2O51A

Crystal structure of bovine c-lobe with fructose at 3.0 a resolution
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal structure of bovine C-lobe with fructose at 3.0 A resolution
rcsb
total genus 104
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o51A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o51A02
4EQ9A 4YKPA 3OO6A 4ISUA 4KR5A 1MG1A 2V25A 3O6IA 2ONRA 2O1LA 3HN0A 1B7HA 3C33A 3OSRA 3TPAA 4ELQA 3FVGA 5KCJB 4IY6A 2PVUA 1Y20A 3V83A 1ATGA 1QJMA 4U1OA 4YMBA 3GBBA 2OBGA 2ZYOA 1NMUA 3SEXA 4F39A 2DWIA 5FTIA 1JW1A 3PUWE 4F3GA 3MP6A 1MXWA 1LSTA 3H6TA 1P1QA 3QK6A 4F2OA 2HQ0A 3FIRA 4P0IA 4H8IA 4G8HA 1PEBA 4N13A 4QSEA 3G3GA 5H8HA 5A5XA 3Q28A 2PMSA 4YMAA 4ELRA 3T96B 2Y7PA 3IJOB 3VV5A 1QW0A 4GF8A 3EN3A 1URDA 3FJGA 3SEYA 4MLVA 4LQ5A 4U4SA 1GV8A 1JETA 4EQBA 3PD9A 2F97A 5I59A 1IIWA 4YZZA 3V89B 1R9QA 2UYEA 3BKIB 4BDOA 4G68C 3MAMA 3WAFA 1GR2A 5L8DA 5BUUA 5K2YA 1FTMA 4NF5A 4H5GA 1VFEA 5AE4A 3PPPA 4H67A 4YKKA 3TTLA 4X1DA 5BWJA 3LSFB 1ZIUA 2Q2AA 3LSWA 1D9VA 1UTHA 2V93A 1A7LA 4NWDA 3VLWA 5CBSA 3UK4A 4MFIA 4R75A 4R6YA 1QUKA 4TLMB 5KDTA 4RYAA 3IB2A 3O66A 4R2BA 4THIA 3MVYA 4OFJA 1N7WA 1YCJA 4G68B 2XXVA 1M5CA 5FHMA 2NVUB 2XXPA 3MUQA 4WEDA 1FTKA 3CI8A 1FCKA 1MXXA 3U8QA 1TWYA 3OENA 3C9HA 3TQWA 2DWAA 4NWCA 3HCQA 4E0WA 4KYSA 2XXIA 1XVXA 3C36A 1B7UA 3DM0A 4FIMA 3FXUA 1OVBA 4JWOA 3RY3A 5CMBA 2GRVA 4GXAA 3ZSFA 4R9GA 3IJXB 1EH3A 1B0HA 3UA8A 2AL5A 4OTEA 3TTRA 4ZZEA 2PT1A 1MM7A 3SEUA 3SERA 1FQCA 1MQHA 2DQVA 3TZAA 1UTBA 3C4MA 4U2RA 3TYHA 3GZGA 3FASA 1MPBA 5AA4B 3RN8A 2HFBA 5ITPA 1HSLA 1TFDA 3HHFA 1JQFA 4Q8RA 3MVZA 5B70A 1US5A 1MXYA 3A09A 3MVXA 2I6EA 4PQJA 4YB6A 5H8NA 4RK2A 3PGFA 2DXRA 3W9VA 4KYDA 3IORA 1VR5A 1Y3QA 3O29A 1Y1MA 2P2AA 1JW5A 5AA2B 4MH5A 3RT6B 1O63A 2ESNA 2DSFA 1ZJLA 3S9NC 1B3GA 2DWHA 4XTCQ 2RKMA 4U23A 4OWDA 4H65A 5I56B 2HZKA 1B32A 1B3EA 2M8CA 1PDAA 2F7AA 1LAXA 1Y3PA 4Q30B 3H6UA 1I69A 1FTJA 2Z8EA 1M5BA 