1H76A

The crystal structure of diferric porcine serum transferrin
Total Genus 229
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
229
sequence length
685
structure length
677
Chain Sequence
QKTVRWCTISNQEANKCSSFRENMSKAVKNGPLVSCVKKSSYLDCIKAIRDKEADAVTLDAGLVFEAGLAPYNLKPVVAEFYGQKDNPQTHYYAVAVVKKGSNFQWNQLQGKRSCHTGLGRSAGWIIPMGLLYDQLPEPRKPIEKAVASFFSSSCVPCADPVNFPKLCQQCAGKGAEKCACSNHEPYFGYAGAFNCLKEDAGDVAFVKHSTVLENLPDKADRDQYELLCRDNTRRPVDDYENCYLAQVPSHAVVARSVDGQEDSIWELLNQAQEHFGRDKSPDFQLFSSSHGKDLLFKDSANGFLKIPSKMDSSLYLGYQYVTALRNLREEECKKVRWCAIGHEETQKCDAWSINSGGKIECVSAENTEDCIAKIVKGEADAMSLDGGYIYIAGKCGLVPVLAENYKTEGENCVNTPEKGYLAVAVVKKSSGPDLNWNNLKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLYNKINSCKFDQFFGEGCAPGSQRNSSLCALCIGSERAPGRECLANNHERYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKDQVVQQNTDGKNKDDWAKDLKQMDFELLCQNGAREPVDNAENCHLARAPNHAVVARDDKVTCVAEELLKQQAQFGRHVTDCSSSFCMFKSNTKDLLFRDDTQCLARVGKTTYESYLGADYITAVANLRKCSTSKLLEACTFHSA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Iron transport
publication title The Crystal and Molecular Structures of Diferric Porcine and Rabbit Serum Transferrins at Resolutions of 2.15 And 2.60A, Respectively
pubmed doi rcsb
molecule keywords SEROTRANSFERRIN
total genus 229
structure length 677
sequence length 685
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A03
4GWOA 2HAVA 4R9FA 1FTLA 3OELA 3VVFA 3PPQA 3PV0E 3VLVA 4JWXA 3S9EA 2Y7KA 2UYEA 3T9XB 3SEWA 1ZIUA 2XXPA 4YB5A 5TU0A 4DXUA 3TTNA 1MY2A 4DXBA 1EU8A 4N13A 1KWHA 4F3BA 5FHNA 4H1XA 3CRBA 1OLAA 5A5XB 2DWIA 3FXRA 5DEXB 4R73A 3K1PA 5TPAB 2Y7RA 3A3UA 3W9VA 4NWDA 1MPBA 1Z7NE 3PUXE 3MJNA 4N6PA 2Y84A 4U23A 5I2NA 1JEVA 2XX7A 1XHYA 3TTKA 3I3VA 3LSFB 5I2KB 3KJTA 1ZU0A 3MBPA 3DP8A 3O2AA 