1I69A

Crystal structure of the reduced form of oxyr
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
212
structure length
206
Chain Sequence
ETMSGPLHIGLIPTVGPYLLPHIIPMLHQTFPKLEMYLHEAQTHQLLAQLDSGKLDAVILALVKESEAFIEVPLFDEPMLLAIYEDHPWANREAVPMADLAGEKLLMLEDGHSLRDQAMGFCFDTHFRATSLETLRNMVAAGSGITLLPALAVPPERKRDGVVYLPAIKPEPRRTIGLVYRPGSPLRSRYEQLAEAIRARMDGHFD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis of the redox switch in the OxyR transcription factor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HYDROGEN PEROXIDE-INDUCIBLE GENES ACTIVATOR
molecule tags Transcription
source organism Escherichia coli
total genus 45
structure length 206
sequence length 212
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-03-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i69A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i69A02
3RNNA 1POTA 2Y7RA 4H1XA 2QMWA 4OERA 2XXXA 2P0SA 3UA8A 3H3GA 2OZZA 1Y4CA 1US5A 3K6UA 5IAIA 5H8QA 4NWDA 3PPNA 3TQLA 3GXAA 4P0GA 1LFGA 1DTGA 1FTLA 3TUSA 2DOJA 1KWHA 4RK9A 1B1XA 4NF6A 4O3BA 3ILUB 3RT8A 1FTJA 4EF2A 3H6VA 3G7WA 1URDA 4G68A 3T96B 2DXYA 3VLWA 3VFJA 4IO4A 2M8CA 1MQIA 1O64A 3IR1A 4OZ9A 3T22A 1I6BA 4IO5A 4RK2A 2XXPA 3MPKA 4POXA 1BP5A 3E3KA 5DT6A 3U94A 3SKPA 1YCJA 2ZNTA 5CMKA 3S9LC 3N5LA 3KN7A 3OEMA 3E4RA 5CM6A 3IX1A 2R71A 5L8DA 1PC3A 5H8HA 4EUOA 2HCAA 3RUMA 1XS5A 1N0TA 3FASA 5CI5A 3CI8A 3ZKLA 4BDRA 3FIRA 4YKKA 3RY3A 5AA4B 3WAFA 4HW8A 3CVGA 3PU5A 4NEDA 4R73A 1MY2A 5KDTB 2THIA 1P1OA 2GFEA 2OLBA 1MXUA 3H6TA 3T9HB 2V93A 3VVDA 1QVSA 1JW4A 5A5XB 2H4IA 4IGTA 3CFLA 3SESA 4IY6A 2HEUA 3UIFA 2OWSA 4QFLA 3VV5A 2VD3A 1US4A 5HBCA 1T0KA 3OO9A 4U21A 3KN8A 1MXYA 4OHNA 5H8FB 2F7AA 1MXWA 5I59A 4G2ZA 3ODBA 1UTBB 1D4NA 1SVXB 1QUIA 1HSEA 1B7HA 3K00A 2I4CA 2QS2A 3T9UA 3PPPA 3A3UA 3MP6A 