1BLFA

Structure of diferric bovine lactoferrin at 2.8 angstroms resolution
Total Genus 207
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
207
sequence length
685
structure length
685
Chain Sequence
NVRWCTISQPEWFKCRRWQWRMKKLGAPSITCVRRAFALECIRAIAEKKADAVTLDGGMVFEAGRDPYKLRPVAAEIYGTKESPQTHYYAVAVVKKGSNFQLDQLQGRKSCHTGLGRSAGWIIPMGILRPYLSWTESLEPLQGAVAKFFSASCVPCIDRQAYPNLCQLCKGEGENQCACSSREPYFGYSGAFKCLQDGAGDVAFVKETTVFENLPEKADRDQYELLCLNNSRAPVDAFKECHLAQVPSHAVVARSVDGKEDLIWKLLSKAQEKFGKNKSRSFQLFGSPPGQRDLLFKDSALGFLRIPSKVDSALYLGSRYLTTLKNLRETAEEVKARYTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLNREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVKQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSTSPLLEACAFLTR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Three-dimensional structure of diferric bovine lactoferrin at 2.8 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
molecule tags Iron-binding protein
total genus 207
structure length 685
sequence length 685
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA03
1RKMA 4LA9A 1SBPA 3USDA 4DLDA 1MH3A 1OQGA 4F3BA 1VE4A 4LUBA 2H25A 1NNPA 4OTEA 1R9QA 4GVOA 1LSTA 3E13X 4KHZE 1IQ7A 1VFDA 1QUJA 3K6UA 2F36A 3FASA 2F7CA 5CRYA 1QUKA 2DXRA 3PD9A 2XXVA 3ZSFA 3O66A 3H03A 4GRKA 5I57A 1Y4CA 1B05A 3VXCA 5H8FA 2YJPA 4EXLA 5AA3A 3VVDA 4OXVA 4F18A 2QS1A 4C1TA 5TPAB 1JW4A 2ZYOA 4LVQA 3UN6A 5ELVA 1JVYA 3OELA 2BJJX 5LOMA 1O64A 4ZZEA 1UQWA 2Q2AA 4OETA 1DTZA 3IO6A 2UVHA 2M8CA 3O29A 4IO4A 3M3FA 3E4RA 1MDQA 1MY4A 3IB1A 4LQ2A 1LCTA 5CM6A 3Q26A 4DCYA 1A8EA 4NF6A 1QKAA 3TYHA 4FIMA 4BDQA 2XD2A 4GF8A 5BWJA 3I3VA 3JZJA 3KJTA 4PE5B 1O63A 1NNFA 3FD3A 2NVUB 1L5TA 2F8DA 1YPNA 3TUSA 1SQYA 2O1LA 1RYXA 5AA2D 1MXUA 1JETA 5AA2A 4K3FA 3QSLA 2Q88A 2I4CA 1ZKBA 2VP1A 2H99A 4ELOA 3K1MA 4ZEDA 1US5A 2H4IA 1UIUA 2OLBA 1LGBC 2V25A 2ZMBA 3GBBA 4PFTA 3K0VA 3GBAA 4F1YA 1GV8A 4FEBA 2FNCA 4KYDA 2HQ0A 1IIWA 3ZKKA 5KCJA 1NKXA 2OJTA 3RLFE 2HAVA 2P2AA 3EHTA 1B7UA 4RPNA 3L6HA 5F1QA 3KBRA 4Q5TA 3TCFA 2ESNA 4F39A 1B5IA 3M3KA 2D5WA 4TQUQ 