1FTOA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in the apo state at 2.0 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftoA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftoA01
3TPAA 1MH3A 3FJMA 2F7BA 1PBQA 3IB2A 1UTHA 3MVYA 5K2XA 1I69A 4X9TA 2XXIA 1YAEA 2VD2A 1B58A 4YAHX 3GBBA 3UN6A 3H3GA 4LP2B 3KN3A 2R71A 3TTRA 3ILUB 1MY4A 1HSEA 3B6QA 3WAFA 2CZLA 2Z8DA 1ZJLA 4GRKA 3DP6A 5AA2B 2ZNTA 5DVJA 4ZEFA 3HO7A 2X7PA 1IUDA 3LSWA 1B5IA 2I3VA 4FATA 4NF6B 4KR5A 1QKBA 2Y84A 1QUIA 2HQ0A 1Y1MA 1M5CA 2YJPA 1NNTA 3T93B 3IOVA 4E0XA 2RF1A 3A3UA 1ZIUA 4PETA 4YKIA 4WEPA 2F6GA 2PBWA 3K00A 4POXA 4PFYA 2H9BA 4IY6A 2DVCA 3VXCA 1M5BA 1NKXA 3UGWA 2DXRA 3O6IA 1JNFA 4H8IA 4DCXA 4KQPA 1P99A 3DP4A 3JYRA 3O6HA 5I2KB 4F3BA 2XXTA 4F1VA 5EYFA 4OYVA 2O6AA 2AIXA 3TKDA 2F6PA 2QMWA 1LGBC 3FASA 2O69A 3SETA 4GF8A 4RY1A 2GHBA 1US4A 3RGYA 4X48A 1KWHA 3HHFA 4PFUA 3RY3A 2OK2A 3USDA 1JEVA 1SW5A 1II5A 1IXIA 4RK9A 4DXBA 2ZYKA 4ZEBA 4F3PA 1ATGA 3TTKA 3U93A 3FJ7A 5CMKA 4EUOA 1B7ZA 3CSBA 4GFRA 3VVEA 3IOWA 1B3GA 2VP1A 3PUZE 3MAMA 2V3TA 5DTBA 3RTWB 4GOTA 4ONYA 5CBRA 1AOVA 3T9VA 3TCGA 4IB2A 3KN8A 2RC9A 5I57A 2QS3A 5L9MA 1ZU0A 4R75A 1TFAA 3E13X 3IR1A 1O64A 1CE2A 4QRZA 4NTLA 4I62A 1Y3NA 1A40A 3HV1A 3C4MA 5DVFA 1JQFA 3O29A 1DMBA 4KPTA 4PFWA 2H98A 4LZ8A 1LB8A 1BIYA 4NWDA 3VE1B 2H4IA 4R6HA 3MZ1A 1MY1A 3CVGA 1PBPA 5H8NA 3O2AA 3U92A 3S9LC 3T9UA 3QYTA 3H6TA 4ZE9A 3EHUA 5CM6A 1OMPA 2I48A 4G8HA 4Q5TA 2REJA 4IGTA 3KZGA 3KSXA 1JW4A 3FIRA 3KN7A 1P1QA 1B5JA 1SI0A 3Q28A 4RA1A 4OMBA 1P1WA 4IO7A 3TDJA 1EU8A 2AYSA 4JSDA 3ZS6A 2WKYA 4IO5A 3M3LA 3G3FA 2IA4A 5JTYB 3VLUA 3ECRA 3CIJA 4IO4A 1F9BA 3V5AA 3C36A 3H4ZA 4FEBA 4ELOA 3MUQA 2Y7IA 3THIA 3BFUA 4NF4B 4KHZE 1R6ZA 2HAVA 1MRPA 3IB1A 4F2QA 5L8DA 2XXWA 3B6WA 3IL1B 2B3BA 3V89B 3TQWA 3E3KA 1HSLA 1P1NA 2XX7A 1USYH 4MBPA 3QXMA 1MXUA 2F7AA 3KJ7A 4M4GA 1Y20A 2QJEA 2PVUA 1UTBA 3G3KA 4H0WA 4LZ7A 2Q2CA 3T22A 4H8JA 1I6BA 1LFHA 1B32A 2I58A 3C31A 1IQ7A 2KLFA 2ABHA 1B9JA 3T66A 3K4UA 4ZZEA 4ZDMA 3FXQA 1T0KA 2I0CA 2M8CA 3K6WA 3K1MA 1RYXA 3PV0E 1B51A 1Q35A 5TPAA 1N0TA 3A3CA 4ESXA 1B0HA 