2Q2CA

Crystal structures of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein artj from the thermophilic bacterium geobacillus stearothermophilus
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
KKVVVGTDAAFAPFEYMQKGKIVGFDVDLLDAVMKAAGLDYELKNIGWDPLFASLQSKEVDMGISGITITDERKQSYDFSDPYFEATQVILVKQGSPVKNALDLKGKTIGVQNATTGQEAAEKLFGKGPHIKKFETTVVAIMELLNGGVDAVITDNAVANEYVKNNPNKKLQVIEDPKNFASEYYGMIFPKNSELKAKVDEALKNVINSGKYTEIYKKWFGKEPKLDRLKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Geobacillus stearothermophilus
publication title Crystal structures and mutational analysis of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein ArtJ from Geobacillus stearothermophilus. Implications for interactions of ArtJ with its cognate ATP-binding cassette transporter, Art(MP)2
pubmed doi rcsb
molecule keywords ArtJ
total genus 74
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2q2cA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2q2cA02
2H25A 2XXTA 4ZE9A 4ELPA 4JSOA 5JK4A 1LFGA 2ABHA 3EHUA 2I3WA 3FVOA 3F11A 1MXYA 1UQWA 3VFJA 4N13A 1OMPA 3IB2A 3O6HA 1R9QA 1LCTA 1B3EA 1I6BA 4F2QA 5EHSA 2VP1A 4LQ2A 3S9NC 2H5YA 1JW1A 4LQ5A 3K4UA 1Z7NE 2NWJA 5I58A 4MFIA 4RNSA 5AA2D 3FASA 3H03A 1FQBA 4RYAA 4RY1A 4NE4A 4LONB 5AA1A 3TMGA 1MQJA 2HQ0A 3OSRA 3OENA 1FQEA 5CRYA 3MUQA 1NFTA 2O6AA 2YJPA 1B52A 1LFIA 3UIFA 4X1DA 2UYFA 3HO7A 2ANJA 3ODBA 4EQ9A 3G3IA 1TFDA 4YKPA 4G68B 1HSLA 1XVXA 2F35A 2OJTA 3PMXA 5FHNA 4Z7EA 2I48A 1IIWA 4ZS9A 1BLFA 3MAMA 4LP2B 3IJXB 3N5LA 4O3AA 2F7BA 4DCYA 1N04A 4OVJA 2F36A 5H8NB 3VXBA 1NH8A 2Q2CA 3ZKKA 3O29A 1UTHA 3TKDA 1ZU0A 4R72A 1URSA 3TQWA 2X7PA 2DE2A 3SEVA 5I57B 4KHZE 4F3SA 5H8FB 2XXUA 3H6UA 1B3FA 2PYYA 3OO8A 1POY1 5I2NA 1AIVA 3EF7A 3HHGA 1SI1A 4OERA 1VFEA 3WAEA 4GD5A 3PMWA 2I3VA 4MBPA 2D3IA 3KFMA 1JVXA 3H3GA 2V93A 1NNTA 3SESA 2I0CA 3KEIA 2Q89A 3DP4A 4H67A 3TCGA 3G3GA 1Y3QA 4IO7A 3PPOA 5JTYA 1MG1A 3LSFB 1B3HA 1LSTA 5TPAB 3FXUA 4XKRA 4IO2A 4R73A 3T9XB 1Y4TA 2Y7WA 4H65A 1XS5A 2DS9A 2I49A 1VFDA 3C9HA 1OVTA 2RKMA 1H3DA 4LZ5A 