1D9VA

Haemophilus influenzae ferric-binding protein apo form
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
309
structure length
309
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Metal binding protein
source organism Haemophilus influenzae
publication title Crystallographic and biochemical analyses of the metal-free Haemophilus influenzae Fe3+-binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (iron-utilization periplasmic protein)
total genus 115
structure length 309
sequence length 309
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1d9vA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1d9vA01
3FJMA 2DE4A 1FQCA 3H6TA 2Q2AA 3CVGA 4KYSA 3ODBA 1R6ZA 3BFTA 4C1UA 3TMGA 2VD2A 4LA9A 1S9TA 3PPNA 4C0RA 3T93B 4IB2A 5H8QA 3GZGA 1MH3A 2A5TA 3PPRA 3G3FA 5CM6A 4YMBA 5CMCA 2Y7KA 4THIA 5K2XA 4IY6A 4NF5B 4OMBA 1Y9UA 3RGYA 4X9TA 3TDJA 4ZZAA 5B70A 2PX1A 4FEDA 3PV0E 4KR5A 2B65A 1P1UA 4GL0A 4U22A 2QL3A 1QKAA 3OSRA 3I6VA 4OEVA 3BBRA 3CFZA 5A5XB 3D4GA 2D5WA 4PFYA 1LB9A 5JK4A 2UVHA 1IUDA 4NF4B 4RPOA 3QUFA 2O1MA 1MXXA 3MVZA 3RN8A 1FTOA 1WODA 1BP5A 1MY1A 2AL5A 1IXCA 1JEVA 4HCWA 5DVFA 4R2BA 2O84X 1UTBA 3RT8A 4FATA 1EU8A 4FJPA 3W9WA 4I8CA 3K00A 1VFDA 4U4XA 3MQ9A 3A3CA 2PMSA 1R1NA 3Q26A 3C31A 3M8UA 1QVSA 5H8NA 1GGGA 4N13A 4EDPA 1AMFA 1HSEA 4U1ZA 4KQPA 3FV1A 4GOTA 2DWIA 4LZ5A 3RLFE 2I3VA 4EXLA 3SKPA 2Y7RA 4ZZEA 1MS7A 1JW4A 3C36A 2I0BA 4ZE8A 1A8FA 1JNFA 4IO4A 5BUUA 2DOJA 4F3PA 5F1QA 4IO5A 1H76A 1M5EA 1URGA 4DZ1A 4R72A 1Q35A 3K2DA 2UXAA 4IGRA 4F1VA 4OZ9A 1N3WA 3MP8A 3PUYE 1UTHB 4PETA 2YLNA 1PB7A 4N07A 5CI5A 3FV2A 3JV9A 4HW8A 3BFUA 1OMPA 2OZZA 1IXGA 4XTCQ 1ZMGA 3N94A 4U1OA 3C4MA 4YMAA 4ZEBA 2XXXA 4GQOA 4YZZA 4I62A 2H98A 5I2KA 2V3TA 4ZE9A 4TLMB 1QULA 3FD3A 1VE4A 1B7HA 5I57B 4JWOA 3ILTB 4KYEA 1Y4TA 4YB7A 4U2RA 3FASA 4RY1A 2DXRA 4F1UA 5ELVA 1B51A 2XD2A 4TQUQ 1TXFA 2NWJA 5CC2A 3U94A 1AIVA 3O66A 2QRYA 4F18A 3JZJA 3LR1A 4WXJA 3UORA 5I2NB 5KCJB 4O3AA 5KDTA 1Y3NA 2PBWA 