1B0LA

Recombinant human diferric lactoferrin
Total Genus 221
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
221
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCTVSQPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of recombinant human lactoferrin expressed in Aspergillus awamori.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LACTOFERRIN)
molecule tags Metal binding protein
source organism Homo sapiens
total genus 221
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-11-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1b0lA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1b0lA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1b0lA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1b0lA03
3C4MA 1B5IA 3GXAA 1S50A 4LZ5A 3C35A 4F1VA 4GXAA 4DZ1A 2OWSA 1MY1A 2O7IA 3ILUB 4NWCA 2QS3A 3K02A 4GXSB 4IO5A 1MM6A 2V93A 4OFJA 2AIXA 3EHTA 3U1OA 3JYRA 3SERA 1OQGA 3O28A 4XTCQ 3KFMA 3G7WA 2BJJX 4YICA 2RINA 5JK4A 4TLMB 3DP6A 3GLBA 1TT1A 4PETA 3A3CA 5H8NB 3OEMA 3K00A 1MXVA 3DELB 4E0XA 3MBPA 5I2NA 1JW5A 4TQUQ 3GBBA 3ZKKA 1Y3PA 1MQDA 4YKIA 4GVOA 3C32A 2GRVA 3E4RA 2VP1A 3KJTA 1XOCA 3FJ7A 4U4XA 1AOVA 2THIA 1MY4A 3CRBA 1B7UA 3PUWE 4EUOA 2I58A 3S9EA 1M5BA 1VE4A 4QF9A 2I48A 1MXWA 1LAGE 4DE8A 1H45A 4FAJA 4PFTA 4BDQA 5I57A 3MQ9A 3DM0A 4RXLA 4NF5A 3TTMA 4H5GA 4HTGA 3OOAA 1N7XA 4JSOA 1UTHB 2XX8A 1B46A 1PB9A 2F6PA 2F5XA 2DE2A 4ZEIA 4THIA 2Q8JA 4ESWA 2DVCA 3VVEA 3FVGA 4DCXA 1ZU0A 3ILTB 4NE4A 5L9SA 4PQJA 5ITPA 2Q88A 1MQHA 2YJPA 4Q8RA 2REJA 1D9VA 3T66A 2DWJA 3Q26A 4IO4A 3KN8A 4IGRA 1NKXA 3M3KA 1USYH 1M5FA 5CM6A 1A54A 2XXPA 1VFEA 3FVKA 3PUVE 5ITOA 2O7UA 1Y3QA 3K2DA 1XHYA 1Y3NA 1H44A 2AL4A 3HCQA 1IITA 1B4ZA 5CC2A 5DTBA 4RY1A 3T96B 4BDRA 2I4BA 1T0KA 2RC8A 4ZEDA 4GWOA 1PBPA 2Z8EA 1LAHE 4GL0A 3PMVA 1ANFA 1NNFA 4EXLA 3PV0E 1QUKA 4G68C 2VOZA 4E0WA 4OWDA 4YKKA 3RY3A 1DMBA 3QSLA 3Q27A 5CI5A 2OBGA 4P0IA 3I5OA 2R6GE 5I59A 3TELA 2XXXA 1Q1KA 2VD2A 4ELOA 2XX9A 4WKMA 4JB7A 1OMPA 1IIWA 4NF8B 