1GV8A

18 kda fragment of n-ii domain of duck ovotransferrin
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
159
structure length
159
Chain Sequence
SYYAVAVVKKGTDFMIKDLRGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLIHRGDIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATTEQKLCRQCKGDAKTKCLRNAPYSGYSGAFQCLKDGKGDVAFVKHTTVQENAPEEKDEYELLCLDGTRQPVDSYKTCNWARVAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Iron transport
publication title The Mechanism of Iron Uptake by Transferrins: The X-Ray Structures of the 18 kDa Nii Domain Fragment of Duck Ovotransferrin and its Nitrilotriacetate Complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords OVOTRANSFERRIN
total genus 45
structure length 159
sequence length 159
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-02-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1gv8A00
3S9MC 1XT8A 4PE5B 3LSXA 2O51A 1SD3A 1FTKA 1OVBA 4QFNA 3GLBA 4XKPA 2V3TA 3K00A 4F22A 3SEXA 1LFHA 3QK6A 4PETA 1MXZA 2DE3A 1YTVA 4IO7A 3PPPA 4NF8A 4YAHX 1B2HA 1FW0A 4OESA 4OQOA 3T22A 2F36A 5L9MA 3DP8A 1N7WA 1TT1A 3OMBA 1PBQA 4QFLA 1B0LA 4R6HA 5AA2A 3SERA 1H45A 2W7YA 4FEDA 3QAXA 3VLWA 1AL3A 3IOVA 4JWOA 3RLFE 3FJMA 4OMBA 3K6VA 5H8QB 3C35A 2REJA 3OD7A 5CMMA 1AMFA 2QL3A 3QXMA 4WXJA 3V8XB 1JW5A 4POWA 3MPLA 3T96B 1YCJA 4G4PA 5B7DA 2O69A 4R2BA 4ECFA 3ZS6A 3Q25A 4OETA 3B7DA 4NF5B 4P0GA 3I3VA 4YZZA 1JVXA 3QYTA 3RPWA 3G3JA 3T93B 2B65A 2ONKE 4BLAA 2QRYA 2NUVA 2PX1A 1J1NA 5KCJB 3PUVE 2Y7PA 4LZ8A 3U8QA 2Y7IA 3LC8A 4F1VA 3TAJA 3HHFA 2XXPA 4GXSB 4I1DA 1OLAA 2QJEA 1II5A 3IB2A 4KYDA 3FVNA 1HSEA 5AA2B 1MY4A 4H6DA 5AA1A 4R73A 2NVUB 1B7HA 4G8MA 3VLUA 3C36A 1LGBC 4QF9A 4JWYA 4G8NA 4NWCA 2G29A 5F1QA 3N5LA 1BIYA 1LBCA 1ZTYA 2DQVA 3E9XA 4H67A 1SW1A 1DPEA 3PU5A 5DYHA 2XD3A 2DWJA 2F7BA 4ZECA 1EZ9A 5CMKA 2RCAA 2HZLA 2H9BA 3AXFA 1USYE 1LBBA 3H6WA 3I6VA 1PB9A 4ZEFA 1AOVA 2ESNA 2B3FA 5JTYA 3ONMA 4DZ1A 3OENA 4DXCA 1YAEA 1EU8A 5H8HA 1H3DA 2F7AA 1SBPA 4LATA 3PUYE 2R71A 4FECA 4YKJA 2FYIA 3FXUA 2AL4A 