1I6AA

Crystal structure of the oxidized form of oxyr
Total Genus 62

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
212
structure length
212
Chain Sequence
ETMSGPLHIGLIPTVGPYLLPHIIPMLHQTFPKLEMYLHEAQTHQLLAQLDSGKLDAVILALVKESEAFIEVPLFDEPMLLAIYEDHPWANREAVPMADLAGEKLLMLEDGHCLRDQAMGFCFEAGADEDTHFRATSLETLRNMVAAGSGITLLPALAVPPERKRDGVVYLPAIKPEPRRTIGLVYRPGSPLRSRYEQLAEAIRARMDGHFD

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTVIII1 (139-142)TI3 (152-155)TI4 (170-173)3H1 (150-152)TIV1 (87-90)AH1 (101-116)S1 (91-97)S4 (156-170)S2 (120-126)S3 (143-147)3H2 (183-186)TIV2 (195-198)S6 (190-192)TII1 (186-189)TIV3 (202-205)TI7 (203-206)TIV4 (207-210)TI8 (210-213)TI6 (175-178)TI5 (173-176)TI1 (98-101)AH2 (129-138)TI2 (117-120)O1 (199-208)S5 (181-182)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transcription
source organism Escherichia coli
publication title Structural basis of the redox switch in the OxyR transcription factor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HYDROGEN PEROXIDE-INDUCIBLE GENES ACTIVATOR
total genus 62
structure length 212
sequence length 212
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-03-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i6aA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i6aA02
1FCKA 3M3FA 3HCQA 2DXRA 2HXWA 4ZDMA 3TQWA 4O3AA 1A7LA 4C1TA 4DXBA 4YAHX 2ZXTA 3UORA 2Q2CA 3B6QA 3GZGA 1JEVA 1POTA 3LSXA 3QUFA 2QS2A 3ONMA 2PT1A 1Y3NA 2XXHA 4RYAA 1M5FA 2NXOA 1B2HA 1MQGA 1OVTA 2FYIA 5F7VA 4E0WA 4NF6B 1KWHA 3CG1A 5EYFA 3T96B 2UVGA 4HS7A 5M2VA 3FJGA 4C1UA 5EHSA 4TLMB 3C36A 4XKNA 5I56A 4G68A 2O84X 3UA8A 2H25A 3B6WA 1IITA 5H8SA 5AA4B 3V5AA 2DE3A 1N7XA 2ONKE 4R6KA 2UYEA 4ZZAA 3HHFA 5I2KA 3VXCA 1B1XA 1LFGA 3GBAA 3U8QA 5B70A 2W7YA 3K2DA 2YPNA 2P0SA 4NTLA 3IX1A 2QPQA 4LUBA 3K1MA 1I69A 3W15C 2VHAA 3RTWB 5K2XA 4R6HA 3RUMA 4OFJA 3MAMA 1ATGA 5I58B 2DYXA 2F8DA 5H8NA 4PETA 3UP9A 5A5XB 4PFTA 2XXIA 1B5IA 2GFEA 2ONRA 1BIYA 3VVEA 4OQOA 5KDTB 4X48A 5AA2B 1H44A 4GOTA 1PDAA 1PEBA 3IOUA 1O64A 3PUXE 3ZKKA 5ICTA 2H5YA 2IEEA 5DEXA 2I48A 1B1HA 2XXUA 1R9QA 