5I58A 2XX7A 4FE8A 3K6XA 2O7IA 3ZKLA 2ZYKA 4EDPA 2G93A 1MQGA 4G68B 2G29A 3G3IA 1DPPA 3CG1A 4HCYA 1B0HA 1ELJA 3N94A 5I59A 4GQOA 1Y3NA 5I2KA 1H44A 4QFNA 1M5BA 1ANFA 3IL1B 3MJNA 4RK9A 2XXRA 1FTKA 3VLUA 1MXZA 2Z22A 4M4GA 2RCBA 2HAUA 2B65A 3FXRA 1MRPA 4IGTA 3PMVA 3U8QA 3Q29A 1H45A 3TTNA 1ZLQA 1RYOA 4F1VA 1HSLA 4YICA 4H5FA 1QVSA 3UP9A 5I84A 3RTWB 3OENA 4PFYA 2VHAA 1SW5A 2I0CA 1Q35A 3KSJA 5FHOA 1AOVA 3JV9A 2QS3A 4I1DA 4KR5A 4L17A 4F3GA 3C9HA 1B46A 4OENA 1JEUA 4QHQA 3SEVA 3TZAA 1P1QA 5ITOA 1XOCA 3TELA 2DVZA 3K02A 2F35A 4GL8A 1IXHA 2UVJA 3FIRA 4RA1A 1NH7A 4ESXA 4U1OA 1OVBA 2Q9TA 1A99A 3TTLA 2OWTA 3W9WA 3DP8A 3JYRA 5CBRA 4H8IA 2O69A 2DYXA 4ESWA 1M5EA 2I58A 2D3IA 4U2RA 1FQDA 3ONMA 3Q25A 2FYIA 5TPAA 3IJOB 3S9LC 4ZEFA 3TCGA 3FV2A 2CZLA 4BDOA 3MPLA 4KD5A 4EQ7A 1I6AA 5DYHA 1LAHE 3OEMA 4FECA 2PT2A 4POWA 1F9BA 4HTGA 4X9TA 2VOZA 3N26A 1B7ZA 4MLVA 2XX9A 2B3FA 2QS2A 4KCDA 3OOAA 4XXUA 4ELRA 3PPPA 3O9PA 3BFUA 1SDXA 3KFMA 2OCUA 3RT8A 1SYHA 3VXBA 4AB5A 4KI0E 4ZEBA 4EQ9A 4OFLA 5L9SA 3S9NC 3SETA 2DWAA 1UTHB 1ZU0A 4ZE9A 2WKYA 5AA1A 2H98A 1OLCA 2RC9A 4XKRA 3B6QA 1MXVA 4MBPA 3H3GA 3PPNA 2I0BA 3H6WA 4N13A 2DE4A 3A09A 2ONRA 2IA4A 3K6WA 3IOUA 4GWOA 1SVXB 1BIYA 4JDFA 3PPQA 1A54A 4WKMA 2PYYA 3MQ9A 1LLSA 1H3DA 3O6GA 3KGCA 3V5AA 4LP2B 1MG1A 4QFPA 3RPWA 3H6TA 2DWJA 3BBRA 3M3LA 2YPNA 1MY3A 4WEPA 5TU0A 4RPOA 4G68A 4MLQA 2R6GE 1MQDA 2X7PA 1FW0A 3QK6A 1DOTA 4U4SA 1XS5A 3FV1A 4WXJA 1Y3PA 3T93B 3KN7A 3CFZA 3LR1A 3FXQA 4N6PA 2KLFA 3LC8A 4NEDA 3N6TA 3U94A 5I56B 4YMBA 4TLMB 3T9UA 3AXFA 1CE2A 1B3EA 1IZ1A 2DVCA 2RC8A 4XIGQ 2DE2A 4IO7A 2DQVA 3V83A 3PUZE 1MPDA 4GIZA 1LAXA 2UVGA 2AL4A 1BP5A 4DDDA 1B2HA 3U1OA 3BFTA 1JW5A 3WAEA 1PB9A 3HSTA 5TP9B 4F22A 3TTMA 4U4XA 3SDFA 1MPBA 3TTRA 3MBPA 4E0WA 3RY3A 2F6PA 1PBQA 3FGSA 3A3CA 3SEWA 4OVJA 1FTLA 3EQ1A 4R74A 3HCQA 3TQWA 4IO6A 3QUFA 4IGRA 4Q30B 1LFHA 5F7VA 4G8NA 1POY1 1JQFA 2OWSA 3Q28A 2V84A 2V3TA 3HV1A 3T9XB 2F7BA 3G3KA 2HEUA 3RNNA 4JSOA 1B5HA 1USYH 3IO4A 1FQFA 1DMBA 3IORA 4FORA 1GTKA 1D9YA 3QYTA 4GFRA 4YKKA 3QUJA 4NMYA 3TAJA 1FCKA 5AA4B 1EH3A 1T0KA 2RC7A 