1EZOA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 57
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA01
3K01A 1B40A 1A54A 5JEIA 3FXQA 4MH5A 3VE1B 2ZYOA 5I59A 3V8XB 3IJOB 2DS9A 5AA4A 2H25A 3K00A 4AB6A 4ZDMA 4G77A 1PEBA 3ZS6A 2QL3A 3RQTA 4TQUQ 5J1DA 2GFEA 1VR5A 4OERA 1UIUA 3RN8A 4N07A 3ZKLA 3GZGA 2Y7IA 3B6QA 4NEDA 2V84A 2ABHA 2X26A 1MXWA 4OWDA 2GHAA 5FTIA 1H45A 1A8EA 4BDQA 4OYVA 1MM6A 2XXWA 4OXVA 3PMXA 3C9HA 4FECA 2VGQA 2F5XA 4KYSA 5FTHA 3VVFA 3MUQA 1XC1A 4OETA 4UACA 4EDPA 4IO5A 2R6GE 1YCJA 1M5EA 2AIXA 3CSBA 1VSOA 4NTLA 1O63A 1TT1A 3G3JA 4KD5A 2Q9TA 2ZNTA 1D3KA 1MPBA 5KZTA 5ICQA 1B46A 1FQBA 1ELJA 4IO2A 1MPCA 4G2ZA 2ZMBA 4YMBA 4R6HA 1Z7ME 2HXWA 4WEPA 1J1NA 4QF9A 3Q25A 4XXUA 1N3WA 3O29A 1Y3QA 2DWIA 3RT8A 1SYHA 2ONSA 1EU8A 3LSXA 1XT8A 2RC7A 1A55A 4LONB 3W9VA 1B6HA 4U4SA 5CMKA 4YAHX 2NUVA 3N6UA 1EZOA 5TPAA 3FIRA 1DTGA 4ESXA 4H67A 4O3AA 2PYYA 5DVIA 3V5AA 3TAJA 3PPNA 1B4ZA 3PUVE 2A5SA 4H65A 3PGFA 4F2OA 3IR1A 3D4CA 1B5IA 5H8HA 5TU0A 2QMXA 4LQ2A 3USDA 3G7WA 2Q8JA 1NNKA 1FTLA 1B3LA 3K1MA 4NE4A 4QFLA 5H8QB 2RKMA 1P1NA 4DCYA 3KSJA 4OMBA 1A99A 3LSLA 3S4UA 3K1NA 3H03A 2O69A 3PPQA 3Q28A 1IUDA 1YPNA 3IK6B 2AL4A 5CMBA 4F3SA 1Y1MA 3V89B 2OJTA 4FEDA 4YB5A 4DDDA 2F35A 3GBAA 2I0BA 2REJA 2DE2A 1JNFA 3K02A 1II5A 5HM4B 4F1UA 4FATA 4G8HA 3CI8A 3VFJA 1MG1A 4RA1A 1DOTA 4ISUA 4U4XA 2ZYMA 4NF4B 4TLMB 3HPIA 2V93A 2QPQA 5AA1A 3RGYA 4H0WA 4FORA 4QHQA 5DTBA 1M5FA 4IB2A 3RY3A 1NNFA 2I4BA 3PD8A 3UGWA 3I3VA 2Z8FA 5I2KA 1N76A 4JWXA 4NF5A 4MLVA 3KOTA 4JWYA 3OXNA 5CC2A 3MC2A 1MQGA 4C1TA 1ZIUA 1OQHA 1FTKA 4POXA 3QSLA 1OVBA 2Y7PA 1F9BA 3E3KA 4U2RA 3CFXA 2XX9A 4LZ5A 2WKYA 2DWHA 3KN7A 1B0HA 3IOUA 4F2QA 3C35A 3OSRA 4P11A 3PMVA 3EHSA 3LR1A 4R6YA 1B51A 1BKAA 2OWTA 3JYRA 3W9WA 3H7MA 3O6GA 4H6DA 3L6GA 4H8IA 2O84X 4F3BA 2VHAA 2Q89A 1B4HA 4DCXA 4ZZAA 4C1UA 1MM7A 4NF8B 4IO6A 3K4UA 4GF8A 5A5XA 4ECFA 