1FQBA

Structure of maltotriotol bound to open-form maltodextrin binding protein in p2(1)crystal form
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the maltodextrin/maltose-binding protein complexed with reduced oligosaccharides: flexibility of tertiary structure and ligand binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 126
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqbA01
2UVHA 1N7XA 3TQLA 3U92A 5I2KB 4DIGA 2H5YA 1SW4A 1GGGA 2RINA 1P1WA 5CBSA 2A5TA 4TQUQ 3EN3A 5AA3A 1B0LA 4M4GA 4QHQA 1SI1A 2UVJA 4OEUA 3N26A 4HCWA 4F1VA 2B65A 4R6HA 1M5DA 1I69A 4F31B 2THIA 4OVJA 2HFBA 1XVYA 2DXYA 3ODBA 5F7VA 1Y3QA 3TMGA 4KYSA 3OO7A 1L5TA 1RYXA 2X7PA 1A54A 2DSFA 3PPRA 2F97A 1B3HA 3R7XA 4IO3A 2QJEA 2H4IA 4IGTA 3H6TA 3TPAA 4NWCA 2FYIA 3FVKA 2XXIA 2HEUA 3W15C 1FTJA 3S2VA 3H06B 1YTVA 1ELJA 4LUBA 1IITA 1B5JA 2VHAA 1KWHA 1H43A 2G93A 2DWIA 3TAJA 4P0GA 5ICTA 2Q8JA 4Z7EA 1DOTA 3L6HA 3MUQA 2AL5A 4EF1A 5M2VA 3T22A 3FUZA 3IO4A 3IJXB 5IKBA 2DP8A 4PE5B 1LFGA 5DVFA 4EUOA 2BJJX 2HAUA 4DCXA 3K01A 5EYFA 4BDOA 2D3IA 3LC8A 3EHUA 1QUKA 3FXQA 5TPAA 3F11A 2Q88A 2ZXTA 1M5EA 2O6AA 4LZ8A 3BBRA 1JNFA 1LLSA 3QYTA 1XT8A 2NWJA 1I6QA 2NXOA 4O3BA 4ZEBA 1P1NA 5I59A 4JWYA 4ND9A 3BFTA 3L6GA 4N07A 2DWJA 1A7LA 3B6TA 1B5HA 4P0IA 3KG2A 2Z23A 3TQWA 3SEWA 2O69A 3H4ZA 1RYOA 3R6UA 4DDDA 4NF4A 3O6GA 4F1YA 5I58A 2DE4A 1DTZA 3P7IA 1Z7ME 1JW5A 5EHSA 4LQ5A 5DYHA 4BDMA 3VVFA 4AB5A 4QSCA 1B51A 1HSEA 4RPOA 2I58A 3FVNA 4XKQA 1O63A 4OWDA 1FTOA 2QMWA 2AL4A 1FTLA 1I6AA 3ONMA 2H98A 4ECFA 4PFUA 1ZMGA 3T66A 4OFLA 5DT6A 1SYIA 3TCHA 4LONB 3PV0E 1MY0A 5CMMA 1USYH 4JWXA 4PFTA 3USDA 4PQJA 4L17A 2DYXA 3TZAA 3K02A 3IB0A 5I57B 3E9XA 3VE1B 3H6UA 1J1NA 1TWYA 2Z8DA 5AA4A 3KSJA 4TLMB 4X1DA 3FZVA 4YU0A 3WAEA 2NUVA 1MQJA 1LAFE 4QSEA 1B2HA 3RY3A 4DE8A 3KN3A 1MDP1 1ZU0A 1LCTA 2GFEA 1ANFA 1T0KA 5ITPA 3OENA 3C32A 1B3GA 1NH8A 1Y3PA 1GR2A 1Y9UA 3HPIA 1IXIA 3CSGA 3B7DA 1B0HA 1AOVA 4KR5A 