3FVOA

Crystal structure of the human glutamate receptor, glur5, ligand-binding core in complex with 8-epi-neodysiherbaine a in space group p1
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structures of Human GluR5 Ligand-Binding Core in Complexes with Novel Marine-Derived Toxins, Dysiherbaine and Neodysiherbaine A, and Their Analogues
rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvoA02
3S9NC 3K6VA 3ILUB 4H5GA 1MXZA 3K4UA 1VSOA 1IXCA 4FAJA 3T96B 4MLVA 2XXUA 2AL5A 1M5DA 5DYHA 1LB9A 3MVYA 3V83A 1JW1A 3G3GA 3IOUA 3S4UA 4ELOA 3IJOB 4GD5A 1MS7A 3V5AA 5TPAB 4JSOA 3H6UA 4RXLA 1BLFA 4ZEBA 4QRZA 5H8FB 1N04A 3K1NA 3SEUA 3VLUA 5H8SA 1IIWA 4GIZA 1A99A 2ZXTA 1XOCA 1TXFA 4IO5A 3OO9A 2PBWA 1A8FA 1WVJA 2H99A 3LSLA 1BIYA 3K6UA 4LATA 1JVYA 3TMGA 2Q88A 3MAMA 5H8NA 3Q26A 1MRPA 4OEVA 1SVXB 4JWOA 2QS2A 4PQJA 1ELJA 2X26A 3THIA 3B7DA 1S9TA 3H6TA 4QHQA 3C34A 1QKBA 3C33A 5FTHA 1IXGA 2DE4A 4ELRA 1B7HA 1MH3A 4ZEFA 1Z7NE 5I2KB 4NF5B 5KDTA 3T9XB 5DTBA 3LSXA 2B3BA 4OFOA 3FXUA 2DSFA 3FV1A 5HBCA 1SW1A 1MDP1 1WDNA 4OMBA 3KBRA 3N26A 4EQBA 3O97A 1LSTA 3T66A 1O63A 4ELPA 2O51A 3OO6A 1FW0A 4P0IA 3A3UA 2RINA 5I56A 4XXUA 4GFRA 1LCFA 5JTYB 3RTFB 3IB0A 2H5YA 3E3KA 5H8QA 2RKMA 1D4NA 2HCAA 4ND9A 1P1WA 4R2FA 2F36A 2DVCA 3C32A 3LBSA 4YKJA 4F3SA 1DPPA 2ESNA 5TPAA 1Y3QA 2F6PA 1QW0A 4O3BA 2PYYA 3HHGA 5AA2D 5H8FA 2H98A 5CMCA 1MPDA 3FVKA 4G8HA 4MH5A 3KJ7A 5DVFA 5I2NB 4KI0E 4R73A 4RK9A 2ZNUA 4AB5A 3VVFA 1UTHB 1N76A 1ATGA 3JV9A 4YAHX 1NH8A 5K2YA 3LR1A 2AYSA 2O68A 5DT6A 5A5XB 1FQAA 1B5JA 3OD7A 3DM0A 1Y20A 1Y4CA 4OYVA 2G29A 1POY1 2B3FA 2HQ0A 1B0LA 1B7UA 3JZJA 1MY1A 1PBPA 4UA8A 2YPNA 3S9LC 3B6QA 3UGWA 4R74A 4OESA 3K02A 3ODBA 1I6AA 3KG2A 1URGA 4R6KA 5I2KA 