1H76A

The crystal structure of diferric porcine serum transferrin
Total Genus 229
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
229
sequence length
685
structure length
677
Chain Sequence
QKTVRWCTISNQEANKCSSFRENMSKAVKNGPLVSCVKKSSYLDCIKAIRDKEADAVTLDAGLVFEAGLAPYNLKPVVAEFYGQKDNPQTHYYAVAVVKKGSNFQWNQLQGKRSCHTGLGRSAGWIIPMGLLYDQLPEPRKPIEKAVASFFSSSCVPCADPVNFPKLCQQCAGKGAEKCACSNHEPYFGYAGAFNCLKEDAGDVAFVKHSTVLENLPDKADRDQYELLCRDNTRRPVDDYENCYLAQVPSHAVVARSVDGQEDSIWELLNQAQEHFGRDKSPDFQLFSSSHGKDLLFKDSANGFLKIPSKMDSSLYLGYQYVTALRNLREEECKKVRWCAIGHEETQKCDAWSINSGGKIECVSAENTEDCIAKIVKGEADAMSLDGGYIYIAGKCGLVPVLAENYKTEGENCVNTPEKGYLAVAVVKKSSGPDLNWNNLKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLYNKINSCKFDQFFGEGCAPGSQRNSSLCALCIGSERAPGRECLANNHERYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKDQVVQQNTDGKNKDDWAKDLKQMDFELLCQNGAREPVDNAENCHLARAPNHAVVARDDKVTCVAEELLKQQAQFGRHVTDCSSSFCMFKSNTKDLLFRDDTQCLARVGKTTYESYLGADYITAVANLRKCSTSKLLEACTFHSA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The Crystal and Molecular Structures of Diferric Porcine and Rabbit Serum Transferrins at Resolutions of 2.15 And 2.60A, Respectively
pubmed doi rcsb
molecule tags Iron transport
molecule keywords SEROTRANSFERRIN
total genus 229
structure length 677
sequence length 685
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A03
2QS1A 3K00A 2REJA 3KN7A 2QS3A 4GD5A 2I48A 2Y7WA 2NVUB 5JK4A 1MPCA 5L9SA 3R26A 5L8DA 1LFGA 3PMWA 4MF3A 1US5A 2D5WA 2UVJA 3OO6A 5AA3A 5IAIA 4LA9A 3VVEA 3VXBA 2DP8A 2FNCA 5I84A 4DXBA 2AL5A 5CC2A 2NOOA 1URDA 3VDFA 4ELPA 3LSLA 1M5BA 4I8CA 1XOCA 1LAHE 5ELVA 2F78A 3V5AA 2XX9A 3CVGA 5BUUA 4HCWA 2HCAA 4F3PA 4P11A 3L6HA 1HSJA 2O6AA 3N5LA 3U92A 3G3IA 3Q27A 5HM4B 3RUMA 4RNSA 1PC3A 