1CB6A

Structure of human apolactoferrin at 2.0 a resolution.
Total Genus 226
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
226
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of human apolactoferrin at 2.0 A resolution. Refinement and analysis of ligand-induced conformational change.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Iron transport
total genus 226
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 1999-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A03
3I3VA 4MLVA 3MP8A 1ANFA 4JSOA 3FXRA 1SQYA 1URDA 4RK9A 1O63A 3V89B 1LAGE 1NH7A 4GIZA 4LVQA 5F1QA 4FECA 4PFYA 2PT2A 2Q2CA 2G93A 1US5A 4Q8RA 2V3TA 3O29A 4OMBA 1NNKA 5CRYA 2OJTA 5ISUA 1N84A 4NF6B 3CIJA 3MBPA 1WVJA 4U1OA 3S9EA 2QS4A 1LFGA 3DELB 3O66A 1QKAA 4UACA 3KOSA 2F7BA 2F34A 2XXPA 2ZNTA 4O3CA 4YICA 3VDFA 1MY0A 1LAXA 4QSDA 4G68C 2R71A 4BLAA 3K6WA 1B7HA 4EQBA 3OEKA 2Y7KA 2Y7WA 4G77A 5I2KA 2UVJA 1FQFA 2H98A 1O7TA 3TMGA 3ILUB 1Y3PA 3FJMA 1SBPA 4KPTA 1UTHB 4DLDA 3RUMA 4H5GA 1AH5A 5TPAB 3SEYA 1T0KA 2OBGA 2HXWA 3W9VA 3A3UA 5CBRA 4POWA 2RINA 4P0GA 1B6HA 3VV5A 4R75A 3TCGA 3MVYA 4H1XA 1I6AA 3A09A 1PEBA 4IY5A 1USYE 4Z7EA 1Y1MA 4IO7A 3Q25A 3TQLA 3R26A 4BDOA 5CMMA 1ATGA 4NF6A 1DOTA 1PB8A 2P0SA 4EUOA 2XX8A 1M5FA 4IO5A 2O7UA 4JDFA 2O7IA 4N13A 3S4UA 1MQJA 2ZNSA 4G8NA 3G3GA 1XVXA 4LZ8A 1OVTA 1WDNA 5H8QB 4F3GA 4F2OA 2F6PA 3DP6A 4O3AA 4PQJA 1Y4CA 1J1NA 1B05A 3EN3A 5JTYA 4O3BA 2VP1A 2YLNA 2ZMBA 3W9WA 1LB8A 4PE5B 1UTHA 2PT1A 4C1TA 5TPAA 1DTGA 1N04A 3C36A 3OENA 4H8JA 4PFTA 2GHAA 4DZ1A 1A40A 1B4ZA 3ECRA 1IQ7A 3KZGA 1ZJLA 3LBSA 1EU8A 4GFRA 3PUZE 3QIMA 1MXYA 3H6TA 1EZPA 3WAFA 2A5SA 1MXWA 1IZ1A 4GL8A 3T9VA 4GXSB 2ZYOA 2NXOA 5HBCA 5ITOA 2VD3A 2Y7RA 3W15C 2DWIA 3USDA 