1FQAA

Structure of maltotetraitol bound to open-form maltodextrin binding protein in p2(1)crystal form
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the maltodextrin/maltose-binding protein complexed with reduced oligosaccharides: flexibility of tertiary structure and ligand binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 125
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqaA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqaA01
1MY2A 3TTKA 2P2AA 1XHYA 4G68A 2B3FA 3TQLA 4O3CA 3THIA 3GXAA 3CI8A 5B70A 1F9BA 3KGCA 4NF4B 2QPQA 2DYXA 1SDXA 1B5IA 3DELB 4L17A 4QFKA 3GBBA 4G8MA 1GVCA 1FTLA 4NEDA 2Y7KA 3TDJA 4XXUA 1FCKA 1US4A 2PMSA 3O66A 4P0IA 2XHDA 3MZ9A 3C33A 4EXKA 3OSQA 3FIRA 1A99A 3BKIB 1Y1ZA 3KSXA 4F18A 2H5YA 5ITOA 4HCWA 3TYHA 3K6VA 3LSWA 2H9BA 3TCGA 2HXWA 3QSLA 4FIMA 4O3BA 3EQ1A 2F6PA 4NF4A 1SD3A 2ZYNA 4I9DA 4KYEA 4H6DA 3OENA 3L6HA 3BFTA 4ECFA 4RPOA 3ZKKA 2Y7WA 3K1MA 1AOVA 3RNNA 5LOMA 1IXHA 1L5TA 2QS4A 1B58A 3TTNA 1ZTYA 1XC1A 1URSA 4DCXA 3D4GA 1TT1A 1H44A 1OIBA 2PBWA 2OCUA 2OBGA 3LC8A 4PP0A 5L9OA 2QSXA 3FGSA 1NNTA 1MPCA 3Q28A 3CVGA 2HZLA 1II5A 1B4ZA 1B4HA 1MQDA 4X1DA 3ZSFA 1YTVA 3K6XA 5AA1A 3KG2A 4YB5A 1Y3PA 1RKMA 1Y20A 4YKIA 3IOVA 3ONMA 4G68C 4JSDA 4EXLA 1Q35A 3MP8A 4ND9A 3S4UA 2NWJA 3H4ZA 1ANFA 3MZ1A 3DM0A 4RPNA 4E0WA 2THIA 1ATGA 1ZBMA 2ZNTA 1BTJA 3V89B 4HS7A 4DXCA 1B0HA 4YICA 5AA3A 1CE2A 4TOZA 3RPWA 1N3WA 3E9XA 3O6GA 5L8DA 1Z7NE 4QFLA 5KZTA 2KLFA 2XD2A 4AB6A 3IOTA 1RYOA 1DOTA 5L9MA 5TP9A 5TU0A 4TLMB 4RY1A 4Q5TA 1DMBA 4LZ7A 1B7UA 3OEKA 1D9VA 2PT1A 4OERA 1GGGA 4H5FA 5IKBA 5BWJA 2AYSA 5KCJA 5H8FB 1TWYA 3T22A 1WVJA 2DE3A 4KPTA 4MF3A 3FV1A 4I1DA 1PBQA 3HV1A 1DTZA 1MY3A 1IXGA 2Q8JA 2DWJA 3C31A 1MQJA 3TUSA 