2I49A 2VOZA 4OXVA 2RC7A 3IO4A 4OESA 4C0RA 5KZTA 3W15C 5L9OA 2O7UA 3KN7A 3D4GA 5DTBA 5CM6A 1R1NA 4NMYA 2Z8EA 3PUWE 4FORA 2ALUA 3QYTA 3G3JA 2V3UA 2OZZA 1YTVA 3QIMA 2ZYNA 3UA8A 3LUYA 1US5A 5AE4A 1QW0A 2Y7PA 4JBZA 3C4MA 2I0BA 2DYXA 4RK2A 2DS9A 4IB2A 4QSCA 3GXAA 4PFTA 3MVWA 3U1OA 3FUZA 3TODA 4EF2A 1FTKA 2QL3A 4LA9A 4RJZA 3H6VA 2X7PA 3TAJA 3KOSA 2DP8A 5H8NB 5H8QA 4DLDA 2I0CA 3V89B 1VSOA 3TCGA 3V83A 4FE8A 2XXXA 1OQGA 1JW1A 4NF4A 1QULA 3SERA 1B5HA 4H8JA 4FEDA 3GZGA 1LGBC 3V5AA 1B2HA 4NTLA 3OO9A 5BWJA 4LQ2A 1CE2A 1DMBA 1O64A 4R72A 4YAHX 4H5GA 2XXVA 2QMXA 5JTYA 1D9VA 2B3BA 1LSTA 1LLSA 4XKNA 1F9BA 3PD8A 1EZOA 5M2VA 1IXCA 1A7LA 1OLCA 2R9JA 3IOTA 4Q30B 2RCAA 3G3HA 2W7YA 3TTLA 1O63A 2I4CA 3C36A 3QXMA 5H8HA 3QSLA 5AA1A 1MQGA 1A55A 2X26A 2Z8FA 3LBSA 1SW1A 3ILUB 5AA2B 1P1NA 3K01A 3SETA 2CMOA 1XT8A 2PVUA 4THIA 3RNNA 2DVZA 4F1UA 4OETA 2IEEA 4PQJA 1QUIA 3P7IA 3IO6A 4BDOA 1NFTA 1LFHA 4QSDA 3VXBA 4U22A 4PE5B 4IY5A 4GQOA 4U21A 3IB1A 4WEPA 1J1NA 1RYXA 2OJTA 1UTHA 4QFNA 1DTGA 2Q89A 1RKMA 1II5A 1B4HA 3IK6B 3OEMA 1HSEA 3S9NC 4Q5TA 1NMUA 3OEKA 2QS3A 2I6EA 4IY6A 2AYSA 3PU5A 4TLMB 3ECRA 3LSXA 4XIGQ 2O69A 3MW0A 1QUKA 4Q8RA 2Q2AA 4ELQA 3I5OA 4BDQA 3O66A 4YB6A 5F7VA 1PB8A 4PFWA 2AIXA 2XD3A 4HCYA 2HXWA 2V84A 3CSBA 4I62A 5CMBA 4R6HA 1JW4A 4OYVA 4QFLA 3H6UA 1JEUA 2D5WA 1IXGA 3N6TA 2DE3A 1SI0A 3KZGA 4ZEBA 4ZEFA 3VLUA 1MXZA 4U4SA 3TQWA 4BDNA 2HEUA 4I8CA 3U93A 3E9XA 1QVSA 1M5EA 5CI5A 1PBPA 2F5XA 5KDTA 3R6UA 3B6WA 3T9VA 3UK4A 2F7CA 2F35A 3HCQA 4JXIA 3UIFA 3FVGA 2E0SA 4NF5A 5H8SA 3UN6A 1PDAA 3FD3A 2DWHA 1USYE 4F3SA 3SKPA 4F19A 1A54A 5CMCA 1PC3A 4ND9A 2ESNA 3HO7A 1B51A 5ELVA 3IR1A 1PB9A 2H99A 4HTGA 1B3EA 4BLAA 3N5LA 4U1OA 1MQIA 3OXNA 2YJPA 2HCAA 3B6QA 3MVXA 4NF8B 3MQ9A 3K02A 3RTWB 4RNSA 4IGRA 3N94A 4FEBA 