1JW5A 3K6XA 5FTHA 4XTCQ 4X1BA 4HW8A 2HQ0A 4R74A 4AB5A 4JWXA 5K2XA 5L8DA 5I56B 4BDNA 3PUVE 4YKPA 4F3PA 1LCFA 1UQWA 1DMBA 4DXUA 4ECFA 3IJXB 3IO4A 3OO8A 1H45A 1Q1KA 5AA4B 1RKMA 3H6VA 1MPCA 2XXUA 5H8QA 2YJPA 2ANJA 4I1DA 2QS3A 3OSRA 1M5BA 1B58A 1FTMA 4C1UA 4I62A 3VE1B 1ZBMA 3K1PA 4XKQA 5ELVA 4BDRA 1H3DA 3PU5A 3H7MA 4TOZA 1IEJA 1ZTYA 2HFBA 3KN7A 4F22A 2RCBA 3C34A 1Z7ME 1QUKA 4MH5A 3BFUA 1A7LA 1LFIA 1MY3A 1FQAA 4LATA 4P11A 3OSQA 3OMBA 2A5TB 2V84A 2DS9A 4FORA 3H6WA 4EDPA 4X9TA 2VOZA 2B65A 3IB2A 2Y7PA 2UXAA 3FGSA 1NNTA 3D4GA 5I57B 4YB7A 4U4XA 1NFTA 2OCUA 3N26A 1SW2A 3KSXA 1XC1A 4AQ4A 4OENA 1R9QA 2ALUA 1DPPA 3V83A 3VXBA 1BLFA 5I56A 3FVNA 3AXFA 4FEDA 3ZSFA 3FATA 2W7YA 4E0XA 2IA4A 5I58B 3S9MC 3FXQA 2KLFA 4KCCA 5I2NB 3KJ7A 3SESA 1M5CA 2PMSA 3GLBA 4LUBA 4F31B 4IY6A 4IO6A 3I6VA 5ICTA 4Q30B 3N5LA 4YB5A 2YPNA 1ZLQA 3MP1A 4ELPA 4R9FA 5JEIA 4KHZE 3IOVA 2AYSA 4H8IA 4OXVA 1TWYA 3PPRA 4OESA 5FHMA 1D3KA 4YKJA 1PC3A 1MDP1 5F7VA 4R72A 3KJTA 2F7CA 4R6HA 5AA3A 2XX7A 3RNNA 3TCFA 2A5TA 1NKXA 4PP0A 4HCWA 3MW0A 4UA8A 3SEUA 2ZYMA 2XXHA 3CVGA 3K02A 2V93A 2P1SA 4R2FA 5I57A 1GVCA 2PBWA 2O69A 3QXMA 1QUIA 3RPWA 3E9XA 2XXTA 4R73A 4ZEKA 2ZYNA 1PB9A 3MJNA 4IO4A 3K6UA 2I0CA 2OLBA 1URGA 2HZLA 1YAEA 3CR9A 3V8XB 3H4ZA 1B3LA 2ONSA 1EZ9A 3SEXA 3GZGA 5A5XB 5I58A 2DXRA 3FZVA 2H4IA 3TTRA 1SYIA 2DE3A 5I2NA 3S9LC 3SERA 3FASA 5B70A 4H5FA 1B4HA 4GRKA 5M2VA 2XXVA 3KEIA 4QRZA 4QSEA 5TU0A 4U23A 4OERA 1JQFA 3SEWA 1MQGA 3FD3A 4LP2B 4X1DA 3CFZA 1URSA 3Q28A 1B5JA 1MQHA 4QFOA 4EXKA 2HZKA 1B5IA 3B6WA 4ELRA 1M5EA 3EHUA 2FA7A 4RPOA 3KSJA 3G3JA 1I6BA 3UA8A 2PX1A 3TELA 3LUYA 3WAEA 1II5A 3O9PA 1FTLA 2F36A 1B46A 4DCYA 2DVZA 5HPQA 3OELA 3N6UA 1S50A 3TTNA 3EHSA 2D21A 3OEMA 1N7WA 1D4NA 1EZOA 5ICQA 3CFXA 