1FTKA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2i) in complex with kainate at 1.6 a resolution
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
262
structure length
250
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
total genus 78
structure length 250
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftkA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftkA01
3FJGA 3OMBA 1P1NA 2UVHA 3K4UA 2Y7KA 4IGTA 4YKKA 2THIA 5EYFA 4EUOA 1N76A 5H8FA 4QFLA 1EZOA 4OVJA 5ICTA 1XVXA 2A5TA 2E1SA 3O66A 2ABHA 3DELB 2X26A 3C4MA 5KCJB 4YB7A 4FAJA 4H67A 1VSOA 4JSOA 4NF4A 2PT2A 1QJMA 4YKIA 2Y7WA 3TUSA 1A8FA 2PMSA 1SQYA 2H9BA 3AXFA 3EHSA 4O3AA 3U94A 1B05A 3S4UA 4PETA 1ZLQA 3IX1A 3MAMA 3CSBA 2F6PA 2HXWA 1AH5A 4XKPA 1R6ZA 2ZMBA 4PFYA 1IQ7A 2WKYA 4LZ8A 4O3BA 2RCAA 4TOZA 2NWJA 5AA4A 3IB0A 2F7AA 3ONMA 3K1PA 1I69A 3PPRA 4YU0A 5H8QA 3W9WA 1AOVA 1MQJA 4POWA 2I4BA 4OFLA 3ZKLA 3D4GA 4R73A 1B3FA 2I3VA 1XT8A 2Y84A 3FXQA 1B51A 1MPDA 4R9GA 4XXUA 1FTJA 3PPPA 4QFPA 2A5SA 2H99A 3PUWE 1QULA 1MXXA 1P1UA 4AB5A 5HM4B 3IL1B 4IB2A 1SW4A 4RK9A 5FHOA 5F1QA 3LC8A 3FVGA 2I58A 2ONKE 4Q30B 4IY6A 1O7TA 3PD9A 3PUVE 1RKMA 1JW4A 1SD3A 2GFEA 3T9XB 2GHBA 1GV8A 1RYOA 3LSXA 1MPBA 4Q0CA 4ZDMA 2I6EA 3VFJA 3DP4A 3TEPA 3N5LA 1N0TA 3SEXA 1EH3A 4GIZA 1MY3A 5I2NA 4GOTA 1UQWA 3WAFA 1FQCA 4ZE9A 3K2DA 1B3EA 3K6UA 3Q28A 1JEVA 4QF9A 4H0WA 3PMWA 4KYDA 3LSWA 1LCTA 3R6UA 3KJ7A 3EHTA 4GXSB 4IO6A 4ZECA 2QL3A 4G77A 1USYE 3IAZA 1ZIUA 1XHYA 3B6QA 4JSDA 1MY1A 1ZKBA 1SW5A 5DVFA 5H8HB 2Z22A 3H3GA 4XKRA 5I56A 4F29A 2ALUA 3G7WA 3RNNA 1JNFA 2I49A 2YLNA 3FD3A 2UVGA 1MRPA 3Q27A 2G29A 1B32A 5LOMA 2OK2A 1JQFA 1S9TA 2XXXA 2F36A 3A3UA 3T9HB 1B0HA 1GGGA 2QMWA 1S50A 5H8NA 4QFNA 5TPAA 2ZXTA 4G68B 4FEDA 4JXIA 4QFOA 4FIMA 1EU8A 1IIWA 4I9DA 5DTBA 1SYIA 1UTBA 3FXUA 4BDLA 3RT6B 1MY2A 5L8DA 5F7VA 3S9EA 4KHZE 3CG3A 4RJZA 3UP9A 3TZAA 2DYXA 1DTZA 5ELVA 3QYTA 4F1VA 4U22A 4L17A 4M1VA 4HS7A 