4F19A 3VXCA 2P1SA 4KD5A 2GH9A 1BKAA 4HW8A 3OSQA 1PC3A 1M5FA 4ECFA 2QS4A 3SKPA 4QFPA 1PB9A 2X26A 4I62A 4C1UA 4F29A 3HSTA 2IEEA 2XHDA 1P1OA 2H98A 1IEJA 1B3HA 3CVGA 1IXCA 4BDMA 2QJEA 1SW5A 1H45A 2ZMBA 1B52A 1MY4A 1B40A 1Y9UA 2QS2A 3R26A 4XXUA 2V84A 1A55A 5F7VA 2OJTA 4PFYA 4XIGQ 1LAGE 4GLIA 4GRKA 1D4NA 4ZECA 3K1NA 4R6KA 1MQDA 1LFGA 3V5AA 5DT6A 3ILTB 2DVZA 2NXOA 3OXNA 5K2XA 4UA8A 1OQGA 1N04A 4F1VA 4G8NA 3K4UA 1OIBA 4EUOA 5HPQA 4RJZA 2F7BA 3KGCA 3K1MA 4GVOA 3O28A 5TU0A 3H6WA 4YKJA 4WKMA 4OZ9A 1OMPA 5I58A 3RUMA 3ZKKA 1B05A 1B3FA 3PMVA 3FATA 3KEIA 1NNFA 2G29A 5CM6A 4FJPA 2UVHA 3CFZA 3PD8A 3TEPA 3KSJA 1GGGA 4IB2A 1OLCA 3H03A 2QS3A 1FQDA 4G4PA 2B65A 1MDP1 1T0KA 1BLFA 1TXFA 1NH8A 5I2KB 4OEUA 3VLUA 3IL1B 3RQTA 3OO9A 3H06B 3TCGA 3C35A 1LLSA 4EF1A 3USDA 3H3GA 2HAVA 1SYHA 4FAJA 1A40A 2DXYA 3MPLA 3QXMA 4GL8A 2DE2A 1QUIA 4JB7A 4DXCA 1N84A 1EZPA 3S9LC 2E1SA 1RYXA 4LZ8A 2NWJA 1P1NA 2GHAA 1AOVA 4FORA 2DP8A 1R1NA 1L5TA 2ZNTA 4NE4A 1IZ1A 1USYE 5I2NB 2RC8A 1POTA 4K3FA 4HCWA 1RKMA 2OWTA 4P11A 3CG1A 3MVWA 3E13X 2BJJX 2OWSA 1SD3A 4FE8A 4ZEKA 3K02A 2F6GA 2DE3A 2I4BA 4HS7A 4QHQA 4IO6A 2FYIA 2V3QA 3IOUA 3C31A 1B58A 3E4RA 1XOCA 2VD2A 5I57A 2R9JA 1SQYA 1US4A 3P7IA 3K6XA 4X9TA 3FXQA 3THIA 2D5WA 2ZNSA 1YPNA 2QMWA 3SEVA 1MDQA 2ZYKA 5DVJA 1PB7A 2H9BA 1FTLA 4KI0E 4F1YA 1DTGA 1B5HA 2QSXA 3KJ7A 3B7DA 3SETA 4GXSB 5CBRA 1DTZA 5AA2D 3MWBA 2ZXTA 1SBPA 3M3LA 4C1TA 2FNCA 1B51A 4BDRA 4NF4B 3TCHA 2E0SA 1LGBC 2UVGA 4ZEFA 4MBPA 3A3UA 4H1XA 4PFWA 4LZ5A 5KCJA 4H8JA 2P0SA 4POXA 2ZNUA 3UN6A 3L6GA 5EHMA 4F1UA 5TPAB 4R9FA 4GOTA 1SVXB 4F18A 3LSLA 5ISUA 1BP5A 3MZ9A 1SW4A 1NNPA 3VVDA 1LCFA 2D21A 5ITOA 2W7YA 3G3IA 3MJNA 3VVFA 5H8FB 1B4HA 2HAUA 5EYFA 3VVEA 1WDNA 3KJTA 3M3FA 3OEKA 1DPEA 2Q2CA 4P0GA 4QFKA 4OFOA 3RTFB 2QS1A 1B0LA 3TFLA 1HSJA 2Z23A 4N07A 2O7IA 4HTGA 3N94A 3O6GA 4IO5A 4F3BA 2VHAA 2XX7A 3IOWA 3LC8A 4NF6B 4M4GA 4NMYA 3T66A 4BLAA 3DLNA 3UP9A 1SDXA 