3R6UA 4TLMB 3DP8A 1O63A 3RN8A 2I3WA 2UVGA 4OTEA 3RT8A 1DOTA 3U1OA 3RT6B 4GL8A 3R26A 1XVYA 4KCCA 2G93A 3QIMA 4FIMA 4K3FA 2NWJA 5IKBA 1M5DA 4BDRA 4BDQA 1VFEA 4F31B 1A54A 2Z22A 3SERA 1MQGA 2F5XA 4C1UA 4DE8A 2OCUA 5H8QB 1DTZA 3PUVE 1BLFA 2CMOA 3FJGA 4HS7A 3PGFA 4BLAA 3I5OA 3BBRA 3B6TA 4M1VA 1MXVA 4QSEA 3KJTA 3SDFA 1YCJA 2Z8EA 1FTLA 1D9YA 2O1LA 2RC7A 1S7YA 3UIFA 3MP6A 5ELVA 1FQBA 1TFDA 2UYFA 1TT1A 3LC8A 4U1OA 4ZZAA 1B7HA 4Q30B 2GRVA 2P1SA 1B7UA 2XD3A 4F22A 5H8SA 2ANJA 5H8NB 1EH3A 3C9HA 3CI8A 3S2VA 2A5SA 3OSRA 2R9JA 3TODA 1SYHA 4EDPA 1A8EA 5H8FA 2XXRA 3RUMA 3KEIA 4DXCA 4DDDA 3ZKKA 3Q26A 1MXYA 1JW5A 3ODBA 3VDFA 1SW4A 3OO6A 1LB9A 4OETA 3PMXA 5DT6A 1TWYA 3ZSFA 2ZYNA 1QUKA 4G2ZA 2ONRA 4MH5A 3TCHA 3GBAA 5KDTA 2Q88A 5FTIA 3FATA 3T9HB 4QSCA 1QKAA 1R9QA 4R2BA 3CFLA 1J1NA 2I6EA 1PB7A 4X1DA 1ZTYA 4EF2A 1B1XA 4NF8A 1UTBB 1FTMA 2Q89A 1OVBA 1IXHA 5K2YA 5KCJB 2UVIA 3VV5A 4L17A 1FQAA 3SEYA 4OHNA 5B7DA 5DVIA 3G7WA 4G77A 4YKPA 3QUJA 1B3HA 4N6PA 3RLFE 1S9TA 3N6UA 3OMBA 3T96B 5ITPA 2FNCA 2HEUA 1MH4A 3EPEA 2V93A 4QHQA 4DIGA 2ONKE 4O3CA 5TP9A 5A5XA 3LBSA 2Q9TA 4YB5A 5ISUA 1OLAA 1UQWA 2E0SA 2RKMA 3IB0A 1PB9A 4R9FA 1PDAA 4NF5A 1R9LA 3P7IA 5FHMA 2HAUA 1POY1 2P0SA 1B2HA 2REGA 2YLNA 3CFZA 1LFGA 1FCKA 3OOAA 4OERA 2O1MA 3K6XA 3TUSA 4U22A 1B0LA 2DYXA 2Y7RA 2V84A 4H67A 3ILTB 1N3WA 1URGA 2PT2A 5I59A 4LONB 2Z23A 3K6UA 4YB6A 2XXXA 2Q8JA 2RC8A 4OFLA 3CFXA 1B4ZA 2ALUA 4EQBA 1POTA 4XKPA 4F19A 4R2FA 3DM0A 2O84X 5CRYA 1NH7A 1LAHE 4C1TA 1H3DA 1I6QA 2RCAA 2Y7WA 5H8HB 5DEXA 1XT8A 4ELRA 2DXYA 4OEVA 4GIZA 3VVDA 5FTHA 5CMMA 3E9XA 3MBPA 4GXAA 3FGSA 2ESNA 3UA8A 4TQUQ 1FQEA 5AA3A 4ELQA 1MXXA 1MM6A 5JK4A 3IO4A 1JVYA 4C0RA 1IIWA 4IO2A 4LVQA 3KFMA 1Y4TA 4N07A 3LSXA 4DXUA 3K0VA 4JWXA 3RPWA 4NWCA 3M3FA 2V25A 1P1OA 1XVXA 5EHMA 4KFQA 4G68A 4Z0IA 3MVWA 1ANFA 1MQHA 4HCWA 3MP8A 1QUJA 3LSFB 1QJMA 2A5TA 3K1NA 1EZOA 1ELJA 4EQ9A 3TYHA 4U2RA 3KBRA 4KYEA 1ZKBA 1LBBA 4LQ5A 1OLCA 2O51A 2VGQA 1SD3A 5I2NB 4OFJA 1FQCA 4YKKA 1IXGA 5ICTA 2RCBA 2AL5A 4P11A 4FJPA 3K02A 3H06B 3OELA 3DELB 5I58A 1UTHB 3PPNA 3HHGA 4JSOA 4PQJA 1B05A 5HPQA 4QF9A 