1F9BA

Melanin protein interaction: x-ray structure of the complex of mare lactoferrin with melanin monomers
Total Genus 210
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
210
sequence length
689
structure length
689
Chain Sequence
APRKSVRWCTISPAEAAKCAKFQRNMKKVRGPSVSCIRKTSSFECIQAIAANKADAVTLDGGLVYEAGLHPYKLRPVAAEVYQTRGKPQTRYYAVAVVKKGSGFQLNQLQGVKSCHTGLGRSAGWNIPIGTLRPYLNWTGPPEPLQKAVANFFSASCVPCADGKQYPNLCRLCAGTEADKCACSSQEPYFGYSGAFKCLENGAGDVAFVKDSTVFENLPDEAERDKYELLCPDNTRKPVDAFKECHLARVPSHAVVARSVDGREDLIWKLLHRAQEEFGRNKSSAFQLFKSTPEEQDLLFKDSALGFVRIPSQIDSGLYLGANYLTATQNLRETAAEVAARRERVVWCAVGPEEERKCKQWSDVSNRKVACASASTTEECIALVLKGEADALNLDGGFIYVAGKCGLVPVLAENQKSQNSNAPDCVHRPPEGYLAVAVVRKSDADLTWNSLSGKKSCHTGVGRTAAWNIPMGLLFNQTGSCKFDKFFSQSCAPGADPQSSLCALCVGNNENENKCMPNSEERYYGYTGAFRCLAEKAGDVAFVKDVTVLQNTDGKNSEPWAKDLKQEDFELLCLDGTRKPVAEAESCHLARAPNHAVVSQSDRAQHLKKVLFLQQDQFGGNGPDCPGKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAELQGKTTYEQYLGSEYVTSITNLRRCSSSPLLEACAFLRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Lactoferrin-melanin interaction and its possible implications in melanin polymerization: crystal structure of the complex formed between mare lactoferrin and melanin monomers at 2.7-A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOTRANSFERRIN
molecule tags Metal transport
total genus 210
structure length 689
sequence length 689
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-07-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1f9bA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1f9bA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1f9bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1f9bA03
