1HSLA

Refined 1.89 angstroms structure of the histidine-binding protein complexed with histidine and its relationship with many other active transport(slash)chemosensory receptors
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
238
structure length
238
Chain Sequence
AIPQKIRIGTDPTYAPFESKNAQGELVGFDIDLAKELCKRINTQCTFVENPLDALIPSLKAKKIDAIMSSLSITEKRQQEIAFTDKLYAADSRLVVAKNSDIQPTVASLKGKRVGVLQGTTQETFGNEHWAPKGIEIVSYQGQDNIYSDLTAGRIDAAFQDEVAASEGFLKQPVGKDYKFGGPAVKDEKLFGVGTGMGLRKEDNELREALNKAFAEMRADGTYEKLAKKYFDFDVYGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Refined 1.89-A structure of the histidine-binding protein complexed with histidine and its relationship with many other active transport/chemosensory proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HISTIDINE-BINDING PROTEIN
molecule tags Binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 68
structure length 238
sequence length 238
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-01-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hslA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hslA02
4PFYA 4LUBA 3PUZE 4C1UA 1P1OA 3IR1A 1OQHA 3SDFA 4U22A 3G3HA 5H8NA 3H7MA 2CMOA 4I62A 1H45A 4LONB 1J1NA 4R72A 2QJEA 3DELB 3PPNA 4R9GA 5DVFA 5FTHA 1JETA 4LVQA 5ITOA 1GTKA 3VDFA 1Y9UA 1M5EA 3FD3A 1FQEA 1IIWA 1HSLA 3Q29A 1IXGA 3PD9A 3HHFA 3TTLA 4ZS9A 3IOUA 1SVXB 3SERA 1Y4CA 2XXTA 3BFUA 3MC2A 5JTYA 1US5A 3K6WA 3GBAA 4F3SA 2DWJA 3KEIA 2UVHA 3SETA 1B1HA 3IB2A 4AB5A 2E1SA 3PMWA 1UIVA 3SESA 3G3JA 1MQJA 4LP2B 4MH5A 1PB7A 4NTLA 3R26A 4G8MA 4GWOA 1MQIA 1A8EA 1DTGA 1BP5A 3CSGA 2A5TA 2R6GE 3FJMA 1LAFE 1LAGE 4GL8A 3DP4A 1DSNA 3R7XA 2VHAA 1LCFA 4HTGA 5CMMA 5ELVA 3RT6B 4F22A 4NEDA 2XX9A 5CBRA 4EXLA 4F2OA 3T9UA 3U92A 5HPQA 1TWYA 4ELQA 1RYOA 2F34A 3OELA 3M8UA 4E0WA 5H8HA 5I2NB 3MWBA 1XS5A 1FQCA 4ND9A 1KWHA 4I9DA 4U23A 4UACA 2UXAA 3K6VA 4N13A 5EHSA 3S9NC 3O66A 4M4GA 4LQ5A 1O7TA 1B7UA 1LCTA 3O6HA 3CG3A 2HCAA 5DYHA 2RCBA 3BFTA 3TELA 2OLBA 4EUOA 1WVJA 2G93A 5H8QA 5I84A 1NNPA 3VXCA 3MZBA 3EPEA 4NF5A 2REGA 3D4GA 