1FTOA 5CMCA 4YMAA 3S4UA 1RKMA 3TUSA 1R9LA 1MQJA 1Y9UA 1JW1A 2DXYA 2XX8A 5IKBA 4MLVA 4XXUA 1OMPA 1POY1 3CIJA 4GRKA 3MZ9A 1R1NA 1O7TA 3OO7A 3T9VA 4YB7A 2HAVA 4NF8B 1OIBA 4R74A 4H0WA 2DOJA 2RC8A 2RCAA 4NEDA 4FIMA 4Z7EA 1FQFA 5I2NA 1TXFA 3DM0A 3PD9A 2Y7WA 3G3GA 5TP9B 4PP0A 5TPAB 3U1OA 4NWDA 4OVJA 4RNSA 3U93A 1NNTA 5IAIA 4ELQA 4JB7A 3PMXA 4YMBA 4QFLA 1DMBA 1XHYA 3OELA 1IZ1A 2V3UA 1D3KA 2RCBA 1OVBA 4R72A 4F31B 4YZZA 3IB0A 4X1DA 2O1LA 5JTYB 2HCAA 3O6IA 5DTBA 4H6DA 4KQPA 1VSOA 4ECFA 4P11A 1MPCA 3U72A 2BJJX 4G8HA 3AXFA 1MY4A 3G3KA 4NF6A 5KCJA 5CRYA 1IXHA 4F18A 1S50A 1ZJLA 4RJZA 3A09A 4EQ7A 4JBZA 4ZECA 3K6VA 5JEIA 5J1DA 3MVZA 3IOWA 3C4MA 1MXVA 4DE8A 4KCDA 4PE5B 1N7WA 2Q89A 3IB2A 1ZBMA 3KN3A 3PUYE 3UK4A 4OERA 3HHGA 4U23A 1B5HA 2DVZA 1I6AA 4QRZA 1ZIUA 1MM6A 1GVCA 4NF4A 3IR1A 1MY2A 4O3BA 3MP6A 2XD3A 4UA8A 1B6HA 1YAEA 4AB5A 3KBRA 2V84A 3MPKA 4MFIA 3TTLA 3N26A 3K6UA 3TTMA 3U92A 4LP2B 2R9JA 5I59A 1B3LA 2OWTA 3BFTA 2DWJA 4WKMA 3K1NA 4OZ9A 1ZMGA 3CRBA 1MS7A 1LB8A 3TAJA 2Q8JA 2ONSA 5H8HB 4HCYA 4Q0CA 4DLDA 4LZ8A 1GV8A 5H8QA 3PPQA 4ZEDA 4QSCA 1XVYA 4OMBA 4GQOA 3GBBA 4ZE8A 1F9BA 3G3IA 1NH7A 5CMBA 3SKPA 2CZLA 4LATA 3O6GA 4G77A 2ZMBA 3QK6A 4ZS9A 4TQUQ 4H8IA 3VLVA 2Z22A 3QUJA 1N84A 3IO6A 2QJEA 5BWJA 2UVJA 1R6ZA 1URDA 3ILTB 3HO7A 4KPTA 1QKAA 3HN0A 3K0VA 3MUQA 3DP4A 3I3VA 1LB9A 5I57A 3PPRA 3T9UA 1USYH 4FAJA 1FQEA 1GTKA 1P1NA 1MXUA 1S7YA 5L9OA 4Q8RA 2ZNTA 1BKAA 2XXVA 1DPPA 1FTLA 3VVFA 3F11A 3ZSFA 1CE2A 4YKIA 4MLQA 3OSQA 3W9VA 4I9DA 4ZEFA 3SEUA 3O28A 1A54A 1EH3A 4IY5A 2AYSA 1Y4TA 3WAEA 4LVQA 3EQ1A 4NE4A 1USYE 3USDA 2XXXA 1AL3A 3JYRA 4F1UA 1Q35A 4JWOA 4LA9A 1TWYA 3QYTA 1MH4A 3RT6B 2ZYKA 2HEUA 1B32A 4KYEA 3MZ1A 3IAZA 1DTGA 3TPAA 2PT2A 1FQBA 4F3PA 2Z8DA 4F19A 5L8DA 2O68A 1B51A 1LAHE 2NWJA 3C33A 3KEIA 1PB8A 3L6HA 1MG1A 3S2VA 4GWOA 3MZBA 1P1QA 1JETA 2ZYMA 4ELPA 3TEPA 1B3FA 4EXLA 4R6YA 3K1PA 4FEBA 5CC2A 1XS5A 3Q29A 1US4A 3Q26A 2IA4A 3RN8A 3CSBA 3SEWA 2UVHA 4U4XA 4PQJA 3C32A 1BLFA 2ALUA 4G8MA 4U4SA 3PPNA 1B4HA 2F7CA 5DT6A 3W9WA 1DOTA 3V8XB 4PFUA 4OFLA 3VDFA 3RTFB 3SEXA 1P99A 4X1BA 4QSEA 4ZEIA 3PMWA 2Y84A 3THIA 1YPNA 4WEDA 