3FVOA

Crystal structure of the human glutamate receptor, glur5, ligand-binding core in complex with 8-epi-neodysiherbaine a in space group p1
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structures of Human GluR5 Ligand-Binding Core in Complexes with Novel Marine-Derived Toxins, Dysiherbaine and Neodysiherbaine A, and Their Analogues
rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvoA02
2Z23A 3W15C 4POXA 1AIVA 1IXCA 4U4XA 4WKMA 4I62A 3OEKA 2ONRA 1QUKA 4NWCA 5ISUA 1GTKA 1MXUA 2V3TA 3H6TA 4F22A 5H8FA 3C34A 4R74A 4OQOA 1PEBA 1LSTA 3S2VA 2HZKA 4PFUA 4IB2A 2UVGA 4KYSA 5JTYA 1I6QA 5A5XB 1L5TA 4DXBA 1MDP1 2XHDA 3DP8A 4N07A 3S9LC 1MY0A 2UYFA 3BFUA 5ICQA 2A5TB 2Z8EA 4R2BA 4ELPA 2H4IA 3TKDA 4F1UA 3CFXA 4JSOA 2QS3A 3S9NC 4FATA 3GZGA 1S50A 4QF9A 1NFTA 1O63A 1LAHE 3ZS6A 1D9VA 4EQ9A 4POWA 1JEUA 4GIZA 3PV0E 4PFYA 4F39A 3VVEA 1POTA 2F5XA 4BDRA 3MVWA 3Q29A 2RCAA 3IB2A 3G3KA 4OESA 3QIMA 2RC9A 4UA8A 4OEVA 1TFAA 2R6GE 3SEVA 4LATA 4HCWA 3SKPA 4GRKA 2W7YA 5HM4B 3U94A 3C9HA 2AL5A 1N7XA 3PMWA 1Y1ZA 3RLFE 4EQ7A 3UK4A 3AXFA 3KSXA 3G3GA 1FQEA 3L6GA 4H0WA 4LP2B 1DMBA 5I59B 3G3FA 1R9LA 4N6PA 3LUYA 1LCFA 4F2QA 1DTGA 1P1WA 3E13X 2F7AA 3M3FA 2ABHA 1WODA 4K3FA 3TMGA 1Y4CA 4HTGA 3S9MC 1DTZA 3VDFA 4X1DA 5TP9A 3UA8A 4U22A 4ELOA 4Q0CA 5CBSA 3HN0A 1MXWA 4X1BA 3MZ1A 4G2ZA 1B6HA 3OO8A 1UTBB 5M2VA 1Y3NA 3MAMA 4R9FA 2AL4A 4FEDA 2H25A 4RK2A 5CMMA 2PMSA 4EXLA 3OOAA 4XTCQ 3T22A 3QUFA 1PB8A 2XX7A 3K0VA 1P1NA 3RTFB 1OQHA 1MQGA 1EZPA 2O7UA 1IXIA 1BIYA 3TELA 2VGQA 3IOTA 4C1TA 3V83A 4WXJA 4PP0A 1AH5A 1B32A 3H6WA 4E0XA 2F34A 1FTKA 2QMWA 5CM6A 3K4UA 3QXMA 5DVIA 2GRVA 4XIGQ 4EDPA 3IO6A 2O69A 1LBBA 4LONB 4LUBA 3SESA 1URSA 1URDA 2H99A 2Y7RA 3K1MA 1MQJA 