3ILTB 3LSLA 4BDQA 3VFJA 4RNSA 1O7TA 1LFHA 5I57A 2I49A 2GRVA 4FAJA 4F3BA 3O2AA 3HHGA 2Q2CA 3N94A 1OMPA 1FQFA 4QSDA 3KFMA 1LB8A 4NF6B 2XXQA 1VFEA 2FA7A 5AA2A 5L9SA 3OSQA 1NNKA 4U1ZA 2KLFA 4H67A 3CFXA 3O28A 3G3JA 1N7WA 2QS2A 3V5AA 5I56B 1US5A 4O3AA 3Q27A 3MVXA 1A8EA 1URDA 4G68B 1DPEA 4R75A 2DWAA 5CI5A 1DSNA 2DVZA 3V8XB 2P1SA 2DE2A 1LAHE 2F5XA 4KFQA 1BTJA 4GXAA 1FTMA 3MPKA 2I4BA 3CIJA 1B5IA 1H44A 2F36A 3VXCA 1BLFA 2A5SA 4Q30B 4G2ZA 1Q35A 1AH5A 1AIVA 1JETA 5LOMA 4H5FA 3D4CA 3IOWA 2H25A 1MG1A 2X26A 2XD2A 1F9BA 3T9XB 2RCBA 1D3KA 2XX9A 3U94A 1FQAA 1MY3A 4YKIA 4BLAA 1USYE 4GXSB 3U1OA 1YPNA 1MDQA 2Y7IA 3SESA 1M5FA 1B7HA 4R2FA 5L9MA 4KYEA 3FASA 3U72A 1VR5A 5AE4A 1B40A 2X7QA 1QVSA 1UTBB 2VD2A 1MPBA 1B1HA 3M8UA 4F19A 3MVZA 1GV8A 1N3XA 1PBPA 2ONSA 2Z8EA 1A8FA 3H3GA 4F18A 3HSTA 3TEPA 1IZ1A 4O3CA 3IJOB 3MP1A 1QULA 2QSXA 5HBCA 3RLFE 1IXGA 2QS1A 3OD7A 3TTLA 5L9OA 4Z0IA 4QFKA 5FHOA 4OMBA 3O6IA 5HM4B 1FQCA 1H76A 3VVEA 4KD5A 1NNFA 5H8NB 3FD3A 3O6HA 3UA8A 3S4UA 3QXMA 3IOUA 4DXUA 4GF8A 2ZYMA 3UORA 1SW2A 1A40A 1OQGA 3Q28A 3Q26A 4IGRA 1MRPA 1Y20A 1YCJA 3H6WA 3E3KA 3KJ7A 1VE4A 2I0CA 3HCQA 3KSXA 4F22A 2PBWA 5FTIA 2QMXA 5K2XA 3KN8A 1POY1 3WAFA 2NVUB 1XVXA 4R73A 4JSDA 4DLDA 4JB7A 4ELPA 3IB1A 3N6UA 5KZTA 4F3SA 1POTA 5I2KA 3T9HB 3EHTA 4GLIA 1IIWA 1ZKBA 4WEPA 2REGA 4NF8B 3MAMA 5ITOA 1UTHB 1MS7A 4LATA 1VSOA 4ZECA 1R9LA 3BFUA 3LSFB 1AL3A 2VOZA 5KDTB 1DMBA 2I4CA 5J1DA 1XOCA 3IB2A 1LGBC 1SW1A 2DE3A 4GWOA 3ZSFA 1FTKA 1A55A 1PB8A 4R72A 3HHFA 4AB6A 4GQOA 2R71A 2GHBA 3U8QA 3V89B 2D5WA 1SD3A 5KCJB 3C31A 3FVGA 1FQDA 3QIMA 5I2NB 2UYFA 2IEEA 1BP5A 2VP1A 3K0VA 1ZIUA 1TXFA 1MXUA 4OZ9A 4OFOA 4R6YA 2F8DA 4XTCQ 3D4GA 5I84A 3T96B 3OMBA 4RXLA 5CMBA 4XKNA 1UTHA 3OOAA 2O68A 2R6GE 2ESNA 1S7YA 4H65A 5ISUA 3MP6A 3SEVA 3H6VA 1MY1A 2OBGA 3EPEA 2PYYA 2OZZA 3JYRA 3KGCA 3OELA 3AXFA 2RCAA 1IEJA 2F34A 3SERA 3K1PA 5TP9B 1ZTYA 3PMVA 4MLVA 2DS9A 2VD3A 4QF9A 4OTEA 2P2AA 3MVWA 3FATA 