4TQUQ 4EQBA 4OXVA 4KFQA 2ZNSA 4EDPA 3IORA 2HZKA 3RY3A 3A3CA 3Q27A 2UXAA 4N07A 5I57B 4N6PA 1LAHE 3ODBA 3RQTA 2W7YA 3KJTA 4HTGA 2Q9TA 5ICQA 4F19A 4YB6A 4IGTA 2F7BA 4U21A 4QRZA 4ZE9A 4JBZA 4R9FA 1HSEA 1MY4A 1URDA 4AB5A 2Q2AA 3KOSA 4P11A 1O63A 5H8QB 4JB7A 2V3UA 1SI1A 1EU8A 1USYE 1LLSA 3Q29A 4H8IA 2QMXA 3JV9A 2RF1A 3T66A 2I58A 2LAOA 5IAIA 3RGYA 3C35A 3SEXA 1MG1A 5I57A 2O68A 4F3BA 5JTYB 1QVSA 3MWBA 2ZMBA 4UACA 1JW5A 4R9GA 2F7AA 1JEVA 3FXRA 1SW1A 1N3XA 3PMXA 5FHNA 3HPIA 1B2HA 4GVOA 3MP1A 2ZXTA 3VLVA 3TEPA 3AXFA 3U94A 5CC2A 5CBRA 1T0KA 5CMKA 2PX1A 5H8QA 4OETA 1R1NA 3PPOA 1GV8A 3P7IA 1NH7A 1S7YA 2O69A 4R6HA 5H8HB 4THIA 2DWIA 3KSJA 3SETA 1LBCA 4GFRA 1LAGE 2VHAA 4QF9A 1UIUA 4OFJA 4FE8A 3C32A 2ZYOA 3PPPA 1LFHA 3BFUA 4F22A 3KN3A 2R9JA 3MVXA 1MXXA 4F3PA 4Q30B 5AA4B 3I5OA 4BDRA 4QSDA 3N6TA 3OEMA 2RC7A 3UN6A 1GTKA 4GRKA 2NUVA 4ZDMA 1BIYA 4YKJA 5F1QA 5H8HA 3U93A 3EHSA 3PMVA 1D4NA 4OVJA 1BLFA 4Z0IA 4RJZA 4R2BA 3DP4A 5ITPA 1FQAA 3MBPA 3JZJA 1B7HA 3IJXB 5TPAB 4Q8RA 3CRBA 1OVTA 1B3LA 4OWDA 3G3FA 3S9LC 5CI5A 1POY1 3PGFA 2F35A 4U4XA 4ZEBA 3VXBA 4RK2A 1FTMA 2XXQA 4PFYA 2Z8EA 4IO4A 3HN0A 3KN8A 1B46A 3TELA 2DE2A 3H6VA 2E1SA 4GOTA 1NL5A 2GRVA 2VP1A 2Z23A 3B6WA 2CMOA 4GIZA 4GL8A 1A54A 1J1NA 1R9LA 1JNFA 2A5SA 1JETA 3S9EA 5TPAA 1SYHA 1BKAA 4PE5B 4RK9A 4U1OA 4DXUA 2V84A 1LCFA 3IR1A 3TCFA 3F11A 4YZZA 4F1UA 2O84X 3FXQA 3MJNA 1XT8A 1FTOA 3LSFB 4WXJA 4O3AA 2B3BA 4YU0A 4F1VA 2H4IA 4ZE8A 1DSNA 4MH5A 4OHNA 1UIVA 5F7VA 4KCDA 5DVIA 2R6GE 2XXVA 1B3GA 1PBPA 1P1WA 3RLFE 1M5BA 2I49A 1FQFA 2FA7A 1CB6A 3TCHA 2X7PA 4X1BA 3V8XB 5CBSA 4ELOA 4XKNA 4NF6B 3G3KA 4QSEA 3UA8A 5HM4B 3K1NA 4EF2A 1FW0A 3I3VA 3RTWB 4OYVA 4FEDA 3B6QA 1MDP1 5H8SA 2F8DA 3N5LA 4YAHX 3O97A 2XD3A 3TQWA 