1DTZA

Structure of camel apo-lactoferrin demonstrates its dual role in sequestering and transporting ferric ions simultaneously:crystal structure of camel apo-lactoferrin at 2.6a resolution.
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
689
structure length
689
Chain Sequence
ASKKSVRWCTTSPAESKKCAQWQRRMKKVRGPSVTCVKKTSRFECIQAISTEKADAVTLDGGLVYDAGLDPYKLRPIAAEVYGTENQPQTHYYAVAIAKKGTNFQLNQLQGLKSCHTGLGRSAGWNIPMGLLRPFLDWTGPPEPLQKAVAKFFSASCVPCVDGKEYPNLCQLCAGTGENKCACSSQEPYFGYSGAFKCLQDGAGDVAFVKDSTVFESLPAKADRDQYELLCPNNTRKPVDAFQECHLARVPSHAVVARSVNGKEDLIWKLLVKAQEKFGRGKPSAFQLFGSPAGQKDLLFKDSALGLLRIPKKIDSGLYLGSNYITAIRGLRETAAEVELRRAQVVWCAVGSDEQLKCQEWSRQSNQSVVCATASTTEDCIALVLKGEADALSLDGGYIYIAGKCGLVPVLAESQQSPESSGLDCVHRPVKGYLAVAVVRKANDKITWNSLRGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGPLFKDTDSCRFDEFFSQSCAPGSDPRSKLCALCAGNEEGQLKCVPNSSERLYGYTGAFRCLAENVGDVAFVKDVTVLDNTDGKGTEQWAKDLKLGDFELLCLNGTRKPVTEAESCHLPVAPNHAVVSRIDKVAHLRQVLLRQQAHFGRNGEDCPGKFCLFQSKTKNLLFNDNTECLAKLQGKTTYDEYLGPQYVTAIAKLRRCSTSPLLEACAFLMR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Camel lactoferrin, a transferrin-cum-lactoferrin: crystal structure of camel apolactoferrin at 2.6 A resolution and structural basis of its dual role.
pubmed doi rcsb
molecule keywords APO LACTOFERRIN
molecule tags Metal transport
total genus 191
structure length 689
sequence length 689
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dtzA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dtzA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dtzA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dtzA03
