3B7DA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (hs1s2j) in complex with cnqx at 2.5 a resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title TARP auxiliary subunits switch AMPA receptor antagonists into partial agonists.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3b7dA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3b7dA02
3C34A 5I84A 4ZZAA 3SERA 4R73A 1IQ7A 3SEVA 1B58A 1JVXA 3S2VA 4X1BA 3DP6A 2Y7WA 4Z0IA 1M5DA 2NOOA 3P7IA 3FVNA 1WVJA 4BDLA 4JBZA 3FV2A 3V8XB 2O84X 4JDFA 3TFLA 3FJGA 1BTJA 1MY1A 2GHAA 3MAMA 2DVZA 1DTZA 3E13X 1SYIA 4NF5A 1ZJLA 3EHSA 1N76A 2DYXA 4ONYA 4EF2A 1JW1A 1B5HA 2XX8A 2ZXTA 2VOZA 2VHAA 1MQJA 3VV5A 3OO9A 4KYSA 1LB8A 5I2KB 3F11A 2F78A 1IXIA 1IUDA 2I48A 4OETA 4NE4A 3PPOA 4I9DA 4ZECA 5H8FB 3KSXA 3S9NC 4YKJA 1XC1A 4ZZEA 1CB6A 2ZYKA 4R9FA 5CBSA 1LBCA 2M8CA 1B2HA 1FQAA 2F7AA 3HV1A 3KJ7A 3SEWA 2HZKA 3LSWA 5AE4A 2F34A 2XXWA 4PP0A 1USYH 4R6HA 3ZSFA 1B7HA 2OWTA 1FTOA 3G7WA 1GVCA 1YTVA 3IO4A 3PPRA 1PB7A 1RYOA 4HCWA 2F97A 3WAFA 5BWJA 4G68C 4THIA 1N04A 2E0SA 3C9HA 3S9LC 3ECRA 4DCXA 3DM0A 1QVSA 1MPDA 4H65A 3W9WA 2ONRA 2IA4A 2VP1A 3UGWA 2XHDA 3OELA 3PUZE 1B5JA 5L9OA 3MP1A 1H3DA 5LOMA 1LBBA 4NTLA 4C1UA 3PPNA 1POTA 3ODBA 1SYHA 2NUVA 1UTHA 4TLMB 2D21A 3MVYA 3QXMA 4G77A 3TELA 5A5XB 2F6PA 4M4GA 3USDA 2PMSA 1D9VA 5CMMA 1B1HA 1WDNA 1ATGA 5H8SA 1A99A 2G29A 4MLQA 3C35A 2D3IA 5ISUA 3V83A 1MY3A 3N26A 1TWYA 3LBSA 2Y7IA 4K3FA 3CG3A 4PE5B 4LUBA 2UVIA 4RNSA 3VDFA 5DT6A 2H4IA 1PBPA 3SEXA 4XKPA 3TTLA 3VXBA 2DXYA 3RTFB 3MC2A 1JEUA 3FASA 2QMWA 2UVGA 1H43A 1DTGA 3LSXA 4U2RA 5TPAA 2I4BA 1D3KA 3Q27A 3CVGA 3PUXE 3TQWA 4KFQA 3K6VA 1B52A 3OSRA 4LATA 3L6GA 3ONMA 5M2VA 1URDA 1VFEA 5I56A 3ILUB 