3E13X 3IK6B 3N94A 3OO7A 2IA4A 1D4NA 3KZGA 3QYTA 2A5SA 2XD2A 4YKIA 2Y7KA 2XXWA 3QXMA 3JZJA 3VVEA 2ZYMA 3C36A 3FJGA 4K3FA 4DDDA 3FVNA 1B3FA 2O84X 2AIXA 2B65A 1I69A 3IO4A 5DT6A 3U72A 1EZOA 3K2DA 1FTOA 3TDJA 1B58A 3U93A 4QSCA 4H67A 1USYH 3Q27A 4NMYA 1MQHA 4QRZA 1AMFA 4QHQA 3LBSA 1I6AA 4N6PA 4YMBA 4GF8A 3IAZA 5LOMA 2GHAA 3C4MA 3MZ9A 1GR2A 2DVCA 2O7IA 5M2VA 2OK2A 2R71A 4DLDA 1DPPA 2X7PA 4F39A 1DTZA 3VV5A 1VFEA 4GIZA 4POWA 2XXUA 1SW1A 1N7XA 4FEBA 1B46A 3V89B 1T0KA 1Y20A 2F8DA 4MBPA 4NF6A 4BDLA 2CZLA 4JDFA 4Q0CA 1IQ7A 2Q89A 4OFOA 4PFTA 2HAVA 3U1OA 3MZ1A 1R9QA 3MPKA 1UTHB 3DP8A 4RK2A 3CI8A 4OVJA 1O63A 1IXIA 3MVYA 4MLQA 2PVUA 4F1YA 5CBSA 5K2YA 1LFIA 1XHYA 4LQ2A 2QMWA 1PB9A 2Z23A 3BKIB 1L5TA 5ITPA 3Q28A 4FECA 1B5IA 1PDAA 1ZBMA 2O6AA 4XXUA 4X9TA 2QSXA 1O64A 4IO7A 4FATA 3C31A 3HPIA 3VXBA 1M5BA 2X26A 1A54A 4GLIA 1ATGA 3S9LC 4ISUA 5I2NA 1IITA 2AL5A 4G77A 2AL4A 3L6GA 2DSFA 4BDRA 2QS1A 2A5TB 3K6UA 5AA3A 1B6HA 1N3XA 5CC2A 3OEKA 1PB8A 3UGWA 3V8XB 1LLSA 2F7AA 1A40A 4I8CA 3KG2A 1Y3NA 2V84A 2ZNSA 4DXUA 4GFRA 4F19A 2ZYOA 3ONMA 5AA2A 2F78A 1MY2A 1AIVA 3PPRA 2F35A 4PP0A 2H98A 3MP8A 1PBQA 5BUUA 5H8HB 4O3CA 1URSA 4KQPA 3TTMA 2ESNA 3M3FA 3RNNA 3MP1A 4POXA 4XKQA 2OWTA 3GBBA 1QJMA 3UN6A 1B40A 3T93B 3A3UA 2OCUA 1YAEA 4O3BA 4BDMA 3TCHA 4YICA 1XVXA 2DP8A 4G8NA 3W9VA 1OQGA 2I4CA 3VVDA 1QULA 3FIRA 4PFUA 1EU8A 2D21A 2B3BA 3K1MA 3N6TA 2Y7IA 3RTWB 3OD7A 2W7YA 1H44A 2RKMA 4YB5A 2XXYA 4F3BA 3IX1A 3FXRA 3K1NA 2RF1A 5CRYA 1A8FA 4ESWA 2VD3A 4JBZA 3FATA 3AXFA 3DM0A 4LATA 1LB8A 2DYXA 3VLUA 2I3VA 4U4XA 2HFBA 3KN8A 3UA8A 3OSQA 4I1DA 4Z0IA 3QUJA 5I2KA 4OESA 5JK4A 4JWXA 1SD3A 2Z8EA 4KR5A 4G4PA 4EF2A 4TLMB 2AYSA 3MPLA 1QVSA 1IXCA 1ZKBA 4MF3A 4F3PA 3EF7A 3CVGA 3QK6A 3K01A 2Z8FA 2I6EA 3B6WA 1DMBA 1UTBB 3IOWA 4EXKA 3RGYA 2FNCA 4XIGQ 2I4BA 1AL3A 4U21A 1SW5A 4IO6A 1UTHA 2XX7A 5HM4B 4LZ8A 2RINA 4BDQA 1SW4A 2Y7PA 3ODBA 4R75A 3K02A 5L9MA 4NF6B 2Q88A 3WAFA 3SEUA 3WAEA 1Q35A 2Q2CA 1TT1A 1B7ZA 3SEYA 3PD8A 4Q30B 5EYFA 4IO3A 1NL5A 4DIGA 3FGSA 4YMAA 1MPDA 3OMBA 1IUDA 1MDQA 4ESXA 4P11A 3PV0E 4EQ7A 1NNFA 4U1OA 1M5FA 