3FJ7A 3FXQA 4O3BA 1SVXB 1USYE 4ZEIA 2OCUA 1XT8A 3V89B 4U4SA 4F1VA 2XXTA 3OXNA 4YMBA 4ZS9A 4F2OA 1I6BA 3TPAA 2DVZA 4H5FA 1Q35A 1ZLQA 4WEDA 3FXRA 4JSDA 1LBCA 1PBQA 2QJEA 3LSXA 1XHYA 1LCTA 4QHQA 1IIWA 4NF5B 1D4NA 4H1XA 4QSEA 4NWDA 1SW1A 3MC2A 5CBRA 4E0WA 5I2KB 2QRYA 1Q1KA 3U92A 4YKIA 4P11A 1PB9A 4KQPA 2HZLA 3CG3A 1AMFA 3O6HA 4PFTA 4KPTA 3TAJA 1HSLA 2XXPA 5TP9B 3BKIB 3T9UA 3W9VA 3GBAA 4KD5A 3PPQA 3N26A 5CMKA 4RK9A 1N3XA 1GV8A 3OSRA 3C35A 2F6GA 1ZU0A 1A8EA 3TUSA 1AL3A 4G77A 4QRZA 2E0SA 3FJMA 1M5BA 1MPCA 4XKQA 3N6UA 2XXVA 2NXOA 2B3FA 1YAEA 3LC8A 4KCDA 2I49A 4ESWA 4R75A 4UACA 1RYOA 5H8HA 1HSEA 2DE4A 3IAZA 2QS4A 3H6VA 1EZOA 3MQ9A 2Q88A 4MLVA 3CFLA 4G8MA 1NMUA 3IO4A 3VLWA 3HPIA 3PPPA 3RGYA 2THIA 3ILTB 1Y4TA 1UIUA 4ZEDA 1MY1A 3B6TA 5FHMA 2OWTA 2FYIA 2DWHA 2PVUA 1MG1A 3CR9A 1EZ9A 2F7CA 3TTMA 2ANJA 3F11A 4P0IA 1I69A 4GFRA 1OLCA 4EUOA 4TLLB 3EHSA 3KGCA 1B5IA 2I3VA 2B65A 2O7IA 4ZE8A 1MXVA 3VV5A 5IAIA 3V8XB 3P7IA 3PUZE 3QAXA 2XXUA 5AA4A 4Z0IA 1NL5A 2NOOA 4F3BA 4U1OA 5ELVA 3H3GA 3JZJA 1POY1 1NNPA 4JDFA 3THIA 2UXAA 4YB7A 3MPKA 3Q28A 4KHZE 1FQBA 1RYXA 4P0GA 4NMYA 1SW2A 3FXUA 2QPQA 2DXYA 5DYHA 3RN8A 4AQ4A 3LSLA 4MBPA 1IQ7A 3SEXA 4PETA 1JEVA 4JWXA 3VLUA 3R7XA 2DXRA 1SQYA 1D3KA 3MP8A 1B3LA 1MXZA 1MM6A 1LAFE 4RYAA 2X26A 5I58B 1O7TA 3U1OA 2GFEA 4DXUA 3G3IA 1BP5A 5CMBA 3OD7A 3KN3A 4O3AA 3ZKLA 5I2NB 2NWJA 4F19A 3TTLA 1B3FA 4IO6A 5EHMA 4OEUA 1MQIA 1OLAA 2CMOA 3DLNA 4I9DA 4GQOA 3T96B 2O68A 3O66A 4RY1A 5DT6A 5KZTA 3SEUA 2NUVA 5H8NA 4F3GA 3N6TA 2Y7IA 4IO5A 2PT1A 3FZVA 3K2DA 3Q25A 5FTHA 4ECFA 3PUYE 5TPAB 2H5YA 2F8DA 3GBBA 2ONSA 1B3GA 1SDXA 4G68B 1TXFA 4F31B 3TCGA 1Z7ME 1JW5A 2RF1A 1S7YA 1D9YA 1MS7A 3O6IA 4EF2A 3EQ1A 3K01A 1SW4A 3CI8A 3O6GA 