3B7DA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (hs1s2j) in complex with cnqx at 2.5 a resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title TARP auxiliary subunits switch AMPA receptor antagonists into partial agonists.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3b7dA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3b7dA02
2REGA 4YMAA 4IO3A 5CBRA 3CFXA 4OYVA 3RTFB 2HZLA 4KCCA 1D9YA 5EHMA 2H99A 5L9OA 3RPWA 3ONMA 3TTNA 4OQOA 1OQHA 5F1QA 4OFJA 1SYHA 3CRBA 1IXIA 1JW4A 1ELJA 3VVDA 3JV9A 1LCFA 4U1OA 1N0TA 3MZ9A 4ISUA 1MPBA 3IK6B 4QFOA 1MXYA 2ONKE 3GXAA 2XXTA 2D5WA 3UP9A 5I56B 3LBSA 4NF8B 1QJMA 1XVYA 1BKAA 4GIZA 4KHZE 1NNTA 3RTWB 3H7MA 1I69A 3C35A 4PE5B 4R9FA 3MQ9A 4LA9A 4LP2B 1RYOA 4OZ9A 4G2ZA 1OQGA 3CI8A 1MG1A 1TFDA 1B1HA 4NF8A 2H5YA 3ECRA 3MVXA 3QIMA 3IB0A 4F3BA 5H8FB 4KR5A 2O84X 1HSJA 3LSXA 1GV8A 4IY6A 3T9UA 3MVZA 5K2XA 3IL1B 4HCWA 1PDAA 3TFLA 4EXLA 4H1XA 4H8JA 5ISUA 2R9JA 5H8FA 3M3FA 2OK2A 3TTLA 2O68A 2OBGA 4WEPA 3F11A 2BJJX 2PVUA 1A8FA 3IO4A 4OEUA 2XXWA 4KQPA 3MAMA 3O29A 3TKDA 3I5OA 1B32A 5I2KB 4ECFA 4ZZEA 1XHYA 1EH3A 2H25A 1QVSA 4N6PA 2Y7RA 1PB8A 3E13X 1AIVA 1ZMGA 5IAIA 3VXBA 3Q28A 3PUVE 1S7YA 4I1DA 1YAEA 1M5FA 5I2KA 1AOVA 1B40A 4WXJA 1MQJA 1YCJA 4POXA 2Y7IA 4BDOA 1SW5A 5ELVA 5TPAB 4H67A 3C32A 2Q9TA 3U72A 1MQGA 3UA8A 1US4A 2I0CA 5J1DA 2DXYA 4RYAA 5FTHA 5EHSA 1N7XA 3K4UA 4IGTA 4F1UA 3TODA 4F2OA 4F19A 3BBRA 3K6VA 4ZE9A 1FQBA 1MH4A 2DWJA 3A3UA 4QSEA 4GVOA 2V3UA 5CI5A 2DQVA 2OZZA 3UGWA 2I49A 3FJ7A 1B3LA 4GRKA 5CBSA 2DXRA 3VLVA 4OEVA 1SW2A 3SESA 2XD3A 1NNKA 4H0WA 3CR9A 3TELA 1T0KA 1URDA 1URSA 1MQIA 3O6IA 4TLLB 1IQ7A 2P2AA 4I9DA 1P1WA 2ZMBA 4U4XA 4ZZAA 1XVXA 1LB8A 3MPKA 3FUZA 