3IK6B 4HCYA 3RUMA 4QFPA 1B1HA 4NF5B 3P7IA 1QKBA 1AMFA 5AA4A 5CMCA 4U2RA 4ZZAA 4YB6A 2ALUA 1F9BA 5DVJA 4OHNA 3M8UA 3TFLA 1N3WA 2PBWA 1MRPA 5FTIA 2Q9TA 3K01A 4EF1A 2OZZA 1POTA 4F39A 2ZYMA 1NNKA 3TTMA 1AOVA 4GXAA 3FIRA 3KOSA 3FXQA 3C33A 3TELA 4F2OA 3QXMA 2QJEA 4NF8B 3UN6A 1B0LA 3I5OA 4BLAA 1LB8A 5AA2B 4HTGA 3CIJA 1P1WA 4EDPA 1JVYA 4ESWA 2UXAA 1S7YA 5KZTA 4IY5A 1S50A 2OLBA 3FVNA 1CE2A 3U92A 5I2KA 1N3XA 3MVXA 4TLMB 4EXLA 1GR2A 2HAUA 2V25A 1LB9A 1H44A 3HSTA 3S9EA 3TAJA 2HZKA 4YAHX 3T93B 3LBSA 4OFJA 2DWJA 1B1XA 1A55A 2F7CA 1QW0A 3G7WA 4KYEA 3FGSA 1R1NA 1S9TA 1IXCA 1LBCA 1LLSA 3IJOB 2DWIA 3OD7A 3MJNA 2H4IA 3PUZE 4F22A 3FXRA 4K3FA 1D9YA 4EQBA 3K6VA 4F1VA 4NF6A 1Q35A 4IY6A 5CMBA 3FD3A 3L6HA 1MH4A 1H76A 4F1YA 3K6WA 1SBPA 4IGTA 3B6WA 3H4ZA 3LC8A 3TDJA 1JEUA 4O3BA 5CC2A 3MVWA 3RLFE 5DTBA 2FYIA 2OBGA 1O63A 4RA1A 3N6UA 5H8QB 4F3PA 4NWCA 4GIZA 1FTMA 3A3CA 4H5FA 3IO4A 3PMVA 4R2FA 4HW8A 2QS2A 4GWOA 3JV9A 3SERA 1DPEA 1URGA 3TTRA 3PU5A 5L8DA 3RT8A 2NUVA 4GL8A 3S2VA 4QF9A 3T66A 3EN3A 3CG3A 1PBPA 3DELB 4YU0A 2AIXA 4QSEA 4KD5A 1FTKA 4U1OA 4JWYA 3V83A 2W7YA 5HM4B 1SDXA 4JB7A 4QFOA 4QFLA 3WAFA 4H1XA 1OIBA 3IOTA 1DPPA 4NEDA 3A09A 2Z22A 2THIA 1B5JA 1EU8A 4ONYA 4PFUA 4BDNA 5HPQA 2UVJA 3PPRA 5A5XB 1Y9UA 3K1PA 4Q30B 2RC7A 3VE1B 4DIGA 2H99A 5H8HB 2GFEA 1J1NA 1JNFA 1IXHA 2F7AA 3GXAA 3USDA 3G3FA 4ZEIA 1LCFA 4LZ8A 3HHFA 2F6GA 3CVGA 4WKMA 3RY3A 4E0XA 3PPPA 5FHOA 4JXIA 5HBCA 4R9FA 1B7UA 4OFOA 3K0VA 2QL3A 3C35A 5TP9B 4IO4A 1PC3A 3IB0A 2XX7A 2QRYA 2XHDA 3MP1A 2D5WA 2XD2A 4OYVA 1IZ1A 2B65A 3U93A 5KCJB 1YCJA 2QMXA 2DYXA 3CFLA 4G68A 2AL5A 4G4PA 4F18A 4F1UA 3PUVE 2XX8A 2ZYNA 4XKQA 1MQGA 1A40A 3M3FA 4PETA 3VVEA 1VE4A 3OO6A 3GBBA 3U1OA 4H6DA 2NVUB 3T9HB 2ONSA 5H8NA 3UORA 2V3TA 5DVFA 1USYE 2REJA 2B3FA 4LZ7A 4OETA 2Z8FA 4YKKA 5F7VA 3N6TA 3E9XA 1B32A 3O6GA 2ZNSA 2DE4A 3OELA 1UTBB 4R9GA 2GHAA 4GLIA 3E4RA 3TEPA 1ATGA 4FJPA 3VVDA 5H8FA 3KSJA 1QUIA 4M1VA 4H8IA 1I6AA 2G93A 3MW0A 2O7IA 1FTJA 1HSJA 1YAEA 5ICTA 2O1MA 1M5DA 2E0SA 1SW1A 1FTLA 1MDQA 3FATA 3G3JA 3C4MA 1M5EA 3VV5A 