2REGA 2GHBA 4DCXA 1IUDA 1AOVA 4YB7A 2UVJA 1GGGA 3G3FA 2XXQA 4R74A 2DVCA 2P0SA 3TYHA 4RY1A 5HPQA 1GV8A 4NWCA 2AL4A 3Q25A 4HCWA 2R6GE 1MQDA 2P2AA 2ZYKA 4GF8A 5IAIA 2UVHA 2FNCA 2LAOA 2D21A 3A3CA 2F6GA 1VR5A 3IJOB 2O68A 3PPNA 3USDA 1B5IA 4ELOA 1B46A 1BTJA 3O9PA 5FTIA 4OQOA 2A5TB 2NWJA 4KQPA 3DP4A 3EQ1A 3IOUA 1A99A 2ABHA 3O29A 4EQBA 1M5CA 4LZ8A 4ISUA 3PGFA 1GVCA 4F2QA 1P1OA 3SEXA 3BBRA 2H4IA 2DSFA 2OCUA 3KFMA 2THIA 4ZEKA 3G3KA 4JSDA 3H06B 4OFOA 4PP0A 2PX1A 3LR1A 3OSRA 5A5XA 3RT8A 3G3GA 3EHUA 5DEXA 1MM6A 1B6HA 5I57B 1LAXA 1VFEA 5TPAA 2PBWA 1UIUA 4UA8A 3S9MC 1P1UA 2D3IA 3PMXA 4AB5A 1URGA 3GBAA 1QUJA 2ANJA 3O97A 1ATGA 3IOVA 1NH7A 3HPIA 1N04A 1MXYA 1AH5A 1BLFA 5I2KA 3G3IA 4FAJA 4TOZA 5I58B 4C1TA 4JDFA 3CSGA 2H9BA 2RCBA 3K00A 1XOCA 4EQ7A 1LFGA 4YMAA 1FQEA 5K2YA 4XKQA 4R75A 2XX8A 4IO7A 1MH4A 1B9JA 1D3KA 3QAXA 1MPDA 5H8FB 2DE4A 4F22A 4GVOA 3K1MA 3MPKA 4O3BA 1IITA 4LP2B 4OZ9A 1SYHA 4GL8A 1Y9UA 2H98A 2RC9A 2E1SA 1VFDA 4Z7EA 3KG2A 3T22A 5H8NA 3SESA 5L9MA 4I9DA 1OIBA 1Y3PA 1Y3NA 2XXRA 4R9GA 1MY3A 4G8HA 4FATA 4EXKA 1SVXB 1Y20A 2I58A 4JWYA 5EYFA 4GRKA 3W9WA 3CVGA 5FHMA 2V3QA 4IO3A 4PFUA 1P99A 2OWSA 4QSEA 3B7DA 1MRPA 2UVGA 1PB7A 3G7WA 5EHSA 3MP1A 1N7WA 1Q1KA 1O7TA 4G68B 1URDA 1MXWA 3VE1B 4POWA 4IO5A 4YKKA 2NXOA 4G77A 4LZ5A 5IKBA 1M5FA 4O3CA 2R71A 4ZE8A 2G29A 1LCFA 2XXUA 5AA2A 2X7QA 2GH9A 3MZ9A 5AA4B 3CR9A 4OERA 3T93B 3IORA 2HQ0A 3T9HB 3T9UA 3EPEA 1S7YA 3I6VA 3IJXB 4LQ5A 3CFLA 3CG1A 4O3AA 4ZEDA 1FTOA 1L5TA 4QFKA 4ZZAA 3O28A 3O6HA 1MH3A 1ZKBA 4HS7A 3RGYA 4DDDA 4NF6B 3OD7A 2H5YA 2G93A 4OMBA 3U92A 4X1BA 1MG1A 1I6QA 3HN0A 3FVKA 1R9QA 1DTZA 3T96B 4R2FA 3TUSA 5DVFA 2VHAA 3ODBA 3S4UA 2QMWA 4R6YA 5CRYA 4L17A 3B6TA 3FJMA 1ELJA 3IL1B 4POXA 3H03A 3RT6B 3GLBA 2VGQA 4FIMA 4MFIA 2VD2A 4ZS9A 2AL5A 