4PFTA 3EF7A 2RCAA 4C0RA 3PUXE 1TT1A 3IORA 1MY0A 1ZBMA 3HCQA 1DMBA 2GHAA 1MY4A 2PBWA 2AL4A 4ELOA 3E9XA 2NWJA 1PDAA 4DXUA 5I57B 2AIXA 1I6QA 2GH9A 4BLAA 4IB2A 5L9SA 1B6HA 3IOUA 3VXCA 4OFLA 3TDJA 1EZOA 3MBPA 1IQ7A 3C31A 3S9NC 3K02A 4G68C 3FD3A 2X26A 3N94A 1SYIA 4AQ4A 3D4GA 1H45A 4FEBA 3OO7A 5KCJB 3VVEA 4AB6A 4DE8A 1XOCA 3MUQA 4TLMB 3RQTA 1LAXA 2WKYA 3FVNA 4F31B 4DXBA 5EYFA 3KBRA 4HS7A 4LQ5A 3USDA 2V3QA 4NF8B 4F3BA 3O6HA 2XX7A 4G8MA 1NNPA 3H6WA 1BLFA 1TWYA 2A5TA 2ZYNA 4YB7A 3PUWE 1FTOA 2OBGA 5EHMA 1B32A 1M5FA 1IXHA 4U1ZA 3JZJA 3BFUA 4EF1A 3KEIA 4G68B 2I58A 4AB5A 1AL3A 1LFIA 1AMFA 1SW2A 4OYVA 5HPQA 3TTMA 4NF5B 3IAZA 4Q5TA 1MM6A 1JEUA 1RYXA 3Q26A 3OSRA 3U72A 3ZKKA 3MWBA 4OFJA 2D21A 2OK2A 1Y3PA 3SEYA 1M5BA 1B3LA 2PYYA 1USYH 1ZTYA 1B0HA 1NNFA 3FXRA 4OXVA 3KOSA 2FYIA 3KN3A 1MXVA 1VR5A 1AIVA 3OXNA 3OSQA 4KI0E 2H99A 5H8HB 1A8EA 3K1MA 4XKQA 1MH3A 4TOZA 2UYFA 4EXLA 1N3WA 4O3CA 5TU0A 1NFTA 1QKBA 3FXUA 4TQUQ 5BUUA 2G93A 5CMMA 1HSLA 2O7UA 3TMGA 1SW5A 1EZPA 3OOAA 1B4HA 4R75A 3PD8A 2HAUA 4MLQA 3O2AA 3CR9A 3TTNA 2Z8FA 1ZLQA 2XXVA 3M3LA 4GFRA 2Z22A 4FATA 3M3KA 1N7WA 4THIA 5I59B 4XKRA 2D3IA 3SEVA 4YKJA 2NOOA 3KFMA 1XHYA 4MH5A 5CMBA 3KZGA 3TEPA 4F3GA 1LBBA 2DSFA 3A3CA 4OTEA 4QFOA 3O66A 4U4XA 4LA9A 5AA4A 1ATGA 1JETA 1SI0A 4U23A 4WXJA 1FQFA 1IXGA 5KDTA 1B1HA 1P99A 3TTKA 3MVWA 4LP2B 2QS4A 2XD3A 4NF4B 2HZLA 1VSOA 5EHSA 4KCDA 4QRZA 4FORA 5AA2B 2Y7IA 3SDFA 1JVXA 5DVJA 3B6WA 4OESA 3OO6A 5HM4B 2O6AA 4ZEBA 3G3HA 3ONMA 1S7YA 2Q8JA 1S9TA 5ISUA 3MP1A 4GF8A 1DSNA 3RTWB 1UQWA 3S9MC 3FV1A 3C34A 3FGSA 1Y9UA 3VXBA 1N84A 4RPOA 4E0WA 1CE2A 2CMOA 2OCUA 2DYXA 3IOTA 4XXUA 4QFPA 2DWJA 1PEBA 1A99A 1MG1A 4BDNA 3QUJA 5CRYA 2ZYMA 3LSWA 2ZNSA 1M5CA 4F3PA 3KG2A 2UVIA 3LC8A 4M4GA 1FQDA 3B6QA 1B0LA 2VD2A 3PV0E 4RYAA 3TCHA 1FQCA 4WEPA 1GTKA 4ZEDA 1MXXA 