3RNNA 4U23A 1MM6A 3ZS6A 2F35A 3KOSA 1QW0A 4GRKA 4X9TA 3QUJA 2RF1A 2HQ0A 2HZKA 2REJA 2V25A 2F7BA 4XKRA 3FXRA 4OERA 5K2YA 2XXUA 3SDFA 2I48A 3MQ9A 2ONKE 3GLBA 4G8HA 3JZJA 2F7AA 4QFOA 3QK6A 3LSXA 5F1QA 2G29A 2XD3A 3VVDA 1S50A 1ZJLA 2HAVA 2Q2AA 1URGA 3A3UA 3S9LC 3SEYA 5CMCA 1QUJA 1MH3A 3GXAA 4E0WA 5EHMA 3PUWE 4F1UA 3G3GA 3UN6A 4LZ5A 3B6WA 3VDFA 1Y4TA 3SETA 3MJNA 3PPQA 3CRBA 1B3EA 3LUYA 3CG1A 3O66A 1EZPA 2WKYA 4OQOA 5DTBA 5ELVA 4H8IA 1B3LA 4H6DA 3TELA 1R6ZA 1UIVA 1JEUA 3ILUB 2P0SA 3E4RA 4GL8A 1PEBA 1SW5A 4EDPA 4IO4A 4IY5A 5JTYB 3RGYA 2XXXA 4POXA 4Q8RA 4HTGA 2HZLA 4YKJA 3TODA 4IO5A 4RK9A 3G3HA 3CSBA 5FHNA 3PPNA 4ELRA 4IO6A 4OXVA 2O1LA 1MPCA 1II5A 2DWHA 2UYEA 4U21A 2W7YA 1P1OA 3FJ7A 3UK4A 2OJTA 3RN8A 2Q89A 1B3FA 1URSA 4YICA 1N76A 4YMAA 5JK4A 3HO7A 3HN0A 3T9VA 3DELB 4ZZAA 4KQPA 1AMFA 2I6EA 4ZEKA 3MP8A 4QFPA 4EXLA 4QFLA 3I5OA 4LZ7A 4H5GA 2DQVA 1B32A 2PT1A 1LB9A 3KEIA 3T9UA 4I8CA 3IX1A 4TLLB 4GOTA 2H99A 3IO6A 1B4ZA 1HSJA 2YLNA 5AA2D 4ESWA 4BDRA 2V3UA 1BKAA 2QS3A 3C4MA 5TU0A 1LAGE 5L8DA 1ATGA 2M8CA 1M5BA 2F6GA 4Q0CA 3PUVE 5H8FB 3A09A 2ANJA 3PMXA 2V3TA 5ICQA 4NF6A 3IOTA 5CM6A 1Z7NE 4F29A 1FQBA 4LA9A 4KCCA 5DEXB 1SVXB 3FVOA 1N0TA 1QUIA 5B70A 2R9JA 1IXCA 4FEBA 3PPOA 3RT6B 2ZNSA 5I56A 1MXYA 3M3FA 4F3GA 3FIRA 4G68A 4F39A 3FV1A 1D4NA 4XXUA 3THIA 4U1OA 2Y7PA 3I3VA 2CMOA 4MF3A 2IA4A 3K1MA 1TFAA 2DOJA 1LBCA 5A5XB 2V93A 2V3QA 3RTWB 3C36A 3OEMA 4GL0A 3GBBA 2OCUA 3MZ9A 1N3WA 1VFDA 3V83A 2Y7RA 5H8SA 3RTFB 4XIGQ 4YMBA 4G8NA 4JWOA 4R9GA 2XHDA 2O7UA 1DPPA 1JVYA 2XX8A 1SBPA 1MY2A 3G3FA 3PUXE 3R26A 3QUFA 3VLWA 3Q29A 4RJZA 2F78A 3PU5A 4YAHX 4PFYA 3IL1B 5BUUA 3EF7A 4FORA 2YPNA 3TKDA 4KI0E 4FATA 1D9YA 4NMYA 4OHNA 2LAOA 3O97A 3CFZA 4WEDA 3TFLA 3KOTA 1NFTA 2QPQA 1JW4A 2ZNUA 4LP2B 3SEXA 5IAIA 3SKPA 2UXAA 4E0XA 1QKBA 1QJMA 2ZYKA 2O84X 1UTBA 1TT1A 4G4PA 3DP6A 4JDFA 4ZEFA 4LVQA 2QL3A 4ZEIA 3K6XA 2PMSA 1B7UA 2XXWA 5JEIA 4RY1A 3MZBA 1SYHA 2O7IA 2HCAA 4ELOA 3EQ1A 