4R2FA 1S7YA 2QJEA 3QK6A 1QKAA 5B70A 4WXJA 4YB5A 2OWTA 1J1NA 1OQHA 1NMUA 5I58A 1MXUA 3KBRA 4C0RA 4GRKA 3TODA 4F3SA 4BLAA 3OD7A 4PQJA 3PU5A 3G3HA 3EQ1A 1SVXB 2V84A 3EPEA 3FV2A 1B1HA 4RXLA 4LATA 4KPTA 2HCAA 4I8CA 5M2VA 3UN6A 3VVFA 4ZZAA 1A54A 1LAHE 4OXVA 1SW1A 1LAXA 5EHMA 4HTGA 4NF8B 2CZLA 3SEYA 3HPIA 2QSXA 1AIVA 4WEPA 3C33A 1MM7A 2X7QA 3BBRA 4LP2B 3CIJA 4WKMA 3QIMA 3O28A 3O29A 1B3GA 4YAHX 4OESA 4I1DA 3K6WA 3U93A 4BDNA 4H1XA 3U72A 3PV0E 3K02A 3TTMA 4HCWA 4THIA 2E0SA 2PVUA 4MH5A 2P0SA 3ZS6A 1FTMA 3E13X 3CG1A 4GD5A 4GFRA 5DEXB 3TQLA 3O9PA 4XIGQ 1IXHA 2CMOA 3DP8A 4N6PA 2PBWA 2I48A 4ELPA 2Q2AA 1FTLA 3ILTB 1MH4A 2FYIA 1HSJA 1XC1A 3RQTA 4F2QA 4POXA 1H76A 1D9YA 1N7WA 2G93A 4U23A 3N6TA 1EZPA 3O6HA 3M3KA 1Y3QA 1CE2A 3SETA 4NE4A 3HSTA 3KN3A 3JYRA 3SEVA 4Q5TA 3ZKKA 4F3PA 4DXBA 1LCFA 3FASA 1A40A 3K1MA 3M3FA 1FQBA 4X48A 2NVUB 3MPLA 3IOTA 2RINA 5AA2A 1TFAA 2ZYKA 2ZYOA 1B7UA 2UXAA 3E3KA 3DM0A 3OELA 2REGA 3UORA 4DXUA 2DE3A 1OLAA 1OIBA 4H65A 1Y4TA 1O64A 1PDAA 3HN0A 4R74A 2QRYA 4LA9A 4KCDA 4R9FA 3VLVA 3U92A 2XXHA 4DIGA 3M3LA 4EQ9A 1M5DA 2YJPA 4K3FA 3SEUA 5ITPA 3FUZA 4NWCA 4UA8A 2AL5A 1I6BA 4Z0IA 2V3QA 2H4IA 1D4NA 3PMVA 4LQ2A 5ICQA 4LVQA 2REJA 4EF2A 5IKBA 3HHFA 3TTRA 3CFXA 4TQUQ 1B2HA 1B46A 2ZNSA 2OLBA 5I57B 2DWAA 1POTA 3W9VA 3VVEA 3MVZA 1NH8A 3MJNA 3BKIB 3MPKA 5FHNA 3RTFB 1D9VA 3PGFA 3SDFA 3MP8A 4ONYA 3EHUA 3TTNA 4QFKA 2XXQA 1Z7ME 3IOWA 3TAJA 4E0WA 3PPQA 4LUBA 1JVXA 4TLMB 3TCHA 3H7MA 3QXMA 2QS2A 1URDA 5H8FB 1IITA 2A5TB 3QUJA 2OZZA 2Y7IA 2Q9TA 2XXTA 4YB6A 2O1MA 4N13A 1P99A 3VXBA 2H98A 3H6VA 2Z8FA 1A55A 4NF4B 2XD3A 5A5XA 2UYEA 1H45A 1Y3PA 4FJPA 4YKPA 5CBSA 4U2RA 4QHQA 1AMFA 4U1OA 1FQEA 2VGQA 3OEKA 2Z23A 3Q26A 4ESXA 3IJOB 1GVCA 3EF7A 2XHDA 5CMKA 2PYYA 2NUVA 3O97A 3H06B 1LFIA 3PMXA 1A99A 1MQGA 5AA4B 3KN8A 1RYXA 3KG2A 4N07A 2LAOA 4DCYA 4JB7A 4I62A 4ELOA 4KCCA 5H8QB 1Y20A 1HSEA 1ZTYA 4U21A 2DQVA 1OLCA 3E4RA 1XS5A 1PB9A 3KFMA 3VV5A 4OERA 5JK4A 