3K6WA 2V3UA 3UORA 2UVGA 2REJA 3TYHA 3FZVA 4C1TA 2B3FA 2XX9A 2GRVA 2UYEA 4H67A 2RC7A 3FVKA 2Q9TA 3TODA 4XTCQ 3KSJA 1B5IA 5KCJA 5TPAB 2FNCA 1SI1A 1R6ZA 4KR5A 1EH3A 3FJ7A 4NF8A 2VOZA 4IO2A 2I0CA 2DE3A 2ZXTA 1LFHA 3ZSFA 1PB9A 4KYSA 3KJTA 2I3VA 3K01A 3FVOA 2HZKA 4ECFA 1FW0A 4X1BA 2UVHA 2ABHA 4MF3A 4FEDA 5CC2A 4G4PA 5FHOA 5H8SA 2F8DA 2HAVA 3CSGA 4JXIA 4POWA 4NF5A 4FAJA 3SEWA 1OQGA 3W9VA 4QSDA 3BBRA 4R9FA 4DDDA 1OLCA 4ND9A 1P1WA 2O68A 2DS9A 2QSXA 2XX8A 4JB7A 4HCYA 4PE5B 3PUYE 1R9QA 4H6DA 1BTJA 1YTVA 1Q1KA 2ONRA 1IEJA 3MAMA 3CG3A 2V84A 3FJMA 5FHNA 2O51A 2IEEA 2GHBA 3H7MA 1O63A 2NUVA 4QSEA 3IL1B 5TP9B 2XXTA 3G3GA 1Y1MA 2Y7KA 1P1QA 3IB1A 1N04A 1M5DA 3TCFA 3K1NA 4NTLA 4ISUA 4PP0A 3MPLA 4GWOA 1M5EA 1Z7ME 4JWXA 4I1DA 3L6HA 1XVXA 1J1NA 3OEKA 2H9BA 2RKMA 3DP4A 3TCGA 3LSLA 4KYEA 2XXUA 1H3DA 1QW0A 4ELPA 4YKIA 5ICQA 3EPEA 3I3VA 3Q29A 1WVJA 3C36A 2Q88A 2I6EA 3Q25A 2I4BA 2B3BA 3CG1A 1D9VA 5DYHA 4U2RA 3OD7A 1MQDA 5ITOA 3T9VA 1NH8A 4IY5A 4QHQA 1N7XA 4E0XA 5DVIA 4NF4A 5JTYB 1JVYA 4N13A 1VFDA 3PPRA 5AA2A 4TLLB 4HCWA 1Y3NA 1GV8A 3PPQA 5AA3A 2QRYA 3FJGA 4IGRA 4OEUA 1QUKA 4F1UA 3C35A 3KJ7A 4JSOA 5DTBA 4OFOA 1IUDA 4X9TA 4O3AA 3HV1A 3MC2A 3VVFA 4IO3A 1IIWA 1EZ9A 3LUYA 1URSA 1MY1A 1PBPA 1DTZA 1OVTA 4PFUA 4KYDA 3IOVA 1DPPA 3DP8A 4H65A 1JNFA 4U22A 2O1MA 4YKPA 4LQ2A 2QS3A 1DOTA 4OVJA 3I5OA 1USYE 1Z7NE 3PMVA 3D4CA 4YB6A 1R1NA 4YU0A 5DVFA 1NH7A 1QJMA 2OWTA 4KPTA 3RTFB 1MDQA 3SEUA 5LOMA 2F7CA 3CIJA 3MJNA 4EXKA 1O7TA 2W7YA 4LZ7A 1FCKA 3UN6A 3RGYA 5ICTA 1ZU0A 2H25A 1H76A 2ZYKA 5TPAA 5I2KA 3IB2A 4Q30B 3OMBA 3TKDA 3T93B 1SW4A 4HTGA 4JWOA 3O29A 1SD3A 4ZEFA 4GXAA 4UACA 4BDLA 1YPNA 1LBCA 2P2AA 4QF9A 3O9PA 2B65A 1XVYA 5H8NB 1Y4TA 3SERA 1N76A 5L9MA 1DPEA 3V5AA 1A55A 2YJPA 3TTLA 3SEXA 4F19A 2VP1A 2DE4A 2HFBA 2OJTA 2RC8A 1RYOA 1YAEA 4F1YA 2Q89A 