5FHMA 1IUDA 1ZBMA 1MXZA 3K6VA 1MXXA 4POWA 1B52A 5H8QB 4HS7A 1R1NA 4JXIA 3K4UA 1MXVA 4C1TA 3GZGA 4X1BA 3S9EA 1PC3A 2E0SA 4OYVA 1MQGA 3TUSA 1IQ7A 5TPAB 1EU8A 1R9QA 5H8NA 3RT8A 1S9TA 1SI0A 1B7ZA 2XX7A 2NOOA 2O1MA 1OLCA 1WODA 1LFIA 2ABHA 2RKMA 4ZS9A 4P11A 4FE8A 2AIXA 2ALUA 5I59B 1UIUA 2E1SA 1PBQA 3FV2A 4OETA 1PB9A 1N04A 4OESA 3MW0A 1GVCA 4GIZA 4LQ2A 5CBRA 3CG3A 4EQ7A 5H8QA 4H8JA 1PB7A 2PT2A 4NTLA 3K1NA 3K6WA 4YZZA 4NF4B 4RA1A 5I58B 3PGFA 1BIYA 4QFNA 3IR1A 4N13A 4Q5TA 2GHAA 2I3WA 3DP4A 3O29A 4F3PA 2RC9A 3OEKA 4THIA 3FGSA 4NF8A 3OO6A 1H3DA 3LR1A 2RC7A 3ECRA 1MY4A 3PUZE 1O64A 4I62A 4G68C 4NWDA 2I0BA 5KDTA 4BDLA 1OQHA 3ZKKA 1LSTA 1XC1A 3PD8A 2B3FA 2Z22A 2DXRA 1PDAA 4EQBA 1Y1ZA 4R6KA 1D9VA 1JVXA 2V84A 3B6QA 2XXPA 1H45A 2ZYOA 4FECA 4I1DA 1XHYA 4U4SA 4ELQA 4YB7A 5KCJA 3Q25A 1DTGA 4HCYA 5I2NA 5CC2A 1YAEA 5DVIA 3QSLA 1Q1KA 1P99A 3N6TA 1B4HA 2GH9A 3LBSA 2ZMBA 1FQEA 2B3BA 1WDNA 2ONRA 1N84A 3K2DA 5AA4B 3C35A 2HXWA 1HSLA 3G3IA 1UQWA 3FJGA 4ZE8A 4TOZA 4ZZEA 4MLQA 3CFLA 2D21A 4C1UA 4WXJA 4FIMA 1Y3NA 2Y84A 4RPNA 5TP9A 4H1XA 1OIBA 2F7CA 2UVIA 3JV9A 3MVYA 4G77A 3KBRA 5CMKA 1MQHA 4KHZE 5FTHA 3SEUA 1IXHA 4XKPA 2Y7KA 3DLNA 1P1UA 3RUMA 3EHSA 1B05A 1Y4CA 2ZYNA 4AQ4A 3LSWA 3G3KA 4ZEDA 1I6BA 4QRZA 4GFRA 1B1XA 3VLUA 3IK6B 3TTNA 1EZ9A 3TCFA 4KYDA 4PFWA 5AA1A 4M1VA 3VV5A 4DZ1A 1EH3A 3MPLA 3RQTA 3MBPA 5CRYA 1OVTA 3A3CA 1US4A 3GBAA 4N6PA 3PD9A 5AA2B 4U22A 5B7DA 4GD5A 4YKPA 1P1QA 2OK2A 2UVGA 3TTMA 4F2OA 3RPWA 3KZGA 3UGWA 4DXBA 4BDNA 1ZLQA 3DM0A 1CB6A 1QKAA 1NMUA 1MH4A 2Z8FA 3IOVA 3CI8A 3QAXA 4NF5B 3H7MA 4YKKA 3T93B 2FNCA 2Y7WA 4UACA 1OVBA 2RC8A 5DVJA 1MM7A 3G7WA 1NKXA 2F6PA 3OSRA 5H8HB 1Y1MA 5JTYA 3DP8A 3TCGA 2QS4A 3PUYE 4OEVA 3ZKLA 2OLBA 1A99A 3C9HA 3IORA 3E13X 4KCDA 3N5LA 1TFDA 3C33A 3K6UA 1FCKA 2ZNTA 3TYHA 4PP0A 2XXYA 3I6VA 4ONYA 3OO9A 4F2QA 4KPTA 1JW1A 1LAXA 1SQYA 4EQ9A 4ZE9A 3FJMA 4G8MA 1LBBA 2H9BA 3OXNA 3IAZA 3U93A 4NEDA 1JEVA 3S9NC 1MQIA 4PETA 