2O51A

Crystal structure of bovine c-lobe with fructose at 3.0 a resolution
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of bovine C-lobe with fructose at 3.0 A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 104
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o51A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o51A02
1DPPA 4ZEKA 3L6HA 2QS3A 3MVYA 3AXFA 3E4RA 2DE4A 1LBBA 2F5XA 2UVGA 2UVHA 4OESA 1OMPA 4EQ7A 3U1OA 4ZEFA 5BWJA 2V3UA 1N0TA 4ESWA 1NNTA 1Y3NA 2FA7A 1LLSA 1JW5A 3I3VA 2XX8A 4GIZA 2ESNA 4PETA 1VFEA 4U21A 3MQ9A 1NFTA 2ANJA 3P7IA 1FQAA 1PC3A 1IUDA 3FJ7A 4NF4B 3ZS6A 3PPRA 3O28A 2XXYA 1H45A 3LR1A 2Q89A 4ZECA 2V25A 1Y20A 4QFKA 2PBWA 1HSLA 4OXVA 3PD8A 3V83A 4XKNA 3SKPA 1FW0A 2DWHA 1QJMA 1B3FA 1QUKA 4M4GA 4N6PA 4QSCA 2OK2A 5TPAB 1MH4A 1ZJLA 4KCDA 3H06B 4RY1A 1QUJA 3TELA 4TOZA 1GR2A 1WDNA 4IO6A 2I3WA 3IB0A 3OENA 1GGGA 2NOOA 4H6DA 5HM4B 1B1XA 2GHBA 3SDFA 4U23A 2RINA 2H25A 5JEIA 3IOUA 4GXSB 4KYEA 5EHMA 1ZIUA 4POXA 4R72A 4ZS9A 4XIGQ 2XXXA 2ZNSA 4F31B 4RXLA 2Q88A 1EH3A 3SEVA 3KN7A 4U1ZA 2B3FA 2QS4A 1UTHA 3O2AA 3FASA 1B0LA 4DXUA 1WODA 4HTGA 1AIVA 2DP8A 4NWDA 1H3DA 4BDRA 3FV1A 4P0GA 1NMUA 1SI0A 1TFAA 1MG1A 1XT8A 1JQFA 1UQWA 3O9PA 1TT1A 1Z7NE 3FD3A 4U4XA 3PPNA 5HBCA 1MY0A 3VVFA 1B9JA 3IAZA 3BFTA 2LAOA 3LSLA 3T9UA 3E13X 5I56B 2XX9A 3WAEA 5AE4A 3RTFB 1MXWA 2I6EA 2DVCA 2XX7A 4ISUA 4DE8A 1MPCA 2QL3A 3ZKKA 3CR9A 1EZPA 5I57A 1A8FA 1P99A 4IB2A 1ZMGA 3O66A 3IR1A 4LZ8A 4BDNA 4G8NA 2F34A 1LFIA 4GXAA 4EQ9A 4NF6B 1IITA 3RY3A 1SW2A 1J1NA 1XVXA 2NXOA 3K6XA 4GF8A 4OVJA 3M3FA 3S9EA 5JTYA 1II5A 1EU8A 3T96B 1N04A 5CM6A 1BLFA 2XXWA 4FORA 3OO7A 5H8NB 2KLFA 4R6HA 4H5FA 4OERA 2DXYA 4KCCA 3QIMA 5I84A 3OEMA 1NH7A 5ITPA 3CFLA 3VVDA 4ZEIA 4GRKA 3IX1A 3BKIB 1RYOA 1AL3A 4LONB 3CRBA 2ZMBA 5DT6A 4O3BA 4RK9A 2X7QA 5CBSA 3HHFA 3KFMA 2HCAA 4WXJA 4I1DA 2Q2AA 3S9NC 4IO7A 3H3GA 3MC2A 3TFLA 2XD3A 1NNKA 4JB7A 2V3TA 4NF8B 1B2HA 