4ZE9A 1JETA 1B1HA 4JBZA 4Z7EA 4FORA 2QS1A 3OSQA 5AA2B 1B9JA 3DM0A 4U2RA 2IEEA 3TTKA 1VSOA 3T9XB 3V5AA 1MQDA 4OZ9A 3MVZA 3FIRA 4NEDA 1B4ZA 4YB5A 2DWIA 3B7DA 3UIFA 1WVJA 1R1NA 4NF4B 1IXHA 2DE3A 4Q8RA 4BDMA 4IO4A 3FVKA 5IKBA 1PBPA 4N13A 4KYEA 1MRPA 1PDAA 2OK2A 2YPNA 5JEIA 3TFLA 1XC1A 4ZZAA 5AA3A 4PE5B 3FV2A 5H8FB 1OMPA 1LGBC 4FJPA 5KDTA 3Q27A 5TU0A 3G3JA 3RQTA 1YCJA 5JTYB 1DPEA 1DPPA 2PYYA 2O1LA 1FTJA 4EXKA 1B3EA 1B40A 2I0BA 1VR5A 1B5JA 5DEXA 4RPNA 4OXVA 3C32A 2VD2A 3A09A 2Q9TA 4I1DA 4GL0A 1B3HA 4YZZA 2HFBA 3IX1A 1SBPA 4JXIA 2O6AA 3HCQA 2XX8A 5CI5A 2AYSA 1R6ZA 1B0LA 3HHFA 3PMVA 3T9VA 2HXWA 1T0KA 4FECA 2YLNA 4OWDA 2I0CA 2DWJA 2RINA 5I57A 3CG1A 2DVCA 1MXXA 3ODBA 1QW0A 5JK4A 5L9MA 1NNKA 3IL1B 3UP9A 2Y7KA 3LR1A 3RNNA 2XD2A 3I5OA 4GOTA 3FVNA 2QSXA 3E4RA 3M8UA 3DP4A 3W9WA 5EYFA 1ZMGA 4LQ2A 1MQHA 3OO7A 2YJPA 3KFMA 4GF8A 4HW8A 5DVJA 2E1SA 2HAUA 4H5GA 4TQUQ 4QFOA 4F3PA 2NVUB 4MFIA 5HBCA 1XVXA 3HSTA 4YMAA 2VD3A 1JW1A 2V3QA 1UTHA 3R6UA 5KCJA 4GXAA 3VE1B 2Q89A 3DP6A 4KFQA 3MP1A 3D4CA 2HEUA 2XD3A 2I6EA 1SYHA 4DDDA 5DVFA 2OJTA 2I58A 2OBGA 1Y20A 1GGGA 2G29A 3PUVE 3S9EA 3U72A 3TTRA 3IORA 4LQ5A 3FV1A 3CVGA 5BWJA 3MZ9A 3EPEA 1MY2A 5EHSA 2ZYNA 3O29A 2ZYMA 4U23A 3FGSA 3MVXA 1JVXA 1TT1A 3KN8A 3G3HA 3PU5A 4R9GA 4KI0E 3ZSFA 5AA2D 1B7UA 3B6WA 3GXAA 3IOVA 2UVHA 4NF6A 4DCYA 1B5HA 1M5CA 1TWYA 4G4PA 5I56A 1LAGE 2QMXA 1N04A 3O9PA 2LAOA 5K2XA 4JWYA 1SI1A 4QFLA 1N76A 5ICTA 3IB1A 4F3SA 3IB0A 4YKJA 4OVJA 1PB7A 1UQWA 4R2FA 4XXUA 3U93A 3H7MA 3BFTA 1NKXA 3VXCA 3FATA 3FJGA 2GH9A 1M5DA 4QFKA 3O2AA 4XKRA 4U1ZA 2XXYA 1GVCA 3TCHA 3SEWA 2F36A 1A99A 2XXIA 5CRYA 3TYHA 2Z22A 3PMXA 2X7PA 4H8JA 1SD3A 2V93A 5A5XA 2UVJA 2M8CA 2I4CA 4ISUA 2RKMA 1DSNA 3KSJA 2VOZA 4ZECA 