2Q2CA

Crystal structures of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein artj from the thermophilic bacterium geobacillus stearothermophilus
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
b'KKVVVGTDAAFAPFEYMQKGKIVGFDVDLLDAVMKAAGLDYELKNIGWDPLFASLQSKEVDMGISGITITDERKQSYDFSDPYFEATQVILVKQGSPVKNALDLKGKTIGVQNATTGQEAAEKLFGKGPHIKKFETTVVAIMELLNGGVDAVITDNAVANEYVKNNPNKKLQVIEDPKNFASEYYGMIFPKNSELKAKVDEALKNVINSGKYTEIYKKWFGKEPKLDRLKQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures and mutational analysis of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein ArtJ from Geobacillus stearothermophilus. Implications for interactions of ArtJ with its cognate ATP-binding cassette transporter, Art(MP)2
pubmed doi rcsb
molecule keywords ArtJ
source organism Geobacillus stearothermophilus
molecule tags Transport protein
total genus 74
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2q2cA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2q2cA02
3BKIB 2Q88A 2IA4A 3RUMA 4NF5A 4XIGQ 1UQWA 3RY3A 1LGBC 3KGCA 1GTKA 5L9SA 2ZMBA 4F3BA 5H8QA 4FEDA 4JXIA 1WDNA 4Q30B 3B7DA 2P2AA 2HEUA 4O3CA 2RINA 1AMFA 1B40A 2I4CA 4DIGA 4BDRA 4R2FA 3OSRA 2VD2A 3OEMA 1LSTA 1ZBMA 4KFQA 4E0WA 3FZVA 3UGWA 1QW0A 4G68A 2XXTA 4QSDA 1LFGA 4LZ7A 1TFDA 3MZ9A 4OHNA 4NF6A 1N04A 4THIA 4X48A 1LAHE 5AA1A 5DTBA 4OXVA 5L8DA 5KDTA 3KSXA 4F2QA 3K1PA 3MZ1A 2I48A 1UTHA 1POY1 1Y1ZA 3C36A 3G3IA 4BDOA 5TPAA 3LSWA 5FTHA 3PUYE 2F6PA 2H98A 2DYXA 3IOWA 3C9HA 3KOSA 3Q29A 4GVOA 4I8CA 4F22A 4YZZA 5H8FA 1FW0A 3BFUA 1PC3A 4U4XA 2AIXA 3OO7A 5CBRA 5ISUA 1SW5A 3RQTA 4IGRA 2X7QA 3IOUA 4JWYA 1M5CA 3FVKA 4JWOA 5AA4B 5DVFA 5HPQA 2DWJA 5L9OA 4OERA 4U1ZA 2I58A 1B46A 5H8HA 4PETA 1Q35A 1UTBA 3TQWA 1N7WA 1UIVA 2I3WA 1S50A 1MH4A 4BDQA 2Q9TA 3V83A 1D4NA 3C34A 2H99A 2O7UA 3UIFA 1ZKBA 