1SDXA 1USYH 4O3CA 1IZ1A 4C0RA 3K6VA 4G2ZA 4NWCA 1MY4A 4DXCA 1POTA 2XXVA 4K3FA 5ISUA 4F29A 3B6TA 2F8DA 3IK6B 5L9SA 4KFQA 3EHSA 2XXHA 4YKIA 4NF4A 2REJA 2Z8DA 3MJNA 2IEEA 4XKRA 3HO7A 4NF5B 1B32A 3PGFA 4QFNA 1PB7A 5ICTA 3OSQA 4QRZA 4F3GA 2O68A 4H65A 4QFPA 1T0KA 4HS7A 3KOTA 4KI0E 1LFHA 2HEUA 1DOTA 3VV5A 1B40A 1UIVA 2UYFA 5TPAA 1MDP1 3QUJA 4PFTA 2DS9A 2I49A 3DP4A 5HPQA 3PUZE 2I58A 4F2QA 2O84X 1B5JA 1PB9A 3KG2A 4OQOA 5CMMA 3U93A 1B51A 5M2VA 1Y4CA 4THIA 1FQDA 4LP2B 3KZGA 2ALUA 5EHSA 1NH8A 3FVNA 1B7UA 1JVXA 2O7UA 4YKPA 2X7PA 2AIXA 1Y3PA 4H8IA 3WAFA 4R9FA 1OVTA 2DWIA 1Q1KA 3T9XB 2DOJA 3QUFA 1QKBA 3OO8A 1NKXA 4NMYA 4MLQA 3I5OA 5L9MA 1LSTA 2QS2A 3THIA 4OHNA 4QSDA 2XD2A 1MXYA 4F3PA 3W15C 2HQ0A 2XXIA 5L9OA 4OEUA 1M5FA 1FQFA 5FTHA 3HSTA 3VLVA 5TU0A 3TTRA 3DLNA 3G7WA 3HHGA 1USYE 5CC2A 3K2DA 2ABHA 4LQ2A 2HAUA 5LOMA 4EUOA 3T9HB 4YKKA 4GFRA 2VD2A 3FVOA 3UK4A 1LFGA 3U8QA 3IO6A 5I56A 3U92A 2I4CA 3OO6A 4BDQA 4YMBA 1S50A 3D4GA 1MS7A 4F19A 2D21A 4ZDMA 1MQHA 1IIWA 1MPBA 3IB2A 1OQHA 2OCUA 4FEDA 3Q28A 4C1TA 5TP9B 2I0BA 1KWHA 2R6GE 1IXGA 4Z0IA 3VDFA 3TUSA 2Y84A 2XXUA 4DCYA 4ESXA 4ZEBA 1I69A 1JEVA 1B1HA 3EHTA 1ZLQA 3G3JA 4NF6A 4RPNA 4JWXA 2HZKA 5DYHA 3M3KA 2XHDA 2HXWA 3TMGA 1R6ZA 3L6GA 1DTGA 4U1OA 4N13A 2G29A 4OEVA 2M8CA 5JK4A 1IXIA 3C9HA 3MVWA 3SESA 3H6WA 2P1SA 5I59B 1SQYA 3HCQA 1PBQA 3S2VA 1B3LA 3Q29A 1MY2A 4EQBA 1OLAA 3K0VA 2Y7IA 1LAXA 5CBRA 3JV9A 2V93A 4XTCQ 3CIJA 4QHQA 4E0XA 3T9VA 1SYHA 3U72A 4OETA 1DPEA 3IO4A 1SVXB 5I2KB 2UYEA 2AL5A 4GL0A 3SEYA 2HFBA 3IOTA 1XS5A 2A5TA 4XXUA 3FV2A 3KSJA 4NF8A 1SD3A 5I58B 4R6YA 4ZZEA 1B05A 3KN8A 3MZBA 4AB5A 3V89B 2QPQA 2VHAA 1D9YA 1B52A 4ELOA 4IO4A 4X1BA 2H99A 1XHYA 1YTVA 2XXRA 3ONMA 2F7CA 2OWSA 4NF5A 3TQLA 3PUWE 4YKJA 3FVGA 4DDDA 2PT1A 5ITOA 1MXUA 5FHOA 1B3GA 5IAIA 3BFUA 1B5HA 4ECFA 3H6UA 2R9JA 4EXLA 2E0SA 1CB6A 2XXQA 2ZXTA 3KBRA 1NNFA 4XKPA 1SBPA 3K6UA 5CRYA 4R74A 4EXKA 3LSWA 3QSLA 5I2NA 1M5DA 