3FVOA

Crystal structure of the human glutamate receptor, glur5, ligand-binding core in complex with 8-epi-neodysiherbaine a in space group p1
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
publication title Crystal Structures of Human GluR5 Ligand-Binding Core in Complexes with Novel Marine-Derived Toxins, Dysiherbaine and Neodysiherbaine A, and Their Analogues
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvoA02
2THIA 3CSGA 1FTOA 2F7CA 5KDTB 4F3SA 3VXCA 3WAEA 4U1ZA 1PB8A 4ECFA 1FQFA 3PV0E 2XXTA 2O6AA 2XXPA 3SETA 2QRYA 4F1UA 5AA2B 4GXSB 3TYHA 3MP1A 3UK4A 1Y1MA 4RNSA 3ZS6A 4ND9A 2V93A 4QFPA 4RY1A 4Z7EA 4QF9A 2PMSA 3MC2A 3K0VA 3OSQA 2Q2CA 4GOTA 4EXKA 2O1MA 1A99A 4H5GA 3E4RA 3SEUA 5DEXA 1JVXA 4YMAA 5ISUA 4F22A 4JDFA 1CB6A 4N6PA 2UVGA 4R9FA 4X1DA 4G68A 3EF7A 1A55A 3TTLA 4WEPA 5AA1A 2DS9A 5ITOA 4FE8A 1RYXA 3MW0A 3I5OA 1MRPA 3T66A 1SDXA 3G3HA 4IO2A 4THIA 1US5A 1SW5A 4WKMA 4ELOA 4PFUA 1DSNA 3O97A 1B3HA 2DXYA 4NEDA 1MH3A 2VHAA 1BTJA 2ZMBA 1MXZA 4IO7A 3TCFA 2RC7A 1B0LA 2F6GA 1O7TA 3LSLA 2F8DA 3H06B 2F6PA 4GIZA 5IAIA 4H0WA 1II5A 3OD7A 5KDTA 2RINA 3UGWA 5F7VA 4RXLA 4U1OA 4RYAA 3Q27A 1WODA 3MPLA 1FQAA 2F5XA 1XVXA 3BFUA 5AA2A 4F1YA 4ESWA 3FGSA 4BDOA 1Y4TA 3H3GA 2O1LA 3A3UA 3IB1A 4LP2B 1MG1A 3MVZA 4G8NA 5JTYA 1QUKA 1XHYA 4P0GA 4NF6B 2O51A 1AIVA 1P1NA 3CI8A 4GL8A 1QW0A 1M5CA 5IKBA 4G77A 2HEUA 4KYEA 4I8CA 4XKRA 5FHNA 1HSLA 4RK9A 3V83A 3S4UA 2CZLA 1FQEA 3SKPA 4ZEDA 1WDNA 3O29A 4OHNA 2D3IA 3FIRA 5L9SA 2ALUA 1H76A 4Q30B 4ZEBA 3EHUA 2F97A 3QUFA 4H6DA 3FVGA 2DXRA 4YMBA 4XIGQ 1M5FA 2UVJA 4POWA 3Q29A 4EDPA 1H45A 4OVJA 4ELPA 3OENA 3RTWB 3BKIB 3DELB 4R75A 3K1NA 4QHQA 5FHOA 1VFEA 5DVFA 2I58A 3PPPA 3T9VA 2HZKA 1LAFE 3O66A 4ELQA 