1H43A 4ELRA 3K6WA 4N07A 1SYIA 4JB7A 1IXIA 2Q88A 2H25A 2FYIA 3RQTA 1UTBB 2XXHA 1XS5A 2V93A 3PMVA 4H67A 2OLBA 4H5FA 5F1QA 4U4XA 3K6VA 4BDMA 4KD5A 4G68C 3U94A 4XXUA 1JW5A 3IB2A 1JNFA 1OVTA 1HSJA 2PT1A 3CFXA 4DXCA 1H45A 3Q28A 1WODA 3PUZE 2F7BA 1GTKA 1B5JA 5L8DA 4RPNA 5L9SA 2XXTA 1BKAA 3FATA 1H44A 4X48A 1TFDA 1FQCA 3C31A 4M4GA 1SD3A 1A8FA 1EZPA 2I3WA 4ONYA 3TTMA 1QKAA 3SEUA 3K2DA 3VLWA 4NF8A 4K3FA 4KR5A 1S9TA 1LAGE 3H6WA 1B7ZA 2F97A 3C34A 1B3HA 1B3FA 4GOTA 3FVOA 3HV1A 3C33A 1NH8A 4KI0E 5I59B 2O7IA 1S50A 1FW0A 2Z8DA 3FGSA 3FXQA 2KLFA 1JVYA 4OEUA 3O6IA 4KCDA 1Q35A 2NVUB 4YICA 3KBRA 5J1DA 3RTFB 4LUBA 1D9YA 4Z0IA 4YMBA 3LSLA 3N6UA 5DT6A 3KEIA 2OK2A 5B7DA 1B40A 1JETA 4U2RA 3RUMA 1UQWA 3PUYE 4DCYA 4X1DA 3CIJA 2XD2A 3MAMA 4ESWA 3LC8A 3PD9A 5CC2A 4OVJA 3H6TA 2UXAA 4H8IA 3FJ7A 3MZ1A 2OBGA 1B32A 2A5TA 1MDQA 3PMWA 4JSOA 3VV5A 3U8QA 3R26A 3KSJA 4IGTA 1DSNA 4QFPA 2CZLA 3RY3A 4HW8A 4DIGA 4OFJA 3R7XA 2VP1A 4YKPA 3DM0A 2HZKA 1XVYA 3BFTA 3CG3A 5K2XA 1MS7A 1SQYA 1M5DA 5I57A 3UP9A 4G8MA 4R2BA 1TT1A 3TZAA 3VXCA 2VD3A 1NKXA 1ZTYA 3VFJA 5FTHA 4P0GA 1MY4A 3WAEA 2XHDA 3F11A 2Y7IA 3DP6A 5I58A 5I56B 2QRYA 3QUFA 4M1VA 3MP6A 3OO6A 2ZNTA 2XXYA 4KYEA 4I1DA 2P1SA 3PPPA 4GXSB 2PMSA 2XXIA 4GL0A 3WAFA 3L6GA 5DVJA 2F34A 1Y4CA 3RLFE 5LOMA 4E0XA 2V25A 3H4ZA 1AIVA 1QJMA 3CI8A 5I84A 4MH5A 2Z23A 3OENA 5H8FA 4BDLA 4YKJA 5HBCA 1N7XA 3E3KA 4EUOA 1B3GA 1LCTA 3PPRA 2RKMA 2GFEA 2QS1A 3TELA 1POY1 1N0TA 4YZZA 1SW4A 1QKBA 1B1XA 4XTCQ 3L6HA 1HSLA 1LFIA 3TEPA 1N3XA 1TFAA 1LB8A 4KCCA 3TCHA 1R9LA 1PBQA 4F18A 1FCKA 4KFQA 3K6UA 2FA7A 2ZYOA 1NNTA 1B3LA 5KCJB 5TP9B 4KHZE 2RF1A 4MLVA 5ITPA 5JK4A 3V8XB 2PT2A 3MP8A 1IQ7A 2O6AA 1YPNA 1FQFA 2NUVA 3TDJA 1A40A 4IO6A 4H65A 3FXUA 1POTA 1MDP1 1YAEA 3BFUA 4MLQA 4G68A 3LSWA 3E13X 4DE8A 2GRVA 