4H67A 2BJJX 1EZOA 4G68C 4FAJA 1B6HA 4FE8A 2ZYOA 3IL1B 5AA2B 4ND9A 1FTKA 2ONKE 1URSA 2DQVA 2F35A 3B7DA 4UA8A 1N7WA 2V84A 5H8HA 3MVZA 4O3AA 3B6QA 1XOCA 3M3LA 4R75A 3C4MA 3CSGA 4POWA 1N76A 4WEPA 1LAFE 2FNCA 3H6TA 3EHUA 5A5XB 3VXBA 4RNSA 3PUVE 1H76A 3K00A 2O69A 2PT2A 4GOTA 3GLBA 4HCWA 4LATA 2WKYA 1D3KA 4QFOA 4P0IA 1N3WA 3HN0A 3N6TA 4FATA 4YICA 1SI1A 5BUUA 2QJEA 5H8QB 1JETA 4DIGA 4TQUQ 3EQ1A 1Q35A 4KHZE 3K6WA 1MXVA 3IJOB 2OLBA 3FXUA 4PP0A 2F36A 3E3KA 3O97A 3K1MA 2QRYA 2YLNA 3E9XA 1SYIA 4H0WA 3PUXE 3SERA 3TCFA 4LZ7A 3FVKA 3A3CA 3MUQA 5TP9A 4I9DA 3F11A 4NEDA 1MY3A 4LQ5A 1B4ZA 4JDFA 1R9QA 1PB8A 1WVJA 1UTBB 1URDA 5DVIA 3C31A 5KCJB 5F1QA 3QXMA 2AYSA 3K1NA 3ZSFA 1P1WA 1SW5A 4F22A 1BKAA 1TXFA 1IEJA 4E0WA 4FEBA 3ILTB 1OLCA 3VE1B 3RT8A 2B65A 1RYXA 2QMWA 1B7HA 5I59A 3BBRA 1B5IA 3O6IA 3EN3A 1CE2A 5IKBA 3MZ1A 3FGSA 5H8FB 4F3SA 3CG3A 4KR5A 1GV8A 1BTJA 2I48A 1ZU0A 1BIYA 1O64A 3PU5A 1FQBA 2DE3A 4WEDA 5I2KA 2DE2A 3MPKA 4H5GA 2ZYMA 3H4ZA 4C1UA 2UVJA 4ELQA 4Z7EA 4G8HA 3OEKA 4DLDA 1ZTYA 5I58A 4HW8A 3S9LC 1B0HA 3IOVA 4NE4A 3OD7A 1A55A 5B70A 3G3HA 2NWJA 4JWYA 2AL4A 3V8XB 4KD5A 1MQJA 3R6UA 3N94A 4G8MA 1QKAA 2OWTA 3OELA 1B3EA 4ZZAA 1B4HA 2DXRA 4Q8RA 3O29A 3VVEA 4G68B 3UN6A 2F7AA 3K01A 3S4UA 1Z7ME 3LSFB 3QK6A 3TTNA 4YB6A 2D3IA 2O6AA 3K4UA 4GVOA 2Q2CA 2ZNUA 1ZKBA 1LAGE 4RJZA 2PYYA 2F78A 4EDPA 1TFDA 2THIA 1ELJA 4H8JA 3U94A 1JW4A 1IQ7A 1VR5A 1S7YA 1D9VA 4OTEA 3C36A 3SETA 1Y4TA 1FTOA 3PMWA 3T22A 2CMOA 2O1MA 3TCGA 3RLFE 3RUMA 4MFIA 3TAJA 4IO3A 1VE4A 1B3HA 3JYRA 5AA2A 1SW1A 1MM7A 1QULA 3TYHA 2I0CA 3LC8A 3EPEA 3GBAA 2NUVA 1LAHE 2GRVA 3KJTA 3RT6B 4X48A 2I3VA 2PX1A 4XKQA 1B7ZA 4F1UA 3CI8A 4MBPA 3EF7A 3S9MC 3QYTA 2DYXA 1H44A 5JTYB 5ELVA 3OSRA 4ZE9A 4N07A 4DZ1A 3LUYA 1VSOA 5A5XA 1LBCA 4P11A 5KZTA 3C35A 4PE5B 2Y7KA 3SEUA 3T93B 1P1OA 3RGYA 4PFUA 4YZZA 2DWAA 4YAHX 5DVFA 1MXZA 2VOZA 3LBSA 3LSXA 2Z8EA 3KEIA 2XXTA 4YMAA 3TQWA 1LB8A 4YB5A 2H4IA 3UA8A 