4FEDA 3ECRA 1ZKBA 2G93A 1MXUA 5KCJB 1IXIA 3C33A 3SEWA 1SBPA 3SEXA 5J1DA 3PUZE 2OK2A 5A5XB 2F6GA 4N6PA 3U92A 4Q8RA 3T9XB 2QS4A 2RC7A 3FV1A 3MPKA 1FQCA 3IB0A 3Q26A 3G7WA 1H76A 1MPDA 1QKBA 1FTKA 5H8FB 4GOTA 2A5TA 5JTYA 1A7LA 5L9SA 3QAXA 4DDDA 3RT6B 5I57B 1MM6A 4MBPA 2VOZA 4YAHX 5CMCA 3O97A 3V5AA 5AA1A 4THIA 3PD9A 1MY3A 3RTFB 1HSEA 4R2FA 3E4RA 1SW5A 2D3IA 2XXIA 5AA2B 2QS2A 1RYOA 4QFNA 2PX1A 5CMMA 2DWJA 3TCGA 3OO8A 4NWDA 1OMPA 1D3KA 2ESNA 1FCKA 4F18A 3HCQA 4F31B 1GR2A 4JXIA 1B40A 1D4NA 4IO5A 4O3CA 4JSDA 1NFTA 4KPTA 1P99A 3FXUA 1P1QA 3MP1A 4KHZE 1H45A 1O7TA 4GIZA 2VGQA 4NEDA 3H03A 1XVYA 4NTLA 3FZVA 3S9LC 4ONYA 4ZEDA 4UACA 3KOTA 3CG1A 3IAZA 1USYE 3M3LA 4OFOA 4LONB 3PUXE 4EXKA 1B3HA 1NNTA 2ONRA 3N6UA 1LAXA 3FIRA 1GTKA 2HAUA 4U22A 2GHBA 4U23A 2RKMA 3HSTA 2Z8DA 2Z8FA 1TT1A 2I4BA 2Q8JA 4KQPA 4NF5A 1N3XA 4DZ1A 4JWYA 4U2RA 3TTMA 3KGCA 2QMXA 4EQ7A 3OXNA 4R9GA 2REJA 1MH4A 5FHOA 4X9TA 2CZLA 3QYTA 3CIJA 4IO6A 4LVQA 2ZYNA 2DOJA 4NF4B 4PFWA 1EZ9A 5KDTB 4GVOA 2X7QA 3V89B 2F97A 3K2DA 4QRZA 1SYHA 2HAVA 2HEUA 4F2QA 3LSFB 4R9FA 1B9JA 3C35A 1L5TA 4ZE9A 4OFJA 2Y7RA 3QUFA 4BLAA 4N13A 5ELVA 2W7YA 3VXBA 1NNFA 5CBRA 4PE5B 1T0KA 3TEPA 3PMWA 5I56A 2UYFA 5K2YA 2HZKA 3JV9A 4JBZA 4YB6A 2P0SA 3K0VA 5ITOA 2F78A 4QFOA 4GL8A 1O64A 1P1UA 2UYEA 1MQGA 3T22A 2O84X 3OENA 3PUVE 1N04A 3VLUA 1H3DA 4F29A 2ZYMA 3MAMA 3MZBA 2PVUA 2A5TB 4HCWA 3KN7A 5JTYB 4TLLB 3S4UA 3VLWA 3UK4A 2HCAA 2F7CA 1DMBA 5L9OA 1VFEA 1XOCA 3PPNA 5CRYA 3PPPA 1Q35A 2X7PA 4O3AA 4OYVA 4ZZEA 5FHMA 5L8DA 1B2HA 2DE2A 3IJOB 1NKXA 1OQGA 5AE4A 1AH5A 1SDXA 3ZS6A 1YAEA 5DYHA 1JVXA 4OENA 3S9EA 1PB8A 1B3GA 3OO9A 1IITA 3HHGA 1JEUA 4UA8A 4F19A 5FTIA 3UP9A 2XX9A 1MDQA 3IJXB 2AL4A 4LA9A 3THIA 2V25A 3W9VA 1LCFA 3I5OA 1MS7A 1LFHA 3K02A 4F39A 3MQ9A 3K1NA 5DVJA 4GRKA 2H9BA 2UVIA 1QKAA 2DP8A 5A5XA 2YJPA 1GV8A 2CMOA 2DWIA 2E0SA 4GWOA 1XC1A 4ELOA 1A8EA 3RUMA 2HZLA 2ZNSA 4U4XA 3GBAA 1MQHA 4IGTA 5AA2D 3D4CA 3CFLA 4RA1A 3T9UA 1NH8A 4LQ5A 4H5FA 3FASA 1B5IA 4MFIA 1BP5A 4ECFA 1BKAA 1ZTYA 3UGWA 3PPRA 4R6KA 3QK6A 4IO2A 2ABHA 1US4A 1B32A 1TFAA 1VR5A 4R75A 1MQJA 2ZXTA 3K4UA 3KN3A 1LB8A 4YMBA 3IL1B 1LFIA 4LQ2A 1MPBA 3TZAA 1MY0A 4FEBA 2D21A 1QVSA 3FJ7A 5I84A 3M3KA 1LB9A 1RYXA 1JQFA 1TWYA 4N07A 1D9YA 1ZMGA 4X1DA 