1QUKA 5I57B 1MY0A 4M1VA 2A5TB 1MXVA 4OZ9A 1OVTA 3CG3A 4EF1A 3WAEA 3MW0A 3TTRA 3MPKA 2E0SA 3FD3A 4N6PA 1UIUA 1EU8A 3HCQA 4H0WA 1HSJA 3TEPA 4X1BA 3H6VA 2RC8A 2HEUA 3IO4A 2XXWA 3UP9A 5J1DA 2ANJA 1FQCA 5FHMA 4NF8A 3BKIB 2XX8A 4Z0IA 2PX1A 4U22A 3ZSFA 3FIRA 1M5CA 4YB7A 5HPQA 4QF9A 4XIGQ 1H44A 5KCJA 1TFDA 5F7VA 5I2NA 2Z8FA 3C4MA 3I3VA 3RT6B 3TELA 5AA4B 4GQOA 5B7DA 4LP2B 2HZKA 1USYH 3FATA 3CFLA 2XXRA 2VGQA 4MBPA 5A5XA 2BJJX 5DVIA 1R6ZA 1MG1A 4IGTA 3H4ZA 3PUXE 2G93A 2H9BA 3KFMA 1T0KA 3FUZA 5I84A 1IEJA 2OBGA 1IZ1A 4EDPA 2QL3A 3OOAA 2OWTA 3PV0E 4JDFA 1D3KA 3TZAA 3M3LA 3L6HA 3RUMA 5I57A 3PMWA 4DDDA 1A55A 2A5TA 1SD3A 4GXAA 3FXRA 4TOZA 4PFWA 2ZYMA 3U93A 3TCGA 4DIGA 3CFXA 3IJXB 4KCDA 4BDLA 3CR9A 4KHZE 2QS4A 1FQFA 2I6EA 3ECRA 2XXVA 1OLCA 4QSCA 4G4PA 1Y9UA 2QMWA 2ZYOA 1LAXA 1FTOA 1LAGE 3TCHA 2ZYNA 1CE2A 1OMPA 3MC2A 3BFUA 2UYFA 2REGA 4POWA 2DYXA 4KCCA 1O64A 3KOTA 5BUUA 1NNTA 1RYOA 4F2OA 3G7WA 2NOOA 5AA4A 2ONSA 3RN8A 1O7TA 4OEUA 3JYRA 1GVCA 3HHFA 4X1DA 4KPTA 4QSDA 1JEVA 5I58A 3TTNA 2F78A 2DWJA 1NFTA 3N94A 4OQOA 4HTGA 1LCTA 3PD9A 3ILTB 4MLQA 5L9MA 1J1NA 1SYIA 3OSQA 5I59B 1I6BA 5CRYA 1MM6A 3IOWA 4PETA 4LZ8A 2DE3A 3B6TA 2DXRA 2GHBA 1UTBB 1N7XA 4EF2A 2OWSA 1OQHA 2ZNTA 3TKDA 4TLLB 3C31A 4JB7A 2HZLA 4RA1A 4FJPA 1BTJA 4DE8A 4I8CA 2UYEA 1OIBA 4NF6A 3FJMA 1P1OA 4XKNA 1N3WA 4Z7EA 3O6IA 3H06B 4ONYA 2Y7PA 1FTLA 2QMXA 4ZEKA 4XKRA 4NEDA 3EF7A 3R26A 1NH7A 2XD2A 2I0BA 1GV8A 3DP4A 2DVZA 4IO3A 3RT8A 4Q30B 1MDQA 1MPCA 1NL5A 2REJA 4HCYA 4DLDA 3RNNA 5AE4A 4G8MA 4YB6A 1MQIA 3O28A 4G2ZA 2DE2A 4GL0A 1MQHA 2HFBA 1NKXA 4KD5A 4IB2A 1ZIUA 1L5TA 3KSJA 2A5SA 3IB2A 3FVNA 1SI1A 1BP5A 3K6WA 3A3CA 2X7PA 2DS9A 3FASA 4BDQA 3U92A 3M3KA 2Y7WA 3PUVE 2GHAA 3H7MA 4R9FA 