1NL5A 3PUYE 4YAHX 1RYOA 5DVIA 1N84A 1AH5A 3UP9A 1UIVA 4PP0A 3IB2A 3RQTA 4YKJA 4M4GA 3PD8A 2D21A 3HO7A 5DEXB 4R72A 3B6QA 1TFDA 4R74A 1PEBA 2ONSA 4QFPA 1ZLQA 3FVNA 5I56A 3CG3A 2PVUA 1LFHA 4QSEA 2F34A 2A5TB 3EHSA 1I6AA 2A5SA 3K1NA 4QHQA 1QKAA 4LP2B 3L6GA 5BUUA 1B4HA 2GHAA 4GLIA 1MXUA 3U93A 4RPNA 5L9MA 3KEIA 4ISUA 2HZLA 2DOJA 3TAJA 3K1MA 1SQYA 3VLWA 4PFWA 3P7IA 2PYYA 4U22A 1P1QA 4F1YA 1DTZA 4Q30B 4PE5B 3RN8A 1FTOA 4N07A 4ELPA 1LAXA 2P0SA 2PMSA 4MH5A 3T9HB 1B32A 1EH3A 4OTEA 2HCAA 4MLQA 2O51A 4RNSA 2HAVA 4I9DA 5L8DA 2O84X 3S4UA 5AA2B 1FQBA 5A5XA 1JW1A 1JVYA 4GF8A 4NF6A 2H25A 2DXYA 2Y7IA 3KZGA 5TP9B 2XD3A 2DQVA 3VXCA 4XKQA 5B7DA 3CFZA 3TUSA 3PGFA 4JWYA 3ZKLA 1BP5A 3TTLA 1EZPA 1BTJA 3TCGA 2Z8FA 2PBWA 2QS4A 4DIGA 1MPDA 1N7WA 4OERA 3KOTA 1H76A 1GVCA 3G3IA 2OWTA 3N94A 1YAEA 3B7DA 3DP4A 5EHMA 1MXXA 4G4PA 3SEYA 3O6HA 4IGTA 4ELQA 3JZJA 3CI8A 1PBQA 3BBRA 5TPAA 1QW0A 3D4CA 4LONB 3G3FA 3V5AA 2H4IA 2G29A 1FQDA 3EN3A 4QSDA 3MP8A 3LSFB 1F9BA 4F2OA 2NOOA 5DVJA 3A3UA 1SW5A 3M3LA 2V3QA 4YMBA 3PPPA 3FJMA 3RLFE 4NTLA 4OXVA 1ZTYA 3UIFA 2WKYA 3AXFA 4RPOA 1B51A 5CRYA 1Y20A 4IB2A 4YB5A 2ZMBA 1SW1A 3TQWA 3C31A 3UA8A 3VLVA 5H8HB 5KDTA 3QK6A 3C34A 3FXUA 3S9LC 4G68A 5KZTA 3FASA 1B58A 1P1NA 2QL3A 1NMUA 2ONKE 4Q0CA 3CSBA 1MG1A 4Q5TA 2X26A 3I3VA 4IO7A 4OFLA 1N3WA 2F8DA 2XXTA 3EF7A 2XXVA 2H99A 1O7TA 1P99A 4YMAA 4F3SA 2V3TA 2DXRA 5ISUA 3VVFA 3A09A 4F1UA 2KLFA 4YB6A 3IJOB 4LZ7A 3RUMA 3H3GA 3LSLA 3KN7A 1UTBA 3B6WA 5JEIA 4OEUA 3RTFB 2XXUA 4OQOA 4KCCA 2AL5A 3FJGA 3H6TA 2X7QA 1WDNA 4ZDMA 5I58A 2FA7A 2F36A 1FQAA 3FXRA 4EDPA 1OLAA 2GHBA 5AA4A 3N26A 1B3HA 1IEJA 3OMBA 3UGWA 3VLUA 1IXGA 2RF1A 4KYDA 2B3FA 3USDA 4U4SA 2ZXTA 3QUFA 1FQFA 3PPRA 1IXHA 4GD5A 5DT6A 3QIMA 1MXYA 5KCJA 4NF4B 1LGBC 1HSEA 3H6WA 5CBSA 4G8MA 4LATA 1OIBA 5FTHA 4HW8A 5JTYA 3GBAA 2XXQA 1O63A 1XVYA 4RK2A 1MXZA 3TMGA 3KSJA 2PX1A 3CFLA 5FHMA 3HSTA 4X48A 3FIRA 3KG2A 4P0GA 1B0HA 4ND9A 3SETA 2XXWA 3MP6A 3OO7A 3MC2A 3IB1A 5I57B 3ECRA 4NF5B 1P1WA 5K2YA 3SEXA 4F39A 1B05A 4X9TA 