2VD3A 1OLCA 2Y7PA 4PFUA 3TELA 3EF7A 3S2VA 4F3PA 3MJNA 5AA4A 3CI8A 1FW0A 4P0GA 1N76A 4RK9A 5H8QA 1B7HA 2O7UA 3E3KA 4PP0A 4I9DA 3GLBA 5I56B 3FATA 2DWAA 4OWDA 4EUOA 2F36A 4EQBA 1PC3A 4XKRA 1DTGA 4AQ4A 3O6IA 3K6VA 5LOMA 5DVFA 2DXRA 2D5WA 2O51A 4EXLA 3C32A 1URSA 4FORA 2YPNA 1EH3A 4DIGA 2NOOA 3RY3A 4MLVA 3K6XA 4XXUA 3LSWA 1POTA 1IQ7A 4H67A 2HFBA 3T96B 4KR5A 3RNNA 3WAFA 4F3BA 5JEIA 4OXVA 5F7VA 3ILTB 2ZYOA 1PDAA 2X26A 4GL0A 4KYSA 3IORA 4RY1A 3JYRA 1WDNA 1BTJA 1LLSA 2Q89A 3MUQA 4RPOA 4OFLA 1B1HA 4LZ8A 1DOTA 3TCFA 4WXJA 3QXMA 1IXCA 3TMGA 2F8DA 1SQYA 2XXWA 3DM0A 2REGA 1NH7A 3OD7A 2OBGA 3TKDA 5JK4A 2HQ0A 4BDQA 4XKQA 4Q5TA 3U94A 3A3UA 1UQWA 2V3QA 1LFGA 2IEEA 2UVJA 2R9JA 3SEVA 2UXAA 3FV2A 1N7WA 4FATA 3GZGA 4OQOA 1JW4A 1SW4A 2B65A 3HN0A 3FGSA 1KWHA 2GRVA 3N6TA 3FUZA 3TDJA 4HCYA 4PFYA 4QFKA 3OOAA 2DQVA 2DYXA 3DP6A 4F22A 4ESWA 3GBBA 1B05A 4G68C 2F7AA 2KLFA 4TQUQ 5H8HB 3V8XB 2Z8EA 2I3WA 2PT1A 4ELRA 1I69A 4XKNA 4QHQA 1MRPA 3FJMA 3OELA 3B6WA 3Q27A 3TQLA 3R7XA 1B5HA 1DTZA 4R74A 1Y1MA 3U1OA 2XXUA 2XXXA 2ONSA 2GHAA 2GFEA 3T93B 4U21A 5AA4B 3DLNA 1JW1A 1A99A 1DPPA 4WEPA 3TTLA 4R72A 5H8QB 4KFQA 3H6WA 3ONMA 1QJMA 5IAIA 4R6HA 4GXAA 3G3HA 4GFRA 3UN6A 4F2OA 5BUUA 4FJPA 2XXTA 4G8NA 5HPQA 3CFXA 4XTCQ 3K00A 2Q88A 1POY1 1MXVA 3MVWA 4JWXA 2VP1A 4XKPA 1M5EA 5AA3A 1Z7ME 4BDNA 4DCXA 2HXWA 3I3VA 2I0BA 2DVCA 5ICTA 3HHFA 4GD5A 1B1XA 2O1LA 1B4HA 3IOUA 3SESA 2WKYA 2NXOA 3KFMA 1DSNA 5L9MA 4P11A 1YCJA 4QFLA 2B3FA 4YKIA 4F3SA 3M8UA 3EQ1A 3FVNA 3PV0E 4BDMA 4IO3A 1UTBA 4C1UA 1I6BA 2VHAA 1B4ZA 1FTJA 3R6UA 4H65A 5CBSA 1URGA 4JDFA 1UTHA 4RNSA 2AYSA 3O2AA 4DE8A 2FA7A 4NF8A 3MVYA 1AIVA 1Y3PA 3ILUB 2PYYA 5ICQA 3RT8A 3OEKA 1QULA 1WVJA 3C9HA 1SD3A 1B51A 3OO6A 3RLFE 1US5A 1FTMA 1MDP1 2NWJA 1MH3A 3USDA 1IXHA 1BLFA 3Q25A 4NMYA 1LBBA 4MF3A 2O68A 3MVZA 4Z0IA 2XXYA 2QL3A 3H6TA 4GXSB 4WKMA 1QUKA 1S50A 1JNFA 2G29A 4Q30B 1PBQA 3OO7A 3K01A 3F11A 4DXUA 1LAHE 3G3JA 4YZZA 2ZNUA 3KG2A 5HM4B 2RCAA 3TAJA 5I2NA 2M8CA 4X1BA 