5I57A 3IX1A 4NF6B 4LVQA 3MP6A 4QFOA 4RYAA 2OWTA 2ZYKA 5KDTB 2PMSA 2XX9A 4G8HA 3FASA 2R6GE 4P11A 2NWJA 3K6UA 3ILTB 2GHBA 4OETA 4K3FA 2XXIA 1A8FA 4F31B 2ONRA 2H4IA 4L17A 4E0XA 1NNFA 1D3KA 4ZDMA 3ONMA 4KI0E 3M3KA 3TCFA 1XT8A 2X26A 4R73A 3CFXA 1A54A 3MAMA 4QF9A 3MUQA 4G2ZA 2ABHA 2ZNTA 2G93A 3TQLA 3DLNA 2NVUB 3QIMA 2HZKA 4ELQA 4X9TA 3N26A 3V5AA 4FJPA 1POTA 1URDA 3A09A 4QSEA 5CMBA 1ZLQA 1MG1A 2G29A 3IOVA 3O97A 4GFRA 1R1NA 4YB7A 1Y1MA 2HFBA 1P1WA 2QS1A 4HTGA 5I2NA 3TTRA 1OMPA 3KN8A 1MM6A 2PVUA 3PPQA 3PUZE 1Y20A 3FJGA 1AIVA 3JYRA 3Q25A 3T9UA 4FE8A 3O6IA 4KQPA 2GH9A 3FV2A 2E0SA 3MVYA 5AE4A 2UVIA 1LB9A 1BP5A 1B1XA 1P1OA 3VLWA 2DE2A 4G68C 4R72A 4RPNA 3EHUA 3IL1B 4BDLA 2RC9A 2O7IA 3MJNA 1FQDA 4NF8B 4DXUA 1SYHA 3K4UA 3ZKLA 3IB1A 3O29A 2VOZA 1Q1KA 2DE3A 3O6HA 2DXYA 2XXYA 1SD3A 5BWJA 1FQFA 3IO6A 1PBPA 4LATA 5CM6A 2XXXA 2XXQA 4GL0A 3U94A 2AYSA 4KYDA 3T96B 4RNSA 4NWDA 5EHMA 3R26A 3KBRA 5J1DA 4OYVA 4RK9A 2REJA 4PFWA 3UP9A 2OWSA 2PX1A 1MXVA 3TMGA 4R6YA 4ND9A 1MH3A 4GD5A 3G3KA 1B4ZA 3L6HA 3RPWA 1JW5A 4R75A 2PT1A 3CI8A 4YB5A 1A55A 3UK4A 5I2NB 4JSOA 3K02A 1MPDA 5TP9A 1USYE 3OO8A 3EHSA 3RLFE 5A5XA 4R6HA 3DM0A 1Y4TA 1VFEA 2E1SA 2Y7KA 2QRYA 3PU5A 1LB8A 3TTKA 1BKAA 3T9XB 4DXBA 4R6KA 5CMCA 1JVYA 1B6HA 2OZZA 3HN0A 2DWHA 2RCAA 1B3FA 5M2VA 4G77A 1M5BA 2ZYMA 3OEKA 1D9YA 1T0KA 3QUFA 2I4BA 5LOMA 3RTFB 2FNCA 1LBBA 1NNKA 1MXYA 1QKAA 1TFAA 4GXAA 4AB6A 4GXSB 2B65A 3HCQA 5HM4B 4YKPA 2DQVA 5F1QA 4OQOA 4OMBA 3WAEA 4ISUA 3MW0A 1PB9A 3O6GA 3T9HB 4EF2A 4NMYA 4WKMA 3IR1A 1OLAA 1Y9UA 4GWOA 2HXWA 2CZLA 3MPLA 1B3EA 3PMWA 2PYYA 1O7TA 4GRKA 1B5JA 2IEEA 1US5A 3OSQA 4JBZA 4ECFA 1QULA 4DLDA 4XTCQ 4FORA 4IO5A 4EXLA 1S9TA 1H43A 3QUJA 4TLMB 3SKPA 4DCYA 4U4SA 4IO6A 2NOOA 4HCYA 4N13A 3K6XA 4DXCA 1MXUA 1M5DA 4EF1A 2Y7IA 3LC8A 3T22A 1GGGA 3SEUA 4NF4A 5AA3A 5B70A 1B51A 3U72A 1B7HA 