1FCKA 4OYVA 3H6UA 4M1VA 3O66A 4GOTA 2Y7RA 4ZZEA 4OMBA 1URSA 3VV5A 4H0WA 4EQBA 1P1UA 1B40A 1MDQA 3VVDA 3C33A 3ZS6A 1ATGA 5HPQA 3M3FA 4FEDA 2W7YA 3DP8A 3C9HA 1XT8A 2RKMA 3MVXA 2GFEA 5I2KA 5H8NA 4F3GA 3FV2A 2QPQA 3IL1B 1OLCA 3CFXA 1XS5A 3IOVA 3QYTA 1B1XA 4IY6A 4DDDA 1SI0A 1XVXA 4IY5A 3CSGA 3IX1A 3R26A 2ALUA 4HS7A 4BLAA 4JBZA 4GRKA 5H8FA 3S9NC 1LFGA 4OHNA 2I3WA 1MY0A 5H8QA 2YPNA 3D4GA 3UN6A 4X1BA 3RGYA 3WAEA 5B70A 1SYHA 4I8CA 1WVJA 1SW4A 2O6AA 4O3BA 2G93A 3MVWA 1N3XA 4TLLB 4EQ9A 2UYEA 4NWDA 2CMOA 4JDFA 1SDXA 4GFRA 3OXNA 3I6VA 5I59B 2DWAA 3SEUA 1JNFA 2OK2A 1S7YA 1Y4TA 4KFQA 5CMKA 1YPNA 4YZZA 4G77A 1OVTA 3IJXB 4UA8A 4NEDA 1TFAA 2ZNSA 3CG1A 3FGSA 3LC8A 3HPIA 3OELA 1H43A 3IB0A 1SYIA 4KI0E 3MWBA 1Y1MA 4FE8A 1CB6A 4ELRA 3N5LA 3MZBA 3KOSA 2Q2CA 3LSXA 4FORA 1DPEA 2ZNTA 5I56B 1LCTA 2VD3A 3E3KA 1YTVA 1O64A 4PFUA 1D3KA 2AYSA 5M2VA 3G3HA 4F29A 1I69A 4OZ9A 4R2BA 2RCBA 2DE3A 3G3GA 2D3IA 1QVSA 3K6WA 2I49A 2ZNUA 4DCYA 1QULA 1GTKA 1LBCA 3MPKA 3LSWA 3Q25A 2Y84A 3TCFA 1LBBA 1USYE 2XXIA 1Y4CA 3H6VA 1PDAA 5DVFA 4MLVA 4YU0A 4G2ZA 1VFDA 4N13A 4H8IA 4ONYA 4NF8A 2RC9A 3PMXA 3TTNA 3UORA 1HSLA 1R6ZA 4OEVA 4H67A 4N6PA 4AB6A 4NF6B 1LAFE 3SESA 1MY3A 1AMFA 4KD5A 1ZMGA 1FTLA 5DEXA 4JWXA 3PPNA 2DWIA 4LUBA 3W9WA 1ZBMA 1VR5A 4Z7EA 2M8CA 5F1QA 3E13X 3BFUA 2A5TA 3T9XB 4F2QA 3K6VA 2I0BA 4YKPA 2DP8A 1DOTA 1JQFA 4HCWA 3O2AA 4GQOA 4XIGQ 4EXKA 1B3GA 1MQIA 3R7XA 1EZ9A 3TFLA 4F3PA 2E1SA 1NFTA 4QRZA 2NXOA 3N6UA 1NNKA 2HAUA 2QMXA 3VXBA 4WXJA 2QRYA 2Y7PA 1NNPA 3ODBA 1MH4A 2HFBA 4FJPA 1BIYA 3FV1A 3CVGA 4AB5A 1BLFA 4DXUA 2PT1A 5AA2A 1NNTA 2DS9A 4U2RA 5AA1A 4ZEKA 1B0LA 4R73A 4F19A 1MPBA 4G68B 5TP9A 1N76A 1B1HA 3KSXA 3OSQA 2NWJA 5AA2D 1Y1ZA 2HEUA 1B6HA 3CR9A 1TXFA 3QAXA 4IO2A 3N6TA 3U8QA 3U94A 5ELVA 4C1UA 2O1LA 3BKIB 2XX7A 3HHFA 2XXHA 3M8UA 3EHUA 1TWYA 1B3EA 4YB7A 2H5YA 1MQJA 1URGA 2F78A 4I62A 2Y7WA 3V8XB 1LFIA 2Q2AA 3IOUA 4POWA 1PB7A 3KGCA 3F11A 3PUZE 2F7BA 1Z7NE 4KYSA 3ONMA 4GIZA 1II5A 1UTBB 2D5WA 1HSJA 2QS1A 4AQ4A 2P1SA 2B65A 4IO6A 