3B7DA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (hs1s2j) in complex with cnqx at 2.5 a resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title TARP auxiliary subunits switch AMPA receptor antagonists into partial agonists.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3b7dA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3b7dA02
2ABHA 4GD5A 2CZLA 2F36A 2XXRA 4R9GA 3PV0E 3OELA 2YJPA 4IGTA 4C0RA 3VXCA 4YAHX 3ODBA 3MWBA 4F29A 3RGYA 3VDFA 3Q26A 5M2VA 3K6VA 1XC1A 1GV8A 3R26A 1LGBC 4BDOA 3EPEA 4FATA 4LUBA 3RLFE 1VFDA 1B40A 3N6UA 3QIMA 1LFHA 3K1PA 4XKPA 3I6VA 4NWCA 5I2NA 1N84A 3FUZA 2I0BA 1XVXA 4DCYA 3OOAA 1FTMA 2O6AA 5JTYA 1A7LA 4X9TA 3IOUA 1DSNA 1YTVA 4IO2A 1QVSA 1FQCA 2DS9A 1ANFA 3VV5A 1LFIA 4U1ZA 1I6QA 2UVJA 3K4UA 3K6WA 2BJJX 5DVFA 2I58A 3E9XA 1P1QA 2O7IA 4E0WA 2IA4A 4NWDA 3KG2A 4X1BA 4YB5A 1USYH 2DP8A 5TP9A 5L8DA 3KZGA 3LUYA 4EF1A 1I69A 3TZAA 1WDNA 2H25A 1BKAA 3EHUA 1P1UA 3TTLA 1MQGA 3K00A 2F35A 1NMUA 2O7UA 1FW0A 4H65A 1A8FA 1D4NA 1B0HA 4GXSB 3T9XB 1Q1KA 1SD3A 4GOTA 1M5DA 3RN8A 4MF3A 4OFLA 5I2NB 3K0VA 3SEVA 1QKBA 5EHMA 1LAHE 1FCKA 1SYHA 4WXJA 1MPDA 4ZEFA 5JTYB 3N6TA 5KZTA 2H5YA 4GRKA 5I59A 2ZYOA 1SI0A 3PMVA 2AL4A 3RPWA 2Y7WA 1LSTA 1D9YA 4R6YA 5B70A 3V5AA 1OLAA 5IKBA 3M3FA 3VVFA 2UXAA 5DYHA 4K3FA 2THIA 3PUZE 2LAOA 1SI1A 2DVCA 4QHQA 2D5WA 1ZKBA 3A09A 1IUDA 1JW5A 3TEPA 2RC9A 5TP9B 2XD2A 4MH5A 2DE4A 2A5SA 3TCFA 5JK4A 2O68A 4O3CA 4NMYA 1BLFA 4N07A 4P0IA 3S9MC 3BFUA 1HSJA 1Y3PA 2DXRA 4G8HA 2H4IA 3BKIB 4WEDA 5ELVA 2O84X 1OQGA 3RQTA 2B3BA 2NWJA 1B6HA 3USDA 2UVIA 3G3JA 1NH7A 3KJ7A 3PPPA 1B1HA 2F6GA 3CI8A 4BLAA 4LZ7A 1II5A 4EXLA 1FTJA 2O69A 2ZYKA 4BDMA 2PX1A 1QUIA 5BUUA 1R1NA 5I59B 1B5IA 