3CIJA 3VDFA 1PC3A 3LSXA 1UTHA 4RK2A 3GXAA 1NMUA 3FVKA 1XT8A 2REGA 1D4NA 5J1DA 1I6QA 4M1VA 5FTIA 3IB0A 5H8NB 3IK6B 3D4CA 4GD5A 2XHDA 2DWIA 4H6DA 1N3WA 1LCFA 3R26A 1SW1A 2VD2A 1H43A 3RGYA 3N6UA 2GRVA 2F34A 4EF2A 3OO7A 3HO7A 1I69A 3RN8A 2AL5A 3CFLA 3K1NA 3T96B 4R2FA 4OHNA 2O68A 3MPKA 1HSEA 4R6KA 2P1SA 1B6HA 3MZ1A 3SEXA 1AH5A 4EQBA 1A55A 1B51A 2V3QA 1N0TA 2ZXTA 3ILUB 1QULA 2Y7WA 1JW1A 3H6VA 5CI5A 2A5SA 4F3PA 3R6UA 1MQIA 3PV0E 1B4ZA 1MY1A 3S2VA 4FAJA 3SEUA 2HCAA 1MY2A 5I56A 4DXUA 2F7AA 1MY0A 4IO2A 2ANJA 1PBPA 2OZZA 4F1UA 3C33A 2I48A 2IEEA 3TEPA 3HPIA 2QRYA 1URDA 3ZS6A 5KZTA 1B0LA 5EHMA 2QS4A 4O3AA 2O51A 3HHFA 4FJPA 2Z23A 3TFLA 3E3KA 2VD3A 1LFGA 5TP9A 2XXUA 4QFOA 3G3FA 4WEDA 3MP6A 2F6GA 3L6GA 3IR1A 3MC2A 3QXMA 4YB6A 2HFBA 2HZKA 3G3JA 1ZTYA 3FJ7A 4NF4B 1A7LA 1JVXA 1D9VA 1IXIA 1R6ZA 3FZVA 1LAGE 1P99A 4JB7A 1D3KA 4I9DA 4I62A 1LFIA 1NNKA 2F97A 1EU8A 1NFTA 3B6WA 1MQHA 4GL0A 4Z7EA 4DZ1A 4X48A 1BKAA 3CR9A 4P0GA 4OQOA 3A3UA 4G77A 4KYEA 5ICQA 4ECFA 3TTKA 2O6AA 3OO6A 4OMBA 5IKBA 1US4A 2PX1A 1CB6A 4FEDA 4ELQA 2O7UA 2PT1A 1MXXA 4LZ8A 3IOVA 2DOJA 1GVCA 1R9LA 1ZIUA 2FA7A 4BLAA 5B7DA 5AA4A 2R9JA 4BDLA 4H8JA 4OEUA 2DXYA 5BUUA 4OERA 1PDAA 4KQPA 3VV5A 1FQEA 1FTMA 3K00A 2ONSA 3LSFB 3OSQA 1Y1ZA 1TFDA 3DP4A 1QKBA 2A5TB 5H8NA 1B1HA 2Y7PA 4NF8B 3MVXA 1N7WA 3PUXE 1JNFA 4YB7A 1GGGA 4QRZA 1NL5A 3OEKA 2RCAA 2Z8FA 2I3VA 3VFJA 2ZNUA 1N84A 3G7WA 4OWDA 2PMSA 3EHUA 3IOTA 1N7XA 2VGQA 1N04A 1A40A 4ZE8A 4O3CA 1WVJA 1MH4A 3WAFA 2UXAA 4F2OA 1QUIA 1B52A 4QSEA 1S9TA 4H5GA 1OQHA 5DVJA 4RXLA 3HHGA 2F78A 4GXAA 3ILTB 3MZBA 5DT6A 2RF1A 3C34A 4C1UA 1UIVA 4H1XA 1P1WA 3PPOA 2H9BA 1B5JA 4YU0A 4IY5A 1FTOA 1PB7A 5CMKA 3C35A 1ZJLA 1ZMGA 3QAXA 3LUYA 1MPCA 4POXA 1Y20A 3KG2A 3UA8A 2I6EA 4Q0CA 3FJGA 4Z0IA 4AQ4A 5DEXB 1HSJA 4YB5A 1Z7NE 1MXWA 3VVFA 2ONKE 3VE1B 1LBCA 5H8SA 2AYSA 4OESA 3W9VA 1UTBB 4YKIA 1LB8A 5FHMA 3LSWA 4G4PA 4R9GA 5HBCA 3IAZA 1AIVA 4LATA 4KPTA 4HCWA 1BLFA 1SI1A 3TQLA 5A5XB 3T9VA 5H8HB 4NF4A 5EYFA 1EZPA 2I49A 4G8MA 2GHBA 5JK4A 2ALUA 4OFJA 3UORA 4R73A 1SD3A 5CBSA 2DS9A 1IXGA 5FHNA 5I2NB 