4BDNA 5AA2A 3TTMA 3KOSA 1SYIA 1PC3A 1A99A 4QSCA 4ELOA 4PFWA 2Q2CA 1FTLA 3QAXA 3VVFA 2R9JA 3BKIB 4FAJA 1LBCA 2H99A 1HSJA 1B5IA 3OO9A 4Q8RA 5IKBA 1N7XA 3C33A 3QXMA 3VXCA 1FTKA 3G7WA 4OEUA 4F2OA 4KYDA 4KI0E 4ZS9A 2I48A 4OESA 3EN3A 5EYFA 2B3FA 2UVJA 4EQBA 5TU0A 2DSFA 5H8SA 3MW0A 3DP4A 5AA4B 3FVGA 3UGWA 1JW5A 4BDQA 3WAEA 4LZ7A 3S9LC 2D21A 2ZYNA 2DYXA 2HXWA 3QYTA 1LAFE 4RXLA 2DVCA 2W7YA 1QUJA 4H8IA 2WKYA 4L17A 2A5TB 1JQFA 4RNSA 3LBSA 4OFOA 1MQHA 3PD9A 2RC8A 3PU5A 3KSXA 1PDAA 4QRZA 3TQWA 1DTZA 4RYAA 2OCUA 1MPBA 2H9BA 1EZ9A 2X7PA 3MZBA 1GVCA 3ZS6A 3K1PA 3EQ1A 4G68A 1URDA 1POTA 2GH9A 2H25A 3O6GA 2QS3A 2CMOA 2FNCA 1DSNA 2QS2A 3S2VA 1KWHA 1P1QA 4ZEIA 4QFKA 3OO8A 4PP0A 2Y7IA 3FIRA 4RA1A 1P1OA 1I69A 3TTKA 4JXIA 3OELA 4YAHX 1M5BA 5CMKA 4YICA 5DT6A 4KHZE 4OWDA 2Z23A 3FZVA 4XKNA 1ELJA 4NF6A 2RC7A 5TP9B 2R71A 1M5FA 1PB8A 1YTVA 1LAGE 4QFLA 4OYVA 2KLFA 2O68A 4JWYA 2I3WA 3CFLA 4GWOA 4R9FA 2DWHA 4YKPA 1B0LA 1LFGA 2Z22A 3UA8A 1SYHA 4GFRA 3V8XB 2OWTA 4K3FA 3FUZA 1MDP1 4N6PA 3KJTA 4MH5A 2AL4A 1PBQA 3OENA 2ONRA 1MM6A 1FTJA 1FTMA 1H45A 1D9VA 5B7DA 3FATA 2ZYMA 2NUVA 4F39A 1Q1KA 1SBPA 3T9UA 3VXBA 3VLUA 4IO2A 4F3SA 1SD3A 1IXIA 3C35A 4RK2A 4Z7EA 1MQJA 5JTYA 4PQJA 4OERA 5J1DA 1HSLA 1ZU0A 2DWAA 3MVWA 3U93A 5FHNA 3QIMA 4EQ7A 2HCAA 2XXPA 1LGBC 1XVXA 4BDMA 2F6PA 2DVZA 4OFLA 4ND9A 2PT2A 4MFIA 1OLAA 4HTGA 5FTIA 3SERA 3A3UA 3T96B 3U1OA 4NTLA 4O3CA 3G3GA 2QJEA 1NL5A 4UA8A 1P99A 3E4RA 2O1LA 1FQFA 3PPOA 1MRPA 4G77A 1ZIUA 3KFMA 3EF7A 4LVQA 4F19A 4QSEA 4KFQA 3B6TA 3TQLA 3KJ7A 5TPAA 4IO6A 4YU0A 2ONKE 4ZEKA 3N5LA 4QFOA 5F7VA 5FTHA 1NNPA 1WVJA 4HS7A 2DXYA 1MPCA 5ITOA 2HAUA 4ISUA 4BDLA 2ZYOA 3IX1A 1H44A 2ALUA 1LAXA 4ELQA 2NXOA 4ZEDA 3EHUA 4P11A 3O9PA 3OXNA 5KDTB 2Y84A 3DP8A 5AA2B 1EZPA 4R73A 3U8QA 2AYSA 2XXVA 3DLNA 3MPLA 2HQ0A 2VP1A 1B1HA 3T9HB 4QF9A 1XC1A 4XKQA 1B2HA 4GF8A 5DEXB 3TYHA 4MLQA 1B3HA 2A5SA 1ANFA 5H8HA 3IO4A 2UYFA 3K1NA 2QSXA 3S4UA 4ZDMA 2UVIA 2GHBA 4OENA 1GR2A 2CZLA 2OJTA 2PVUA 3H7MA 5ICQA 3QSLA 