1GGGA 4TOZA 1S7YA 5AA2B 5EHMA 5B70A 2H25A 2ZMBA 1BLFA 1MDP1 2RC8A 1DMBA 3RTWB 4KD5A 2RKMA 2XXTA 5H8HB 4LZ7A 2OCUA 3VLUA 5JEIA 3TCFA 1AL3A 3OEKA 2QS2A 1B7UA 4MLVA 3SDFA 5TP9A 3U1OA 4NF6A 1B46A 4ZE9A 1H44A 3HO7A 3IB1A 3BKIB 4OEUA 5HM4B 4BDNA 3UIFA 1QUKA 4F2OA 3B6QA 4KCDA 1LAHE 3A3CA 3O97A 4ZEIA 4IO4A 4JXIA 4LVQA 3D4CA 3OXNA 3G3FA 3GXAA 3LUYA 4XKRA 2PX1A 1OMPA 3H6WA 4YICA 2I0BA 3KFMA 2Z8FA 1ZIUA 4JWOA 4EXLA 2BJJX 1NL5A 3VLWA 4AQ4A 4YB6A 4POWA 4R72A 2DXRA 3MW0A 4MBPA 4XKQA 4QFNA 1NNTA 4BDMA 3FV1A 3K1MA 3M3LA 2R9JA 3FUZA 1B1XA 5KCJB 5CBRA 3TDJA 2XXRA 4NEDA 3THIA 1A8FA 1RKMA 5FHOA 4OTEA 2QRYA 2CZLA 1NNPA 3IOVA 1ZU0A 1ELJA 4MH5A 5DVFA 3S9MC 2ESNA 3JYRA 3HSTA 4GWOA 4FECA 4R2BA 5H8FA 1R9QA 4Q5TA 2HFBA 4O3CA 3TCHA 2HXWA 2X26A 3U93A 1LAXA 3CIJA 2RF1A 1DPPA 1A54A 2A5TB 5FTIA 1LCTA 2B3FA 1OVBA 4F19A 4NMYA 3H4ZA 2QS1A 2Q88A 1SVXB 2OWSA 5K2XA 3PPQA 2GHBA 3C31A 4H8JA 2ZYNA 1MQHA 1FTJA 1SBPA 1US5A 1QULA 2A5SA 2O1MA 1HSLA 1PEBA 3PD9A 2DWIA 3TUSA 3OEMA 2XXHA 4YZZA 3PUVE 4GXAA 1SW5A 3S4UA 3EF7A 1LB9A 1A40A 3A3UA 2Z8EA 4N6PA 4ISUA 1VFDA 2F36A 4EDPA 4ZEBA 3H3GA 5TU0A 1ZMGA 3LSLA 5ICTA 4QF9A 3IOUA 3MZ9A 1P1NA 3IJXB 3Q25A 4YKIA 3FZVA 4ESWA 1SW2A 1OIBA 2V84A 2ONKE 1A7LA 3SETA 2PT1A 2REGA 4OZ9A 5A5XA 4ZEKA 3ILTB 5KDTB 4I8CA 1II5A 3MBPA 3I5OA 3KJTA 5ITOA 3TTKA 1F9BA 1B3EA 3UN6A 2OK2A 1ZKBA 1FQBA 2PT2A 4XIGQ 3M3KA 1XHYA 1MPCA 3SKPA 1R1NA 4PQJA 4WEPA 3H6TA 3GLBA 2HZLA 5I59B 1LLSA 2XX9A 3IK6B 2VGQA 3KOSA 1S50A 4GF8A 3ZS6A 3CFXA 1B51A 1P1OA 1MM6A 1MQIA 4X1DA 5DTBA 2DSFA 2XD3A 1SD3A 4U21A 1SQYA 3KBRA 3OSQA 3U94A 3VVDA 4LZ8A 1JVYA 4QSCA 2QJEA 5CI5A 4O3BA 3B7DA 1AOVA 3MVWA 1LFGA 2QPQA 2V3TA 2ZYOA 4ZS9A 1MXXA 3EN3A 4U4XA 1EU8A 2O51A 4OERA 