2OBGA 3FASA 4R2FA 1LGBC 5M2VA 3I6VA 4NWDA 2QS1A 4MF3A 4X1DA 1NH8A 1TXFA 4R74A 3SETA 1ZJLA 1QUJA 1JW1A 1AIVA 2UYFA 4YU0A 3IO6A 2YJPA 3UA8A 2OLBA 2A5TB 2Z8EA 3K6UA 5TPAB 3G3GA 3E13X 2NXOA 5DVJA 1LCTA 2DP8A 3DP4A 1MDQA 3JZJA 1P1QA 3FVOA 2F7BA 3H3GA 3B7DA 1Y1ZA 4R73A 1TFAA 1R6ZA 4KYDA 2XXQA 1H3DA 2PVUA 4THIA 1I69A 3M8UA 1ZU0A 4H5FA 4KYEA 3SEYA 3H4ZA 5CBSA 4DE8A 3CFLA 1VFDA 3MVZA 4OESA 3T66A 3RNNA 1B32A 3TTLA 5AA3A 3SEVA 4G68C 2DWJA 5KDTB 5L9MA 4YKKA 4POWA 1TWYA 2O6AA 4PQJA 1Y4CA 4EF2A 2H99A 4YZZA 3TQWA 1CB6A 3QUJA 1QW0A 1BLFA 3CFZA 3K6WA 4KQPA 3THIA 1H76A 4R72A 2NVUB 1NKXA 3FJGA 3OEKA 2D21A 5H8NA 1IITA 3RTFB 5ICTA 1SI1A 1D9VA 2VOZA 3IJXB 2ZNUA 3B6TA 5TP9A 5KCJA 4H8JA 2YLNA 3K6XA 2Z22A 4N6PA 1H43A 1ZLQA 3IOVA 2DE3A 4U1ZA 2UYEA 1FTJA 1B58A 1WDNA 1A40A 2LAOA 5ITPA 1B52A 4OFJA 3K6VA 4QFKA 2B3FA 1FQDA 4IGRA 4PETA 3S9LC 1B7HA 4R2BA 1PB8A 3ECRA 1SDXA 3TEPA 5BWJA 3S9EA 2P1SA 3FVKA 4ELOA 4H1XA 4X9TA 3MVXA 3MP8A 4PE5B 1URGA 2O51A 4JBZA 1DTZA 2XD2A 4GVOA 2FNCA 2XXTA 1USYH 5CMCA 2F6GA 1MXVA 4P0GA 3TQLA 2DYXA 3ZKKA 4IGTA 5H8SA 1S7YA 1SI0A 4WKMA 2QJEA 2RF1A 5I2NB 3MW0A 4EQBA 2RINA 3PV0E 1S50A 4YMAA 1NFTA 4NWCA 3O2AA 5DT6A 4OFOA 3QUFA 4WXJA 3VLVA 3D4GA 1B9JA 2UVGA 1O64A 4FIMA 4HS7A 2XXIA 4RXLA 4NF6B 3O6HA 2I0CA 1UTBA 3VDFA 3C31A 5I58A 3KJ7A 3HCQA 3RLFE 4GXAA 1B5HA 4Q5TA 1YTVA 4ELRA 1NH7A 2V25A 3MAMA 4LVQA 3EPEA 4RY1A 4GL8A 4PFTA 1MH4A 1Q35A 5I56B 3ZSFA 3HHFA 1BIYA 2ZYKA 1GVCA 4QSCA 4DXCA 3OEMA 2Y84A 2I3VA 4BDMA 2PX1A 1Y3NA 4OQOA 3OO6A 2F36A 1ZBMA 2Z23A 3SKPA 5AA2B 3OOAA 2H98A 1DPPA 3WAFA 4RYAA 1UTHB 5BUUA 4FAJA 3BFTA 4IY6A 2XXUA 2HEUA 4X1BA 3KEIA 3LBSA 3CSGA 3C34A 4R75A 3G3FA 4F3GA 3U94A 1QULA 1A7LA 1CE2A 1N04A 3CR9A 3WAEA 3VLUA 3TMGA 2X7PA 3K1PA 4M4GA 2QSXA 2V3TA 2E1SA 4EQ9A 1AOVA 3UN6A 1JETA 4YKIA 3TODA 5AA2D 5CBRA 1GGGA 1MQIA 1URDA 2UXAA 2RCAA 2OWSA 1JEUA 5ELVA 4I9DA 1ZKBA 2THIA 