2Y84A 2W7YA 5I59A 5CM6A 1P1NA 3I6VA 4F22A 5CBRA 2XXTA 1FQDA 1CB6A 3OSRA 1SW4A 3TCFA 4YICA 1EZ9A 3AXFA 4F39A 3Q28A 4BDMA 1LFGA 1YAEA 3IOVA 4H1XA 3KEIA 2CMOA 4G77A 2V84A 3FV2A 3QUJA 4IY5A 2XXPA 4HS7A 2I0CA 3QSLA 1B52A 4OWDA 1B58A 1B0HA 2I48A 1I6QA 4OERA 2XX9A 2I3WA 1B3EA 1B51A 4PFTA 4R72A 1N84A 3H03A 1XVYA 3VDFA 4GRKA 1US4A 3RPWA 3I5OA 1JW5A 3CIJA 1KWHA 4XKPA 3C35A 4U1ZA 5ELVA 4H67A 4E0XA 5AA2B 4P11A 1PC3A 1HSLA 1MXUA 3IK6B 1R9LA 4X9TA 1ZJLA 4YMBA 3U8QA 3TDJA 2P0SA 1N3XA 2RCAA 4ESXA 1Y3PA 3VVEA 4LA9A 1TFAA 3S9MC 2F8DA 4PP0A 3SDFA 2DWIA 2OZZA 4XKQA 2ONRA 2XX7A 3U72A 4YKKA 3MVXA 1MY3A 2UVIA 3UK4A 3E4RA 1GGGA 5DEXB 1JETA 1PB8A 1A54A 3T9HB 3KGCA 4FEDA 4Q8RA 3SEWA 3TODA 4H8IA 1NNPA 1JNFA 1RYXA 1AL3A 1OVBA 1ZTYA 1Q35A 3O29A 2F7BA 1MQDA 3G3JA 4O3AA 3W15C 3TTMA 4QFOA 1Y3NA 5H8HB 1JEUA 4OXVA 2Q2AA 4FORA 4IGRA 4NF5A 4RJZA 2DXYA 4IY6A 1D9YA 2P2AA 4AB6A 1YPNA 3MZ1A 4LQ5A 3U94A 2UXAA 5TP9B 2ZMBA 1NMUA 4OFLA 2OLBA 5JTYA 4FIMA 3TUSA 2F5XA 4LZ5A 3ZKLA 3PU5A 4GOTA 3SEYA 4BLAA 1P99A 3EHUA 2F7CA 2XXHA 3OEMA 4GVOA 3K2DA 5KZTA 3QXMA 2O6AA 4F1YA 1WODA 4MF3A 3K00A 3O6HA 1M5BA 1B3HA 3FJ7A 1SW2A 1AH5A 5ITOA 3S2VA 5L9OA 5ITPA 4KQPA 1XC1A 3KSXA 3EHTA 1B2HA 1UTHA 1QULA 3EQ1A 3U1OA 1ZMGA 5FHNA 3MP8A 3OMBA 4PFUA 3SESA 1HSEA 3TQWA 1FQBA 3PPOA 1MPBA 4RNSA 4LVQA 3Q27A 4QFLA 5AA1A 3UN6A 1IUDA 3RLFE 2GFEA 2YJPA 2F97A 4OETA 2UVHA 1PBQA 1B3FA 2Z22A 4JXIA 3K6XA 1B1HA 2HAVA 3DP8A 2VD3A 2H4IA 4H6DA 3HN0A 1FTJA 3PUZE 2I49A 1LB8A 3HSTA 5H8HA 1MM7A 3PMVA 3IORA 4P0GA 2QRYA 1EZOA 2F34A 3A09A 4R2BA 3VXBA 3OEKA 2GH9A 2YLNA 4H65A 4RPNA 3PUYE 3SETA 5CMKA 1FCKA 2F6GA 4GF8A 1ZU0A 5TP9A 3K1PA 1Y1ZA 1MQGA 1VFEA 4PFYA 4ZZAA 1URSA 3EPEA 2O7UA 4R6HA 4TQUQ 1AOVA 4JWYA 1GR2A 