1H43A

R210e n-terminal lobe human lactoferrin
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
309
structure length
309
Chain Sequence
SVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIEESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title "Dilysine Trigger" in Transferrins Probed by Mutagenesis of Lactoferrin: Crystal Structures of the R210G, R210E, and R210L Mutants of Human Lactoferrin
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 309
sequence length 309
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h43A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h43A02
3I3VA 4DXBA 2XXUA 1Y1ZA 1DMBA 3KJTA 2B3BA 2PX1A 4EQ9A 5I2KB 1P99A 5HPQA 2I49A 2DSFA 5TPAA 3C32A 4RK2A 4RXLA 3PMVA 3DP8A 3TODA 2E0SA 3TFLA 3PU5A 4ELOA 1GV8A 3A3UA 1B4HA 3G3IA 4F3GA 4KFQA 3SESA 4C1UA 3RQTA 4ISUA 3E13X 3MPKA 3N5LA 3QK6A 5I59A 4NMYA 3VVDA 3TTRA 4GWOA 3HPIA 3CFXA 5FHMA 1O63A 1MXYA 1B3FA 3SEVA 1FTOA 4PFUA 3RNNA 1PBPA 2ZYNA 2XXXA 3GBBA 3V8XB 1Y3QA 1GVCA 1XHYA 4FEDA 2DWIA 5AE4A 5I56B 2RF1A 3MZBA 3BFUA 4M1VA 2Z23A 4KYDA 1MY0A 4NF8B 5H8HB 4ZS9A 3FXQA 2I4BA 2O51A 1SI1A 2I0CA 4P11A 1SDXA 1MY1A 2OK2A 3KOTA 3IO6A 2GHBA 4X48A 1URSA 4F39A 4PE5B 3CR9A 4ZE9A 4ZE8A 1MDP1 1FTMA 1WVJA 2V25A 4ONYA 1WDNA 1P1QA 3IO4A 3CI8A 3K4UA 4GXSB 3FXRA 5CM6A 2I4CA 3K6WA 1NMUA 1O64A 4FE8A 2V3QA 4ECFA 2A5TA 2CMOA 3FJ7A 5LOMA 2F7AA 1SI0A 3PUVE 2B65A 1Y3PA 5I59B 3PPRA 4YMBA 2Z22A 2PVUA 4DXUA 2REJA 4NWCA 5DEXB 3ZS6A 3CIJA 1XS5A 2QSXA 3HCQA 3MP8A 3UORA 3B6TA 3OOAA 4R2BA 4KCDA 2XHDA 3G3GA 3VE1B 4U4SA 4MF3A 4X1BA 2Q89A 3K1PA 5H8FA 1ANFA 1PB9A 3U92A 3E4RA 4KQPA 1IIWA 1A8EA 3A09A 3D4CA 1N3XA 3G3HA 1FQCA 1S50A 3MPLA 3P7IA 3C35A 1YTVA 2G29A 2HEUA 4MLVA 2ESNA 3OO6A 2YJPA 3T96B 1B7HA 3G3JA 3LSLA 3H6WA 1MS7A 4YAHX 5L9OA 3PPOA 3MC2A 1LAFE 2HZLA 3L6HA 3VLUA 3FV1A 1BP5A 5I58A 3ZKLA 3KN8A 3KG2A 1JEUA 2RC7A 2ALUA 1II5A 4OVJA 3PUWE 1T0KA 1PC3A 1NFTA 2XXWA 1MDQA 1S7YA 4R6YA 5DT6A 1TXFA 4Q8RA 1MXXA 4NWDA 