1FQAA

Structure of maltotetraitol bound to open-form maltodextrin binding protein in p2(1)crystal form
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the maltodextrin/maltose-binding protein complexed with reduced oligosaccharides: flexibility of tertiary structure and ligand binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 125
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqaA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqaA01
3A3CA 1S7YA 2HEUA 3T9HB 3O2AA 3MP1A 2F36A 2A5TA 3H06B 1HSLA 2ZXTA 1B51A 4KR5A 4LONB 2DP8A 3OO8A 4F31B 2ZNSA 3RQTA 4BDMA 2VD3A 2O84X 4KYEA 1FQBA 5KDTB 3S9MC 1N3WA 1A8EA 5H8FB 4F18A 4Q5TA 2IEEA 3MVZA 3FXRA 1A55A 2H4IA 3I3VA 3IORA 1QKAA 4R6HA 2DVCA 4QHQA 5DYHA 2PX1A 4ESXA 4H0WA 4EUOA 2ESNA 4EF2A 3G3HA 1B4ZA 1LBCA 4TQUQ 2QPQA 5FHNA 1N7WA 2DS9A 4G68B 4KFQA 2I48A 1A7LA 4OENA 1R6ZA 5F1QA 3FXUA 1FQEA 3D4GA 1IIWA 2I3VA 5CMKA 4JWOA 3V5AA 3IL1B 3T66A 4IY6A 1N7XA 3GBBA 3K00A 4OVJA 1XS5A 3OELA 4OWDA 1OLCA 4OFLA 5DEXA 1IXCA 1MH4A 3MVXA 2HQ0A 5AA3A 3CIJA 4JWYA 3FUZA 3QAXA 3PMXA 4RK9A 1H3DA 3EHTA 2QS4A 1AIVA 3U92A 4XKPA 4I8CA 2R71A 1EU8A 4RYAA 2P1SA 5ICQA 2HZLA 5KCJB 5CM6A 3SEXA 4XTCQ 3Q26A 3R26A 3H4ZA 5JK4A 3VLVA 1B5IA 2FYIA 2F6GA 3MVWA 2Q2AA 3BKIB 1ZJLA 4AQ4A 3TMGA 4ELQA 4GOTA 2DE4A 1IEJA 2QMXA 1ZKBA 2DSFA 3OO7A 5EYFA 3U94A 4ZS9A 2XX9A 3HPIA 3VFJA 1UTHB 1XC1A 1P1WA 2F35A 1B1XA 4TLLB 3V83A 4FORA 4GL0A 4F1VA 2XXUA 4C1TA 5HBCA 1B40A 3OXNA 4LUBA 3I6VA 4HCWA 4WEDA 4ELRA 2F78A 4R72A 4R2FA 3TUSA 1FTJA 4EXLA 4ZEKA 1MXXA 3E4RA 5TU0A 2E0SA 2I0CA 3BFTA 3ILTB 3U8QA 3H6WA 4GWOA 3THIA 1LAGE 1M5FA 3UA8A 1B58A 3H6TA 1LGBC 3K6UA 2NVUB 3QXMA 3GXAA 1VFEA 3BFUA 5DVFA 1IITA 3KJTA 3C36A 3PPNA 4E0XA 2I4CA 2RC9A 3H03A 4XKQA 4IB2A 3IAZA 1L5TA 5I57A 3VVEA 3SEWA 3JV9A 1LCTA 2Y7IA 4P0GA 2PBWA 3TCGA 2O7IA 4OETA 4ZE8A 3G7WA 2ZYMA 4HW8A 4GIZA 4XXUA 1JW5A 2QS1A 4NF4B 5I84A 2ZYOA 5KZTA 1WVJA 4G8HA 1TFDA 4GF8A 1ZLQA 3MUQA 