1MM7A 4R72A 3OENA 4TLLB 4F3SA 1GV8A 1FTJA 3H6WA 1NNPA 1ZMGA 3CG1A 3D4GA 2P2AA 4OWDA 1PC3A 2B65A 5F7VA 1WDNA 5KZTA 1SBPA 2H5YA 4H1XA 4NF8B 3KOTA 2ZYOA 1MS7A 5I56A 1SW1A 2ZNSA 1DTGA 4ND9A 3W9WA 3HPIA 4U23A 3ZKLA 4WKMA 1URDA 3OEMA 4RK2A 1Y1ZA 4X1BA 4KYSA 4H6DA 2YPNA 2XXHA 5TP9B 5A5XB 1D3KA 3SKPA 3OSQA 3VLVA 2F36A 4YKJA 1XHYA 2XXYA 3PD9A 1NL5A 4GL0A 1FTOA 1ZBMA 2F34A 5EHSA 4NF5B 4ZEKA 4OZ9A 2QS4A 3MP1A 1RYOA 1B3FA 3TTMA 4RNSA 2D5WA 1AIVA 1LLSA 2Y7KA 1I6AA 1MXZA 5JEIA 4IO6A 1DPPA 2XD2A 5AA2A 1O7TA 1SYIA 1IITA 2HZLA 3KOSA 4LZ5A 2VOZA 1H76A 1BP5A 4U1ZA 5I59B 1MQJA 1WVJA 4H65A 4YU0A 3FD3A 4YMAA 5FHNA 3FUZA 2D3IA 3EHSA 2I4BA 2DWJA 1UIUA 4JWOA 1MDQA 5DEXB 1MY2A 5TU0A 1LCFA 3MC2A 4ELPA 4XXUA 2RINA 4POWA 1VSOA 2OWTA 4IGRA 4JB7A 1LAXA 1YPNA 4OQOA 3MPKA 4LUBA 3G3IA 4YICA 3S9NC 3TCFA 3F11A 2F8DA 1S50A 5CI5A 2PX1A 1IEJA 1A7LA 4G8MA 3SEWA 3H03A 3OO7A 4I9DA 2DSFA 2PMSA 5I57B 1Q1KA 4Q0CA 3FXRA 1GR2A 2QSXA 3OEKA 2DOJA 4G8NA 5ITOA 3I3VA 3FXUA 3FVOA 1QULA 5J1DA 2XX8A 4YB7A 3TEPA 1JW1A 4G68B 4U21A 2O68A 3VFJA 2QS1A 3OO9A 3L6HA 1H45A 1XS5A 4HW8A 3IORA 3S9MC 4F29A 1LCTA 2NVUB 2GH9A 1SQYA 3MVZA 1B3EA 4QSDA 1TXFA 3LR1A 3GLBA 2NOOA 3O28A 2OZZA 3B7DA 4TOZA 4G4PA 4N13A 4NMYA 4E0WA 2X26A 3MZBA 2B3FA 4UA8A 5LOMA 1P1UA 3IJXB 2DE3A 2Y7PA 4GWOA 3KGCA 3S4UA 4R6YA 3W9VA 3IOUA 2DWAA 4YMBA 4U4SA 3OD7A 4MFIA 4RYAA 3VLWA 2X7QA 4R6KA 5I56B 1MPCA 1Y9UA 3U72A 4KCDA 3C32A 3N6TA 1XOCA 4LA9A 3TFLA 4EF1A 3FV2A 5AA4A 2FYIA 3TMGA 2F97A 3G3HA 4IO3A 4QFOA 4XTCQ 3SEVA 1D4NA 3PMWA 2H25A 3I6VA 1R1NA 1DPEA 1LBCA 2DP8A 3GXAA 3MJNA 5F1QA 2PYYA 3K01A 2OLBA 2QS2A 2DE2A 1Z7ME 4RPNA 4LQ2A 2H99A 1SW2A 3PPPA 2XHDA 1N7XA 3BFTA 3MZ9A 1JETA 5JTYA 3RTFB 3IX1A 2LAOA 5AA1A 4QFLA 2OWSA 2HCAA 4KD5A 1OQGA 4GD5A 3VXBA 3IAZA 4H5FA 1A8FA 4ISUA 4O3AA 3H7MA 3V8XB 4QFPA 3OO8A 1Y4CA 4GXSB 4NF4A 4Z7EA 4Q8RA 2XXUA 5TPAB 2QMXA 1QVSA 1B1HA 5L9OA 2UVJA 1BKAA 2F35A 4JDFA 3GZGA 3K2DA 1MG1A 4ZECA 3EN3A 1OVTA 2HZKA 1NNKA 3PPQA 1WODA 3U8QA 1VR5A 4GVOA 4F39A 5DYHA 2XXPA 1Y3PA 3G3JA 1Z7NE 3TTNA 2PT1A 3UK4A 1UIVA 2UYEA 4ZS9A 3VVFA 3FV1A 4U4XA 3JV9A 3RQTA 