2DWHA 4NF5A 1PEBA 3B6TA 3LR1A 4GQOA 5I2KA 4ZE8A 2XXWA 4GL8A 1JETA 1BKAA 4ZZEA 3O6GA 4ELQA 4MF3A 1WVJA 2XXIA 3HO7A 3S9MC 3H03A 3TQWA 4KR5A 4OQOA 5TP9A 3FJ7A 1USYH 3T66A 1XOCA 4F19A 2UVJA 1LAFE 1M5CA 3VVDA 1BIYA 1PB7A 4OETA 1LSTA 4C1UA 2R71A 3BFUA 3FJMA 4OWDA 5DYHA 1OVTA 2D21A 3Q25A 5CI5A 2H5YA 4LQ5A 5I2NB 1POY1 1SDXA 3UA8A 3ZSFA 1LB8A 4NF6A 1ZU0A 3ECRA 1NNTA 3RPWA 3B7DA 1LLSA 1VE4A 4IY5A 1P1OA 3KN7A 4RPNA 5I59A 3C32A 5ITOA 3V5AA 3KEIA 4ZEIA 1IXGA 4P0GA 5TU0A 1A8EA 4RA1A 5CM6A 2KLFA 2I0CA 1QUJA 1VR5A 4NMYA 1H44A 2O69A 5I56B 1B52A 2HFBA 4YICA 3K1NA 3VXCA 3IR1A 3F11A 3K6VA 2XXVA 4DDDA 3DLNA 3HHGA 3MZBA 5DT6A 4AB6A 3A09A 2AIXA 5H8NB 3PUXE 4R72A 5TPAB 1VFEA 4P11A 4G68C 3MBPA 5CMCA 2VD2A 4E0XA 3JZJA 1UTBB 4GL0A 2Z8DA 5JTYA 2ESNA 1Y9UA 4EDPA 1DTGA 3UIFA 4ZEFA 1LBBA 5DVJA 2HAVA 2UVIA 3T9VA 3FZVA 3KOSA 1YTVA 3KZGA 2XX8A 1O63A 3C34A 4R6YA 3IOUA 3MVXA 3V8XB 2VHAA 3RLFE 3OSRA 5I58B 3FVKA 1MH3A 1NKXA 3LBSA 4ZEDA 1N84A 3OENA 5FHMA 3G3KA 2M8CA 4ELRA 5H8SA 1GTKA 1MG1A 2Y7RA 4GVOA 4R6HA 3MW0A 2I0BA 2FA7A 1N04A 4F3BA 4F22A 2FNCA 1MDQA 3MP6A 2QPQA 2XX7A 2Q8JA 4IO3A 2Z8EA 2NXOA 4FE8A 5CC2A 3QAXA 4PFUA 4OHNA 4IGRA 3QSLA 3S9NC 3K0VA 1BP5A 2O7UA 1YPNA 3CFLA 3V89B 1NNFA 5BWJA 3RUMA 3FIRA 3A3CA 4H8IA 3MQ9A 3G3FA 3GBBA 1B6HA 2HQ0A 5KDTA 2V3TA 1SYHA 2B3FA 2NOOA 3GLBA 3KSJA 4ESWA 5BUUA 2GRVA 2XX9A 1Y1MA 1AL3A 3SERA 1VFDA 1Q1KA 1UTHA 2DP8A 1FCKA 1LFGA 1NL5A 4F1YA 1GR2A 2VP1A 1I6QA 1DMBA 3CR9A 4KYEA 3QUFA 1MQHA 3MZ1A 3S2VA 2DXRA 4H5FA 4KQPA 1JW5A 3FATA 4IO2A 3IJXB 1OMPA 2F78A 2F5XA 1Y1ZA 4EQ7A 4X1DA 1HSLA 1WDNA 2PX1A 3IB2A 3MWBA 1R9LA 2UYFA 3TTLA 4QSCA 3TYHA 3UK4A 3D4CA 5AA1A 1MDP1 4MFIA 3G3GA 2Q88A 1P1WA 3ODBA 4AQ4A 4F3GA 3KJTA 2F35A 5AA2B 1URSA 3THIA 1MXZA 1B1XA 3B6WA 3IO4A 1EZ9A 1MQDA 3OSQA 4MBPA 4FORA 3TPAA 4U1ZA 3N6UA 2XXUA 4RY1A 2O7IA 5L9SA 4LZ5A 4UACA 2V25A 1L5TA 3TDJA 2OCUA 4GF8A 2P1SA 4ECFA 2XXPA 1FTKA 3Q29A 1URGA 3G3IA 3VE1B 4H5GA 1YAEA 