1IEJA

Ovotransferrin, n-terminal lobe, holo form, at 1.65 a resolution
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
KSVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAITLDGGQVFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLLHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Domain closure mechanism in transferrins: new viewpoints about the hinge structure and motion as deduced from high resolution crystal structures of ovotransferrin N-lobe.
pubmed doi rcsb
molecule keywords OVOTRANSFERRIN
molecule tags Metal binding protein
total genus 112
structure length 329
sequence length 329
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-04-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1iejA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1iejA02
3IOUA 2A5SA 3OMBA 4GIZA 4F3SA 4JBZA 4OYVA 1Q35A 1GVCA 4F19A 4U4SA 4N13A 5L9SA 1Y1ZA 4NE4A 4ZEKA 3PPNA 3MVZA 2F35A 3C36A 4AB5A 4NWCA 2ZYNA 2XXQA 2A5TB 3Q27A 3C33A 1GTKA 3T66A 4G8MA 4U21A 4FAJA 1XT8A 1B9JA 1URSA 3IOVA 1A40A 4H0WA 3CSGA 2PT2A 3RPWA 4U1ZA 3TQLA 2O69A 5EHMA 2RC9A 1NNFA 1URGA 3F11A 5TU0A 4I9DA 3IB1A 2HEUA 5KDTA 3B7DA 3VXBA 5CM6A 1HSEA 4NF6A 1FCKA 3CR9A 3K1MA 4LZ7A 3VLVA 1FTLA 2ALUA 3ZS6A 4E0WA 1FQEA 5DYHA 2HAVA 3KZGA 1USYE 4PE5B 4I8CA 1FQFA 1NFTA 2R71A 1UIVA 1CB6A 2I4BA 4RYAA 3TTNA 3GBAA 3PPRA 2B3BA 5I57A 5ELVA 2UVHA 1Z7NE 1VE4A 1R9QA 4ELOA 2QS3A 4OZ9A 5CMKA 2IA4A 4ELPA 4XKQA 4F18A 1B40A 5DVJA 1MXXA 1D9VA 1IQ7A 4Q30B 4F39A 1JETA 3K1NA 3OO8A 1Z7ME 3CG1A 1MDP1 4POXA 3CFZA 4FE8A 4E0XA 2ESNA 4FATA 1ZJLA 4NMYA 1SD3A 4R72A 2HQ0A 3VVFA 4TOZA 2GFEA 1SI1A 2B65A 1PB9A 2F78A 1MQIA 2M8CA 1USYH 4DIGA 1KWHA 2PVUA 3N6UA 3OXNA 5B7DA 3TAJA 5H8QA 2H9BA 1LFGA 4MF3A 4LVQA 2UVJA 1BTJA 1IXCA 4KD5A 3MC2A 1B3GA 4XKRA 4JDFA 3I5OA 