA 3IO4A 3T9XB 4H0WA 4HCWA 3IK6B 4QFNA 4ZEIA 4WEPA 4C0RA 2HAVA 1B40A 2UVJA 5JK4A 4BDNA 4OEVA 3MUQA 5H8QB 4ZDMA 1PC3A 3VLVA 3Q29A 1LFHA 1N3WA 5I2NB 4KPTA 2REGA 1MPDA 3TYHA 4FORA 2ZMBA 1SI0A 4BLAA 3EF7A 1DOTA 2FA7A 1P1WA 1ZTYA 4R6YA 4DIGA 2O6AA 2VD3A 3PMWA 1II5A 2Z8DA 2H25A 3N6TA 4GD5A 3EQ1A 4DZ1A 4F1VA 1P1UA 3TTKA 4Q0CA 3N94A 4X9TA 2I0BA 1L5TA 1MH4A 4GVOA 1POTA 4DE8A 4OQOA 1FTKA 4EF2A 2O7UA 2XXIA 2H5YA 4X1BA 3ONMA 5CRYA 3WAEA 4MBPA 5AA2D 1BKAA 3VXCA 2HEUA 3DP6A 4MFIA 3SEWA 1LB9A 1QUKA 1FCKA 4F3BA 4H65A 3O28A 4YB7A 4OVJA 5DEXA 2QPQA 1NFTA 1JW1A 1GV8A 1EZ9A 1URGA 3TCGA 1MY4A 1MXWA 3FD3A 1ZBMA 3TTNA 2O1LA 3VFJA 3ODBA 2NUVA 3PUYE 1MPBA 5FHOA 4ELOA 2O1MA 2O7IA 1IEJA 1SI1A 2XXPA 3RNNA 5AA1A 4HS7A 3CVGA 1JNFA 2ALUA 2HQ0A 2RC9A 1MQJA 3CR9A 4U4XA 3FASA 4U1ZA 1M5EA 5TPAB 3B6TA 1D4NA 5J1DA 1FQAA 1H45A 1LB8A 2VD2A 4QSCA 2NWJA 3N26A 2Y84A 3O66A 3OMBA 4U23A 1B7ZA 3OOAA 1B0LA 1AL3A 1I6AA 1B5JA 3FV2A 3U94A 3FUZA 4NWDA 1I6QA 2ZYKA 5BUUA 4QRZA 2R71A 1H3DA 1B32A 3CRBA 3B6WA 1YPNA 2H99A 2XXRA 2WKYA 3UORA 2B3BA 2RCAA 2QSXA 3B6QA 3LSXA 3N5LA 1B51A 1LBCA 4AQ4A 5JTYB 5FHMA 1MXZA 3K1MA 5F1QA 1TXFA 2O51A 3C32A 4ZEDA 4RNSA 1ZJLA 1A55A 1URSA 3K6WA 2QS2A 4Q8RA 1NNTA 3RQTA 3M3FA 4KD5A 4IGTA 3GXAA 1NH7A 2VP1A 4LONB 4LQ2A 4ISUA 2XXXA 2ZNUA 3T96B 2I4CA 1B1XA 1Q35A 1PBQA 2AIXA 3N6UA 3R7XA 1TWYA 1DTZA 1MM6A 1MRPA 3VVDA 4PFWA 1B7HA 3U92A 3S9EA 2I58A 4XKRA 2GHAA 4WXJA 1P99A 4C1TA 1Y3QA 5FTIA 3ZS6A 4OERA 1SBPA 5AA3A 1PBPA 3SESA 1SD3A 4RK9A 2Y7IA 1M5FA 3C35A 1T0KA 1UTHA 3C4MA 4BDRA 3UK4A 1LBBA 4IGRA 3ZKKA 1QJMA 2E0SA 3TUSA 2I0CA 1ZU0A 5TP9A 4XTCQ 2Q2CA 3IX1A 4G8NA 3P7IA 4EUOA 3M3KA 3RTWB 1IITA 5L9SA 1H76A 4YB5A 