2IA4A 2ZYNA 4EF1A 1YCJA 3PUYE 3RT8A 3S9LC 4MLQA 2AL4A 3IOVA 3ILUB 2F7BA 2OWSA 3OO7A 1FQFA 5KZTA 4U4XA 1UIUA 3I3VA 1MXVA 5CMBA 1B40A 3E9XA 3G3JA 1IZ1A 3CRBA 1Y4CA 2RF1A 3TFLA 3CSGA 1B58A 1B3LA 4OMBA 2V3UA 5KCJA 3RTWB 2F7CA 1M5FA 1DSNA 4DCXA 1Y3NA 3RN8A 4BDMA 5J1DA 3JV9A 3K01A 4ZEKA 3K6XA 3U8QA 5K2XA 5L9OA 3FXRA 3KOTA 4RYAA 3CVGA 3FV1A 4DXCA 5CBRA 2O51A 2DXYA 4X9TA 4MLVA 1II5A 1PBPA 3UGWA 3DP6A 2Y7PA 1TT1A 3PPOA 5K2YA 3WAEA 5DVIA 4EXKA 5FTIA 2X7PA 2D5WA 5IAIA 4RPOA 3O2AA 3C31A 1ZMGA 5A5XB 4XTCQ 1IXCA 2RKMA 5EHSA 5B7DA 2RC9A 3LSLA 3GZGA 4R6KA 4G8NA 3T22A 2V93A 3LSFB 5JEIA 2HZLA 3PUZE 4F39A 4KFQA 4IO4A 1JW1A 4OFJA 3K00A 1LFHA 5FTHA 2O1LA 3C35A 3MUQA 3FVNA 4JWYA 1QUKA 1MS7A 4OTEA 3KSXA 4FATA 3LUYA 4X1BA 1WODA 3OO9A 4C1TA 2PT1A 5ISUA 4GLIA 1PC3A 1SBPA 3H6WA 2XD2A 3IB1A 2ANJA 2HEUA 2DS9A 2VOZA 2O68A 4XKNA 1MQIA 1SI0A 4WEDA 1LAGE 4OFOA 4F31B 3VLUA 3USDA 2B65A 4NF5B 1M5BA 1H43A 2OJTA 1B5JA 5I2KB 2DVZA 3HCQA 5HPQA 4QRZA 1B0LA 2DE2A 4JWOA 1MY0A 1N3XA 2HAUA 1QKBA 3SESA 5TP9B 3OO6A 3KGCA 4R75A 4PFTA 3TTKA 5I84A 1BLFA 2RC8A 4EQBA 1P1QA 5CRYA 2W7YA 2B3BA 5AA3A 2DWIA 1T0KA 4JDFA 4JWXA 3OXNA 3TELA 4HW8A 3M8UA 4G2ZA 5H8HA 1D3KA 3MVWA 1N7XA 1B3HA 3T93B 4NF6B 4LONB 3TCFA 1MY4A 4QSDA 4NTLA 1Q35A 4ND9A 2GHAA 1KWHA 4G8HA 3MVYA 5I59B 1LB9A 1CB6A 3T9UA 4YMBA 4G68A 1XVYA 1QVSA 1B5IA 1IEJA 1NNPA 4QSEA 3SEWA 4HCYA 2F8DA 1M5EA 2P2AA 4F18A 4Z7EA 2DVCA 1DPPA 4BDRA 3IK6B 3R7XA 2ONSA 1JVYA 3EN3A 1FQAA 4PP0A 3TKDA 3PPNA 2Q2CA 1B7HA 2OBGA 4PFWA 1MXWA 4O3CA 1H3DA 3OEMA 2R6GE 3O6IA 1OVBA 5AE4A 4R2BA 5JTYB 4ZEBA 1FTOA 3TMGA 1QW0A 4KYSA 1ANFA 1LBCA 4M4GA 4KD5A 1TFDA 5AA2D 5HBCA 2ZNUA 3V83A 2ONRA 4JBZA 4NF8A 3RGYA 3MP1A 4RNSA 2QMXA 3IO6A 1TXFA 2O84X 3HV1A 4OEVA 4Q8RA 2VD3A 1B7ZA 1B4ZA 2O6AA 2QS1A 1IUDA 1SI1A 3IORA 1Z7NE 4G8MA 1PBQA 2F97A 4IO7A 3H4ZA 1PB8A 4DZ1A 4BDOA 4DE8A 1N3WA 3W15C 3FGSA 3VDFA 3RY3A 4FECA 1JEUA 1I6AA 4NWDA 5DEXA 3VLWA 3BFTA 3GBAA 1QUIA 