3KSJA 4H6DA 3K02A 2QPQA 2Z23A 3O2AA 2THIA 1I69A 4F1UA 1QUKA 4ZEIA 3ZSFA 4GXAA 1JW5A 4UACA 3MUQA 1FQAA 2H98A 1MY3A 1B5IA 1POTA 3RLFE 5L9OA 1N3WA 4O3CA 3FIRA 4NF8B 4R74A 5CMBA 4U22A 5CMMA 1LB8A 4WKMA 2VD2A 1WODA 5KCJA 1OIBA 3H6VA 4TLLB 3MPLA 1MQJA 3MZBA 5AA2A 3B6TA 2QRYA 5I57B 2XXIA 3IK6B 4QFNA 5CBRA 3ZKKA 1II5A 2Z22A 2IEEA 3TFLA 3R6UA 1ATGA 5FTHA 2OLBA 4H65A 4THIA 3MJNA 1I6BA 4AB6A 2AIXA 1B5HA 3SEYA 2AYSA 3V83A 4OHNA 3DP6A 3C31A 4JWOA 3PV0E 5AA4A 4RJZA 1B58A 2CZLA 3E13X 3SEUA 1Y1MA 2NUVA 3KBRA 3VVDA 1A55A 5J1DA 4QFKA 2DE3A 5H8HA 3OO9A 4IGRA 4NF5A 4RXLA 2ZXTA 3FJ7A 3T9HB 4TLMB 1BLFA 3T22A 1B1HA 3O6GA 3TTMA 5H8QB 4DXCA 3IOTA 1ANFA 1M5CA 3D4GA 4LONB 5ICQA 3K2DA 4P0IA 4XKNA 3TUSA 2PBWA 4YMBA 1B7HA 4RPNA 4LP2B 3LSFB 3S9EA 3HCQA 5F1QA 4R6YA 3H7MA 4O3BA 3G3HA 4H8JA 2XXTA 3HV1A 1PBPA 5JEIA 2Q89A 1MH3A 3FASA 2OWSA 5I58A 1OQHA 3ONMA 4G68C 5ICTA 3N5LA 2Y7RA 3I6VA 3C32A 1S7YA 1B32A 4HCWA 1UQWA 5ISUA 5KCJB 4UA8A 3MZ9A 4U2RA 3I3VA 4IGTA 1IIWA 4ISUA 4OENA 3G7WA 1MPBA 5AA2B 1EZPA 1IEJA 3PMVA 1FTMA 4IY6A 2XXVA 2BJJX 1EU8A 2ONKE 2XX8A 5I59A 1MXZA 1NL5A 2AL5A 4KI0E 2H4IA 2QJEA 1JVYA 3W9VA 3OSRA 4IO7A 3M3LA 4KYSA 1IXHA 3PGFA 4F1VA 3RN8A 3PD9A 2RC8A 2ZNSA 4FJPA 3GZGA 2O6AA 2XXHA 2PX1A 5IKBA 1H45A 5I2KA 2QS1A 1SW5A 1B0HA 5AE4A 1EZOA 3FJGA 3D4CA 1XS5A 3DLNA 1MDQA 1MQDA 2H99A 1YTVA 2D21A 1FTOA 3KGCA 2ANJA 3PD8A 1SDXA 1LLSA 1GR2A 1ZTYA 2DSFA 2Y84A 1CE2A 3UA8A 3TEPA 4XKPA 4NF5B 4FECA 3B6WA 3QUFA 5DVFA 3K6UA 3MVYA 4NF4A 4RPOA 4EF2A 3TCHA 5HPQA 3IJXB 1P1OA 3KEIA 4YKIA 3PUXE 2GHBA 2FYIA 1DSNA 1UTHA 1A54A 2LAOA 1OVBA 1NH8A 3U92A 4BDNA 3T96B 3E9XA 5BUUA 2QL3A 4H1XA 2F8DA 1FQCA 1VFEA 1R1NA 4EQ9A 3BBRA 4ZDMA 4I1DA 1IXGA 4Z0IA 1N84A 3MBPA 1B5JA 2O7UA 3IB0A 2RINA 3DP8A 3FVGA 4EF1A 2NOOA 1MG1A 2KLFA 1QW0A 2QS2A 5I56A 3BFUA 