4OEUA 3O6HA 1EZOA 1MPBA 4AB6A 5I2KB 5B70A 3SESA 3MW0A 2UYFA 5H8NA 1FCKA 3TPAA 3V8XB 1N3XA 3K2DA 1P1UA 1QULA 3MPKA 4UA8A 2F7AA 2HXWA 5H8HA 5JTYA 1H76A 3PUWE 3SEVA 2DWJA 2KLFA 5AA1A 1B3GA 1BKAA 3GZGA 3EF7A 3EHUA 4DXBA 5B7DA 4U1OA 4DXUA 1XOCA 5TPAB 1MY0A 3MVYA 3FVNA 1Y4CA 2F97A 4FJPA 1SW1A 2ONKE 1Y20A 3B6QA 1FQFA 3PU5A 3C31A 4N13A 3UP9A 4POWA 2Y7RA 1WODA 4F22A 2VHAA 4POXA 1GVCA 1J1NA 2XX8A 3G3IA 3PUXE 3H7MA 3B6TA 4K3FA 1JQFA 3CSGA 3OSRA 1DMBA 3MZ1A 3UGWA 1VR5A 1B46A 4MLQA 4NF8A 5L9OA 4I1DA 3EN3A 4ZEFA 1PC3A 2B3BA 3VV5A 1B3FA 1NNFA 4LVQA 3CG3A 3TCFA 3IB2A 1LLSA 3PPPA 4MBPA 5A5XB 5FTIA 1LCFA 3MJNA 1B7UA 3TQLA 5AA4B 4ISUA 3GBAA 4QFNA 5L9SA 2AIXA 2GHBA 4G68C 3BBRA 4X48A 2OK2A 3OMBA 3QUJA 2H98A 3K01A 1Z7NE 1NH7A 1IUDA 3TTLA 3T96B 1H44A 1MXUA 3C4MA 2DE2A 4PFTA 3SDFA 3O29A 2XXIA 3VVDA 3FXQA 3ZSFA 4KCCA 4EQBA 3KSXA 3IJOB 1NNPA 3N94A 3EPEA 3G3FA 3FATA 2Y7WA 5CC2A 2DXYA 5I59B 1FQAA 4IO4A 2XXRA 1KWHA 2AL4A 4I9DA 3CVGA 2D5WA 3FJGA 3IOWA 4M1VA 2Q89A 2ZYKA 4FECA 1MY4A 4LZ8A 3TYHA 4KD5A 3L6GA 2O6AA 1YCJA 2QJEA 3VLUA 2ANJA 1JW4A 5CMBA 3SETA 2V3UA 3TAJA 3HCQA 4WEPA 4DIGA 1MM6A 4ND9A 4ELOA 1B2HA 4YKPA 3FD3A 4U1ZA 4GXSB 1B5JA 3FVOA 3O66A 3RTFB 2GFEA 2UVGA 5AE4A 2PT2A 2F6PA 3CFZA 3FJMA 3ZS6A 2XXYA 2Z8DA 4G2ZA 1A99A 3O28A 5ITPA 1VFDA 4JXIA 1YPNA 1LFHA 2XXWA 3A3UA 3IJXB 2QSXA 1UIVA 2XD2A 3LSFB 1P99A 1RYOA 4Q8RA 2XX7A 3TDJA 1OQHA 4QF9A 1JNFA 2X26A 1IZ1A 3E13X 1LSTA 3K6VA 4HTGA 2H9BA 1FTLA 3QYTA 5J1DA 1M5EA 4RPOA 3MPLA 5LOMA 4NMYA 3RT6B 3DP4A 4ONYA 1UIUA 3W9WA 4F2QA 5H8QB 4EF1A 2G93A 1VSOA 2A5TB 1D3KA 1ZIUA 1B0LA 3FGSA 3S9NC 1BIYA 4DE8A 4G4PA 5HM4B 3IK6B 3MC2A 3VXBA 3EQ1A 3CSBA 4RPNA 3UK4A 4NWDA 2XD3A 4ZEBA 1CB6A 2NWJA 2F8DA 5CMMA 1OIBA 4HS7A 1NFTA 3TTMA 5CBRA 3IOVA 4XKNA 4TOZA 1O7TA 3TEPA 4O3CA 1DPEA 4YKKA 4F3GA 2RC7A 3B7DA 4H1XA 4ESWA 1FTMA 2H99A 4ZEDA 3Q29A 3UORA 4YU0A 1PB9A 4JBZA 5FHMA 1ZTYA 1URGA 4Q30B 2V25A 4R9GA 1N04A 4YB5A 1FQCA 3W9VA 2NUVA 1GR2A 