1A7LA 1LGBC 4H8JA 4XIGQ 4FORA 3Q28A 1SD3A 1ZIUA 2XXYA 4GL0A 3PV0E 3QSLA 4Q0CA 1Z7ME 1B40A 4ZDMA 5IAIA 3EHTA 4G68C 5CM6A 5DYHA 2DWHA 3M3KA 3RGYA 5KDTB 4YICA 1LFHA 3V89B 3SEWA 4RXLA 3MP8A 1TXFA 2R6GE 2Q88A 4QSCA 4Z0IA 4N07A 4LVQA 3FJMA 4U22A 1IXGA 5I58B 3VXCA 4X1BA 1OLCA 3FUZA 3IOUA 3KZGA 3O6IA 5IKBA 1USYH 3DM0A 2HAVA 4OENA 2XXPA 2Z8EA 2QS4A 4O3CA 1MPDA 4NF8A 4GRKA 1B5HA 3O66A 2DXRA 2XXWA 4L17A 4OTEA 3CSBA 1MXZA 4F19A 1LAFE 2GHBA 4GQOA 1MM7A 3ZKLA 3H6TA 3OOAA 5K2XA 3AXFA 3H06B 1VR5A 2QPQA 3KJ7A 1PB9A 5FTHA 1B51A 4G77A 3FVGA 2LAOA 2OK2A 3ZS6A 1QUKA 3RQTA 3FJ7A 3SETA 1IXIA 1SW4A 4F29A 1MDP1 4OEVA 1MXXA 2RC9A 3VLWA 3CI8A 3DLNA 1M5FA 1IEJA 4LUBA 4PFWA 1RYXA 3IB1A 4DLDA 2I6EA 3U72A 3MVZA 3RN8A 3DP6A 2GH9A 3THIA 2XXIA 3KN8A 1PDAA 3C31A 1DTZA 3JZJA 3IO6A 1JEVA 3H6WA 1N0TA 4FEDA 3OEKA 2QS1A 5K2YA 1D4NA 2V84A 3LSWA 3K6XA 3L6GA 1GGGA 1NH7A 3SEYA 3N94A 4KYSA 1VSOA 3MPKA 3SEXA 5L9SA 3UGWA 4ND9A 4RK9A 5JTYB 3CFXA 3KG2A 5H8QA 3E3KA 4C0RA 2X26A 1P99A 3T22A 1DOTA 3CSGA 1LAHE 4OFLA 4I9DA 4I62A 3R26A 3K02A 3VVFA 4FAJA 4ZECA 2O69A 2A5SA 3SDFA 1BIYA 3KN3A 5DEXB 3S9MC 1WDNA 3KOTA 1XVYA 4GF8A 4Q5TA 2QMWA 4IO5A 1MY1A 1RKMA 3HCQA 2E1SA 1HSEA 1GVCA 2XXHA 1MH3A 2Z23A 1PB7A 2Y7PA 1B9JA 4YZZA 3CFZA 2Q8JA 1B0HA 2Q2AA 4OMBA 1TT1A 3FJGA 2HEUA 3CG1A 4GOTA 1OVBA 3MWBA 3KJTA 4JWOA 5ELVA 5H8HA 3BBRA 4R74A 3IOVA 4R6KA 5L9OA 3QUJA 4H5GA 3U8QA 4PFTA 5I84A 1R6ZA 3HV1A 4U21A 2DXYA 2R71A 4EF2A 5I56B 4IB2A 5I2KB 3V5AA 4EUOA 5F1QA 2KLFA 3LR1A 4POXA 1SYHA 1NNPA 4FECA 1B2HA 3IORA 4KI0E 1FQAA 4EXKA 2DVZA 4JDFA 2I0BA 1Y1ZA 1L5TA 1B6HA 3QYTA 5EHMA 1XT8A 4YMBA 1SVXB 5TP9A 1QULA 3PUXE 4AB5A 4ISUA 4KYDA 3TCFA 1NL5A 1ZTYA 5KCJA 3MZBA 2P0SA 2HZLA 4UA8A 5LOMA 2P1SA 4DXUA 2PMSA 4F3GA 4NF6B 2A5TB 2I58A 3Q27A 1ANFA 2DQVA 1NMUA 4P11A 1YTVA 4BDQA 5I59B 1QJMA 4BDRA 1BKAA 3ZSFA 5AA3A 3R7XA 1OQHA 1N7WA 2ZMBA 2RF1A 3D4CA 1DMBA 1SYIA 5CBSA 2X7QA 1WVJA 3VDFA 4XTCQ 4NF4B 4C1TA 1O64A 5CI5A 2ESNA 3B6QA 2I4BA 1B58A 3C32A 4F31B 5CMMA 1QVSA 2O1LA 1TWYA 3IL1B 4N6PA 1LAXA 1URDA 2ZNTA 2PT2A 3OO9A 3TUSA 