3SETA 3C33A 3TZAA 1QUJA 1SI0A 5CRYA 1B4HA 3K2DA 4ELPA 3A3CA 4KYSA 4Q8RA 2UVJA 3RQTA 2D3IA 3GZGA 2F97A 3N94A 3KOTA 3SEYA 3O6IA 4E0WA 1FTJA 1O63A 1JEVA 5I2KA 3S4UA 1A40A 1B32A 3TDJA 2R9JA 3T9UA 2XXVA 4OYVA 4U2RA 3B6WA 1NFTA 2HAUA 4H5FA 4G8HA 4EQBA 3UN6A 2HXWA 3CSGA 1UTHA 1I69A 4M4GA 4DLDA 2O7IA 4NF6B 5DVIA 4JB7A 3O6HA 1I6AA 4HTGA 5B70A 2A5TA 4UA8A 5CBSA 1UIUA 5JK4A 4IGTA 4LUBA 3LSWA 3HSTA 3IX1A 1JW1A 3CFLA 2GFEA 3VXBA 1NKXA 3E3KA 4I8CA 4FJPA 3D4GA 2OCUA 2FA7A 3PD9A 4R9FA 4ZEIA 5BUUA 2PBWA 3KSXA 5EHMA 1ZU0A 1TFDA 2O84X 1NL5A 3UORA 1HSJA 1OQHA 1D3KA 4ZEBA 1JNFA 2XXTA 4OHNA 2I58A 4QSDA 2ZNTA 4ESXA 4IO3A 4C1UA 5I2KB 1SYIA 4GIZA 2I4CA 3OSRA 2XXYA 3PUXE 5IAIA 1B4ZA 4GQOA 2I0BA 4DIGA 3K6XA 3BFUA 3ODBA 4QRZA 4MFIA 2RC8A 1MPCA 1F9BA 2P2AA 1A8EA 5BWJA 5AA4A 3IOWA 1DTGA 5F7VA 1TWYA 2H4IA 1QUKA 2DYXA 1UTHB 2D21A 3KSJA 1IITA 4P11A 5I84A 4F1UA 1US4A 2Q88A 2P0SA 3MVWA 2AYSA 1BLFA 4Q5TA 1D9VA 3FV1A 2V3UA 2XX9A 3SKPA 1CB6A 1SW4A 2Q8JA 2OBGA 4KD5A 1PDAA 1FQBA 1MM7A 3RTWB 1ATGA 4QFPA 3W9VA 3R26A 5ELVA 3U93A 2YPNA 3HCQA 3G3HA 1M5BA 3U1OA 3VV5A 3MZ1A 4BDMA 3K02A 5I56A 3C32A 5I57B 1B7UA 1UIVA 1IQ7A 2THIA 3H6TA 2ZNSA 4GF8A 2QS1A 4JBZA 3ZSFA 4IO6A 1GV8A 3EHTA 3K1NA 1EZPA 5AA4B 2DXYA 3CFZA 4F3GA 2OZZA 4YMBA 4OFLA 3L6HA 2HQ0A 1DPPA 3FJGA 4GFRA 1MXYA 3O97A 3HPIA 3C34A 3DP4A 1MQHA 3TPAA 4Q30B 4ZZAA 3RUMA 4XIGQ 1LFGA 3MZ9A 3EF7A 2AIXA 2O6AA 1GR2A 3G3GA 2ONSA 3MAMA 4JXIA 1B6HA 3GBBA 3M3KA 1POTA 2CZLA 4OERA 2Y84A 5DVFA 3K1MA 1JETA 2VD3A 4IO4A 3VXCA 4GOTA 3EQ1A 3KZGA 2UVGA 2ANJA 3CR9A 3OXNA 4EF2A 3IO4A 4KYEA 3M3FA 1BP5A 3E4RA 1JQFA 4MH5A 3G3KA 3G3IA 4QSCA 4F31B 4U21A 4E0XA 3TFLA 3PPRA 1D9YA 5CM6A 1B3LA 4LZ5A 3MVYA 3H4ZA 3P7IA 3KJTA 4DCYA 3JV9A 1QKAA 4BDQA 1B3FA 3H06B 3U94A 4YB5A 5H8FA 1B1XA 1FQDA 4N6PA 4UACA 3RT6B 1T0KA 4H8IA 1MH3A 2YLNA 3LBSA 3THIA 3FATA 3K6WA 1Y3QA 3W9WA 3CFXA 2XHDA 2Y7KA 1XOCA 2REGA 2I3VA 4I62A 1YPNA 2H5YA 4JSOA 1ANFA 1Z7ME 3KG2A 1FQAA 3TCHA 1JW4A 4ISUA 1ZLQA 4FE8A 3QSLA 3FVGA 2DS9A 3OELA 1FCKA 4YB7A 3Q29A 1H44A 2Q2AA 