1A40A 4YB6A 3CR9A 4N13A 4QFKA 3N94A 1N3WA 4F19A 4F1UA 1WVJA 2OZZA 3H6WA 1PB9A 1NNFA 3T96B 1S9TA 4KCCA 4H8IA 3CG1A 1B3LA 3AXFA 3OXNA 1QJMA 4Q30B 1TFAA 3H7MA 3T93B 2QS3A 2DWJA 4NF4A 3TCHA 2DWHA 2ZNSA 2AL5A 3MPKA 3HO7A 3D4GA 2Y7IA 3I5OA 4YU0A 1IXCA 1AL3A 4NTLA 2Q9TA 3R6UA 2I3VA 3U92A 4Q0CA 4G8NA 3CFLA 2XXTA 5CM6A 2VOZA 4U4SA 3H6TA 1IQ7A 3U1OA 4Z7EA 3PUWE 2F7CA 2OK2A 1BIYA 4N6PA 3SEXA 2F34A 4IO6A 1SW1A 1GR2A 4HS7A 4O3AA 4QSDA 4QFOA 1H43A 1WODA 5H8FA 4ZDMA 4JSOA 4ZEBA 5CMCA 3MC2A 3FATA 1MG1A 4PQJA 2OCUA 1MS7A 4ZZEA 4OFJA 1D3KA 4ZEKA 3V8XB 2PT1A 3T9UA 4IO4A 1LB9A 2IEEA 1SVXB 3TQWA 3SESA 4OESA 2YPNA 1YPNA 2O51A 4NF4B 4THIA 3HSTA 1B5HA 4HCYA 2VHAA 3K01A 1ZTYA 3MP1A 4KFQA 3W9WA 3BFTA 3CSGA 1Y9UA 2RCBA 4F3BA 2DWAA 4KI0E 4YKJA 2ONRA 3SEUA 4EXKA 4FIMA 3FVOA 1MPBA 2ZMBA 5AA2D 4XIGQ 4F2OA 1Y4TA 3KN3A 5AA2A 4KYEA 3PUYE 5AA3A 3B7DA 2HAVA 3O2AA 3OO7A 2VGQA 2HQ0A 3TQLA 4JB7A 1N7WA 4MBPA 1FTOA 1Y3NA 1B3EA 5H8FB 4F1YA 3EQ1A 4G77A 3G7WA 3VLWA 4I8CA 3IJOB 2O1MA 1NNPA 1Y3QA 4OENA 4H67A 4YKPA 5ITPA 2ONKE 1Z7NE 4HW8A 3FXQA 4P0GA 1H44A 1OQHA 2Y84A 2B65A 3KFMA 3MP6A 3TFLA 1H76A 1MPCA 4ELOA 4OTEA 2UYEA 4DLDA 3EN3A 4MLVA 3G3HA 1R6ZA 3KBRA 4NF6A 2XX8A 3KOTA 3FJGA 3EHTA 2HEUA 5EYFA 3G3KA 3SEYA 3TMGA 3GBBA 1O7TA 1VR5A 3JYRA 4YKKA 1MXVA 3PPNA 3CG3A 2PMSA 1IITA 1P1NA 3OEMA 2XXQA 4XKRA 2QS2A 4AB5A 1L5TA 4NF5A 5ISUA 4DDDA 3QYTA 1B51A 3GBAA 1MY3A 3TYHA 5I84A 3MBPA 2KLFA 5LOMA 1LB8A 2I3WA 2REJA 2RKMA 3OO8A 4YZZA 5TU0A 4X48A 1MY0A 1N76A 1AMFA 3KGCA 4DXUA 4F3PA 1H3DA 3FV2A 4ZS9A 2NUVA 3MZ9A 3O29A 1JW1A 2Y7KA 3C34A 3E13X 1B58A 2D3IA 4XXUA 1A55A 2GHAA 2NOOA 1DPEA 2PBWA 3SKPA 4NF6B 4JWOA 3UA8A 1NFTA 3FD3A 4QRZA 3PPQA 2H99A 1ATGA 1XOCA 3B6QA 2Z8FA 