3IO6A 3VE1B 3N5LA 4JSOA 4RJZA 4O3CA 1SBPA 3FXRA 1GR2A 4NWCA 3IR1A 2A5TB 4KFQA 1DPEA 1JEVA 2UVHA 3MP6A 2XXHA 4G8HA 2Z22A 4NEDA 4OHNA 3R6UA 3TUSA 1B58A 2GH9A 1N84A 4RK9A 5LOMA 1B7UA 4GFRA 2I4BA 4GL0A 5DEXB 2ZYOA 3SERA 2G93A 1XS5A 4JWOA 1B3EA 1MH3A 1FQEA 3MVYA 1B4ZA 2A5TA 2HFBA 2F34A 3S2VA 4EQ7A 1OLCA 3TMGA 3CIJA 1BP5A 4POWA 5CC2A 3H6WA 4JDFA 4AB6A 4MH5A 4Q30B 3G3JA 3U94A 3S4UA 4DCXA 3D4CA 3RT6B 5FHMA 2XXYA 2QJEA 4LQ2A 4IGRA 1FTKA 4ELOA 1M5BA 4IY5A 3O9PA 4LUBA 3PPOA 2HZKA 4ZEIA 3KEIA 4I8CA 1B5JA 2E1SA 3G3HA 3O6GA 2NWJA 2UVIA 4NF6B 5M2VA 2F5XA 3HN0A 1DSNA 3HV1A 3H4ZA 1UTHB 2I58A 3OEKA 3ODBA 3FZVA 3UN6A 3EQ1A 3I3VA 5I58B 1ZLQA 1NNPA 1LGBC 1QUIA 4YICA 5H8NB 4OWDA 4LZ8A 4NF6A 3G3KA 4N07A 3K02A 1UTHA 4F3SA 3RGYA 1IXGA 3JZJA 2PX1A 3C9HA 2DVZA 4X1BA 1MY0A 5I58A 2QL3A 3SEYA 3IOWA 4ZEKA 3IAZA 5KCJB 1IEJA 4GQOA 5AA2B 1ZKBA 5H8NA 4IO4A 3RNNA 5HM4B 1NH8A 5A5XB 3UK4A 3FVOA 1YTVA 1P1OA 2RC7A 5DVJA 3LUYA 4JBZA 4FEDA 2HEUA 1B05A 3OO9A 3T22A 2XX8A 4Q5TA 4NF5B 4IO2A 3A09A 5KCJA 2F36A 5AA2A 4R2BA 5A5XA 3FGSA 3LSLA 2V84A 1MXZA 4DIGA 1SDXA 1QW0A 3EPEA 4ND9A 3BKIB 2F78A 4TOZA 4KYEA 2QMXA 2XXIA 3SEXA 1XT8A 3HCQA 4HCYA 2QS4A 1M5EA 1OMPA 1B3FA 4IO7A 3FASA 2NXOA 4OETA 3KSJA 1ZU0A 5L9SA 3LC8A 4G8MA 2RCBA 3MWBA 4M1VA 1B4HA 2F7AA 4F18A 4QFNA 4FJPA 3PMVA 4RK2A 2HQ0A 2DP8A 4TLMB 1B3GA 1LFHA 1Y1ZA 1D4NA 1LFGA 5CMMA 4QSCA 1B51A 3CSBA 3TEPA 1MS7A 3FATA 3GBBA 2ZNSA 4O3BA 5TU0A 3K1PA 2UYEA 2H98A 5CMKA 2RC9A 1FTMA 3S9LC 1CB6A 4EF1A 2LAOA 2XXRA 3RLFE 2ZYNA 3KSXA 3T9XB 1PC3A 1HSLA 5TP9A 3T96B 1PBQA 1XOCA 4MLVA 4RY1A 1RKMA 4GWOA 5CMCA 3FXUA 3OENA 3RT8A 2QS1A 3E9XA 3TQWA 4OVJA 4R6HA 5I57B 1YPNA 4L17A 2Q89A 4FIMA 1ZIUA 3C31A 3KGCA 3QUJA 1KWHA 1PB7A 