2I58A 3UP9A 4GL0A 4PETA 4IB2A 4H8IA 2H98A 5B70A 1MXVA 1B3GA 2XX8A 4OEUA 1OQGA 4IO5A 1M5CA 5H8SA 2AL5A 2F36A 5L9MA 1EZOA 4MFIA 3USDA 4KR5A 4YKJA 3RT6B 1SW4A 3MJNA 2FYIA 1I6QA 4KYEA 5DYHA 1OQHA 1IXCA 1H76A 4ZDMA 2X7QA 4H8JA 1UTBA 4IY5A 4OTEA 4HW8A 4JWXA 1Q35A 3GBAA 4JXIA 2VD2A 1A7LA 3MVYA 1M5FA 4GL8A 3PD9A 4YKIA 4GOTA 5H8FB 3OEMA 2XXRA 3TTLA 1BKAA 3IR1A 1B05A 3C36A 4F2OA 2F6PA 4KI0E 3HV1A 3FVKA 4WXJA 5A5XB 3K6VA 3QUJA 2ZMBA 1P1OA 3EHSA 2H5YA 1DTZA 1IXIA 3TKDA 1LAXA 1PEBA 1QULA 4G8MA 4EUOA 1QJMA 3FATA 1GTKA 1TFDA 1SVXB 3TPAA 2UVGA 5TP9B 4E0XA 4DXCA 3VVEA 3CFLA 4UACA 4F29A 3FZVA 4IO7A 3IL1B 3F11A 1MQDA 3K6UA 1LCTA 3R7XA 1IXGA 2YPNA 3KN3A 1MH4A 4Q0CA 1SYHA 3AXFA 1B5JA 4XIGQ 2NVUB 3E3KA 2ZYKA 1MPDA 3GLBA 3CG3A 4R75A 5TU0A 3IOWA 4RPOA 3IAZA 2H25A 4TLLB 2I48A 1B3HA 3FVNA 2V84A 4R2FA 4WEPA 4QSCA 1FTJA 3H06B 4R74A 4H1XA 3O6GA 1F9BA 3C4MA 4C0RA 3T22A 1B2HA 1POTA 2THIA 3IOTA 2F35A 2ZNTA 4YKKA 3RPWA 4PP0A 4MBPA 2W7YA 1LGBC 3N94A 3H3GA 5AA1A 2DXRA 5M2VA 1OVTA 1URDA 3S9NC 1H45A 4GLIA 5I57B 1P1WA 4XKPA 2UVHA 3OEKA 4IO2A 3OO8A 1ZKBA 3C31A 4DE8A 3A3CA 2O7UA 1XVYA 4LZ7A 5BUUA 4DZ1A 1SBPA 1N7XA 4OEVA 2RC9A 1R9LA 3K1MA 4YB6A 2P2AA 3FVOA 2DWHA 3G7WA 1FQAA 1MQGA 1Z7ME 3K2DA 4R6KA 2UXAA 1JEVA 4JSOA 2DVCA 2R71A 1Z7NE 4GFRA 3S9MC 3VFJA 2DP8A 3FVGA 3DP4A 4O3CA 3B7DA 4YKPA 2DWAA 2QS1A 4I62A 2PT2A 3K00A 4NEDA 1MM6A 4NF4A 2X7PA 1SW5A 1N0TA 3K02A 1B7UA 5FHOA 2ZXTA 2A5SA 4NF6B 2XXQA 1MY3A 3H6VA 4MH5A 1BTJA 3S9LC 1VE4A 2F7BA 3DLNA 1MQHA 4MLQA 4ELQA 1JNFA 1JETA 2DE2A 3KSJA 1MY4A 1MXZA 5CI5A 1EZ9A 4H65A 3SKPA 4KPTA 3SEXA 3KJ7A 4R9FA 3O9PA 3O66A 4XKRA 4E0WA 1D4NA 1M5EA 4OETA 5EHSA 4JBZA 5JK4A 4QF9A 3FJGA 3T9HB 1HSEA 3U72A 4JDFA 1US5A 3S2VA 5HM4B 4RJZA 2E1SA 3QAXA 1FQDA 1B46A 2HXWA 2Z8FA 3SEWA 2D21A 3TUSA 4Q30B 1BIYA 2P0SA 3MUQA 4U21A 2ZYOA 2XXYA 1DSNA 5ITPA 4F3BA 1LB8A 4G8NA 3EPEA 3H4ZA 4QFOA 4N13A 3JZJA 3LBSA 1N7WA 1USYE 4NF5A 3OD7A 5JTYA 4I1DA 2RC8A 1USYH 3UK4A 5ICTA 1IXHA 5KZTA 3W9VA 1NH7A 