3FATA 4JWOA 3TODA 4C0RA 3MPLA 2UVGA 3ZSFA 2QJEA 1J1NA 1B52A 3PPOA 4F31B 5CBRA 5I58B 1JEUA 4H5FA 3MP1A 3KN3A 3U72A 2Z8DA 3MZ1A 3OO6A 3RPWA 3OSRA 5HBCA 3SDFA 5CMBA 1RKMA 2RCAA 5KCJB 3O9PA 3O6GA 1IXIA 2ZYKA 4LVQA 1I6QA 2FNCA 3T22A 1FQEA 1A55A 1SW2A 1PB8A 3IO6A 4LQ2A 3TYHA 2VGQA 3FVOA 2Q9TA 3SKPA 1UQWA 4R6YA 3S2VA 4EF2A 1A8FA 2ONRA 5I2NB 4C1TA 3K0VA 3PUXE 1IXCA 5J1DA 3OENA 2OLBA 1SI1A 4R75A 3RT8A 1A8EA 4LQ5A 2R71A 1L5TA 4OFOA 3TZAA 4U1OA 4JXIA 2I6EA 4I1DA 3IO4A 3K1PA 1M5CA 2DWHA 4ZE9A 3PD9A 5I2KB 1B2HA 4RYAA 4NF4A 1IZ1A 3Q29A 3W9VA 2PT2A 2NUVA 5CMMA 2UVHA 3G3KA 4QFLA 4KHZE 3IOWA 2XXYA 2F6GA 1SD3A 4RK9A 3T9UA 3DLNA 1A7LA 3K4UA 4EF1A 5FHNA 5H8FB 3V89B 1WODA 2HQ0A 5H8QB 1ELJA 1SBPA 4H1XA 4IO3A 3MUQA 5FTIA 2ESNA 3QUJA 3U92A 1IQ7A 1JVXA 3KJ7A 5DYHA 2O68A 1GR2A 3LUYA 3MZ9A 3MJNA 4BDNA 2ZYMA 1D9YA 2F7CA 1XC1A 2B3BA 4DLDA 2E0SA 1OVBA 4NMYA 4KPTA 1A40A 4QFNA 4ZEBA 4RA1A 2V25A 1MQGA 1AIVA 1DSNA 3K6XA 4PFYA 4H6DA 4U23A 2QS2A 4P11A 1Q35A 2LAOA 2QSXA 4TOZA 1I6BA 3KBRA 1S9TA 2REGA 4QFKA 1Z7ME 2V84A 4EQ7A 3EQ1A 2X7PA 4FECA 1UTHA 5F7VA 1US5A 1MY2A 3FD3A 1DPPA 4KR5A 3JV9A 1ZKBA 4KYEA 1M5EA 2OZZA 5TU0A 4KCDA 2H98A 5IAIA 3T93B 3TCHA 3TQLA 1POY1 4BDMA 1GV8A 3BFTA 3PPQA 2HXWA 2DSFA 5ICTA 1FQCA 1FTJA 4R9FA 2ZYOA 1IUDA 1ZJLA 2F7AA 1MS7A 5LOMA 1GGGA 3W15C 4Z0IA 4U1ZA 2OCUA 1LCFA 1JETA 1B5JA 5AA3A 3VDFA 2IEEA 3K01A 3MW0A 3G3JA 4O3CA 3L6HA 1Y9UA 5BWJA 2I0CA 1QUIA 5EYFA 3K6UA 4R6KA 2DE4A 3Q28A 5L9OA 5ICQA 4ZE8A 2I4CA 1R9LA 1ZIUA 3TTRA 3VE1B 4R2FA 1A99A 3B6TA 2O1MA 1KWHA 3GZGA 1RYXA 5A5XB 1B3FA 1D4NA 3VFJA 2UVJA 3THIA 1LLSA 4O3AA 4WEPA 1B7HA 4G8HA 5EHSA 3TEPA 1AL3A 2QMWA 3TDJA 3QXMA 2XHDA 3T9VA 1JEVA 3UK4A 1US4A 3RNNA 2FYIA 4KQPA 1LSTA 1MDP1 2Z23A 4H8JA 3IORA 4G8NA 2OJTA 1R1NA 5I84A 5H8SA 4X1DA 1MH3A 4QSCA 1QJMA 4QFOA 1EZOA 3IAZA 5TPAB 4OESA 2R9JA 1B3LA 4ZS9A 3FUZA 5AE4A 2Y7KA 1QKBA 1M5DA 1R9QA 1MPCA 1MRPA 1FTMA 3HN0A 3SEVA 4FEBA 3FZVA 3EPEA 1POTA 1B7ZA 2Z22A 2F97A 3FXQA 3IOTA 3SEWA 3O6IA 4MF3A 3C36A 4K3FA 4BDOA 