4R75A 2FYIA 4RA1A 5CM6A 2ONSA 1B0HA 2QSXA 4F1VA 1TT1A 3WAEA 2AYSA 1LAFE 3E4RA 4ESWA 5I57A 1MDQA 2XXQA 1A8EA 5CMBA 2DE4A 4HTGA 1GTKA 1N3WA 3GBAA 4M4GA 4U22A 4LZ5A 3VV5A 1PBPA 1A54A 3DLNA 1WODA 4F31B 3DP8A 3CVGA 3RQTA 3KN8A 2CMOA 4IO6A 1SD3A 3H6VA 1Y3PA 2I0BA 3FV2A 2ZYKA 4IO5A 5ICTA 3K6UA 3JYRA 1N76A 3H6UA 3EN3A 2Q88A 3KOTA 4I62A 3MZBA 4JB7A 3OO6A 3ZKKA 1R9LA 2V3TA 1VSOA 3PMXA 3VLUA 3N26A 3EHSA 3PD9A 1M5CA 1DTGA 4QFKA 4KYSA 3N6TA 3ILTB 3TCFA 1QULA 4FATA 4GOTA 2Z8EA 2M8CA 4YZZA 2O7IA 3KJ7A 4YMBA 3U1OA 1MXWA 4E0WA 1TWYA 4AQ4A 2DWIA 1R1NA 2A5SA 1MDP1 2H4IA 1SW1A 2Y7KA 4GXSB 4X9TA 4R74A 3B6QA 1Y4CA 3TTMA 1FTJA 4HW8A 4PFTA 1S9TA 4BDMA 4G8NA 4G77A 1SW4A 1R9QA 1LAHE 5FTIA 1H43A 1UTBB 2ZYMA 2UYFA 5JK4A 1R6ZA 2XHDA 1WDNA 1UIUA 3M3LA 1O64A 3QYTA 4GF8A 3T9HB 4H5FA 4K3FA 4XTCQ 1LAGE 3QK6A 2B3BA 1QKBA 1PEBA 4ONYA 4YB6A 5L8DA 1NNFA 1UTBA 2VP1A 4PETA 1LAXA 2I6EA 1DPPA 3FJMA 3PPNA 3FXQA 1H45A 2XXXA 4ZEDA 3D4GA 2HXWA 2RC8A 1FQCA 4NWDA 4UA8A 1EZOA 2E0SA 2D21A 1OLAA 2F6PA 3SKPA 4BDNA 3Q26A 3T93B 1MM7A 4YU0A 4FE8A 4THIA 4OXVA 4P0GA 5ICQA 3FVNA 1IUDA 1LSTA 3O66A 4U21A 3IORA 1AH5A 1B46A 3DM0A 2F6GA 1FQDA 3MP8A 3V8XB 4EXKA 1MM6A 2Y7PA 2R6GE 3G3GA 1D9VA 4DE8A 3W9WA 2F7CA 3EF7A 1S50A 3QUFA 4F39A 2D3IA 2HAVA 3MZ1A 4JXIA 2Z8DA 2PYYA 4BDRA 5DVFA 4Q8RA 3TYHA 3FVKA 4ZE8A 5AA1A 2O7UA 1JW1A 1DOTA 3O6HA 1VE4A 2DE3A 3ZS6A 1A55A 4LZ7A 3VFJA 5AA2D 2F7BA 1QUJA 1DMBA 2DOJA 1EZPA 4C1TA 1SVXB 1OIBA 2F8DA 3TPAA 4HS7A 2WKYA 1Y3QA 3TCHA 2V25A 1EU8A 1FQAA 3PUYE 1BLFA 4QHQA 2DWAA 3HO7A 3OELA 3QXMA 2VD2A 4PQJA 3PMWA 1D3KA 3PPPA 2THIA 3PUZE 5L9MA 2F97A 5BWJA 1URGA 1SI1A 1NFTA 3O2AA 4U4SA 3UIFA 2X7PA 1VFDA 1H44A 4PFYA 4GLIA 5H8HB 2Y7WA 4OESA 2DWHA 4YB7A 