4U22A 4G68C 5TPAB 1PBQA 2QMWA 3TELA 1JW1A 2B3FA 4IGRA 1MY2A 1N04A 2YLNA 1JVYA 1FTLA 1FW0A 2V93A 2H99A 2PYYA 2QS4A 3H6UA 5I84A 1R9QA 5AA2A 3HSTA 1UTHA 4RYAA 3KN7A 4LVQA 5DTBA 2KLFA 2IEEA 4OFOA 5I2NA 5CRYA 3IK6B 4FIMA 2NOOA 1L5TA 4IGTA 3TTMA 2O68A 5EYFA 1XC1A 5KCJA 3DELB 4LZ5A 5CC2A 1B0HA 2FNCA 5KDTA 2XD2A 1ATGA 3V5AA 1VR5A 1OLAA 2Y84A 3O97A 1AH5A 1IZ1A 4G4PA 4OYVA 4XTCQ 4LQ2A 1FCKA 3N26A 4DIGA 2AIXA 3ZSFA 3G3FA 1POY1 2Q8JA 3G3KA 3UGWA 4BDQA 1QUJA 3KEIA 3H03A 4OESA 3TQWA 1N76A 2D3IA 3Q27A 3FGSA 2Y7RA 4I8CA 2XXHA 3BKIB 1BLFA 3TCFA 2F97A 1NH8A 1FTKA 2Q2CA 2OZZA 4LP2B 4NF5B 5CBSA 2OWSA 4LUBA 1H44A 5FHNA 3IJOB 3VLVA 2Z8DA 4QFPA 4F22A 3FUZA 3W15C 3S9EA 3RY3A 4HS7A 4N07A 5H8QA 3S4UA 2O69A 3UIFA 3Q28A 1H43A 2A5TB 4QFNA 2HQ0A 1I6AA 3LSWA 4KD5A 3MVZA 1D9VA 5AA2B 4F2QA 1UTHB 3IJXB 1SW1A 1IEJA 4BDOA 3O6HA 4THIA 2RINA 1MH3A 4U2RA 1MRPA 4U4XA 2QL3A 4XXUA 1LFIA 4OFJA 2QJEA 2Q9TA 5CMCA 5H8NA 4ZZEA 2DXYA 4GD5A 1B4ZA 2V3UA 1PB7A 5K2XA 1NKXA 3MQ9A 4BDRA 4JB7A 3MZ9A 4U1ZA 4QRZA 4ESWA 4Q5TA 1A55A 2ONRA 1Y4TA 2F78A 5AA4A 4OXVA 4U1OA 3Q26A 3CG1A 3EHUA 1B9JA 3MP1A 1YAEA 4XKQA 1N3WA 1OLCA 4DDDA 3IORA 5I58B 3MBPA 3IB0A 2UYEA 4DLDA 3KBRA 1DPPA 1M5DA 3FJMA 1EU8A 4ELPA 1ZLQA 1YCJA 4BDLA 4Z7EA 3JYRA 4OFLA 4K3FA 1OMPA 2ZNUA 3H6TA 5H8QB 2V3TA 1JW5A 2PBWA 2CZLA 3M3FA 3OELA 1Y1MA 1LAGE 3DM0A 4G2ZA 2DVZA 4GQOA 3UA8A 1B5HA 3T9VA 4ZEDA 3TQLA 1NNTA 3U1OA 4PFWA 1P1UA 1LB9A 4ZEIA 4JWOA 1B6HA 1LLSA 4M4GA 5I2KA 1YPNA 5L8DA 1UTBB 3OENA 4LATA 4RPNA 3HO7A 2VD3A 2OJTA 4RNSA 4F3SA 4AB6A 3IX1A 3MAMA 4C1TA 2UVIA 3IB2A 3HN0A 2Y7PA 4F1YA 3HHGA 3CFZA 4JWYA 2DQVA 4TOZA 1MQIA 1NNKA 2DE4A 4LA9A 4KYSA 1URGA 3PV0E 5AA4B 2RCAA 3M3KA 3TTNA 4ELRA 4EF2A 3CSGA 5I56A 2QPQA 4LZ8A 1IQ7A 4FEBA 2OWTA 4FAJA 4KHZE 1CE2A 2PT1A 2OCUA 3CRBA 3TCHA 4ZEFA 1HSJA 2ONSA 4HCYA 1AL3A 2Y7IA 3OMBA 2XXTA 5DVIA 4YU0A 2AL4A 3RTWB 4LONB 2Y7KA 1IUDA 2VOZA 2XXPA 4ZEKA 1QKAA 1B3LA 2GRVA 3PPPA 4QFLA 1Y20A 3MWBA 1QKBA 2ABHA 3MVWA 1SD3A 4KCCA 4XKNA 