1MY1A 1OQHA 4U2RA 2XX8A 4F3BA 5I57A 4GL0A 2HFBA 3SERA 1XS5A 1Z7NE 2D21A 4GQOA 3KFMA 4R6YA 3FVKA 2PMSA 3MC2A 4ND9A 1B3HA 1B6HA 4FAJA 2Z22A 3WAFA 3Q29A 4F18A 5TPAA 1YCJA 4BDLA 4H6DA 3CSGA 3D4CA 4WXJA 2I6EA 3SETA 4PETA 5AE4A 4JB7A 2G93A 4NF4B 1N76A 2DYXA 4NF5A 4FEDA 3MZ1A 3HCQA 1JW4A 4BLAA 5BWJA 1LAFE 1MY4A 3T22A 1LGBC 2XXRA 1S7YA 1B5HA 1I6BA 3QYTA 3OO7A 3T9VA 1TT1A 1RKMA 4RK2A 4EDPA 3BFUA 1KWHA 1SVXB 4FJPA 3C31A 5I2NA 4QFNA 2D3IA 1AH5A 4H65A 4NF8B 1AMFA 3M8UA 5F1QA 2Q2CA 2IEEA 2CMOA 3O2AA 3TQLA 3HN0A 3V89B 1LSTA 2KLFA 3G3GA 1MRPA 1A55A 3CFZA 2ZYKA 4M4GA 1AIVA 3MAMA 4GIZA 4LONB 4PQJA 2OWTA 1FTOA 4C1TA 2Q8JA 3O28A 3PV0E 3IO4A 4GXSB 4GOTA 3W9WA 3QK6A 2VGQA 4EF1A 3TUSA 2AIXA 1D9YA 4NTLA 4JXIA 2A5SA 2HZLA 4YKIA 2V3QA 1QW0A 2ONSA 2DOJA 1DTGA 1B1HA 3QXMA 3T9XB 4ESWA 5I58B 4OERA 3TYHA 2QMWA 2GHAA 4U4SA 5KCJB 1OMPA 3KZGA 1I6QA 3S2VA 2X7QA 3Q28A 5KDTB 4NF6B 4HS7A 3BBRA 4G2ZA 5HBCA 1B7HA 3CRBA 3MZ9A 1B40A 1B5JA 1IXIA 1Y1ZA 1MXYA 1SI1A 4BDNA 3HPIA 3K1NA 4G8MA 4KCCA 4MLVA 1A8FA 1GTKA 4IGRA 4U23A 5CMBA 3DLNA 3N6UA 1OVBA 4YKPA 3EQ1A 2ZYMA 4ZEFA 4R9FA 4KQPA 2DVZA 1JEVA 1O64A 3IB1A 3SEXA 2DWAA 2ZMBA 2H25A 1RYXA 1GV8A 2LAOA 1FQDA 2Q89A 2XXIA 3RLFE 1MQDA 4I1DA 3TKDA 2RC8A 4PFWA 3QUFA 1EZPA 3DELB 3PPRA 1B51A 2OJTA 2PT1A 1B05A 3FXQA 2RCBA 3O97A 3O9PA 2H99A 2F7CA 3TEPA 3DP6A 3U1OA 3G3FA 5F7VA 4F3SA 2YLNA 1UTBA 4ZZEA 1MM7A 4JBZA 4GFRA 2F7BA 2I3WA 3FVOA 3SEWA 3W9VA 3H6UA 1VFEA 5FHNA 1QKBA 1BIYA 1LLSA 2PX1A 3TTKA 1NH7A 3TZAA 5A5XA 1B46A 5I57B 4ZEIA 3EN3A 2UVIA 3M3FA 4QSCA 4IO4A 3RTWB 3PPOA 1XVXA 1MQIA 2OBGA 4UA8A 1USYE 1BP5A 2PVUA 2DWHA 4E0XA 1Q35A 2XXUA 1JETA 3P7IA 1B5IA 2HEUA 1BKAA 4JSOA 5TPAB 3IX1A 3TCGA 1LCFA 3GBBA 3KEIA 4N13A 2HQ0A 3U72A 3GBAA 1Y3QA 1EZ9A 5L9MA 1M5CA 3FVNA 1O7TA 5DT6A 4OYVA 