1WVJA 3OEKA 2HZKA 3FGSA 1M5DA 1MDP1 4MF3A 3S9NC 3N6UA 3RTFB 1SDXA 3UGWA 2DVZA 1P99A 1D4NA 2O68A 4FORA 3PPNA 2UYFA 4F18A 2E0SA 1B5IA 5CBRA 4ESWA 4GL8A 2ABHA 2DSFA 5TPAA 1B3EA 3D4CA 3OOAA 2V25A 4XKNA 3HN0A 4G68A 4P0IA 3TODA 3HO7A 4PFTA 4NF8B 3HV1A 1EZOA 3MPKA 3UK4A 3BFTA 5H8FB 1B0HA 1PEBA 1VFEA 1POY1 3O66A 4IGRA 3KOSA 1UQWA 2HCAA 3PUZE 1AIVA 1B3HA 3Q28A 5ITPA 1LAHE 1SW2A 3PUWE 5AE4A 3O6GA 1PB8A 3TQWA 1N0TA 1MQIA 1URDA 4HW8A 1MRPA 4NF4A 1MM6A 5FHMA 1QKBA 3EPEA 3PGFA 2F34A 2DOJA 4THIA 4R75A 3VVFA 4IY6A 1MQGA 1PBPA 3MC2A 1R1NA 1S9TA 2X7QA 1CE2A 1N76A 2QPQA 2X26A 2M8CA 4WKMA 3R6UA 1WDNA 2ZYMA 1NMUA 4EDPA 3TELA 4LONB 4YKPA 3MVXA 4G2ZA 3VVEA 3M8UA 4X9TA 1FQEA 2GH9A 3GXAA 4R74A 2DE2A 4EXLA 4F1YA 1URGA 4G68B 4X1DA 3MP1A 3TMGA 5AA2D 1N7XA 2H98A 5M2VA 5HBCA 3PPQA 3H3GA 3PMWA 4ZZEA 4U4SA 4F2OA 1Y3PA 3KBRA 1O7TA 1LCTA 1Z7NE 4F3PA 4JSDA 2Z8FA 4NWDA 4TQUQ 5CMBA 4GRKA 1LSTA 1LAFE 1OMPA 5EHSA 2NWJA 4K3FA 1OLCA 4PFYA 4R9GA 1B40A 1GGGA 4RK2A 4ELRA 2GHBA 1S50A 2ONRA 4OXVA 2OLBA 3MP6A 4RPNA 4O3CA 4AQ4A 2I3WA 4RY1A 2QS3A 1DMBA 1OQGA 5JTYB 1Y4CA 2GHAA 3IJXB 5H8HB 5HPQA 5FHNA 1RKMA 4KHZE 5I59A 3FVOA 3MUQA 5KDTA 1R9QA 4EQ7A 3L6GA 1I6BA 3V83A 3K0VA 3C9HA 4JDFA 1MY2A 3TCGA 4M1VA 2UXAA 4U1ZA 2Q2CA 1A8FA 1B05A 5DEXA 3PMVA 3PD8A 3K4UA 2QMXA 4NE4A 2IEEA 4RK9A 4DCXA 3BKIB 4BDOA 3TTRA 1QVSA 5CMCA 1MDQA 3M3LA 1BKAA 3TTNA 1MH4A 1B5JA 5ICTA 3CIJA 5J1DA 1FTMA 4ONYA 1FQCA 3C4MA 4F19A 1LLSA 5TU0A 2XD2A 4KFQA 2XXQA 3G7WA 4F29A 5A5XA 2A5TB 4YICA 4H8JA 3IO6A 3ILTB 4OENA 4RA1A 5HM4B 3RGYA 3TEPA 4TOZA 4F3BA 2QSXA 5I59B 3A09A 1ZKBA 2XXRA 1JEUA 5KDTB 3LUYA 3CSBA 3FXRA 4OTEA 3VLVA 3FZVA 2WKYA 4FATA 2IA4A 2XXUA 3LSFB 4FIMA 3TTLA 3KN7A 2V84A 1NH7A 3K1PA 5FTIA 4U23A 1SQYA 3CG3A 3EN3A 4U4XA 2F7CA 2F8DA 1LCFA 2DXRA 2OWTA 1GVCA 4IO2A 2AL5A 2RCBA 5KZTA 1N04A 1Y3NA 4DE8A 4F2QA 2Q9TA 3WAEA 3USDA 1O64A 3PPOA 3QUJA 2KLFA 1US5A 4MLVA 1NNPA 2UYEA 4OWDA 3TYHA 1VFDA 5I2NA 1P1QA 3TTMA 4WEPA 1MY0A 4N07A 3ZKKA 1GTKA 4DDDA 4BDLA 4JWXA 5CC2A 1B52A 3MVZA 1QW0A 4H0WA 3T66A 1Y1ZA 