3IO6A 4RK9A 3CG3A 1YTVA 4XKNA 2A5TB 4IGRA 1PBPA 4NF4A 2PYYA 3IAZA 1USYH 1PBQA 4ELPA 3K00A 3S2VA 3QYTA 2F7CA 4X1BA 4ESWA 5CMCA 4YU0A 1EU8A 3PU5A 1MRPA 4NTLA 3DP8A 1EZ9A 1Q1KA 2F36A 3U72A 2Z22A 3IOTA 5TPAA 2G93A 3WAEA 2KLFA 3G3FA 2Q9TA 4XKQA 1IUDA 3FUZA 1B6HA 1P1UA 1NNKA 4G8MA 4JDFA 3RLFE 5JTYB 1R9LA 5H8FA 5HBCA 3PUZE 4LQ2A 1LCTA 1KWHA 5FHNA 1ZLQA 2A5SA 2Z8DA 5DEXB 4LATA 5FTHA 3KOTA 4ZZAA 1FQEA 2O68A 3MP8A 4EF2A 3ODBA 5HM4B 1JNFA 3H7MA 3TCFA 1N0TA 3N6TA 4G68A 2XXWA 3TQLA 1N3XA 1NKXA 3D4CA 4DLDA 2R71A 4DZ1A 4KCCA 1B46A 5CI5A 2GHBA 4QF9A 2XXXA 3T9HB 3ILUB 5AA1A 4L17A 1AMFA 4WXJA 3T22A 3T9XB 3BFUA 3HO7A 5CMMA 4O3BA 4JSDA 3Q27A 2RC9A 3TDJA 2OZZA 1IXGA 3MZ1A 5CMKA 3MW0A 5CC2A 3TTMA 4XKPA 1SI0A 1BTJA 3FZVA 3DP6A 1MQJA 3KN8A 1H76A 5M2VA 5DVIA 3VLVA 3PPQA 1IXHA 2QRYA 4ESXA 3AXFA 2PBWA 3UORA 4G2ZA 4POWA 4F31B 4JBZA 1A54A 5AA4A 4OETA 1MY0A 1OLAA 4YKIA 3EHUA 1S50A 1ZKBA 3TMGA 3PV0E 4MLQA 3F11A 3FJMA 2Z8FA 1N7XA 1CB6A 2I4CA 2PT2A 1A8EA 1URGA 2XXTA 1XHYA 5LOMA 5CRYA 4ELOA 3FD3A 1I6AA 2F34A 4RPOA 1JEUA 4O3CA 5AA2A 3EF7A 2H5YA 3G3HA 3B6WA 4NF8B 3U1OA 2RINA 4Z0IA 2YJPA 3CFLA 3RT8A 4RXLA 3MQ9A 1MXUA 4PP0A 5I56A 4F22A 3S9MC 3BBRA 5B7DA 4IGTA 4AQ4A 2XXUA 3Q26A 1DSNA 3JYRA 1B1HA 3O6HA 3ZS6A 3H4ZA 1B5IA 5L9SA 4QFNA 4ZE9A 1LB8A 1WVJA 1ZMGA 3CRBA 3T93B 3CIJA 2XD2A 4KFQA 4IO3A 1B1XA 3IOVA 3I6VA 2F35A 1LB9A 3K2DA 2RC7A 4ZEBA 4BDNA 3S9EA 4NEDA 1JVYA 1EZOA 2ABHA 1NL5A 5TP9B 2ONKE 4FATA 4Q0CA 2AL4A 4JSOA 2DOJA 1Q35A 2ANJA 4OEVA 4I1DA 3OD7A 1S9TA 4KHZE 3K1PA 4TLLB 2Y7WA 3SEWA 2UVJA 3M8UA 5I84A 2XXRA 3CSGA 4GIZA 1TT1A 2X7QA 3TTKA 1QKBA 2ONSA 1GVCA 1B4ZA 1IITA 1TFAA 2HEUA 2DS9A 1D3KA 4GL0A 3LR1A 1JVXA 1N3WA 3H6VA 2HZLA 3BFTA 3O9PA 4YICA 1R6ZA 1MH4A 1URSA 1ZBMA 4LONB 4JWXA 1PB8A 3OOAA 5H8HB 5A5XB 3MC2A 1MY1A 3EPEA 4FEBA 3W9WA 2VP1A 1B3LA 4OHNA 3VXBA 2AIXA 3I3VA 4F2QA 1B5JA 1UIUA 2IA4A 3FVOA 2THIA 3TKDA 4HCYA 3MBPA 4DDDA 1QULA 2XX8A 1FQAA 