2DP8A 4NF5B 1VE4A 1IEJA 5K2XA 5AE4A 4FECA 4H65A 3QK6A 2DWAA 4JDFA 3FVOA 2DQVA 3UIFA 4NF6A 3HO7A 4LVQA 3U8QA 3O29A 2H98A 4TLLB 2F36A 2FYIA 3K6UA 1IUDA 1D3KA 1OMPA 3IO4A 5I2NB 2O1MA 2VD3A 3K02A 5H8NB 2REGA 2I0CA 1MS7A 1I69A 1N76A 1QUKA 3OSRA 4NF5A 2E0SA 3UGWA 4R6KA 3OO6A 1MXVA 2V3TA 3MPKA 5FHMA 2D21A 3R6UA 5ELVA 1OQHA 1XVYA 4KQPA 1WODA 4LA9A 4KHZE 4H67A 1A7LA 1N84A 3SEUA 1JW4A 2RC9A 1FQEA 2XXIA 5I2NA 2FNCA 2I6EA 1MQHA 4LQ5A 3K4UA 4OZ9A 2F97A 2NVUB 5I84A 1OVBA 1H3DA 1M5EA 2ALUA 2GFEA 2QS3A 1P1OA 2RC8A 3HSTA 3IO6A 3RTFB 3U92A 4ELRA 3H03A 2D3IA 3OMBA 4KD5A 4ZZAA 3RT8A 4KR5A 2RCBA 2Y7PA 2ESNA 4OFOA 1NNKA 1AL3A 1TFAA 2HQ0A 1WDNA 4MFIA 4BLAA 4GF8A 2QRYA 2X26A 2D5WA 3HCQA 3GLBA 3H3GA 1JEUA 3VLWA 4ZEDA 4UA8A 2O1LA 3JYRA 5J1DA 1JVYA 5CMBA 2RCAA 1QKBA 3E4RA 3KBRA 1LB8A 4U22A 3MZBA 2NXOA 4OQOA 5I58B 2DVZA 4ZEFA 1M5FA 1B40A 1B5JA 2UVJA 4AQ4A 3MVYA 3TAJA 3S9MC 1N7XA 3IB2A 3VXCA 4EUOA 3IK6B 1FQCA 2YJPA 5H8FA 5A5XB 3FUZA 3N26A 2H99A 3ZS6A 2XXYA 3PPRA 3QIMA 1USYH 3LR1A 4U4SA 3B7DA 3CFLA 4BDMA 2GH9A 1MPDA 1UTHB 3V5AA 3LSLA 4DXBA 4YMBA 3DP6A 1B6HA 1PB7A 4LQ2A 1ZJLA 4MBPA 1IZ1A 5I58A 1MXWA 3LSXA 1MXUA 1UTBB 3IAZA 1PC3A 4PFTA 4IGRA 3CSBA 2XXRA 1SVXB 2Q89A 1RYXA 2PVUA 1DTGA 3DP8A 2O7UA 4GD5A 2DWHA 3K0VA 5A5XA 1AIVA 5B7DA 3GZGA 2DXRA 1AH5A 3USDA 3VDFA 2G93A 3O6HA 3SERA 1R9QA 3BBRA 3QUJA 3PUZE 4WKMA 2Z8DA 3FZVA 3OELA 5EYFA 2QJEA 4R75A 4GLIA 1VR5A 3FD3A 2Y84A 3T9HB 1SI0A 3T93B 1MH4A 3S9NC 2M8CA 1SW5A 3H7MA 5JTYA 1LFIA 1H45A 3C36A 3O6IA 1GR2A 2IEEA 2F6GA 1MY0A 2HAVA 1MXZA 3K6WA 3SEWA 3QYTA 2X7QA 4KYSA 1I6QA 1N04A 4DIGA 1QW0A 2DS9A 1OQGA 4NWCA 4PETA 4HCYA 4BDOA 4DZ1A 3EPEA 2I4CA 5I2KB 2NOOA 1EZ9A 3IJOB 2OZZA 4IO2A 3CSGA 3O2AA 1LCTA 2ZYMA 3K2DA 3M3LA 