4RK2A 5K2YA 4RXLA 1B46A 3I5OA 1EU8A 1RYXA 1XHYA 1NNFA 1R6ZA 5I2NA 4IGRA 3OSQA 3TKDA 4GFRA 4OZ9A 1QULA 5KDTA 4WEDA 3SEVA 4ZECA 3EQ1A 5F1QA 2OK2A 3VVDA 1JQFA 1B40A 2NVUB 3SKPA 3V5AA 3ZKLA 4F31B 1O7TA 1AL3A 2O51A 2I4CA 1MRPA 5F7VA 3G3KA 1JW5A 1NL5A 2Q88A 3DP4A 1O64A 3MUQA 5CI5A 1Y3NA 1MY4A 4OMBA 3LSXA 5BUUA 5EHSA 3Q26A 3T93B 3M8UA 3OOAA 4PETA 2DXYA 1OVTA 1R9LA 1BKAA 5TP9A 1AIVA 4ZEKA 1B3FA 4X1DA 1LSTA 4I8CA 3L6HA 3Q27A 4GVOA 5H8NA 4TOZA 1UTBA 3MC2A 5AA2A 2X7PA 2IA4A 4U23A 4GXSB 4HTGA 1NNTA 3IB2A 3MPLA 3TZAA 1JVYA 5I58A 4X48A 3OO7A 3MZ9A 1M5DA 2F36A 3OEKA 5JEIA 4R75A 2H9BA 3O28A 3RGYA 4R6HA 5JTYB 4RPNA 2G93A 3A09A 3THIA 3FJMA 1MQJA 4OTEA 1MXYA 4BLAA 3CFLA 1MXXA 3RT8A 2PX1A 3K0VA 3S9LC 1HSJA 4NWDA 3IJOB 1I6QA 3ONMA 1ZU0A 1IZ1A 1S50A 3MPKA 2ZMBA 2UXAA 3T96B 3WAFA 5L9SA 3C33A 2I3VA 3PPRA 5M2VA 4NTLA 2Z22A 4KYDA 1VFEA 3VLUA 1H45A 1QW0A 1YPNA 4WXJA 3KJTA 4NF5B 1XOCA 1QUJA 4ZS9A 3K2DA 1A8EA 1LFIA 1P1NA 2DE4A 3PPPA 4EQ9A 4R9FA 4RA1A 4YICA 3HHGA 3ECRA 3VXCA 4AQ4A 3K1MA 3KOTA 4GLIA 1HSLA 1B58A 3FD3A 3MWBA 4JSDA 3UGWA 2O1LA 3O6GA 5HPQA 3KJ7A 4RJZA 1XVXA 1USYE 4AB6A 4JWOA 3PPQA 4ZE8A 4HS7A 4TQUQ 1AH5A 1JW1A 3TCGA 1FTLA 3T22A 2O7UA 1JVXA 4FEBA 3K6WA 2OBGA 3K6UA 4YMBA 2V3UA 4U1OA 2VD3A 3SDFA 1UIVA 1MQIA 3O97A 2Z23A 4LONB 2Q9TA 1DPEA 5I59B 5FTIA 2F7AA 1MM7A 4OETA 4KI0E 4ELQA 4M1VA 1SDXA 4R6YA 1N0TA 2I4BA 1YTVA 4QHQA 5DVFA 3PD8A 1M5BA 2PT1A 1NMUA 3E3KA 3O66A 4U4SA 4ESXA 4X1BA 5DEXB 3ZKKA 5JTYA 3FXUA 3TPAA 1LAGE 3LUYA 2O68A 3MVZA 1IXIA 1URDA 3PMWA 2HXWA 3PMVA 3T9XB 3QIMA 2XX9A 4NF4A 3VLWA 2ZYNA 1B52A 1B0HA 2A5SA 1LB9A 5CC2A 4YKKA 1F9BA 1M5CA 3VFJA 3G7WA 4O3AA 3HHFA 3H6VA 5DYHA 3OD7A 2OWTA 2O6AA 2H99A 4NF5A 1P1QA 3EF7A 1ANFA 4OERA 1B3LA 2RINA 3BFUA 3C34A 3S9NC 1P99A 2RC8A 1B7UA 1JETA 1MY0A 4XKNA 4P11A 4K3FA 3DP8A 2HZLA 5AA2D 5ELVA 4PFUA 3JZJA 3SESA 2PT2A 1URSA 4YKJA 2NWJA 3PMXA 1MY2A 4HW8A 2RF1A 4XKQA 4KFQA 1POTA 2PVUA 4OVJA 3KBRA 4GIZA 1N7XA 3OEMA 4ZE9A 5L9MA 4GRKA 4YAHX 4XXUA 2DWHA 