4OENA 4F3GA 2QS2A 4F3PA 1UIVA 5DYHA 3HHFA 1OQHA 4H0WA 2ONRA 4GFRA 3TKDA 5HM4B 3EF7A 2B3FA 5AA4A 1ANFA 1B7UA 1B0HA 3KSXA 4QF9A 4U1ZA 3Q27A 4QHQA 4QRZA 2B65A 4IO2A 2I3VA 1CB6A 4OTEA 1SW2A 1IIWA 3TFLA 1YCJA 4F1VA 3MZBA 3OMBA 4X9TA 5ITOA 1US4A 3HSTA 4MBPA 4NF6A 4E0WA 1LBBA 3C9HA 3MVZA 3K1NA 3RPWA 3AXFA 4GD5A 1R6ZA 2F6PA 3PPOA 2O1LA 1NNPA 1P1QA 4YU0A 2ZNUA 2IA4A 1LAFE 1MY1A 2XX9A 3DELB 5I2NB 5FHOA 3UORA 2O1MA 4EDPA 2RC8A 4OWDA 4KYDA 5AA3A 3OOAA 2BJJX 4WEDA 4F1YA 1H3DA 2ZNSA 2Q9TA 3K4UA 4NEDA 5ICTA 5CMKA 4ELPA 3JYRA 4EXLA 3PUVE 1UTBA 3K6XA 2F78A 3ONMA 3JV9A 2HZLA 1MPCA 2DXRA 4LVQA 3EN3A 3VVEA 2OWTA 2DWAA 4ZECA 1FQBA 1MY0A 4DZ1A 4EQ9A 2HAUA 3IAZA 3Q26A 1MXUA 1WVJA 1H76A 4WKMA 1BP5A 3KOTA 5H8QB 1RYOA 2Y7WA 4YKIA 3DLNA 1B4ZA 4NF4B 4GLIA 3ZKLA 1NL5A 4ESXA 4TLLB 3ZKKA 3OSQA 3ZSFA 1B7HA 5JTYB 1OVBA 1MXXA 2DOJA 3UGWA 4RYAA 4PFYA 2RINA 4G4PA 3FZVA 2UVIA 4WXJA 1B52A 1FQDA 2HFBA 1DOTA 3TMGA 2WKYA 5I59A 2QS4A 4ZEIA 3S2VA 3ILTB 2V3TA 3E4RA 4ECFA 1URSA 2DXYA 4GXAA 1ZBMA 1LBCA 1N3WA 5H8HB 5EHMA 1ZMGA 3CFZA 4OFLA 2DE2A 1TXFA 1Z7ME 5CBRA 3S9LC 2A5SA 1I6AA 4ZE9A 5ICQA 3Q29A 3SEVA 3TTRA 1XC1A 3K0VA 4KYSA 1Y1ZA 2O51A 1JQFA 1N84A 5CBSA 4LZ7A 4OEVA 2QSXA 5CMMA 3A09A 4IO4A 3MWBA 1UTHB 3FASA 1BIYA 4P11A 4LONB 1MQJA 3IX1A 3MC2A 4QFOA 1DPEA 4JWOA 3FV2A 1JVXA 1TWYA 2UYFA 4RA1A 1GR2A 2PYYA 1SBPA 3FV1A 2ONKE 1B05A 2XXWA 4ZZEA 4F29A 4F2OA 2QJEA 2F8DA 1VE4A 2I48A 2F36A 4NE4A 3MUQA 4G2ZA 2O84X 1Y1MA 1IXHA 1T0KA 2I4BA 1PEBA 4BDRA 4PETA 3BKIB 2Q8JA 3H7MA 4FECA 3TCFA 4RPOA 3EHSA 4Q0CA 2F7AA 1I69A 4C1UA 1MQHA 5ISUA 1ZJLA 5I56A 5KDTB 3QUJA 1LB9A 4OHNA 4H6DA 5BUUA 1AMFA 1ZLQA 3SDFA 3HHGA 3KN8A 4NF5B 3IOWA 2ZYMA 3C32A 2ZXTA 3OO7A 4TQUQ 2YPNA 3M3LA 4P0IA 4G8NA 4UACA 3TQLA 3JZJA 1Y3QA 4GIZA 1P1WA 1SDXA 1B0LA 