4N6PA 1VSOA 4P0GA 4GQOA 1P99A 1US5A 1I6QA 5I58B 4ZZEA 4EUOA 4PFTA 3IL1B 3BKIB 2UYEA 3AXFA 4QF9A 3TZAA 3M3FA 2Y7IA 2G93A 4C1TA 3O66A 1HSJA 2B3FA 1MQGA 3VLUA 1M5EA 4EQBA 5KZTA 4Q5TA 1B7UA 4MBPA 5TPAA 2DWIA 3V5AA 2R9JA 4TQUQ 3G3JA 1Y3QA 4DLDA 1LFHA 5I59B 1H76A 2ZNTA 1QKAA 3RGYA 3T93B 3OO7A 1WDNA 2NWJA 2Y7PA 4PFYA 1O7TA 3MVXA 4NF8A 4OFOA 3PMXA 4KPTA 3QXMA 4DCXA 3K6VA 3C34A 4F2OA 2GHAA 1H3DA 4KHZE 5I2KB 3T9UA 2E0SA 2I3VA 5DEXA 4NEDA 1VFDA 3DP4A 4Q8RA 1M5DA 1B05A 5JTYA 4QFOA 3SETA 3KOSA 1DOTA 1P1WA 3KN3A 1Y3NA 3JZJA 3W15C 4JSDA 2E1SA 3TTLA 2Q9TA 3TODA 3ILUB 1TFDA 1IXIA 4JWXA 2F7AA 4NF4B 4G2ZA 5FHNA 1ZBMA 2HZLA 3G3IA 1O64A 1LAFE 3UP9A 4G8NA 3QSLA 1UTHB 4QSEA 4IO2A 1IUDA 4YZZA 1FTJA 1O63A 4HW8A 1Q1KA 1LAHE 1L5TA 1B4HA 1D9YA 4BDLA 1XOCA 3HO7A 4LUBA 5AA2D 3G3KA 3RT6B 3FV1A 2XHDA 4H5FA 5I56B 3OO6A 4R75A 1JW1A 4XXUA 1H44A 2DE2A 2QS4A 4YB7A 4N07A 2I3WA 5ITPA 3HN0A 3MP6A 2XD2A 4YMAA 2FNCA 4RK9A 5EYFA 4R6KA 4F31B 1LCFA 4H8IA 2YLNA 2PMSA 3M3KA 1QUJA 4KCCA 3MAMA 2DXYA 3TTKA 1LCTA 3IO6A 4QRZA 4OFJA 2QSXA 1MY1A 1P1QA 3N26A 4F3GA 4FORA 5TPAB 3DM0A 1OLAA 1YCJA 4G68A 1NH7A 3MZ1A 1ZLQA 2ZNUA 2G29A 3MP1A 5FTIA 4KYDA 1XC1A 2YJPA 3PUVE 5CMCA 1D3KA 3FUZA 2XD3A 1B7ZA 3C35A 1MY2A 2ABHA 4I62A 4U23A 1TXFA 5IAIA 1OVTA 4HTGA 5DEXB 3BFTA 3U8QA 1MM6A 4BDQA 2HFBA 2F97A 3K01A 2YPNA 2XXWA 4KQPA 3HSTA 5JTYB 5L8DA 3S2VA 2I4CA 1YPNA 2Z8DA 4ZECA 1LBBA 1T0KA 2P2AA 3T9XB 5CI5A 3GLBA 2I49A 1B3HA 4OEUA 1Y4CA 3EF7A 1ZU0A 1DPEA 4JWYA 2F36A 3SERA 1TT1A 3L6HA 2XXYA 4KYEA 3MVWA 4JXIA 3T9VA 4F2QA 1FTKA 4RK2A 4EXKA 3PPOA 4GD5A 2DWHA 3EHTA 4MH5A 4MLQA 3TQWA 3KJTA 4LQ5A 4OWDA 1VR5A 3UORA 3ILTB 2OBGA 2GH9A 4AQ4A 4DCYA 4R2FA 3LBSA 4WXJA 3V89B 3IX1A 3E4RA 5F7VA 3K0VA 3OEMA 2F5XA 3FZVA 1B0LA 1SI0A 3ZKLA 3P7IA 4QSDA 2V84A 3H6TA 1M5FA 1UIUA 4QSCA 