3HO7A 1IXHA 3RQTA 1SDXA 2R9JA 1B5HA 4ZE8A 2H25A 5CBSA 1VR5A 3HV1A 1PB9A 3FJGA 4G8NA 4F1UA 2NUVA 4K3FA 2XXXA 5ISUA 4THIA 2VHAA 4OENA 1S7YA 4RK2A 1P1QA 1A40A 3KZGA 4NTLA 1N0TA 3PPNA 4U4SA 3CVGA 4U1OA 2F7AA 2QJEA 3G3FA 4DXUA 4DCXA 2I3VA 4EXLA 4LUBA 5IAIA 5FTIA 5DVJA 2NWJA 4I1DA 3IB1A 1ZLQA 3UA8A 4F31B 4GWOA 3WAFA 4YZZA 2RC9A 3K0VA 5FHOA 4R9GA 3DP6A 1B4ZA 2IEEA 3T9UA 3L6GA 2XHDA 4ZDMA 3B6WA 1Q1KA 5F1QA 1NNFA 2V25A 4ZECA 1F9BA 3O9PA 2RF1A 3KN8A 2OCUA 1PB7A 4L17A 1B1XA 2LAOA 3HPIA 4UACA 2FA7A 3PGFA 1XVXA 4Q0CA 1OQGA 2Z23A 2R6GE 1NNKA 3BFTA 5K2XA 1SW5A 4YB5A 3VVDA 1P1UA 4N13A 4O3CA 4C0RA 5CMMA 2XD3A 4GL8A 2Q89A 2D3IA 4JWXA 1H3DA 4LQ2A 5CC2A 1B6HA 3M8UA 3H3GA 1VFDA 3VXCA 3EHSA 3MQ9A 4R6YA 2DOJA 1SI0A 3N5LA 3E9XA 1SBPA 1R1NA 4DXBA 5I56B 1URDA 3C9HA 2Q9TA 3OELA 1B9JA 5HM4B 4F3PA 3K01A 5H8QB 2NXOA 3V8XB 2PVUA 3CSBA 4NWCA 2F35A 5EHSA 1GTKA 4KYDA 5JEIA 4JBZA 4EQ7A 1LFIA 3RY3A 3MZBA 1JQFA 2O1LA 4LONB 1B5IA 4GXSB 4TLMB 2QSXA 2CZLA 4DXCA 1BKAA 3G3IA 3W9VA 4FE8A 3OENA 1IITA 4F3BA 1LAFE 2Y7IA 3LC8A 3DLNA 4Q5TA 3UIFA 3PD8A 1ANFA 2HAUA 1UQWA 1UTBA 2AL4A 2WKYA 4WEDA 3E13X 1SQYA 1JVXA 4BDRA 1B3LA 4RY1A 4H5FA 3ONMA 2OK2A 1QVSA 3SEXA 3CRBA 5JK4A 3R6UA 4YKPA 3TTLA 4OHNA 1B46A 4FEBA 5BWJA 4NWDA 1MXWA 4KFQA 4G68B 2PMSA 4HW8A 2Z8DA 3FGSA 4BDOA 1PDAA 3EN3A 3VLVA 1MY4A 2XXQA 1Y1MA 2AIXA 4F3GA 3PPQA 4XTCQ 1DTZA 3FVGA 1XS5A 3RGYA 2Q2CA 3TPAA 1ZBMA 2V93A 3MJNA 4NF8B 1DMBA 2Y7RA 3ZKKA 3IL1B 3QYTA 2XXIA 5TU0A 1DOTA 1M5FA 4OVJA 1LLSA 1POTA 3PMXA 3C36A 5KCJB 1A8EA 3T22A 3ZS6A 2VOZA 1MH4A 4QFNA 3V89B 2DQVA 2ZYKA 1B4HA 4WXJA 4QFKA 2PT2A 1R9QA 2O7IA 1US5A 1B7ZA 1II5A 1LAHE 1AMFA 3T93B 3MP1A 4LZ7A 3RTWB 4KYSA 4M4GA 2UVJA 1FTKA 3OXNA 4QSEA 3O66A 4ISUA 