1MRPA 2QS4A 1XVYA 1GV8A 3FVGA 3BFUA 5EYFA 2XXHA 5JTYA 3TELA 3EN3A 4KI0E 5H8NB 4JSOA 3TYHA 2HAUA 3ILUB 4G8MA 3PUXE 1SW4A 4OEUA 4XTCQ 5TP9B 4E0WA 3N6TA 4IO7A 3DM0A 4X48A 5FHMA 4JDFA 3RTWB 2VD2A 1AMFA 4I62A 5FHNA 1P1OA 3EHUA 2ALUA 5LOMA 3HN0A 1SW2A 3VLWA 3KN8A 3OO8A 4G68B 1YAEA 3LSWA 4KCDA 4AQ4A 4I8CA 2BJJX 1LB8A 3LUYA 3SERA 4GWOA 2QMWA 1DSNA 1SW5A 3HV1A 3QAXA 4BDRA 4IY5A 4JWOA 4EXLA 3IAZA 3TZAA 5I59B 1N7WA 5AA4B 4K3FA 4ND9A 3I5OA 1LLSA 3OD7A 3TCFA 5JK4A 1TFDA 1LFHA 5IKBA 2DSFA 4IO4A 1IXCA 2KLFA 2Z8DA 2HAVA 3PUYE 4NMYA 5DEXA 1M5CA 5L9OA 1IXGA 3UK4A 3MP6A 1WVJA 2R71A 3LC8A 2XXYA 1ATGA 1POY1 3O97A 3MVYA 3MPLA 2DXYA 2ZYNA 3FXUA 3PUZE 3L6HA 2IA4A 5H8FA 4LZ8A 2F34A 2V3UA 1UIVA 3TTMA 4F1VA 1OLCA 3IL1B 3FD3A 2ANJA 4LA9A 2NWJA 3FJ7A 3T93B 3H6TA 1Z7NE 3MJNA 2UVJA 4P0IA 3T9VA 3GLBA 4ZE9A 4R9GA 3T9HB 4RJZA 2B65A 3N94A 2PT1A 4R9FA 2GHBA 4GL0A 4Q0CA 4XKQA 2H9BA 3M3KA 1RYOA 4R6KA 2X7QA 3C4MA 3TPAA 3T22A 1B3FA 1SW1A 3GXAA 3HHGA 1N3XA 2W7YA 4KPTA 1JEVA 4M1VA 2REGA 2O1LA 1QKBA 4Z7EA 1LAHE 2CMOA 3TKDA 5L8DA 4DZ1A 3U72A 2E0SA 2P2AA 3N26A 3O9PA 4TLLB 5ITOA 1R9LA 3F11A 1MXUA 4OHNA 3PU5A 1EZ9A 3KGCA 2UVHA 1LAFE 3MZ1A 4ELQA 4ONYA 1GR2A 3ONMA 1PB9A 2ESNA 5H8HB 4F39A 4HCYA 1ANFA 3HSTA 1MDP1 4ZZEA 2Y7RA 4RK2A 1SBPA 5I57A 3PPOA 5JTYB 3JV9A 4I1DA 3G3KA 4BLAA 1NNPA 2I58A 1PC3A 2I4CA 4GQOA 1QVSA 1JVYA 4JSDA 4GFRA 2Q88A 5L9SA 1IIWA 3EHTA 1R9QA 1LSTA 1Y3PA 2VP1A 1O7TA 1M5BA 3PUWE 4WEDA 4KCCA 3TDJA 1FQAA 4OTEA 4FJPA 1I6QA 3VXCA 4G8NA 1ZTYA 3IORA 2F7CA 1FQEA 4QFNA 3IX1A 1OMPA 3FVNA 3OMBA 4MBPA 1LB9A 1MPDA 1QUIA 1B1XA 2OCUA 3MPKA 5H8QA 1SQYA 1RYXA 4RK9A 1MXYA 3DP8A 1B3HA 4ELPA 4ZEIA 4XKPA 3B6WA 1MY3A 3MWBA 4U1OA 3FXRA 1I6AA 3SESA 3FJMA 4MLQA 3A09A 5DEXB 5I2KB 4KHZE 4EQ7A 2FA7A 4GOTA 4NF5B 4YB6A 3O28A 4KR5A 2DVCA 5ISUA 1B3EA 1FQFA 1H44A 3T9UA 1LAXA 3SEXA 2HZKA 3C32A 5H8FB 3OSQA 1XHYA 4NF4A 1PBQA 