3KJ7A 3TYHA 2ZNTA 1MXZA 4KCDA 2DSFA 3MP8A 4Q0CA 3MVXA 2B3BA 3GXAA 1B5JA 4YB7A 3FJGA 1QUJA 4BDRA 4KD5A 1B58A 3OSRA 1R1NA 2F34A 2V93A 2P1SA 4ZEKA 3K1PA 3B6QA 1CE2A 3O6GA 3TUSA 1I6QA 5EHSA 4ZZAA 3UIFA 3CFZA 1N0TA 2RCBA 1XVXA 4G8MA 3RQTA 1MQDA 3IB2A 1S7YA 3U93A 5M2VA 4DXCA 2I3VA 4FAJA 1H43A 4F1UA 2I49A 4EDPA 4LZ7A 3VDFA 2V3TA 4OZ9A 1AL3A 3PPQA 4R6YA 2F5XA 4E0XA 1FTOA 1S9TA 3N94A 4BDLA 1SI1A 5I58A 1LCTA 2OWTA 1SVXB 3B7DA 1VE4A 1D9VA 3FXRA 3C31A 3DP8A 5I59A 4HTGA 3IOVA 5H8HA 1JEVA 4KYEA 2XHDA 3KSJA 5TP9A 4HW8A 4Z7EA 2YLNA 1NL5A 1MXXA 2I4CA 1M5BA 4ELQA 1EZPA 1R9LA 4C1TA 3EN3A 3S9NC 3C4MA 1UTBB 5BWJA 1MQIA 4U4SA 3SDFA 1UTHB 2V84A 3ODBA 4ZEFA 1B7ZA 2O1MA 2H98A 4NF8B 1QW0A 1FQFA 1I6AA 4H0WA 2H4IA 5ITPA 4TOZA 5H8SA 3IB1A 4H5GA 2OLBA 4YICA 4IO7A 3EPEA 1YPNA 1Y4TA 4I8CA 2H25A 3CVGA 1B0HA 1O63A 1NMUA 1JVYA 4RXLA 2QS1A 1M5CA 2OCUA 1Z7NE 2RF1A 5KZTA 4JWOA 2QPQA 4EQ9A 1OIBA 4XIGQ 1UIUA 4GQOA 4OHNA 3SKPA 4YB5A 4DXBA 3CSBA 3R26A 3IX1A 2Z23A 4OEUA 4OEVA 5I2NB 4R2BA 1DPEA 1PB9A 3G3FA 3CR9A 1IXGA 5B7DA 3PUWE 3OMBA 4MH5A 1BIYA 2RC8A 3IK6B 1ATGA 3VVEA 1Y1ZA 5CI5A 5TPAB 4H6DA 5EHMA 1GGGA 3IO6A 2ALUA 3TTNA 4LP2B 3OSQA 2QJEA 5EYFA 4TLMB 4YKPA 3K6UA 3V83A 4F1VA 1P1OA 4ZS9A 3TFLA 3E9XA 3T9VA 2O7IA 2P2AA 3ZKKA 3OEMA 4U1ZA 2NVUB 1VFDA 4GF8A 3BFUA 3U72A 1PBPA 3EHTA 3SEYA 2NUVA 3CSGA 5DTBA 4AB6A 4NF6B 4POXA 2AL5A 3N26A 4OMBA 1MXYA 4KI0E 1AOVA 1OLAA 5DEXA 3MBPA 4ZECA 5I58B 1HSJA 4NWCA 4G77A 2DWHA 3TCHA 4PETA 1ZJLA 4FECA 2UVHA 1JW5A 5I59B 1M5FA 4KCCA 3ZSFA 4LZ5A 3PMVA 4ZEIA 3H6UA 3PPOA 5TP9B 2DE3A 4P0IA 4E0WA 2QS3A 2PBWA 1MY1A 1XT8A 3G3GA 3G3KA 1IIWA 4QSCA 4OTEA 2XD2A 3VVDA 5CMBA 3VV5A 1LAFE 1ZU0A 4EF2A 3LBSA 1UIVA 4G68A 2QMWA 3K6WA 2Q2AA 3L6HA 5CM6A 5DT6A 4I1DA 1XHYA 5CC2A 3DP4A 3FVGA 4M4GA 2UVGA 1SYIA 3KOSA 4ZE8A 3W15C 1ZLQA 2Y7KA 4YU0A 2XD3A 1MXWA 2RC9A 2I0CA 3N5LA 3AXFA 1PB7A 3KEIA 4YKJA 3UORA 3VFJA 4JB7A 3E13X 4MLQA 1SI0A 2H99A 5DVIA 3M3FA 3FXQA 1A8FA 1Y4CA 1OVBA 4IY6A 4YMAA 3PMXA 4C0RA 