5CI5A 5ITPA 3ONMA 3HV1A 1D9VA 3K1NA 3T93B 2F97A 5A5XA 1CE2A 4DXBA 3PMWA 5H8NA 4H65A 3N6TA 3TQWA 3U8QA 1N7XA 2VD2A 4QFKA 4OEVA 3E13X 1MXVA 2E0SA 1MXUA 3GBBA 4N6PA 5DEXB 3TZAA 5L9SA 5DVFA 5AA2B 4F2QA 1SDXA 1XVYA 4H67A 4WEPA 3FV1A 1JVXA 4RA1A 2GFEA 3VVEA 3JYRA 1F9BA 4OTEA 1BTJA 4Q0CA 1TFDA 1JW4A 3G3KA 2THIA 2B3FA 1XOCA 5IAIA 3HSTA 2O68A 4GWOA 3MZ1A 3ZKLA 3MUQA 3L6GA 3MVXA 2QRYA 5AE4A 1LBBA 5KDTB 4RXLA 3VVDA 1AL3A 2B3BA 1GTKA 1LBCA 4TLLB 5TP9B 2XXYA 2Q89A 4ZEFA 4I8CA 3RY3A 4QFPA 3HO7A 1OIBA 5I59B 2DXYA 4GL0A 3TCHA 2I48A 3PPPA 2I3WA 2REJA 3QUFA 1XS5A 3G3IA 5DEXA 2RCAA 5AA2A 1VFDA 1O64A 2PVUA 4FAJA 2QJEA 1SI1A 3C31A 1Q35A 4F19A 2DWJA 2QMWA 2HEUA 2OWSA 4YMAA 4XXUA 4NF8B 4K3FA 1NNPA 2AL4A 4ELQA 2NUVA 3G7WA 4ZZAA 4YB6A 5AA1A 3TKDA 3TTKA 3K0VA 5KDTA 4NF5B 1VR5A 2Z8EA 2M8CA 4XKPA 1JVYA 3FIRA 4NEDA 5TP9A 4LQ5A 1LCTA 5LOMA 3LC8A 3T96B 1N0TA 5I59A 3B7DA 4JB7A 2HAUA 1P1NA 4XKNA 1Z7NE 4JXIA 4POXA 4I9DA 3PUYE 4EQ9A 4ZEDA 3OO9A 4YZZA 1H43A 4MLQA 3ILTB 1I69A 3SKPA 4KI0E 3T9XB 1MY4A 3UORA 2O51A 2Z23A 2Y7IA 2RC8A 2Q2AA 4FE8A 4G4PA 4ZE9A 4FEBA 4LZ7A 3CG3A 3PV0E 1S9TA 4NTLA 4FJPA 2AL5A 4QSCA 3IB0A 4ZEIA 2UYEA 5H8FB 3T22A 3IK6B 1US4A 3VLWA 4YKIA 4NF8A 4KD5A 2DQVA 3CI8A 4G8HA 3DM0A 3N94A 4NF4B 1ZMGA 2RC7A 2RKMA 1UTBB 4DXCA 5DVIA 1BP5A 3MZ9A 3H6UA 1FQEA 5BUUA 3HHFA 4NF5A 2DE2A 2QSXA 2I0BA 5H8HB 3E4RA 1SD3A 4JWOA 4Z0IA 5EHSA 1P1OA 1FTOA 1L5TA 1SVXB 3H06B 4LZ5A 2F5XA 1DPEA 3IJOB 4M4GA 3DLNA 2R9JA 5KCJB 2HCAA 1UIVA 2O1LA 2DSFA 3E3KA 3DP8A 3UP9A 5AA4A 3R6UA 2RF1A 2D3IA 1AIVA 4LONB 4NWDA 1B51A 5H8FA 3FJGA 2ZXTA 1MY2A 5I84A 3Q27A 4X48A 4FIMA 2I3VA 1IUDA 3SEVA 3RTFB 4E0WA 3PMXA 4NF4A 4OVJA 5HM4B 2OK2A 2ESNA 1R6ZA 1FW0A 3HPIA 1UTBA 1B9JA 1S7YA 4IB2A 1MXZA 4F1YA 