3CRBA 3K1PA 4HW8A 3O6IA 4ND9A 4RY1A 3N5LA 3OMBA 1SI0A 1J1NA 1P1OA 3MVYA 4DXCA 2Q89A 1PB8A 2AIXA 1SYIA 2Y7RA 3S9EA 5HM4B 3C32A 3CG3A 2DE3A 3IJXB 2UVIA 3EN3A 2DP8A 2PBWA 4JXIA 5K2YA 4IB2A 2H5YA 3OD7A 3FUZA 1B32A 4P0IA 3K4UA 2W7YA 4FATA 5CMMA 1M5FA 3LSLA 4NTLA 4G68C 2QMXA 3SERA 1XHYA 4G8HA 1Y1MA 4GOTA 1FQCA 4X1DA 4ZEIA 3C36A 2A5TA 4NF8A 3O6HA 4TOZA 3I5OA 5EHSA 2PVUA 4XKPA 3TMGA 5ISUA 1OVTA 3CSBA 4OYVA 4H65A 2QMWA 1FQBA 4THIA 2LAOA 4IO3A 2V93A 4R6YA 3TDJA 1LBBA 3CFXA 4NF5B 2X7QA 5DVIA 1MS7A 1P1NA 4QSCA 3CSGA 1USYE 3RUMA 4ZEKA 4RNSA 2XX8A 3GZGA 3QIMA 3KZGA 2HZLA 2ZYNA 3ODBA 4LZ7A 3MP8A 4NWDA 4F19A 1NNTA 1QW0A 1FQAA 2UYFA 4JSDA 1N3XA 3GLBA 3PUVE 1Y9UA 4IY6A 4XKQA 4KYSA 4EF1A 4QFLA 4NE4A 1PEBA 3PMXA 3U72A 5DEXA 3BKIB 4EXKA 1AMFA 3MVWA 5H8QB 1KWHA 4TLLB 3KEIA 1DSNA 3CVGA 1Q1KA 2XXWA 1UTBA 4EUOA 3KOSA 3R7XA 4DIGA 5L9MA 2R71A 4PP0A 2E1SA 4RJZA 1M5DA 3VLWA 2THIA 1B3GA 4X1BA 2QJEA 3S9MC 5CMCA 4R6HA 1Y4TA 4PFWA 1TWYA 4R2BA 2D21A 5A5XA 3MWBA 3K01A 5H8HA 2E0SA 1OIBA 3OO9A 4AB6A 1MQJA 3T9HB 4GLIA 2QPQA 1IEJA 3PU5A 4KCCA 1EZ9A 1TFAA 3D4GA 3KJ7A 2XXPA 2I4BA 3I6VA 5L8DA 4C0RA 3PPRA 5I2NA 2F5XA 4OEVA 1NH8A 5ITPA 3TODA 3V89B 1FTJA 2XXQA 3FATA 2V3UA 1O7TA 3EHSA 2Y7KA 3PUYE 5B70A 5KDTB 4LONB 3H4ZA 4UACA 3TPAA 1ATGA 2X26A 5IAIA 4QF9A 3IB2A 3H06B 2QSXA 4QFKA 4JWYA 4I8CA 1OLAA 4F31B 3PMWA 4LQ5A 1MXYA 1WODA 4KFQA 4BDMA 2CMOA 3Q27A 2NWJA 3IX1A 4H0WA 3FVNA 3C31A 1XVYA 4JBZA 3TCHA 3MAMA 4U1ZA 3FVOA 1BTJA 3H6UA 4OZ9A 3K2DA 4ZZAA 2B3BA 5AE4A 3KOTA 4XTCQ 5JTYB 3E9XA 2DSFA 3DLNA 1DPEA 1IITA 1XVXA 2Q2CA 1JEVA 3K6VA 2XXIA 4H67A 2OBGA 3T22A 4PFUA 4F2QA 4JWOA 4LZ5A 5DTBA 2UYEA 2P0SA 5L9OA 1H76A 4N07A 3SESA 3B6TA 4RYAA 3DP6A 3ECRA 4YZZA 4NF5A 3KN3A 3SKPA 3P7IA 1SW4A 4U23A 2RINA 3O2AA 1XC1A 2ZNSA 1A8FA 3HN0A 2GFEA 4PQJA 4MF3A 2Z8DA 1POTA 1B3FA 4F29A 1B3LA 1WDNA 2RKMA 3O28A 1VR5A 4R75A 1GR2A 1IXCA 4BDNA 3MUQA 4MH5A 5CC2A 3FVGA 5JEIA 3C4MA 1B9JA 1IUDA 1I6BA 1TXFA 2I3WA 3DELB 4ISUA 2DWHA 1QJMA 5I57B 4YAHX 3RT6B 1MM7A 1S50A 2Q8JA 4ELPA 3FJMA 5H8FB 4NWCA 2GHAA 5H8QA 3KN8A 1TT1A 3H7MA 2Y84A 