1YTVA 3LSLA 3TPAA 4LZ5A 4F2OA 1AOVA 1JEUA 1TT1A 2Y7RA 1P1NA 2QMXA 5DYHA 2Q8JA 5AA4A 2I49A 4I1DA 2DXRA 5F7VA 3CG1A 3R7XA 1RYOA 1B0HA 3PPOA 5CMKA 4RPOA 3U92A 2V3TA 5HBCA 3KN7A 3VVDA 1MDQA 3QSLA 1I6BA 2DVZA 1QJMA 3D4GA 2DP8A 1DPPA 2UVHA 1ZTYA 1MPCA 3FD3A 3SEVA 3USDA 2NXOA 2YPNA 1H44A 3O66A 4GF8A 2UXAA 3P7IA 3MPKA 3RT8A 4ZE8A 1MQJA 2I6EA 4IY6A 4LONB 4FEBA 3E13X 3O28A 4JDFA 4DE8A 4EXKA 3TDJA 1Z7ME 3TTMA 4JSDA 4LQ2A 4F3PA 1EH3A 2X7PA 5AA2B 1MY2A 3IJXB 1IXIA 2XXVA 2F36A 1B32A 5ITPA 1ZIUA 4G8NA 3TCGA 4RK2A 4NF4B 2WKYA 4YICA 1MM7A 1N3XA 1I6AA 2F34A 3M8UA 2YJPA 3GBBA 5L9MA 2R71A 5ICTA 3H6VA 4ZE9A 1IITA 2AL5A 5KZTA 4NEDA 1XVXA 4IO2A 4EQBA 2Y84A 4R74A 5DEXA 4PE5B 2F78A 3TAJA 3TTLA 2XX7A 1VE4A 1II5A 4PFYA 1LCTA 2V84A 3OMBA 4DDDA 3FVGA 2F97A 2HCAA 1MXZA 1TXFA 1CE2A 3VVFA 2UVGA 1LCFA 1H3DA 5FTIA 4BLAA 4KYEA 1MY1A 1SW4A 2F7BA 2V93A 1IEJA 3SEWA 3LSXA 3C4MA 3PD8A 3FXRA 5DVJA 1MY0A 2V25A 3FGSA 2KLFA 1B0LA 1LFIA 1ATGA 4M4GA 4IO3A 2NUVA 2OLBA 4NF8A 3CRBA 1XOCA 1ANFA 2Y7PA 3IOTA 4QSCA 3VDFA 3C33A 3ZS6A 3KEIA 3MC2A 4R2BA 4IO4A 2ONKE 4H67A 3TYHA 3OXNA 4KD5A 4YB6A 2ANJA 5TU0A 2XXRA 3LSFB 4F3GA 5H8SA 1HSJA 1XHYA 1ZU0A 4H5FA 2B3BA 4H5GA 1SQYA 3DELB 4X1BA 3VVEA 3FJMA 2F5XA 3E9XA 1OVBA 2DVCA 4POWA 5CMMA 3SDFA 5DEXB 1P1QA 4MH5A 4F19A 4WXJA 3S4UA 1MY4A 4Z0IA 1R9LA 1Y3PA 3G3JA 3B6QA 4HCWA 3QK6A 4UACA 2GHAA 4F39A 1SBPA 3CSGA 3PV0E 1R6ZA 1S7YA 1DMBA 1MQGA 3VLUA 3E3KA 1FTJA 1NKXA 3V8XB 2UYFA 3VXCA 2O68A 2DSFA 2OJTA 1B3LA 2O84X 3H4ZA 1JQFA 3RT6B 1B1HA 4AQ4A 3CVGA 3IJOB 2GRVA 3N6TA 2XXWA 3N6UA 4LA9A 3H3GA 1A99A 1B58A 4ZZEA 4OENA 5IAIA 4ZS9A 4FAJA 1J1NA 2F35A 2ZXTA 3LBSA 3MZBA 2H25A 3PD9A 1DSNA 3TUSA 3UORA 3KFMA 4RJZA 4ELPA 5CRYA 1PB7A 1PDAA 1ZJLA 3T93B 3G3HA 3KSJA 2VP1A 1SW2A 4P0IA 5ICQA 2OK2A 3I5OA 3N94A 4H65A 1EZOA 4LZ8A 4OFLA 2PBWA 1HSLA 5IKBA 2CMOA 3EPEA 3H6WA 