3S9MC 3FXUA 4F2QA 1AIVA 1YAEA 4YU0A 1Y20A 4PFUA 1POY1 2Z8FA 1B58A 4TLLB 4R6KA 4NF8A 4GWOA 2XX7A 4OWDA 3MPKA 4H8IA 4KCCA 5AA2A 4NF5B 1AMFA 2YJPA 4M1VA 2DXRA 2ZXTA 2ZYNA 2XHDA 2B3FA 1A8EA 4IB2A 1MXYA 3DELB 1B3FA 3K1NA 3RTFB 3LSFB 4YMBA 2DE2A 5K2XA 4N13A 3TTMA 2OK2A 2DOJA 5L8DA 1QKAA 2Y7KA 3OEKA 1A7LA 3U72A 4AB6A 4TOZA 1MM7A 3T66A 4OESA 3MPLA 1KWHA 3KEIA 1CB6A 4DXUA 1PB7A 3FV1A 1SW4A 4XXUA 3UIFA 3T9VA 1NNKA 5H8FB 1BP5A 2OCUA 3L6GA 1R9LA 2CMOA 2OWTA 4IO2A 4LP2B 3OD7A 2OZZA 4KI0E 2G29A 4NTLA 3MZ1A 4R75A 2XXTA 2DYXA 1I6BA 1NKXA 5BWJA 1ATGA 3LSLA 5AA4B 4F18A 3VXBA 4U4SA 3C34A 1ZKBA 2AL5A 4HCYA 5I2KB 3TMGA 4F2OA 1SYIA 1NH8A 4OTEA 3MP6A 5CBSA 3T9HB 5H8HA 4PE5B 1FTOA 2D5WA 3L6HA 3FZVA 3IB2A 1B0HA 3SDFA 1MPCA 3O6HA 5A5XA 4F19A 1QVSA 4WEDA 1YCJA 5H8NB 1GGGA 3K01A 2HFBA 3TTLA 4ELRA 4THIA 2F5XA 1ANFA 5EHMA 4YB6A 4R9FA 2V3QA 2X26A 4GIZA 5HM4B 4IO5A 3CI8A 2KLFA 3B7DA 3IORA 5I57B 3A3CA 4RY1A 2PT1A 3LBSA 1MXXA 3K02A 4Z0IA 4OENA 1EZOA 3EHSA 3FJGA 1CE2A 2AL4A 3OELA 4K3FA 3TAJA 3PPRA 4XKPA 3SEYA 1D9VA 4ZZAA 4BDOA 2FNCA 4F29A 1B2HA 4NEDA 4EXKA 5ITOA 3KSJA 3OO9A 1B5IA 2F6GA 2R6GE 2XX9A 1LFGA 4OHNA 3FXRA 2QS3A 1P1OA 5KDTB 1Y3NA 4GXAA 4P0IA 3H06B 5I58B 5DVJA 1LLSA 2ZNSA 4JSDA 2PYYA 4RK2A 4IY5A 4BDQA 2P0SA 3G3GA 4KYSA 4YICA 3G3IA 1EH3A 3JV9A 3GLBA 2H9BA 1DSNA 3FGSA 2OLBA 2VGQA 4EF1A 2X7QA 3KJTA 4N07A 5B7DA 3QSLA 5I56A 5EYFA 1UTBB 3TTRA 2UYEA 1JVYA 1ELJA 3TQLA 2XXQA 2QRYA 2QMXA 3HO7A 1BLFA 4KYEA 1IUDA 1MDQA 2PBWA 1FQFA 4IO3A 1JEVA 2XXVA 5ICQA 1WVJA 2PVUA 2XD2A 3U1OA 2X7PA 4GFRA 2NVUB 4ZE9A 1MXUA 2RF1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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