5J1DA 1Y3NA 4KCCA 4WEDA 3GLBA 2ZYKA 1P1OA 1BTJA 2XXXA 4AB6A 4U1ZA 2REGA 3KN7A 3N26A 3SEUA 2QSXA 4G8HA 3BFTA 2NXOA 1Y20A 1QUJA 3QAXA 2O84X 1MM6A 5EYFA 2Y7IA 1Y4CA 3PUWE 3C36A 1IQ7A 3K00A 2IA4A 2OWTA 4OQOA 4R2BA 4KCDA 1MQIA 2O51A 1MPCA 3ONMA 1DTGA 4GVOA 1GTKA 4R6HA 3EHSA 5KDTA 2BJJX 3MC2A 2FA7A 3HPIA 3K2DA 4KQPA 1NNFA 1SQYA 1B05A 4XKNA 5I57A 4F3BA 2AL4A 1MXWA 3TQLA 1MY3A 4X9TA 5ITPA 3W15C 1Y3PA 4ZEFA 1EH3A 3EQ1A 2F78A 3G3KA 2DE3A 3E13X 1AH5A 3UK4A 2UVGA 3GZGA 1EZ9A 3ILTB 1MQDA 2H98A 4MLQA 4POWA 4PE5B 2HCAA 2RC8A 4ZZEA 3K6UA 1SI0A 5TPAA 1ELJA 3ILUB 4C1UA 3KSXA 2RINA 2FNCA 1KWHA 1R9LA 3TYHA 3M3LA 2P2AA 3C34A 3TCHA 3CR9A 3CRBA 2DWAA 1I69A 4TQUQ 1H45A 3UP9A 1B46A 4NF5A 4PQJA 5FHMA 1P1UA 2D21A 2VD2A 4KPTA 1B7ZA 4R6YA 1IITA 4YKIA 1MQHA 5L9MA 1XOCA 4ZEKA 3BKIB 4TOZA 3UA8A 1D3KA 2PT1A 4M4GA 1GV8A 3I6VA 4XKPA 4THIA 4BDOA 1FCKA 1N84A 3B6TA 3MVYA 3R6UA 3KGCA 1XHYA 4ELOA 2R9JA 5AA2A 4NTLA 4HS7A 2UVHA 1OQGA 1PEBA 1EZOA 1JW4A 4U4XA 2YPNA 4NWDA 4MH5A 1ZBMA 2Y84A 2Y7KA 4RPNA 4ZE8A 5BUUA 4JBZA 2F97A 1B3GA 3PUYE 3TTLA 1P1QA 4KR5A 1DSNA 2XXRA 4OESA 2ONKE 4ELQA 1JW5A 2O68A 4PP0A 3H6VA 1MY2A 4YB5A 2XX9A 4G2ZA 5TU0A 4WEPA 1PB8A 5DVIA 1UTHB 2NOOA 3Q25A 4IO3A 4PFYA 4QRZA 2RCAA 3V8XB 3Q29A 1MY0A 5DEXA 4ZEBA 2PVUA 3O28A 3IAZA 4DZ1A 4FEBA 3IOWA 4P0GA 4QFKA 3K1MA 5I2NB 3TZAA 4JWXA 3D4GA 4P0IA 2I4CA 2CZLA 1JQFA 1B7HA 2XXVA 1M5CA 1ZMGA 2WKYA 2DVCA 4DCXA 3O9PA 4NMYA 2ZYOA 3S4UA 5BWJA 2F34A 3TTKA 3MBPA 1B4ZA 4FE8A 5M2VA 1LAGE 1JETA 1PBQA 1US5A 2YLNA 2G29A 2F8DA 4IGRA 3PPQA 1FQCA 4XXUA 1LBBA 1Y1MA 5CMKA 5ITOA 5I56A 4OZ9A 3RTWB 1MXUA 4GXSB 3TODA 3T9VA 4DXBA 1Q1KA 3ECRA 3W9VA 3T96B 4WXJA 3JYRA 4OXVA 2DOJA 5AA4B 1ZKBA 1AL3A 1MXVA 5DT6A 1MY4A 3S9LC 2Y7RA 4I8CA 1WODA 4MLVA 3O2AA 3QIMA 4U23A 2F5XA 4RK2A 1A54A 3GBAA 3MQ9A 3RTFB 2H9BA 3IX1A 3KBRA 3PD8A 2DP8A 1A99A 1ZJLA 3IR1A 1FTOA 4RJZA 2VOZA 1MPBA 3VLUA 1O7TA 4ECFA 1B5IA 5A5XA 2A5TA 2Z8DA 3OEMA 3W9WA 4UACA 4EQ7A 2PX1A 1N76A 2ZXTA 3RPWA 4ESXA 3TTNA 4G8MA 3OSQA 3VLVA 1OLAA 4YKJA 2VGQA 1B3LA 2ONRA 3H7MA 5I59A 4YMAA 