4ZZAA 3TTKA 3MVYA 1URDA 4FIMA 2UVIA 2V3UA 3O97A 3H7MA 3HHGA 3V83A 3S9MC 1VSOA 3PU5A 4U21A 4DXCA 3MVZA 2DYXA 5KDTB 1DTGA 4LA9A 1UIUA 1B5HA 1P1OA 4POXA 4RJZA 2IA4A 4XKPA 2ZYNA 4XKRA 1SVXB 4F18A 2GH9A 2YLNA 4GL8A 2HZKA 3WAFA 2RC7A 1YCJA 5FHOA 2UXAA 1BKAA 4H65A 1OQHA 1QUJA 4LZ8A 4MBPA 1FTKA 4MFIA 1NH8A 3RT6B 3MAMA 3OD7A 2XXRA 3HV1A 1PC3A 1N04A 3TKDA 3LBSA 5K2XA 4JSDA 2VHAA 3R6UA 4FATA 2DVZA 3LR1A 4ZECA 4F3BA 3OO9A 2I3VA 5IKBA 4HCYA 4DXBA 4WEDA 2XD2A 3IR1A 2ABHA 3OEKA 4XXUA 1NH7A 5AA4B 4BDLA 3OO8A 1CE2A 5HM4B 4R9GA 4UACA 1N0TA 2CZLA 1LB8A 5H8HA 2UYFA 4ESXA 3H06B 4OETA 1H3DA 2Q89A 4OENA 2O69A 3IK6B 4R6HA 1EU8A 1FW0A 4ZEFA 2NVUB 4L17A 2F35A 1MM7A 3CIJA 5JTYB 3O29A 1B9JA 3H03A 4ECFA 3H4ZA 2H9BA 4XKNA 5CMCA 1JW4A 1LB9A 2ANJA 3PMWA 3RTWB 4F22A 3TPAA 2P2AA 3E9XA 4OVJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C4MA 1K9YA 4GWXA 1B5IA 3GXAA 1S50A 4LZ5A 3C35A 4F1VA 4GXAA 4DZ1A 2OWSA 1MY1A 2O7IA 3ILUB 4NWCA 2QS3A 1LBXA 3K02A 4GXSB 4IO5A 1MM6A 4AS5A 2V93A 1DCUA 1LBWA 4OFJA 2AIXA 3EHTA 3U1OA 3JYRA 3SERA 1OQGA 3O28A 4XTCQ 3KFMA 3G7WA 2BJJX 4YICA 5DW8A 4JVDA 2RINA 5JK4A 4TLMB 3DP6A 3GLBA 4PF8A 1IMBA 1TT1A 4PETA 3A3CA 3ISPA 5H8NB 3OEMA 3K00A 1MXVA 3DELB 4E0XA 3MBPA 5I2NA 4G61A 1JW5A 4TQUQ 3GBBA 3ZKKA 1Y3PA 3LUZA 1MQDA 4YKIA 4GVOA 3C32A 2GRVA 3E4RA 2VP1A 3KJTA 1XOCA 3FJ7A 4U4XA 1AOVA 2Y5LA 2THIA 1MY4A 3CRBA 1B7UA 3PUWE 4EUOA 2I58A 4PFIA 4I40A 3S9EA 1M5BA 1VE4A 4QF9A 2I48A 1MXWA 1G0IA 1LAGE 4DE8A 1FPGA 1H45A 4FAJA 4PFTA 4BDQA 5I57A 3MQ9A 3DM0A 4RXLA 4NF5A 1FPBA 3TTMA 4H5GA 4OVSA 4HTGA 3OOAA 1N7XA 4JSOA 1UTHB 2XX8A 1B46A 1PB9A 2F6PA 2F5XA 2DE2A 4ZEIA 4THIA 2Q8JA 4X8RA 4ESWA 2DVCA 3VVEA 3FVGA 4DCXA 1ZU0A 3ILTB 4NE4A 5L9SA 4PQJA 5ITPA 2Q88A 1MQHA 2YJPA 4MJOA 4Q8RA 2REJA 1D9VA 3T66A 2DWJA 3Q26A 4IO4A 3KN8A 4IGRA 1NKXA 5T3JA 3M3KA 1USYH 4MEVA 1M5FA 5CM6A 1A54A 2XXPA 1VFEA 3FVKA 1RDYA 3PUVE 5ITOA 2O7UA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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