2NOOA 1DOTA 1J1NA 1BP5A 4PETA 1JW4A 3M3LA 4ZEFA 4F2QA 1Y3PA 1B51A 1MQGA 2DE4A 3FUZA 1I6BA 4MLQA 2V3TA 1JEUA 1OIBA 5CC2A 2H99A 2FNCA 3FV1A 3OSRA 3DLNA 3E13X 1N3XA 2XHDA 1B7HA 3E9XA 4HW8A 1NL5A 4YB7A 1DTGA 1M5BA 1I6AA 4LUBA 1P1WA 3MZBA 2UXAA 3OEKA 5H8QB 1EZPA 3MVWA 3B7DA 5I58B 1LGBC 1RKMA 3S9EA 4YB5A 2DOJA 1N04A 5L8DA 1CE2A 3N5LA 2XXHA 1USYE 3K6UA 3RT6B 1Y20A 4R6KA 4IO5A 4P0IA 1FTLA 2F34A 3JV9A 1VSOA 3K6WA 2DWAA 1B1HA 1Q1KA 3KG2A 3UIFA 1IZ1A 4FEDA 3FJGA 3ECRA 4C1UA 3TCGA 4KI0E 3QK6A 3H6TA 4IGTA 4OQOA 4YICA 4G68C 2XXVA 5FTHA 5TU0A 1B05A 3L6HA 3IORA 1FQBA 1MPCA 4C1TA 3THIA 3W9WA 1N3WA 2ZNTA 3V8XB 1B40A 2HFBA 1FQDA 4NF5B 2ONRA 1Q35A 3N26A 4HTGA 3WAFA 3OOAA 3SDFA 4G8HA 3H6VA 2XXRA 4KD5A 3GLBA 5I2NA 4OFOA 5A5XB 3VLUA 3C33A 1B46A 2Y7PA 5K2YA 4H67A 1A40A 5F1QA 2ESNA 1OMPA 2O84X 3P7IA 2Q9TA 2RKMA 1XT8A 4QSDA 3PPQA 5HBCA 5H8NB 5H8QA 3C32A 1OLCA 5I58A 3PMWA 4LQ2A 1EZOA 1MXUA 1PBPA 4BDRA 4GF8A 2QS2A 3TCHA 4M4GA 2W7YA 3OO6A 2PX1A 1AL3A 3M3KA 1LLSA 1H3DA 3OMBA 3TTNA 1D3KA 1D9VA 2X7PA 1ZKBA 2QMXA 3S9LC 4ISUA 2B3BA 1MPBA 5EYFA 1QVSA 1GVCA 3PU5A 4LZ7A 1XS5A 4IO6A 5HPQA 4U4SA 2VD2A 1SVXB 2NXOA 3FJMA 4UACA 1Y1ZA 3U72A 3KN7A 1SI1A 4JBZA 2X26A 4KR5A 1D9YA 1LB9A 1POTA 4YZZA 3KN8A 4Q8RA 3N6TA 1PEBA 1OVBA 4NF5A 2RCBA 5AE4A 3LC8A 4RA1A 1NKXA 1EZ9A 3EN3A 5H8SA 1B1XA 3B6QA 3FVNA 3TPAA 4AB6A 5KCJB 1MXYA 4EQBA 3PGFA 3USDA 1MM7A 4F3GA 3EPEA 5H8FB 1NNFA 3QYTA 3MUQA 2R6GE 5ITPA 3O9PA 3TDJA 3AXFA 3FD3A 5A5XA 1PB7A 2DYXA 2HZLA 4F3PA 4U21A 4K3FA 3MWBA 1TXFA 3ZKLA 1R9LA 4KQPA 4I1DA 3U93A 1YAEA 1URDA 3ODBA 4F18A 5H8NA 5JEIA 3OEMA 2HCAA 4TOZA 5BUUA 1IUDA 2V25A 5I2KB 4BDMA 2H5YA 2XX7A 4P11A 4OERA 1M5EA 1JEVA 3FATA 1XVYA 5JTYB 1JQFA 3TEPA 1A7LA 3CR9A 1MQDA 3VFJA 