2ZNUA 3K1PA 3RQTA 1JW4A 1B3GA 4MLVA 3SEWA 1OLAA 3CFXA 1MXWA 4NF8A 2DXYA 4YB6A 4BDNA 3UIFA 4OXVA 4P0GA 3Q25A 5J1DA 1MRPA 3H6WA 2XXVA 4G68C 2ONRA 2UVGA 2Z8DA 3TCGA 3IJXB 1S50A 4BLAA 3T66A 4KYEA 4DCXA 2D3IA 3QUFA 3KSXA 4H6DA 4JWYA 1M5CA 5CMCA 1FTKA 2RC9A 4KD5A 4OETA 1DPEA 4IY6A 3FXUA 4ELPA 1R9LA 2DOJA 1D9VA 4OFJA 4F2QA 5AA2B 1MXXA 3QAXA 2VGQA 3HSTA 4DZ1A 1MQDA 2ZMBA 1GV8A 3I6VA 4NWDA 1MXVA 5L9SA 1OMPA 2FA7A 3D4CA 3P7IA 3K0VA 4WXJA 5H8FA 5F1QA 2QMXA 1B32A 3GLBA 1A99A 3FUZA 2KLFA 4ZEFA 1YCJA 2Q2AA 1VFDA 3IB1A 4OZ9A 3MVZA 3OEMA 5TU0A 2Y7RA 1A7LA 1AOVA 2DWHA 3KOSA 4GQOA 3EQ1A 3LC8A 4ZZAA 4R74A 1B51A 3OXNA 1Y3QA 1NNTA 4FEDA 4WEDA 1LFHA 1RKMA 2RC8A 4R2FA 1FQDA 4U1ZA 3MAMA 1XT8A 2XX8A 3TYHA 4QF9A 2P2AA 4LZ7A 2I3WA 4BDOA 1PC3A 3GZGA 2ABHA 4RYAA 2Q8JA 2ZNTA 4E0XA 2HEUA 3L6HA 1Y3PA 1MXUA 2HQ0A 2O69A 1P1WA 5AE4A 1SYHA 3LUYA 1OLCA 5IKBA 2PYYA 4KI0E 3IJOB 1UTBA 1ZMGA 3R6UA 4YZZA 3T9HB 5I2KB 1LAHE 3ZKKA 1MXYA 3FVOA 3G3KA 3T22A 5I56B 3FV2A 4JSOA 2DXRA 2RCAA 4R6YA 1DOTA 1H43A 2NVUB 3CIJA 3FJ7A 5KDTA 1TFDA 4ZEKA 5I59B 2I0BA 2V3UA 3H03A 4XTCQ 3O28A 3RUMA 3OO6A 3IORA 4NF4B 4JWOA 3SEVA 3MJNA 4ELRA 4QFNA 2XXIA 3KBRA 5FTIA 2XXRA 4N07A 2REJA 2ZYNA 1B52A 3K6XA 4OERA 3USDA 3O2AA 5ICTA 4H1XA 2XD3A 3LR1A 3MUQA 5EHMA 2YLNA 4C1TA 1GVCA 4OHNA 5I57A 4WEPA 1S9TA 5AA4A 3V5AA 1MH4A 4RXLA 3GXAA 2H5YA 1ELJA 4EF1A 3FASA 3TPAA 4RA1A 2GHBA 1B3HA 1BTJA 3PUYE 5B70A 4JB7A 3TAJA 3E3KA 4QFLA 4QFOA 3C33A 1CB6A 3I3VA 4G8HA 1OVBA 1D3KA 3TTNA 2O1MA 4NF8B 3EHSA 4OWDA 1D9YA 3IOTA 1FQBA 4GXSB 3UP9A 5KZTA 4KPTA 3CR9A 2PMSA 4KFQA 3H6TA 2Z22A 4YKKA 2VOZA 3A09A 4ECFA 1EZ9A 4IB2A 1PBPA 1RYXA 1P1UA 3M3KA 4X1BA 2F97A 1SBPA 1SQYA 2ZXTA 1WODA 1B5JA 2WKYA 4PQJA 3UORA 3U8QA 4C0RA 1VR5A 5DEXA 1SI1A 4RNSA 2ALUA 3MBPA 4DXCA 4U2RA 1SDXA 4Q5TA 3G3FA 2QS2A 1VSOA 3C34A 3HCQA 2H25A 4IO4A 3H06B 2HXWA 5DTBA 3EN3A 1QKAA 4ZECA 1LBCA 4G2ZA 4YKJA 2QRYA 1YTVA 5H8FB 3Q26A 2P0SA 1BLFA 2PBWA 3RTFB 1B7HA 1N0TA 3ILUB 2XXPA 3SEXA 4P0IA 3CRBA 4RY1A 3T9VA 2BJJX 2GRVA 2I48A 4HCYA 1UIUA 2H9BA 2XHDA 2GH9A 1B2HA 2XXHA 3G7WA 4IGTA 1I6BA 3F11A 