4YB6A 1BTJA 3R7XA 1Z7ME 4LVQA 1MQHA 4THIA 3M3FA 2DWIA 5AA1A 1RYOA 3Q25A 4PP0A 5I59A 1NH8A 4IO4A 1GV8A 3TTMA 5IAIA 1TWYA 1J1NA 3TELA 4U21A 3S9MC 1DSNA 3G3FA 4EF1A 4BDRA 4KQPA 4LQ5A 1DPPA 5FHNA 3E13X 3JV9A 1H76A 3TQWA 2DS9A 2HEUA 4QF9A 3PUWE 4UA8A 5JK4A 2DP8A 3AXFA 4H5GA 2GH9A 3GZGA 3ILUB 3K00A 4R9GA 4P0GA 5H8QB 3H6WA 2QMWA 2WKYA 1B9JA 4GL0A 4ZEIA 3SEYA 1IIWA 1BP5A 3TAJA 1IITA 1A8FA 1IQ7A 1EZ9A 3KGCA 2QS1A 1B0LA 5CRYA 4F3BA 3MVXA 2H98A 4KHZE 3R6UA 2NUVA 4ISUA 1Y3PA 2A5TB 1H43A 1B1HA 2H5YA 3FVOA 3KZGA 2QS4A 1N3WA 2Y84A 1N3XA 5EHMA 3IL1B 3FV2A 1MXUA 3SEXA 1XVYA 2ESNA 4IGTA 1ZTYA 2P2AA 3FV1A 3IB1A 5AA4B 3H4ZA 2O69A 3H6UA 4R73A 2X7QA 1MDP1 3G3HA 2AL4A 4F39A 5CBRA 4QFOA 1LLSA 2CZLA 3LSWA 1MXWA 1B32A 4OYVA 2I49A 3Q28A 5CMKA 5BWJA 2HFBA 2F8DA 5I57B 1DTZA 5KCJB 3K6VA 4NEDA 3QUJA 3MW0A 4KCDA 3CIJA 3IOWA 2VGQA 2XXYA 4F22A 3B6WA 4TLLB 5HM4B 3TMGA 1LAXA 3E9XA 5CBSA 1FTKA 1LCTA 3D4GA 4HCYA 2ZYMA 1US4A 2Y7WA 1FQDA 3PD9A 2QPQA 5ITOA 4BDMA 3PPNA 1ELJA 4R6KA 4H6DA 2E0SA 3MP6A 2DVCA 1VE4A 5L8DA 1MQGA 1SYIA 4XIGQ 3QSLA 3MVYA 3IORA 4DZ1A 1Q35A 4I1DA 4OFOA 3HV1A 4BDLA 1ZLQA 1Y1MA 5L9OA 4QFNA 4LZ8A 4Z0IA 1GR2A 4DXCA 2XXPA 1L5TA 3N26A 4ECFA 1IXCA 4I62A 4I9DA 1LAFE 2P1SA 3DP6A 3TTRA 3EHTA 1B7HA 3FUZA 4DE8A 2ALUA 1POY1 3O29A 1O63A 4C1TA 3BKIB 3ZS6A 2Y7RA 2A5TA 3QAXA 1EZOA 1I6BA 4Q0CA 1MY3A 4UACA 3TCHA 2ZNSA 4R2BA 1FQCA 5CMMA 1NKXA 1OLAA 1S7YA 2XXIA 1LAHE 3T9VA 4LZ5A 3MAMA 5AA4A 3OXNA 3KG2A 3N94A 3B6QA 4GD5A 4OQOA 5H8SA 3B6TA 3ILTB 4F2QA 5I57A 3TTLA 3FVKA 3KSXA 1B51A 1UTHB 1GTKA 5KCJA 1IXGA 3HN0A 3ZSFA 3N6UA 1Y9UA 2AL5A 4G8NA 4NF8B 5B7DA 4OFJA 4H8JA 4OHNA 4JDFA 4DLDA 3MP1A 2Q2CA 4G68C 3IX1A 2D21A 3HSTA 2VP1A 4FEDA 3RUMA 3IO6A 2RKMA 1IUDA 3PUYE 4EDPA 1GGGA 1WVJA 2XXQA 3CRBA 2I0CA 4JB7A 4L17A 1LBBA 4F2OA 4FATA 1II5A 4F1UA 5CMCA 5H8FB 