5EHMA 1MY0A 3RT8A 1RYOA 3OO8A 4YB5A 1LB9A 4E0WA 3TCHA 1IQ7A 1AOVA 3G3HA 1SW5A 3FASA 4BDMA 1P1NA 1CE2A 3A3CA 4X48A 3T96B 2UYFA 2F97A 3TQWA 1LAXA 3TODA 3VLWA 5J1DA 3UIFA 5AA4A 3IL1B 1SW2A 3GZGA 5KCJA 3K6VA 2O51A 4U4XA 2Z8DA 1IEJA 1UIUA 4KR5A 1USYH 2O1LA 2V3TA 3VXCA 4KYSA 3KJ7A 2B3BA 4QFOA 1URSA 5FHOA 5I2NB 4DDDA 4HTGA 1LBCA 2HZKA 3LSFB 1MH3A 5TP9A 3S9NC 2I58A 5TU0A 5JEIA 2QMXA 2DWJA 1I6AA 2QRYA 1WDNA 1US4A 4GWOA 3PUXE 1M5EA 2O1MA 3MWBA 3FJ7A 5I2KA 3VE1B 2PYYA 3IB0A 4O3CA 4F3GA 3JYRA 1M5DA 4RPNA 1JW1A 4YB7A 3QIMA 3VVFA 2H5YA 2I0CA 1IITA 5H8SA 3B6QA 1MPBA 3IO6A 3VVDA 4THIA 4ONYA 3IK6B 1PB8A 4FEBA 4M1VA 1ANFA 5H8FA 3TTRA 1MXXA 3CG1A 2P0SA 4LP2B 4KHZE 3ODBA 4N6PA 4EXKA 1IXGA 4DCXA 2WKYA 2V25A 2NXOA 4PFYA 3R7XA 1IIWA 1Y20A 3VLUA 2Q9TA 1FTLA 4Q0CA 3MVXA 1B3GA 4R2BA 3H06B 1B0LA 2GH9A 5L9OA 1FTMA 1ZIUA 1Y9UA 1ZJLA 1B52A 3N94A 1PEBA 3MVZA 4H5FA 4IGTA 3QAXA 4LVQA 4XTCQ 1N7XA 1P99A 2Y7PA 3MPLA 2F6GA 4H0WA 2VHAA 4GF8A 3CR9A 4YKJA 4TLLB 1MXUA 1TFDA 4DXCA 3PU5A 3HO7A 1N04A 2BJJX 3EHTA 5IKBA 4IB2A 2Y7IA 1B9JA 4RYAA 1UTBB 3A09A 1Z7ME 1J1NA 2Y84A 4OWDA 4KFQA 1LFIA 2V84A 2XXQA 3RGYA 1T0KA 4HCYA 4IO7A 4H67A 2HXWA 2ESNA 5A5XB 3VFJA 3HV1A 1YTVA 3RNNA 1NKXA 3UA8A 1NNKA 2XXYA 3RTFB 1R6ZA 1PB9A 4F39A 2DE2A 3MVWA 4DCYA 1FTKA 3FXUA 1MQHA 4JWOA 3SDFA 3HHFA 3BFTA 4NWCA 4YB6A 5CBRA 3SEUA 3PUWE 2NUVA 3CFLA 2QSXA 3UK4A 3IJXB 1UTHA 4TOZA 1B3LA 4YMBA 3KSJA 5ITPA 2DE4A 1DMBA 3WAEA 5EYFA 3OMBA 4KCDA 4Q5TA 3FGSA 3RPWA 1FQAA 2AYSA 1XHYA 1B32A 2Q88A 3H7MA 2UXAA 3F11A 3MBPA 1LB8A 3TTNA 5H8HA 3LUYA 3N6TA 1LFHA 2CZLA 4WKMA 1H76A 4O3AA 3C34A 1R9LA 2E0SA 5AA4B 5DYHA 4ELOA 2XD3A 3EHUA 2P1SA 1ATGA 4FORA 4OESA 1PBQA 4AB5A 1ZMGA 3TELA 2F7AA 4OFLA 1GGGA 2O69A 4PFTA 2M8CA 3IR1A 3Q26A 2PBWA 2Q2AA 4OQOA 3CIJA 3IOTA 