2XX8A 4HS7A 4ZE9A 3SEWA 3RN8A 4YMAA 3O2AA 2VD2A 4O3AA 5CI5A 4F3SA 3IOTA 3FUZA 2I4BA 3IL1B 4ZEDA 3FASA 2DE4A 2OWSA 2I0CA 4PFWA 2VGQA 2NOOA 2CMOA 3IAZA 4QFKA 2DWHA 2F35A 2XX7A 2XXHA 5L9SA 2ZXTA 1B46A 2I49A 5I56B 3H7MA 1P1WA 3TKDA 4NF5A 4R6KA 4AB6A 1XS5A 2ZYNA 1B9JA 3WAFA 1Y1MA 1ELJA 4RXLA 1ZBMA 4NTLA 3S2VA 3MW0A 5KCJA 3IR1A 1LB9A 1B51A 5I2NB 1NNFA 4EUOA 3UP9A 3VFJA 1SW5A 1P1UA 1N3WA 1BTJA 1Y20A 1S7YA 2VOZA 4ZE8A 1MS7A 2XXIA 3KGCA 3FXQA 5K2XA 3RY3A 3V5AA 1XVXA 1SVXB 2HFBA 2O7UA 2H99A 1N3XA 4IB2A 3H6UA 1MQJA 1P1NA 2XXXA 3RT8A 2E1SA 3QIMA 4RNSA 1A7LA 3O9PA 3S9LC 4LVQA 3SEUA 1MXXA 2F6GA 4Z0IA 3JYRA 3KJ7A 3IK6B 4X48A 3N6TA 4H1XA 5H8NA 2PT2A 1ZIUA 3FIRA 1NNKA 2LAOA 2RC7A 4YKIA 2QS4A 4RYAA 4QHQA 4U22A 4I9DA 1IXCA 4KCDA 4EXKA 2ALUA 4MLQA 1PC3A 1IZ1A 3B6QA 1AH5A 3FJ7A 3IOUA 4WEDA 4DXUA 3OO8A 4QFOA 1LAXA 3N26A 4LP2B 5I58A 3TCFA 4R72A 2Z22A 1PB7A 3Q26A 4YU0A 3IB0A 3T9HB 4AB5A 1UTBA 4GXAA 4XKQA 1IEJA 1Y4TA 3C31A 2UVHA 5TP9A 1MG1A 3DELB 4G68C 1QULA 3HHGA 1M5FA 4QSEA 3VE1B 3TUSA 2DWAA 2A5SA 3SDFA 4OVJA 5FHOA 4GLIA 1MPBA 4LA9A 1Y9UA 4IY5A 4FEBA 4NF6A 4C1TA 4X1BA 1OVTA 1OIBA 3UA8A 2O1MA 1A55A 2NXOA 5TPAB 4R2FA 5H8NB 4OEUA 2HEUA 3ILUB 3PMXA 3OO7A 4KQPA 5K2YA 4TLLB 2BJJX 2R6GE 4RJZA 3U92A 3TQLA 3EHSA 3PV0E 1FTLA 1ZJLA 2PVUA 4ZEKA 3OO9A 1A54A 5AA3A 1XVYA 2PYYA 3DLNA 4HCWA 2ZNUA 2Y7WA 2G93A 5FTHA 1Q1KA 1R6ZA 2Y7RA 1IIWA 1QJMA 4KPTA 5I58B 1FTOA 1M5CA 2ZYKA 3DM0A 4NF4B 5ITOA 1URSA 2DWIA 1UTBB 1H43A 3Q27A 3CVGA 2YJPA 3G3FA 5TP9B 1B7ZA 1B5HA 3ZKLA 4POXA 3EHUA 2RF1A 1M5EA 3MJNA 1SYHA 4KI0E 1NH8A 1MXUA 2I48A 5LOMA 3K6UA 1TXFA 5DT6A 2D5WA 1N84A 4F39A 5EYFA 3OEMA 1P1OA 3UIFA 2Z23A 4KCCA 2Q89A 4NEDA 1DOTA 4Z7EA 3ECRA 4C0RA 1RYXA 2H25A 1JVYA 2QMWA 2B3BA 2F6PA 1LB8A 4OEVA 3KEIA 3K01A 1KWHA 1DTZA 2FNCA 4ND9A 3KN8A 2ZYOA 3H03A 4ZDMA 4L17A 4GVOA 1EH3A 2ZMBA 1DSNA 1VSOA 3RNNA 3OO6A 3LSLA 3CRBA 3MP8A 1LAGE 4H5GA 3IORA 4LQ5A 4Q0CA 4XKRA 1IUDA 1XC1A 4ELQA 4DXBA 1A99A 3LR1A 1NNTA 2F78A 5I57A 1SI1A 1L5TA 4GWOA 1ZMGA 1B3GA 4BDRA 1MXVA 2OK2A 4PP0A 