1NNFA 5BUUA 2V3UA 5AA1A 1LFGA 1P1QA 2A5TA 1MPDA 3CRBA 4ONYA 1JVYA 4EQBA 1A54A 3FASA 3OMBA 1O64A 1JQFA 5H8SA 1ATGA 2O51A 1CB6A 3VFJA 1QUIA 4DIGA 3C4MA 3T66A 3PPRA 3JV9A 2Z8FA 2QL3A 3K00A 3PUXE 2ZNUA 4Q5TA 3RUMA 4OENA 4YAHX 1N3WA 1NH8A 4IO7A 2Z8DA 3PD8A 5FHOA 3O97A 4NTLA 4FAJA 1FTLA 2PT2A 3KJ7A 4GL8A 3DELB 2ZYOA 4BDNA 2HQ0A 2DQVA 3VLVA 4NF8A 2H98A 2UVIA 2XXQA 4X9TA 2F6PA 2AIXA 3R26A 1B4HA 4IO2A 3G7WA 4IGRA 3E3KA 2XXXA 2CZLA 4NF6B 2P1SA 3PPNA 3TZAA 5H8HB 5I59A 2FA7A 1CE2A 4BDOA 3CSBA 1UIVA 4ZEFA 1H44A 1QKBA 3OO6A 3UORA 1DOTA 1BLFA 4OYVA 3K6UA 5AE4A 3IJOB 1FTOA 2PBWA 4TLMB 4LZ7A 1R9QA 4L17A 3HO7A 2DP8A 4AB5A 1JNFA 1S9TA 1UTBA 1XOCA 4ZEBA 2DWAA 2UYEA 2XX9A 2ESNA 1US4A 5B7DA 2Y7WA 1FQDA 3BBRA 4FEBA 2WKYA 3K02A 4OETA 2GHAA 3WAEA 2P2AA 1J1NA 1F9BA 5J1DA 2G93A 4OMBA 1XS5A 2O84X 3QUJA 3K6XA 3K6VA 4F29A 2Y84A 3H03A 3OO9A 5B70A 1MXYA 4KCCA 1BKAA 1MH3A 4R73A 3MVYA 1B1XA 5AA4B 4ESXA 4DLDA 4IY6A 1B58A 3SETA 1YPNA 3SEYA 1OQGA 5H8QA 4THIA 4ND9A 4R6YA 1TFDA 3A3UA 3Q26A 2VP1A 2HAVA 2IA4A 5F1QA 3PD9A 3RTWB 4NF8B 4LZ5A 3HHGA 4M4GA 3K6WA 4BDLA 2F97A 3U8QA 4WEPA 3CSGA 1LB8A 4X48A 1QJMA 3N94A 5L8DA 4YB6A 3FVOA 4NF5A 4RPOA 2XXRA 1QVSA 3EHUA 1B46A 3HV1A 1ZBMA 3TEPA 2ZYKA 4U21A 4OTEA 1FQCA 4BDQA 5I2KA 5CMCA 1PC3A 2DE2A 1Y3QA 1ZTYA 1SYIA 4YKKA 4MF3A 3IJXB 2PX1A 1IITA 3MUQA 3IR1A 2OZZA 5L9SA 3MP6A 3C31A 4QSCA 3FUZA 4Q30B 3PPOA 3VXBA 3I3VA 4HS7A 1B05A 4HCYA 4RJZA 3TDJA 3EF7A 2F35A 1SW5A 5H8NB 4QFNA 2DOJA 4TOZA 2KLFA 1EH3A 4R72A 1OVBA 2DS9A 4RA1A 1B7HA 5FHNA 3C33A 1KWHA 4RNSA 2RC8A 3CIJA 3M3KA 2RCBA 4I8CA 1IUDA 4R6KA 3OEMA 2I48A 2R71A 1H3DA 1FCKA 2REJA 1MPBA 3MBPA 1QKAA 4LVQA 1RKMA 3LSFB 2R9JA 1HSJA 2ALUA 3ECRA 2Y7PA 4XKNA 2ZMBA 5L9OA 4FIMA 