4YKPA 5CRYA 4PFWA 4HCWA 5B70A 2VD3A 3KJTA 5CM6A 3OO9A 1IXIA 4ZEKA 2DVZA 2XXVA 4O3CA 3IB0A 3TTNA 1URSA 2GH9A 1BTJA 5F7VA 4DLDA 2QS3A 1A8FA 2HCAA 1EZPA 1ZMGA 4ZEFA 3MP1A 4GXSB 1IQ7A 3S9NC 5A5XB 4LUBA 3BBRA 3SEUA 3CRBA 3FUZA 2FYIA 3RUMA 4ESWA 4UA8A 3CIJA 1VE4A 1BP5A 1Y9UA 3T9XB 5AE4A 4EXKA 2Q2CA 2AL5A 3PPRA 1B1HA 1B2HA 4KFQA 2HZLA 1WODA 2IEEA 4GLIA 1LBBA 4EF1A 4GIZA 1B3GA 3S2VA 3O66A 3FGSA 1QUKA 3H6UA 1HSJA 4NF8A 1OIBA 1FQCA 2PMSA 1OLAA 3U1OA 2ZNSA 2B3BA 5IAIA 3U92A 3DELB 2XXXA 1NL5A 4QFOA 3Q29A 3KZGA 5I57B 1B7ZA 1N0TA 1N7XA 4EUOA 3MQ9A 4O3BA 1FW0A 2A5TA 1Y4TA 4LP2B 1Q1KA 2G93A 2DOJA 5HBCA 1UQWA 1MQHA 3G3IA 1MQJA 1T0KA 3UORA 1DMBA 1JQFA 3E9XA 1PDAA 3IB2A 4QRZA 3TCHA 1FTMA 2XXRA 1LFGA 3FZVA 3TCGA 3IB1A 3C33A 1XOCA 3R7XA 3PPPA 1B7UA 5KCJB 1MQDA 2XX8A 3ODBA 2I49A 3OO7A 2M8CA 3R6UA 1NMUA 4QSDA 1PBPA 4TOZA 4GRKA 5KDTA 3LSFB 1LBCA 4F31B 4U23A 2GRVA 1LFIA 1MY0A 2PBWA 4Q30B 2QS2A 3M3LA 3KBRA 2H5YA 1SD3A 3U8QA 2RC9A 4F3PA 3IOWA 4IO3A 2YPNA 4LATA 2I6EA 4F22A 2V3QA 4DIGA 4OZ9A 4FEBA 2XHDA 4ZECA 2XX7A 2ONKE 1B0LA 3TTKA 1IXHA 2Y7WA 1JVXA 1HSEA 4MFIA 2ZXTA 2F8DA 1USYE 3OENA 4RNSA 1HSLA 2NOOA 3P7IA 2ONRA 3QK6A 1SYIA 3KN3A 4HW8A 4ZS9A 2DWAA 4XKRA 1N84A 5CMMA 1XS5A 3TUSA 3BKIB 3FATA 5HPQA 4C0RA 3N5LA 1Y20A 1D9YA 3RT6B 2D5WA 4N13A 3A3UA 1GTKA 2HFBA 1UTBB 1EH3A 1LCFA 4ZE8A 5I58B 3S9MC 1M5DA 2R9JA 2PT2A 3KSXA 5I84A 1FCKA 4LZ7A 1DPEA 1JW5A 2F78A 4XIGQ 1OQGA 4RPNA 3HO7A 5EHMA 4BDOA 5I2NA 1D4NA 4OFLA 4ZEDA 4QSEA 3CG1A 4OENA 3C36A 3IOTA 4PP0A 3ILTB 1POTA 4NF6A 2DXRA 3TFLA 3TTRA 5FHOA 1L5TA 3Q26A 2F6PA 1AH5A 3K2DA 3MZ9A 3VV5A 1MH3A 5B7DA 3R26A 1PB7A 3SDFA 1P99A 3KOSA 3VXBA 5EHSA 4BDLA 5I56A 3MVWA 5F1QA 3UP9A 2XXPA 4HTGA 4OEVA 1XVXA 5DYHA 3PMWA 3EQ1A 1AL3A 5CI5A 4F29A 4RPOA 2DQVA 3QXMA 2HQ0A 5AA2A 1P1WA 4G4PA 3UIFA 1UTHA 4GD5A 1MXZA 4QFPA 1FTOA 4YKJA 3DP6A 3KG2A 3PD9A 3VVEA 3KFMA 1LAGE 1S9TA 