3RY3A 4KFQA 1MRPA 3IAZA 5I2NA 3VE1B 3O9PA 4G68B 3O6IA 1NNTA 3FJMA 3FVKA 4F3BA 3TTRA 1Y4TA 2I48A 3CRBA 4LATA 3GBBA 3U72A 5CBSA 5DVIA 4OFLA 2Y7WA 3TMGA 2Q88A 1JEVA 3A3CA 4HS7A 1OQGA 2GRVA 4C0RA 3OELA 4C1UA 4EXLA 1MS7A 3HHFA 4F3PA 5HM4B 1WVJA 2HZKA 1MH4A 3N94A 3OEKA 2UYFA 4F1YA 3CVGA 4U4XA 4K3FA 5H8FB 3WAFA 2AL4A 2D5WA 1XHYA 3IR1A 2F34A 4YKKA 3Q25A 2V93A 1AL3A 1MY0A 4H5GA 3FVOA 3U1OA 3FGSA 3TYHA 3C9HA 2ZMBA 4IO5A 1J1NA 2OWTA 3UIFA 1B3FA 3PPQA 1IZ1A 4QHQA 1NMUA 2REGA 4ZEFA 3TPAA 4XIGQ 4YB6A 2VGQA 3RQTA 3O28A 2V3QA 3TKDA 1FQBA 2PYYA 1DMBA 3IORA 1NNPA 3H6WA 3OENA 3OSQA 3PU5A 2Q2CA 4DDDA 4LZ8A 2O68A 3IOWA 3HPIA 4QFPA 4ND9A 5AA3A 2XX7A 1B3EA 5HBCA 3UGWA 3G3FA 2DOJA 3VVEA 3KN8A 2DWJA 1MY4A 3HHGA 4XTCQ 1SW1A 5DT6A 4GL0A 3H6UA 1ELJA 4ELRA 2XX9A 2XXPA 2O51A 2DS9A 3QUJA 4ZEBA 2W7YA 5A5XB 1TWYA 2ONRA 4PETA 1QJMA 4OERA 3FXQA 4PP0A 4ZS9A 5I2NB 1SW2A 4IO4A 4LZ5A 1AMFA 4BDMA 3GXAA 4NTLA 1A7LA 3PMWA 5TP9B 4L17A 1FQDA 2XXUA 2F7CA 4X1DA 2DE4A 4O3AA 2O1MA 2I0CA 4POWA 2F7BA 1N7XA 4R6HA 4G4PA 1A8FA 3QIMA 1DTGA 1Y9UA 2DXRA 3IJOB 3IO4A 1QULA 4OXVA 2ONSA 1MQHA 4ONYA 3S9LC 2OJTA 3PPPA 3VLWA 1POY1 3QK6A 3CSBA 3MW0A 3CI8A 3C4MA 1R6ZA 4GXSB 4FEBA 3MQ9A 1PB8A 3U94A 2F6GA 3JV9A 1LBCA 1B6HA 1GV8A 3LSWA 3KJ7A 5BWJA 2X26A 1QKBA 4ZZAA 4YKJA 4R9GA 3U93A 1FW0A 4RNSA 5CRYA 1UTBA 1B2HA 1EH3A 1EZ9A 1B52A 3Q29A 5B70A 2I0BA 2DYXA 4YKPA 3FV2A 1JW4A 3LUYA 3LC8A 4ESWA 1P1NA 1US4A 1RKMA 3SEXA 1I6AA 3FVNA 2O1LA 4ECFA 1H43A 1N0TA 4YU0A 3FXUA 4OETA 2Q2AA 3IB2A 2OK2A 4DXUA 2F6PA 3Q26A 3RNNA 2DWAA 2RCBA 1F9BA 3SKPA 2DQVA 4KR5A 1SYIA 4GRKA 1D4NA 1N76A 3W9WA 3MP8A 1LFIA 1LB9A 3H3GA 1SVXB 3L6GA 3R7XA 3KOTA 2HAUA 1OLCA 3EHSA 5AA1A 2ZYOA 1MXYA 4IB2A 2X7PA 4ZE9A 1R9LA 3RTWB 1ZMGA 1S50A 4IY5A 4IO6A 3B6QA 5ITOA 4YICA 3MWBA 3EQ1A 3SDFA 3TDJA 3H06B 