3THIA 1S7YA 2GH9A 2HXWA 4U22A 2XXTA 3O97A 2XXHA 4ZDMA 3UIFA 1Z7ME 1YCJA 3M8UA 4U21A 2ZNTA 1R1NA 3UGWA 2Y7IA 1URGA 3VVEA 3OO8A 3G3HA 1B7HA 3W15C 1YAEA 3G3GA 4NF6B 3S4UA 4PETA 1B1XA 3RQTA 4E0XA 1MDP1 2O84X 2OK2A 2NOOA 4O3BA 3EPEA 4GXSB 3F11A 3MZ9A 5K2XA 4Q8RA 1DTGA 3KSXA 4YKPA 4IO5A 4MFIA 3PD8A 4YMAA 2YLNA 5DVFA 3LBSA 5CMBA 5AA2B 5KDTA 5M2VA 4DE8A 1N76A 3U92A 2ZYMA 1VSOA 1ZBMA 1VFEA 4XKNA 4JWXA 3IOWA 1URSA 4OFOA 4BDRA 1AL3A 4DXBA 1B4HA 4R72A 1SW2A 2Z8EA 4ZECA 3UK4A 3VLVA 2NXOA 4ONYA 4R9FA 5KCJB 1OMPA 2NUVA 3OXNA 3B7DA 3RTFB 4HS7A 4ZS9A 1P1UA 2O1MA 1B58A 5I58B 1EZOA 4F3SA 3V8XB 5JTYA 4P11A 1YTVA 2XXXA 3MW0A 3OSRA 3T66A 2XD3A 1II5A 1LAFE 4YKJA 4UA8A 3TKDA 3FXUA 1B40A 5I59B 1MM6A 3PUWE 3PGFA 2QL3A 3DM0A 5ICTA 2XXYA 3SEYA 1LB9A 3MP1A 1B3HA 4QSDA 3U93A 1M5CA 3EF7A 2REJA 5I2KB 3CI8A 1Y3QA 3MVZA 5HPQA 2ABHA 4DCXA 5FTHA 4G2ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MSTA 1RKMA 4LA9A 1SBPA 3USDA 4DLDA 4JVCA 5EQ8A 1MH3A 1OQGA 4F3BA 1VE4A 4LUBA 2H25A 1NNPA 5ET5A 4OTEA 1FBGA 1R9QA 4GVOA 4PGNA 1LSTA 3E13X 4KHZE 1IQ7A 1VFDA 1QUJA 1FPFA 3K6UA 3RPLB 2F36A 3B8BA 3FASA 4OVTA 2F7CA 5CRYA 1QUKA 2DXRA 5J16A 3PD9A 2XXVA 3ZSFA 3O66A 3H03A 4GRKA 5I57A 1Y4CA 4GX3A 1B05A 3VXCA 5H8FA 5F24A 2YJPA 2HPGA 2Q8MA 2QVRA 4EXLA 5AA3A 3VVDA 4OXVA 4F18A 2QS1A 4C1TA 2PFYA 2CEYA 5TPAB 1JW4A 1NV6A 3FXBA 2ZYOA 4LVQA 3UN6A 5ELVA 2P3NA 1JVYA 3OELA 2BJJX 4PF8A 4X04A 5LOMA 1O64A 4ZZEA 1UQWA 2Q2AA 4OETA 1DTZA 3IO6A 2UVHA 2M8CA 3O29A 4IO4A 3M3FA 3E4RA 1MDQA 1MY4A 3IB1A 4LQ2A 3KC0A 1LCTA 5CM6A 3Q26A 4DCYA 1A8EA 4NF6A 1QKAA 3TYHA 4FIMA 4BDQA 2XD2A 1LBXA 4GF8A 5BWJA 3I3VA 3JZJA 3KJTA 4PE5B 1O63A 1NNFA 3FD3A 2NVUB 1L5TA 2F8DA 1YPNA 4MCOA 3TUSA 1SQYA 2O1LA 1RYXA 1YYZA 5AA2D 1MXUA 1JETA 5AA2A 4K3FA 2KQZA 3QSLA 2Q88A 2I4CA 1ZKBA 2VP1A 2H99A 4ELOA 3K1MA 4ZEDA 1US5A 5EQ7A 2H4IA 2XWOA 1UIUA 1G0IA 2OLBA 1LGBC 2V25A 2ZMBA 3GBBA 4PFTA 3K0VA 4P9KA 3GBAA 4F1YA 1GV8A 4FEBA 2FNCA 4KYDA 2HQ0A 4MJOA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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