3TTMA 3W9VA 4DXBA 4LATA 3IB2A 3C36A 3K6XA 5CMKA 1GTKA 3D4GA 3O6IA 2NVUB 4BDNA 3TAJA 1SI0A 2AIXA 1IXHA 3EHSA 4G2ZA 3OO9A 3G3FA 1LB8A 2XD2A 3HHFA 3O6GA 4OEVA 4HCWA 1NH8A 4E0XA 3KZGA 4O3AA 4KYDA 4OMBA 3QAXA 1A8FA 3Q28A 4YKKA 2YPNA 2V3QA 2ZNUA 4F29A 3TUSA 2HXWA 3LSWA 5H8HB 5KCJA 3IK6B 4JB7A 1FTMA 3KFMA 5H8FA 1FW0A 3ONMA 3VXBA 2ONSA 3IOUA 1D4NA 1MY4A 4MFIA 1LBBA 3JZJA 3MBPA 2XXWA 2H25A 2QS1A 4R74A 3D4CA 3FXQA 4EQ9A 3KEIA 1FTJA 2OWTA 2ZYNA 3E3KA 4H8IA 3T93B 2BJJX 1NNTA 2YLNA 3G3KA 4XTCQ 4BLAA 3PD8A 5I2KA 4GL0A 4H8JA 1QKAA 2I4BA 5CMCA 1N84A 2Y7RA 3DM0A 2QSXA 2QL3A 4YB6A 1TFDA 3FXRA 3N94A 4XKQA 1ZU0A 1L5TA 1P1OA 3U94A 1R9QA 1R1NA 3K02A 3T22A 3QIMA 1LFIA 1IXGA 4R6HA 1VR5A 3JYRA 1SW2A 3TFLA 4XKNA 3EQ1A 3G7WA 1IQ7A 3FVKA 3I3VA 4TLLB 1ELJA 2XXYA 4YKIA 4F2OA 3KBRA 2E0SA 4O3CA 4U22A 4DZ1A 4R73A 4BDLA 1N7XA 3TQLA 4ZDMA 3QUJA 1DTZA 5H8HA 2F7BA 5M2VA 4N07A 3TQWA 5EHMA 3ZSFA 3TZAA 3SESA 4BDQA 4ESXA 1QUIA 3FZVA 1FQCA 1TWYA 4TQUQ 4IO4A 4RPOA 5I2NB 3RTFB 3OELA 4R6YA 2B65A 3HSTA 2Z22A 4JSOA 3S9MC 5CBSA 2RCAA 3G3IA 1DPEA 3R7XA 4FATA 4ZECA 4RJZA 3CRBA 3PPOA 3QXMA 3TTKA 5I57B 3MVXA 3PPNA 3G3JA 2Q2AA 3SEWA 3SEYA 1LSTA 2RC8A 3LR1A 2Z8EA 3T9HB 2Q89A 1ATGA 3KJ7A 2VGQA 3C9HA 4JXIA 2IEEA 4QFNA 1XC1A 4JWYA 2O7UA 3T9XB 4C0RA 3IJOB 1MH4A 4G8MA 4QFOA 1NNPA 5JK4A 1Z7NE 4ZE8A 1EH3A 2P1SA 3IO6A 2HQ0A 3M3FA 1IEJA 4DLDA 1ZMGA 4EF2A 1S9TA 4HCYA 1HSJA 3PMXA 1LFGA 3R26A 4NMYA 3IAZA 4H5FA 4ZEKA 1HSEA 3RY3A 4FAJA 4QFLA 3RT8A 4DXUA 5CMBA 2DE2A 4GLIA 4R72A 4QSCA 1USYH 1B7UA 3IJXB 3G3GA 4Z0IA 3TODA 3GXAA 1QUJA 1B52A 3H4ZA 2XXIA 4YKJA 3B6TA 4OENA 1LFHA 3VVEA 5I56B 2A5SA 2DWIA 3HV1A 2Q8JA 3RNNA 2Z8DA 1LCTA 5TP9B 3IOVA 3IOWA 4GRKA 4LVQA 3A3CA 1ZIUA 1DPPA 4OTEA 4ELRA 