3B7DA 3H6TA 4QF9A 1B7HA 3LSWA 1FTLA 3GLBA 3Q25A 3TTRA 1B3HA 2Q2CA 4G4PA 4Z7EA 3M8UA 4ZS9A 1POTA 3IOVA 4H5GA 3GZGA 4RXLA 3SEUA 4E0XA 1I6AA 2YLNA 3K01A 1Y1MA 4FEBA 4R6KA 5H8HA 1L5TA 1N04A 4R6YA 2VOZA 5JTYA 3LSFB 3PGFA 1JW5A 4YAHX 4LONB 1Q35A 2NOOA 2XD2A 3H03A 3K1MA 2Q8JA 5FHOA 1I6QA 2VHAA 1OVBA 1PB9A 1USYE 1NL5A 2OWTA 1Q1KA 2I3VA 1Y3NA 5JEIA 5KDTA 2Q2AA 3W9VA 2ONRA 1NH7A 4WKMA 2XX7A 1LFIA 2UXAA 2GRVA 4XIGQ 3SEVA 2YJPA 1Y9UA 3MVWA 1MXVA 4DCYA 1JQFA 1MXUA 1H76A 1JVYA 3L6GA 3C33A 3IJXB 2P1SA 4XKPA 2V3QA 1FW0A 2R71A 1BIYA 1B2HA 2DS9A 2PT1A 4R72A 3T9VA 2W7YA 1IITA 4X1DA 3KN7A 5TP9B 2RF1A 4DLDA 3VDFA 4FORA 5B7DA 3FV1A 3Q27A 2AL5A 4LVQA 1H3DA 4YKKA 4QRZA 2Y84A 2AIXA 3MJNA 1A7LA 4WEDA 3RN8A 3K0VA 1TFAA 3VLWA 3UORA 4PFWA 3C34A 3KG2A 3EHTA 1POY1 3FJGA 3IJOB 1IIWA 1LCTA 4LATA 2UVGA 1I6BA 3ZKLA 2Z8FA 3U92A 4U23A 3HSTA 1VFEA 3SDFA 3H06B 1USYH 4X48A 3MC2A 2OLBA 1B9JA 4AB5A 4EDPA 5I56A 2OWSA 3H3GA 2XXPA 2HAUA 3O97A 2PT2A 3PUXE 2O6AA 4EUOA 3T66A 5H8QB 3G3FA 3TQLA 2IA4A 3SETA 1AMFA 2X7QA 4ZEFA 4DDDA 3M3KA 4QSDA 4OTEA 2VD3A 2O1LA 3PD8A 1HSEA 3C4MA 2PBWA 2QPQA 2ZNUA 4C0RA 4DXBA 3MBPA 4FECA 3VXCA 2ZXTA 5HBCA 3ZSFA 1NMUA 2O69A 5H8QA 3BFUA 5F7VA 3EHUA 1N3XA 2OCUA 2V93A 1TXFA 4YKJA 2GFEA 1B5IA 3HPIA 3MP1A 1ATGA 2UVJA 1MY4A 2DYXA 1P1NA 1Z7NE 4OMBA 3K6XA 3S9MC 4DXUA 3IOUA 4MBPA 4KYDA 5AA4B 4P11A 1F9BA 4F3GA 5EYFA 2ZNTA 1FQFA 3B6TA 4NMYA 1J1NA 1M5DA 2QRYA 1A99A 4PFUA 3MW0A 3TZAA 1UQWA 4U2RA 4C1UA 3OO8A 4YKPA 4EF2A 2Z23A 2O1MA 5I84A 3K2DA 4P0IA 5AA4A 3KZGA 2GHAA 1IXHA 2RINA 2QS3A 1VR5A 2OJTA 3CG3A 2F35A 3N94A 4PP0A 2REJA 4RPNA 4BDQA 3G7WA 3S9NC 3DELB 4UACA 2PMSA 4MF3A 5HPQA 4R2FA 4LQ5A 3FIRA 4OFOA 4OFLA 2VGQA 1FTOA 5AE4A 1Z7ME 2DVCA 