3HSTA 3K6WA 4U23A 3ILUB 1DOTA 1T0KA 1ZKBA 4GD5A 3TODA 2GRVA 3F11A 3CI8A 5CMMA 2QMWA 1ZLQA 2QMXA 4NE4A 2RF1A 4LUBA 3QK6A 4YB5A 4E0XA 1O64A 3E13X 4R74A 2O51A 1ATGA 3U72A 5ICTA 3SEXA 3TEPA 1Z7ME 1H3DA 2XXRA 1XT8A 2UYEA 3TPAA 1MY2A 4F29A 3VFJA 3K4UA 4BDRA 3OEKA 4BLAA 3IK6B 3R6UA 3LSXA 1NNFA 5KZTA 2HZLA 3HO7A 1DTGA 1TFAA 1IIWA 3IOTA 2F7BA 2ZNTA 2VGQA 1UQWA 1LSTA 4R6HA 3L6HA 2YPNA 1BTJA 3V83A 3TTLA 4MLVA 1LCTA 1IQ7A 4IGTA 1B5JA 4LZ8A 3E9XA 4G8HA 3TUSA 4ZECA 4NF6B 4QFNA 3MBPA 3VLWA 1RKMA 3OMBA 3K02A 2ABHA 1ZTYA 3TTNA 2ANJA 2M8CA 1TT1A 5AA2D 3HHFA 1VSOA 3FVNA 2I49A 2Z8DA 1B4HA 1M5DA 1CB6A 1JETA 3PUXE 4NF5A 3UIFA 4DCXA 1B3LA 3IB2A 3M3KA 1VFEA 4HCYA 4OVJA 1XOCA 2V25A 3PPPA 5A5XA 5L8DA 1FQEA 3K0VA 5HPQA 2FA7A 1XVYA 3FXQA 1N76A 3I5OA 4NF8B 3H03A 1Y1MA 1MPDA 3EHTA 1SDXA 3GBBA 1B5HA 4X48A 1B7UA 3Q28A 1OIBA 3T22A 3H3GA 4QSDA 3ZKLA 3SEVA 4LATA 1B52A 4G8NA 1D9YA 2I6EA 2DE3A 4IO7A 2F78A 3TCHA 1USYE 3CR9A 3KZGA 3PMXA 3OO7A 2O7IA 5EHSA 2XX7A 4WEPA 3EPEA 3TELA 2PYYA 4JSDA 1B7ZA 1NFTA 1BLFA 4DE8A 4O3BA 5H8QB 3TCFA 4M1VA 1EZOA 5I58A 3PD8A 4EQ9A 1I6BA 4H5GA 2Y7WA 2O7UA 3CSBA 2D3IA 3O6IA 3FVOA 5TPAB 3OEMA 1JVXA 1B32A 4R9GA 1US5A 3LUYA 3RQTA 2THIA 1DPEA 1RYOA 3AXFA 1OQGA 4Z0IA 2P2AA 3B6WA 3H6WA 2F5XA 4UACA 1LFIA 3IB1A 5BWJA 4OQOA 4POXA 3UP9A 4YB6A 3UK4A 1N0TA 2F8DA 3PUWE 2P1SA 2XXUA 4C1TA 3T9XB 1D4NA 2R6GE 3HHGA 3RT6B 4TOZA 1LB8A 1MDQA 4EF2A 4RJZA 1FCKA 2XXHA 2ZMBA 1Y20A 1N3XA 1IZ1A 5HM4B 3IB0A 4DDDA 1XS5A 3PUVE 3VLVA 4H67A 2F7AA 2YJPA 5CMBA 4ECFA 1UTBB 2IA4A 2QPQA 3L6GA 4G4PA 3MPKA 1MQDA 4DXCA 3CG1A 3I3VA 4GLIA 1SW4A 4F31B 5DVIA 5H8NB 1Y4CA 4YKJA 1B9JA 3IJOB 2NVUB 4X1BA 3G3KA 4GXSB 1H43A 2ONSA 2Q8JA 4EUOA 1R9QA 2DWJA 3IL1B 1BIYA 1B3EA 1UIVA 1N84A 5I56A 2GFEA 3TAJA 3TKDA 2DQVA 3IR1A 3K1MA 1FW0A 2P0SA 3P7IA 3IJXB 4GL8A 2Q9TA 3H4ZA 2E0SA 1B1XA 1PBPA 1QKBA 3E3KA 5L9MA 3MJNA 4OTEA 1UIUA 4H0WA 3KN3A 3OSQA 2X7QA 2ZYKA 3B7DA 2Q89A 1A40A 5L9SA 1CE2A 1SW2A 2I58A 4QFPA 1MY0A 1DPPA 2PT1A 1JW1A 1QUIA 