3JZJA 3IB1A 3OMBA 2FYIA 2HFBA 4EUOA 4IB2A 1ELJA 1PEBA 2Y7RA 3M3LA 1IEJA 1B32A 1IIWA 4PE5B 2M8CA 5L9SA 5I56A 4UA8A 4NF5B 1B3GA 2Q8JA 4ZEIA 4DXCA 2I4CA 4LA9A 1NL5A 5HPQA 1J1NA 4KQPA 3N5LA 2P0SA 2VD2A 4EQBA 1YCJA 2VD3A 3HHGA 4OERA 3TTMA 1TFDA 4AQ4A 4OYVA 3W9VA 3IK6B 4I62A 4OEUA 1A54A 1MY1A 2OLBA 4KPTA 1B05A 3QXMA 2E0SA 2ZXTA 4FE8A 3TAJA 4QSCA 4ELRA 4NE4A 3OSQA 4GFRA 3LSFB 1N7XA 1BTJA 4XKNA 3CFXA 3G3FA 1MXYA 2QJEA 3CFZA 5FTIA 3RTWB 2I0CA 1NNKA 4H6DA 3MQ9A 3M8UA 1DOTA 4EQ9A 3PMXA 4RY1A 5DVJA 3R7XA 5I56B 2XXUA 3OENA 4OFOA 3WAEA 2OJTA 3MPLA 1GGGA 1LAXA 4JBZA 1LAGE 1M5FA 2Q2AA 4POXA 3MVZA 3LC8A 4RNSA 5EHSA 1IZ1A 1MM7A 2FA7A 3RY3A 2RF1A 4GQOA 5IAIA 5H8SA 3U94A 3TTNA 4AB6A 4R9FA 4M1VA 3IOVA 4BDNA 4RJZA 3DLNA 2V93A 2RC7A 3IOTA 2XHDA 5FHOA 5BWJA 4WEPA 4OVJA 1S50A 3T22A 1ZMGA 4L17A 1LCTA 1JVXA 2UYFA 2A5TA 1YAEA 4ZECA 1POTA 3SEWA 3VVDA 2ESNA 1O64A 2XX7A 4PFTA 1JQFA 1B7UA 3PUVE 3C32A 4RK9A 3IORA 2OWTA 3O66A 4XTCQ 4KCDA 4POWA 2R71A 3LSXA 1GTKA 4DIGA 4OXVA 1EZPA 3C4MA 4EDPA 4Z0IA 2VP1A 4JWYA 5CRYA 4ND9A 3A3CA 3PPRA 1SW5A 2V25A 2V84A 3IO6A 4G68A 3GLBA 4GIZA 4O3BA 4R2BA 3WAFA 4MLQA 4ELPA 3THIA 2UVGA 3A3UA 1PC3A 3HHFA 5K2XA 4GL0A 2F7BA 4YMBA 3PU5A 4U2RA 1MDP1 3FXUA 2QS4A 1OLCA 2QL3A 5CBRA 4G2ZA 4F18A 1Z7ME 2DE2A 2ONSA 2V3TA 2Q89A 2D21A 2XXVA 4U22A 4LATA 3HV1A 4TQUQ 3TCGA 5I57A 4LONB 4R72A 2A5TB 3L6GA 3GZGA 1IXIA 1MXZA 3MP8A 3FXRA 4KHZE 3RT6B 1MQIA 4MFIA 4GF8A 5ICTA 2X26A 4R2FA 2XXWA 3HPIA 4OWDA 5H8HA 4H5FA 4ECFA 4OEVA 1RYXA 3S9LC 2WKYA 1JNFA 4F31B 2XXYA 4EQ7A 1ZIUA 3IB0A 3K2DA 1R9QA 3IL1B 1FQBA 4PP0A 3JV9A 3H03A 5AA1A 3C31A 3IO4A 3MZBA 2XXXA 4OETA 4G68B 3DP6A 4LP2B 5B7DA 3DELB 2AYSA 4PFUA 4ZEDA 3GXAA 2E1SA 3CRBA 2QPQA 1JW4A 