4HW8A 5AA2A 2OLBA 4ELPA 1SI0A 1I6AA 1BP5A 1ANFA 1UIUA 4Z7EA 3CRBA 2HCAA 3C4MA 2LAOA 1XT8A 4R2FA 3T93B 3M8UA 2O1LA 2UVJA 5H8HA 4KHZE 3R26A 4JSDA 4YAHX 2H9BA 4JWXA 2GRVA 3DELB 4QHQA 3C33A 2FA7A 2H5YA 1IITA 3T22A 1QW0A 2UYEA 2QSXA 5ELVA 3MPKA 1OQGA 5CM6A 1YAEA 3TTRA 1Y20A 2THIA 4U22A 4UA8A 3V89B 1B0HA 3N5LA 2PBWA 3EQ1A 4GXSB 4F3BA 3PUWE 4KYDA 1UTBB 1YCJA 4N13A 4LZ5A 3E3KA 4H5GA 3DLNA 4EF1A 1Z7NE 4DLDA 4IO2A 1MRPA 4OVJA 4LONB 3K00A 2I49A 3OMBA 4BDOA 2RC9A 1LSTA 3OD7A 3MVZA 1I6QA 3BBRA 1US4A 3TYHA 2HAVA 3SESA 3TTMA 3GBAA 5AA4B 5I2NB 2R6GE 2RCBA 1MH4A 1MPBA 5KCJA 1SW4A 1IXGA 4F1YA 4ZEFA 3AXFA 1QKAA 4XTCQ 3KGCA 4RA1A 5I57B 4EQ7A 3IOTA 3MZBA 3CFLA 4F3PA 3MJNA 1JNFA 4GQOA 1T0KA 3PU5A 1UQWA 4FEBA 5KZTA 1B3LA 5L8DA 3OO8A 4F1UA 4ND9A 2I6EA 4P0GA 1VR5A 1MQGA 3W9VA 1EZPA 4R6YA 4H1XA 3T66A 2ABHA 5ITPA 4LQ5A 3RUMA 2DWJA 3LC8A 2A5TA 3K2DA 1QKBA 4ECFA 2DE2A 2QS3A 3RT6B 5HPQA 2Y7PA 4NF8A 3IORA 4RXLA 1AMFA 4RPNA 5CMBA 2Q2CA 2ZNSA 3VE1B 4YB5A 3MVXA 5J1DA 3PPPA 1R9LA 3C36A 2YJPA 2O69A 4KYEA 1URGA 3IB0A 2Q2AA 3CSBA 3QUJA 1L5TA 3VLVA 1FQCA 3VVEA 1WODA 3FXUA 3TCGA 2Z22A 3V5AA 4H67A 5DVJA 4OHNA 4EXKA 1A8EA 1PDAA 1B0LA 4TQUQ 1I6BA 4G68B 3RLFE 2IEEA 1MY4A 1VE4A 3K6WA 3O6IA 2I58A 5CRYA 3MUQA 5DEXB 4ZDMA 1AH5A 3IO6A 5AA2D 4JSOA 1GTKA 5JTYB 2XXXA 4X48A 2D5WA 1QUJA 4F3GA 4AB6A 1JW5A 4F3SA 5KDTA 4KPTA 3ZKLA 4XXUA 5FHNA 1MXWA 4BDRA 4DXUA 4PFWA 3L6HA 3DP4A 1MXZA 1FQDA 3VXCA 1NH7A 4RPOA 3IAZA 4ZEDA 2DVCA 1LAGE 5F7VA 2ZNUA 2HQ0A 4I1DA 4U4SA 1FW0A 4E0XA 3S9EA 5I59A 1B32A 1POY1 3SEUA 3UORA 2O7IA 3TEPA 3IJOB 4YB7A 3IX1A 2DWHA 3I3VA 3K1PA 3H6VA 4RK9A 1JETA 4PFYA 2DE4A 2DE3A 3KZGA 3FIRA 5I2KA 4L17A 2DOJA 4FIMA 3QYTA 4KQPA 2NWJA 2GFEA 2I4CA 4U1OA 