3KN7A 4LQ2A 4OYVA 2IA4A 1DTGA 4OESA 1B05A 4H65A 4R2BA 1URSA 2V3QA 3PUVE 5DEXB 2RCAA 3RTWB 4ZEIA 1S50A 1BTJA 4TLMB 4H67A 3MAMA 1Y9UA 2DYXA 1XT8A 2RCBA 5IKBA 1DSNA 1SW2A 3JZJA 4QFKA 4F3PA 3LSWA 3O9PA 4AB5A 2ZMBA 4H5FA 2QMWA 5DVJA 3VE1B 3FZVA 3LSXA 3H3GA 4KQPA 5DVIA 3QK6A 4YMAA 1P1QA 1NMUA 3CI8A 1SW4A 1D9VA 3SKPA 1A8FA 3RNNA 3N5LA 4F19A 4EDPA 1O64A 3Q28A 4F3BA 4X1BA 4YKIA 2HAUA 5I2KA 4PP0A 4JB7A 1MRPA 1MXYA 4IGTA 5TP9A 4DXCA 1B5HA 2V3TA 4KCDA 1JVYA 3KOTA 4IO6A 1UTBA 4FEBA 2Y7KA 2Z8FA 4R6KA 5I56B 4QFPA 3U1OA 2Z23A 5AA2B 2OWTA 2RINA 1R9LA 3KBRA 2WKYA 4OFOA 3PMVA 5BWJA 1XHYA 5JEIA 4NWCA 2OZZA 1TWYA 3ZKKA 3IOUA 4H8IA 2V84A 4F39A 1A54A 2FNCA 1LAHE 1LAFE 4LA9A 1PDAA 3C35A 4LATA 1BP5A 4RNSA 4IO5A 2REGA 1M5DA 2VOZA 4GXAA 3KJ7A 1YAEA 2E1SA 5BUUA 3OENA 2HZKA 3DM0A 3MP6A 3N6TA 2DWIA 1AMFA 4U4SA 1PBPA 4OZ9A 4OXVA 2P2AA 4EQ9A 1MS7A 3E9XA 4RA1A 3DP8A 3S9LC 2REJA 2AYSA 5K2XA 4DZ1A 3MWBA 1MQJA 2RKMA 4LZ7A 1Y3NA 4ZE9A 1PEBA 4LQ5A 3W15C 3RLFE 3PUYE 3R6UA 1PB7A 3RT8A 3LUYA 2HAVA 3D4CA 1I6QA 5I58A 2XXHA 1GV8A 3C33A 4R9FA 2ABHA 2D3IA 2O68A 3FIRA 4O3AA 1R9QA 5CI5A 3K1PA 4QRZA 3K6WA 1MPCA 3VVFA 1MXWA 4RJZA 3HN0A 1PB8A 4FIMA 1Y1ZA 4UACA 5CBSA 3MZ9A 1SI1A 3TFLA 3FJ7A 3HV1A 1S9TA 3IB1A 4HCYA 5I59A 4NF6A 1RKMA 2UVJA 3N26A 3QUFA 4R74A 1USYH 2B65A 3G3JA 2OJTA 1MDP1 2PYYA 2ONSA 4NF5B 1P1NA 5I2NA 1B3LA 2O1MA 4BDOA 2Z22A 1MDQA 4O3BA 1FW0A 3RY3A 4MLVA 3PPRA 3H6UA 4M4GA 3AXFA 2Q9TA 1Q35A 1EH3A 5DTBA 3CR9A 2DWAA 3S9EA 2I3WA 1GGGA 3TODA 1LB9A 3H6VA 1NH8A 3K1NA 4NF8B 1Q1KA 5ELVA 1B32A 3K6XA 1OQGA 4P0IA 3KGCA 3LSLA 3T9XB 1UQWA 3M8UA 4IGRA 3IO4A 2H5YA 5CMCA 4Z0IA 2GRVA 4PFYA 2CMOA 3PD8A 3TKDA 1O63A 3SEUA 3MP8A 4F2OA 4H8JA 5KDTA 1NKXA 3F11A 1N0TA 2RF1A 3K1MA 3KSJA 2YLNA 5H8FA 3HSTA 3I5OA 3PMWA 3P7IA 1IXIA 1AH5A 2G29A 2NOOA 3C34A 1PBQA 4JSOA 4OTEA 1JETA 2OBGA 2XXXA 2ALUA 3K4UA 3FVKA 3KEIA 3ODBA 1B3EA 1B52A 1AOVA 3T93B 1QKBA 4WXJA 3U72A 1DTZA 1CE2A 4G8NA 4G68A 3CFLA 3Q25A 1MG1A 