2O84X 5FHNA 2I6EA 3VXCA 4F18A 1PDAA 3CFLA 3LSXA 3TYHA 4QF9A 1B1XA 3GBAA 5H8HA 3OO7A 1XHYA 3KGCA 4ESWA 1PBQA 2V3UA 3S2VA 3ZS6A 1OMPA 3B6QA 1B40A 2F6GA 5FTIA 1MRPA 5IKBA 4MBPA 4JSDA 1R1NA 1IITA 3TTMA 2XHDA 1TT1A 2CZLA 2I4CA 4RNSA 4ZECA 2F7AA 3MZBA 4OFLA 3VLVA 5KCJA 3CSGA 2QL3A 3PUXE 2ABHA 4OHNA 3VFJA 4NE4A 2AIXA 2P2AA 2DP8A 2PYYA 1JNFA 1MPBA 4YMBA 3TODA 2XXIA 1FQDA 3HN0A 4U21A 4U1ZA 3RQTA 1P1QA 1ELJA 4WEDA 1JEVA 2HAVA 1YPNA 1OQGA 3M3KA 4FATA 4KCDA 1JETA 2NWJA 1MG1A 4ELOA 1YCJA 2DYXA 4ONYA 5DYHA 2XXQA 3GXAA 1MDQA 4OYVA 4RYAA 3RT8A 3O97A 1HSEA 4THIA 3LR1A 4KYEA 1TXFA 3O6IA 4QFNA 3Q26A 2DWAA 4G8MA 2UVIA 1IXIA 4H6DA 1DSNA 2H25A 1BKAA 5EYFA 4OFJA 3T9HB 3C32A 3THIA 2UVGA 3MAMA 3MQ9A 4ESXA 1H76A 1Y20A 4AB6A 4RK2A 1OQHA 3UK4A 3PUWE 4HTGA 4EF1A 1MY1A 4LA9A 1HSLA 3QSLA 4LQ2A 1Y3QA 1KWHA 2XXRA 5DT6A 3BFTA 3C4MA 1AMFA 3LSFB 4F1VA 3QK6A 4PETA 1Y3NA 3FVKA 3MC2A 5H8SA 3TTLA 3CSBA 5B7DA 3M8UA 1AOVA 2Q9TA 2XX9A 2ONRA 4C0RA 2QS1A 1A55A 3VVFA 1LGBC 3K01A 1MH4A 3MVZA 3HCQA 2G29A 5DTBA 1B52A 1MS7A 3KG2A 3FVOA 1RYXA 5CM6A 1MH3A 3UGWA 1LB9A 1P1UA 1B1HA 1SW1A 1ZU0A 5JTYB 3K4UA 3RT6B 1FTJA 4GOTA 1PBPA 2ONKE 2OZZA 4OQOA 2Y84A 3QYTA 1B3FA 2X26A 3IAZA 1HSJA 3OOAA 5CBSA 1B7UA 3TEPA 4OZ9A 5AA2D 1IXCA 4IGRA 2GRVA 1P1WA 2E1SA 2F78A 1Y4TA 3JV9A 4N07A 4G68B 3U94A 3SDFA 4GF8A 1LFHA 1B3EA 3IX1A 4ZEBA 5KZTA 2H5YA 3M3FA 3TUSA 3O2AA 5JK4A 1NH8A 3FV2A 2O6AA 5L9MA 3RN8A 1Y9UA 1D9YA 4U22A 3O28A 1FTKA 4ZDMA 2REGA 1H44A 3B6TA 1N3XA 3K6VA 3MP6A 3KN3A 1GV8A 2Z8DA 1SI0A 2XXXA 4OFOA 4GVOA 1MPDA 3F11A 3K00A 3Q29A 3QUJA 1B5HA 4F29A 1B0LA 1BIYA 2IEEA 3CRBA 4YU0A 2X7QA 1IXGA 2XXWA 2RC9A 1OVBA 1YTVA 4GXAA 1VSOA 2V3QA 4QFLA 4M1VA 1A99A 1QULA 4G68A 3TFLA 4OETA 4ZZEA 4KYDA 1FQBA 2X7PA 4R9GA 