2Z22A 4QF9A 4I8CA 1IXHA 2IA4A 3QAXA 4JSOA 1FQEA 5H8QA 3IOWA 2Y7PA 1Y1ZA 1MXXA 3N6UA 3VFJA 1MQDA 2DWJA 5H8NA 5ICQA 2HZLA 3Q25A 3ILUB 1I6QA 1LB9A 4GL8A 3C32A 3SEXA 4U4SA 1I6BA 4OENA 4OFJA 1VFDA 4G4PA 2VP1A 3M8UA 5H8SA 3W9VA 1H43A 3B6WA 3OMBA 1P1UA 3OOAA 2X26A 3KGCA 3PMVA 3TDJA 4IY6A 3VXCA 2QSXA 3MPLA 4OWDA 4RYAA 3IJXB 3TTKA 2ZYKA 1UTBA 2OZZA 4NTLA 5KCJA 3CFXA 4R6KA 1LCTA 2O51A 4BDMA 1QUIA 4R2BA 5FHMA 3DM0A 5CMBA 3HPIA 1MY1A 3MZ9A 3PPPA 1M5BA 2E1SA 2B3BA 1N84A 2F6PA 1DSNA 3FXRA 3FATA 3CG1A 1MPDA 3N5LA 4LA9A 1P1QA 3MVXA 3G3IA 3K1PA 1LCFA 3GZGA 4X9TA 2OJTA 3CSBA 4FIMA 3Q27A 4BDOA 1ATGA 3G3FA 4YU0A 4R2FA 1YPNA 5H8FA 3FZVA 1S9TA 2VGQA 3O6GA 4TLLB 3ZKLA 1MDQA 3ODBA 4ZEDA 3A3UA 4MF3A 4Q30B 3H03A 5J1DA 1AMFA 2H9BA 3UP9A 4IGTA 5FTIA 5AA3A 1ANFA 2OBGA 3HV1A 4LVQA 2P2AA 1Y9UA 4ONYA 2W7YA 2Z23A 1US4A 2REGA 5AA4B 3DELB 3H7MA 4JBZA 2RC8A 3UIFA 3TTLA 4ELRA 1M5CA 2QS1A 4QFLA 3V5AA 5AA2D 5CMKA 2DVZA 3RTWB 4WKMA 1YAEA 4U22A 3R26A 1SW4A 3O6HA 4IO5A 2A5SA 2RF1A 2FYIA 4G68A 3MWBA 1B46A 3Q26A 1NNPA 2RKMA 3GBBA 4KYSA 5DEXB 1A8EA 4EF1A 4OFLA 1NL5A 4DXBA 1D4NA 2H98A 1DMBA 2O7IA 4MH5A 4F18A 1JNFA 3CVGA 4R9GA 1MQGA 4AB6A 5KDTB 4QSEA 4FJPA 1QW0A 3KJ7A 3PV0E 4R73A 4RPOA 4TLMB 5DVJA 4F3BA 4F1VA 1EZ9A 4F2OA 1FTJA 2F7BA 3TCHA 1A54A 3D4CA 3KOSA 5K2YA 3TPAA 2Z8FA 1R9LA 2ZYNA 5AA1A 4LUBA 4PFWA 5K2XA 3RPWA 1GTKA 4OZ9A 4U2RA 1JEUA 3C33A 1FQCA 1O7TA 4KQPA 4BDLA 1ZBMA 3PMXA 3K02A 1OVBA 3FXQA 1MRPA 3KN3A 2Q8JA 1PEBA 3RQTA 3KSXA 4PQJA 3OO9A 2GH9A 3OXNA 4GLIA 1BP5A 1M5EA 3VLUA 3A09A 3RN8A 2P0SA 4RA1A 1A7LA 2YJPA 3W9WA 3MBPA 1LGBC 2NVUB 4OYVA 1Y1MA 2H5YA 3UORA 2A5TB 2RCBA 1F9BA 1L5TA 4M1VA 2G93A 4YB7A 3UGWA 4X1DA 3FJMA 2F97A 3PUYE 3PPQA 5DTBA 4KPTA 3RNNA 4JWOA 4MLVA 1P1NA 4ELPA 2DSFA 5B7DA 3GXAA 4JXIA 1RKMA 4L17A 4GQOA 3SEWA 4OFOA 1A40A 4OMBA 4UACA 2RCAA 1US5A 1JVYA 4GD5A 1HSEA 3R7XA 2QMXA 4IY5A 2UXAA 3TODA 3TKDA 1I6AA 4GWOA 1PDAA 4Q5TA 1FTMA 2GHAA 4F1YA 