3MBPA 4KYDA 1D9YA 4KYSA 5H8QA 4DCYA 1JW1A 5L8DA 2UYEA 4U21A 1MY1A 1MQDA 1TXFA 4H5GA 5FHOA 4BLAA 4GQOA 2DXRA 2XXTA 1ANFA 1I6AA 4FAJA 4DDDA 3QIMA 3C32A 2VD2A 3C9HA 4BDRA 3OO9A 4KPTA 1US4A 4GLIA 4U23A 3O6GA 3OOAA 5KCJA 2DWHA 1MQGA 1N76A 4PFUA 2RC8A 3TCHA 3S4UA 1LBBA 2B3FA 3M3KA 4H6DA 2R9JA 3O6IA 3HO7A 1OLAA 2QRYA 4MFIA 3ECRA 4L17A 4XIGQ 2Q2CA 2THIA 3L6HA 1JVXA 4NTLA 4R75A 2D21A 1SW5A 1B0HA 4GRKA 3RPWA 4JSDA 1FTKA 1UTHA 4YZZA 4ZZEA 3KN3A 3USDA 1DPPA 1BLFA 4FATA 3PPQA 4OQOA 2DQVA 2BJJX 3ONMA 4KI0E 3VXCA 2F7CA 3DP6A 4IO3A 3A09A 1SI0A 4R6YA 5H8SA 3DELB 1FQDA 2VGQA 1QVSA 1NNKA 4NEDA 3CRBA 4ZZAA 1B6HA 2O7UA 3ZKLA 3VDFA 1EZ9A 3TZAA 2AL5A 3K02A 1VE4A 3Q27A 4OHNA 4PFWA 3PGFA 2DOJA 1MXVA 3T9UA 3FVGA 1MXZA 3SEYA 1LB8A 1QUIA 1ATGA 5EHSA 4DCXA 5M2VA 1JEUA 3IB0A 4F1YA 3PV0E 3FV2A 4R73A 4I62A 5CRYA 1MY2A 3PD9A 1LFIA 2QS2A 3LBSA 3HHFA 4FE8A 1POTA 1IXHA 1SBPA 3UIFA 4Q0CA 1IXGA 1MH3A 2FA7A 2HCAA 2O69A 2XXQA 2CZLA 4GD5A 1B4HA 5I56A 3PPOA 3O97A 4NF4A 1II5A 3KOSA 4ELPA 5AA2A 1SYHA 4KHZE 2NXOA 3IR1A 1HSEA 1A40A 2I58A 3IOTA 4OMBA 2M8CA 1FTOA 1QW0A 4YB6A 4F29A 1SVXB 1N84A 1OVTA 1NL5A 2DVZA 3KG2A 3GLBA 2VP1A 3M3FA 2QS3A 3OD7A 2GH9A 2UVIA 3JYRA 5ITOA 4OFJA 3FV1A 3PUZE 3EHSA 1XVYA 2QL3A 4XKRA 5AA2D 2ZNUA 3RUMA 1LFGA 2Y84A 4ZDMA 4GFRA 2XXPA 4U22A 1WDNA 2DE3A 2HFBA 3UN6A 1ELJA 5TPAA 1B1HA 4BDQA 4C1UA 4RY1A 3IO6A 1NNTA 5ICTA 4THIA 1US5A 4Z7EA 1D4NA 1QUJA 1RYXA 4JWXA 1B3HA 2OCUA 3MQ9A 5F7VA 2Z8EA 3R7XA 1MQIA 4MF3A 4MH5A 1EZPA 2PT1A 5EHMA 4IO2A 4ECFA 1SD3A 1XVXA 5TP9B 4NE4A 3VLWA 4RXLA 5I57B 4JDFA 1TFAA 4QFOA 3TELA 2XXVA 1Z7ME 1DOTA 3CFXA 3N6UA 3T22A 1UTBB 5HPQA 2F5XA 1I6BA 1M5CA 1P1OA 3KN8A 3QSLA 3OSQA 1I69A 3KFMA 2OWSA 5A5XA 4U2RA 3LR1A 3S2VA 4N07A 1SQYA 1B9JA 5AA4A 3RGYA 2X7QA 2A5SA 1MPDA 5H8NB 4RK2A 4U4XA 4NF5A 3TTKA 1F9BA 3LC8A 4QSCA 1ZMGA 1MQHA 1MM7A 1Y4TA 3MZBA 1MY3A 4ZECA 4G77A 3G3GA 5H8HB 3U93A 5JTYB 1Y1MA 2UXAA 2W7YA 3IX1A 2P0SA 4P11A 3OEMA 1R1NA 3WAFA 