3CG1A 3MZ1A 1ZLQA 4KCCA 5I57A 4ZE9A 4WEDA 1O64A 4PE5B 1LCFA 1QKBA 1B5HA 1BIYA 1MXVA 5CRYA 4R2FA 1O63A 4H65A 3UORA 2RC9A 3PUWE 1B58A 1B2HA 3S9NC 4ZS9A 4IY5A 1JW1A 1B3GA 1Y9UA 1MY1A 3PD9A 2F36A 4DCYA 1M5DA 3ZKKA 3I6VA 2FYIA 2XX8A 1EU8A 4EQ7A 4M1VA 3DP8A 5DT6A 2R71A 5CI5A 1RYOA 1UTHA 5CBRA 2UVIA 1YPNA 4POXA 2ABHA 1AMFA 2Z8FA 4QSEA 2I0CA 3U8QA 1SQYA 1UIUA 5ICTA 4OFJA 1TT1A 2RF1A 5ICQA 1IXIA 4MF3A 5DTBA 4IB2A 1MPDA 4DDDA 3MZ9A 1MS7A 4U4XA 2HAUA 3KJTA 1H44A 4FECA 3RQTA 3IX1A 3IL1B 1P1UA 2GFEA 3CG3A 4O3BA 1P99A 2Y7WA 4KCDA 3SERA 5I56A 2AL5A 3F11A 1BKAA 4OXVA 4GWOA 1N0TA 5TP9A 1MM6A 4EF1A 3MP6A 3VV5A 1IXCA 1SW4A 3CIJA 3HHGA 3K1MA 2GH9A 1B4ZA 2OWSA 3LSXA 1NH7A 2REGA 3H7MA 1QJMA 2XXQA 4U23A 1B32A 2I4CA 1H43A 1AH5A 1P1QA 1JVYA 4IGRA 1MY0A 2A5TB 4GD5A 4PFWA 3HCQA 1S50A 1FTKA 1URGA 3IOTA 2B3FA 3PPRA 2NWJA 2PT2A 2X7QA 2P0SA 2HAVA 2XD3A 3MP8A 1SYHA 2OZZA 4KHZE 4RK2A 4ONYA 5CM6A 2XXUA 4PFTA 1A54A 2QPQA 1OLAA 4OWDA 1MQHA 2PT1A 3HO7A 3IO4A 1UQWA 3FASA 3VVFA 3KN3A 2PYYA 1MXXA 1SBPA 1GR2A 3SEXA 3C31A 2Z23A 2NUVA 2QJEA 2QS3A 3MVYA 1US4A 3C4MA 3VLWA 4MLVA 2Q88A 1SD3A 3DP4A 3V5AA 4OZ9A 1B7ZA 2O7IA 1PC3A 3K00A 3TTRA 4DXCA 4MBPA 4F39A 3RPWA 2H98A 4Q5TA 1B6HA 5TPAA 3K2DA 4DIGA 5L9MA 3T96B 1N76A 1IIWA 3KOSA 2VP1A 1PB9A 3BFTA 4QRZA 5AA4B 4YU0A 4E0WA 3VVDA 2DWJA 1OQGA 4LZ8A 3LSFB 1BLFA 1SW1A 2H4IA 4HS7A 3SEVA 3CFZA 4NTLA 4G4PA 2F35A 4JWOA 5DVIA 3IB0A 2AYSA 1Y4CA 1MY3A 1XOCA 3KSJA 1B3LA 2A5TA 2XXXA 2ZXTA 4GXAA 1URSA 1AOVA 2PBWA 2GRVA 5FTIA 4R2BA 3T9UA 2DE3A 3KSXA 5DVJA 2Y7IA 5FHMA 1B0HA 1I69A 4TLMB 4XXUA 1GGGA 1MDP1 2UYEA 3KOTA 3PMVA 3H03A 3V89B 4ZZEA 3GBAA 1MXWA 2I6EA 3UP9A 3MPKA 4X48A 3RUMA 2DQVA 2I3WA 5B7DA 3S2VA 3O6HA 4FEBA 3RN8A 4PQJA 1B4HA 