2Z8DA 3I5OA 2V93A 4U1OA 4EF1A 5JEIA 5DVJA 1FQFA 4ELOA 4PQJA 3O28A 4ZS9A 4GD5A 2QS2A 4YB6A 2I6EA 3IB1A 4H65A 3IJOB 2HAVA 2PT1A 1MY3A 1RYOA 1MQDA 1VR5A 2Z8EA 3FD3A 3B6TA 4PFUA 3GBAA 3KN3A 4HCYA 4XXUA 5ISUA 3F11A 2F5XA 3A3UA 5DTBA 5ICQA 3SEVA 3VDFA 1MY1A 3R7XA 4IO5A 3DP6A 4R6YA 5DEXB 3V89B 4RPOA 3U72A 2P1SA 2RINA 4GL0A 4BDNA 1WODA 3O29A 3OSQA 1USYH 1H76A 4YKKA 3T9VA 1B1HA 4XTCQ 4KR5A 2RC9A 5A5XB 3W15C 2OJTA 3H6VA 4G77A 1MPDA 5L9OA 2X7PA 4MBPA 1IXHA 3SESA 4TLMB 5H8SA 2XXWA 3MBPA 2VP1A 2O1LA 5L8DA 2RKMA 1VE4A 4OFOA 4EQ9A 3VVDA 4FAJA 3MQ9A 1LFIA 5IKBA 3JZJA 2VHAA 1I6QA 3TTKA 2DP8A 3FV2A 4N13A 3QUFA 1XHYA 4LZ7A 3MWBA 2PMSA 3T9XB 3BBRA 1IXGA 1HSLA 2UVIA 1TFAA 5H8QA 2GRVA 3CI8A 1B58A 1IXIA 4LQ2A 3FVKA 1MXWA 1R9LA 3MZBA 2DVCA 1QUIA 4OZ9A 4OFJA 3KFMA 4NMYA 2V3QA 3E13X 3S9EA 4O3BA 1Q35A 3CG1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3S9MC 1XT8A 4PE5B 3LSXA 1EYIA 2O51A 1SD3A 1FTKA 1OVBA 4QFNA 3GLBA 1G0HA 4XKPA 5EQ8A 2V3TA 3K00A 4F22A 3SEXA 1LFHA 3QK6A 4PETA 2QVRA 1MXZA 2DE3A 1YTVA 2Q8MA 3E79A 4IO7A 4PF8A 3PPPA 4NF8A 4YAHX 1B2HA 1FW0A 4OESA 4OQOA 3T22A 2F36A 5L9MA 3DP8A 1N7WA 1TT1A 3OMBA 1PBQA 4QFLA 1B0LA 4R6HA 5AA2A 1FBPA 3SERA 4N81A 1H45A 1D9QA 2W7YA 4FEDA 5I3SA 3QAXA 4JVIA 3VLWA 3SZPA 1AL3A 3IOVA 4N4UA 4UABA 4JWOA 1EYJA 3RLFE 3FJMA 4OMBA 3K6VA 5H8QB 3C35A 2REJA 3OD7A 5CMMA 1AMFA 2QL3A 3QXMA 4WXJA 3V8XB 1IMBA 1JW5A 4POWA 3MPLA 4NX1A 3T96B 4NAPA 1SPIA 1YCJA 4PBQA 4G4PA 5B7DA 2O69A 1FPEA 4R2BA 4ECFA 3ZS6A 3Q25A 5EQ9A 4OETA 3B7DA 4NF5B 4P0GA 3I3VA 4YZZA 1JVXA 3QYTA 2HPGA 3RPWA 3G3JA 3T93B 2B65A 2ONKE 4BLAA 2QRYA 2NUVA 2PX1A 1J1NA 5KCJB 4PGNA 3PUVE 2Y7PA 4LZ8A 3U8QA 2Y7IA 3LC8A 4F1VA 3TAJA 3HHFA 2XXPA 4GXSB 2FIEA 4I1DA 1OLAA 2QJEA 2FBPA 1II5A 3IB2A 4KYDA 3FVNA 1HSEA 5AA2B 1MY4A 4H6DA 5AA1A 4R73A 3A29A 4N8YA 2NVUB 1B7HA 2XXKA 4G8MA 3VLUA 3C36A 1LGBC 4QF9A 4JWYA 4G8NA 4NWCA 2G29A 5F1QA 3N5LA 1BIYA 1LBCA 1ZTYA 2DQVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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