1N84A 1ZMGA 2I3VA 1D9YA 1XOCA 3OSRA 4QSDA 2HCAA 2WKYA 3TMGA 4FATA 3PMXA 2LAOA 4QHQA 1B7ZA 1B5IA 3PPNA 4EF1A 2RKMA 3Q29A 1QUKA 3RN8A 4HTGA 1R1NA 5F1QA 4G8HA 4DCXA 3K1NA 1PDAA 3I5OA 2F6GA 4H0WA 4OQOA 2I6EA 3OSQA 3MP6A 2QS3A 5ICQA 1O7TA 1QVSA 4EQ7A 2DE3A 1B52A 1JW4A 3HHFA 4ESXA 1MPCA 3KSXA 2NUVA 2RCBA 4PFYA 4F19A 4X9TA 1B32A 1VSOA 1MM7A 5DEXA 3I6VA 3FASA 1VFDA 3FXUA 2P1SA 4POWA 5AA3A 5CMKA 3LR1A 3SEYA 3FIRA 1FQEA 2Z8EA 2O1LA 1SW2A 3E9XA 4IO6A 2GH9A 1P1NA 1NNFA 2OBGA 1OVBA 4IY6A 3LSXA 1XVXA 1MXUA 2VHAA 3T9UA 1JQFA 3OXNA 3SETA 2QMXA 2REGA 1H3DA 1DOTA 1I6BA 3MVXA 3B6WA 2XXIA 2VGQA 4OERA 4IO4A 4NE4A 4BDNA 1CB6A 1DPEA 4U23A 2XX7A 4GXAA 3ONMA 1ZIUA 2PMSA 3PD8A 2F7CA 1B1XA 2F34A 4F1VA 3U93A 2GFEA 2ONKE 3TDJA 1ZTYA 1LBBA 5AA2D 4YZZA 4O3BA 1FQBA 2H4IA 1A8FA 1MXWA 3T93B 3PUXE 4F18A 5HBCA 1OIBA 1DTGA 3B6QA 5L9SA 1B3EA 1GGGA 3W9WA 4OZ9A 4NF4B 4WKMA 3IB1A 1A54A 1UIUA 1PB8A 3THIA 3DP6A 3UN6A 3PPQA 3VVFA 2QS2A 3WAEA 3TCGA 1ELJA 4OMBA 3IOVA 1NL5A 1AMFA 4EXKA 1KWHA 1MG1A 4P0IA 2O1MA 3BFTA 2O84X 3LC8A 1LCFA 4YMAA 3KGCA 1LAHE 4OHNA 2M8CA 1HSLA 4O3AA 3VDFA 3QUFA 3RTFB 3N6TA 4Z0IA 4GF8A 3TZAA 5IAIA 2UVJA 1SQYA 4R72A 4F1UA 2UYFA 5DVFA 5J1DA 2OLBA 3KZGA 2ZNSA 3SDFA 4QSEA 2I3WA 4H67A 3RGYA 3V89B 5CMBA 4RA1A 4GIZA 2I0BA 3RT8A 2R9JA 1S9TA 4TQUQ 2XX9A 2ZYMA 5A5XA 3K6XA 4ZZAA 3LUYA 4H6DA 4L17A 3FV2A 4UA8A 3PGFA 5JTYB 3CSBA 1Y9UA 1SYIA 4R9GA 1M5BA 2FA7A 5DVJA 3EF7A 5TP9A 3PMWA 2ANJA 4YB7A 4F31B 3C9HA 3SEUA 3M8UA 4G68A 4NTLA 3SERA 1B40A 3K01A 1B1HA 3EN3A 4P0GA 1IITA 3K0VA 4FORA 1J1NA 3L6GA 3QXMA 4F3PA 2O7IA 4BDMA 1LBCA 5F7VA 2XXVA 5I2NB 1US4A 5ELVA 2F5XA 1ZBMA 1TWYA 4PQJA 1GR2A 4OENA 3TYHA 2H9BA 3C33A 5EHMA 5KCJB 3C34A 3ILTB 5KDTB 1TT1A 2R6GE 2XD3A 5FTHA 1ZU0A 3D4GA 3H7MA 4POXA 3OO9A 1EZPA 3ILUB 4PFTA 2IA4A 1VFEA 1LFHA 4IO3A 4H5GA 2Q2AA 3BBRA 2HAVA 3TEPA 3V83A 4H5FA 3U94A 5K2YA 3QYTA 4FECA 3JV9A 3U8QA 2VP1A 3R26A 5CMMA 1I69A 2HZKA 1MQJA 5ISUA 2HAUA 1RYOA 4QFKA 1Y3NA 3O2AA 3O6IA 4N6PA 4ZEBA 