3JZJA 5AA2D 3IOUA 5TP9B 3MZBA 5CRYA 1QKAA 4H1XA 1SDXA 3OO9A 5JTYA 2RF1A 5K2YA 1DPPA 3EPEA 2Z8EA 1TXFA 4RY1A 5I2KB 1QUKA 3IORA 2NWJA 1JNFA 5FTHA 1JEUA 3UP9A 4U22A 4QF9A 2OZZA 1MXZA 4IY6A 3JV9A 2F6PA 1MDP1 3MUQA 4KD5A 1B1XA 3MJNA 3QUJA 3S9MC 2GRVA 4G68A 4ESXA 2I3VA 2XXHA 3R6UA 3K2DA 3CG3A 1MDQA 2XXVA 1HSEA 3FV2A 4DXUA 2H98A 4IO3A 4OMBA 4OEUA 3B6TA 5ISUA 3H6VA 4FATA 3I5OA 1ZLQA 4N07A 4I9DA 5H8FB 3MQ9A 4RJZA 1NL5A 3U93A 1OLAA 5CMCA 3ZS6A 3ZSFA 3T66A 3K6WA 4F19A 2ZNTA 4K3FA 3O29A 3T93B 5DEXA 3KSXA 3DM0A 1SYHA 4OXVA 1AL3A 4LUBA 1Q1KA 3PMVA 1MXWA 4F1YA 1H44A 5H8QA 1VE4A 2QS2A 1XT8A 4QFPA 4O3BA 3KN8A 3OSQA 1SW1A 2X26A 3PPNA 2QPQA 4F22A 4F2OA 3K1PA 3FUZA 2DS9A 4POWA 1SI0A 4DZ1A 1A7LA 1N0TA 4RXLA 4XIGQ 4ZE8A 1Y3PA 2F5XA 1SD3A 4GRKA 4OTEA 1WVJA 1PBPA 1POY1 3OD7A 3K0VA 1EU8A 2ONKE 4FE8A 1OIBA 3PUYE 3DP4A 4JDFA 3BKIB 1DPEA 2QJEA 3TTLA 1A8EA 3C9HA 4OETA 3PUVE 4F1VA 3V8XB 2F36A 4RK9A 1H3DA 4NMYA 3K01A 4EXLA 3FJMA 1A54A 2GHBA 1F9BA 1H45A 1ZBMA 2VD2A 2F8DA 2OLBA 3O6HA 1SBPA 4F2QA 4U21A 4OFOA 1JVYA 1EH3A 3FD3A 3K6UA 1VSOA 3PUZE 4QHQA 4JWXA 3HHGA 1MG1A 5I56A 3ECRA 2Y7RA 1D9VA 4IO5A 4XKQA 1JVXA 3KBRA 3KOSA 3OELA 4QRZA 1QJMA 3OXNA 1N84A 3I6VA 4F31B 3TDJA 4QSEA 4YICA 3U94A 3C32A 3H03A 3UGWA 1UTHB 1TFAA 1P1WA 3K1MA 3T9UA 1QUIA 3Q25A 2VD3A 4XKRA 1MXVA 3C33A 4KYEA 1N3WA 4EUOA 3PGFA 2O68A 2FYIA 1B4HA 4H8JA 4POXA 1JW5A 1NNPA 3O6GA 3FIRA 3PD8A 4MBPA 4YMAA 5H8HB 4XKNA 1B2HA 1FQFA 5I59A 3G7WA 2O7UA 1O63A 1P1OA 3K02A 4IO2A 4ZDMA 3GLBA 1YAEA 3AXFA 1B0HA 2Y7KA 1FQEA 3TFLA 3MP6A 2I0BA 3SKPA 4OEVA 5HPQA 5DVJA 1UIVA 5ICQA 1MY3A 5AA1A 4GXAA 4OZ9A 4WEDA 1IUDA 2OK2A 1VR5A 2X7PA 3D4GA 3TCFA 1N3XA 5JTYB 3UORA 2R6GE 1A99A 3IB2A 1B58A 5AA2B 4HW8A 2HAUA 4NEDA 2P2AA 5KZTA 1OVTA 3KOTA 1QULA 5FTIA 3MP8A 4ISUA 