1NNTA 4H1XA 3SERA 2GFEA 5DEXA 1RYOA 1B52A 2HZLA 4F2QA 3IR1A 2Z8DA 5H8NA 3MUQA 3KSXA 1POY1 4PFYA 4UACA 5I57B 3F11A 3H6VA 4H5GA 2ALUA 1MDQA 3QSLA 3EF7A 4I9DA 1UTHA 1MM6A 1Y1ZA 4E0XA 5J1DA 3S4UA 1I6AA 5H8HB 3VE1B 4KD5A 5CMMA 1SW4A 1DTZA 1JEUA 3UIFA 3B6TA 1UIVA 3Q28A 4R6KA 4OHNA 3IJXB 1MQJA 2XD3A 1M5EA 4ESXA 2P1SA 3G3IA 1FQAA 1A99A 2QRYA 3OSRA 2X7PA 3U93A 3PD8A 1SDXA 4F1VA 1VSOA 4IO7A 4KR5A 4IY6A 1UQWA 1A8EA 4PFWA 3QUFA 4ESWA 4OMBA 3W15C 3KOSA 1B9JA 2DXYA 5DEXB 3U72A 3PD9A 4WKMA 2I6EA 3UN6A 4IGRA 5H8NB 4TLMB 1NKXA 4BDLA 4FEBA 3IOWA 3RT8A 4TOZA 3OO9A 3CSBA 4KYSA 4FAJA 1UTHB 3U8QA 4DZ1A 1PB8A 3QAXA 3ILUB 1Y4CA 1TT1A 4H8JA 2XXIA 1LCFA 2B3FA 3K6XA 5KDTA 4HTGA 1US4A 2P2AA 3VFJA 2HXWA 3DP8A 4OZ9A 2O1LA 4IY5A 3FV1A 3VVEA 3FIRA 3MW0A 4TLLB 2NVUB 4GL8A 4Q8RA 3S9NC 3UORA 1KWHA 3ECRA 3RTFB 4HCWA 2I49A 1USYE 5K2YA 2Z8EA 4LQ2A 4LQ5A 1B1XA 3VLVA 3Q27A 4JSDA 3IB2A 3I3VA 3MZ1A 4EF2A 1F9BA 1FTKA 2QMXA 4QF9A 2V3QA 1S7YA 4F22A 4R74A 1B4HA 3OEKA 4QFLA 5ITOA 4LVQA 3PGFA 1B3FA 1TWYA 1I6BA 3KJTA 2REGA 4JXIA 2GHBA 3LSLA 1H45A 3UK4A 3C35A 2FNCA 4ZE9A 4DE8A 1US5A 4F3SA 4YMAA 3VLUA 1VFEA 3LBSA 2R9JA 1MH3A 2OWSA 1MH4A 2XX9A 1MQDA 2F5XA 1LAFE 3FVKA 4G4PA 3C9HA 3SETA 1LFGA 2PT2A 1LLSA 2G93A 5KDTB 4OQOA 5DTBA 1B46A 5HM4B 3MVXA 1PB7A 1URSA 1JVYA 1BP5A 5I2KA 1B2HA 3O6IA 2DE3A 3V89B 1Y1MA 5A5XA 4GXAA 3ONMA 3TDJA 4ISUA 1DMBA 2QMWA 2XXPA 3K02A 3OD7A 5TPAA 1UTBA 2ANJA 2DQVA 1OIBA 5H8QA 3LSWA 1URGA 2PYYA 3T9HB 1IXGA 1MXXA 1B0LA 2HZKA 5DT6A 5CMBA 1EZOA 1AH5A 2W7YA 4RK2A 3FGSA 3H3GA 3RUMA 3OO6A 1QUJA 3V83A 3K1NA 4FEDA 4YICA 1Q35A 1SW2A 3C36A 4QFPA 4ELQA 5CC2A 2DWIA 1N3XA 2QS1A 3M3KA 1RKMA 1SBPA 3FVNA 2GH9A 4QFNA 4YKIA 3HCQA 4XKQA 3C33A 4DCXA 2NXOA 