5I2KB 4OEUA 2ABHA 3O6IA 3IK6B 2HCAA 3FXQA 4U22A 2H4IA 1NNPA 3CG1A 3OO9A 3FJ7A 4ESWA 2ZNTA 2FYIA 1MPBA 3USDA 3VLVA 2ONRA 2XHDA 4LUBA 1LFGA 3U92A 4DCXA 4RNSA 4WKMA 3M3LA 4G2ZA 3C35A 4PFTA 1A7LA 4O3CA 4YB7A 3GBBA 4OXVA 1WDNA 2RC9A 1XS5A 4KCCA 2F6PA 3R26A 3TTKA 2XD2A 3TYHA 5H8HB 2I3WA 3UN6A 2RC7A 2CMOA 1MXVA 4IO7A 2DWAA 1PEBA 3K01A 1YAEA 4QSCA 3S2VA 4NF6B 2AYSA 5B70A 4BDQA 3PUXE 5FHOA 3G3GA 4PQJA 4OWDA 3B7DA 1ZBMA 4YKIA 1A99A 3I6VA 4ELOA 4EQ7A 1NH7A 3RY3A 5KZTA 2F97A 1JNFA 3V89B 2XXWA 1MM6A 3CFXA 3W9WA 4ZEBA 1JEVA 3CSGA 3KN7A 1S9TA 4DXUA 1ZMGA 4C0RA 4ZDMA 1UTHA 2OZZA 1PBPA 5CM6A 3DM0A 1LCFA 1MPDA 2Z8EA 2VHAA 2XD3A 4NF8A 2VD2A 4MFIA 4M4GA 1QUIA 2W7YA 4G68B 5EYFA 4FORA 1Y4CA 3CVGA 3GLBA 3KEIA 2DE2A 2DQVA 4JWYA 2BJJX 1XC1A 2Y7PA 3CSBA 4LA9A 3JYRA 4H5FA 4LZ7A 1TXFA 4MLVA 4BDNA 1MQDA 3IOVA 1D9YA 2PYYA 1JEUA 2OCUA 3S4UA 4DCYA 5H8FA 5I2KA 4DXBA 2OWSA 3OENA 4RYAA 4FE8A 1DMBA 3SERA 3K6XA 3VVEA 5I84A 1PDAA 4ONYA 3IR1A 3N5LA 1QKAA 4EUOA 1PC3A 1LFHA 3EHSA 3IB0A 4QFKA 4GOTA 5TU0A 3MJNA 2Z8DA 1EZPA 5K2XA 1FQFA 2R71A 3MQ9A 3TUSA 1H44A 4E0XA 1D9VA 5H8HA 3PUVE 1OIBA 1SI0A 4ZEFA 2UVHA 2Q8JA 3DELB 4IO2A 3O9PA 1M5FA 3IAZA 3D4CA 5H8NB 4NF6A 5DEXA 2DE3A 3CI8A 4QFPA 3C36A 5LOMA 3T9HB 5ISUA 4R2FA 2ONSA 4EXLA 3MVWA 2F7BA 2Q89A 2F35A 1MPCA 2UVJA 4F18A 2ZYOA 3C31A 4NE4A 1Z7NE 3W15C 2XXVA 4IB2A 4IY5A 2X26A 1OMPA 4NWCA 1FQBA 1VR5A 3VDFA 4ELRA 1N84A 3QYTA 4Q5TA 3FVNA 4R72A 3KSJA 3U1OA 3FXRA 4OFLA 2REGA 5AA3A 2M8CA 3K1NA 4MLQA 3H3GA 4FAJA 2VOZA 4YZZA 1AOVA 3BFTA 4F1YA 1P1WA 1B05A 2HQ0A 4QFLA 1FW0A 1I6AA 1B3EA 4PFYA 3H6TA 2Y7KA 4FECA 3LC8A 1B4HA 2AIXA 4N07A 2I48A 1MDQA 3V8XB 2ZNUA 1UIUA 1NNKA 1SBPA 4G77A 3S9EA 3LSLA 2DSFA 2Z8FA 4JBZA 4LQ2A 1OVBA 2F34A 3RQTA 4RK9A 1DOTA 1US5A 4RPOA 2UVIA 1URGA 1SVXB 3KFMA 3T9UA 3TTNA 5ICTA 5I56B 1MH4A 1TFAA 1PB8A 