3O28A 4XXUA 2F34A 4U4SA 3RPWA 1QUKA 3SEUA 5I2KB 3FJ7A 1SI1A 4H8JA 4TLLB 4KPTA 1JVYA 1LBBA 3C9HA 4G2ZA 3PPQA 3FXRA 3V5AA 4G68C 1L5TA 3S9MC 1II5A 4GRKA 1OVTA 2X26A 2RKMA 2OLBA 3S9NC 1YCJA 5H8FA 3K6UA 1PB9A 4XKPA 2DP8A 4FORA 4NWCA 1SI0A 4F22A 1A55A 5AA3A 1FQDA 5CRYA 3SEYA 2ESNA 3UN6A 1AOVA 3IO6A 3KSJA 4LQ2A 4NWDA 5AA1A 2REGA 1TWYA 4E0WA 4LP2B 3C32A 3IOUA 2RCBA 3HPIA 4RK9A 2H5YA 1QW0A 3A09A 1AH5A 5I59A 4ZEFA 1JEUA 5CBRA 3OOAA 3PGFA 3Q27A 1OQHA 1DMBA 3CIJA 3MP6A 4KCCA 3RTWB 1P1WA 2OWSA 3PMWA 2Z8FA 1VR5A 2V84A 3ONMA 2F35A 1SVXB 5TP9A 3H6UA 4MF3A 1POY1 3EHSA 5EHMA 5K2YA 3MWBA 1Y3QA 2V93A 2RC9A 3VV5A 1QJMA 4XKRA 4EXKA 4POWA 2IEEA 3M3FA 4AB6A 3W9VA 1PEBA 1O63A 3KG2A 4M4GA 4YKIA 1B58A 5I58B 1P1NA 3G3JA 1A8EA 1MXYA 4PE5B 4R6YA 1I6QA 2XD3A 3H6VA 3N26A 3SDFA 2XXYA 3IOWA 1TFDA 4I9DA 1NNTA 4JWXA 4OETA 4ONYA 4WEDA 1O7TA 2Q88A 3KN7A 5I84A 3N6UA 2QS1A 3S9EA 3DP6A 5ISUA 1SQYA 4G68B 3VVEA 1MXVA 2VOZA 3T9VA 1MY4A 4P0IA 2NOOA 4H65A 1S7YA 5IAIA 2FYIA 1I6AA 4KD5A 4F3GA 3SESA 3ECRA 4RPNA 4FIMA 3FJGA 4XIGQ 2V3QA 1Y1ZA 1OVBA 1B40A 1NKXA 4Q30B 1LLSA 3TFLA 4QHQA 5FHOA 3HV1A 2B3BA 2REJA 4GXAA 3D4CA 3KOTA 1NNKA 4IY5A 3MZ1A 1B6HA 4OFJA 1B0HA 3TCGA 2F36A 3C34A 1S50A 3O2AA 2I4CA 1B05A 2VD3A 3CG3A 4DXBA 3LSWA 3O97A 4WKMA 4JB7A 3THIA 1R9LA 4DCYA 5AE4A 3MVYA 1M5CA 2HAVA 1MXUA 1WDNA 3VVDA 3MC2A 4JSOA 4F3BA 5HBCA 4X1DA 3ZSFA 1D3KA 1B4ZA 3OD7A 3GLBA 1IXHA 2OBGA 2DE2A 3MVXA 3IOVA 1N04A 1B3FA 4KCDA 4Q5TA 4I1DA 1LFHA 3H06B 4R2FA 5I56B 4MBPA 3KGCA 4FEBA 4NF4A 4PFTA 1LCFA 2LAOA 3RNNA 3CSGA 5JTYB 2XXWA 3FVKA 5LOMA 3RUMA 2OK2A 1NH8A 4R75A 2UVGA 3HN0A 2H4IA 3VE1B 2HEUA 5DEXA 4FE8A 2RCAA 1F9BA 4F2QA 2XX8A 3VDFA 1Y3PA 2BJJX 1MH4A 3R26A 5FHMA 2ZXTA 1MXWA 4FECA 2F6GA 3T66A 5L9OA 1FQBA 2HZKA 3USDA 1NH7A 2XHDA 2QS4A 1FQAA 3QUJA 3HCQA 4BDOA 3KN8A 2F7CA 3G3IA 1MQIA 1J1NA 1OLCA 2F97A 4DLDA 4ESWA 4DIGA 3B6QA 3GXAA 3SETA 4DXUA 4H5FA 5H8FB 4OXVA 1URSA 2I0CA 1SW5A 1N7WA 1B3GA 2O6AA 1AL3A 1Z7NE 1GV8A 2ZNSA 4GVOA 3W15C 4U21A 