1ZJLA 5CBRA 4G77A 5I57A 2D5WA 1A99A 3TAJA 3RUMA 4EDPA 3EQ1A 1QW0A 3VXBA 3M3LA 4EXLA 3OO7A 1TFAA 4G68B 4GRKA 3GZGA 4WEDA 3PUZE 2BJJX 3GXAA 4ZECA 3WAFA 5IKBA 4LQ5A 1AOVA 3TTKA 4YICA 2DWJA 4X1DA 3N6UA 4FJPA 4DCYA 2AYSA 3ECRA 1Q1KA 5FTIA 3R6UA 1MPBA 1R6ZA 2GHAA 1RKMA 3MZ1A 2G93A 1JVXA 1WODA 2O6AA 4R73A 4RY1A 2Y7WA 3ODBA 4TLMB 5JEIA 4GVOA 1EH3A 3PUYE 5H8NB 4BLAA 1LFGA 2DS9A 2NWJA 1AIVA 1D3KA 3VV5A 1UQWA 3T66A 2Q88A 4NF6A 1A40A 3IOUA 3EHTA 5B7DA 1NNPA 4YB5A 4AB5A 2DYXA 2F8DA 4ND9A 3O28A 2X26A 3KOSA 3VLWA 4OWDA 3Q25A 1B0LA 4RK9A 4EQBA 1FQFA 2DOJA 1XT8A 3LSFB 1QUIA 5BWJA 3O29A 3ZKKA 4JSDA 5ITOA 3KFMA 3QIMA 3CVGA 4NF8A 2HFBA 5H8HA 1B58A 3RLFE 4HCWA 4AQ4A 1UIVA 4I9DA 1B51A 4R6HA 3VXCA 3FD3A 3MW0A 1LSTA 2QRYA 2NXOA 1Y4CA 3T9XB 1RYXA 3QSLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3I3VA 4DXBA 2XXUA 1Y1ZA 5LDZA 1DMBA 3KJTA 2B3BA 2FVZA 4PAFA 4O7MA 2PX1A 4EQ9A 5I2KB 1P99A 2Y5KA 5HPQA 2I49A 2DSFA 5TPAA 3C32A 4RK2A 4RXLA 3PMVA 3DP8A 3TODA 2E0SA 3TFLA 3PU5A 5IZ3A 4ELOA 5IZ1A 1GV8A 3T0JA 3A3UA 1KA0A 1B4HA 3G3IA 4F3GA 4KFQA 1IMDA 3SESA 4C1UA 3RQTA 4ISUA 3E13X 1QGXA 3MPKA 3N5LA 3QK6A 5I59A 4NMYA 3VVDA 3TTRA 4GWOA 3HPIA 3CFXA 5FHMA 4AS5A 1O63A 1LBXA 1MXYA 1B3FA 2P3NA 3SEVA 1FTOA 4PFUA 3RNNA 1PBPA 2ZYNA 2XXXA 3EKIA 3GBBA 3V8XB 1Y3QA 1GVCA 1XHYA 4FEDA 1VDWA 2DWIA 5AE4A 5I56B 4I40A 2RF1A 3MZBA 1NI9A 3BFUA 4M1VA 2Z23A 4KYDA 1MY0A 1AWBA 2PCRA 4NF8B 5H8HB 2WBDA 4ZS9A 3FXQA 2I4BA 2O51A 1SI1A 2I0CA 4P11A 1SDXA 1MY1A 2OK2A 3KOTA 3IO6A 4MIJA 2GHBA 2FBPA 4X48A 1URSA 2R8TA 4F39A 4PE5B 2QVRA 3CR9A 4ZE9A 4ZE8A 1MDP1 1FTMA 1WVJA 2V25A 4ONYA 1WDNA 1P1QA 3IO4A 2ZZVA 3CI8A 3K4UA 4GXSB 4N17A 3FXRA 4GBVA 4LN5A 4OA4A 5CM6A 2I4CA 5LTCA 3K6WA 4GWYA 1NMUA 5ESYA 1O64A 4FE8A 2V3QA 4ECFA 2A5TA 1FBPA 5ET7A 5IZ3B 2CMOA 3FJ7A 5LOMA 2F7AA 4GWXA 1SI0A 3PUVE 2B65A 1Y3PA 5I59B 3PPRA 4YMBA 2Z22A 2PVUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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