1JVXA 3S9EA 4P0GA 2UVHA 5I84A 1PEBA 4KYDA 2E1SA 4R74A 3RNNA 3TELA 5HM4B 4XIGQ 3CR9A 4BDMA 3MQ9A 2OBGA 1A55A 1OIBA 1SVXB 3IK6B 2ZXTA 3CSGA 3HSTA 4QFKA 5CC2A 4I1DA 1GGGA 3LUYA 1MY3A 2F7CA 3EHTA 2QRYA 2HFBA 5CBSA 2QPQA 1N04A 3BKIB 3ONMA 2DE4A 4DZ1A 1FQDA 4DLDA 4OENA 3C35A 1OQHA 5H8QA 2NUVA 2F78A 4DCYA 3W15C 3IJOB 2XXQA 4WXJA 4FAJA 2DWIA 5CMBA 2FA7A 1Y3QA 4F1UA 3H6UA 5H8FB 4ZEIA 2HXWA 3PUWE 2IEEA 1MXWA 3PUYE 1H44A 4NE4A 1M5FA 3T9XB 3N5LA 2O7IA 3O6GA 1DSNA 1EZPA 3N94A 4F18A 4GLIA 1MDP1 3L6GA 3C34A 3MPLA 3O9PA 3G3GA 3UORA 3FVKA 3CG3A 4OESA 4ECFA 4ZEDA 3QUFA 3LSLA 2VHAA 3M3KA 3PMVA 1GTKA 1N76A 4LATA 1VFDA 4THIA 1MQDA 1NFTA 5KDTB 1SI1A 4JBZA 5AA4B 4BDLA 4UACA 1AH5A 3SEXA 1D9VA 3TQLA 4F1YA 1FTKA 4F3GA 1USYE 3H6VA 4WEDA 4BDNA 5BWJA 2I49A 3SESA 2I0BA 1B40A 1B6HA 1LSTA 3PD8A 2BJJX 2XX9A 3WAEA 1JEUA 5AA2D 4QFNA 2XXVA 5BUUA 2VD3A 1ZLQA 3K1PA 2ONSA 1B46A 4RJZA 4RXLA 1M5EA 5HBCA 5L9SA 1EZ9A 1B4HA 1URSA 3FVGA 5ICQA 3MW0A 1B52A 3MWBA 4PP0A 1VE4A 3QK6A 4HTGA 3TZAA 1SDXA 4H5GA 1XC1A 1LFIA 2AL4A 1B5HA 5B70A 3O97A 4IY5A 3PPOA 2Q2AA 5KCJA 1MY0A 4ESWA 1L5TA 3CRBA 1RKMA 1US5A 3Q27A 1CB6A 4F2OA 2QL3A 2DVZA 4OFOA 1AL3A 4EQ7A 3O66A 4FORA 5CMCA 4MF3A 3QSLA 3PUXE 3PU5A 1B3LA 4NF6A 3A09A 1FQFA 2D21A 2ZMBA 3SEUA 4AB5A 3KSJA 3E4RA 3FVNA 5M2VA 4AB6A 4EXKA 3KG2A 1HSJA 3TTLA 4OXVA 3IO6A 4FE8A 5FHOA 4EXLA 4NEDA 5I2KA 4GQOA 3R7XA 4AQ4A 1NH8A 3Q29A 4OEUA 3UP9A 4RPOA 1NMUA 3JZJA 4XKQA 1H43A 1LAGE 4BDOA 4O3BA 4FECA 3HN0A 3QAXA 1FW0A 4OVJA 3IOTA 3N26A 2GHAA 2ZYMA 2UXAA 3U94A 1A99A 4HCYA 2GFEA 3K6VA 2NXOA 5H8HA 3PPRA 2W7YA 4XKRA 2G29A 1QW0A 1N7WA 4P0IA 3TAJA 5IAIA 4R9GA 1BTJA 4MLQA 2A5TB 3FZVA 1LAFE 1N84A 4FEDA 4JXIA 3M8UA 1GVCA 2DWHA 1NNFA 3D4CA 4PFTA 2DS9A 1IZ1A 4PE5B 2DQVA 2O7UA 3DLNA 2ZNUA 2THIA 4ZE8A 1MQIA 4XKNA 1AMFA 5I58B 3HCQA 4R73A 4G68C 3OXNA 2OJTA 4JWYA 3AXFA 3EF7A 4KI0E 1IXCA 2Z8FA 1MPDA 4YZZA 1YTVA 3C33A 3Q25A 2V3UA 3EQ1A 2R6GE 5AE4A 2I4CA 2V3QA 1N3XA 4MLVA 1PB8A 3V83A 5I2NA 1MPBA 4I8CA 3MVXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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