4ESXA 3OO6A 1UTHA 2XX9A 2XXIA 1RYXA 1US4A 3JYRA 4OHNA 4F1YA 1ZBMA 3LSFB 2V3UA 5I59B 3Q25A 4NMYA 1MXZA 1YAEA 4G8MA 3MUQA 4JBZA 1NMUA 5DTBA 4Q0CA 5H8HB 3RTFB 5ITPA 3MAMA 1A7LA 4H1XA 3M3LA 5DYHA 4GIZA 3R7XA 4EF1A 5I57A 3TTRA 1IITA 1EH3A 4R6KA 3CRBA 4AQ4A 3IORA 3V89B 1MQGA 4AB5A 3CFXA 3ZKKA 3LSLA 2VHAA 1SW1A 1MY3A 3G3HA 1ZJLA 3N6TA 1MM7A 3PUZE 2HFBA 4IO3A 1LAHE 3IAZA 2G93A 3K6XA 5M2VA 3FGSA 4JDFA 3Q29A 3WAFA 3MP1A 5I2NA 1A54A 5KCJA 3O6HA 2XXTA 3KEIA 4LONB 3DELB 3GBAA 1XHYA 2O69A 5CBSA 3DM0A 3SEWA 1USYH 2E1SA 4YKKA 2DS9A 1GTKA 2GHAA 4LQ5A 4H6DA 2Y7PA 4ELRA 2AIXA 4NF8A 5DVJA 4ELPA 2ZNUA 3LC8A 3FXUA 3K01A 4PFUA 1YPNA 3PMVA 2G29A 3K6VA 5JEIA 1BKAA 3U92A 2I4BA 3KBRA 1IEJA 3RY3A 3MZ9A 1B46A 2XXQA 3O29A 4NEDA 2Z8EA 4P0GA 5AA4A 1MG1A 2RINA 3TZAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FJMA 2DE4A 4X8RA 1FQCA 2HPGA 3H6TA 2Q2AA 3CVGA 4KYSA 3ODBA 1R6ZA 3BFTA 4GBWA 4C1UA 3TMGA 4JVCA 4PCDA 2VT5A 2VD2A 4LA9A 1S9TA 3PPNA 4C0RA 3T93B 4IB2A 5H8QA 3GZGA 1MH3A 2A5TA 3PPRA 3G3FA 5CM6A 4YMBA 5CMCA 2Y7KA 4THIA 5K2XA 4IY6A 5IZ1A 2WYKA 4NF5B 4OMBA 1Y9UA 3RGYA 4X9TA 2CEYA 3TDJA 4ZZAA 5B70A 2V4CA 2PX1A 4FEDA 1NV4A 3PV0E 4KR5A 2B65A 1P1UA 4GL0A 4P1EA 4U22A 2QL3A 1QKAA 3OSRA 3I6VA 4OEVA 1NV3A 3BBRA 3CFZA 5A5XB 3D4GA 2D5WA 4PFYA 1LB9A 5JK4A 2UVHA 1IUDA 4NF4B 4PAFA 4RPOA 3QUFA 2KQZA 2O1MA 1MXXA 3MVZA 3RN8A 1FTOA 1WODA 1BP5A 4MAGA 1MY1A 4PDDA 1NI9A 4PF8A 2AL5A 1IXCA 1JEVA 4HCWA 5DVFA 4R2BA 2O84X 2CEXA 1UTBA 3RT8A 4FATA 1EU8A 4FJPA 1YZ0A 3W9WA 4I8CA 3K00A 1VFDA 4U4XA 3MQ9A 3A3CA 2PMSA 1R1NA 4XFEA 3Q26A 3C31A 3M8UA 1QVSA 5ET6A 5H8NA 1GGGA 4N13A 4EDPA 4OVRA 5I7IA 1AMFA 1HSEA 4U1ZA 4KQPA 3FV1A 4GOTA 2DWIA 4LZ5A 3RLFE 2I3VA 5ET5A 4EXLA 3RPLB 3SKPA 2Y7RA 4ZZEA 1MS7A 3SZPA 1JW4A 2HHMA 3C36A 2I0BA 4ZE8A 1A8FA 1JNFA 4IO4A 5BUUA 5IZ3A 2DOJA 4F3PA 5LTCA 5F1QA 4IO5A 1RDYA 1H76A 3B8BA 2VPNA 4AS4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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