2NVUB 5DVJA 2QS2A 4GLIA 4MFIA 3U92A 3D4CA 4QHQA 1GR2A 4NMYA 1B3HA 1NMUA 1RYOA 2Z22A 3FUZA 4TQUQ 1QVSA 5K2YA 4GQOA 1NL5A 3O6GA 4EQ7A 2I49A 5L9OA 4WKMA 2I4BA 4ISUA 3T66A 4EXLA 4Q5TA 3KFMA 2CMOA 1N76A 3IL1B 1IIWA 3PD9A 1UIUA 4TLMB 4PFUA 2QMXA 3IORA 2XD2A 3ZKKA 1B3GA 3UIFA 3RGYA 4EF2A 4JWYA 1A8EA 1B32A 3BKIB 5BWJA 2DOJA 4KYSA 4DIGA 3EF7A 4L17A 3TDJA 4DCXA 4F1UA 3BBRA 3LSLA 1LAFE 2ZYKA 4ZE8A 1VFEA 1POY1 5FHOA 3HHGA 4KQPA 1POTA 3LSWA 1P99A 3KOTA 1MM6A 2FYIA 2O1MA 2V25A 1A8FA 4NWCA 1FCKA 3KN8A 3SETA 3U1OA 1B7ZA 3IOWA 4KR5A 1B2HA 3FXUA 2H99A 2OWTA 2UVHA 5CMBA 3K2DA 4MF3A 1NNFA 1ZKBA 1QUJA 3IOTA 3TAJA 2H9BA 3L6HA 4OWDA 4XKRA 3MVWA 3OD7A 4BDQA 4IO3A 4RPNA 1WODA 5CMKA 2Q88A 3IR1A 4ZS9A 4HS7A 4HCYA 4ND9A 5J1DA 1PB7A 3C9HA 1A54A 3K1MA 3IOUA 3M3LA 4OEUA 3OXNA 2F8DA 2F35A 3CG1A 4BDLA 3A3CA 1QJMA 2DVCA 2GHBA 1Y1ZA 2BJJX 3EPEA 4IO2A 2UYFA 1MM7A 4BDMA 2FNCA 2VHAA 2D5WA 2GH9A 1LLSA 3FVGA 1IXHA 1MXXA 3DP4A 1B0HA 3O6HA 1GGGA 2WKYA 1OLAA 4IGTA 3R7XA 1M5DA 1XT8A 4YAHX 4RY1A 3I5OA 1QKBA 2DWHA 5CC2A 2Z8FA 1DTZA 3ODBA 3H3GA 2NOOA 3MWBA 3IB1A 3U72A 1OLCA 3PD8A 4YKKA 3JZJA 1USYH 3MPKA 4F39A 4XIGQ 3RLFE 4P0IA 2I58A 3EQ1A 1R9LA 5EHMA 4KFQA 3VLUA 3T9UA 3MPLA 1SYHA 3PPOA 1JW1A 1MQDA 2LAOA 5H8NB 2R6GE 4PFWA 3EHTA 3C35A 4WXJA 2ZNUA 1JEUA 4H0WA 4DDDA 3S9NC 3TPAA 4RJZA 4GD5A 3C33A 3QAXA 2Q8JA 1SW5A 1CB6A 4R6KA 3FJ7A 3RTWB 3H03A 4U2RA 3OO6A 1SW4A 4U4SA 2QPQA 1QW0A 1EH3A 3PMVA 2DE4A 4G2ZA 3IO6A 3V5AA 3G3HA 3PPQA 1LAHE 5I2KB 4R2BA 4R6YA 3PPNA 3UN6A 3KBRA 3P7IA 4F3BA 1VE4A 1FQCA 5CMCA 4F3SA 1TFAA 1LSTA 4DE8A 4JBZA 1I6QA 2VGQA 2XD3A 3U93A 3PGFA 1N3WA 1ZIUA 1MQIA 3G3FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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