3V89B 4BDLA 4YB7A 1OVBA 4GVOA 5IAIA 5L9MA 4YMBA 4PE5B 2Y7PA 1B7ZA 3TQWA 2OLBA 1JEVA 3RN8A 4OEVA 4G8MA 2YJPA 2I0BA 4F3SA 4DLDA 3K0VA 4IY5A 3CG1A 4YKJA 1TT1A 1OMPA 2XHDA 2Q88A 4WKMA 3OO6A 4BDNA 5K2YA 2I49A 3OEKA 4OERA 2GHAA 3T9VA 5I58B 4GL8A 1SDXA 4X9TA 1POY1 4PETA 4FEDA 3SERA 1H45A 4LP2B 5ISUA 5FTHA 2I4BA 4YICA 1ZBMA 4IO7A 1AL3A 1GTKA 2R6GE 1HSJA 1ZU0A 4QFLA 1QJMA 1IQ7A 2ZYNA 4C0RA 1B7HA 3WAEA 2F34A 1T0KA 4LZ5A 4QSEA 1QUKA 4NF6B 2PMSA 4E0WA 2O1LA 4F1UA 1USYE 3M3LA 5DT6A 2ZNTA 1URDA 3ILUB 3FASA 3HHGA 4QSDA 1H43A 3TTNA 5I2NB 1M5BA 2H25A 1Y3QA 3B6WA 2PVUA 3KZGA 4EQ7A 4N6PA 2O51A 3TTRA 3DLNA 2LAOA 4YAHX 1YTVA 2V93A 2F7BA 1LAXA 2YPNA 2UVHA 2X7PA 2Q8JA 4PQJA 1SYIA 2ONRA 3G3KA 4X1DA 3E3KA 4EXKA 1Y3PA 2I6EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A3CA 1S7YA 2HEUA 3T9HB 3O2AA 3MP1A 2F36A 2CZHA 2A5TA 3H06B 1HSLA 2ZXTA 1B51A 4KR5A 4LONB 2DP8A 3OO8A 2ZNSA 3RQTA 4F31B 4BDMA 2VD3A 2O84X 4KYEA 1FQBA 5KDTB 3S9MC 1N3WA 1A8EA 5H8FB 4F18A 4PE3A 4Q5TA 2IEEA 3MVZA 3FXRA 1A55A 2H4IA 3I3VA 3IORA 1QKAA 4DI3D 4R6HA 1QGXA 5DW8A 4PDHA 2DVCA 4QHQA 1FBCA 5DYHA 2PX1A 4ESXA 3B50A 2CZIA 2XWVA 4H0WA 5IZZA 4EUOA 2ESNA 4EF2A 3G3HA 4PBHA 1B4ZA 1LBCA 4TQUQ 2QPQA 4P56A 5FHNA 1N7WA 2DS9A 4G68B 3CHGA 4KFQA 2I48A 4UABA 1A7LA 4OENA 1R6ZA 3FXUA 1FQEA 5F1QA 4AS5A 3D4GA 1IIWA 2I3VA 5CMKA 4QXDA 4JWOA 3V5AA 3IL1B 3T66A 4IY6A 1N7XA 3GBBA 4NN3A 4GWZA 3K00A 4OVJA 1XS5A 3D1RA 3OELA 4OWDA 1OLCA 4OFLA 5DEXA 1IXCA 1MH4A 3MVXA 2HQ0A 5AA3A 3CIJA 4JWYA 1YYZA 4LN5A 3FUZA 3QAXA 3E78A 3PMXA 4RK9A 1H3DA 3EHTA 2QS4A 1AIVA 3U92A 4HE1A 4XKPA 4I8CA 2R71A 1EU8A 4RYAA 2P1SA 5ICQA 2HZLA 5KCJB 4JVIA 5CM6A 3SEXA 1FBGA 4XTCQ 3Q26A 4PTKA 3R26A 3H4ZA 5JK4A 3VLVA 1B5IA 2FYIA 2F6GA 5LDZA 3MVWA 2Q2AA 3BKIB 1ZJLA 4AQ4A 3TMGA 4ELQA 4PAKA 4GOTA 4GWXA 2DE4A 1IEJA 2QMXA 1ZKBA 2DSFA 3OO7A 2QVRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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