3LUYA 1VSOA 3CR9A 2Y84A 3DP4A 4OERA 5I59B 1LFIA 3EHTA 4DE8A 5IAIA 2Q88A 4RA1A 1MY3A 5H8QB 5I2KA 4QSDA 3GBAA 1CE2A 1RYOA 3UIFA 1VE4A 3E3KA 1D9YA 1MQGA 4UACA 5IKBA 3FGSA 3R7XA 3RGYA 4YAHX 4NF5B 5JK4A 3E9XA 3KFMA 4U1ZA 2VOZA 3GLBA 4EXKA 4XKRA 3KSXA 1M5EA 3N5LA 3VFJA 3L6HA 2LAOA 4R74A 3C34A 4PFUA 3MP1A 1UTHB 4LUBA 3M3KA 4GFRA 4IO4A 2QPQA 4OXVA 4ONYA 1Y3NA 1AH5A 1QVSA 2VD3A 2UYFA 4I9DA 5KDTB 1FQFA 3OO8A 2V3TA 4WEPA 5I2NA 4BDQA 3G7WA 4ZEDA 1GTKA 3KN3A 2XXHA 3PPNA 4R2FA 3K01A 3LBSA 4H0WA 3K6VA 4ZE8A 3SESA 2I3WA 1H44A 4DCXA 4Z7EA 5ICTA 1QKAA 1POY1 4ZDMA 5H8QA 1H3DA 4U4XA 1IQ7A 2O69A 4TOZA 1FW0A 4G77A 1NH7A 5DTBA 1SYIA 2FA7A 1ZU0A 4EXLA 4QFLA 3JZJA 1ZTYA 1UTBB 2I0BA 2XD3A 3DELB 1ELJA 1MXVA 3TUSA 4GD5A 1XC1A 3SDFA 4R6HA 4YB7A 1F9BA 3W15C 2RCAA 1MQIA 1Y4TA 3R6UA 1B2HA 3OEMA 1DPPA 3U92A 3FV1A 3JV9A 2XXQA 3CSBA 1UIVA 2CMOA 3A3CA 4IY5A 2QMXA 3OELA 4Q5TA 3O97A 2H99A 2PX1A 5H8NB 4AB6A 2DYXA 4EQ7A 4IO7A 3S4UA 2O7UA 5H8SA 4QFOA 4KPTA 4ZEIA 1ANFA 2GFEA 4LA9A 4OQOA 2I58A 5L9MA 2Y7KA 2YPNA 2RF1A 1Z7ME 3K6WA 2WKYA 3TODA 3QUFA 2XXYA 2OCUA 1XT8A 4PE5B 2B3BA 3N26A 1OVTA 2F8DA 4TQUQ 2DWJA 2AYSA 2I49A 1FTOA 3B6QA 4DIGA 4NF6A 4OFLA 1A8FA 3N6UA 3QIMA 3PUYE 1OQHA 2H4IA 3FV2A 3U94A 4LVQA 3V8XB 3B6TA 1Z7NE 2A5TA 3PMWA 3CFXA 2YLNA 1O64A 2V3UA 3EQ1A 3QUJA 1SW1A 1HSEA 2I3VA 3IO4A 5L9OA 1XVYA 1LAHE 5ICQA 5JEIA 3ZKLA 1MY2A 1MS7A 2Y7RA 2RCBA 5EHSA 2ZYMA 2ZYNA 4H6DA 2O6AA 1SW2A 3PPRA 2OLBA 4RNSA 1LAFE 4OENA 2QL3A 4QRZA 3T9VA 2B3FA 1IXIA 2NOOA 5JTYA 1WODA 4JWYA 4GWOA 3HV1A 4RY1A 5KZTA 1II5A 3PUVE 5DEXA 1B9JA 1MM6A 4M1VA 1LBBA 1NNTA 3K6UA 1J1NA 4OESA 4RPNA 3OMBA 3I5OA 4GQOA 4MF3A 3KOSA 4E0XA 4O3AA 4PETA 4R72A 1AIVA 2XX9A 1BIYA 5F1QA 4FECA 4OMBA 2DVCA 3IX1A 3K0VA 5I58B 4X48A 1NFTA 3GXAA 1YAEA 3RNNA 1FQBA 4BDLA 1N76A 2O51A 4FEDA 3RTWB 3IR1A 1P1WA 3QSLA 3TELA 3Q25A 3EHSA 4F3SA 4LZ7A 3FVKA 3KBRA 3TAJA 2I48A 2F5XA 5ELVA 4N6PA 2Q8JA 1MH3A 3MPKA 1I6QA 