1MM6A 3TTMA 1MH3A 3TZAA 3FIRA 2ONRA 2CZLA 2ZNTA 2RC9A 1UTHB 5EYFA 3FJGA 1HSJA 2PMSA 2XXPA 3MP8A 1AOVA 4RK2A 5I2NB 3MP6A 4LZ5A 3USDA 1URGA 4AQ4A 3H6VA 3G3KA 4JSDA 2GFEA 4KYDA 1MQIA 5CMCA 3C34A 4DCXA 5H8HB 5AA4A 1B58A 1FTLA 3DP8A 4G77A 1OQGA 4Q0CA 3T66A 1Y3QA 3VLWA 3MP1A 2I4BA 2VD3A 2V3QA 1FCKA 2ONSA 3TEPA 2PVUA 4IO2A 3I6VA 4EF2A 2Y7WA 4BLAA 2D5WA 5I57B 2HAVA 1O63A 2O1LA 3G3GA 2R71A 1QVSA 2UVIA 1UIUA 3FUZA 4H1XA 5CI5A 2RC7A 3N26A 2F6GA 3CFZA 5F7VA 1R1NA 4I62A 1PBPA 1GVCA 3IB1A 3PPOA 4FECA 4PFYA 4HCYA 5DEXA 3MW0A 1OIBA 1XC1A 3PD9A 3JZJA 4IGRA 1JW1A 1AH5A 3DP6A 1N3XA 4ZE8A 5FHNA 3ECRA 1IXCA 3IORA 1XVYA 1TWYA 5L8DA 1DTZA 1POY1 1YCJA 1A99A 1N7XA 2Y7RA 5KDTA 3MAMA 2YPNA 4F39A 2Q9TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1SI0A 1TFAA 1MG1A 3T0JA 1XT8A 1JQFA 1UQWA 3O9PA 1TT1A 1Z7NE 3FD3A 5ET6A 4U4XA 3PPNA 5HBCA 1MY0A 3VVFA 1NUYA 2FIEA 1B9JA 3IAZA 5FBPA 4OVSA 4DI4B 3HFUA 1JP4A 3BFTA 2LAOA 3LSLA 4PAIA 3T9UA 3FBPA 3U65A 2ZZVA 3E13X 5I56B 2XX9A 3WAEA 5AE4A 3RTFB 1MXWA 2I6EA 1FSAA 2DVCA 2XX7A 4ISUA 4DE8A 1MPCA 2QL3A 3QMFA 3ZKKA 3CR9A 1EZPA 2Q8MA 5I57A 4PDDA 1A8FA 1P99A 2VPOA 4IB2A 1ZMGA 3O66A 3IR1A 4LZ8A 4BDNA 4G8NA 2F34A 1LFIA 4GXAA 4EQ9A 4NF6B 1IITA 3RY3A 1XI6A 1SW2A 1J1NA 1XVXA 2NXOA 3K6XA 4GF8A 4OVJA 3M3FA 3S9EA 5JTYA 1II5A 1EU8A 3T96B 1N04A 4GWYA 5CM6A 1BLFA 2XXWA 4FORA 3OO7A 5H8NB 2KLFA 3NOHA 4R6HA 4H5FA 4OERA 2DXYA 4KCCA 3QIMA 5I84A 3OEMA 1NH7A 5ITPA 3FXBA 3CFLA 3VVDA 4ZEIA 2CEXA 4GRKA 2XXKA 3BKIB 3IX1A 1RYOA 1AL3A 2WYKA 3RYDA 4LONB 4N15A 3CRBA 2ZMBA 3ROJA 5DT6A 4O3BA 4RK9A 2X7QA 5CBSA 3HHFA 3KFMA 2HCAA 4WXJA 4I1DA 2Q2AA 3S9NC 4IO7A 3H3GA 2BJIA 3MC2A 1DK4A 5IZ1A 3TFLA 2XD3A 1NNKA 4PFBA 4JB7A 2V3TA 1NUXA 4NF8B 1B2HA 1SDXA 1USYH 4O3CA 1IZ1A 4C0RA 3K6VA 4G2ZA 4NWCA 1MY4A 3CHGA 4DXCA 4PFRA 1POTA 2XXVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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