3A3CA 4AQ4A 3TZAA 2F36A 1URGA 1JQFA 1JVXA 2R9JA 3ZSFA 3ZS6A 3K00A 4DE8A 1SI0A 4IO5A 3S4UA 1OVTA 3TODA 3JYRA 4TQUQ 1TFAA 5I56A 2DE4A 1FW0A 2V3TA 5TP9B 3O6IA 4OMBA 3RY3A 4THIA 3O9PA 2Y84A 2I49A 1FTLA 3KN7A 5I59A 3FVGA 4RPOA 3VVFA 4NF4A 3KJ7A 4OQOA 2OZZA 4GXAA 5IAIA 4FIMA 3VLVA 3MVWA 1VE4A 4PE5B 1LSTA 3LSFB 5BWJA 1R1NA 5KDTB 1AH5A 4YKPA 1ZU0A 2I58A 4DCYA 3B6QA 1CE2A 1M5DA 5HBCA 3FZVA 1N7WA 1B1XA 4ZE8A 5DVJA 1Y1MA 3FXQA 1B5HA 1LB9A 3KOTA 3K4UA 2UVIA 1NMUA 2VP1A 3N5LA 3IOVA 4KCDA 3I5OA 1SYIA 5ISUA 4QFPA 3ZKLA 5KCJA 4M1VA 3TKDA 3FVKA 1MPCA 1UQWA 4JSDA 5I57B 5AA4B 2ANJA 3HV1A 3E9XA 1QUJA 2G29A 4UA8A 2DE3A 4EQ9A 1Y1ZA 3QIMA 1IZ1A 4EQBA 2ONKE 1Z7ME 4TLLB 4IO2A 4DXBA 5AA1A 1B3EA 1R6ZA 3C9HA 3HO7A 5I58B 5CMKA 1QUIA 1FQFA 2HZKA 2HZLA 2Q9TA 5FHOA 3HN0A 2YJPA 4F29A 3DLNA 1Q1KA 1POTA 1QW0A 2XXQA 1MPBA 3PUWE 2O51A 4Q8RA 2DWAA 3TFLA 2E0SA 2QPQA 3V83A 3HHGA 4F18A 2PX1A 3MQ9A 2THIA 4L17A 1MY3A 1NH7A 1BIYA 4FJPA 3RPWA 2FYIA 2P1SA 2RC7A 1HSEA 4FE8A 3RT8A 1LAXA 3M3LA 3S9EA 5B7DA 2OWSA 1F9BA 4XKRA 1FTMA 2OJTA 3EHUA 5DEXB 1B4HA 1EZPA 1MY4A 1JNFA 3CFZA 3B7DA 2DVZA 1MXZA 1B9JA 2F7CA 2UYEA 1USYE 2QS3A 3E4RA 2V25A 2H99A 3OO8A 4OENA 4RJZA 1N3WA 2H4IA 2V3QA 3TTRA 4H65A 1URDA 1Z7NE 2DS9A 3PUVE 1B05A 2F5XA 1FQAA 3IO6A 5TP9A 4OEVA 2HAUA 5TPAA 1II5A 2O1LA 4G68A 1MY1A 1I6QA 5CM6A 4FAJA 2VD2A 2DE2A 3OSRA 3LSLA 4TOZA 3TEPA 2M8CA 1QKBA 4OTEA 2NOOA 2PT1A 4F1UA 1LBBA 2GFEA 4HS7A 3VLWA 1MH3A 5AA2D 3CSBA 1NKXA 1B0LA 1ZJLA 3S2VA 4ONYA 3JV9A 3TMGA 4YU0A 3O29A 2ONSA 5A5XB 4F1VA 3KFMA 1JEVA 3T9XB 4FORA 3C35A 5CMBA 3TTKA 1PEBA 3PUXE 4OEUA 4ZEDA 3KN3A 3H4ZA 4F3GA 3PGFA 3G3IA 1IEJA 5H8NB 2IEEA 1MM7A 2I0CA 4H5GA 3RLFE 2Y7WA 5K2XA 1P99A 1NFTA 3N26A 3PU5A 4R6HA 2QL3A 2UVJA 4NWCA 3PPQA 4KCCA 1POY1 1MQGA 1H76A 3PPOA 2D5WA 3VFJA 3RN8A 5JEIA 3H6VA 2O7UA 3C32A 4MFIA 3QSLA 3O6GA 3TQWA 2DQVA 3IB0A 1B0HA 5L9OA 4H5FA 4RK9A 5I58A 3KJTA 4F31B 4EDPA 3BBRA 1MS7A 5JTYB 1IXHA 3TUSA 1OIBA 1H3DA 1HSJA 3OOAA 1JEUA 3TCFA 5KCJB 1N84A 4RPNA 4QFKA 3CG1A 4XKNA 1N76A 4ZDMA 2LAOA 4IGRA 4YB7A 4ZE9A 1Y4TA 1TXFA 1FTJA 3W15C 4H8IA 