4G8HA 4YKPA 2Q8JA 2Q2CA 3T93B 4LZ8A 4H8IA 3L6HA 2V84A 2HCAA 2I3WA 2X7QA 4H65A 4EF1A 5H8QB 2F78A 1IXGA 3PGFA 1MY4A 1US5A 3EN3A 4PQJA 4H67A 2I4BA 5ITPA 4GXSB 1VFEA 3TTNA 3LBSA 3IOWA 3KN7A 2ZXTA 1ZKBA 4XKPA 4OERA 4ZEKA 1FQFA 3QYTA 3KJTA 1LFHA 3CFZA 3H6UA 4DE8A 3T9HB 4KYDA 3H4ZA 3SDFA 5CC2A 4MLQA 4DCXA 1N84A 2Q2AA 4JB7A 1N7WA 3QSLA 1LB9A 3S4UA 3MJNA 3FVGA 2F7BA 3GLBA 3PUWE 1USYH 4OFLA 3FD3A 1B0HA 4R6HA 1QULA 3RY3A 3TQWA 3KEIA 5KDTB 4RXLA 1FTMA 4MH5A 4ELQA 3K1NA 1B51A 4ZDMA 4F1YA 3IK6B 2DYXA 1URGA 3E9XA 3TCFA 4KR5A 4IGTA 4PFWA 4G68C 1FW0A 3ONMA 3OENA 4GWOA 2XXWA 2ZNTA 1II5A 5DEXB 2B3BA 1B2HA 4QFPA 3MWBA 1OVTA 4AB6A 4YICA 2OLBA 2ONKE 3IOUA 5FTIA 1I6AA 2RC7A 1ANFA 1Z7NE 5ITOA 2VHAA 3JYRA 1NNTA 5LOMA 1H43A 4IY5A 3MZBA 3WAFA 1H45A 2D21A 4QSDA 5I58A 1Y3PA 3SERA 4NE4A 1AOVA 1ZIUA 4M1VA 3VVFA 3MPLA 1A8FA 3KG2A 4GVOA 5I57B 4G8NA 1ELJA 2H9BA 5I2NA 2A5SA 3RPWA 3RT8A 1IZ1A 1P1UA 1IEJA 4FE8A 3MW0A 4C1UA 4ZZEA 1MM7A 1LFIA 4LA9A 1BTJA 1LAXA 1XVYA 2BJJX 1A55A 2QS2A 1JW4A 3UN6A 4JWOA 3QK6A 3VVDA 3KZGA 1Y1MA 1VE4A 4DXCA 3N5LA 1LLSA 2OWSA 1MH4A 1EU8A 5I84A 1SI0A 1ZJLA 2DSFA 1UTHB 3KOTA 1A7LA 1OIBA 3O28A 3RT6B 5KCJB 2GHBA 2O1MA 5DTBA 1B7ZA 5TPAA 5K2YA 1P99A 1H76A 2REGA 4GD5A 4C0RA 3ZKKA 1NH7A 4G68A 1P1OA 4OHNA 3LSWA 4BLAA 2ZNSA 2D3IA 1B52A 3KBRA 1Y9UA 1MDQA 1VFDA 3M3LA 1FQAA 3I6VA 3C36A 5HPQA 3H06B 1QUJA 4ELRA 4OFOA 1A40A 1N0TA 3EHTA 3TODA 4H6DA 4F18A 1GR2A 3UGWA 2V25A 4O3CA 3KOSA 1M5FA 2FNCA 2XXHA 5AA2A 3USDA 3D4GA 1M5EA 1WDNA 3ILUB 3TQLA 3B6QA 4DZ1A 5I56B 4GLIA 4IO3A 4YU0A 4OFJA 5F7VA 1YTVA 2D5WA 4NF4A 3A3CA 2P0SA 3K1PA 3OELA 1MY3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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