1B4ZA 1SW1A 3GBBA 1OMPA 3N6UA 3O97A 1H44A 2O7IA 1IITA 2I49A 2R6GE 4IO6A 1NKXA 3B7DA 3UP9A 4PFYA 4H5FA 3HHGA 2O1LA 3DP6A 3K1PA 3QXMA 1PB8A 2ESNA 2UVJA 3K2DA 4P0IA 5J1DA 3LR1A 3A09A 4RNSA 3QK6A 5TP9A 5ITPA 1ZIUA 1Q35A 3UGWA 4GL0A 4MLVA 3GZGA 2XXRA 2QJEA 2BJJX 3BFTA 5FTHA 2O69A 3CFZA 4RPNA 4ZEKA 5AA1A 2QMXA 2RCBA 1MPDA 2UXAA 1I6AA 2DQVA 3EQ1A 4M1VA 1FTMA 4RA1A 2X7QA 1PBQA 4RJZA 1B3HA 4R6KA 2HQ0A 2QPQA 2O84X 1B5HA 4G8HA 3R6UA 4WEDA 2IA4A 2NVUB 2AL5A 3QAXA 4QSCA 1JW5A 3R7XA 4R9GA 1Y20A 3HSTA 3IJOB 3TQWA 3KOTA 4F39A 3EHUA 1CB6A 4X1DA 1ZMGA 2CZLA 2F78A 3PUVE 4I8CA 2PT1A 2YPNA 2DWIA 1PB7A 2XXQA 4G8NA 1ANFA 3N26A 1TFAA 2LAOA 4LUBA 1B3EA 1JQFA 3O6IA 3G3JA 4GD5A 4F2OA 1SYHA 1IZ1A 5JTYA 3TELA 3TTRA 5CMCA 4PETA 4C1UA 1A40A 3K6XA 3VE1B 3EHTA 2F34A 4H0WA 5DEXA 2F5XA 1VFEA 3TPAA 3IB0A 2F6PA 3FUZA 1UTHA 3JYRA 4FIMA 5I2KB 1B46A 4H8JA 3MZBA 4Z0IA 3K6VA 3OO8A 1FQBA 5BWJA 1F9BA 1VE4A 3M8UA 1SQYA 4DIGA 1SBPA 1II5A 2F6GA 1Y1ZA 2ONSA 5CBSA 2NXOA 1UIVA 3RT6B 1OLAA 4R6HA 1FQAA 5CBRA 1IXCA 4KD5A 3MVZA 1QULA 1XT8A 4OMBA 1A54A 4R72A 4YICA 3H03A 3VDFA 1MS7A 1MPCA 2REGA 2ZNUA 1MM7A 3VLUA 3K0VA 1GGGA 5AE4A 4XKPA 2RF1A 2I48A 5JK4A 1AH5A 3WAEA 1WDNA 3MZ9A 4UA8A 2PT2A 3IOWA 2H5YA 3U93A 3H4ZA 1P1NA 3FV2A 4YB5A 4F18A 1ZJLA 4H8IA 2V3TA 4LZ8A 4R2BA 4BDOA 4N6PA 3ZS6A 4EQBA 4ZS9A 4DXCA 4GLIA 4N07A 1D9YA 3HPIA 3L6GA 2QS1A 2PVUA 3H06B 4JSDA 1MRPA 1TXFA 1ELJA 3LSXA 3CSBA 3C9HA 1OIBA 5H8NA 2F35A 3F11A 2AYSA 1D3KA 5AA2D 3R26A 1URGA 4H5GA 4KCCA 1A7LA 1OQHA 4MFIA 1LLSA 4DLDA 2DXRA 4Q0CA 5M2VA 1POY1 3ECRA 4XIGQ 3Q27A 5I2NB 3H6UA 3MW0A 3HN0A 2Y7WA 4ESWA 2V25A 4DCXA 4BDMA 1MQJA 2FA7A 4GRKA 3UK4A 1JEVA 4P11A 3FATA 4IO7A 1WODA 3S4UA 1LCTA 3QIMA 4F2QA 4G77A 1B2HA 4ZECA 3LSFB 3VLVA 3DM0A 5KZTA 3PD9A 3V8XB 4OENA 2F7BA 4F3SA 3I6VA 4I9DA 4PFWA 3V89B 4ZEIA 