4F3GA 5ITPA 4U4XA 3RNNA 2NOOA 3MZBA 1Y20A 1MXZA 1T0KA 2V3TA 2QMXA 1SW2A 4GF8A 4IO5A 4RY1A 3EHUA 1B5HA 4DIGA 1D4NA 1N76A 1QVSA 4H1XA 3GBAA 1FQEA 2P0SA 3A3CA 2OJTA 4FJPA 3TCFA 3RN8A 4EXKA 4OESA 3HCQA 3TDJA 3G3JA 4QSDA 4AB5A 3G3IA 3M3KA 1Y4TA 2DYXA 3IOTA 1OLCA 3FVGA 3MBPA 2O1MA 2GRVA 2DOJA 1SQYA 3T66A 2D3IA 1FTOA 1A54A 3N6TA 4H67A 3UA8A 1B3HA 2YJPA 5H8QA 1DTGA 3FGSA 2UYEA 2FA7A 2XXXA 3CG3A 3I3VA 3U93A 4WEPA 3OELA 5DVJA 4EQBA 1LB8A 3VV5A 2I58A 2REJA 2PBWA 4QSEA 4MBPA 3CR9A 1SW4A 2F7CA 4PFWA 1EH3A 3UORA 4DDDA 3CFZA 4KR5A 3RTFB 3QUFA 4ELPA 2QS3A 4YMAA 2B65A 3E4RA 4NF4B 1ZKBA 1TT1A 1A40A 5FHMA 3A3UA 3C32A 4O3BA 3KOSA 3KN3A 3UIFA 4KPTA 2OLBA 2QSXA 4R74A 4OEVA 1B7ZA 4GQOA 4HCWA 1PB9A 3OSRA 1OQGA 3K1PA 3FATA 5HBCA 1CE2A 4XKPA 2R9JA 1QUKA 1FQAA 3SEWA 5I56A 3RTWB 1Q1KA 2V25A 1B5IA 1I69A 4ZEDA 1WODA 3U72A 3PGFA 4LP2B 2ONKE 3MP8A 1MS7A 2XXRA 2G29A 4XKRA 1PB7A 1SW5A 1ATGA 1B5JA 4PE5B 3RT6B 3K4UA 4POXA 3SETA 1RKMA 4Q8RA 3PPOA 2GFEA 3TQLA 4YKPA 3BBRA 4LATA 4ZZEA 2F6GA 3W9VA 4Z7EA 1QJMA 1KWHA 2RCAA 5AE4A 1B4ZA 1VSOA 4MF3A 4POWA 2HZKA 3TEPA 1IEJA 4GL8A 2XXHA 2DVZA 2I6EA 4XTCQ 3H06B 2R6GE 1Y3QA 3HPIA 2F5XA 3HO7A 2XXTA 2YPNA 3UK4A 1UQWA 2ANJA 3UP9A 3P7IA 3FZVA 3LR1A 1BLFA 4F29A 1MH3A 3DLNA 2O84X 3FJGA 2LAOA 2I0BA 4KD5A 1N04A 2HAVA 3PU5A 4EF2A 1M5EA 2Q2AA 4G4PA 2FNCA 2DXRA 2KLFA 5A5XB 3EN3A 1JW4A 3IOUA 1FTJA 3OO6A 2IEEA 4Q30B 1H3DA 4G8HA 4H0WA 1R1NA 4F1VA 1VFDA 1AMFA 3OMBA 4G8MA 3C4MA 1B6HA 3IO4A 4TLMB 5IKBA 1LGBC 4JSOA 4E0WA 1NFTA 1ZIUA 4GWOA 3VXBA 4C1UA 1FTMA 3F11A 5TPAB 4ZZAA 1CB6A 5DT6A 4X9TA 3SEUA 1YCJA 1USYH 4MH5A 3KN8A 2B3BA 2V3QA 3PUZE 1A55A 2XX7A 3TODA 5FTHA 1R9QA 5I2NB 4ND9A 4QRZA 1FCKA 3QK6A 5KDTB 2PMSA 2ZYKA 1XT8A 4NMYA 3GXAA 2RCBA 3QXMA 4F3PA 4FIMA 4H65A 2GHAA 1TFDA 1BIYA 4OENA 5DTBA 4YU0A 2F78A 3PV0E 2B3FA 4JWXA 