3TDJA 1GTKA 4NF5A 3H03A 3MZ1A 4R74A 3W9VA 1MQDA 2OWTA 4C0RA 4ZDMA 3M3LA 3VLVA 4MH5A 5H8HA 4EXKA 3W9WA 3TTRA 4RK2A 4DXCA 4JBZA 3PPPA 1XS5A 3K00A 1OLAA 2QRYA 5HPQA 1LCFA 4IY6A 3KN7A 3CVGA 1MPDA 1B9JA 4R9FA 4WKMA 2Q9TA 2YJPA 4R2BA 4H0WA 2OWSA 4MFIA 3UIFA 2VGQA 2DVCA 1MXWA 3MWBA 3S9MC 1NL5A 1CE2A 5H8FA 4IO2A 2AYSA 1M5CA 3TTKA 3OO8A 4FEDA 2XXRA 3CR9A 4I9DA 1FW0A 2I3VA 4MBPA 1NNPA 4EF2A 4HW8A 4NE4A 5BWJA 4IO7A 3PMWA 5DEXA 1B46A 2A5TB 1NNTA 2PVUA 4IB2A 3HV1A 4OFJA 1WVJA 4FJPA 4UA8A 3VXBA 1RKMA 4U4XA 4DCYA 4JSOA 4YB6A 1EZOA 3BKIB 4RYAA 4YB5A 1NH7A 4ISUA 1JQFA 3KJTA 3UP9A 4K3FA 3FXUA 4X48A 3M3KA 2XXVA 2XXTA 4GVOA 3MC2A 2O51A 5A5XA 4OENA 1B6HA 4ESXA 2XXHA 3C34A 2CZLA 2PX1A 1SDXA 4U2RA 3O9PA 1B58A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2UVHA 2FIXA 1D9QA 1N7XA 3TQLA 3U92A 5I2KB 4DIGA 2H5YA 1SW4A 1GGGA 2RINA 1P1WA 5CBSA 2A5TA 4TQUQ 3EN3A 5AA3A 1B0LA 4M4GA 4QHQA 4NHBA 1SI1A 2ZZVA 2UVJA 4OEUA 3N26A 4HCWA 1FTAA 2Y5KA 4F1VA 4OVRA 2B65A 4R6HA 1M5DA 1I69A 1RDZA 4F31B 2THIA 4OVJA 2HFBA 2XWKA 3E78A 1XVYA 2DXYA 4GWZA 3ODBA 5F7VA 1Y3QA 3TMGA 4KYSA 3OO7A 5T3JA 1L5TA 1RYXA 2X7PA 1A54A 2DSFA 3PPRA 2QVRA 2F97A 1B3HA 3R7XA 4IO3A 2QJEA 2H4IA 4IGTA 3H6TA 3TPAA 4NWCA 2FYIA 3FVKA 2XXIA 1FJ9A 2HEUA 3W15C 1FTJA 3S2VA 4NF0A 3H06B 1YTVA 1ELJA 4LUBA 1IITA 1B5JA 2VHAA 1KWHA 1FPKA 1H43A 2G93A 1NV5A 2DWIA 3TAJA 4P0GA 5ICTA 2Q8JA 4Z7EA 1DOTA 3L6HA 3MUQA 2AL5A 4EF1A 5M2VA 3T22A 1NV4A 3FUZA 3IO4A 3IJXB 5IKBA 2DP8A 4PE5B 1LFGA 5DVFA 4EUOA 2BJJX 2HAUA 4DCXA 3K01A 5EYFA 4BDOA 2D3IA 3LC8A 3EHUA 1QUKA 2WYKA 2OWZA 3FXQA 5TPAA 3F11A 2Q88A 2ZXTA 1M5EA 2WYPA 1NV3A 2O6AA 4LZ8A 3BBRA 1JNFA 1LLSA 3QYTA 1XT8A 2NWJA 2KR0A 1I6QA 2NXOA 4G61A 4O3BA 4ZEBA 1P1NA 3E79A 5I59A 4JWYA 4QBAA 4ND9A 3BFTA 3L6GA 4N07A 3BIGA 2DWJA 1A7LA 4PFBA 3B6TA 1B5HA 4P0IA 3KG2A 2Z23A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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