5TPAA 1IXCA 4BLAA 4IB2A 1LLSA 3FVGA 4EQ9A 3OD7A 3PPRA 4H6DA 3DP4A 4DXCA 3V89B 4TQUQ 3K1NA 4GXAA 1MQHA 4F2QA 4Z0IA 4EQBA 3PV0E 4JSDA 2NUVA 5DTBA 3OEMA 1SI0A 2RCAA 1GVCA 5ITOA 1BTJA 4G68C 2CZLA 4OERA 3R26A 5I59B 4F1YA 3V83A 3TAJA 5I2NB 3WAFA 1XC1A 4QFLA 3VVFA 3TTKA 3PUWE 2ABHA 3OSQA 5AA3A 2O51A 4F29A 4ZECA 1MXXA 4RPOA 4XKNA 1MPDA 1MY3A 3PU5A 3QSLA 2XXUA 5DVIA 5I59A 5IKBA 5I2NA 3USDA 4XXUA 5KZTA 1MY2A 1US5A 2QMWA 4ELPA 3KOSA 4H8IA 4YB5A 3TDJA 3U93A 3W15C 4XKRA 2FNCA 3MUQA 4RNSA 1P1QA 1B1XA 5CRYA 4F22A 3CFLA 3B6WA 3PPQA 4ESXA 2QS2A 5FHNA 4MLQA 2H9BA 4H65A 1CE2A 4N13A 2P0SA 2FA7A 1LBBA 2I48A 3AXFA 1N7WA 3R7XA 1B0LA 4KD5A 1RYXA 3QAXA 1WVJA 4XKQA 4KI0E 3V5AA 4JWYA 4JWXA 1EZ9A 1B52A 1A40A 5DEXA 1ANFA 3CG1A 3O28A 3RUMA 5DT6A 2I3WA 3VVEA 1O63A 3TCGA 2I4CA 1LBCA 1JETA 3N6UA 3THIA 4KCDA 1DTZA 3OOAA 1MPCA 3BFTA 2AL4A 3MPLA 2G29A 4G68B 4ELQA 2B3FA 1B7ZA 3LR1A 3U8QA 1AL3A 2DE2A 4ZDMA 1IZ1A 1ZBMA 3CFZA 3HHGA 3A3CA 1OVTA 3KJTA 3IOTA 1B6HA 1LB9A 1JVXA 4NTLA 3CSGA 2HCAA 1MY1A 1NKXA 2ESNA 4GL8A 3KFMA 3G3IA 1ZTYA 5JTYB 5ITPA 3FD3A 3C36A 4ELRA 4YKIA 1ZJLA 3OXNA 3IX1A 4G68A 3IB1A 4QFPA 1II5A 4KPTA 4R73A 3P7IA 3I6VA 4NE4A 2XXVA 1MQDA 4ZEBA 4MFIA 4U1ZA 1Y4TA 5DYHA 5B70A 2X26A 1SYIA 3OSRA 5KDTB 2DSFA 3KBRA 2RKMA 3SEWA 5K2YA 3L6HA 3OMBA 4NF4B 3S9EA 4OENA 1FCKA 1QUKA 3K00A 3K6WA 3RY3A 2KLFA 4F3PA 1P1UA 1UIVA 3ILUB 2B65A 2IEEA 3HHFA 1JEUA 1Y20A 1GGGA 3OO7A 4NF4A 4GD5A 5BUUA 2NVUB 1JNFA 3E3KA 3KN3A 2YPNA 1SQYA 4NF5A 4FAJA 4DZ1A 4BDLA 3Q29A 1B5HA 5H8SA 4O3AA 1P99A 1MRPA 2XX9A 4R9GA 3DP6A 4Q0CA 2ANJA 2ALUA 1QKAA 1O7TA 2GHBA 3IB2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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