3PPNA 1B0LA 4FAJA 4U2RA 4IY6A 4JWOA 5JEIA 4ZEKA 3UK4A 5DEXB 1IXCA 4DDDA 3C34A 1P1NA 3EHUA 2QL3A 1LFGA 3N94A 3TTRA 5DTBA 3PUWE 4QHQA 4DCYA 1SW2A 3RUMA 1TFDA 2XX7A 1XOCA 3ECRA 3S2VA 4MLQA 4ESWA 1R6ZA 4R72A 4H8JA 4YB7A 1I6BA 5AA4A 4OEUA 4C0RA 5I2KA 1FQBA 4YMAA 3UORA 3HHGA 1AMFA 1LSTA 4GWOA 2YLNA 4LZ8A 3TFLA 4GXSB 5L9SA 1S50A 2F5XA 1H43A 4U23A 4DLDA 3WAEA 3T9UA 2HFBA 4QSCA 2OLBA 4RXLA 3MC2A 1FTKA 3D4CA 2HEUA 3SKPA 3A3UA 2V3QA 2UVIA 3G3IA 1LGBC 2XXUA 4OTEA 1URGA 4RA1A 3PMWA 3A09A 3B6TA 3KEIA 5CMCA 1JQFA 2OK2A 5ICTA 1P1UA 5I56B 3O9PA 4NTLA 2XX8A 3H6UA 1ZMGA 5EHMA 4OFLA 4G2ZA 4C1TA 1ELJA 3ILTB 3U1OA 4FJPA 2UYEA 1P1QA 1FTJA 1HSLA 4M1VA 1DPPA 2ANJA 3W9WA 2PYYA 5BUUA 4OEVA 1VFDA 4FEBA 1IITA 1VSOA 1Y3NA 3ZKLA 3OO9A 1B3HA 3FVNA 4H0WA 4R74A 5FTHA 2A5TB 2UVGA 4EQ7A 4QFNA 4R73A 3OOAA 1LB9A 2I48A 5I56A 4ESXA 4GQOA 2OWSA 5AA2B 2XXPA 4NMYA 4XIGQ 1M5DA 1IIWA 3PUYE 1SYIA 4F39A 1MPBA 2O6AA 3VVEA 1MRPA 3TKDA 4IO6A 2WKYA 3EN3A 1QKAA 2DSFA 2F7CA 4KYDA 3VVDA 3WAFA 1B05A 3M8UA 3FVKA 3EHTA 2XXWA 2QMWA 3VFJA 3CIJA 4PFUA 2ONSA 2I0BA 2Z8FA 5DT6A 1MDQA 4JXIA 4LUBA 2A5TA 5CRYA 4X9TA 1B3FA 4X48A 4BDQA 2ZYKA 1NFTA 4G8HA 2XXHA 1Z7ME 3RT6B 5DVJA 5AA2A 3K1PA 3OO7A 2UYFA 3VLUA 1B3EA 1FQDA 1A40A 2VD2A 4QFPA 3IB0A 3FJGA 2XX9A 3KJ7A 4JSOA 4RNSA 1LBBA 3HHFA 3MAMA 3OXNA 3VVFA 2REJA 2ONKE 5ISUA 4R2FA 3W15C 4ZECA 3PD9A 1B5HA 1N7WA 2P0SA 4H5GA 4U1ZA 3SDFA 2F78A 3IB1A 3CG1A 4F31B 4PFWA 1EZPA 3I6VA 2AL4A 5AA2D 4EQ9A 3N6UA 1NH8A 5I59B 3PD8A 1DPEA 1PB8A 3OD7A 5TP9B 4BDLA 1KWHA 1MQGA 5H8NA 3K01A 2GHAA 3T9VA 5FTIA 4H1XA 3PV0E 3SESA 5KCJB 3TZAA 1EZOA 1NNFA 1LAFE 3G3HA 3SEYA 4RYAA 3IL1B 2I3WA 1B1HA 4KI0E 3MVWA 4ELQA 3KOTA 3ILUB 2ONRA 5M2VA 3MUQA 2V93A 1A55A 4OMBA 1B7ZA 2BJJX 