5ICQA 3RPWA 2YLNA 1SD3A 3FASA 4N6PA 4IY6A 2THIA 3MZ1A 3EPEA 3O2AA 4P0IA 4H8IA 1B3GA 2XX8A 1MY1A 2ZXTA 4IO3A 3L6GA 5TP9B 1Y1ZA 3LBSA 1D3KA 2HAUA 4JXIA 4IO6A 2Y7IA 3O6HA 2DWJA 3K02A 1UTBB 1QKBA 1P1UA 1OQHA 5AA2B 3H7MA 4YB5A 2UYFA 3U94A 2UVGA 3TFLA 2QJEA 5CMBA 4N13A 4BDOA 2XXUA 2V84A 4F19A 5A5XA 5I58B 2QL3A 1SW1A 4U1ZA 2H25A 3FIRA 2V93A 1N7WA 3V83A 5J1DA 3LSFB 2QS2A 1GVCA 1IXHA 1B1XA 3VE1B 3ODBA 1MG1A 3OO8A 4U2RA 5DVIA 1B2HA 1LBCA 3WAEA 4F3SA 2E1SA 3C9HA 1HSEA 3U8QA 1SYHA 1ZJLA 3VVFA 2D5WA 2QRYA 4KYSA 4GXAA 2GHBA 5TPAA 2NXOA 3Q29A 3RLFE 4G68A 4KYEA 1P1OA 3H03A 1SI1A 2O7IA 1PBQA 3IJXB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RK2A 5K2YA 4RXLA 1B46A 3I5OA 1EU8A 1RYXA 1XHYA 1NNFA 1R6ZA 1NV2A 5I2NA 4IGRA 3OSQA 3TKDA 2Q74A 4GFRA 4OZ9A 1QULA 2CZIA 5KDTA 4WEDA 3SEVA 4ZECA 3EQ1A 4PFRA 5F1QA 2OK2A 2XA5A 3VVDA 1JQFA 1B40A 2NVUB 3SKPA 3V5AA 3ZKLA 4GWSA 4F31B 1O7TA 1AL3A 2O51A 2I4CA 1MRPA 5F7VA 3G3KA 1JW5A 2CEYA 1NL5A 2Q88A 3DP4A 1O64A 3MUQA 5CI5A 1Y3NA 1MY4A 4OMBA 3LSXA 2OWZA 5BUUA 4GWWA 5EHSA 5LDZA 3Q26A 3T93B 3M8UA 3OOAA 4PETA 2DXYA 1OVTA 1R9LA 1BKAA 5TP9A 1AIVA 4ZEKA 1B3FA 4X1DA 1LSTA 4I8CA 3L6HA 3Q27A 4PF8A 4GVOA 5H8NA 4TOZA 1UTBA 3MC2A 5AA2A 2X7PA 3E78A 4PBQA 2IA4A 3IFAA 4U23A 4OVTA 4GXSB 3RPLB 2ZZVA 1NNTA 4HTGA 3IB2A 3MPLA 3TZAA 1G0IA 1JVYA 5I58A 4X48A 3OO7A 3MZ9A 3LUZA 1M5DA 2F36A 4KXPA 3OEKA 5JEIA 4R75A 2H9BA 3O28A 4R6HA 3RGYA 5JTYB 3BIGA 2V4CA 2HPGA 4RPNA 2G93A 3A09A 3THIA 5J16A 3FJMA 1MQJA 4OTEA 1MXYA 4BLAA 3CFLA 2HXRA 1MXXA 3RT8A 2PX1A 3K0VA 3S9LC 1HSJA 4NWDA 3IJOB 5FBPA 1I6QA 3ONMA 1ZU0A 1IZ1A 4UABA 1S50A 1FBEA 3MPKA 1LBXA 2ZMBA 2UXAA 3T96B 3WAFA 5L9SA 3C33A 4P8BA 2KQZA 2I3VA 3PPRA 5M2VA 4NTLA 2Z22A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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