3O28A 1TFDA 2RINA 4GLIA 3RPWA 1SW1A 2QRYA 2LAOA 2ZYKA 2FYIA 2OZZA 2Y84A 3P7IA 5F1QA 1B6HA 1EZOA 2DVZA 3W9WA 3TQWA 3IOTA 4HS7A 5I2KA 3VE1B 1WODA 3LSXA 3SEUA 3C36A 3H4ZA 3C34A 5H8NA 4KYDA 1SW2A 5ISUA 1B3FA 4PFTA 4H8IA 1URDA 3Q28A 2GH9A 1P1WA 3O6HA 1ELJA 3PD8A 1Y20A 4O3BA 2DS9A 4ZEBA 1NNKA 4POWA 3QSLA 3A3CA 2R6GE 3O9PA 3CRBA 2OWSA 3SERA 3KJTA 2A5SA 1FTLA 4AB5A 1OQHA 3LR1A 5K2XA 3ZKLA 1CB6A 3BKIB 3B6TA 3HV1A 2Q2CA 1ANFA 3QIMA 1OVTA 5DEXB 1Y3NA 3HPIA 3MW0A 4F3GA 2FNCA 3T66A 1LSTA 2R71A 3D4GA 3TTRA 4IY5A 2XXHA 2O6AA 2Y7WA 1FQAA 3Q29A 5HBCA 1FQDA 3LC8A 2XXQA 1EU8A 4ZDMA 3VXCA 1R6ZA 4JSOA 1A40A 1M5DA 1A55A 4IO4A 4BDOA 2H5YA 4DLDA 4H1XA 1AMFA 1JETA 3VVFA 2Y7IA 2ZMBA 2I48A 4G68B 1B7UA 1B0LA 3G3IA 4U1OA 4PQJA 3RGYA 3EHSA 4OETA 4DCYA 5TPAA 5B70A 3RN8A 4G4PA 4M1VA 3FVKA 1MY4A 3PU5A 4RYAA 3HO7A 4OERA 2THIA 3PGFA 1PEBA 2F6PA 3MPLA 1FQEA 3KBRA 5CMKA 3RTWB 2I6EA 1B3LA 2VD2A 2BJJX 2ONKE 3MZ1A 1MPCA 2QSXA 1Y3QA 3IOWA 3JZJA 4R73A 1IZ1A 4FE8A 4NF6A 4WEDA 3LUYA 1MY2A 3BFTA 1QUIA 5KCJA 1B46A 1N84A 3H3GA 1NNPA 2ANJA 2V3UA 1TXFA 4K3FA 4OESA 3U8QA 1IEJA 3TTKA 4OVJA 5FHNA 1MM7A 2O69A 3T9HB 1HSLA 5H8FA 4X48A 5I2KB 1H44A 3FD3A 2F7BA 1LBCA 3TODA 4NF5B 4I62A 5I57A 2PMSA 4RPNA 3KN8A 1GVCA 5H8NB 3TPAA 3O29A 1ZBMA 3KZGA 4IB2A 4EF1A 1USYH 3H7MA 4ND9A 4QF9A 3KSXA 3A09A 1ZIUA 1LGBC 2PT2A 4IGRA 1Y9UA 2XX7A 5AA2A 1Q1KA 1II5A 3K1MA 4L17A 1IUDA 1B52A 2XXVA 3CG3A 4ELPA 2DXYA 4G8HA 2OJTA 4NE4A 2F35A 1N3WA 3SETA 3IO4A 3EHUA 1A54A 3BBRA 1R9QA 3VLVA 3UA8A 2Q9TA 2Z22A 1YTVA 3IR1A 1J1NA 3LSLA 2E1SA 1XS5A 1FQBA 3MC2A 2XX8A 2DE4A 3O66A 3WAEA 3PUYE 3QUJA 3MWBA 1N7XA 4ISUA 1B3EA 4H8JA 3MZ9A 3H06B 1LAGE 1P1NA 1VSOA 4RK2A 3H6VA 3S9MC 2IA4A 5TU0A 4QFPA 4F1YA 1RKMA 4YKKA 2AIXA 4FIMA 3FVOA 3MP6A 5FTHA 1MG1A 2XXRA 4NF4A 4G2ZA 5KDTA 4LATA 4QSDA 5IKBA 4LUBA 2XXPA 1F9BA 3DELB 4QSEA 3L6GA 4ESXA 2I58A 3I6VA 4RJZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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