1P1UA 1JVXA 1B1XA 1PC3A 3Q28A 2NXOA 1ZKBA 4OMBA 4H67A 2HCAA 3N6TA 3SEWA 1B46A 3K6WA 2I58A 4QFLA 1BIYA 1MM7A 3WAEA 2UXAA 4HCYA 1QUIA 3CFXA 4X48A 2FA7A 5KDTB 4PFWA 1QVSA 1NKXA 2O84X 4NF6B 1N3XA 1DPPA 4GLIA 4MLVA 3EHUA 3FXRA 3G3GA 2DVZA 3CIJA 4YAHX 1A8EA 2RC7A 1SW4A 4MFIA 4R9FA 4BLAA 3FATA 3QAXA 1UTBB 2O7IA 1BP5A 3S4UA 1HSLA 2VOZA 3R26A 4WEDA 5H8FA 2XXRA 4X9TA 4BDRA 2Q8JA 3EPEA 5FHMA 2V3TA 4LA9A 4Q0CA 3PUYE 2WKYA 4X1BA 2P1SA 1AOVA 2HXWA 3QYTA 2I6EA 1B3LA 1URDA 5LOMA 1Y20A 2UVGA 2UVIA 2RKMA 1BKAA 1MPCA 2CMOA 1JQFA 3CG3A 3VFJA 3O29A 3UK4A 3H03A 3KG2A 1XVYA 3EN3A 1GGGA 1PBQA 4KCDA 1B4ZA 4OQOA 3LSXA 1SQYA 4R73A 3A09A 1ZIUA 2ZYKA 4DXBA 4P11A 4M1VA 4FEDA 1XVXA 2DVCA 3K6XA 3PUWE 3DELB 4GFRA 4M4GA 1RYXA 2QMXA 5H8NA 3M8UA 2V3UA 1TFAA 1DTZA 4GVOA 2X7QA 4JB7A 1S9TA 3FD3A 3MPKA 5A5XA 2PT1A 2NVUB 2D3IA 3SESA 3PUZE 3K4UA 3KFMA 1LSTA 4BDOA 1N7WA 1JNFA 4GOTA 3O97A 1RYOA 3TCGA 1LGBC 2Z8EA 3JYRA 1IITA 5K2YA 2A5TA 2OCUA 2Y7KA 2Z8FA 5TP9A 1N04A 4DE8A 5FHOA 5DTBA 1NNKA 4ESXA 2VD3A 3SEVA 4GWOA 3O6HA 2DP8A 2OZZA 3A3UA 1SBPA 4PFUA 5CC2A 2REJA 1Y3PA 1AIVA 1A99A 1MPDA 1MXVA 1M5BA 3K00A 1PDAA 3H4ZA 2R6GE 3LR1A 5L9MA 4FIMA 2XXXA 5K2XA 1OMPA 4WEPA 2VHAA 4G8HA 4EDPA 3KN7A 1MXUA 4U1OA 3RT8A 1MXWA 2H25A 3VDFA 2RCAA 4LQ2A 3V8XB 3VXCA 3OOAA 2V25A 1JEUA 2ZYMA 3K1PA 4JSOA 4OESA 1LAXA 4OVJA 4GF8A 4GL8A 1LAGE 4OEVA 5AA4B 4ZEDA 3E3KA 3ODBA 5M2VA 3TCFA 3THIA 1B51A 4ELQA 2P0SA 2QMWA 4YB5A 1AH5A 3USDA 2H5YA 4PQJA 4R2BA 3S9MC 3RUMA 3VV5A 4IO3A 4ZE8A 3TELA 5H8SA 5H8HB 5I84A 4RY1A 3KSXA 4NWDA 4DZ1A 5JK4A 3OD7A 2RF1A 2VP1A 1SYHA 3ECRA 4RA1A 3LSLA 1PEBA 1YAEA 4Z7EA 5H8NB 4G77A 1PB7A 3CFLA 5EHSA 4EQ7A 4OTEA 3RTFB 4F29A 4F22A 3S9NC 3UN6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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