4DLDA 4G68B 5H8NB 2GFEA 3EHSA 3OEMA 1MS7A 4XKPA 1Y4CA 2B65A 1OLCA 4UACA 3B6WA 4R6KA 2H4IA 2XXPA 4TQUQ 2XXWA 4PP0A 4U1ZA 1POTA 3GXAA 3MW0A 3L6GA 1GVCA 4X1BA 4F29A 1LCTA 3OEKA 3PD9A 5DEXB 2ZYNA 3IJOB 1SQYA 4RA1A 2HAVA 2REGA 4QFKA 2UVGA 5H8QB 3FZVA 3ZKLA 1IZ1A 1JQFA 3M3LA 4X1DA 3S9LC 4ZEBA 3RN8A 3T9HB 1R9QA 2ZNSA 4L17A 2UYEA 3H6WA 2RKMA 3H6TA 1TWYA 5B70A 4R9GA 1N7WA 4H5GA 2OCUA 2OWSA 4GL8A 2DXYA 4AB6A 1NFTA 4Z7EA 3O6IA 1DTZA 1FQCA 4Q8RA 4KPTA 4R2FA 2V93A 4FIMA 1Y3NA 2ONRA 4X9TA 2YJPA 3K6XA 4Q30B 1EZOA 1YPNA 3CSBA 4NWDA 5CMKA 1Y4TA 3ILUB 4ZEDA 4QSDA 2O7IA 4PFUA 4MLQA 3B7DA 1BLFA 4KYDA 3PPPA 2VP1A 5CMMA 4R72A 4Z0IA 1QVSA 4ELQA 3VLVA 2DVCA 4ZE9A 3KG2A 2XXTA 3A3UA 1MY2A 3LC8A 1ZTYA 4F1UA 3DP8A 2DQVA 2ANJA 2A5TB 3PMXA 2RC7A 3H3GA 1LBBA 1FW0A 1ZKBA 3O66A 4DIGA 2R9JA 2XD2A 3N26A 2B3FA 4DE8A 4ZS9A 1PB7A 3KJTA 5I56B 3EF7A 3C36A 3CI8A 1II5A 4YKKA 1Y1MA 4WEPA 1NNFA 1D3KA 1VFDA 4IO6A 1MQGA 3UN6A 4C1UA 1LAGE 3LBSA 3OSRA 4P0GA 5CM6A 2UVHA 1XC1A 5DTBA 3S9EA 2QL3A 3C35A 2DE3A 3W15C 3ILTB 4G8NA 3SEVA 5DVIA 1M5FA 2E1SA 4LZ5A 2I4BA 1I69A 1S50A 3C4MA 2Z23A 5AA2A 3USDA 5B7DA 4ELRA 3S4UA 3G3KA 5ITOA 3VV5A 1B4ZA 1L5TA 4FECA 1MPDA 3SEYA 1QUJA 1H43A 3SESA 5I59B 5H8NA 4ZZAA 3TPAA 4G77A 2DXRA 2W7YA 3MPKA 1B3FA 4R74A 4P0IA 4BDOA 1WODA 2G29A 2XXXA 4GLIA 2I49A 3MVYA 3E3KA 1B3EA 1ELJA 2RC9A 3KN3A 3V83A 3ONMA 3LSWA 4PE5B 4KI0E 5CBSA 3E13X 1NNTA 1D4NA 2IA4A 2R71A 3QSLA 1A40A 5K2XA 2F34A 4MH5A 1MH4A 4G8HA 5ICTA 3H4ZA 5LOMA 2YPNA 5FHMA 4AQ4A 5CI5A 5DVFA 3FATA 3IOWA 3G3JA 4YZZA 1ZU0A 3M3KA 3E9XA 5M2VA 4OVJA 4R73A 4IY5A 3E4RA 2QS4A 3IOVA 4NF4A 1DOTA 1OQGA 3OOAA 2XHDA 4EQBA 2ABHA 2H9BA 3FXRA 1XVYA 5EHSA 4U1OA 3TAJA 1FTJA 2ZXTA 4I62A 1R1NA 4LATA 4YU0A 1P1QA 1BTJA 1B7UA 1PDAA 2XX7A 2ZNUA 2DSFA 4GVOA 2I4CA 