5HBCA 1BP5A 5EHSA 3DLNA 3QXMA 4E0XA 1S9TA 5I59A 5JK4A 4R6YA 2CZLA 3CR9A 1OLCA 2QS1A 1XVXA 4LATA 1I6AA 2Z22A 4P0GA 3KZGA 2IA4A 4QFOA 2VGQA 2R71A 1B9JA 1ZU0A 1POTA 1TXFA 4FORA 3TTLA 2ZNUA 2O7IA 1N0TA 3PUXE 4IY5A 4XKRA 4EF1A 1O64A 1PEBA 2YPNA 4XTCQ 3E3KA 4XKQA 2QS2A 1ZIUA 2DVCA 4BDNA 4F2OA 1Y3QA 3VE1B 2GHBA 3LUYA 4F3GA 3FXUA 3Q25A 3C9HA 3MPLA 4JWYA 1QJMA 3RN8A 4IO7A 1ZKBA 1IQ7A 1MH3A 1IXIA 3T9XB 1MM6A 3G3GA 4KCCA 1PB9A 4ZZEA 3FATA 3R26A 3M3FA 5CM6A 3U72A 4ISUA 3T96B 3LBSA 5HPQA 3VV5A 1US5A 3CG3A 3CFZA 2DXYA 2AL5A 1MY1A 2OJTA 1P99A 4Q0CA 4NWDA 1YAEA 5KDTB 5DVFA 1UTHA 2UVHA 2B65A 1QULA 3MVZA 3E13X 4LP2B 3OO8A 4LZ5A 3MQ9A 4OESA 2DE4A 2I4BA 3K00A 3FV2A 1UTBA 3TMGA 2RINA 1M5CA 3MP6A 2Q2CA 3FJ7A 4NE4A 3G7WA 4IO3A 2Y7IA 2I3VA 1MXYA 3QUFA 4I8CA 1B51A 1QUJA 3KFMA 3FJMA 1Q1KA 1O7TA 1PDAA 4M4GA 4XKPA 1A8EA 4WEPA 3MW0A 1OLAA 3C4MA 2OWTA 5KDTA 4JWXA 4LONB 4ELPA 3L6GA 4PQJA 1Y4CA 4GXAA 1NNPA 4F2QA 2XXXA 4Z7EA 1MQIA 3M3KA 1XS5A 4I62A 4WEDA 3G3JA 4G8NA 3PUVE 5CMMA 4ZS9A 1H76A 2ABHA 5FHOA 1JVXA 3EF7A 3H6WA 1QUIA 5K2YA 4IO5A 3FASA 4ONYA 1JW1A 3W9VA 4G4PA 4HW8A 3Q26A 2HCAA 3PPQA 3TODA 4GL0A 5DYHA 1VFEA 1ZLQA 3FVGA 3SEVA 2P1SA 4IB2A 3KN7A 2O51A 3TPAA 4C1UA 4N13A 1SW4A 1NMUA 1LAXA 2PT2A 2XXTA 2V25A 3V83A 1YPNA 5DEXA 3IOUA 4OENA 4K3FA 4NF8B 2F34A 1YCJA 1EH3A 1A8FA 1SQYA 1SBPA 4F1YA 3PU5A 4YKKA 3IOWA 1Y4TA 4MLVA 1NKXA 2Y7RA 1B1XA 3CFXA 4G68B 3GBAA 2H25A 4POWA 2VOZA 3IX1A 4YKPA 1UQWA 4POXA 1B32A 3TTMA 1Y9UA 2DOJA 4F29A 3QAXA 3H6TA 1Y1MA 3R7XA 3O28A 4NF8A 1MM7A 4F3SA 1HSJA 4FATA 4G77A 2G29A 4ZEIA 1B52A 2AIXA 1D9YA 3H06B 2HAUA 2Q88A 3UP9A 4DE8A 2RKMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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