3CG1A 1SDXA 3O66A 4IY5A 4X9TA 4LA9A 2OBGA 1DSNA 2UXAA 3RGYA 3O6GA 3T96B 1O64A 3CFZA 1B3GA 1IIWA 1SW1A 3UA8A 1B4ZA 2ALUA 2Z8DA 3PGFA 1H76A 4HS7A 4JWYA 2Y7KA 4OENA 2DS9A 4G8NA 1NKXA 1GV8A 2GH9A 1LFIA 5DYHA 2RC7A 5IKBA 3MQ9A 1B3HA 5I58B 4GL8A 1B4HA 1S9TA 4Q8RA 4F29A 3KN8A 3T9HB 5K2YA 2Q8JA 2WKYA 4Q0CA 1MS7A 2I3VA 2P2AA 3W15C 4M1VA 4HTGA 3G3GA 3OO6A 3IB2A 3C32A 4KCCA 3TODA 2QS4A 1FQEA 4G2ZA 3FGSA 2R71A 4YMAA 5AA3A 1XVYA 2V25A 3MPLA 2Q9TA 3HHFA 4IB2A 1MXVA 4OWDA 3PMXA 1MQDA 4KI0E 5CC2A 4EQBA 3FXQA 3LSFB 1D9YA 2DP8A 4GD5A 1B3FA 4I62A 3G3IA 2E1SA 1MXUA 3K1NA 4O3AA 3RY3A 5AA4A 5DVIA 5I2NA 4OMBA 1B9JA 1B7ZA 1NFTA 1PBQA 1IEJA 4YU0A 3FJMA 5EHSA 2ONSA 3QAXA 1LFHA 4NF4B 4EQ9A 4OYVA 3TMGA 3ZKKA 1PC3A 3EHTA 3R6UA 5I57A 4QSEA 3OENA 2H99A 3TAJA 2RINA 3JZJA 5F1QA 3PV0E 5H8QB 4DCYA 4POXA 3T9VA 2I0CA 4G4PA 1MDQA 3FXRA 3R7XA 1N7XA 2XXPA 1TXFA 1LAFE 3BFUA 1MY0A 2F7BA 4PFTA 2DQVA 3PMWA 3N94A 1Y1ZA 3D4GA 5H8NB 3B6TA 1OLCA 4H5FA 4AB5A 3SEYA 4G8HA 3PD8A 1LCFA 4GOTA 4Q30B 3K0VA 3H03A 1M5BA 4PETA 1PB8A 1ZTYA 1NNKA 4XKNA 3VVFA 3OOAA 3FVGA 4FJPA 4EUOA 3Q26A 3CSGA 4C1TA 4OFJA 3E9XA 1YPNA 4R6KA 4DIGA 1I69A 5HBCA 4H8IA 3K01A 4DZ1A 5FTHA 3HPIA 3JV9A 3O2AA 2Y84A 1Y4TA 4DXBA 3TKDA 1EH3A 2F8DA 1Y3PA 4QFLA 3G3JA 4G68A 1IXHA 4R74A 4YKPA 3FJ7A 5DEXA 3KSJA 4GLIA 2UVHA 2HEUA 2F35A 1Y3QA 1Y9UA 1N0TA 2REJA 3RPWA 4OFLA 3HN0A 5JTYA 1R6ZA 1IZ1A 1TT1A 3KN3A 2O68A 3VFJA 2CMOA 1M5CA 1MG1A 4H0WA 1AIVA 4F18A 2V3UA 4GRKA 3M3FA 4P11A 4IGRA 4MFIA 3QK6A 3N6TA 1BKAA 3FD3A 1SI1A 1DOTA 1XS5A 5ICQA 3G3KA 4PFUA 2XXUA 4FE8A 1KWHA 2YPNA 4NWDA 2ZNTA 2AYSA 3MWBA 3DP8A 1NNFA 1JEVA 1M5FA 4E0WA 4RYAA 1MM7A 2X7PA 4QFOA 1GR2A 2ZYMA 3KG2A 1O63A 3TZAA 4F1VA 2ANJA 2W7YA 5CMCA 