4LQ5A 1LLSA 2O1MA 1B2HA 2H9BA 1N3WA 1WVJA 5I2KA 3CR9A 3OO9A 3A3UA 3S9EA 4Q5TA 3T9VA 3FJ7A 3EHTA 2Z22A 1ELJA 4KHZE 2ESNA 3H06B 2O69A 1HSEA 1XS5A 2RKMA 1B7UA 4ESWA 4ZEDA 4KYSA 1PBQA 1VFDA 3V89B 1QVSA 3THIA 2ZYOA 4EDPA 4QRZA 3VXBA 3TFLA 2QS4A 4YMBA 3JZJA 3WAFA 1B05A 1OVTA 4PP0A 2HQ0A 4ZECA 4ELOA 3FVNA 5I58B 3MVWA 1JW4A 4QHQA 4OFOA 1QUKA 4H0WA 4MFIA 4Z7EA 4GIZA 4QFPA 2REGA 2O1LA 1GVCA 3ZSFA 5FHNA 3EQ1A 4QFNA 2Z8EA 4OEVA 5BUUA 1LAFE 4ONYA 2QS2A 5I84A 4R9GA 4AB5A 1A8EA 2I0BA 4GQOA 1IZ1A 1YAEA 5I59B 1B3GA 1B9JA 3H7MA 2A5TB 3QXMA 1MDP1 1P99A 4F29A 1LAXA 3ECRA 1BLFA 4MF3A 1NH8A 4ZEFA 5I2KB 5FHMA 3MVXA 1L5TA 2VD3A 2XXHA 3G7WA 3TCHA 3AXFA 1NNTA 4OESA 2THIA 2F7AA 1I69A 3ZKKA 3RN8A 1SI1A 5I56B 3W15C 4QFLA 3IORA 4U22A 5AA2A 2DE4A 1B7ZA 2VHAA 1B52A 1TWYA 1FCKA 1JW1A 2FA7A 3FATA 5AA2D 3U93A 3HHGA 2LAOA 2XXPA 3TZAA 2XD3A 3OOAA 4RA1A 1NL5A 5K2YA 3KJ7A 3OENA 4O3AA 2QS3A 2FYIA 2R9JA 5KCJA 4OZ9A 4H1XA 4U1OA 2YLNA 2DWAA 1IXCA 1FQEA 1O63A 1WODA 4C0RA 3M3FA 4JB7A 1OQHA 3MBPA 2ZNUA 2P1SA 4XKRA 4JWXA 2I3VA 3H03A 3U1OA 3SEXA 1H76A 4YKJA 2HAUA 1GR2A 3CG3A 4XKPA 2RC7A 4WEPA 1LAGE 3QAXA 5H8NB 2Z8FA 3SEYA 1FQCA 1XC1A 3CIJA 4OEUA 3MP8A 1EZPA 3W9VA 1JNFA 1N7XA 3S9NC 1MPBA 1N0TA 2Z8DA 1M5FA 4G8MA 2A5SA 1FTOA 4U23A 3HSTA 4X1DA 3SERA 4TOZA 2F8DA 3H6UA 3VV5A 1FQBA 1SDXA 3TKDA 3PGFA 1SW1A 2Q2AA 4NE4A 1FTMA 1D9VA 1MQIA 2RF1A 3UN6A 2W7YA 1RKMA 1IXGA 1JVXA 5KCJB 1O64A 3FXUA 4KR5A 4IGTA 1SVXB 4ZEBA 2V3UA 4ZEIA 3RGYA 5DVIA 4BDMA 4NF5B 3U8QA 1NMUA 4NTLA 4GOTA 4PFUA 3MP1A 5JEIA 5CC2A 2D3IA 1P1UA 1NNPA 4Q8RA 2QMWA 3I3VA 4N6PA 3DP6A 4XKQA 4HW8A 5H8QB 1QKBA 1SI0A 2RCBA 1QUJA 1B4HA 4LUBA 1A40A 1MQHA 4IO7A 3ILUB 2O51A 4YAHX 1QUIA 4Q0CA 2XXUA 3RNNA 2D5WA 2XD2A 1IUDA 4G68B 1NFTA 5JK4A 5JTYA 2DOJA 4C1TA 2F7CA 1AL3A 1DTZA 1IXHA 1PB8A 3IB2A 1A7LA 1DPEA 1UTHB 2UVJA 3OD7A 4POXA 