3FV2A 2O68A 3AXFA 2OK2A 1P1UA 3QIMA 3EF7A 1JW4A 2O1MA 4H5GA 1RKMA 2I48A 3MZBA 3O6IA 4DXUA 1KWHA 5DVFA 3VVDA 2XD3A 4AB5A 2UVIA 4F1YA 1SVXB 3MBPA 5K2YA 3DLNA 3CG3A 1OVTA 3GBBA 2H4IA 3SEWA 1I6BA 4LQ5A 2F97A 3OELA 3Q27A 1MY4A 3K0VA 2Y7KA 4YB7A 3QYTA 4BDNA 4JXIA 3V83A 2Q2AA 1QKAA 2D3IA 1B5JA 4YICA 2AYSA 3H06B 4ZEBA 3M3FA 1IEJA 4PFYA 3CVGA 2QRYA 4F19A 1IZ1A 4JB7A 4DXBA 1MXXA 1US4A 3H6WA 2RC8A 3G3HA 3U93A 4OVJA 4Q8RA 4FE8A 4PFUA 5K2XA 1R1NA 4F18A 2P0SA 3H6VA 4L17A 2RCBA 4U21A 3W15C 2OZZA 1MY2A 3FV1A 1MS7A 4E0XA 1VFEA 1US5A 4XKNA 2DE4A 3E4RA 2O7UA 2I3WA 2CZLA 1B05A 3RPWA 4G68A 2F7AA 1QJMA 2O7IA 1NNTA 4U22A 3A3CA 4Z0IA 2G29A 1MY1A 3T96B 3IO4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XWVA 3K01A 1B40A 1A54A 5JEIA 3FXQA 4MH5A 3VE1B 2ZYOA 5I59A 3V8XB 2F3DA 3IJOB 2DS9A 5AA4A 2H25A 3K00A 4AB6A 4ZDMA 4G77A 1PEBA 3ZS6A 2QL3A 3RQTA 2FHYA 4TQUQ 1NUWA 5J1DA 2GFEA 1VR5A 4OERA 1UIUA 3RN8A 3T0JA 4N07A 4MIJA 2P3VA 3ZKLA 3GZGA 2Y7IA 3B6QA 4NEDA 1YXIA 4H46A 2V84A 2ABHA 2ZZWA 2X26A 1MXWA 4OWDA 2GHAA 5FTIA 1H45A 1A8EA 4BDQA 4OYVA 1MM6A 3MYUA 2XXWA 4OXVA 3PMXA 4PF8A 3C9HA 1NV4A 4FECA 2VGQA 2F5XA 4KYSA 5FTHA 4OVTA 3VVFA 3MUQA 1SPIA 1XC1A 4OETA 4UACA 4EDPA 4IO5A 2R6GE 1YCJA 1M5EA 2AIXA 3CSBA 1VSOA 4NTLA 1O63A 1TT1A 3G3JA 4KD5A 2Q9TA 4GX3A 2ZNTA 1D3KA 1MPBA 5KZTA 5ICQA 1B46A 1FQBA 1ELJA 4IO2A 1MPCA 4G2ZA 2ZMBA 4YMBA 4R6HA 1Z7ME 1IMEA 2HXWA 4WEPA 1JP4A 1J1NA 4QF9A 3Q25A 4XXUA 1N3WA 3O29A 3A29A 1Y3QA 2DWIA 3IFAA 3RT8A 1SYHA 2ONSA 4GBWA 1LBZA 1EU8A 3LSXA 1NV5A 2GQ1A 1XT8A 2RC7A 1A55A 1NV1A 4LONB 3W9VA 2B4LA 4PAIA 1B6HA 1FPIA 4U4SA 5CMKA 4YAHX 3N6UA 4HXVA 1EZOA 5TPAA 3FIRA 1DTGA 4ESXA 4H67A 4O3AA 2PYYA 5DVIA 3V5AA 3TAJA 3PPNA 1B4ZA 3PUVE 2A5SA 4H65A 3PGFA 5ET6A 5EQ9A 4F2OA 4IR8A 3IR1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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