1RYXA 1QUIA 1CE2A 2QMXA 1N84A 3O9PA 4OFOA 4JB7A 4HCYA 3FATA 3OO7A 4FORA 3K4UA 4NF5B 4RY1A 4OESA 4U23A 4FEDA 5EYFA 4MF3A 1VSOA 1FQFA 4IO3A 1J1NA 1USYE 1OQHA 4IY6A 2AIXA 3MP8A 1LGBC 4QRZA 4C0RA 3QUFA 2PYYA 4F22A 4NWCA 3H6UA 2VD2A 2I3WA 1B05A 1UIVA 4R9GA 1Y3NA 4WXJA 1FCKA 1OLAA 3N6UA 2XXYA 1Q35A 2FYIA 3I6VA 5I58A 4LP2B 4N07A 5L9SA 2YLNA 1ZBMA 1P1WA 4QSDA 4FAJA 2B3BA 1N3WA 4RK2A 2NVUB 1N7WA 3EHUA 1H45A 5BUUA 5CMKA 2O6AA 1HSJA 1MH3A 2XXQA 4ZE8A 2KLFA 1MXYA 2PVUA 3U8QA 4OEVA 2XXIA 3GBBA 4DDDA 1JW4A 3FVOA 5AA1A 1FTLA 1EZ9A 3QIMA 1NMUA 3Q28A 2RCAA 3BFTA 2HAUA 4IO7A 2VD3A 3GZGA 1TFAA 1QJMA 4BDQA 1BIYA 2XD2A 1A55A 1P1QA 3IL1B 1URSA 1UTHB 3KN7A 4NF4A 2O7UA 4BLAA 2Y7RA 3UK4A 4QFPA 4YKKA 2P1SA 4OXVA 3HCQA 3RNNA 2V93A 3H7MA 4KR5A 4R75A 1EZOA 1N3XA 4UACA 3K6XA 1JQFA 2Q89A 5H8QA 4ESXA 3TPAA 4WKMA 2Z23A 5FHMA 2QL3A 3CR9A 4ELRA 1Y4CA 4QFKA 2F5XA 3EPEA 4GVOA 3LR1A 2V3QA 1M5EA 1IXCA 3RQTA 1NH8A 1O7TA 1XOCA 4U1ZA 3FVKA 1HSEA 4TLLB 4IO6A 4DXCA 1Z7ME 3IR1A 4GIZA 5H8NA 1ZLQA 2P0SA 3CI8A 3QSLA 5TPAB 4YMBA 2FNCA 1P1UA 3MZ1A 2NXOA 5L9MA 4WEDA 3K6UA 1FTMA 5IAIA 4OQOA 1D4NA 1TFDA 2XX7A 1Q1KA 3H06B 1B5IA 2AL5A 2G93A 4DE8A 3T9UA 4GFRA 2F6GA 5I56B 3TQLA 3KOTA 4F39A 4H6DA 5B7DA 3Q29A 1Y1MA 4NF8B 3WAEA 3E4RA 1OVTA 2H98A 3U92A 1XVXA 3UP9A 3PUYE 2OZZA 3U72A 2F7CA 4G8MA 1DPEA 4ELQA 4IGTA 4P0IA 2OJTA 3TTNA 1P99A 3HHGA 3O29A 2UYFA 1B6HA 2XXVA 4RJZA 1MY2A 1UTBA 3O6HA 5TP9B 1B40A 3A09A 4NF6B 4F31B 4FATA 3K02A 3O28A 5JK4A 3B6WA 3KEIA 3PMVA 2AL4A 3G3HA 2DWAA 4IO5A 4F2QA 3RN8A 4ELOA 3MP6A 2X7QA 3RT8A 2B65A 1FTKA 3T9XB 4LQ2A 4GL0A 1PB9A 3IOWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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