1F9BA 2UVHA 2ZNSA 4KPTA 4RPNA 5AA3A 1YTVA 4OETA 1IITA 4XKPA 2V84A 4GVOA 4UA8A 3RGYA 4KFQA 2ZYKA 1KWHA 4FORA 4IY6A 2D21A 5AA4A 1B9JA 2CMOA 3GBBA 3W15C 3H6WA 4N13A 1LBCA 4LA9A 3C35A 2E1SA 5K2XA 1LAGE 2FA7A 2Y84A 3QSLA 2IA4A 2UYFA 5CMMA 2OLBA 2I49A 1ZJLA 3C34A 3Q25A 1N7WA 4IO3A 5AA2D 2I0BA 2GHBA 1JW5A 5KZTA 3OXNA 4AQ4A 2M8CA 2QS4A 3CFXA 1Y3NA 1OQHA 2VOZA 3LBSA 3CSBA 3O28A 1JETA 3FJ7A 4EUOA 1MQIA 3MQ9A 3OO8A 4NF6A 1B3EA 3UA8A 4F1VA 1GV8A 1TFAA 2P2AA 5I84A 1VE4A 4X1BA 3BBRA 4LQ5A 3O2AA 5DYHA 2ZYOA 1UTHB 5I59B 2KLFA 1UTBB 4KYSA 1A8EA 3OO7A 3EHTA 4ZZAA 4YKPA 4F19A 4R9GA 3H6UA 2VD3A 4GQOA 1LAHE 4QFKA 1SYIA 4OESA 1R6ZA 2WKYA 2R9JA 1NFTA 5L9OA 1NMUA 2Y7KA 2DSFA 1JNFA 2DP8A 3PUVE 2G29A 2GHAA 2ONKE 3B6WA 3PUXE 3MJNA 4JSDA 3K1PA 4Q0CA 2DVZA 4OEUA 3U92A 4DE8A 1Y3QA 1POY1 2ZYMA 3M8UA 4NF4B 4NF8B 3VLVA 1MDQA 2O69A 3U1OA 4EXLA 4I62A 4NWDA 4FJPA 1YCJA 2QMWA 4FIMA 2XX9A 2ANJA 1S7YA 1QULA 3L6GA 3TMGA 5J1DA 4GFRA 1UIVA 3PUZE 3FVOA 2F7AA 1B5JA 4JWXA 5ELVA 4AB5A 1VFDA 3K01A 5LOMA 1MY2A 4L17A 2DVCA 1ZTYA 4F31B 4ZEIA 2H9BA 3MAMA 1DMBA 2AL4A 3DP6A 3GZGA 4U2RA 1I6QA 3LUYA 4X9TA 2G93A 1LAXA 3A09A 2OBGA 1ZBMA 2YJPA 2OCUA 3K6VA 3KGCA 1T0KA 2OJTA 1Z7ME 3VDFA 5BWJA 2F78A 3RLFE 4PP0A 5I59A 5EHSA 1UTBA 3R6UA 4MH5A 4H1XA 3K4UA 3CFLA 3VE1B 5DEXB 2PVUA 3N6UA 4F3BA 3ILUB 1B5IA 2V3UA 2I48A 4NE4A 3FV2A 4LZ5A 3CVGA 2I3VA 2LAOA 2O68A 4G68B 1OVTA 5B70A 1FCKA 4PFYA 3FXUA 4WXJA 2OK2A 1PBQA 4LONB 3HN0A 4DCXA 5TPAB 3HPIA 3ILTB 3PUYE 5HM4B 1MQJA 3UN6A 4YAHX 2DWHA 1ANFA 3TKDA 1PDAA 2REJA 4NF4A 2D5WA 4NF8A 1NNKA 4I9DA 3IR1A 3TELA 1B3FA 4NWCA 1WVJA 4OFLA 4OYVA 3Q26A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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