2ALUA 4NE4A 4ZECA 1FQBA 3FV1A 4NF8A 4C0RA 1SYIA 2ZYOA 3THIA 3U8QA 1B7ZA 3I3VA 4EF2A 3PPQA 3MP1A 1SW4A 1HSLA 3TTMA 4JSDA 1S9TA 1P1UA 3FJGA 4JWYA 4G68C 2A5TA 3CFXA 2Z8FA 4BDQA 2VOZA 2O84X 4QFLA 1DSNA 4ECFA 1CB6A 2FA7A 2RCAA 3RY3A 3LR1A 3HSTA 4OFJA 4LZ8A 1IXHA 4NF5B 1NH8A 3TMGA 1MM6A 2DWIA 2V3UA 2RINA 2F35A 2PT2A 3RT6B 4OENA 5I58A 4G4PA 3OENA 4MFIA 4RPOA 4OHNA 5KDTA 4ZEKA 4NF6A 4YAHX 3K4UA 4LQ5A 1MQJA 1NMUA 4H8IA 4LZ7A 4EQ7A 4EQ9A 3LSXA 1UQWA 1IXCA 2THIA 4BDRA 1URGA 4XXUA 3ZKKA 1FCKA 2AL4A 4R6HA 3IAZA 3KGCA 1GR2A 4R75A 4TLMB 3FVGA 3RQTA 4LQ2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QS1A 3K00A 2WYPA 2REJA 2Y5KA 3KN7A 2QS3A 4GD5A 2I48A 2Y7WA 2NVUB 5JK4A 1MPCA 5L9SA 3R26A 5L8DA 1LFGA 3PMWA 4MF3A 1US5A 2D5WA 2UVJA 3OO6A 5AA3A 5IAIA 4LA9A 3VVEA 3VXBA 2DP8A 2FNCA 5I84A 3PTYA 4DXBA 2QVVA 2AL5A 5CC2A 2NOOA 1URDA 3VDFA 4ELPA 3LSLA 1M5BA 4HE1A 4I8CA 1YYZA 1XOCA 2WYKA 1LAHE 5ELVA 2F78A 3V5AA 2XX9A 3CVGA 4AS5A 5IZ1A 5BUUA 1QGXA 4HCWA 2HCAA 4F3PA 4P11A 3L6HA 4N15A 1HSJA 2O6AA 3N5LA 3U92A 3G3IA 3Q27A 5HM4B 3RUMA 4RNSA 1PC3A 1MY1A 1OQHA 4P9KA 1NV0A 4U2RA 2XX8A 2KR0A 4F3BA 5I57A 3SZPA 4GL0A 2HFBA 3ISPA 3SERA 4PGPA 1NV7A 1XS5A 2HXRA 1Z7NE 2D21A 4GQOA 3KFMA 4N8YA 4R6YA 3FVKA 2PMSA 3MC2A 2HHMA 4ND9A 1B3HA 1B6HA 4FAJA 2Z22A 4P3LA 3WAFA 3Q29A 4F18A 5TPAA 1YCJA 4BDLA 4H6DA 3CSGA 3D4CA 4WXJA 2I6EA 2PFYA 3SETA 4I40A 4PETA 5AE4A 4JB7A 4JVDA 2G93A 2L5VA 1G0IA 4NF4B 1N76A 2DYXA 4NF5A 4PAFA 4FEDA 3MZ1A 3HCQA 1JP4A 1JW4A 4BLAA 5BWJA 4PF6A 1LAFE 1MY4A 2FVZA 3T22A 1LGBC 2XXRA 1S7YA 1B5HA 1I6BA 1INPA 3QYTA 1LBVA 3OO7A 3T9VA 1AWBA 5DW8A 5ET6A 1TT1A 1RKMA 2HPGA 4RK2A 4EDPA 4OVSA 3BFUA 1KWHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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