2ZYMA 1M5BA 1EU8A 1NH8A 2AIXA 3BBRA 3Q29A 1SQYA 3O97A 2F7AA 1HSLA 1ZU0A 2G29A 4RXLA 1GVCA 3HN0A 5FTHA 1Y20A 4C1UA 1MQHA 2QSXA 2DSFA 5AA4A 3TUSA 2Q88A 5I2KB 1QKAA 5A5XB 4FECA 2Y7PA 3D4CA 3QUJA 1PBQA 3PMWA 1JEVA 4P11A 5TPAB 3FZVA 2F8DA 2Q2CA 1QUKA 1UTBB 5H8QB 3FASA 1QW0A 1MXWA 3IX1A 4R6HA 4ZZAA 1N0TA 3KN7A 4LZ8A 1N04A 5CMKA 2V3UA 3TELA 4RPOA 2H9BA 4GVOA 4G68C 3E3KA 1ZBMA 1ZJLA 5KCJA 1FQDA 4QSEA 1B7HA 3ZS6A 4C1TA 5CBSA 3FVGA 4X1DA 2DYXA 1UIUA 1LBBA 1OVTA 2HAUA 2F97A 1VE4A 2F6PA 3P7IA 1CE2A 3TTKA 4IO5A 3DM0A 2CMOA 3G3GA 1B5JA 2GRVA 4JDFA 4GWOA 4PETA 1B3HA 3KSJA 1DPPA 4ZE8A 3E4RA 3IAZA 5AE4A 2DOJA 3K1MA 3PPOA 3UP9A 5AA4B 2YLNA 3H06B 3B6WA 1HSEA 4FORA 4U1OA 2RCAA 2ZNUA 4DXBA 2I4BA 4IO3A 4ONYA 3MVYA 1R9LA 3O6HA 4R73A 5FHMA 3ZKLA 5I58A 4JWXA 3UGWA 3KEIA 3T66A 3QK6A 3TKDA 4YB7A 3O6GA 3KN8A 1XS5A 3SDFA 1O63A 4NEDA 4KYDA 5KCJB 3LR1A 3EHSA 1MY4A 3CIJA 2Z23A 1MRPA 1XT8A 4BDRA 1P1WA 4RPNA 3N26A 4FJPA 1CB6A 2I48A 1EH3A 1PBPA 4G8MA 1DTGA 2PVUA 1JETA 1FQFA 2Z22A 1P99A 3K6UA 4NF8A 2DVZA 3O9PA 5FHNA 3TTRA 3MJNA 3L6HA 4RYAA 4Q5TA 4F39A 1MY2A 3Q25A 3FJMA 2XXHA 4H0WA 1EZ9A 1AOVA 3VXBA 1IXHA 5F1QA 3ILTB 2OBGA 3MAMA 5F7VA 5I58B 3FJ7A 2H98A 1M5CA 1XHYA 3CVGA 4LZ5A 1T0KA 4U23A 1SYIA 1OVBA 5HBCA 3DP4A 5CI5A 3PUXE 1XVYA 3MVWA 2HCAA 2RC8A 2ZNTA 1FTLA 4U4XA 1MXUA 2ZYNA 4R75A 1B7ZA 4M4GA 1LBCA 1ZLQA 3S2VA 1URDA 1D9VA 3H6UA 3H4ZA 2F78A 1PDAA 4BDQA 3RNNA 4F3GA 2UVHA 3O28A 3S9EA 1OMPA 4NF8B 1QULA 4GLIA 5DVIA 3T9VA 2R6GE 1B4ZA 3TPAA 4RA1A 3ZSFA 1TXFA 1P1OA 2X7QA 5L9OA 1AIVA 5ICQA 5L9MA 2RINA 3TODA 3ZKKA 5JEIA 4U21A 1FQEA 5AA2B 4I1DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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