1OMPA 3VDFA 3U72A 1N76A 3VVDA 1USYH 3H3GA 1NNKA 1DPPA 3D4CA 1EZ9A 5DVIA 4XKPA 3RN8A 4LATA 3OO8A 4XKRA 3FJGA 1MM7A 3MPLA 3M3KA 2DQVA 3FIRA 1SI1A 1MXVA 4AB6A 2GHAA 1AL3A 3QK6A 4AQ4A 1FTMA 2REJA 2DWJA 4RXLA 5KCJA 1EH3A 3TPAA 5TP9A 1SW5A 3KN3A 4F31B 3GBBA 3N26A 4F39A 1FQAA 2ONSA 1B1HA 4ZDMA 3MVYA 3IB0A 1D4NA 2QPQA 2M8CA 4RK9A 1Y4TA 4R6KA 1XVXA 1B58A 3EHTA 1IEJA 2NOOA 5AA2D 1IZ1A 5JEIA 2ZMBA 4FJPA 3ZS6A 1FTJA 5B70A 3M8UA 3THIA 3KGCA 1WDNA 1NNFA 3C35A 1I6BA 4EF1A 2Z22A 3T66A 3SEYA 1LAHE 2Q2CA 2YLNA 3FVNA 3O6GA 3KJ7A 4MF3A 1M5BA 4KPTA 3M3FA 1A8EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GWOA 2PFZA 2HAVA 4R9FA 1FTLA 3B8BA 3OELA 5I5PA 3VVFA 3PPQA 3PV0E 3VLVA 4JWXA 3S9EA 1YYZA 2Y7KA 2UYEA 3T9XB 3SEWA 1ZIUA 2XXPA 4YB5A 5TU0A 4DXUA 3TTNA 1MY2A 4DXBA 5IZ1A 1EU8A 4N13A 1KWHA 4F3BA 5FHNA 3IFAA 4H1XA 3CRBA 1OLAA 5A5XB 2DWIA 3FXRA 5DEXB 1AWBA 5IZZA 4R73A 3K1PA 5TPAB 2Y7RA 3A3UA 3W9VA 4NWDA 1MPBA 1BK4A 1Z7NE 2CZKA 3PUXE 3MJNA 4N6PA 2Y84A 4U23A 5I2NA 4PFIA 1JEVA 2XX7A 4PDDA 4PFRA 1XHYA 3TTKA 3I3VA 3LSFB 5I2KB 3KJTA 4OA4A 1ZU0A 3MBPA 3DP8A 5ET7A 3O2AA 2I49A 2VOZA 4OXVA 2RC7A 3IO4A 4OESA 4C0RA 5KZTA 3W15C 5L9OA 2O7UA 3KN7A 5ET5A 3D4GA 5DTBA 5CM6A 1R1NA 4NMYA 2Z8EA 3PUWE 4FORA 2ALUA 3QYTA 3G3JA 2V3UA 2OZZA 1YTVA 3QIMA 4HE1A 2ZYNA 4DI4B 3UA8A 1QGXA 3LUYA 1US5A 5AE4A 4GWUA 1QW0A 2Y7PA 2F3BA 4JBZA 3C4MA 4P1LA 2I0BA 2DYXA 4RK2A 2DS9A 4IB2A 4QSCA 3GXAA 4PFTA 3MVWA 3U1OA 3FUZA 3TODA 3KBZA 2QFLA 5A5LA 4EF2A 1FTKA 2QL3A 2XWIA 4LA9A 4RJZA 3MSTA 3H6VA 2X7PA 3TAJA 3KOSA 2DP8A 5H8NB 1D9QA 3CHGA 5H8QA 4DLDA 2I0CA 3V89B 1VSOA 3TCGA 3V83A 4MIJA 4FE8A 1INPA 2XXXA 1OQGA 1JW1A 4NF4A 1QULA 4MMPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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