2RCBA 1B5HA 3T96B 4F1UA 2DE4A 4GXAA 4YMAA 4OZ9A 2AYSA 2XXYA 4LZ7A 1BTJA 3GXAA 1ATGA 4EXLA 3MC2A 1DPEA 2IEEA 4F2OA 4U4SA 4OYVA 3OOAA 4G4PA 4NEDA 1US4A 3C36A 3I5OA 5KDTB 2R9JA 1NNKA 4TLLB 2F6GA 2HZKA 4KI0E 2Q89A 3C9HA 5L9MA 3L6GA 1TWYA 4YZZA 1UTHB 3H6TA 1R9QA 2ZNTA 1LGBC 3CI8A 1A7LA 4OENA 1MM6A 2DOJA 3PD8A 4H8JA 2DSFA 4IO5A 1B9JA 2RC7A 3H6UA 4ISUA 1R1NA 2F34A 4PE5B 1B4HA 2QS3A 1ELJA 4XKQA 4GWOA 3U1OA 5CMMA 3CFZA 1MXYA 2YPNA 1UIVA 1NFTA 1FQDA 3MZ9A 2XXRA 3R26A 1US5A 3N94A 3N26A 2I4CA 3I6VA 1FW0A 2QS4A 4YKJA 1F9BA 1OQGA 1ZJLA 1IXIA 4BDQA 4RK2A 3SKPA 2I3WA 4FEBA 1SW2A 2D3IA 4OEUA 4ZS9A 1MPCA 3TCGA 2BJJX 4DLDA 1ZBMA 3L6HA 2DWJA 2ZYMA 4P0IA 5I57A 3P7IA 1NH7A 2H25A 2GH9A 1DOTA 3FVOA 3OO8A 4H6DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FJGA 3OMBA 1P1NA 3ROJA 2UVHA 3K4UA 2Y7KA 4IGTA 4P1LA 4YKKA 2THIA 5EYFA 4EUOA 4KXPA 2CZIA 1DCUA 1N76A 5H8FA 4QFLA 1EZOA 4OVJA 5ICTA 1XVXA 2A5TA 2E1SA 3O66A 2ABHA 3DELB 2X26A 3C4MA 5KCJB 4YB7A 4FAJA 4H67A 4N8GA 1VSOA 4JSOA 4NF4A 2PT2A 1QJMA 4OVPA 3T1BA 4YKIA 4MEVA 2Y7WA 3TUSA 1A8FA 2F3DA 4I40A 2PMSA 1SQYA 2H9BA 4GX6A 3AXFA 3EHSA 4O3AA 4OVQA 4UABA 1NV5A 3U94A 1B05A 3S4UA 4PETA 1ZLQA 3IX1A 3MAMA 3CSBA 2F6PA 2F3BA 2HXWA 1AH5A 2VPOA 4XKPA 1KA1A 1R6ZA 2ZMBA 4PFYA 1IQ7A 2WKYA 4LZ8A 4O3BA 2RCAA 4TOZA 2NWJA 5AA4A 3IB0A 2F7AA 3ONMA 4MMPA 3K1PA 1I69A 3PPRA 1FBCA 3LUZA 4YU0A 5H8QA 3W9WA 1AOVA 2HXRA 1MQJA 4POWA 2I4BA 4OFLA 3ZKLA 3D4GA 4R73A 1AWBA 1B3FA 5ET6A 2I3VA 1XT8A 1RDZA 2Y84A 3FXQA 1B51A 1MPDA 4R9GA 4XXUA 1FTJA 3PPPA 4QFPA 2A5SA 2H99A 3PUWE 4NN3A 1QULA 1MXXA 1P1UA 4AB5A 5HM4B 3IL1B 4IB2A 2WYPA 1SW4A 1FRPA 4RK9A 5FHOA 5F1QA 3LC8A 3FVGA 2I58A 2ONKE 4Q30B 4IY6A 1O7TA 3PD9A 4G61A 3PUVE 1RKMA 1JW4A 1SD3A 2GFEA 3T9XB 2GHBA 1GV8A 1RYOA 3LSXA 1MPBA 4Q0CA 5T3JA 3KBZA 4ZDMA 2I6EA 3VFJA 3DP4A 3TEPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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