3OO7A 3PMXA 4QSCA 3KN7A 4U21A 1LBCA 4OVJA 1MXZA 3QAXA 4ND9A 2F78A 4H5FA 1MPCA 2X7PA 4OYVA 5DVFA 1O7TA 4JXIA 3IB1A 3TTNA 1I6BA 2NUVA 2D3IA 4U22A 4C0RA 5AA3A 1B7ZA 1VFDA 2DE4A 2F6PA 3ONMA 4KQPA 3Q29A 2UXAA 3KZGA 3HPIA 3RPWA 2UVIA 4IO2A 1H43A 2R6GE 3PUXE 1JW4A 2OK2A 2VGQA 3IK6B 3FJ7A 4ZS9A 1MPDA 2ALUA 3HHGA 4PFTA 2O1MA 2HXWA 3T9UA 4NF8A 3FVNA 1A99A 1M5DA 4KYEA 5FHOA 1P99A 1DMBA 4R73A 3D4GA 2Q89A 2CZLA 3O2AA 3LSXA 3U93A 1JEVA 3PPOA 1QUJA 4YB5A 5DYHA 3ECRA 2REJA 5I57B 2H25A 1AL3A 2Y7IA 3MZBA 2O84X 4AB5A 1LFHA 2HCAA 1Y1ZA 3IB0A 4F3PA 3UGWA 4DCYA 4I8CA 1SI1A 3FXRA 3C32A 2I0CA 1XS5A 2REGA 3G3KA 3KG2A 1Y4CA 1S7YA 1DOTA 3VE1B 4DXUA 3VDFA 4LP2B 4KCDA 1UQWA 5TP9A 5J1DA 4DXBA 3G3JA 4EDPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4EQ9A 1IMDA 4YKPA 3OO6A 4ISUA 4OVTA 4KR5A 1MG1A 2V25A 3O6IA 2ONRA 2O1LA 3HN0A 2Y5KA 5IZ3A 4GBVA 1B7HA 3C33A 3OSRA 3TPAA 4ELQA 3FVGA 5KCJB 1IMCA 2PVUA 4IY6A 1Y20A 3V83A 1ATGA 1QJMA 4U1OA 4YMBA 3GBBA 2OBGA 2ZYOA 1FRPA 1NMUA 4O7MA 5ET6A 4P1LA 4O7IA 3SEXA 4F39A 2DWIA 5FTIA 1JW1A 3PUWE 4F3GA 3MP6A 1MXWA 1LSTA 3PTYA 3H6TA 1P1QA 3QK6A 4F2OA 2HQ0A 3FIRA 4GWSA 4P0IA 4GWXA 4H8IA 4G8HA 1PEBA 4N13A 4QSEA 3G3GA 5H8HA 5A5XA 5ET8A 3Q28A 2PMSA 4YMAA 4ELRA 3T96B 2Y7PA 3IJOB 3LUZA 3VV5A 1QW0A 4GF8A 3EN3A 1URDA 2VPNA 3FJGA 3SEYA 4MLVA 4LQ5A 4U4SA 1GV8A 1JETA 4JVCA 4EQBA 3PD9A 2F97A 5I59A 1FPJA 1IIWA 4YZZA 3V89B 1R9QA 2Q8MA 2UYEA 3RYDA 3BKIB 4BDOA 4JVIA 4MX6A 2WX9A 4G68C 3MAMA 3WAFA 1GR2A 3B8BA 5L8DA 5BUUA 5K2YA 1FTMA 4NF5A 4H5GA 1VFEA 2P3VA 5AE4A 5EQAA 3PPPA 4H67A 4YKKA 3TTLA 2V4CA 4X1DA 5BWJA 3LSFB 1ZIUA 2Q2AA 3LSWA 1D9VA 1UTHA 2V93A 1A7LA 4NWDA 3VLWA 5CBSA 3UK4A 4MFIA 4R75A 4R6YA 1QUKA 4TLMB 5KDTA 4RYAA 3IB2A 3O66A 4R2BA 4THIA 3MVYA 4OFJA 1N7WA 1YCJA 4G68B 4DI3D 2XXVA 1LBXA 1M5CA 5FHMA 2NVUB 2XXPA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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