5ISUA 2CMOA 1BP5A 1T0KA 1H43A 3LSLA 2M8CA 2QS3A 3PPNA 3RNNA 2OWSA 1SW2A 2HFBA 4IO6A 3FZVA 4YB7A 2XXQA 1CB6A 4NF4A 4X48A 4LATA 2VD3A 2AYSA 3MZ9A 3PD9A 3MP6A 4E0WA 4OEUA 3Q26A 4KFQA 3A3UA 5B7DA 4QFNA 1A8EA 3G3HA 3PGFA 1N7XA 5ICQA 1FW0A 3MZ1A 4QSDA 2V3UA 3HN0A 2UVIA 3OMBA 4BDMA 3T9UA 4DE8A 3OO7A 4OWDA 3K1NA 4BDLA 5AE4A 1MS7A 1US4A 3SKPA 4FATA 3TPAA 4R75A 2IEEA 3EPEA 1IUDA 3QK6A 4I1DA 3OXNA 3BFUA 4LA9A 3U94A 3MPLA 2HXWA 5B70A 4Q8RA 4RPOA 1UIUA 1UIVA 4HCWA 1YPNA 3LUYA 1I6QA 1TFAA 1ZLQA 3B7DA 2OCUA 1SW5A 1UTBA 1D9VA 2XD3A 3FV2A 1FQDA 2V3QA 4ELRA 1M5BA 4DXCA 5H8SA 2VHAA 3I3VA 3FV1A 2UYEA 1FQFA 1NKXA 3DP8A 2B3BA 1RYOA 1P1NA 1QKAA 4H0WA 4U4SA 4FIMA 2O7UA 2F6PA 4TLLB 3LSXA 1A8FA 1XC1A 2RCBA 3FVKA 3QUFA 4G8NA 4QHQA 1II5A 5CBRA 4JSDA 2ZNUA 4DDDA 2GRVA 2DSFA 1EZPA 3RT6B 4MF3A 4GFRA 5JEIA 1B4HA 3O97A 4AQ4A 4ZEDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2H25A 2XXTA 4P9KA 4ZE9A 4ELPA 4JSOA 5JK4A 1LFGA 2ABHA 3EHUA 2I3WA 2BJIA 3FVOA 5EYGA 3F11A 1MXYA 1UQWA 3VFJA 4PAFA 4N13A 1OMPA 3IB2A 3O6HA 1R9QA 1LCTA 3NOHA 1B3EA 1I6BA 4OVRA 4F2QA 3BIGA 5EHSA 2VP1A 4LQ2A 3S9NC 2H5YA 1JW1A 4LQ5A 3K4UA 1Z7NE 2NWJA 5I58A 4MFIA 4RNSA 5AA2D 3FASA 3H03A 1FQBA 4RYAA 4RY1A 4NE4A 4LONB 5AA1A 3TMGA 1MQJA 2HQ0A 3OSRA 3OENA 3RPLB 2P3VA 1FQEA 3E78A 5CRYA 3MUQA 1FPFA 1NFTA 2O6AA 1DBZA 4N6KA 3PTYA 2YJPA 1B52A 1LFIA 3UIFA 4X1DA 2UYFA 3HO7A 2ANJA 3ODBA 4EQ9A 3G3IA 1TFDA 4YKPA 1YXIA 4G68B 2QFLA 4OVQA 1HSLA 1XVXA 2F35A 3SZPA 2OJTA 3PMXA 5FHNA 4Z7EA 2I48A 1IIWA 4ZS9A 1BLFA 3MAMA 4LP2B 2WEFA 3IJXB 2Y5KA 3N5LA 4I3EA 4O3AA 2F7BA 4DCYA 1NUZA 1N04A 4OVJA 2F36A 5H8NB 3VXBA 1NH8A 2Q2CA 3ZKKA 3O29A 1UTHA 3TKDA 4N8YA 1ZU0A 5I3SA 4R72A 1URSA 3TQWA 2X7PA 3IFAA 5DW8A 2DE2A 3SEVA 3QMFA 5I57B 4KHZE 4F3SA 2XXUA 3H6UA 5H8FB 1B3FA 2PYYA 3OO8A 1POY1 5I2NA 4X8RA 1AIVA 2OWZA 3EF7A 3E79A 3HHGA 1SI1A 1FBFA 4OERA 1G0IA 5EQ8A 1VFEA 3WAEA 4GD5A 3PMWA 2I3VA 4MBPA 2D3IA 3KFMA 1JVXA 1YYZA 4N4UA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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