4XKNA 1IXIA 3T9XB 2DP8A 3DLNA 4ZE9A 2F36A 3IJXB 5FHMA 5I56A 4ZE8A 2F97A 2DE2A 2Y84A 4GXSB 4YMBA 4GIZA 2Z23A 3GBAA 5DEXB 1NNTA 1MQHA 4NMYA 2P1SA 3EN3A 1B7UA 3EHSA 3PUZE 1UTHB 4LZ5A 3CRBA 2VGQA 1MXZA 1S50A 3AXFA 3FVGA 3W15C 1RKMA 4ELRA 1GR2A 4YZZA 4ZDMA 5F7VA 3PMXA 1B9JA 2Q2AA 5ELVA 4QFKA 1LAFE 4F22A 1QKAA 4MBPA 1LAHE 5H8QB 1R9LA 1LAGE 2E1SA 3KGCA 4YAHX 1UIUA 4FE8A 4YMAA 4PQJA 1MQGA 5FTIA 3IO4A 1B05A 2E0SA 1EU8A 3FXQA 4X48A 4NF6B 4FECA 4JDFA 2ZMBA 2XXWA 4WKMA 1TFDA 3IO6A 1H43A 5I58A 3W9WA 2ZYOA 3RPWA 5B7DA 1NMUA 3C4MA 2DVZA 4BDQA 2G29A 4DZ1A 4R74A 4KHZE 1LSTA 3G3KA 3BKIB 2ANJA 1L5TA 4L17A 3MQ9A 2X7PA 2ONKE 4JBZA 2I3WA 3MVXA 3E13X 3OENA 1A8FA 1LB9A 1ZKBA 3QYTA 1Y3QA 5F1QA 2Z8EA 1AOVA 1FTKA 2DWAA 3PPOA 3U8QA 4NE4A 1B51A 1B40A 3N6TA 4I62A 3MP8A 1P1UA 3IK6B 1B3FA 3RLFE 2D5WA 4U1OA 4ZZAA 3S2VA 4NWCA 4EQ7A 3MVYA 1GVCA 4EQ9A 4OETA 4JWYA 1LGBC 1JW1A 3ILTB 4Z7EA 4R6YA 4QFNA 3B6TA 2A5SA 3U92A 2YLNA 4OEVA 3TAJA 2QL3A 2I0BA 4K3FA 2XD2A 4RY1A 4OQOA 4Q8RA 1XC1A 4LONB 1I69A 2PMSA 1LCFA 1MPBA 2Q2CA 4RXLA 5B70A 3O28A 3HHFA 4ONYA 2Z8DA 4GOTA 1BIYA 4DCYA 4ELQA 1NL5A 3G3IA 4ESXA 3U1OA 3SETA 3QSLA 4EDPA 4FJPA 1MDP1 2XXHA 1B52A 4U4SA 2XXIA 3K4UA 3DELB 5JEIA 5I56B 1HSJA 3P7IA 3MZ1A 4LATA 3LBSA 3KSXA 1B5JA 4ZZEA 3THIA 3T66A 3Q28A 5I2NA 2H98A 2Y7PA 3HO7A 4F1VA 1FQEA 5A5XA 3OELA 2PX1A 1NNKA 3M3FA 3JV9A 3V83A 3G3FA 2RINA 3C33A 4R2FA 3RN8A 2DVCA 1N3XA 1MH4A 1OVBA 2R9JA 5K2XA 2VHAA 5H8FA 5I84A 5L9OA 4KQPA 1UTBA 2KLFA 2XXYA 3CFXA 1B58A 4OWDA 3O6GA 5IKBA 3PMWA 1QUJA 4F29A 4KFQA 3GLBA 2DWHA 3QUFA 4GVOA 2A5TB 4GL8A 1B3GA 1LB8A 5I58B 5K2YA 4LVQA 2ALUA 3S9EA 3C32A 1B7ZA 3PGFA 3TFLA 5I57A 1BKAA 4GQOA 2XHDA 2HXWA 2RC9A 1SDXA 3TZAA 1MY3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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