4GD5A 1GR2A 1LAFE 3A3CA 4IO7A 2OZZA 4EQ9A 2RC7A 2F6PA 3OENA 3O6HA 2I6EA 2ZNUA 1IXCA 3FIRA 1B5JA 1FQCA 2DWIA 1YCJA 2WKYA 3ILUB 4JSOA 1M5EA 4ISUA 5HM4B 3TELA 2QMWA 3PUZE 2ABHA 3Q25A 2P2AA 3QSLA 4M1VA 1QUKA 1UIUA 3LR1A 1FW0A 3JZJA 3OXNA 3E3KA 1PC3A 2DQVA 4QF9A 2V93A 4LZ5A 3IJXB 3LSWA 2X26A 4GLIA 5FHOA 2VGQA 1M5BA 4RA1A 5FHMA 4ELOA 4F1VA 3H03A 3FV2A 4TLLB 1HSEA 3TTKA 3KFMA 2XD2A 3S9NC 1Y1ZA 4ESXA 1LFHA 2XHDA 3FXRA 3S9EA 4HTGA 2NUVA 5FTIA 3KSXA 4EXKA 2Q2AA 3CFLA 3OEMA 2ZYOA 3S9MC 1Y3PA 3KZGA 4POWA 3HPIA 1DPEA 2AL5A 3EHSA 5FTHA 3SEYA 4OEUA 4E0XA 1MXYA 3LUYA 2I49A 4BDQA 4ND9A 2H98A 3IOTA 1QW0A 3UGWA 1MM7A 4I62A 2GHAA 2Q9TA 3R7XA 3EF7A 3ODBA 4ESWA 2O51A 4OEVA 1VR5A 4KFQA 1UTBA 3FATA 3CG3A 2B3FA 1MQIA 2X7PA 3MVWA 2R6GE 3L6GA 3R6UA 4XKRA 1Y4CA 3DP8A 4P0IA 3Q27A 3GXAA 3G3JA 3MQ9A 1OQGA 3VVDA 3CSGA 1D9YA 1ZKBA 3RY3A 1XT8A 3QAXA 1RYOA 5ICQA 2Y7PA 4HW8A 2Y7RA 3R26A 5DYHA 5F1QA 1IEJA 4F3SA 4G2ZA 1JEUA 3OSRA 1B58A 1CB6A 3BKIB 2XX9A 1WDNA 2H4IA 4IO6A 1NMUA 3TTNA 3VFJA 4YB5A 4DXCA 4EDPA 2CMOA 4I8CA 3CR9A 4FE8A 5AA3A 2F78A 2X7QA 3K02A 3KOSA 1N04A 1NNFA 1B40A 1AIVA 5JK4A 1B05A 1NFTA 3Q28A 2RINA 2A5TB 1B46A 3HSTA 2O7IA 1II5A 1ELJA 3KN7A 2ANJA 4G68C 3G7WA 3LSLA 4RY1A 3CVGA 4ZEBA 4M4GA 1B3EA 1S9TA 2I4CA 1DTZA 1B7HA 1D9VA 3QXMA 3C31A 3GLBA 1B9JA 2DE2A 3OEKA 4JSDA 2F7BA 3PD8A 1OLAA 1LSTA 4NF5B 3ZS6A 3MWBA 1MXXA 2F6GA 5AA4A 1JVYA 1UTHB 5CMMA 2AIXA 1UQWA 4F29A 1LCFA 5L9MA 4FECA 4KD5A 2RC9A 1HSJA 3MJNA 3MP1A 4ZZEA 3M3LA 4U22A 3V83A 1VFDA 3EHTA 3PUWE 1MPDA 2B3BA 2XXRA 2Y7KA 2ESNA 4GL0A 5I58A 3RNNA 3MBPA 5ELVA 5A5XA 1IQ7A 4GIZA 2XXYA 1M5CA 3U94A 3UIFA 3H6VA 2GHBA 4P0GA 5KDTA 3QIMA 3RGYA 5AA2A 3OD7A 4DCXA 1TFAA 2E0SA 1N0TA 1SD3A 3LSFB 3T66A 3TYHA 5K2YA 1DSNA 3M3KA 2OCUA 2I0CA 2PX1A 2OWSA 3TFLA 2I0BA 3FXUA 1XC1A 4EUOA 1MXWA 3K6WA 3H6UA 4F2QA 3T9XB 4R2FA 5I84A 1B0HA 2YLNA 4LONB 1H76A 3H6WA 2F36A 2ZNSA 4BLAA 3O2AA 2G29A 2DWAA 2Z23A 1QULA 3OO9A 4RK2A 4KHZE 5H8NB 4XKPA 2HQ0A 1SVXB 2VP1A 4NF8A 3E9XA 4RPNA 2F97A 1NKXA 2XXQA 4R2BA 4RXLA 3CFXA 2H9BA 2XX7A 5DVJA 3TZAA 4LQ5A 1NNKA 4GXAA 5TP9A 1MPBA 5TPAA 1EZOA 3FVOA 1SW4A 5DEXB 