1FTKA 2Q2CA 4GL8A 5TPAB 3K01A 4PQJA 4F3SA 1URGA 4ZEKA 1MY3A 2H5YA 2F6GA 2O6AA 2BJJX 3K00A 1XVYA 4YU0A 2PT2A 4F1YA 5H8FB 2RC8A 4BDNA 5DT6A 3KOTA 1USYH 3S9LC 3DP4A 2B3FA 3O2AA 4U21A 2HAVA 2ZNSA 4ELRA 4EQ9A 2AL4A 4F1VA 1RYXA 3Q28A 4IY5A 3TELA 3IK6B 3CFZA 3OO6A 3FIRA 3SETA 1UIUA 2QJEA 2UYEA 4ZZAA 3HV1A 1VSOA 4IB2A 4XKNA 1Y4CA 4KPTA 2DWIA 2V3QA 1BIYA 3HHFA 1FQAA 1MQDA 3CFLA 5H8HB 1GV8A 1UTBB 1Y3QA 4FATA 4M1VA 4XXUA 3GLBA 5CBSA 4EQ7A 3F11A 1KWHA 5JTYB 5I57B 4KCDA 3DP8A 3FV1A 1IIWA 1DTGA 4TQUQ 4DCXA 3S9MC 5ELVA 1OQGA 2HZLA 4YKIA 4I9DA 3M3LA 3PUVE 3EN3A 5I58A 2XHDA 1VR5A 3C35A 3O9PA 4MLQA 2QPQA 1AH5A 3LUYA 3PMVA 1Y3NA 2Z23A 3W9WA 3KJTA 4R9FA 2M8CA 3TTNA 4YKKA 4OFJA 3BBRA 1B5HA 3B6TA 3K2DA 3S2VA 3VFJA 1OLCA 3KG2A 2I0CA 4RY1A 3EF7A 1MXXA 5I59A 3PMXA 2A5TA 2QL3A 4MLVA 5ITOA 5CI5A 3D4CA 3I6VA 3HPIA 4N07A 2Q89A 4EUOA 1PEBA 3T66A 4KCCA 2D21A 4FECA 3K6VA 4MBPA 4UA8A 4I62A 4F1UA 3FXQA 5EHSA 5I56A 3N5LA 4RXLA 3Q27A 3MQ9A 3FUZA 3GBAA 2ONSA 3GXAA 3E4RA 3LR1A 1US4A 3PPNA 4ESXA 4DZ1A 4LP2B 1ZMGA 3PUXE 3C32A 1LFHA 3K1NA 4P0GA 3PPPA 1I6QA 3PPRA 1IQ7A 1N84A 4OTEA 1EZ9A 1R9QA 3IO4A 4WEDA 4OWDA 1LBCA 4U2RA 5B7DA 2P0SA 3KZGA 2ALUA 4H8JA 3K0VA 2QSXA 2DS9A 3L6GA 4F18A 4OVJA 3CSBA 1URSA 1DOTA 3H6TA 3OELA 1EU8A 2ZYNA 1B3HA 1JEVA 3C31A 1MS7A 3ODBA 1MRPA 4GLIA 4H6DA 1YPNA 4HS7A 5FHOA 2OCUA 3TEPA 3RTWB 1SYIA 5H8NA 3BFTA 3VLVA 3G3FA 2OBGA 3GZGA 1B5IA 3FVOA 3UA8A 3KN3A 3JV9A 1JETA 1CB6A 4C1UA 1Z7NE 3QYTA 1FTLA 3VE1B 3R6UA 5K2XA 2GFEA 3MWBA 3B6WA 5TP9B 2VGQA 2XX8A 4NWCA 3G3GA 3IAZA 3PUWE 3Q26A 5A5XB 4PFTA 4QFKA 1NH7A 3IB0A 5EYFA 1YCJA 3HO7A 1BTJA 1OIBA 1N76A 3TODA 3MVZA 3K6WA 4TLLB 3SESA 1F9BA 3K1MA 4O3BA 4YMAA 1MXWA 3A3CA 4H8IA 4G4PA 2Y7WA 1M5EA 4FIMA 1H45A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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