3GBAA 4KR5A 1QUIA 1FTMA 2I4CA 3TTKA 2IA4A 1LGBC 3GLBA 3GXAA 1I69A 2VD2A 3DELB 1S50A 1ZKBA 1USYE 4F2QA 2ALUA 1LBBA 3CFZA 4I9DA 2DP8A 4F29A 4G68A 4AQ4A 3M3FA 3KN3A 5AA2A 1UIVA 3CI8A 4E0WA 2B65A 5CI5A 4H8JA 1Z7ME 4U23A 5AA3A 2HXWA 2V3QA 2RC7A 2DWAA 4KYEA 4BDNA 3N6TA 1VE4A 4MFIA 3G3KA 3FZVA 2UVGA 2I58A 2GRVA 3W9WA 2OJTA 1TT1A 2Z8EA 3SKPA 4ELQA 1DPEA 1PEBA 4F1VA 4U4XA 4DCYA 2ABHA 3R7XA 4GLIA 3Q29A 2RCBA 4ZS9A 3PUWE 5DEXA 1M5EA 4C1TA 1YCJA 4N07A 4EQ9A 5L8DA 4POXA 3USDA 1N7WA 2R71A 4ZE9A 4YMAA 3MVWA 3SERA 3IOTA 3FXQA 5I58B 3S9EA 3TFLA 3VV5A 3SEVA 3BBRA 1TWYA 3QIMA 3VLWA 3IR1A 3GZGA 3OO7A 4YKIA 3LSWA 2X7QA 1MQJA 4PE5B 1QUJA 1FQEA 2M8CA 3PPPA 3MP6A 3QUFA 2QS3A 4U2RA 4ZEIA 1DSNA 4JSDA 4WKMA 1AIVA 4EUOA 3VFJA 3Q25A 2THIA 5M2VA 4C1UA 2V3UA 4NF4B 2O84X 1Y4TA 5ICTA 1EH3A 4RYAA 4NF6B 1QKAA 1MY2A 3D4GA 3QK6A 1A7LA 3PPRA 3OO8A 3GBBA 2FNCA 5CMBA 2ZNSA 1D9VA 1IQ7A 2I4BA 3TYHA 3MBPA 2P1SA 3MZ9A 4ECFA 4IO6A 1H45A 1XHYA 4F19A 2XXYA 1H76A 1MXYA 4FECA 2VP1A 4QFPA 3MWBA 4I62A 3P7IA 3O6GA 3IAZA 4IO2A 1SYHA 4OFJA 1JW4A 4X48A 1H43A 5ICQA 3LSFB 2D21A 1RKMA 2V3TA 3G3HA 5EHMA 3FVOA 1OLAA 4U21A 5IKBA 3K1MA 4R75A 2PT1A 1IXIA 4YU0A 2E1SA 2Y7KA 3TQLA 3O2AA 2O1MA 4IO4A 1LBCA 3TAJA 4NE4A 5B70A 1XT8A 1MXXA 4IO7A 3KJTA 4G68C 4FATA 1B40A 3KOSA 4ZEDA 3LUYA 4ESWA 1QJMA 3MPLA 1YTVA 4HCWA 3QAXA 2KLFA 5H8NB 3VE1B 5LOMA 4ZZEA 1EZPA 2O69A 3CSGA 3H6WA 3T9VA 2D5WA 1DTGA 3N6UA 1B05A 3F11A 4F18A 3MUQA 4EXKA 2QS1A 3CG1A 4NMYA 2FYIA 1B3GA 3UORA 2Q8JA 4OTEA 1LFHA 4NF4A 2DWHA 3IO6A 5L9SA 1B32A 5KDTB 4WEPA 5EYFA 2QPQA 3KN7A 3MVZA 2ONKE 2NVUB 4RPOA 3D4CA 3IX1A 4DZ1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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