4MBPA 4OWDA 2VD3A 3D4GA 1WVJA 5CI5A 4FJPA 3RPWA 4DDDA 1PBQA 4JWYA 4L17A 3I6VA 2D3IA 4QFKA 3VXBA 3UN6A 2YJPA 5JTYA 3T22A 4NWCA 1LGBC 3VE1B 4GVOA 2Y7IA 1MQDA 1QKBA 4IO4A 1B7UA 4JDFA 3KSJA 3N6UA 1H45A 4R9GA 1A55A 4IY6A 3TDJA 4KYSA 1B3GA 1MDP1 1MH3A 4BDRA 1AMFA 3LC8A 2F5XA 4N07A 1SDXA 3K4UA 1Y20A 2VD2A 1SQYA 4YICA 4IO5A 2O7UA 4LQ2A 2F34A 3PU5A 5AA1A 3MC2A 5HPQA 3G3HA 1N3WA 1B7ZA 1LAXA 3FXQA 3E13X 4F2OA 4FATA 4OETA 4KCCA 3O66A 1SYIA 2Z8FA 3M8UA 2XXWA 4R75A 4YKKA 5CBSA 3E4RA 4KYDA 4BDLA 2RF1A 2V25A 2FNCA 5H8HA 2VOZA 1LLSA 1MY0A 3B6TA 4ELRA 1ZTYA 5ISUA 2PVUA 1SBPA 4Z0IA 1OLCA 5KCJB 3FD3A 3MVXA 3OOAA 1LAGE 3KN8A 4GL8A 2QL3A 5ITPA 3WAFA 4NMYA 3T9HB 2F35A 5H8FB 4WXJA 1PBPA 3FZVA 3FVGA 1YTVA 2HAUA 1B0LA 1XOCA 4THIA 2PYYA 1N76A 4NF4B 2B65A 1EU8A 3RT8A 1IXIA 4ZE9A 4PFYA 3TTRA 1O63A 1SI1A 1EZPA 3IB1A 1MY3A 1ZLQA 2XXPA 3EN3A 3JV9A 5I59B 4LZ7A 4WEPA 1Q1KA 3A3UA 3H7MA 1H3DA 1N3XA 2HZLA 3LBSA 2DS9A 1BP5A 3G3FA 2I3WA 4N6PA 5H8QB 3TQLA 1I6QA 1QUIA 1URSA 4UACA 1FTJA 1B52A 3FVNA 4XIGQ 2E1SA 1JQFA 2NOOA 3DP6A 1SW2A 3I5OA 2ZYNA 1J1NA 4QSDA 1IUDA 4DCYA 3OO8A 1LCTA 4XKQA 1XVXA 2D21A 1MY1A 3HV1A 3KGCA 3PUVE 4U1ZA 1FQAA 4O3CA 4HCWA 2R71A 3TCGA 3TMGA 2OJTA 3PGFA 3P7IA 3TODA 4GF8A 2AL4A 3FUZA 3FJMA 4IB2A 1JW5A 2QS4A 5I57B 2GH9A 2O1MA 3IO4A 4FEDA 4RPOA 2QRYA 1SW1A 1H43A 2KLFA 3SDFA 3RQTA 5HBCA 3C35A 3DLNA 4OENA 3TCFA 1A8EA 2D5WA 3K00A 4H5FA 3H6TA 1QVSA 3SESA 4EF1A 3RLFE 2NVUB 2O6AA 1LBBA 2P1SA 2OBGA 1LBCA 1ZU0A 2LAOA 2OLBA 2I4BA 1P1UA 3OMBA 3KG2A 2DE4A 2PBWA 1HSLA 1QUJA 4H5GA 4KI0E 1EZ9A 3IL1B 3K6XA 3MPLA 1D4NA 5AE4A 1US5A 3IJOB 4OFOA 3N5LA 1MDQA 3BFUA 1M5DA 2UYFA 4R73A 2O69A 4JWXA 2G93A 3VV5A 3MP8A 4IGTA 1VFEA 1Y1MA 2REJA 2QMXA 4OYVA 4X9TA 1B4ZA 4OESA 2M8CA 3SETA 3FJ7A 3IOVA 2Q88A 3VLUA 3EHUA 2QSXA 4OHNA 1SI0A 2H99A 1FQDA 3O9PA 1TFDA 3O97A 1Y3QA 1B3HA 1UIVA 5CM6A 1A8FA 2GRVA 1T0KA 1MRPA 4MF3A 3N6TA 4DIGA 5H8FA 5EHMA 3EPEA 4JXIA 1IIWA 1P1WA 5L9SA 2DP8A 1MQHA 3DELB 2A5SA 2V3TA 5ITOA 3D4CA 1JW4A 3CI8A 2HFBA 3B7DA 4RK9A 1JVXA 2FA7A 5TU0A 3FV1A 1Z7ME 1PB7A 1WODA 1ANFA 3N94A 4MH5A 4F22A 3KJTA 2PMSA 4BDNA 2QS1A 1OQHA 3MVYA 