1ZTYA 4KYSA 1US4A 2OBGA 3ECRA 2NXOA 3MVXA 4O3AA 1GGGA 4PFWA 5FHNA 4X48A 3B6TA 3OENA 1JW5A 3PPPA 2O68A 1P1QA 4OFLA 2XXXA 1B4ZA 1P1NA 4GOTA 1XOCA 2QS4A 4IY5A 2NWJA 4R6KA 4R73A 3CFLA 4R9FA 1S7YA 1XC1A 3VE1B 4GVOA 1WDNA 1FCKA 1XVYA 4H0WA 2NUVA 3MW0A 4KHZE 3PMVA 4PETA 3S9MC 4X1DA 1JW1A 3THIA 3LSWA 5ICQA 3W9WA 3DP6A 3ILTB 3EHTA 4R2BA 4GL0A 1A55A 3TQLA 2YPNA 1ZIUA 4ZZEA 2F6PA 4GD5A 1ZLQA 4U4SA 5H8QB 3T96B 3IL1B 4KYDA 3KGCA 2ZYKA 3LSXA 2F7BA 1SW2A 5F7VA 4XKPA 4NF5B 3H6UA 4LZ5A 1MDP1 1MY0A 5CI5A 1LFGA 1QUKA 3G3GA 2V93A 4ZEIA 1MG1A 2B3FA 1JVYA 4GRKA 1YPNA 1N04A 1NNKA 3MP6A 4Z7EA 4QSEA 3FV1A 5FHMA 4LA9A 3SKPA 1MM6A 4HCWA 4OYVA 5DVIA 3KSJA 4ZEBA 3U94A 3N6UA 4WKMA 4YAHX 1BKAA 2PT2A 1LGBC 3PMXA 3UK4A 4HW8A 2X7QA 4AB6A 4NE4A 3O97A 3H3GA 1ANFA 5H8SA 4ELOA 5L8DA 2DWIA 2F6GA 4JXIA 5TPAB 5A5XA 1EH3A 2UYFA 4G68B 3OO9A 4QSDA 1B3LA 4H8JA 1NH8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PFYA 4LUBA 3PUZE 4C1UA 1P1OA 3IR1A 1OQHA 3SDFA 4U22A 3G3HA 5H8NA 3H7MA 2CMOA 4I62A 1H45A 4LONB 1J1NA 4R72A 2QJEA 3DELB 3PPNA 4R9GA 5DVFA 5FTHA 1JETA 3U65A 4LVQA 5ITOA 1GTKA 2CEYA 3VDFA 1Y9UA 1M5EA 3FD3A 1FQEA 1IIWA 1HSLA 3Q29A 1IXGA 2FVZA 3PD9A 3HHFA 3TTLA 4ZS9A 3IOUA 1SVXB 3SERA 4NAPA 2VT5A 1Y4CA 2XXTA 3BFUA 3MC2A 5JTYA 1US5A 3HFUA 3K6WA 3GBAA 5EYHA 2XWIA 1DK4A 2DWJA 4F3SA 3KEIA 5I7IA 2UVHA 3SETA 1B1HA 3IB2A 4AB5A 2E1SA 3PMWA 1UIVA 4N6KA 3SESA 3G3JA 3E79A 1MQJA 4LP2B 4MH5A 1PB7A 4NTLA 3R26A 4G8MA 4GWOA 1MQIA 1A8EA 1DTGA 1BP5A 3CSGA 2A5TA 2R6GE 3FJMA 1LAFE 1LAGE 4GL8A 3DP4A 1DSNA 3R7XA 1FPIA 2VHAA 1LCFA 4HTGA 5CMMA 5ELVA 3RT6B 4F22A 4NEDA 2XX9A 5CBRA 4EXLA 4OA4A 4F2OA 1FBCA 3EKIA 2FIXA 3IFCA 4PF6A 3T9UA 3U92A 5HPQA 1TWYA 4ELQA 1RYOA 2F34A 3OELA 3M8UA 4E0WA 2BJIA 5H8HA 5I2NB 3MWBA 1XS5A 1FQCA 3SZPA 4ND9A 1KWHA 4I9DA 4U23A 4UACA 1K9YA 2UXAA 3K6VA 4N13A 5EHSA 3S9NC 3O66A 4M4GA 4LQ5A 1O7TA 1B7UA 1G0IA 1LCTA 1FTAA 2Q8MA 3O6HA 3CG3A 2HCAA 5DYHA 1NUXA 2RCBA 3BFTA 4MJOA 3TELA 2OLBA 4EUOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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