5CMKA 2HZKA 5CBRA 1QJMA 1FTKA 1NNPA 3O29A 4U1OA 3PMVA 4PFWA 3BBRA 5I56B 3FGSA 1TT1A 4G68B 1L5TA 2OK2A 4ZEKA 4ONYA 2Z8EA 5DVIA 4YU0A 4IO2A 4KR5A 1VE4A 2DWHA 5I2KB 2REGA 4F3BA 3KOTA 4YKPA 4EF2A 4GXSB 4U21A 1RYXA 5B7DA 4YKJA 4F39A 4XTCQ 5FHNA 4I1DA 4G4PA 2F7AA 3ECRA 4H67A 1PB9A 3FVKA 4OXVA 4QFPA 1A99A 3SEVA 4IGRA 4TOZA 2THIA 4GFRA 4C0RA 3SERA 4OTEA 2DVCA 3S9LC 4QFOA 3VLWA 4QFNA 3KJ7A 2UXAA 4IO3A 4DZ1A 1MXZA 1NH8A 4BDMA 1BTJA 4AQ4A 4Q30B 1IXGA 3CFZA 4F3GA 4U2RA 4H8JA 3C34A 2RKMA 4H65A 3T93B 1A40A 4N13A 5LOMA 5KZTA 4H1XA 3H06B 4DXUA 1JNFA 4QHQA 4AB6A 1SYHA 4K3FA 4EQBA 1P1OA 1AOVA 1SW5A 4F1YA 1I6BA 2DSFA 3PV0E 1AH5A 3K01A 4Q5TA 1GGGA 5AA2D 2XXTA 2V3QA 1FTMA 1Z7NE 4POXA 3ZKLA 2A5TA 1UTBB 4BDOA 5BUUA 2I3VA 1NL5A 3TKDA 4G8NA 4YB6A 3C9HA 3PPPA 3PPOA 3V89B 2QS3A 3IORA 5DVFA 3H4ZA 3OO6A 4R9FA 2UVIA 3H3GA 2I58A 4FORA 1URGA 4NF5A 3TCHA 3MW0A 3FASA 5I2NB 1LFIA 1UTHA 3IK6B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FCKA 3M3FA 3HCQA 2DXRA 2HXWA 4ZDMA 3KC0A 3TQWA 2XWIA 4O3AA 1A7LA 4C1TA 4DXBA 4YAHX 2ZXTA 3UORA 1DBZA 2Q2CA 3B6QA 3GZGA 1JEVA 1POTA 3HFUA 5IZ3A 3LSXA 3QUFA 4MEVA 2QS2A 3ONMA 1FPEA 5IZZA 4HXVA 2PT1A 1Y3NA 2XXHA 4RYAA 1M5FA 2NXOA 1B2HA 1MQGA 1OVTA 4PAFA 2FYIA 5F7VA 4UABA 2OX3A 4NF6B 4E0WA 4QXDA 1KWHA 3CG1A 5EYFA 3T96B 2UVGA 4HS7A 5M2VA 3FJGA 4C1UA 5EHSA 4TLMB 3C36A 4XKNA 5I56A 4G68A 2FHYA 2O84X 3UA8A 2H25A 3B6WA 1IITA 5H8SA 5AA4B 3V5AA 2DE3A 1N7XA 2ONKE 4R6KA 3MSTA 2UYEA 3KBZA 4ZZAA 3HHFA 5I2KA 5IM2A 4OVRA 2JJKA 1FPJA 3VXCA 1B1XA 1AWBA 1LFGA 4MNCA 3GBAA 3U8QA 5B70A 2W7YA 3K2DA 2YPNA 2P0SA 4NTLA 3IX1A 2QPQA 4LUBA 3K1MA 1I69A 3W15C 3T0JA 2VHAA 3RTWB 4MJOA 5K2XA 4PAKA 4R6HA 4P47A 3RUMA 1DK4A 4OFJA 3MAMA 1ATGA 5I58B 2DYXA 2F8DA 5F24A 1FRPA 5H8NA 4PETA 3UP9A 5A5XB 4PFTA 2XXIA 4PF6A 1B5IA 2GFEA 2L5VA 2ONRA 5ET7A 2Y5KA 4NF0A 1BIYA 1JP4A 4PAIA 3VVEA 1NV5A 4OQOA 5KDTB 4X48A 5AA2B 1H44A 4NQ8A 4GOTA 1PDAA 1PEBA 3IOUA 1O64A 3PUXE 3ZKKA 2FVZA 5ICTA 2H5YA 2IEEA 5DEXA 4O7IA 2I48A 1B1HA 2KR0A 2XXUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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